Moc06g32630 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTCAATCTTCAAGCTTCCTTGTTTTGCAATCCTTCTTTTTCTCCCTTGCCTCTGCTTTCTCCTCCTCGCCCCCCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTGCTGCTGCGAGGCAGAGGATTCCCTGCTCTCTGTTTTTGCCTTTCCACTATCCGCACACTTCTCGCTCCATTTCTTGCAACTCATTTTCGTTTTCTAATCTACGATTTGGGTCGCGTTCTTCTTCTTCTGTTCCGTGTACATTGCACCCCGAGTATGGGAATTTCAATTCAGAATCAATTTCTTCGGCGGGCGGCTATATGGGTTCTGGTCCTCAAGATTTGGGAATTGATGGGTTCGGCGATCAGGGCGTGAGGTTCGATGGGGGCAAGTTGGAGGATGGTGGAGGCGATGGCGCCAGAAATGGGGCCTCCGAATTTGAGATGAATAATGATGATAATGGCGAGGCAGTGTTGGATACTTCTGGATTGAGTGTGGAAATGGTGGGAAGTGAGAGTGAAATTCAGACCGAGAAAGAGAGGAAGTGGAGGAGGTTGCCGTTTGTGGTGTTCTTGATGGGATTGTGGGCAGCGACCAGAAGGAAATTTGAGAAGGTAATTGAAATCGTAATGGACTGGTACAGTTGGTGGCCATTTTGGCGGCAGGAGAAGCGGCTGGAGCGGTTGACTGCAGAGGCAGATGCGAACCCGAAGGATGCGGCGAAGCAGAGTGCTCTATTAGCCGAGTTGAATAAGCAGAGGTTATGTTCTGAACCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGATTGCCAACTGGTTCTGTTTTGCGGCAGCAGAAGATTTAGTTGATACTGTTTTCAAATTTCAAGTTTGTATTAGAATCAAGGTTCTCGAAATAGCAATGACCGTGTAATTTTCCTCTTGCATCTACAACCTTTTCCTTCTGAGGTTAAAGGAATTTATTCTTGCAATGCCTTCTTTAGGAGTCTTCTTTGGAATTATGACTTCACAAGTCATTAACTGGACGGTACTTTTCTGTCTTGTAGTACACAAATTCCGTGTAAAAGTTGTTTTTCCTTGTTTTTTTCCCTCACCAATGGCCTATTTTTAGGAAGAATAAAGTTGTTATTTCTTTAAAAACTATGGATTTGTGAATAGTGATTTCAATTTATACAAATAACACTAGTTTTTATTAGCAATTCATTTAAAAACTATTTTGAAGACAAAAAATGGTGAGAACTGGTTTCTAAACAGCCTGTTTAGTTTTCAATGACCATGTAATTTTATCTATCTCTTTTAGATTCGAATCATCCCATTTTCCTTTGTCATTTGCTGTGGTTAAAAGAATTAATTATAACAATGCCTTCTTCAAGTAGTTTTTGTTTGGAATTATGATTTCACATGTCATTAACTGGCCGGTACTTACTGTTTCATGCTCTATGTAATGTGTGTTTCCAATTCCAGTCCTGAGTCTGTCATTAGGCGTTTTGAACAAAGGGATCATGCTGTAGACAGTAGAGGAGTAGTGGAGTATCTTCGAGCTCTTGTGGTCACCAATGCCATTGCTGAATATCTTCCAGATTCTGAAAATGGAAGACCGTCCACTCTTCCTACATTGGTACTCAAGCTTGCCCGATTTCTCTTCCTTTCTTAAAAAGATCTCAAATTTGTATGAACACGCTTCAATTAATTGCTCTTTGGTCTGTTCTTATCAATATTTTTAGTTGTTCATGTTGTTCTTCTAATTGAGAAAAAATGCACAGCTACAAGAGTTGAAGCAGCGTGCTTCAGGAAATGTGGATGAGCCCTTTATGAACCCTGGCATTTCTGAGAAACAACCATTGCATGTAGTAATGGTAAGTATCATATCATTCATCAGGATACGGTGTTTCTTGGACTTTTCCTCCTCTATCATTTAATATTCGTTTTGTTGCTCTATGAGAATTACTATTTTTTCCCCCAATTTTTAATATGTGAGTTGAAATGCTTCTGAAGGTTGACCCTAAAGTGCCCAACAAGTCTCGTTTCATACAAGAACTTATCTCCACTATACTTTTCACAGTTGCTGTTGGATTAGTATGGTATTAGCGTTTACCTCATGATCTCTGTCATTGTTCCCCTCCCCCTACCCCCGATTTTAGGGTGGTTTTGTGTTCTTTTAGTTGTCAATTGTATTAAATGAAAGTTCTCTTTCAGGTTTATGGGTGCTACTGCACTTCAAAAGTACATAGGGAGTTTGGGGGGCATAGGAACCTCAGGCGTTGGTTCAAGTTCTTCATATGCACCAAAGGAGTTAAATAAAGAAGTTACGCCGGAGAAGGTAGATACAAAGTATTCTACGTGCTGATTGTATGTGAAATAAATATTGTAAATGTTGCAAAAAGTTGGTGGTTGTTTGGAAACTATTTCCAAAATGGTTTTTTGCATTTTGGAACACTATTTATGTATTAAAGTTGCCTTCTTTTTACTGCATTTTCATAAATGCCTATATATTTTTTTAAAATTTTTTATAGAAAAAGATAATGTTGTCATTTGTTATAAAATCATGAATTTGTGAGTAGTGATTTCAACATGCACATTAACACTAGGTTTTATAAGCCATTTGTTAAGAAACAGTTTTGAAAACAAAAACAGTGAAATCAGTTTTCTAAACAGTTCTCCACTATTATTGCTTTTTTCCTTTTTCCGTAGAGACATGGGTAGAAAAAGATTGTTATTGTTCTAGTTTTGATCAGCCTGGGCAGAAATATAGGATCTTGGTTTAGTTCTAACATGATTTGACTCCTAGGCTAGGTGTCAGTTAAGGTGGGTTAGTGTGGGAAGAGAAGTTATTTGTTTTATGCGTAATTTTTCTTTGTATAGATGGTCTTACATTTTAGTACGCTCTTATTTTATGCAGGTAATTGACAGGGAAAAAAAAAAACTTCCTTTGGACTGAAAGCACGTGATTCAAGATTTTTTATTTTCTGTACTTGTAAGCATTACCTTTCTTCTGGAGCATTTTTGTTCTTAATTACGGGATAACTTTTCCCCTGTAGAATGTCAAGACATTTAAGGACGTTAAAGGTTGTGATGATGCAAAGCAAGAGCTGGAAGAAGTGGTGGAGTACCTGAAAAACCCTTCCAAGTTTACTCGGCTTGGTGGAAAGTTGCCAAAGGTTTGTGTTCGTCATTCCCTGTCTTGATTTGAATTTGTGGTTGCTTTTTTATTTATTTTTTATTTTTTATTGGGATAAAGACATTTATATTTAAAACTGCACCAAAAAAAGGACAACCTAAGGGCAGAGGGTTGAGAAAACCCCCTCTCAATACTTAAACAATAGTAATTTAAAATGGAATTAAAGCTATAGTTGCACAAAAATTTCTTGTGATTTGTTATCCACCAAGAAGCTGTGTCCTTGTACACTAGTACCAAAAGAATCCACGGAAAAAAGATTTCCATCAAAAAGTCTACTATTCCTCTCCCTCAAAAGAAGCCATAATAAAGCTGAGCTTGCAGTTCAAGACTGTTTGAGCTTTTCCTTTAAGGAACAACCCACCAAAGTACTCCTGTCTTTCACCTTGCTTTGTGAAAACTTTCTTCATTGTACCCTGGGATTTCAGAGGGAGCTTGAAAAGAAAACTTTAAGTTTTGTGTGTCCATATTAATGTCTTGATGTTGGCAGTTTTAGCCAGAAACTATTAGACAATTTAATTTTGTGTCATTTGTTTTTCTAATACATCTTTTGTTGTTATGGTTTATTTATTTATTTTGATAAGAAAGGGAGCCTATATTAATTTTTTTTGAACAAGATACAAACTTTTCATTGAATGATAAAAAAGAAACAAATATTCAAAGAAATGGAGAATATATTAATAAAAAAACCTATACAAGAAGGGGAATGATATTCTTGTATAGCTAAAAGGTTACAAAAAGGCTTCCTAACGGGCAATAATATGCAAATGAAAAGAGTCTTTGATGCAACAAATCAAATTGAATTCTTATTGATAGCAGTCTGTCTTAAAGGATACATAAACCAGCCTTTAAATAGGCAAACAGATAAGACACGGTAACAACAAGTTACCATAGAGTAACTACTAACAACCCATAAAAAACAAGTAATAAAAGGATTAAACAGCAAGCTAACTTATAAGAGGTTAGCTACATCACTCTTCATAGGCAAAGAAACTTTCTACTGAGTGTTTTTGGGAGAGTGTTCATACTTTTGCTTCTTCGTGGTGTCTCGTCGACAGTTTTTTGTTACAGCTCTGTGAATCTTAATGCCAACTGAAAATATTTTTTGTAACCGTTGGCTCTTTGGGGATTGCTTCTTCTTTTATAAAAAGCTCTCTATGATAATGAAATTCTCAGTTTCTTATAAAAAAAAGTGAGAAGATGCAAAAGATCATAGTTACATAAATCTTTAGAAAGAAGACAGGGGCTCTGTGCTAGAGTAAATTCCTTCAAAGGTTCTCTTTTTTGTTATGGTTTATAAGAAATGCCATTGTTTAATTTTACACCTAGATAAAGGATAATTTACCTTCGGAAGTTTTCTCACACAGAGGAGCATGTGTATATGAGAACAAAAATAGGTTACAATAGTTCCTATTCTATGAAAAAGGGTTATAGTTTGTGTCCGCCATTTATTTTCGTCTGCTATATTGCAGAACAGTTGTATGATTTATTATGGTCCATTGGAATGGATCTAATGACATTCGTGGTCAAGATGGTTGGTTGCAGAAGGATCTGTTACCAAATAACCAAATTCAACAATTACAAAAATGGTGGAAATAACCATATGGAACAATAGTAGTCAGTAGTAGTTGGAAAGGGGGCTGTTTTTTCATTAGGAACTATTCAACCAATGGGTTCAATTATATAAGATCATCCTACATCGAAGAAGAAGTTTCAGATAATGTCTCTGAAATAAGTATTAGCAGTTGTGATTCAGAACATCTCTCTCCCGATGTTAATGAAGAAGATGAAATCAGTTATGATGAAGAGTTTAATGTGGAGAAAGCGGTCCTAATTTCCAAGAGGGATTTTTCCC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BLAST of Moc06g32630 vs. NCBI nr
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BLAST of Moc06g32630 vs. NCBI nr
Match: XP_022922253.1 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1412.1 bits (3654), Expect = 0.0e+00 Identity = 748/859 (87.08%), Postives = 782/859 (91.04%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. NCBI nr
Match: XP_022922254.1 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1408.3 bits (3644), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/858 (86.71%), Postives = 777/858 (90.56%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. NCBI nr
Match: XP_022973025.1 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1407.9 bits (3643), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/857 (86.81%), Postives = 778/857 (90.78%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. NCBI nr
Match: XP_022922252.1 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1407.1 bits (3641), Expect = 0.0e+00 Identity = 748/866 (86.37%), Postives = 782/866 (90.30%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2ZVG7 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 9, chloroplastic/mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=FTSH9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1075.1 bits (2779), Expect = 0.0e+00 Identity = 550/692 (79.48%), Postives = 604/692 (87.28%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80983 