Moc09g32620 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc09g32620
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr9: 24595749 .. 24598999 (-)
RNA-Seq ExpressionMoc09g32620
SyntenyMoc09g32620
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATCATCCACCGGCGACGGCGGAAGAACCTCCGATTTCCGAACAGAGCTGGAAATGCAATGCGAAAGCGAGAGAGAGAGAGAGTGGGAGTGAGGCGGAGCAATCCAAAGTCCAAAAGTGCGAAAAGGTTCCTCGGAATCCGTTCCATTACTTTGCATGAATGGTAAAAAAGAGAGAGAAGAGAGAGAGTAGGCCTAGGCCAGTCGCGGCAAAGGGGCAGGGGATGTAAATGAGGGAGAAGGGGGAGGGCAGTTTGGGAAATGGAGGGGTGGGAGATCAGACGGCTGTGATTGATGTGATGTGAAGTGAATCAGAGGGTCCAGATGATGAAATTGATGAGGTAAGCGTGAGAACGGGCACGTGGATCAGAAATCAGTGGCGTTGTTGGTTTTAGTTGGAATTGGTGAGGACTGAATCAGTAAGTTTGTCTCAGTTTAGTTTCTTTTTAGTTGTTTGACTTTTCCGAAGTTTGAGCCAACTTTTCACCGCTTTGTAATTTTTTTTTTCTTTTTTGCTTTTGGTTTAAAATTACCGTTTCGGTCTTCTGTACTTTTTTATCCATTCTATTTTTGTTACTGTACCCTATACGTTTAAATGCCCAAAATCAGTTACTTAGATTTTTAATAAATCTTTTGAAATAGTACACTTTTCCTATCTCTCTTAAGAAGTGATTTTTAAATATTGTTGGAGGGTAAAAACCAATATGACATATGAGTAACCGCGTCGGTTTGGTAAGCTTGATAAAATTTGTACATTTCACATAACAGGTCCGACCTACTAAAAAATGGTGATGTGTAGAAGTCTACAAGATTAACCAAATCTCTCAAGTCTCACTTGATTAAGCTAAAGCGACTTCGACCTCAAGTCCGACAGTCTTTAATCGTCCAACCTCCTGTCGAGACGGCCATGACAAACTTGTACCCCACTTCACTTATTAAAGGAACGTCATTTCTACTATTCACCTATGCAATTTTGTGTCTAGCTGATTTACTGAGCTTGAACTCTCACTAACTTAAATTTCAGTTTCCTTTTAGCAAGTCACTCCTTGAGCACATCGTTTTTCCGTAACTCACTTGAGTTTATTGGAAGCCAACCTTCGATAGTTCGATAGAATTTAGCAATATATATAACATGTTTTCTGAAAGTAATTTTAGAAAAATCACTAATAGAAACCATCGATAGGAACAAGAATAAAATTTTAAATGAATTGACTTAGCCTAAAATTTAAAATTTAAAGAAAAGAATTGCCCAATCTTTGAAGTGGGTAAGTTCATTTCTCTCTTAAATTCTCATCAATTACATTCTCATTTAGTGAATAGATACCTTTTCAAATAATTATCTTACAACTTTTGTATTTTTCTCTTACCTAATTAATTGTTTCACCATTTTATTTTTTATTTCTCTAATAAAAAATTATCACCTTTTATTAGTTGATGTTATTTTATTATAACTATTACAATTTTGTATTTAATTTACTTCACTATTATAAATTAATATCAATAAAATCATTAAAATATAATTTATTGTTATTAAATATTATAACAATATATTTTTATATTAATCATGGTCGTGCTATATAGTTCAATTTTATTTTAATTATTTATTATTTTTTAATTTTAAATAAATTGTTATAACAAAAAAATTAATAATAAAAAATTATTTTAATTAAAAGTAATATTAACACACTTTCTAGTTAATGTATTTATAATTAGCTAGAAATGAAATACGAGTATTCTAGAGTCCATGGTAACGTTTCCTTCCTTGTTTTTCGTTTTAGTTTTATTAAGAAATGTAAACATTTAGCAACTATTTATATTTTATATTTCTAATTTTTTAGAAACATTCTTAAAATTGCATAAATTGAAAAAAATCGAGTTTATTACTTTTGTTCTAGTTTTCAATTTTTTCAAGATATAAATAAAAATATCGTTTTATCATTTTTTACTTATAAAATACATAATAAATATAAAATATAATAATAACATAAAAACGTGAATATAAACCAAAAAAATAATTTTCATACAAAATTTTTCCTTTTTGAATCTATAATTTAATGGTGACCTTAATTTTTAAATAAAAAAAATATAAAAAACAAGAAATAGCTTCCAAATTCAATTGTGTTTTTCTTTATTAAAAAATAGGAAACAAAAAATAATAAAATACAAGATTACCAACCAAGTCTCAAGTTTCTTATTTCTAGTTTTTTTTCAAAACATAAATAAAGGCATTACTTTATCGGCTTAGAAAATATATAATATATATTTTTTAAAAATATATATGACAAAAAATTTCAATATTTAATTTAAAAGTTTTTTATTTTTTTAATTTAAAAAATAGAAAACCTAAAAAAAAATAGAAATGAGAAACTATATAGGTGAAAATCTTAGCATTTCTTGCTAAAAACTTTTTAAATTTTACCATTTTACCATTTACAAAAGTTATTTTTAGTACAATATGTAGGGTAAAGATTCAAATTCATAATCTCTAGGTAGAAGATAGATGTCTTAACCAGTTCAACTATGATCAGATTTACATCATCTACGTATGGTTGTAAGAGAGATATCTTAATTAGTTCATCATTTACGTATTCATATATTTTTATTTTTATTATATTTTCAATTTTCACTCACTTTTAACTTCAAAATTAGTAAAACTTGTTAGGTTCATTCTTAAATTCTAGGAGCAGCCTAATTAATTAATGTTTAAGAACATTTTAAAACGATTTTCATCATTTTATTTTTATTACCTTTTATATTAACATTTTAATAACATTTTATTCGATATAACTTTGTTATAAACATTTGTTTTAGAATATGGGATTATAATTGTTACTATTTCTCCTAATCTTTTTATCAAATAATTTAAGGGAACAAAATATATTGAGATAGTTTACAACTAATTGATTTAGTTTGTTACTTATGTCACGTTGTATTAGTGACACATGTATTTAAAAGGACATCTGTATTCGTTTATACATTTTCCTCATTCCCATCTTAATAAAATACAATTTACGATTTAAATAGTTTTATTTTAAAAAGTTTATCAATCAATTATCGACATAAAATTATACATAATTGAAATAATATGTATACTTGAATCATTATAGTTGGTGGTCAAAGGGGCACTCCACCCAAGGATCAGGTACACAATTTCCTCCGAGAACGACTTGAACTTGTAACTGACTTGGGCGTTGGAGTGTTTGTTTCCTGTGCAGGTTCACTCGAATAGCTCGGCAGCTCGTCCTCGTTAG

