Moc07g02690 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGCAGAAGGGGGCTGAAATCTCTCCGACTTCTCTCAACCTCCTTCAATTCTTCCCCATTTAGATTGAACGCCGTCTTCTCCACGAACCCATCACTCATATTCTCTGATTCCTCCAGATTTTCCTTTGGGAACATCAGTGTATATCGCCTAAGCCTTTCATCCGCCATTGCCAAGTACACCACTTCTCCTCCGGACAATCTCGAGGGACTAGTTGATTTAGACGACTCAAATCCGTCTGAGAGTTCGCGGGTCGAATGCTTTTCGGCCCAAGAAGTTGGGTTTCTGCGTGATTCTTTGTTGGATTCTCCTGCAGACTCTGGTTCTTCTGAGAAGACACTCGAGATTGGTAAGATTTCAAACGAGGCTATTTCGATATTAGATGCAATTCGTAACGGTGATGATGGGTTTGGGGACAAAACCCAGAAATTACTTAGGCAATTTAGACAGAGTTTGAATCCCGATTTGGTTGTTGAGGTTTTGAATCTTTTGAGGAGTCCTGAATTGTGTGTCAGGTTCTTTCTGTGGGCGGGTAGGCAAATTGGTTACAATCACACTGCGTCTGTGTACTGTGCATTGTTAGATGTTTTCGAGTGTGATAATTACGATCGAGTACCGGAGGAGTATCTGCGAGAAATTTGGGGTGATGACAAAGTGGTGCTTGGGAAGTTGCTTAATGTGTTGATTCGGAAATGTTGCCGAAATGGGTTGTGGAATGTAGCATTGGAAGAGCTCGGGAGGCTTAAGGATTTTGGATACAAGCCGACCCGGTTAACTTATAATGCTTTGATTCAAGTCTTTCTCAGAGCTGATAAGTTGGATACTGCTCATTTGGTTCATAGAGAGATGTCACAATCAGGATTTAGTATGGATGAGTTTACTTTAGGTTTTTTTGCTCAAGCCCTCTGCAGAGTGGGCAAATGGAGGGATGCCCTCTCATTAATTGAGAAAGAAGATTTTGTCCCCAATACGGTTCTCTATACGAAGATGATATCTGGATTGTGTGAAGCTTCGCTTTTTGAAGAAGCTATGGATTTTTTGAACAGGATGCGGTCTACTTCCTGCATCCCTAATGCTCAGACTTATAAGATCTTGCTTTGTGGCTGTTTGAATAAAAAACAGCTGGGTCGATGTAAGAGAATTCTGAGTATGATGATTGCAGAAGGCTGTTTTCCGAGTTATAGGATATTTAATTCTCTTGTTCATGCTTATTGCAGATCAGGGGATTTTTCATATGCTTATAAGTTGCTCAAGAAAATGGAAAATTGTGGATGCAAGCCTGGCTATGTGGTTTACAATATCTTAATTGGCGGTATTTGTGGTAGTGAAGAGTTACCTGGCCCAGTTACATTTGAGTTGGCCGAGAAAGCTTACAATGAGATGCTTTCTGCAGGAACTGTTCTAAATAAGGTAAATGTTGTGAACTTTGCTCGATGCCTATGTGGCTTTGGGAAATTTGAGAAAGCATATAAAGTAATCCATGAAATGATGGATAATGGTTTCATTCCTGATACCTCTACATATTCTGAAGTGATAGGTTTTCTATGTAATGCCTCAAGGGTAGAAAATGCCTTTTTGTTATTCAAAGAAATGAAAGGGACTGGTGTTGTTCCTGATGTTTATACGTACACAATTTTAATTGATTGTTTTTCTAAAGCTGGCCTCATTAAACAAGCTCACAATTGGCTAGATGAAATGGTAAGAGATGGGTGTGAACCTACTGTGGTGACTTATACAACCCTCATCCATGCATATCTTAAGGCTAAGAAAGTTTCCATTGCTAATGAACTTTTTGAGTTAATGCTAGCAAAGGGTTGTATTCCTAATGTTATTACATATACAGCTTTAATTGATGGCTATTGTAAATCAGGGAATATAGAAAAAGCTTGCCAGATTTATTCAAGAATGAGAGGTGACGAAGACATTCCGGATGTAGATATGTATTTTAAAACGGAAAATAATGTCTCTGAAAAGCCGAATGTTGTTACATTTGGAGCTTTGGTGGATGGTTTATGCAAGGCCCATAAAGTCAAAGATGCTCGCAACTTACTGGAAACCATGTTTTTGGAAGGCTGTGAACCAAACAATATTGTATATGATGCACTTATTGATGGCTTTTGCAAGGCTGCAAAGTTGGATGAAGCACAAGAGGTGTTTGCTAAGATGGTCGAGCGCGGGTATAATCCTAATGTCTATACTTATAGCTCTCTGATTGATAGGTTATTCAAGGATAAACGTCTAGATTTTGTTTTGAAAGTGTTGTCCAAAATGCTTGAGAATTCTTGTGCTCCTAATGTTGTTATCTACACAGAGATGATTGATGGCCTTTCTAAAGTTGCAAAGACAGATGAAGCTTATAAGCTTATGTTGATGATGGAAGAAAAGGGATGTAAACCAAATGTTGTGACTTACACTGCAATGATTGATGGCTTTGGGAAAGCTGGTAAAGTTGACAAATGCCTTGAGCTTTTCAGGGAAATGGGCTCAAAAGGCTGTGCACCAAATTTCGTCACCTACACAGTGTTGATCAACCATTGCTGTGCTACTGGCTTTTTAGACGAGGCTTATGCACTTTTGGATGAAATGAAACAAACATACTGGCCAAAACATATATCGAGCTACTGTAAGGTGATTGAAGGCTATAACCGGGAGTTCATTCTCTCTCTTGGGCTCTTAGAGGAAGCGGAGAAGAATGATTCTGCTCCAATTATTCTGCTATATAGGGTTTTGATTGATAACTTTATTAAGGCAGGAAGACTGGAAGTGGCACTGAAGCTTCACAAAGAGGTTATATCAGCTTCAATGTCCATGGCTGCTAAGAAAAATATGTATACGTCATTGATTCACAGTTTTTCTAATGCAACTAAGATCGGTCACGCGTTTGAGTTATTTAATGATATGATAAGACAAGGTGCTATACCAGATCTTGGTACATTTGTTCACCTTATCACGGGGCTTATCAAAGTTAGCAGGTGGGAGGAAGCACTTCAGCTTGCAGATATCATATGTCAGATGGTTTGTGTCTTAACCCCTCTGATTTCTGTTTTTCCGGGCAATCATATAAGTCACCTGATTCATTTTGCAGTATCAAATTATTTTGGAAATTTTAACTTAATATGGGCCATCAACTCCCTCCCCTAAATAGCAACCTAGTATTTTTCTGCTTGATTTTTCTCCTCTTTTGTGTGTGTGTGGTAGTACAATATCCCGGGGAACTAATAAAGGGTTACCGCCCTCTGTCAACAAAGCCTTTTTGATCTGATCTTCAAGAAACTTTAGGCTTTCTATACTTAATATATTGCTATAGGGTTCATTACTTTTTGAGCGTTATATGCCCACCCTCACCCCCAACTTCTGTGTTACTGCCTCAAATATATTGAACCAGAGAGCAAGTACTTTTGCCATGTACAGCCAAAGAACTTGATCTTATTTAAAAAGTCGATATTCACTGACACACTAGAGAAGCACAACTCTAACAAGTGTATGCATGACCGGATTGGGTAGGAAAAAATCGATTGATGGGTGTATTTAAAAAAAAAAAAAACTTGAAAATATATTTGGAAACATTTTTTGTTTTTTTGAAAGGTCTGCAAAGATCATTTTTACATTTTGAGCCTCCAGTTACTTCTATCTTAGAATATTTATGAATTTTTAATATTAGAGTTACTATTCATCATCATGTACTGAAAATTGTGCTGCTGACACTGAGTGCCTGATTTTTTTTTTTGTATGCAAAGATATATTATATATATTTTGTATGAAAGTTGGTTTCTCATCCAAAAAAAAAAGTGAAAATACCAAAACTGGCCTTCATGAAAAATTGGCTTATCTTTGAGAATCAATAGTTCAATACTGCTTGAGAATACATAGTCGCCATTTTCCAGTCATTTTAACTTTTTATATGTGTTTTTGATATTTGTGATTTTAAAAGATTTTGATCTAGCAGGATATCAATTGGTTGCAACAAGAAGACACACCTTGAAGAGATTCGTGAACTGTTGTTTTTAGTGCTGTCTGCCCGTGGATTATGCGAAGGCCTTTGAGTGTGCTCAATAATTCGGCAGTGGCAACCATATTGGGGGGTTCTATCATGCACTCAAGAAAACCTGAGACGATATGCAACCATAAACAACTATTGCTGCTTGAGACAGATTTGATTTCCTTTGATTTTTGCCCATAAATCCGAGGATAAGTTCGCCGGAAATCTTTATCGAGCTGTTAACCAGATTCAGACTTGTGAGAAGGGTAAGATCACATAACTTCTGCTTGACTTTTCTTAGAGGGGTGGGGAGGAGGACCGGTTCACTGACATTATACCACCATCAATTTGCTTTAGTTTGAATCCTATTTTGGTAGGTGACTGAAATTTTATGCCTATTTTGTTTGGTCCCCAAATTTTATAATGTTCTATTTTTGTCCTTAAATTTTCAAATTTACCATTTTAATCCCTAACCCTTAAAAAAAAAGAAAGTCAAATCATTTTGGTAATTCGGCACTTGACCAGTGTCGTTAAATTTTCTACAAAAGATTTCATGAAAAAGACTAAAATGGTTACTTACGTGAAGTTTAAAGCCTAAAACTGGTAATTTGAAAATTTTGGGACCAAAATGAAACGAACATACAAGTGTGAAAGTATCAAAATAGGATTCAAACCCTTTGCTTAACACTGTAGTCTCCTCCTTGTGATTATAAGTTTATTGTGTTCTTAGGTCCATGGCATTTAATTTGCTTTTTGTTCTTTTATTGGTTCATTTAGTGTATAAGTTTTATTCATCTTAGATATGATTAGTGATGTTCAGGAGGCGATCAAGTTGATAAATACTCTTTTTATGTTCTACTTGTGCCCTTGGTAGGGTGTTTAGAGTTTGGTTTGGTTTAGTTTTTGCACCAAACCAAAAACTGAACTGTGGTGGTCGGTTTTCTATTTATGCAAACCAAACCAAACCAACTCTTCTTGAAAATCGGTTTTTACTGTACTGATCAGTTCGGTTAAA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Homology
BLAST of Moc07g02690 vs. NCBI nr
Match: XP_022150421.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial [Momordica charantia] >XP_022150422.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial [Momordica charantia] >XP_022150423.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2036.5 bits (5275), Expect = 0.0e+00 Identity = 1006/1006 (100.00%), Postives = 1006/1006 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. NCBI nr
Match: XP_022992076.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1792.3 bits (4641), Expect = 0.0e+00 Identity = 878/1006 (87.28%), Postives = 938/1006 (93.24%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. NCBI nr
Match: XP_022929904.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial [Cucurbita moschata] >XP_022929905.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1789.2 bits (4633), Expect = 0.0e+00 Identity = 877/1006 (87.18%), Postives = 935/1006 (92.94%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. NCBI nr
Match: KAG6575348.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1785.4 bits (4623), Expect = 0.0e+00 Identity = 872/1006 (86.68%), Postives = 936/1006 (93.04%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. NCBI nr
Match: XP_038884804.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1784.6 bits (4621), Expect = 0.0e+00 Identity = 880/1006 (87.48%), Postives = 931/1006 (92.54%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M9X9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g06710 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1206.4 bits (3120), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/979 (61.29%), Postives = 742/979 (75.79%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZW74 (Plant UBX domain-containing protein 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUX11 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 2.4e-96 Identity = 236/541 (43.62%), Postives = 317/541 (58.60%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SZ52 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g31850, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PGR3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 320.1 bits (819), Expect = 1.5e-85 Identity = 233/859 (27.12%), Postives = 372/859 (43.31%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LSL9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g65560 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g65560 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 303.9 bits (777), Expect = 1.1e-80 Identity = 232/872 (26.61%), Postives = 373/872 (42.78%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q76C99 (Protein Rf1, mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=Rf1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 8.7e-78 Identity = 192/707 (27.16%), Postives = 323/707 (45.69%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DAP3 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018584 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2036.5 bits (5275), Expect = 0.0e+00 Identity = 1006/1006 (100.00%), Postives = 1006/1006 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSJ3 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488532 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1792.3 bits (4641), Expect = 0.0e+00 Identity = 878/1006 (87.28%), Postives = 938/1006 (93.24%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EVK3 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436368 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1789.2 bits (4633), Expect = 0.0e+00 Identity = 877/1006 (87.18%), Postives = 935/1006 (92.94%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BE59 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06710, mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488647 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1758.0 bits (4552), Expect = 0.0e+00 Identity = 861/1006 (85.59%), Postives = 920/1006 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V4K9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold381G00700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1755.7 bits (4546), Expect = 0.0e+00 Identity = 860/1005 (85.57%), Postives = 919/1005 (91.44%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. TAIR 10
Match: AT1G06710.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 1207.2 bits (3122), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/980 (61.22%), Postives = 743/980 (75.82%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. TAIR 10
Match: AT2G43210.1 (Ubiquitin-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 1.7e-97 Identity = 236/541 (43.62%), Postives = 317/541 (58.60%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. TAIR 10
Match: AT2G43210.2 (Ubiquitin-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 1.7e-97 Identity = 236/541 (43.62%), Postives = 317/541 (58.60%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. TAIR 10
Match: AT4G31850.1 (proton gradient regulation 3 ) HSP 1 Score: 320.1 bits (819), Expect = 1.0e-86 Identity = 233/859 (27.12%), Postives = 372/859 (43.31%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02690 vs. TAIR 10
Match: AT5G65560.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 303.9 bits (777), Expect = 7.8e-82 Identity = 232/872 (26.61%), Postives = 373/872 (42.78%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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