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 4, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FTSH4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 563.5 bits (1451), Expect = 4.0e-159 Identity = 322/610 (52.79%), Postives = 429/610 (70.33%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LQJ8 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 5, mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=FTSH5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 560.5 bits (1443), Expect = 3.4e-158 Identity = 325/621 (52.33%), Postives = 425/621 (68.44%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LQJ9 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 4, mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=FTSH4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 539.3 bits (1388), Expect = 8.0e-152 Identity = 313/620 (50.48%), Postives = 416/620 (67.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUM0 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1656.3 bits (4288), Expect = 0.0e+00 Identity = 849/849 (100.00%), Postives = 849/849 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E626 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430290 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1412.1 bits (3654), Expect = 0.0e+00 Identity = 748/859 (87.08%), Postives = 782/859 (91.04%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E2V5 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430290 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1408.3 bits (3644), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/858 (86.71%), Postives = 777/858 (90.56%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IAB1 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471540 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1407.9 bits (3643), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/857 (86.81%), Postives = 778/857 (90.78%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E2Q6 (ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430290 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1407.1 bits (3641), Expect = 0.0e+00 Identity = 748/866 (86.37%), Postives = 782/866 (90.30%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. TAIR 10
Match: AT5G53170.1 (FTSH protease 11 ) HSP 1 Score: 1136.7 bits (2939), Expect = 0.0e+00 Identity = 585/714 (81.93%), Postives = 644/714 (90.20%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. TAIR 10
Match: AT2G26140.1 (FTSH protease 4 ) HSP 1 Score: 563.5 bits (1451), Expect = 2.8e-160 Identity = 322/610 (52.79%), Postives = 429/610 (70.33%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. TAIR 10
Match: AT5G15250.1 (FTSH protease 6 ) HSP 1 Score: 424.1 bits (1089), Expect = 2.7e-118 Identity = 241/491 (49.08%), Postives = 315/491 (64.15%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. TAIR 10
Match: AT5G15250.2 (FTSH protease 6 ) HSP 1 Score: 412.9 bits (1060), Expect = 6.1e-115 Identity = 243/514 (47.28%), Postives = 317/514 (61.67%), Query Frame = 0
BLAST of Moc06g32630 vs. TAIR 10
Match: AT2G30950.1 (FtsH extracellular protease family ) HSP 1 Score: 406.8 bits (1044), Expect = 4.4e-113 Identity = 245/541 (45.29%), Postives = 328/541 (60.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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