Moc07g00790 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview


Name	Moc07g00790
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	Unknown protein
Location	chr7: 505754 .. 525928 (-)
RNA-Seq Expression	Moc07g00790
Synteny	Moc07g00790

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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CAGGGACGCGCCAAGCTGTACGGTGCCTGACAGGAATGTACACTCCCGACAACTAGTGGGCGGCGCCTCCATCGACAGGCCTGGAGCTTGTCTCCTGCCGGTGGTAGGTCGCAGGGCTCGGCGTGCTCCCCGTACTGTGGGAGCGGACATGTGCTATCCTGCCATCGCAGGGTAA

mRNA sequence

ATGTCTGCGTTCCTCTCTGGCCGGCTCTGTTTTTCTCCATCGCTCGCCTCCGTTTATCCCGTTCGAAAGAATATTTCTGTCCTTCGTTCTTCTCTGGCCATTTTTGCCTACCTTCGTCTCCAGCCGATGTCTACCTGCTTTCATCTCCGATCGCCTCCGTTTTTCTCCATCGCCAGAGCAGTTCATCTTCGTTTATCCCGATCGAAAGATTGTGCTCGAACTCGGCCTCTGGACCGATCTGAATCCTTGGGCGGACCTGCACAAAAAGGTGAGCACTCCGACGATCAAGTCAGTATAGTCCCGCTAATCTCGCAACGGTTACACCTGGTAATCTCGGAATTGTCGATTACACCCGGTAATCTCGGGACCGACGATTACACCCGGGACCAAAGTGGGTCGTTGCCTCCAGTATTAGTTATCTCCTTCTATGACATGCTATTGTCGTCACCATATTCCATATGTAACTTAGTCATCTCTGCCTCATTGCAGGATCCCTCACATTCGGATGTGGGTACTCAGGCTTGCACCTGGGCGATATGGGGTGCAGGCGAGGCAAGTATTGGCGAGCACAGGGGCATGGGTGTTGGATGGCGCACGCGGTTGAGGCAATTGGCGGCGCGAGCGTTGGAGCGCACGAGTAAGGGACATGCGTCGGGATGGAAGGGCATATGCACGGATAAGGACCCTTCCTTTTATAGGATTAAATGGCCGACTAGGAAGGACGACGGTTGGGATGGCAGGGACGCGCCAAGCTGTACGGTGCCTGACAGGAATGTACACTCCCGACAACTAGTGGGCGGCGCCTCCATCGACAGGCCTGGAGCTTGTCTCCTGCCGGTGGTAGGTCGCAGGGCTCGGCGTGCTCCCCGTACTGTGGGAGCGGACATGTGCTATCCTGCCATCGCAGGGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCTGCGTTCCTCTCTGGCCGGCTCTGTTTTTCTCCATCGCTCGCCTCCGTTTATCCCGTTCGAAAGAATATTTCTGTCCTTCGTTCTTCTCTGGCCATTTTTGCCTACCTTCGTCTCCAGCCGATGTCTACCTGCTTTCATCTCCGATCGCCTCCGTTTTTCTCCATCGCCAGAGCAGTTCATCTTCGTTTATCCCGATCGAAAGATTGTGCTCGAACTCGGCCTCTGGACCGATCTGAATCCTTGGGCGGACCTGCACAAAAAGGTGAGCACTCCGACGATCAAGTCAGTATAGTCCCGCTAATCTCGCAACGGTTACACCTGGTAATCTCGGAATTGTCGATTACACCCGGTAATCTCGGGACCGACGATTACACCCGGGACCAAAGTGGGTCGTTGCCTCCAGTATTAGTTATCTCCTTCTATGACATGCTATTGTCGTCACCATATTCCATATGTAACTTAGTCATCTCTGCCTCATTGCAGGATCCCTCACATTCGGATGTGGGTACTCAGGCTTGCACCTGGGCGATATGGGGTGCAGGCGAGGCAAGTATTGGCGAGCACAGGGGCATGGGTGTTGGATGGCGCACGCGGTTGAGGCAATTGGCGGCGCGAGCGTTGGAGCGCACGAGTAAGGGACATGCGTCGGGATGGAAGGGCATATGCACGGATAAGGACCCTTCCTTTTATAGGATTAAATGGCCGACTAGGAAGGACGACGGTTGGGATGGCAGGGACGCGCCAAGCTGTACGGTGCCTGACAGGAATGTACACTCCCGACAACTAGTGGGCGGCGCCTCCATCGACAGGCCTGGAGCTTGTCTCCTGCCGGTGGTAGGTCGCAGGGCTCGGCGTGCTCCCCGTACTGTGGGAGCGGACATGTGCTATCCTGCCATCGCAGGGTAA

Protein sequence

MSAFLSGRLCFSPSLASVYPVRKNISVLRSSLAIFAYLRLQPMSTCFHLRSPPFFSIARAVHLRLSRSKDCARTRPLDRSESLGGPAQKGEHSDDQVSIVPLISQRLHLVISELSITPGNLGTDDYTRDQSGSLPPVLVISFYDMLLSSPYSICNLVISASLQDPSHSDVGTQACTWAIWGAGEASIGEHRGMGVGWRTRLRQLAARALERTSKGHASGWKGICTDKDPSFYRIKWPTRKDDGWDGRDAPSCTVPDRNVHSRQLVGGASIDRPGACLLPVVGRRARRAPRTVGADMCYPAIAG

Homology

[Close]

BLAST of Moc07g00790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4D6MN26 (Uncharacterized protein OS=Vigna unguiculata OX=3917 GN=DEO72_LG8g912 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 7.9e-04
Identity = 30/37 (81.08%), Postives = 32/37 (86.49%), Query Frame = 0


Query: 131 SGSLPPVLVISFYDMLLSSPYSICNLVISASLQDPSH 168
           SGSL P  VISFYDMLLSSPYSICNLVISASL+  +H
Sbjct: 130 SGSLAPP-VISFYDMLLSSPYSICNLVISASLRVSTH 165

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Moc07g00790 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Moc07g00790 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Moc07g00790 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A4D6MN26	7.9e-04	81.08	Uncharacterized protein OS=Vigna unguiculata OX=3917 GN=DEO72_LG8g912 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Moc07g00790 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 73..95

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Moc07g00790.1	Moc07g00790.1	mRNA