Moc09g13950 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc09g13950
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr9: 11898261 .. 11905272 (+)
RNA-Seq ExpressionMoc09g13950
SyntenyMoc09g13950
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTATTTCTTGCGTAGCTCGGCTAGCTTGCCTATGGAGCAAGTTGAAGGTGGAAGCTCGACTAAAGGAGTTCTAGAGCTAGAGGCTACATTGGGATCTCCAGGGTACCTCAAAGGTTGTCATCCGATGGAAACAGTGAGCAAGATGCGATAGAAACAATGCTTGGAAAGCGATTATAGTACACGAAAGGGATGGGGTACGGTCCAAAGCCACCAAGTCAGAAACAGGCAGGAGGATACTCCTAGGAATATGTTCATGCTTTGGAGGCTAGACTGGCAAAAGATGAAGAGTTATTGCAAACTCAACGCCAGGAAACCCAGAGGTTGTTTGAAATGCAACGTCAAGAGTATGAAAGAAGGTTTGACAGTATGGAAGAACTTTTTCGAAGATTTACTGAAGGAGGAGGAAGTTCATCGTTGAACAAGGTAAGAAAAATTGTAATTTATCTATGTTTGAGTTTGTGTATTTGATAAAGTCTTAGATTTTGAGTATGATATTATTTTGATATTGTTCTTGGATCTTGATACTTTGATGTGTTGATTGTGGATGTTTTTGCTTGAACAATTGTTGGGAGCTTGAAACTTTGATATTGTAGTTTGATGAGGTGGAGTGTGCATTTGTCGGGATGCATTGATGTTGGAGATTGAAATGTGGGTATGCATGTTTTTTTTCTTGGGGGGGGGAGGGTGGGGGGTTGGGGGTGGGGTATTGATAAATTTTTGTTGGAGGTTGTGCTTTGATGCTATAGTTTGAAGAGTGGAGTATGCATTGATCTTAGAGATTGAAGAGTATTGAATCTACTTTTGCTTTAAATGTTGTTGAAAGTTTGAGACTTTGATGTTGTAGTACGGGGGTGGAGTGTGTGGGAACGGTGTATTGACTTTGTTATGAATGTGCATTTGTATTGAATCTATGTTTGGATTTATGTATTTTGTGAAATTTTAGATTGTGGGTGTTTTTACTTGAACTATTGTTGGGAGCTTGAAACTTTGATGTTGTAGTTTGAGGATTTTGTAGTTTGAGGAGATGGAGTGTGCATTTGTAGGGAGGATGCATTGATGTTGGAGATTGAAATGTGGGTATGCATTCTTTTTATTTGGAGGGGTATTGATTTTGTTGTGAATGTGCATTTGTATTGAATCTATGTTTGGGTCTATGTATTTGGTAAAATTTTGGATTTTGAGTATGATATTCTTTTGATTTTATTCTTGGATCTTGATACTTTGATGTGTTGATGTGTTCATTGGGAGTGTTTTTGCTTGAACTATTATTGGGGGGCCTGAAACTTTGATGTTGTAGTTTGAGGACGTGGAGTGTTGTAGGAAGGGTGCATTGATGTTGGAGATTGATGTATTGACTTTGTTATCAATGTGAAGTTTATTGTTAGAGATTTAATTGTTAGATGATTATATGTTGTTTGTTTAAATTTGATGTTAGAGATTTAACTGTTGAATACCTATAATTATGTCGTTGGAACTTTGAATATTAAAGTTAGATATGCTATTGTTAGTGTTTTTTTTTTATGAATGATTGTATTTTTAGTTTGCTAATAATGTTGCTCAAATGCAATTATTTGTGCAGGATTGAAAACATGATCTTCTGTTGATCGTGATGCTTAAAGATCTGAAAAAAATATGTAACGATGATCTATATTACGTACGTTTTTCTTATAGTGAACATGTACCTTTCTTATTTATGTTGTCACATTGTACACATTATCTTTAATTTTGAAATTTAATACGATTTTATTTCACTTCTATTATCATTGATTATATTTTTTAAAATTTCAGGAACTAAGTAATATTGTAGAGTACTTTAAAAAGTTGGAGTTTTTATTTGCTAGCGACGAAATACTGAAAGCGTCGCTATATTTAGCGACTAAATTGCATAACGTCACAATAAGCAAATAACAAAGGGAATTAATGTATGAAAAAAAAAATTTAGCGACGAAACATTTTCACCACAAAACCAAACCAGTGACGATAACTAGGGATCTTACAATTTCCATTGCTTCAAGCGACGAAAACGTCATTTTCGTCACTGCAGTGACAAAATGCTTTTCGTCCCTGTAGTGACGAAACATGTTTTCGTCGTCGCAATGATGAAAACTCGTCGCATCACTGCAGCGACGAAAATAACATTTTCGTCGCGAAACTTTGTGACGCGCGTGTTTTCGTCGCTGACGTCCAATAGCGACATTTATTGAGCGACAAGACGCGCGACGTTTTATTTTTCGTCGCTGAACGTGTTAGGCGACAAAAATACTACTTCGGTGATGAAAGTATTTTCGTCGCCGAGTGTCATTTTTTTTTTTGTAGTGTACTAGACCCAGGCGATGAACCAGACGTCGAACTACTCATACTTTAGAAACTTCTAATCCTAAAGCTATTCGACGGAAAATGGAAAATAACTAACTTAGCTGAGGTCCGAGGTATTCAAAAACTCCAAATGAAACAATGACGCCAAGAAAATCCCTCTATTTATAGGATAACTTGGAAACACAAGGACCGTTCGATGAAGAGGAAATCAACGGCCCAGATTTCTCTAGATGACAGCTTGTATATGCAACGGTTGAGTTCTCGATATAACGAGTAGGGCTGACATTATCAGTGACAGCATACGGCAACACGTGGGACTCATTCCACCATAGGTACCTCAAAATACTTTGCTAAGTCGAGCTTCAACTCGCCGAAGTGGGGGCCAATGTTAGGCGTTGTTTATCGCCCGCCACGTGTCAACAGGAAAAAGGTATTCTTGTTTAAGAATATTTTGATCATGATAAGTTGTGCAAGTTTCCTTAGGTCGAAGTATGTTGCCGAGCTGAATTGCTGAATACGTTTCATTGGCCGACCTTGAAGGTCAGAGTCGACCTATGTAAAGATATCCACAGTGTTAAGAATCCCACATTGATAAAAGAAGGGACCTTACCTAGGTTTATACTGATAGTACATACTGATAACTCTCCAAAAGAGAGTTAATGAGGCTTGAAATTCAACATATTTTAGCTTAAGGTTAGCCACAAGATCACCCAATATAAACTTAGTGATGCCAGAAATGAATCAATAATTGTCATTCTTCCTAGCTTTGCGAATTCTATTATAAGTTCTAATTTTGGGTTATTAACTATGCTACAGCATCGCAATCAGAAAAAGTACAGAAAAGTAGCAAACTGACAGTGACAGTGACAGAGCTGTTAAAAAGGAGAATTACCATAGTAACTGTAGAAAACCTAGAAGTGAGAGTTGGGGGCCCATAAATGCTGTTTGTTGCCCTAAAACAAAAAGGGGTATAAAAGCATCATTAAAGGAAGCCACCAAAGGAAATTTCTTACATCAATCATCCCTCACTTCAAAACATCCTCCCAAGAAAATCTGTTTAGAAAAGACAAGAAGAAGGTGGAGTTCCAAACCTGAGCTAGAGCAAAGGAAGAGAGAAAAGACCATAAAGAGTTGAACCTTTCAGCTCTTTTGTTTTGCTCTTGCGCCCACTTTCTCTTTGTATCACTTCATTGATTTTTGTTTCTTTTTATTTTTCCCCATGACTATGCGTAGCTAAGCCTATTGTAAGGGGTAAGGGTTGTAAACTTTTTATGGAGCTAAATATTGTGCTGTTGATATTAATGATGAATGGGTTTCAATTTGTTGTTGTGTTTCATTTCATTTTCAGCATGCTTGATCATCATTGTTGAAATATCTCTTGGTTAACTCTTGGAAAAGTGTAATGAGGAGTGATAAACTTCAGCTTATGCTAGATTCTGCTTGTGTTAGAGAGTGAGTGCTTAGGAATAGGGCTCACCTCGCATGGCTATAAACCGCTTTTAATAGCTGTGTAAGTTTGTCCAGCAAAAATCTGGGAAACCTGGAAAGGATCCACGTCTGTTTGGCCAGTACTCACATTGTTAATGCTACAACATTGTTTAAGCAACCAAGGAAAAGACACACCTAAACCTTCCCCCTTACCTTGTTAACACGAAGTAATCAACCTTCCTCATTAATTACCATTTAGTTAGACGCTGTTCAACCCTAACTGTAATGTGATTTACAGTAGTTAGTGCGCAAAGTAGTTTTTCGGTTTTTTAGACATTCTGTTCATTTCGATTTGACCAAGAATTAGTTGATTATAGATTTGATCTTTCTCGAAGCACTGTTAGAGTGTGTATGCAACATTTCCCTATGGATTTGAACTTTTTATTACTTGCTATAACGATAGTGTACATTTGAACATAAGGAGTCATTTTCGTTAAACACATACCATCTTAGGTTCTTTCATGGCAGTGGCGTAGCACTCTCGAAAAGCTCGCTGTTGTCCATCCACATTCCCCAACCCATTGGGAGTGGGGACTTCATTACCTGGTGATAAGTGTGGAAGTGATATATCGCTGGCCTACCCAATATGGCGTTGTATGCCAAAGGACCGTCGACTACCACGAACTCTTCAACTTGGGTGACGGCCTCTTTTCCCTCTTCCAATGTTAGAGATAGCTCGATGCTGCCTTCTGGATAAACCCTCTCTCCCGAGAAATAGATCAATGGGGATGGGCATCTTTTGAGCTTCGTGGAGTCCCACCCGCGTAGCACCCACAGGGGAAGGACATTGGTCAAGCTCTCCCCATCCACCAACACGCGGTGTGTAGGCACATGGTCGATGCCTGCGACGATTAGCACTGTGTCGTTGTGTGGCTAAATCTGGACGCATGCTCTCCGTCCGTAAATGTTACCGATAACCCTGGCTCAGTCGCTTTTGGGGTCAGAACCTCGCGCACCCCTAGCTCGTTTCGAACTTGTCGGGCCAGCGCTTTTCGTTTGTTGCTTGAACGTCCTCCTGTCGGGCCTCTACTGATGGTTAGGATGGCCGACAAGCGTTCATCTTTCTTTGGGGATTTTGGCTTTGGTTATCCTCTGTTGCCATTGTACTTCCGCCAACGACGTCCTGGTTCCAAGCCTTCACCTACAAACTTCTTCAGGTATCCTCTTTGGACCAGAGACTTGACCTAATCCTTG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mRNA sequence

ATGTATTTCTTGCGTAGCTCGGCTAGCTTGCCTATGGAGCAAGTTGAAGGTGGAAGCTCGACTAAAGGAGTTCTAGAGCTAGAGGCTACATTGGGATCTCCAGGGTACCTCAAAGGTTGTCATCCGATGGAAACAGCTAGACTGGCAAAAGATGAAGAGTTATTGCAAACTCAACGCCAGGAAACCCAGAGGTTGTTTGAAATGCAACGTCAAGAGTATGAAAGAAGGTTTGACAGTATGGAAGAACTTTTTCGAAGATTTACTGAAGGAGGAGGAAGTTCATCGTTGAACAAGGTCGAAGTATGTTGCCGAGCTGAATTGCTGAATACGTTTCATTGGCCGACCTTGAAGGTCAGAGTCGACCTATGTAAAGATATCCACAGTGTTAAGAATCCCACATTGATAAAAGAAGGGACCTTACCTAGAACCTCGCGCACCCCTAGCTCGTTTCGAACTTGTCGGGCCAGCGCTTTTCGTTTGTTGCTTGAACGTCCTCCTGTCGGGCCTCTACTGATGGTTAGGATGGCCGACAAGCGTTCATCTTTCTTTGGGGATTTTGGCTTTGGTTATCCTCTGTTGCCATTGTACTTCCGCCAACGACGTCCTGGTTCCAAGCCTTCACCTACAAACTTCTTCAGGCAAGTTTCACCAGGGTCTTTTCTTGAGGCAGCTCGGTCTGCCGGCTTTCCTTTGTCTCGCGGAGCAGGGTCACTCGAATTTTTGCTCAAAGACTGGGTCTCGAGCAACTCCTCTCCCGCTAATCGGTTGATTCAAGCGGTCTTCGTCCGGCATCTGCTTGACAAACGAGAGATGGGCTTCCGTGCGCTTGTTGATGCAAGAACAATGAAAGTGGGCGACAAATTTCCTCACCAAGTCTTGGTAACTTCCGATCGAGTGTTGGGGGAGGTTCGGGAACCATTGTCGAGCATGTCCGATAAGGGTTCTAGAGAAACCTCAGCACTGCTCGGCATCGTTGTATCCCGCCTGACGCATGACATCATGATACGACATGGCATGGTCCACGCGGCAACCTTTGATGGTTCTTACTGTATGGTGGGACCAGCTCCTCCGACTCCGAGCTCGGCTTTCACTCGGTTGAAGATCTCCGCCTTTACCTGGTCTAGCTCCTCTAGTACGGTTCCGGCTTGGGAACCGTTGGGCCTGCTCGACGTTTCGATGCTAGGAACCCGAGTGACACCAGGGGGTCCTCCCTTCCGAGTCCCCTTGGGTTGGGGCCTGAGGTTCCCCGCCAACTGCTTCACTTTCGATTGCTCTCCCGTTGGGGAGGGGGAAGCTACCCGCATCTCTTTGCCGAAACCTAAGCTTTTGCAATGGGGATGCCCCACCTTATGCTTGCCTAGGCCGATCGGACGAAGGGCGTTGACGGTGTCCGAGGTCCCCTTGCCTTTTGTGGGGTCGGGGGAGTCAAGACAAGCTTATCAACGAGCTTATTGCACCGATGCTCCTCGTCGACGGTGTTCTCGAAGGATGACTCCTTATCGGAGACGGCACCAACTATTGACAGCGAATTCTGGTCGTAGGCCACATGTCCCTTCGGACGAGCAGTCCGGCTGGAGAACAAGAGAACCAAAAACCAAAAGAACACGACGCTGGACAAGGGTCCTTCCTTTTACAGCCTTAGGGAGCCGACCAGGAAGGACGTCGATTAGTGGTGGTAGGAACACGGCATGTGGTACGGGGAGCATTAGAGGGCGCACTTCCAATAGTCGTGGGGCGGCACCTCCTTCTGCGGCTCAGAGCCTATTGCCTTCAACTGTGAGGCGTGCCCGTCTTACTTGTGGCATCTGCCTCCTAGTACGGTTACGTATGGCGTCCAGCTGTCCGTGTTCCCTCATCTCTTCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTATTTCTTGCGTAGCTCGGCTAGCTTGCCTATGGAGCAAGTTGAAGGTGGAAGCTCGACTAAAGGAGTTCTAGAGCTAGAGGCTACATTGGGATCTCCAGGGTACCTCAAAGGTTGTCATCCGATGGAAACAGCTAGACTGGCAAAAGATGAAGAGTTATTGCAAACTCAACGCCAGGAAACCCAGAGGTTGTTTGAAATGCAACGTCAAGAGTATGAAAGAAGGTTTGACAGTATGGAAGAACTTTTTCGAAGATTTACTGAAGGAGGAGGAAGTTCATCGTTGAACAAGGTCGAAGTATGTTGCCGAGCTGAATTGCTGAATACGTTTCATTGGCCGACCTTGAAGGTCAGAGTCGACCTATGTAAAGATATCCACAGTGTTAAGAATCCCACATTGATAAAAGAAGGGACCTTACCTAGAACCTCGCGCACCCCTAGCTCGTTTCGAACTTGTCGGGCCAGCGCTTTTCGTTTGTTGCTTGAACGTCCTCCTGTCGGGCCTCTACTGATGGTTAGGATGGCCGACAAGCGTTCATCTTTCTTTGGGGATTTTGGCTTTGGTTATCCTCTGTTGCCATTGTACTTCCGCCAACGACGTCCTGGTTCCAAGCCTTCACCTACAAACTTCTTCAGGCAAGTTTCACCAGGGTCTTTTCTTGAGGCAGCTCGGTCTGCCGGCTTTCCTTTGTCTCGCGGAGCAGGGTCACTCGAATTTTTGCTCAAAGACTGGGTCTCGAGCAACTCCTCTCCCGCTAATCGGTTGATTCAAGCGGTCTTCGTCCGGCATCTGCTTGACAAACGAGAGATGGGCTTCCGTGCGCTTGTTGATGCAAGAACAATGAAAGTGGGCGACAAATTTCCTCACCAAGTCTTGGTAACTTCCGATCGAGTGTTGGGGGAGGTTCGGGAACCATTGTCGAGCATGTCCGATAAGGGTTCTAGAGAAACCTCAGCACTGCTCGGCATCGTTGTATCCCGCCTGACGCATGACATCATGATACGACATGGCATGGTCCACGCGGCAACCTTTGATGGTTCTTACTGTATGGTGGGACCAGCTCCTCCGACTCCGAGCTCGGCTTTCACTCGGTTGAAGATCTCCGCCTTTACCTGGTCTAGCTCCTCTAGTACGGTTCCGGCTTGGGAACCGTTGGGCCTGCTCGACGTTTCGATGCTAGGAACCCGAGTGACACCAGGGGGTCCTCCCTTCCGAGTCCCCTTGGGTTGGGGCCTGAGGTTCCCCGCCAACTGCTTCACTTTCGATTGCTCTCCCGTTGGGGAGGGGGAAGCTACCCGCATCTCTTTGCCGAAACCTAAGCTTTTGCAATGGGGATGCCCCACCTTATGCTTGCCTAGGCCGATCGGACGAAGGGCGTTGACGGTGTCCGAGGTCCCCTTGCCTTTTGTGGGGTCGGGGGAGTCAAGACAAGCTTATCAACGAGCTTATTGCACCGATGCTCCTCGTCGACGGTGTTCTCGAAGGATGACTCCTTATCGGAGACGGCACCAACTATTGACAGCGAATTCTGGTCGTAGGCCACATGTCCCTTCGGACGAGCAGTCCGGCTGGAGAACAAGAGAACCAAAAACCAAAAGAACACGACGCTGGACAAGGGTCCTTCCTTTTACAGCCTTAGGGAGCCGACCAGGAAGGACGTCGATTAGTGGTGGTAGGAACACGGCATGTGGTACGGGGAGCATTAGAGGGCGCACTTCCAATAGTCGTGGGGCGGCACCTCCTTCTGCGGCTCAGAGCCTATTGCCTTCAACTGTGAGGCGTGCCCGTCTTACTTGTGGCATCTGCCTCCTAGTACGGTTACGTATGGCGTCCAGCTGTCCGTGTTCCCTCATCTCTTCGTGA

Protein sequence

MYFLRSSASLPMEQVEGGSSTKGVLELEATLGSPGYLKGCHPMETARLAKDEELLQTQRQETQRLFEMQRQEYERRFDSMEELFRRFTEGGGSSSLNKVEVCCRAELLNTFHWPTLKVRVDLCKDIHSVKNPTLIKEGTLPRTSRTPSSFRTCRASAFRLLLERPPVGPLLMVRMADKRSSFFGDFGFGYPLLPLYFRQRRPGSKPSPTNFFRQVSPGSFLEAARSAGFPLSRGAGSLEFLLKDWVSSNSSPANRLIQAVFVRHLLDKREMGFRALVDARTMKVGDKFPHQVLVTSDRVLGEVREPLSSMSDKGSRETSALLGIVVSRLTHDIMIRHGMVHAATFDGSYCMVGPAPPTPSSAFTRLKISAFTWSSSSSTVPAWEPLGLLDVSMLGTRVTPGGPPFRVPLGWGLRFPANCFTFDCSPVGEGEATRISLPKPKLLQWGCPTLCLPRPIGRRALTVSEVPLPFVGSGESRQAYQRAYCTDAPRRRCSRRMTPYRRRHQLLTANSGRRPHVPSDEQSGWRTREPKTKRTRRWTRVLPFTALGSRPGRTSISGGRNTACGTGSIRGRTSNSRGAAPPSAAQSLLPSTVRRARLTCGICLLVRLRMASSCPCSLISS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
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Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 549..586
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 550..586

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc09g13950.1Moc09g13950.1mRNA