Moc11g16400 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGCGCATTTGTGTGCGCATTGCCTCATCTCTCTCTGGAGCGATCAAAGTTCTCGCTTGTTGGAGCCGGGGCTGGACCCCGGGCGCCCTTCTTAGAGGTCCCACCTCGGCCACGGGTGGCTTGGACGTCCTCGGGTGCGCAGGCGGGGGTAGGGCAGGGCAGTGATCCGTGCGACCTGCGGAGGGGTTCCGTTGCTAGGCTGTCGTGACCTTGCCCTCTACCACTGCTGCTCCGACCTCCCTCTGGTGGGCATCGCTGGCAGCTAAAGTTCTTCGATCTGTCGTATTGGTCGAGTTCGCTGGTTGAACCATGTTCGCTCGCGTGTTGGTTTTAAAGAATTGGGGATGACTGAGATTGTCGTTCCCCACAGACGGCGCCAAATGTTTATGCAAGGATATGCACCACAGTGTATTTCAGATTGCAGCTCGAACTCGGCCTCCGGACCGATCTGAATACTTGGGCGGACCTGCACAAAAAGGTGAGCACTCTGACGATCAAGTCAGTATAAGTCGGATTCCCAGTTTAGTTCGAGGTCAGAATCATCGTACCTGATCGTGGAGTGAGGCCCTCTACTTATGGGTGGTAGTCCCTCTAATCTCGCGACGGTTACATTCGATATCTCGGGACCGTCAGTTACACCAGGTAATCTCGGGACCGACGGTTACGCCCGATAATCACGCCGCTGACTGTTTACTCACATCGGCCCCTACCGAGCTCCCCTGTAGGTCGGACCTGGGCCAGGTTCACCTCGGCCCTCATTCTTAGCATTTGTCGACGTTAGTGGCGGCCATCTCGGCTATCCGAGCTGGGCATGACTCATGAGCCATCTTGGAGCACCAATAGGGGTCCTCCACGTGTCAGGGTATTCCCTCCCCAAACACACTTGGTTTTGGATAAATAGATGGAATTATGAGGAATATATATGTTTTATAGGGAAAAGGAAGGAAAAAAAAGCAGCAATGCACCTACTGCAGATGGACACATAGGCTATCTTAAAGCTAGCAGCAATGCGTCTGGCGCATCGCCAACACTCCAGATACTTCAGCAATGCGCCTGGCGCATTCTCCACCTACAAATAAGGGTTTGTTGACCGGGCAGTTAGAAGAAATCTCAACCCATCCATTGATCCGTGCAACCAAATGCTGTTAAGCCCCATTGTAGCTCCTCCATCAAATACCCAAGATTTTCTTCCACAACTTGCAAGGTTAGCTTATGAATACCAAGTTCCATCAAGCTTCAAAGGGGGAGCTCACTTGACATTTAAATTCCAGCTTGCTTTCTCTCTAGAATTTATGCTTTATAATTTGTTTTGTCTAATTGTGTTCAACATTCCTAGAATTATTTTTATTGCAATTCCTTTTTGTTGTTATCATTTTCTTAGATTTTGGTTCTCGATTTTAATTTAGCTATTGTAATTCTCTTAACTTAATATGACATTTTATTTCACTCCATTTCTTATTATTCTATTTTTCAGTTTCTATGAGTAGCTAATTGCTTTTCAACCCTCCTACGAATGACTTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGACATTCTCCCTTATTAGATGCCCATTTCTTTCCCCACCCACAGTCCATATCAGCTTAGCAAAAATATTCTCACCTACTCATATTTTCTTTGCTACTAGTTTGGGGGTATGTTGGGAGCATTTTCATGCTTTGTCTTTAGTTGCATTGAGGAAATGCAAGCTTTTCAGTTTTGGGGTGTGCACATTCGCTTTGCTTCTAACACTTTTTTAGCTTAGTTTTGTACAATTATGAATCTTTCTAATCCTGTAATTCAGTTAAAAAAAAAAAACTCAATATCATTAGAGGCTGCGGATTAGGAAAGCTAGTAGCCCATAGTTGAGAGCTCAATCCAGTAAAAAAGAGCTAGCGGTTCAAAGCAAGTGAAAGGGAGTTTAGAAAAGAAGTCTCTAGGTGGGTCAGGTTTGTGAAAGTAAAGTAGGAGGATGCTAATCCTAGGACAATATCCTTTTCTAGAGTTAGGCAAGATCTTAGCTACTCTCTTTCGTTGTCCAAGGTGGAGGCCCGAATGAATGAGCTCTCAAATTTGTGTGCATTGTGGGTGAACCGAGTAAGTAGAGCTAGTTCAGCATTTGATGCATTGCATATTCAGTACTTTTCTGTGGGGTGTAAAGTGTAGTCTTGCCTTGAGGATAAGCAATGATTTAAGTTTGGGGGTGTGATAACTCTACAAAAGAGAGCTATTCTAGACATTATTAGGGAAGTTTTTGTGCAATTTATTGTTAATGTGTGTCTATTTTAGCTCGAGAAAATCCTGAATAAAATAGAAAATTAATTATGAGATGAAATCTCGAGCAAATAATGTTTTGGCTTAAGGAAGTGCTGAATTCTTTCTATATATCGGCTCTATTATGCAAGATTGAAGTGAGAACCATAGAATGAGATAAACGTTGAGTCCAAAGAGCTGTTGACAAAACACAGTCAAACCTGAGTAGGAGAATGCCGGAGTGTTGCAGGGTTAGAGCATCCCGATTTTGGACAGCATCTCTTTCTGTAGAAATTTATGGGCAGCACAGTAACACGCGGGGTTCTCACTTATGTCCGTACAACGCGCGTTTTACTGATTTTTGCCCTAGTTTTTTGGGGGAGTTATAAAATCCAAGATGTGGGTTGCCTCTTCATCAATTTCCCAGGGGAAAAACCCAAGAGAGGAAATAGCTCCCAAAACGTGCTGAAGACAAGGAAAGCTACCCCCATTTCAAGAAGAAGTCGATGGGAGGAGGCTGGAACTGCTGGTTTCTCACTGGCTGTAGGTTTCGAGAATTGCTCAAGCTTTTTCACCAAATGAGTTGTTTTCTCTCTTTGCCCATTGTATTTTTTTCTCATTCTCCATGAACTAAACCCCATTTTTTGGGGAGACCTTTGGTGTAGCTTGTGAACGAGGCTCTCTATCTGTTTTGTTGCTGTTAAATAGAGTTGATATAATATTTTCATCTCACTGATCTATGCTGGCACATTTATTAGTTTGTTTGATCTTGTATGACTCGGAAGGGTATATAGGTAGCGTGTTTGGCTTTTTTTGTGGTTAGCTACTCTTTTCTAATAGATTTGTGGTGCCTAGTGATGACTCTCAAAATAGATTGTTTTGTGGGCTCTTATTAGGGGCATTTATGTGCGGAAATGTGAGAATCTAGTCCACATGGCCAAAAAAATGTGAAATTCCAATAGTGGACCCTAATTACATGTATAATTCTTAGATGCTCTCAATTATATTATTTAATGCTAAATACTAAGGATTTGTGCAGAAAGAGTAGCATGGCGTTTAGGTCGAGTAGAATGCTGCCTTGTTTAAAGAACTGCTGCTAGATGCTGAAAACGAGCGCAAACCTTGGAAGCTTGCAGTTACCTGGATGCTCTAGAGTAGAGGCTAAAGCAGTACTGCTTTAAGTTAACATCTCTTTTACCACGTTCGTACAGCGTCCCGCGGGTGCCCTAAGTTTTAAGGCCTGGTATTTAAGGAAAGGGGGTCCGAAGCCGACAAATAGGAGACCGATGACAGATTGATTCAATCATTTTTGGAATCATCAATTTCAGGGAATGTTTCTGTTTTTGACGTGGGGACTTTATCGAGGAAGGTGAAGGGTGACAGATTGTTGAGGATTTATATTGTACACCTGAGGAAGCTTTCTACTATATTTTCATTTCTTCAACAAGAACTCCTCTCTTTCATTTTCCTTCTCTTTTCTTCTTTCCATTATGAACTAAACCCCACCTTCGGGGAAGAGTTGAAAGGTTTCTGTAATATTTTTGACTTGCTACACTTTAGAACTTTGAAGTACTGATTTATAACAGAATTGTGTTTGTTTTTTCTTTCTCATTAAACTTGTGGGCCAACTCGTTTAGGGTGCTAGCTTACTTGAGGCACGGAACTCGTTTAGGGTGCTAGCTTACTTGAGGCTCGGAGAGTCCTTATTGAGTTGCTTGATTGTTTAGCTATAGTTTCCTTTTTCCTTTCTGAAACAGGGCAGTGAATACCCAGGGATGGGGTTCACTTTATAGCACCTTTAGACCGCTTTATTTGTTTGCTTAAATTACAATGGAGTTGGGTTAGAGCAAGTGTAGTATCCTTGGAGGAGAGCCATGAAGGTTTGGGTAATCATTGTTTATGGGACTATTAGGTAGTATCTGAGAGTAACAGTATGTCAATCTTCCCCTCCCCAATCTTTTAACTAGTCGTAATCCCCTTATCATTTTCGTTGTATTCGTTGGTTGTTTTTAGGAGCAGATCTAAGTAGTTCTGGCTAGCTTTTGTTTAAATCTTTATACATCTTAAGTTCACAAATCAACGCACAACATATATTTTTTCTTGTTTTGTTTACTTGTGGTATTTCGAAATTACTAACCATTTTATGAGTTATTTTCCCTGAGGAGACGACCTTATTTGGACTACACAACTGAATATTTAGTGTACACTTGTCTGAGTTTCTCCTATTCGTGAGAGAACGAACACTAGGGATAAGATCCGCCTAACCATGCTTATAAACTGTTCTTCATGTTTAGTATTTAGCAACAGAAGTTGTAATATTCTATTTGGGTGTCTCGGAAGGAAACCACGTCAGTTTGAGCATCAGTAGTAATTTTATGCTAGAGCGTCTTCTGTGAACGTGTGAAAGCATGTCACAATCTCCCCCGGTTCCATCCCATTACTGTTTGTTTTCGTTTTTTTTCCCCGTTCTGTTTATTTTGCTACAGCATTTCTTTGACCCAGCATCTGTTAATACTATATTTCTCTCTTGGAATTTCTTTTGTGTTTTATAGTATTTTACTTAGTTTAATTGTACAAACATCGATTATCTTTTATTTGCATTTTCTTGGTATTCTTAAGTGCATGCTTAAAGTAACATTCTTAGTCCATTGAATTTCGAC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MERICVRIASSLSGAIKVLACWSRGWTPGALLRGPTSATGGLDVLGCAGGDGAKCLCKDMHHSVFQIAARTRPPDRSEYLGGPAQKGEHSDDQVSISRIPSLVRGEKPKRGNSSQNVLKTRKATPISRRSRWEEAGTAGFSLAVAIVEPDIDADEFEPTPVMFQMLQTVGQFEGHESEDPHLHLRYFLELGYGYTPYHQNASVHGMNWGICKRIMGKVQGTFAKVPIPQYPQVYLERYIFNGLNEATRLVVDAYANGALLSKSNVESVTKASLTHTDQRTSPHRQEFITHSGLRMSFLVRRMKFSTQVNHTAKAYGRFGGHYPLGNLLAPVPVEPLQPPYSKWYDPHVRCDYHAGAVGHSTENCTSLKHKVQVLMRAGWLKCTIRPKIIAPEVAQQLPMKPSVDVFSFSSACRGTQFNMSTAFHGLHSYPILYDLWAFQSLTLHAATGLSKTDQHLTCTGHTTHKKPITAATTFFTASSKPAGTPTISFAVVRFNLVPRASTRWIRVGDSKGRRHNYLAGSSFIREKICIKHLKTLAMLEGIHNLDNPNGVDVYLETDLLDVKWLMNKEMDDFKKVLWLAEEIRALLEVKKIVSICHIKTRSESRGS Homology
BLAST of Moc11g16400 vs. NCBI nr
Match: XP_022158986.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111025431 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 1.0e-17 Identity = 40/55 (72.73%), Postives = 50/55 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. NCBI nr
Match: XP_031738551.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC101203611 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 1.2e-16 Identity = 39/53 (73.58%), Postives = 45/53 (84.91%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. NCBI nr
Match: XP_031737539.1 (uncharacterized protein LOC116402431 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 1.2e-16 Identity = 39/53 (73.58%), Postives = 45/53 (84.91%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. NCBI nr
Match: XP_031741698.1 (uncharacterized protein LOC116403895 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 1.2e-16 Identity = 39/53 (73.58%), Postives = 45/53 (84.91%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. NCBI nr
Match: XP_031741309.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC105435093 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 1.2e-16 Identity = 39/53 (73.58%), Postives = 45/53 (84.91%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E2J7 (Ribonuclease H OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025431 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 5.1e-18 Identity = 40/55 (72.73%), Postives = 50/55 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D099 (Ribonuclease H OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 1.6e-16 Identity = 50/109 (45.87%), Postives = 64/109 (58.72%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM29 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022231 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022231 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 3.6e-16 Identity = 53/139 (38.13%), Postives = 78/139 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VBN6 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold468G001210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 4.7e-16 Identity = 46/79 (58.23%), Postives = 56/79 (70.89%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g16400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ90 (Ribonuclease H OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024415 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 4.7e-16 Identity = 45/95 (47.37%), Postives = 63/95 (66.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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