Moc09g27470 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc09g27470
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr9: 20557968 .. 20562227 (+)
RNA-Seq ExpressionMoc09g27470
SyntenyMoc09g27470
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCTGTCAGGCCCCCAAGTCGGTTGTCGGGTCTAAGGTCGAAATCCTTACGTCGGCGGGGTGATGTTGCTCCCCTCACCTTGGTAGTTGGTCAGGTAGGTATGTCTAGTTGGTTTAGATTTAGAGTTCCACTTTCAGTTACTCCAAACTGAGTCCACGTGTCAGTGTTAATTTTTCCTCCCACATTAGCTCCCTCTTAGATAGATCCAAGCTCCAACTTGACAAAGAAGAGGATTTGAAGTGGATCAAGGTTGCGAGCTGTTGTGCACCAAGCTGAGATATGAATCCAACTGTTCTGATAGAAGGTAGAAGGTCGCCCTGACAAGGCGACGCATTTGAGTAGCGAACCGCCGATTGATGAGATTATTTAGGCCGCTCTTCGAATGCCATATGGACGGTGGTGATCGAATTTTGGGTCCTATGTATAAGGTACTTAGGTTTCATTTCTCATGCTTTTAATCAGATTTGCTCTTGAGCCGAGCTGAGCTATCAAGCACTCCCCCTAAAAGTCGATCTTCTTTCCTTTAGCTTTTCCTTTATTTAGTGGCCTTAATAGGCTTGTCTAGAGTAGATAGCGATAGAAGTAGCTCAAGGAATGGTAGGTCTTCCAGTAGCTCGTCGTCGAGCTATTCTAGCTTAGATTCAACAATCATTCCCAGGAAGAGACCTTTAGGAGTGCTGACTATCCATCCAAGCTCGATAGGGGATGGATTGACTTTATTAGGGCTAAGTATGACATTCATTCGTGCATAGGCATGAGGTACCCTGTTGCAAGGTGAGAAGTTGGTGGAGCCACTTGCTAGACACGTCGAGTTTTACTTGAAAATGTTTGAGTTCGGCATGCGCCTTCCCGTTCCAGCTTTTGCTCAAGAATTTTTTAATAATGTGAACTTAGCTCCAACTCAGCTCCCTCCCAATGGATGAGGGATGTTGTATGGACCCTACTACCTCCAGTGGAGGGAGTGTGAGAGGAAAGTGAAGGGATCAAATCTCGCAGCGGAAACGCGTGAACGCTTTTACTTCGATTTTGTTTTAGAAATACAACAAAGAAAAGACAAAAACATTATTAAAATGAAGTAGTGAAACATACATTTGAACACACTTATTCAATGTAGACACCAATGCCACCAAAAAGCCTTCCCCGCTATCCTCTAGATGTTAAGAACTCGGTTTGTGGAAACCTTTCTTAAAACTGGGAGGGAGATTGAGAGAGAGACTTTATTTTAGACTTTATAAACTCAAAACACCAACCAAAACCAAAAGGAGAGAACCTCCCTTTTAAAGGAAGGAATGGTACGGCACTCACCACCTTCCCACTTCCCAATATTTATGTTGGGGATTGCGAGAGATTTTTTGTTTTCTTTTATTTAATTTAACAACTAAATTAAATAATTAATTTAATTAAAACAATTTAATTAACTTAACAATTAATTAAATCAAATTTAATTAGTTATAAAAAAATTATTAATTTAATTTTAACGAAAATAATATAATCAATTAATTTAATTAAATCATATTTAATTAAATTAAACTTAAATTAATCAACCATATTAAAATCAAATTCAAATATTCATCCCTCTCATGATTTTGAATCCAATTCAAAATTAACTTTATATCATAATGCATGAACGTACACTATATTAATTGCATCTCATACAATTAACTTTAATTCTCTTTAACAAATTTGAACAAGTTAAATTCTTTTCAATACTAAATGTTCTTAAGTATATTTTACGAGCTAGTAGAAGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATACGAGATTAATTGATTAAACTCATTAATCATATTAATCATCATTCGTTAACTGTTGGTCACTCCACTAAAGACTCACAGTTTCACTCTTCTCACTGTAGAGTATTTTGCATCCATGGATATTGACCATTAACAGCAAGTCAATCCTTCACGAGTGTTCGTAACCACAGCTAGGTCAAATAACCGTTTTACGCATATGTTACATCTTGTACCTTAAGTACTGCTGATCCTCTAATGAACAACTCGATTATGGTCCGACCAATAACCAAAAGTTCCTTTCAGGCTAGTGGGAGGGTGGGGTCCCTTGTTCAAGTCCTGGAGTTAACACTAAAGAGAACATTCATCTACTCTCCTAAAGTCGGGGAGGAGTGAATTCCATCTTGTGAAGTTATGTTCCCAGCTCCCCATTCGATCTTGTCCCCAAAATGGTAGGAATGTTGAGTCAGCGACTAAGGCCACCCTCACCCATACAAATCAAAGGACGTGTCCTAACAGGAATGAGTCAATAACTCACTCATGATTGAGATCGAGTTACCTGGTCATCTTATTGAAATATTAATCTATTAGCTAACGGTGTTACAGCTAAAGATTAATCATTTCGCGGTCTGGTCTTATACAAACTCATTATATAGGATACCCCCACTTGCATGTCTCCACACGAACAACCCAGATCAAGTCATTTGTAACTATTAATTACAAAGTCTGTCGTATCCATAGTGCTACTAAGATAAGGTGCCCAACCTTACCCATATATTATAGACCCTTTAGGTTAATACTGGAACATTATCCACTTGTATATCGAATATATACTGTATGTATATACATTGTATATTAAATATATATTTTATATCTATTATATATTGATCAAGTTACATACATAACCTCAGATGTTAGTATAATAATAGACCGCGAAATAATTAATCTTTAGTTATAACATCGTAAACTAACTAGATTAATATTTCATAGGATAACCAGGTAACTCGATTTTAATCCTGAGTGAGTTATGGACTCCTGCCTATAATGGATCGTCCTTTGATTTGTATAGGTGAGAGTGGCCCGGGTTGCCAACTCAATAATCCTCCCATTTTGGGGACAAGACCGGGTGGGGAGTTGGGAACATAACTATGAAATATGGAATTCACTCCTTCCTGATAGGGCAAGTAGATAAGTGTTGCCTTAAATGCTGACTCTGGGACCTAAACAAGGGGCACCACCCTCTCACTAGCCCGAGAGGGACCTTTGTTTAATGGTCGGACCATAAAAAGATTGTTTATTAGAGGTTTAGTAGTATTTAAGGTGAAAGAGGTAACTTAGGGGTAAAACGATAATTTGACTCAACTGAAGTTATGAACACTTGTGAAGGATTGACTTATTGTTAATGGTAAAAATCCACGGACACCGAATTTTCCACAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGGTCTTTAGTGAAGTGACCAACAATTAAGGAATGTTGATTAACATGGTTAATGAATTTAATCAATTAATCTCGTATCGTTGAGCTTCTGATTTGTAGGTCCATTAGGTCCCTTTTCTAGCTCGTAAACGATAGTTAAGGACATTTAGTTTTAAAGAGAATTTGAATTGTTCAAAGGGAATTAAAGATAATTGTATGAGATACAATTAATATAATATATATTAATACATTATAAAGTTAATTTTGAATTTGATTCAAAATTATACTATATTATCATGAGAGAGTTATTTGAATAAGATTCAAATTAAAATTTAATATGAATTGGATTCATATTAAAATTATAGGTTAAAATTAATGTGCATATATTAAAACCATAGGGACGAAAAGAATTATATTCAAATTTGATTTAAATATATGTTATTAATTAATTATTAGTTTTTTGAATAATTAATTATATTAATTATTTCATTAAACTAATTATTAATTTAATTTAATTAATTAATTAATTTTATTTATTTGTTTATTTTTAACTAATTAATGACTTCCTACTCTCCACCCTTCTTGCAAGAGAATAGGGAAGCGATGAAGTGGGTAGCTCTAACCACCCCATCATTAAATGCATAGAAAAATTGCATTTATGGGTTCCCAATTTTTTATTGCTCCGTCTCTCACCAAAATATTTCCAGTGTTCTTCAAAATAAGGTTCCCACATAACCGAGTTCTTGACGTCCAGAGAATAGCAGGGAAGATCTAGTGGTGTCCTTTTGGTGTTAGAGAGGAAAAGAAAAACTTCAAAGGTAAAAGGCTTTTCCCCTATTTTTTATTTCTCCGTGTTTCAAATTTCAAAGGAAAATTCAAGAATACGTTCTACCGCTTTCGCTTGGGATTCACATCCCTTTTAGCTCGGGAACCAATTCTTCTCCAAAGAAGGAAAAGAAGAAAAAGGACCGGAAGGTGGAGGTCGCCTCCATCAAACTGGAGAAAGTGGAGTCGGTCTCTAAAAGAGCTCAGATTGAGGCTTATCAAGATTACAAACTTCACTTCTGA

