Moc09g08450 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACCTTTTTGAGCACCTCCCTGCTAGTAACAAGAGGCCTGCTTCAAAAGGGGGAGCCTCTAGTTCAGTCCCACCCTCCCAACGACATCGAGGAGTAGAGGCGTCTGCTCCAATGAGACCTGCGGGTGTTGCCTCTACAGCCACAGTTTGCCTTCCCCCTCCACCTTCTGCTAGGCCTTCATTCTCGAGTTCCGCGCTTGTGGTGACTGGGCTGCCTCTATCTCCAGTTGCGGAGTCTCCCTGCTCTAAGGGGTCCATGTCCCAGATGCGGCTTCCCATCTTTGGTTTTTTGGGGCCTTACCAAGCTCCCGTGTTACCGGCGGACATTGATAGGTCTGTGCGGGACACCCAGGATAGGATACAGAGAATGACTCTCCCTGGGGTGTTTCCAGCTGGGGAACCTGATCGAGATTTCTGTCAGGCATTGTATGAGATTCGTAGGGTAAGCTCACTCGCGCTCTCTCTCTTTTTGTTAAAGTTACCAATTGTATGTCTTTCAGGCTAGCGTGTGAGTCAGCTCTATGGTTCACCGCATGGGAGCCGAGCTTTCTTATTTGCAGCAGCAGAAGGTTGCAGCAGAGAAAGCCTTGGAGGAGGCCCGAGAGCTCCTACGCTAATTGACCAGCAGAAGGCTAAGTTTGAGGCTGCTATTGGTCGAGCACAACTCAAGTGAGATCATTTGATGGCTGAGATTGAGACTCTAAAGATGGACCTCGTGCGACATGAGGATGAGGTGGATCAGGCTAGGGCTGAGTTATTTAGCCGTCAGGTTGAGTTTGAAACTTTGCGTACTCAATCTGCTGCTAACTAGAGAGACTCGAAGAAGCTGGAGATGGCGATGCGGGAGACGGGTGCCTTTGATACCTTGAAGAAAGAGGCTATGAGGCTAAGCATAATATGGGTGACCAGTCAGGTGGGCGCGAGGTTTCCAGAGGTAGACCTCGGGTTTCTCCCTTTTGCTTTTGAGTCGGAGTGGGTTCAGCCAGGAGAGCCTAGTCTTCCAGGAGAGGTTTCTAAGGGTGCTTTGGATGCTAGTGATAGAGGTTGATGATGCTGAGAGAGGTGTTGCGGCTACACTCACTGCCACGTCTAAGTTGGGTTCCTCGGTTGACCGTCAGCACTTTGAAAACTGCACATCTGAGCGAGCTTGTTGCTCAATTGGTTAGCCTTTAAAGACTTAAGGTGAGACTCAGGATAAGGTTCCATAGGGGCACGAGACTCTAGAGTAGTTTAACGGTTTCTTTTTATTTACTCAACCTTGTATGCATTTTTTTCTCGTAGATATACATTTTCTGAGACTTTTTTTAGTCCAACTGACTGATCTTTACTTGTTCAAGATAATACATTTCGCTTTATGGATAATATTTCTTGAGATGTTCAACATTCCATGGATGTTTCAATTGCTTTCCTTCGAGACTTTCTAAATAATAGGTTTTGGGTCGTGCAACTTTGATGACCCGGTATGGAACTTCTTAAATGGGTCCGAGTAGGGGTGTTCACCATGCATCGAAAAACCGCTCCGACCAACCGAAATCGACCGAACCGTGTCGGTTCGGTAGGTTTCAACAGCAGGTCGGTCGGAGTCGGTTTTGCCTTTTGTAAAACTGACCAGTCGGTCGGTCGGTGGTTTCAGAAGAAGAAAAACCGATCGACCAACCGACTTTTTCATTTTTATAAATGTATATTAAGGAAGATGGTGTGTTCCTCGAGATGGTTTGGAGAAAAATCTAGGGGCACATGGTTTTCTCGAAACCATACAACCCTCTATTTATTTATTTTTCTTTCCTCTCTCATCTTCATTTTCCAATATCACTAACATTTTCATTTATTATCTCTTCCTCTTTCTTCCCATTTCCCAAAATCTTCCTCTCACCATTCTCTCTTCACTTCACTGTCGTTCTTTCTTCTTCATTTCTTCTTCTTTTCATCTTCTTTTCATCTTCTTCCTCTCTTATTTTTCTACTTCCATATTCTCATTTCATATATTTTTCTTTTTACCTGATCTTCTTGTATAATAAAATTAGGGTTAGCCTCCCCTCCTTCCATCTCTCTCCCTTATCCACACTCTCCCAGCCACTGCCTCGTGGCCGCATCGCCCACAAACGACTTACACTCACCATCTTCTCTGTCGCATTGCCCTCGCCGTCGTGACGCCGTCGATCTCTGTCGCTCAAAAGCCCGTTGTCCATCGGTCACTTTACACAGTGACCCAGCCATAGCTGAGATCCAACCCCCGCCGCAACCCAATCCTACAGCCGTCGATCCGCCTCTCGGATTTTGCACACAGTTCACACACTGATATTAAAAAAAATAGTCGGTTTTGTTGAAAATCGACCGACCAAACTGACCATTTCGTCGGTCGATTATATCTTATTTAAGCGGCCGATGACACCCCTAGGTCCAAGTACTCCGTTGGTAGTGTCTCTAGTACATTATGCCACTTTGCGCAGTACCCGATCACCTTCTTGGAACACTCGTGGTCGAATGTTGGTGTTGTAGTATTGTAAACCTGTTGTTTTTGGGCTAAGATGTATCAGTGAGAGGTTTCATGGATCTCGTCCAGGAGATCCAAATGAACTTCTTAGCCTCTCATCGTTGACGATGGGGTCATATTCCTCTACTCGCAATGACGGAAGGTCTTTTTCTACTGGGATGACTGCTTCGGCGCCAAAGGCTTAGGAGAAGGGGGCTTCTCCAGCAGGTTGTTTCGGCTGTTGTTCGATAGGCCCACAATACACTGGATAATTCTTGGGCCCAACCTCCTTTTAAGGATTATAGGCAAGTCTTATGCTTGATGATTTTGTTCACCACCTTTACTTATCCATTGGACTGTGGATGGGCTGGGAGGATTAAAAGTGTCGAATGTTAAGTTGGTCACATAAATCAGCGTCATAAAATTGTTTTCCGTTATTTGAGATGATAGCATAAGAGACGCCAAACCGACACACAAGGTTTTGCCATACGAATTTTGTGACCTCTGCGATTGTAGCTAATGCCTCGACTTCGACCTATTTGGTAAAATTATCCACGACCACGATGACATACTTGGTTTACCTTTCCCGCGTGGCGATGACCTTATAAGATCTATTCCCCATTTTTCAAAGGGCCAAGTACTAACCACAACAAATAGGGGTTCAGCAGGTAACCTTGGGATCAGTGCAAATTGTTGGCACCGGTTACATGTTCGAGTATAGACCTGAGTGTCTCGTCATAGTGTCGGCCAATAGTATCCTTATCAGATGATCTTGTGGGCCAACGACCATGCTCCCGAATGGTTACCGTAGACTTCTTCATGAATTTCTCGCATTACATATTCGACTTCCTCCAAACACTTTAGAAGTGGTTGGGAATATCCTAGCTTATATAAAGTTCCCTCAATCGAGGTGTACTGGGTCACTTGACATTGTAATCATTTGGCCTCGATCGTGTTAGTAGGTAATTCACCTGTGATCAAATACCTGATGATTAGGCTTGTCAGATATGGTATGGGGTGTTCGCATTGTGGATATCCAAGGCTTTTCCTATGCTAGATTGTGGTACGAACACGACCGGTATGGTTTGGCCTGTGTTAGTCTGATAAGTAGTTGCAAGTTGAGCTAAGGTATTTAGATTTCTATTTTCAGCTGGAAGAACTTGTCGAATATCCCATGTTGGAAAATTGACAAGTAAATGTTGCACCTGTGCTTTATAGGCACTTAACTTCTCTCTTTTTACTTAATACTCTCCACTGATCCTCGTTGATGACCAACAAGGAATCACTGCAAATTTTGGACGCCTTATCCTCGTGCTGCTTGGAGTCCGAAGATTAAGGCTTCGTATTCAACTTTGTTGTTAAAGGTTTTAAATCCAAATCTGAGGGTGATTTCTGTTCGTTCTTTCATTGGTGATATTAACACCACTCATGCTCCACATCCTTGGCTATTGGAGGATCCATCTACATGGATGGTCCATAGGTTGGAGTCAGCGGACCTGTCACTAGTAGTGTTGGGGTTGTTGTTTTCATTTTAAAGCTTAGGGTTAGAAGTGAAATCAACAATGAAGTCGGCAACAACCTACTCTTTAATGGTGGTTTGGGGCCTGTATCGTATGTCATACTCCCCTAATTCCATGGCCTATTTCATCAACCGGCAAAGTTTCAGGCTTCTGGAGAAAATGTTTCAATGGAAGATTAGTAAACACATTCATGGTGTGAGACTGGAAATAACGCCGTAGGCGCCAGTCTGCTATTATTAGCACTAGGGCCGCTTTTTGAATGTACGGGCAGCGAGTTTCAACGTCAGCCAAAGCCTTGCCAGTATAGCATATGGTTCCTGGCATTTGTTTTCTTCCTTGACCAATGTGGAGCTTACTACCGTTTATGAGACAGCTAGGTACAAAGATAACTCACACTTGGAAGAGGCTTTGCAAGGAGGGGTGCATCACTAAGGTATTTTTTAAGTTTATGGAAAGTTGTATCGCACTACTTGGTCCACTCAAATTACCAATCTTTTCGAAGAATCGGGAAAAAGGGCAAGCACTTGTTAATGGTTCTGGATATGAACTGATTTAGTGTTGCAATTCTTCTAGTCTTGACGTAAAGTTCTTGGTGAGGCCATATCTATCACAGCCTGTATTTTGTTAGGGTTAGACTCAATCAATTTTGATGAACCAAGTATCCTAAAAACTTGTCTAATGAAACCCCAAGAATGCATTTGTTGGGGTTTAGTTTCATATGATATTGTCGCAGGATGTTGGAAGCTTCTTTTAGGTCTGTCCATGCTGGGTCGAGAGTCGGCTTTTGACCAATATATTGTCCACATAAACTTTCACATTACTATCAATCAAAGGGAAAACATATTATTCATTAACCTTTGGTAAGTGACCCCCGTATTCTTGAGGCCGAAAGACCTGACTTGATAACAGTAGAGTCCTTACTCTGTTATGAAGGACGTCTTCTCCTGATCTGGCCCGTGCATTTGCAATTGATTGTATCTAGAATAAGCGTCCGTAAAG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MNLFEHLPASNKRPASKGGASSSVPPSQRHRGVEASAPMRPAGVASTATVCLPPPPSARPSFSSSALVVTGLPLSPVAESPCSKGSMSQMRLPIFGFLGPYQAPVLPADIDRSVRDTQDRIQRMTLPGVFPAGEPDRDFCQALYEIRRLYGSPHGSRAFLFAAAEGCSRESLGGGPRAPTLIDQQKAKFEAAIGRAQLKDSKKLEMAMRETGAFDTLKKEAMRLSIIWVTSQVGARFPEVDLGFLPFAFESEWVQPGEPSLPGEVSKGALDASDRGLASPPSISLPYPHSPSHCLVAASPTNDLHSPSSLSHCPRRRDAVDLCRSKARCPSVTLHSDPAIAEIQPPPQPNPTAVDPPLGFCTQCISERFHGSRPGDPNELLSLSSLTMGSYSSTRNDGRLGIRTHIELIKHYLVVDIGHVVVRPAKVWILLPQLVPLECYWDFLPGALFDDASLGTEPYCSIHGRYTACPKRSLLLRGSFMLPRWTHSPSNPIKGVVHTLNLSRPILMAWMVCNAKTSAELPPSTKFYFIRRLVGVASMITKCATLLLLCGILTMMVEEFKKTPVFQFTGRMEETPVEEGDTNKDVEVAPALIAVHPAEKSVAVAVGSDLRVFDLVGNCPVSLVDESGEQHHKDSIRAICYGSKGQLFVSAGDDKTVKIWSTESWRCIYNVCSEKRVSAAAISPDGLHVCFADKFGVIWVVDLDGGIDENQPLANKTAVSLLSHYCSIITSLKFSLDGRFLVSADRDFKIRVTTFPTKPVDEAHEIQSFCLGHTDFVSCVAFISNLECPHGFLISGSGDSTVRLWDILSGSLLDIFEIGDKVELLESKEREGCNSAVTSLCTIADGPLVAVAVQSLHGIILLNCDLSNRTLSVVKVVSTREETFIPTSVSSSCSTGYLWMVTGVSSLHDVGQSSLACVKVISGFNKDNPYSTGNELFVLEDDAIPGGKKLLEKLQGGVSFDEKVFLAAAEAVKTAMSNLLTKKQGKISASAQLQAGKGAEFEGSDHFLNPCASSHGFHAVRSIIIIMIGFDQRWFSCLLPPLWEAAMEATEV Homology
BLAST of Moc09g08450 vs. NCBI nr
Match: XP_022150294.1 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 824.7 bits (2129), Expect = 9.0e-235 Identity = 413/413 (100.00%), Postives = 413/413 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. NCBI nr
Match: KAG6575921.1 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 743.8 bits (1919), Expect = 2.0e-210 Identity = 381/453 (84.11%), Postives = 403/453 (88.96%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. NCBI nr
Match: XP_023549061.1 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023549063.1 tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 741.1 bits (1912), Expect = 1.3e-209 Identity = 370/413 (89.59%), Postives = 390/413 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. NCBI nr
Match: XP_022954128.1 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 [Cucurbita moschata] >XP_022954129.1 tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 736.9 bits (1901), Expect = 2.5e-208 Identity = 368/413 (89.10%), Postives = 388/413 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. NCBI nr
Match: KAG7014455.1 (F-box/kelch-repeat protein SKIP30 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 736.5 bits (1900), Expect = 3.2e-208 Identity = 376/446 (84.30%), Postives = 394/446 (88.34%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54UI3 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=wdr4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 110.2 bits (274), Expect = 1.5e-22 Identity = 80/257 (31.13%), Postives = 131/257 (50.97%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZY78 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=wdr4 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 5.6e-22 Identity = 90/329 (27.36%), Postives = 156/329 (47.42%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5FVB6 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=wdr4 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 7.6e-19 Identity = 77/271 (28.41%), Postives = 129/271 (47.60%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4IGH4 