Moc11g06650 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATGCTTCGATCTCCATCTCTCTGCCATTCCTCTGCTCTTCACCTTCCTCTCTTTGCGTCCTGCACCGGAGGCTCTCATTTCCTTCACTTGCGGTACTCTTCATCAATCTAATGTCGTTCTATCGATTTAGTTTTTTCATTTTATTTGCTTAATTTGTTGGACAGATTGAAGGCAGGGAAGCGAGCGCTAGGAAGCAGCTGCCGGGAGATTTCTGGTGAGGTATGGTTGTTAACGAATCCGCTCTTGTGTCTGCTTGCTTTCAACTTTTGAATGTCTCGTGTTTGCGAGTGACTTGGCCGAGCTTTCTGCTTAGGTTAGACAAAGGAGGGAGGTGCCAAGCATTGCGTTGTAACTGCGTATGCTCGCCGTGATCAAGATCGCGTGTTAGAGGTCCGTACTTGTTCATTGTAGACGTGTTTGTTTTTAGTAAAAATTTTACTTCCATACATCTCTTGCGCTGTCAGTAATACGGAGGACAAATTGTTGTTTGAAAATTAAAAATCTCATTTGCTGTGTTATCTGGTCATCTCAGACAGAGAAGAGCTTAACCGTTAGGTAGTTGATCAATTATGAGATCTGGGAATAGAAATAAATTCGGTGCCAACGTGGCATTTTATTTGTTGATGTGATAGAGGAACTGATGTCTCTCTTTAACAAATTGTTCTTCGACAATCTGATTGCCACATCCCTGATAAGTTGGAAATGAATGTAGGATATCGACCTTTTAGATGTTGCGGACCATCATTCTAGTCAAGTTATTCTCCATCAGTATTGATTAACTGATCACTTTATTTTCAGATCATGAAGCTTTTGCCATTTGGCCATCGACTAGTTTAATGTGCCAAATAAGATTCCACTGTGACTTTAAAATGCAATTTATTCCAACATTGATAAGAGAAATTGGGATCTTTGTAACTTTTCGTTCATTATATGTAACAATGCAACATCCCTTCATCTTGTTCGAAGTCATTATCTGTTCTTGGTTTTACTTAAGGCCAAATATCTATTATATTGAAAGAACGAACCAAGAACGAAATATCTCTTATTTTGTTTGAGTTTTCTTATGGGTCATTTAGCAAGAATGAAATCAAAGAATATTCAATGATGCAGAAACGCTACTTCTACCGGTTTTTTTGATGCTATAGTATTTTTGGTTATTTCTTGGTGTAAATGTCCCCCTATTTAATTTCTATAATATTTCTTCTCTCATATCCAATTGGGAGAAGTTTTCCCCAATTATAATTTCATATCATCAATAAAATTATTTCTTATTAAAAAAAAATTGCCTGACAACGTTGTAGCAATCCATTTAACACGACCTGTGGTTTCTTTTTGCAACATCAGCAAGAAGCCCCTGAAATTTTGGACACTGGCCCAATGTTGAAAATGTTCCCAGGCGAAGCATTTCCCTTGGGTGTATCAGAAGTCGATAATGGGATCAATTTTTCCATTTTCTCAAAGCATGCTACATCTGTCACACTTTGTTTATCACTTCATGAGAGGTGCGTTTCTAATTTGCAATATGTAATGGGACAAAATGCCAATTCTTAACTTATTAATTTAAATTTTTGGTGCAAATGCACTTATTAAGATATTAACTTGCAATATGTAATGGACGTTTTACATCTATGGACAACTTCCACTGGTCTTGCTGGCTTGGAGTTGAAAGGATGTGATACTTGGGATACTAAAGTTATACCAATTGAAGGGGCCTCTACCTTTATCTTCAACATAACTTTGCATGAATCTCACGTGTTTTTCTCTCTCTCTTTCTTGGTTGAGGTTGTCTTCTTGAATATTCATTAGATTGTTAGTTTAGTAATATCAGCAATTTTTATATCTTTTTCCTGTTCATTCTTCCAACTTCAAGCTTTTGATGGTAACGTTTCTTGGCCCTTTCAGGATTGATGATAGAATGTTGGAGTTCAAATTGGATCCTCACGTCAATAGAACTGGAGACGTTTGGCACATTCGTGTCCAGGTTGACTAGGAAAAATATATTGCTTAACTTTTGCAGTACCGTTGCCTTATTTATTTATTTATTTATTTTCTTTGCAGTTATCATCCTCGTCACTTTAACTTATTTGAAATCTCATGTTATATTTATTTTTGGTATTTAGAGGGTAAAATGCATTGTTGATGGGTATTTATTGTTTTGTAACATGTCGGATCAAATACTTTCTGATCTCGTATTATATTGCTTGCTGGAAATGAGAGGAAAAACTCCTAAAGCATGTATTAAAAATTGCCTAAAAGACTAATGAAGTCACTTGGGAGTAGAACTAATGGAGTCAATTATGCAGGCATGGTTGGACAGTAGTCCATACATGACTTGCACCACCAGAATAAAAATGTGTATATAATTTATAATCTGATTAGTTTTCTAGCTTGCAGTTTTGACTAATTGGTTTCAAATTTTACTCTTATTATTATCTATGTGATCTGTACAAGAAAGCCATCGTCTTCTTTAATTCTGGAAAGTTTTAGTGTATTGATCGGCTTGGTGATTGGATTGACTTTACAAACAATTCCTTTTAATTTTGATCCTCTCTAGAACTATGGAATATTGCTTAGAAGTTTGTTTTAAAAATTAATATTTAATTCTGTGTTGTAGTTCATATCACATGTGGCATCAGTATAGTTTTCGGGGTCATCTTTTGTTGCCCCTCAGTTGGGCTTTGCATGCTCCTTTTAGTTTCATATTTGTTAACGATAGTTTACTGATTTTAAGATGCAAATTATTAAAATTACTTGTGAGATGAACAATTTTGTGGTCATTAGCTTTTAAGATGGTATTATACTTGCATGCATGTGATCACACATAGTCACCTGTCAAAAGAGTTTTTTTTTTGAACAAGATACGAACTTTTCATTGATAAATGAAAATGAACAAAATTGTTCAAAGATACAAACTCCCATAGGAGTGAAGGTACAGGAAATAAATAAAAGTAAGCATTAGAAGAAATAAAAACCATAAACTTAAAGAAACCTCCTTAAAGGGGAATTATAAAAGCCTCCAAATTCATACAAAGCATACTAGGAGAATAAGAAAAGAAGAGATCGGAACGAACACACCATTGGGAGGCTTTGAATTTTACGATTGAGAAACACTCCATAGGAGATCGATTCTTGCCTTCAAATATTCGTTGATTTCTCTCAAACCATAATTCGGAAAGAAGAGCTTTTATTCCAAAAGCCCAAAGCAGATTAGTTTTAGAGCTTGCTTGCAGTCCACTGAAAAGCTGAAAAATGACTTGAGGCGCCTCCAGATCCCACACCCATGAAACTCCAAACATAGATAGGAATTTTTTCCAACAGACCACTGCATAGCTACATGAGAAGAAGACATGTCTTTGGGTTTCCCCACTTGCTTTGCACAGTAAACAACATGATGGCTTTGCACAGTAAACAACATGATGGCATTTCTACTCCCAAGTGGCTGCATCAAAGAATTGGGCATTTTCTTTTGTAATGTCTCTGAAGTGTTAACTTTGCCCATTAGAAGAATCCAAACCATGAAATTAACTCTCTTTGGACAAAAAGAGTTCCATAGAATAGGTAGTACTTGAAACACAGATACGCACATGCACATTGACCTGGACGCATGCACCAGTTTTCCTTTTTGTTTTTTATTGTGGGGGTTGGGGGCAATCTGGAGAATGAGTGAGAACTTCTTTAAAGTATGTCTTAAGTAAGTGACATGAGATTTAGAGTGCGTGCATCTCAACGCTTTTCTTTGGTTACCTAGCAACAAAGAATCTGTCATTTTCTTTTCGTTGTGATCTTGGTTAGTTAGATAGATCCCCCTAGACCTTTGTTTGAGCTTGACTCCTTTTTTTGTTTGGTATACATGTAAAAGAAAATGATTGAAGCTTGTATTTTATAATTTTGATACTGCTCTTTGAGCAGGATTTACCTCGGAGAAATGTCCTATATGGTTATAGGATTGATGGTCCTCAAGGTTGGCATCATGGGCATAGATTTGATGATAGGATCGTTCTTTTAGATCCTTATGCAAAGTTCGTTGAAGGTCGCCGATATTTTGGGGGTGAAAATAAGGCATCTGGCTTTCTTGGGACTTATGATTTTGGTAGCATGCCTTTTGACTGGGGAGATGACTATAAGCTTCCTAATATCTTAGAGGTAAAAATTTCTTATCTGTTGCTAGAATAATTTTGAGGTGCATTCACAATTATGTATATAAGTATATCTTTTAAATGTTTAGGATGTATATTTTACATGAATAAATGCATGAACAAACATGTATATTTTACATGAGTAAATGCATGAACTCATTCGTCATACCATCGTTGTAAAATATAAGACAGATTAAGGGAGAGGATACATGTTGGCTTTTCTTTTCCCAACTAAATTGCGACAAGGTTAGATTTGAGAACTGGGCTGACTTTGCTTAAGACTAACACCACAGAGTTCATTTGGAGAGCTTAGCTTTTGTCCTTTCCGCCAATCGTGTACCTTTTTAGTTTTCAGAGGACTCGAACCACCTTTTGTGTCTTCTATTATGCAACTGATCTGTAGTCTATGATATAGTAGACTTTTGGCATAAGTTGTTATTATTTTTCGTATCCTTTTGTATTTTCATTTGTGACAATGAAAACTAGTTTGTTTCTTTGTTAGCTTTGTCAAATAAGTTTTACCGCATGTGAAGTCTTTCATTGCTTCTCCAACATGGATTTAATTTTTTCTTTAGAATATTCGTATTTATGTTTTACACTTTGACATACTATGTATTTCCGGACTTATTTGCAGAAAGATCTTGTAATATATGAAATGAATGTCCGCTCATTCACAGCTGATGAATCTAGTGGCCTGGCTTCAAGCACACGGGGCAGTTACCTGGGTGTTATTGAGAAGGTAGAGATTATATTGTTAAAGCAGAGCGCTGGGATTGTCCATGCTTTTCTTTTTATCCGCCTTGTGGGACATCAAAATTTTTTCATTTAGCAAGAACCCAAAGTATGATTTATGGC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BLAST of Moc11g06650 vs. NCBI nr
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BLAST of Moc11g06650 vs. NCBI nr
Match: XP_022131352.1 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1449.9 bits (3752), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/685 (100.00%), Postives = 685/685 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. NCBI nr
Match: XP_022975928.1 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1424.5 bits (3686), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/772 (87.44%), Postives = 717/772 (92.88%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. NCBI nr
Match: XP_022936809.1 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1423.7 bits (3684), Expect = 0.0e+00 Identity = 676/774 (87.34%), Postives = 717/774 (92.64%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. NCBI nr
Match: XP_023535183.1 (isoamylase 3, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1420.6 bits (3676), Expect = 0.0e+00 Identity = 674/772 (87.31%), Postives = 716/772 (92.75%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9G434 (Isoamylase 3, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ISA3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1096.6 bits (2835), Expect = 0.0e+00 Identity = 515/698 (73.78%), Postives = 588/698 (84.24%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D0TZF0 (Isoamylase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ISA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 3.7e-172 Identity = 343/769 (44.60%), Postives = 446/769 (58.