mRNA sequence

ATGATCATCCACCGGCGACGGCGGAAGAACCTCCGATTTCCGAACAGAGCTGGAAATGCAATGCGAAAGCGAGAGAGAGAGAGAGTGGGAGTGAGGCGGAGCAATCCAAAGTCCAAAAGTGCGAAAAGGTTCCTCGGAATCCGTTCCATTACTTTGCATGAATGTGAATCAGAGGGTCCAGATGATGAAATTGATGAGGTTCACTCGAATAGCTCGGCAGCTCGTCCTCGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGATCATCCACCGGCGACGGCGGAAGAACCTCCGATTTCCGAACAGAGCTGGAAATGCAATGCGAAAGCGAGAGAGAGAGAGAGTGGGAGTGAGGCGGAGCAATCCAAAGTCCAAAAGTGCGAAAAGGTTCCTCGGAATCCGTTCCATTACTTTGCATGAATGTGAATCAGAGGGTCCAGATGATGAAATTGATGAGGTTCACTCGAATAGCTCGGCAGCTCGTCCTCGTTAG

Protein sequence

MIIHRRRRKNLRFPNRAGNAMRKRERERVGVRRSNPKSKSAKRFLGIRSITLHECESEGPDDEIDEVHSNSSAARPR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 56..77
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..40
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 18..34

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc09g32620.1Moc09g32620.1mRNA