mRNA sequence

ATGGCTGTCAGGCCCCCAAGTCGGTTGTCGGGTCTAAGGTCGAAATCCTTACGTCGGCGGGGTGATGTTGCTCCCCTCACCTTGGTAGTTGGTCAGGTAGGCTTGTCTAGAGTAGATAGCGATAGAAGTAGCTCAAGGAATGGTAGGTCTTCCAGTAGCTCGTCGTCGAGCTATTCTAGCTTAGATTCAACAATCATTCCCAGGAAGAGACCTTTAGGAGTGCTGACTATCCATCCAAGCTCGATAGGGGATGGATTGACTTTATTAGGGCTAAGTAACTCGATTTTAATCCTGAGTGAGTTATGGACTCCTGCCTATAATGGATCGTCCTTTGATTTGTATAGGAAAATTCAAGAATACGTTCTACCGCTTTCGCTTGGGATTCACATCCCTTTTAGCTCGGGAACCAATTCTTCTCCAAAGAAGGAAAAGAAGAAAAAGGACCGGAAGGTGGAGGTCGCCTCCATCAAACTGGAGAAAGTGGAGTCGGTCTCTAAAAGAGCTCAGATTGAGGCTTATCAAGATTACAAACTTCACTTCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTGTCAGGCCCCCAAGTCGGTTGTCGGGTCTAAGGTCGAAATCCTTACGTCGGCGGGGTGATGTTGCTCCCCTCACCTTGGTAGTTGGTCAGGTAGGCTTGTCTAGAGTAGATAGCGATAGAAGTAGCTCAAGGAATGGTAGGTCTTCCAGTAGCTCGTCGTCGAGCTATTCTAGCTTAGATTCAACAATCATTCCCAGGAAGAGACCTTTAGGAGTGCTGACTATCCATCCAAGCTCGATAGGGGATGGATTGACTTTATTAGGGCTAAGTAACTCGATTTTAATCCTGAGTGAGTTATGGACTCCTGCCTATAATGGATCGTCCTTTGATTTGTATAGGAAAATTCAAGAATACGTTCTACCGCTTTCGCTTGGGATTCACATCCCTTTTAGCTCGGGAACCAATTCTTCTCCAAAGAAGGAAAAGAAGAAAAAGGACCGGAAGGTGGAGGTCGCCTCCATCAAACTGGAGAAAGTGGAGTCGGTCTCTAAAAGAGCTCAGATTGAGGCTTATCAAGATTACAAACTTCACTTCTGA

Protein sequence

MAVRPPSRLSGLRSKSLRRRGDVAPLTLVVGQVGLSRVDSDRSSSRNGRSSSSSSSSYSSLDSTIIPRKRPLGVLTIHPSSIGDGLTLLGLSNSILILSELWTPAYNGSSFDLYRKIQEYVLPLSLGIHIPFSSGTNSSPKKEKKKKDRKVEVASIKLEKVESVSKRAQIEAYQDYKLHF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 38..62

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc09g27470.1Moc09g27470.1mRNA