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit wdr4 OS=Danio rerio OX=7955 GN=wdr4 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 7.1e-17 Identity = 84/283 (29.68%), Postives = 129/283 (45.58%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P57081 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 2.1e-16 Identity = 59/192 (30.73%), Postives = 92/192 (47.92%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D9K9 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018494 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 824.7 bits (2129), Expect = 4.4e-235 Identity = 413/413 (100.00%), Postives = 413/413 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQ89 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456486 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 736.9 bits (1901), Expect = 1.2e-208 Identity = 368/413 (89.10%), Postives = 388/413 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KAG0 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G387800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 731.5 bits (1887), Expect = 5.0e-207 Identity = 367/416 (88.22%), Postives = 390/416 (93.75%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JND1 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488451 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 729.9 bits (1883), Expect = 1.5e-206 Identity = 367/413 (88.86%), Postives = 386/413 (93.46%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DRZ8 (tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold111G001450 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 718.0 bits (1852), Expect = 5.8e-203 Identity = 363/413 (87.89%), Postives = 384/413 (92.98%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. TAIR 10
Match: AT1G03110.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 469.2 bits (1206), Expect = 9.0e-132 Identity = 242/413 (58.60%), Postives = 302/413 (73.12%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. TAIR 10
Match: AT5G50120.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 2.4e-12 Identity = 54/182 (29.67%), Postives = 90/182 (49.45%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. TAIR 10
Match: AT1G24130.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 5.4e-12 Identity = 48/180 (26.67%), Postives = 83/180 (46.11%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 1.5e-09 Identity = 37/92 (40.22%), Postives = 53/92 (57.61%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g08450 vs. TAIR 10
Match: AT1G18080.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 1.6e-08 Identity = 53/186 (28.49%), Postives = 79/186 (42.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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