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04196 (Isoamylase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ISA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 600.9 bits (1548), Expect = 2.0e-170 Identity = 333/711 (46.84%), Postives = 429/711 (60.34%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0A4Y5 (Glycogen operon protein GlgX homolog OS=Mycobacterium bovis (strain ATCC BAA-935 / AF2122/97) OX=233413 GN=glgX PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 461.8 bits (1187), Expect = 1.5e-128 Identity = 302/735 (41.09%), Postives = 397/735 (54.01%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BQ05 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004593 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1619.0 bits (4191), Expect = 0.0e+00 Identity = 770/770 (100.00%), Postives = 770/770 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BQS3 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004593 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1449.9 bits (3752), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/685 (100.00%), Postives = 685/685 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IKM9 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476487 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1424.5 bits (3686), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/772 (87.44%), Postives = 717/772 (92.88%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9D1 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443282 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1423.7 bits (3684), Expect = 0.0e+00 Identity = 676/774 (87.34%), Postives = 717/774 (92.64%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CS22 (isoamylase 3, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503684 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1415.2 bits (3662), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/769 (87.26%), Postives = 709/769 (92.20%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. TAIR 10
Match: AT4G09020.1 (isoamylase 3 ) HSP 1 Score: 1119.4 bits (2894), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/774 (70.03%), Postives = 622/774 (80.36%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. TAIR 10
Match: AT2G39930.1 (isoamylase 1 ) HSP 1 Score: 600.9 bits (1548), Expect = 1.4e-171 Identity = 333/711 (46.84%), Postives = 429/711 (60.34%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. TAIR 10
Match: AT1G03310.2 (debranching enzyme 1 ) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 1.3e-103 Identity = 254/706 (35.98%), Postives = 359/706 (50.85%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. TAIR 10
Match: AT1G03310.1 (debranching enzyme 1 ) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 1.3e-103 Identity = 254/706 (35.98%), Postives = 359/706 (50.85%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g06650 vs. TAIR 10
Match: AT5G04360.1 (limit dextrinase ) HSP 1 Score: 113.2 bits (282), Expect = 9.1e-25 Identity = 80/276 (28.99%), Postives = 129/276 (46.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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