Moc11g07170 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGGAGCTCTCAGAGAAAGAGCACTCTCTCTCATGGCCGCCGCTAACAACCATGGTGATTTAACGGTCAAGATTTCATCTTTGAGGCAGGTGAAGGATATTATACTGTCCATCGAGCCATCGTTCGCCGCAGAGCTCTACTCCTACTTGGTGGAGCTTCAGTCTTCCCCCGAGAGCCTACTACGTAAATTGTTAATTGAGTGAGTCCACAACCCTAATTTTCCATCTCTGTTGTATGTATTTTGGATTATTTATACTTTTTGTTACACTTCCCATATTTATACTACCTACAAAGTGACTTACACCGAAGTATGATCCTTGTATGAGTCCAACGTTGCTAAATAGTGGAGCGAGATGTAAAGTTTGGGGAAACCATATCCCATTGCGAGGGAAAGTACGTTTTGGTCTTGTGTATACTGAATTATATGCAAAAATATTGGTTACCTACTTATGGGAATCTTGTTTCTTACATATCATGCTCGTCCGTCTTACTTGGTCCGCAATGTATTTATATGCGGCATCAAATTTTGATCAAAGACATCAATCTATAGTCATTAGGTACATGTTCAATTATTATGCTAAAAAACTTAAAGTTGATAGGTTTAAGATAAATTTTATTCTAAAATGTTTGGAGTTTGGTGCTGGAAGAATTTGAGCTTAAATGCGATTCTGCTAAGGAGGCTTTGTCCTTGTTCCGCCTCCTCCTTTACAGAGCTCCTTTCAAGAGACCAATGAGGGACATATTTGTGAACTTTGGGAGTATGCCAAATTTAACGTCATTGTGTGGTGCTTTGGTCAAAGTTTCTTAGTACTTATTCTTCTTTTTCGATTACTACATTTTTCATCAACTCCCTTGGTTTTTGTTGGTTGGGAGATTGCTTATCCTTCCCTCCTGTAATTATCTATTTGACAATGAAAAATTGTTTCTTGCAAAAAATAGATGGGCTAGGCCTAGGGTAAATTTAATAATTTCAATATATTTTTAATGGGATAGTTGGTCAGTTTCACGTGGATTCAGTTTTCTTGCATATATATGTCTTTTAAAAACTATTGTTTTACTTTGGCTAATTGTTTGCTATGAAGGAGATATGCTTAGTCCAGGTGCAGTCAATGATAGCTCATCTATGTTGCACTCTTTTAGCCGCTGTGTATTTGTTATCAGAGCCGTATCTTATATTTTACTCTGTTACTGTCCGAGAATGTTCTTATACTCGAATCAAATTTTATGGCCAGTTAATATACTCATGGTATAACTTGTATTTTCTTCTGTAAGCATAACTATATTTGCGTTTCAGAGTGAGTGCATGGCTTGTCCACTAGGCTTCTTTTTTTAATACCTTCAATTTCTCCAGCTGCTGGAATATTTTTCTATCGTTTATTTATACCCTAAATGGTTTCAATTTACACGATGTACAGGGTGATTGAAGACATTGGACTAAGAGCCATGGAACATTCGCCTCTATTAATGTCAGTTTTATTGGCATCTTTAAAGGATGAAGACCCTATTGTAGCAAGACAATCAATTATTAGTGGCCAAAAATTATTTTGTGGTGTTTTAAGAGAGATGACAATGCAGGTTTCTCCTTCTGCTTCTCCTTGCTTAAAGTGGAAGAAATGTTAAAACTGTCGGACTTACTAAACATATGCTTAATTTTATTGCTTGCCCGACATGGTTAGAGAAGGCCAGTCAATCATTATGTTATATTTATGTATAATCACTTCTAGTCTTTGATCAATGTCATTAGCATGCAGATGCTTTATATATATTCTCCAGTTGAAATTTATTTTATAGTTTTTAAAATTAGATGCTAACTTTAGAATTCCACAGTTGCATCGGCGAGGTAAAGTTGAGAGATGGCTTGAAGAACTGTGGATGAGAATGTTGAAGTTTAAAGACGATATTTTGGCAATTGCTATAGAGGTATATAAATGCCCAACTTCCAGTCCTCTAAACATTGTGCTACTGTTTTTATTTGAAATTGGAATTGCATTCGTATTTGCGTGGATATGTTGATCTTGTTAATGGTACATCAATAATACAAGTAAACCTGAGGCTGCCATTGCCAGGTACTTCTCTGTGTTTTTTGGAGGAATGCATGGAAATAGTATGGAGTAATCCCATACTATGGCATTTATATGGTCCCGAAAGTTTTTAAGCTAGCCTATCTTGTCATTTTAGTCTTATTTTCCTGTTGTTTTATAAAGCAATTGAAGCTCTTTTGAGTATTGTTACCTTGCATCTTATAGTAGTAAGTTTTCCTCACATTTGATGCTTTTTTATGCAGTTGAATTTCAGTGCTTTTTTCTCAGTATCAGTATATACAGTGTATCGTTTAAGGATTTGTATGTGATAAAAAAAGATTATTTTTGTACTCCATTTCTCAAATTCTCCATTTTTGTAGTGAAAAATTTAAAACTTTTCAGGAGTTGTCAATTTATTTGAATTCGAGCATTAATCCATAAAAGTTTATCTTATGGTTGAAGTACACTTAGAATAATATTGAAGATATACATGATTGTCTTGATAGTTTATGGGTCAGTCATGAGTGTGAAAAATATGGTATAAATTTGGATACGAATCTGAAGGTTTAGATGGTTCAATAACTTTTTCTATTCCCCCTTTCTTTAATAGATTACACCTCTTTGTATTCTATGTTTCTAGAGGAATTTTAATTTTCCTAACATAACTTTACCATACTTTTAGTAATGAATACATTTTTTTAGTTCTGAATACTTTCAGTGGATGTTGTGTTTTAATGTGTGTTTAATATTAAAATGCTCCTTCCGGGCCACTTCCTTGTATATTTCATTTTTCTTATCGGAAGGTACACATGATTAGTTGAATTTCCAGTATTTTATTTTTATTTTTGAGGAACTACCAAGTGTTATGATCTTAAAGCTGCTGCTTAAATGTCATATTGTAGCCTGGTTCTGTTGGGAAGAGGTTGCTGGCTTTGAAATTTTTGGAAACATATGTTCTACTTTTTACCTCTGATACAAATGATCCACAGAAACCTGTCTCAGAAGGTATTACATTTAGGCATCACAAACTTGTTCCCACGTTTGTAGCATTTCTCATTTTTTCCAGTTGTTTAGCTTAGAAGTAAATATATATTTGTAATCTGTTTCTAGAAGTTTGTTTGCTCGGAATTTAACTTAATTCTGTCTACTAACAGGAAATGGGGATATTTTTAATATTTCATGGCTAGCTGGTGGTTTTCCTATTTTGGATCCAGTTGGGCTCATGTCGGAAGCTAATAGGATGCTTGGCATTCTGTTAAATTTGTTGCAGTCCAGTTCTGTTCCTGGTACATACACAGTTACAGTTGTCAGTTGGTGAGATTTCTCTCTCTAATTTTTGGTTGTTTTATTAGTTGATGGCTGTTTGACATTTAAAATTGAAGTTTATTCTCTTCATTCTGTATAATTTATCCATCGCTAGTTGCTATCTGTCCTTTTGGTGTAAATGTACTGTCGTTTAGGATAATGTGAAAGAAGTTAAAGAAAAAAAGGCAGGATTACATACGTTACTGCTGTGTATCAAGTGAAAAGCATCAGACTTCATTTTCATCAGCTTAAGGATCTTGAGTTAATAATATTCATTTTTTTTCTTTATTGTTAATCATAGACCACCACCTCTCAACATATGGGAGAGGAAATCAGATTTAGAATTGGTGCTAGATGGTGTGTCTTGATATATATGTTTAAGTACAAACTTGTTCATGCACACATCTAACCTAAAGAGGCCAAGCCCAAAGAAAAATTTATGTCTACATCACTAGAACTTACTTCTAGGTTCTCATTTCTCGACTGGTTGTATTTGTTTTTAATTATTTTCTAAAGTCCAGCAACTTCTAATATTATATTTTCAACAATATATCTCCTTTGTGGTTGTTGATCTAGATCTTTCTGAATGATGATGGAACTAACTGCTTTCTGGATATTTTCTTATAAAAATAAACTGCTTTCTGCATATTTAGAGTGGAGAATTTATTGGTTTAAAATTTTATTTTGAATTTATGTATGTATGTATGTATGTTAATTTGAGCGAATTTCTGTATTCCTAAATGCGACATTGAAATCTGTGTTTGAGTCTTCATCATTTTCTCCAAGAGTAAAGCTGTGATTTTCTTTGAGAGTTGGTAACTTTTAAAATATAAATGATTAGTTTTTATTTCTTGAAAAAAAAGGGAAAAAAAGGAAAGATTTGAACTGTGACATTCTTCAGGTGTAGTTGATTCTTTTTGAATGTTCTCTAATCAGCACTTTTTTTGTGCTTGTCAAATTAACAAATTTGTTTGCGTAATTTTTGCTTACATGCCATTTTATGATATTTTTAAATTAGTTTATTGTTTGATTCAATTTCTTGTGCTGTCTAAAATGTAATGCTCTTCCTGTTATGTACTATTACGTTCTTATTTTGAAGTATTTGATTATGATATTATAGAATTTTTACTTCTTGTTTATTGTATTTATGTTAGATCTTTATATTCTCCTTTTCCAGCATTCATCACGGTGATTATATGATAATGACAATACTTCTAAAAAGACATAACATAGAGGATGCAGAAAGTTGCAGATAGTGCCGTTACTGTTTTACTTGCATTCTGTATGCATCTAGTTATACAACAACTAAATTAGATTGGAAATTATCGTCTTGATCTATGTTGAAAGATGTGTTCCATTCAAAATTTAGTGCTTATAATCTTTTTAGAACATCTATTCATCTTTATTATTGCTTATATGACATGGCCAACATTCTTAGGTCATGATCATTGAATCTTATCAAACAAGCTAGGAAATTAGATTAGTTTGAAGAAAGAAATCATGTGGGGCAATCATTCTAGACGTTCAAGTTTGAGAAAGTTGAGAGATTTCATGTCATTAAGGATGAATTTTTTCCAATGTTTATATGGGTATTGGAGATATGAACGAGTGTTTGATAGCCGATATGTTAGTTGAATGTTCTCTTTCAGAGATGGCATCTTTTA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BLAST of Moc11g07170 vs. NCBI nr
Match: XP_022139751.1 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2478.4 bits (6422), Expect = 0.0e+00 Identity = 1305/1307 (99.85%), Postives = 1305/1307 (99.85%), Query Frame = 0
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Match: XP_038898452.1 (uncharacterized protein LOC120086087 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2217.6 bits (5745), Expect = 0.0e+00 Identity = 1171/1307 (89.59%), Postives = 1224/1307 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZYV9 (Symplekin OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=sympk PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 233.0 bits (593), Expect = 1.9e-59 Identity = 180/610 (29.51%), Postives = 298/610 (48.85%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92797 (Symplekin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYMPK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 228.0 bits (580), Expect = 6.1e-58 Identity = 184/607 (30.31%), Postives = 298/607 (49.09%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80X82 (Symplekin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Sympk PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 227.3 bits (578), Expect = 1.0e-57 Identity = 182/607 (29.98%), Postives = 297/607 (48.93%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8MSU4 (Symplekin OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Sym PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 6.5e-44 Identity = 111/312 (35.58%), Postives = 178/312 (57.05%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q01329 (Pre-tRNA-processing protein PTA1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PTA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 48.9 bits (115), Expect = 5.0e-04 Identity = 33/109 (30.28%), Postives = 57/109 (52.29%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKE2 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2487.6 bits (6446), Expect = 0.0e+00 Identity = 1305/1305 (100.00%), Postives = 1305/1305 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CFX6 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2483.0 bits (6434), Expect = 0.0e+00 Identity = 1305/1306 (99.92%), Postives = 1305/1306 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CIR7 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2483.0 bits (6434), Expect = 0.0e+00 Identity = 1305/1306 (99.92%), Postives = 1305/1306 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CDN2 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2478.4 bits (6422), Expect = 0.0e+00 Identity = 1305/1307 (99.85%), Postives = 1305/1307 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQF9 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2189.8 bits (5673), Expect = 0.0e+00 Identity = 1152/1306 (88.21%), Postives = 1215/1306 (93.03%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. TAIR 10
Match: AT1G27595.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Symplekin tight junction protein C-terminal (InterPro:IPR022075); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HEAT repeat-containing protein (TAIR:AT5G01400.1); Has 593 Blast hits to 297 proteins in 111 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 139; Fungi - 49; Plants - 57; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 345 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 831.6 bits (2147), Expect = 8.5e-241 Identity = 494/958 (51.57%), Postives = 653/958 (68.16%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. TAIR 10
Match: AT5G01400.1 (HEAT repeat-containing protein ) HSP 1 Score: 667.5 bits (1721), Expect = 2.1e-191 Identity = 488/1341 (36.39%), Postives = 718/1341 (53.54%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. TAIR 10
Match: AT1G27590.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3453 (InterPro:IPR021850); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein (TAIR:AT1G27570.1); Has 109 Blast hits to 109 proteins in 38 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 65; Fungi - 4; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 285.4 bits (729), Expect = 2.3e-76 Identity = 142/239 (59.41%), Postives = 186/239 (77.82%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.1 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 1.6e-69 Identity = 151/340 (44.41%), Postives = 215/340 (63.24%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07170 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.2 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 6.3e-42 Identity = 123/361 (34.07%), Postives = 182/361 (50.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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