Moc06g40770 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTCGACGGGTGGCCGGTGACAGAAAAGAAACATCGGGATAAAAGGACGGAAACAATGGACGGGCTGCTGGAGACGAAGGAGAAGCTAGACGGACTATTCCGGCAACGAAGAAGAATGGAGGCGACAGTTGGAAACGAGGGAACGCAGAAGGCGACCGGAGACGAAGGAATGAATGGAAACAAAATAACAGAGGAAGAAGAAAAGTCGGAGGGAGGAGGTTTTCAAATTTTTTCAATAACGGAGGATTTTGGGATTTGATATTTTTTACTTTTAAAGGTCTAATTAGGCAAAATTTGAGGGATTTAAAATGTAATAACCAATTTTGAATTTTAAAAATTAATTAATATTGAAGTGAGATATAAAAGGATATGTTAGTAAATTTAGTGATGGACACCATCTTAAATAGAATTGTTTCATAAGTGTAAATTTTATATCATTCGATCCTTTTATATAATTATATTGTCTAAATAGTCTATTAATGTACTAAATCTCTTATTATAAAAAGCTCAATTTCATTATATTATGTCATAAAAATTATATTTTTATTGACCGATAAATTTCCGTCAATCATGAATCTTCACATGTCACTTTTATGCTTGTTTGATACACAAGCTACCTTGATCAAATTGGGTCATACGAAATTTGGGCCCATAATCAAATGAACCCAAAACCTAACAAATGGTCATAACCTCGACTGCACCTATTTTAAACTAAAAATTTGATTCGCCACCTCGTCCAAAATCCAACGCATCCTCAAAACTAATTCGAAAGAGAAAATTTTCATTCTCCAGAATCATTCTCCATCTCATCCAAGTAGAGTATGTGTAGAAAAAAATTATTTTTTGAGGTAAAAAAGGGGTTTATCCCTGCAACTAGTTCGGTTTGTTAGAGAAGATCTTATTAAATATAACCACCAAATTAAGTGTCATTCTAAAGATGGAAGGGAGGCATTGGATTCCACCAATTCAGCTGTACCTTTTTAATTTTTTTAATATTATTAATTTTTATCTTTTACCGAATTTAAATTTTCAAAAAAATAAATAATATATTAACCAATTGAACTATTGATAAAAAATATTAAGTTACGTTATATCAGCCGTATATATCATTTAAAATAAGTTATTAAATTCATAATGATATATAAAATAGTCTCTAATCTTTTAAGTTTTTCTCATCTTGATACTTATTTTTTTTTAAATTATTAATTTTACCTTTAACATATACGAGAAATTATAAATTAAGTTCAATTGTAAAAAAAAGATGATAAAATTTGTTAAAGAATACTTATGCATCATTAAATTATTCTTTTCTTGATATATTTAGATGGGCAGATAAGTAGGCATACCACTTAATCATGAGATTTTTGTTTAAAATATTACTAAAAATAAAATTATTAATTAAAATATTCCAATTCCTAAACTAATTTTTAAAATAATGCTATTTTAATTCCCCACGTTTCCTCAAAATGGGACTTTCAAGCTTCCAAGATTCATCCCAGGCCTCTCTCTCCCCCTCATTTATTCCTCGATGTAATCAATCCAAGCAATAAATTATAAAGATTGTTGAGGGTAAAATCCAGCCGGACGTGTGTCCACATTGGAGGGAGACGTATGATCGATCATATACGGTTATGTATCATATGTGGATACAGTTGAACAGGACCCGTGTCCACCCTCGGAGAAGCACAGGACCACATATGGTTACATACCATACCAAGAGGTAGCACGGGACGTACATTTCCGATACGGTAGGTGAGAGTATCACCAGCCAATTGCCAGGAACGTACGTCAATGACAGTCACCGTATCACGCGGCACGCCCTTGCCACCTCCAACCATCATCTTTCTTGGTAGGCCACCCGAGCGCATATAAGGAAGGATCCTCACCTTAAGGTGTCTTTGTCCTACTCCCTATTCTGATTACTAACTTGATCGTCAGAGTATTTTAGGCGAAACATCGTACCGATGTCGAGTTTTTGGTTGTAGGTCTTCTTGTTCTCAAGCAAAGTTACTCATCCGAGGGACGCGTGGCCTCCTCCAGAAATTCGCCGTCAACAAAGATAAAAATACAATATAACCTAATTCAAAACATCGGGGTGTTAGACATAAGATTTTGGATGAGGTGACGAATCGACTTCTAATTTGAAGTGAATATCCAGTTAACCGACCGAATACCACATCGGTGCAAGATTTATTTATAGGTCATAACAACTCATCACTTTGTCTAAAATCTTGCATCAACCAAAAGAGGTTGACAATCATTCTCTCAAAATAAAACAAATTCTCATCCTCTACTAAAAACATTCTCCATCTTGTTGTTGAAGTATAGTTTGTGAAAAATAAAGTTTTTTTTAGTCCATGAGAATGAAGGGAGGAGAATCAGTTTACCAAATTTTTGAAATAGGAATCAAATGGTGGACCCCTCCACTTTTTTCATTCTCACTGACTCATCACTTTTTATTTAATTGTTTTATACTTTCTTATTTCCTTTTCATTTATGCTCTGTTTTAGTAAAAATTTATATCATCTTTCTTTGATATTATTATAAAATATTTAACTTTTATTTATTTTTAAATTTTTAAATTTAATTTTGTCATTATTAATTAATGTTAGATTTTCTAAAATATGATTCATTTTTATTAATTATTATTAATAATAAAATTTAATAACATTATTCTTAAGTATTATTATAATAAAATTTAATAATATTTTATATTATATAATGATGGTTCTAATAAAATAGTATTTTAGTGGATGTAATTTTATTTTAATTATTTATTATTTATTAATATTAATATTAAATAAATTATTTTAGTAGAAAATATTTATTATCAATAATATAGTAATAAAATACATTATTATTGTAATTAAAAAATTAGCACCACATATTTGTGATTAGTTAGAAAGAAGATATGGGTATACTAGTAATTGTCATATATTTGATTCTAATTTCGATTACAGACTCATTTTCATTCCAATTCATTTTCATTCCAATTCCTGGTAGGTAAACAAGATCTAGTTAAAAAAATTGGTTTATCCCTCCAACTTAATTTATTTTGTTAGAGAAGAAATTACTAAATGTAACCACCAAATTACATGTCATTCTAAAGATATGAGGGAGGCATTAGATGCCAGCATTTTGTTTTTTATTTTTATTTTTGTCTTTGTATTTTCACTCTAACCAGAACAACTTCACCTTCTAATCCTTGACTTCAAAGTGTTAGTTGTAGCGCTACCACGCGGATCTAAAAAAGATCTTATCCGTTTTAAACAAAGGGCGTTAGAGGACGTTTTTCATTCTTTAGCATTTCCAAAGTCAAAGTCGCAGACGGAGAAAGCTACCGGCCCAAAACCTTTGACCCTTCCTTCTAAATGGGGTGTCTGGAGCACCTCATCTTCTTCGACAAAAGTCGAATAACAGAAGTATGACAAAAAAAGGGGTCCCATGACCTGGACAATTATCCCTACCTTCCCTAACTTACGGAGGTAAATAATATATCGATTGGTTGAACTATATTCATGGCATAAAAATTGAATTATATTTATATTAGCAATACCATATAATTTAAATAAGATATTAAGTTCATAATTAAAATGCTACAACATAAAATACTCCCTATTCTTTAAAATTTTTCTCAAATTGGTTCTTAATCTTTTAAAATTCTTAATTTTACCTTTAATGTGTATTAAACCTTCAAAGTTAGGTTATTACATAAAGAAAAATATTATAAAATTTGTTAATATAATGTTTAAGCATTATTAAATTATTATTTTCTTTAAGAAATTAATTTTATTAACGATCAAATCTAATTTTGTTAATAGAAAGTTGAGTTTCGCAGCTTGTAATTGAACAAGCAAGTCTAATTTTGCTAATAAGAAATTGACTTTCCTGTGTCCAAGTAATATTAAGTAGCATATTCTTGTGTCCAAATATATTAATAAAATAATATTTAATAATACATCAACTTTTTATTAGTAAATTTTAATAATTTTTTTACCTAATTAGAATTTTATAATACATCAAGAAAATCAATAATCTTAGAGTAAAATGATCTGAATAAGTTACGAACAAACAAGCAATATATTTAGTTTATGTCAATACGAACCTAACTGCGGTAATTGGCATAACTTTTTTCTTGGACGTCGGGGGTTGGATTCCCCTATGTTTGAATTATTGGTACCAAACAATATATATTTAGTTTGATTAAAAAGTAGTTACTATTTTTCAATCGCGTTGACTCACTCCCGAAACGGCATCGTTCAGCCGGCTCCGAGGGAGGGGGAAGGAAGCCGGACGGGAGAAGAGAACCGCATTTTCAACTCTGCAAGAGAGATTGACTGCCTTCTCTATCGGAAGAAACGCGCAATCTTTTGAGTAAGTTCGTGGAACTTCTCTGAATTTATGTTCCTAATTTTCATTGTTCTGCTTTAACAGAAAATTTGAATGTGGACTCTGTAAGTAAGCGAAGAAATTGAGTGCCGAGATCTCAGGCTTAGTTCTTGGTTATTGATATTTTTTTGTGGTGCCTGGTAATTTCGGATGGACTTATTTTCCAGATTGAACTGAAATGGGATGCGTTTGATAATTGCATCCACTTCGACTTTTATGTTTACTTTAGAAGAAACAGAATCCAAATTTTATCTTGGAAATGTTTGAGCTGATGGTTTCTTGGGGTGTGTTTGGATGGCATCGGGAAGAATTAGTAATTTAGAGTGTAAGTATAGCTTGTTTGTGAGATGATTATTCAAAGTGATTGATACTCTTGTATTTTAAACACTTGAGAGATGATTATCCAGTGAAAAAGTGACTAAGTTAAAAGGTACGTCGAACTCATAGTTAATCATGATGAGTTAATGGAGATAGCTCAGGAGGGAATGTTTGTTCATGTTTGAACTGTATTAATTAATGAGTTATAGCTAGTTGAGTTGACCATGTGGAATGACTCCGTACTCAGTCCTATTTACGATAAGAATGGTCGACAACGTCCCATTA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TTGAACTTGAATTTTAACACGCCAACAATAATATGGACTTGAAAGTACCTTAATTTCGTGAAGAAACCAATTATTAGTAAACTAGTAATTTATTATTATTATTATTATTTTTTTGACTTCTGGACACAGGACGGCTTGAATTTGGATCTTCAAACCTCTTGCCACTGCGCCAACACCCGAAGGTGCAGTAATTTATTATTATTATTATTTTTTTTAAAATTCAACATGTGAAAGTAGATATTCGAACTTTCAATATTTTAGTTGATAAATATATACTTTAATCAGGTGAACTATGTTAGATTGACGGTAATTTAATCTTTTCAAATTATGGTATATTTGATACTTTCTCTGATGACATGATGAGTAGAAAATAAAATACTATATAACCTAGGTATAATTTAACAATTGAGGAACTAAAAACCTTTTCTGGAGACTGAAGGTCTATGATTACAAATGTTGTATTCTTAAGAAATAAATAAAAAAATAACTTTTGGATTACCTTGGAATTGAAGAATGATTCCATTTAGCTCCTAAATCGTTGAAAAAGTAAAACACCTTTGAAGTTTAGAAAATGGTATTAAGTTAAATATATGATATTCATTAAAATTGATTTTTCTTAAAAAGAAATATTACATTAATTAAAAAATAAAAGGTAAATATTTGAATCTAACCTACCCAATTAAATTTAAATAAAATTGATTTTAGTGACATTTAAAAAATAACATAAAATAAATATAATATAGTAGAAATTTTAAAATATAAATATAAATACCTTAAACAAAGTTAAATTTATCTATTTGAAGAAAAGTTTTGATATTTTTTAAAAATACATTGCTGTCGAGTAAAATTTATCTTTTATATTTTTTGACTACATGCCAAATAAAACAAACGGAAAAGGAAAATACAACCAACAAAAAGGAAAATTGAAAAACTAAAGCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAATTCTTTTTAAGGTTTGGGTATGATTAATTTCCCTTTTCCGATATTAAGTTCAATGCGACGACGTTTAAGTCGTCTCCTCATAATAGCAGAGTTGCTCCAGTTTCTAGGGTTTTAGGTTCTTCAAACTCTCGCATTCGTACTTACACTGCTTCGCGCGGTCATGGACAGCCCTTCTCCAGCTTCATGCTGGAGCAATGTCGTCAAATCCCAACCAGCTCCGAAGCCTCAGCACCAGACTCCGACTTCAACCGTCAAAGTATTCGCCGACAGCTGCAAGTCCAGTAA 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ATGGTCGACGGGTGGCCGGTGACAGAAAAGAAACATCGGGATAAAAGGACGGAAACAATGGACGGGCTGCTGGAGACGAAGGAGAAGCTAGACGGACTATTCCGGCAACGAAGAAGAATGGAGGCGACAGTTGGAAACGAGGGAACGCAGAAGGCGACCGGAGACGAAGGAATGAATGGAAACAAAATAACAGAGGAAGAAGAAAAGTCGGAGGGAGGAGTTGAACAGGACCCGTGTCCACCCTCGGAGAAGCACAGGACCACATATGGTTACATACCATACCAAGAGGTAGCACGGGACGTACATTTCCGATACGGTAGAAAATTTGAATGTGGACTCTGGTTGCAGCTTGCTGCTGAATTTCTTTCATTTGTTCTTCTTGGTGGTGGTAAAATGAATGTGGAGAGTCACGACAAGAAGAAAGAGTATGCTGCTGATATTTCATCCATCAAGGAAGCACGGCTACGAATCGAGCCTTTCATCCATCAAACCCCAGTTTTGACTTCTGAGTCTATTAATGCTGCTTCAGGAAAACAACTTTTCTTCAAATGTGAATGTTTCCAGAAGGGTGGAGCTTTCAAATTCAGAGGTGCCTGCAATGCTATATATTCACTTGATGATGATGAGGCTGCTAAAGGGGTTGTGACTCACAGCAGTGGCAACCATGCCGCAGCTTTGTCTTTGGCTGCAAAACTTCGAGGGGTCCCTGCATATATAGTTGTACCAGAAAATGCTCCCAAATGTAAAGTTGAAAATGTGGTACGTTATGGTGGTCAGGTTATTAGGAGCGGAGATGCGATATGGTCAAGGGAGACGACTGCCACGAAGGTTATGCAAGAAACTGGTGCGGTTCTCATACACCCATATAACGACGGGCGCATAATGAGCGGGCAAGGTACGATCTCTTTGGAGCTTCTGGAACAAGTCCCTCAACTAGACACTTTAATCGTTCCCATAAGCGGTGGCGGTTTGATATCAGGAATTTCAGTGGCTGCAAAAGCCATCAATCCTGCCATCCGGATTTTTGGTGCAGAACCTAAGGGAGCTAACGATGCAGCCATGTCAAAAGCGGCTGGTAAGATAGTAACACTGGCAGAGACCAACACCATAGCCGATGGTCTTCGAGCTTTTCTTGGTGACCTTACTTGGCCCGTAGTTCGAGATTTGGTCGAGGATATAATAACCGTGGAGGATGGGGAGATAGTTGAAGCCATGAGAGTTTGTTATGAAGTGCTGAAAGTTGTTGTGGAACCAAGTGGGGCAATAGGCCTCGCTGCTGTTCTCTCTGATGGTTTCAAGCAAAACCCTTCATGGAAGGACTGCAACCATATAGGGATTATACTTTCAGGAGGACGGCTTGAATTTGGATCTTCAAACCTCTTGCCACTGCGCCAACACCCGAAGCCCTTCTCCAGCTTCATGCTGGAGCAATGTCGTCAAATCCCAACCAGCTCCGAAGCCTCAGCACCAGACTCCGACTTCAACCGTCAAAGTATTCGCCGACAGCTGCAAGTCCAGTAA MVDGWPVTEKKHRDKRTETMDGLLETKEKLDGLFRQRRRMEATVGNEGTQKATGDEGMNGNKITEEEEKSEGGVEQDPCPPSEKHRTTYGYIPYQEVARDVHFRYGRKFECGLWLQLAAEFLSFVLLGGGKMNVESHDKKKEYAADISSIKEARLRIEPFIHQTPVLTSESINAASGKQLFFKCECFQKGGAFKFRGACNAIYSLDDDEAAKGVVTHSSGNHAAALSLAAKLRGVPAYIVVPENAPKCKVENVVRYGGQVIRSGDAIWSRETTATKVMQETGAVLIHPYNDGRIMSGQGTISLELLEQVPQLDTLIVPISGGGLISGISVAAKAINPAIRIFGAEPKGANDAAMSKAAGKIVTLAETNTIADGLRAFLGDLTWPVVRDLVEDIITVEDGEIVEAMRVCYEVLKVVVEPSGAIGLAAVLSDGFKQNPSWKDCNHIGIILSGGRLEFGSSNLLPLRQHPKPFSSFMLEQCRQIPTSSEASAPDSDFNRQSIRRQLQVQ Homology
BLAST of Moc06g40770 vs. NCBI nr
Match: XP_022155519.1 (serine racemase [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 635.6 bits (1638), Expect = 3.7e-178 Identity = 322/325 (99.08%), Postives = 323/325 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. NCBI nr
Match: KAG7036051.1 (Oxalate--CoA ligase [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 589.7 bits (1519), Expect = 2.3e-164 Identity = 310/390 (79.49%), Postives = 339/390 (86.92%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. NCBI nr
Match: KAG6606105.1 (Oxalate--CoA ligase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 587.4 bits (1513), Expect = 1.2e-163 Identity = 308/389 (79.18%), Postives = 336/389 (86.38%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. NCBI nr
Match: KAE8647861.1 (hypothetical protein Csa_000415 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 575.1 bits (1481), Expect = 6.0e-160 Identity = 290/342 (84.80%), Postives = 314/342 (91.81%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. NCBI nr
Match: XP_023532555.1 (serine racemase [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023532556.1 serine racemase [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023532557.1 serine racemase [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 573.2 bits (1476), Expect = 2.3e-159 Identity = 286/325 (88.00%), Postives = 309/325 (95.08%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2PGG3 (Serine racemase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SR PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 2.0e-134 Identity = 231/318 (72.64%), Postives = 284/318 (89.31%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2XWA9 (Serine racemase OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=OsI_16936 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 466.5 bits (1199), Expect = 3.9e-130 Identity = 228/329 (69.30%), Postives = 279/329 (84.80%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XSN8 (Serine racemase OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SERR PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 466.5 bits (1199), Expect = 3.9e-130 Identity = 228/329 (69.30%), Postives = 279/329 (84.80%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54HH2 (Probable serine racemase OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=srr PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 300.8 bits (769), Expect = 2.9e-80 Identity = 149/313 (47.60%), Postives = 218/313 (69.65%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q76EQ0 (Serine racemase OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Srr PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 293.1 bits (749), Expect = 6.0e-78 Identity = 147/333 (44.14%), Postives = 220/333 (66.07%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQI1 (serine racemase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022643 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 635.6 bits (1638), Expect = 1.8e-178 Identity = 322/325 (99.08%), Postives = 323/325 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H0A4 (serine racemase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459245 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 572.8 bits (1475), Expect = 1.4e-159 Identity = 285/325 (87.69%), Postives = 308/325 (94.77%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K3H2 (serine racemase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490819 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 569.7 bits (1467), Expect = 1.2e-158 Identity = 285/325 (87.69%), Postives = 308/325 (94.77%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KKK3 (PALP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G154750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 1.6e-158 Identity = 285/325 (87.69%), Postives = 306/325 (94.15%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TMH7 (Serine racemase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold44G002710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 561.2 bits (1445), Expect = 4.3e-156 Identity = 279/325 (85.85%), Postives = 302/325 (92.92%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. TAIR 10
Match: AT4G11640.1 (serine racemase ) HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 1.4e-135 Identity = 231/318 (72.64%), Postives = 284/318 (89.31%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. TAIR 10
Match: AT3G10050.1 (L-O-methylthreonine resistant 1 ) HSP 1 Score: 161.0 bits (406), Expect = 2.5e-39 Identity = 106/343 (30.90%), Postives = 179/343 (52.19%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. TAIR 10
Match: AT1G55880.1 (Pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme family protein ) HSP 1 Score: 44.7 bits (104), Expect = 2.6e-04 Identity = 31/105 (29.52%), Postives = 53/105 (50.48%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g40770 vs. TAIR 10
Match: AT1G55880.2 (Pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme family protein ) HSP 1 Score: 44.7 bits (104), Expect = 2.6e-04 Identity = 31/105 (29.52%), Postives = 53/105 (50.48%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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