Moc06g13310 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc06g13310
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6: 10405185 .. 10410743 (+)
RNA-Seq ExpressionMoc06g13310
SyntenyMoc06g13310
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCAATTTAATATGAGTACAGCTTTCCACCACCTCCATTCAGATCTCATCCTTTATGATCTCTCGACATTCCAATCGTTAACTTCTCAGCTGCTACGGCCGTTTCTAGGACTGACCGACACCTCACCTACCCAGGTACATACGTAGTGTAGTGTCGATTGCCAGGATGAATTGGTTTGGTCTTACCTCTCGCTTGGATATCAGACTCCCGCTATGATAAGTACTGCATACTGCCATTAGAAGTTTGCATTCATATGAACACGTGGTTTTTGTTAGTCTTATTGTCAGGCGTCAAGTGCGCATCTCATGCATTTAGGCAAGTTTAATCCTCCTAAAATGGAAAATTGCATTTTAATCTGTTGGAGCTGGTTTTTTACCTCACACGTGGTACATCCTTATTAGAAGAGAAAAACACGCATGACTTTAAATCCATGAAGCCAAGTTTTACACCTCGGTATTTCGATTGTCTATCGAGTCGACGCCCGTTATGGCCGAGCCGACCAAGATCTTATTTGGTCCGTTTGTTTGAACCGACCTAGACGTGTCATGCTCAACCTCATATACCGACAAACTCCACGACAGCACGCCATGATTCGCGCTTACCTTAAAGAGCCGTTGGGGCCTTCTTGGGAATCCTGTCGAAGACCTTGCCTATATATAAAAACCATTTGCCTCTATCCCAAGTACGTGAACATTGTATTTTCTCTTGAATACAACTCGGATTCTTCCTGACTTGGGCGTCAGAGTGTTTTCTCCTACTGGTTTCCTACTCCGCACGTTTCATCTCATCCTCAAGGTCATCCTTCCGTCCTAGCCTAGTTCGTAAACTTGGTCATTTTTATAATCAAACATCTATCTTTCGGTTAAATCGAACCCGATCCAAGTCGAGATCGAAGCCTGTTAAAGTCAAGTCTGTTGCATTCTATTTTTCAGTTAAATCGGACTCGATTGTGGTCGAGGTTGATGCTTGTGTAAAAATCAGGTCCGTTGCATTATATTTTTCGGTTAAATCGAACCCGATCCAAGTCGAGATCGAAGCCTATGTTAAAGCTAGGTCTGTTGCATTCTATCTTTCGGTTAAATCGGACCCGATCGTGGTCGAGGTCGAAGCCTGTGTTAAAGCTAGGTCGATTGCATTTTCTCTTTCGGTTAAATTGAACCCGATCCAAGTCGAGGTCGAAGCCTGTTGTTAAACCCAGATCCGTTGCATTTTCTCATTCGGTTAAATCGAACCTGATCCAATTTGAGGCCGAAGCCTGTTGTTAAAACCATGTTTGAATCCCATCTAGTGTCAAGGTGGGTTCATCTCTATCTTACCTTGTTTGAATAAATTTTTCGCCTTACCAATACTTTGTCTTTTTGCCTTTGTCGACCCTTTTAGTTCTGCAAAGATACATAAAGGGAGGCAAGCTATAGACACCGTATTTGGTCCGGCTAAAAATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTCTTTCTAATTAAGAAGGTTGTACTTAATTTGAGTTTTATTAAAAAATTTATTTTTCTAAGTGATAACATATTAAATTAAAATTGAGATTATTTAATTGTTGTTATGAAAAGGAAAAAATGAGGAAATAAATGAAATGGTCATTTTGGTTTTCTTTAACGAAGATTTTTTTTGTTTGTTTCTTAAAAGGTTTTAATCTTAAATTAGCCTTTTAGTAAAAGATTTTGTAGGTTCGGTATTTTTTCCTTTTTTTTTCTCTACCTTTAGTTAAACACTCCAGATTTATTTTTCTTCCACTATAAAAGGAAAATTAAATTAGCAAAAAAAAAAAAAAAACACAGAGAAGGAACATGACAAATAAGAAAACTAGTTCCTTTCTCTCTCTAAAAGGGTCACCTTCTTCTTCTACATGTCACCACTTCATCTTTCTCTATGTACAAAAAACTCCGGCAACCCATACCGGTGACAACTTTGCAGACGGTAACAATGCACCACAAACTCCGGCAACGAACTCGTGAACTTTGGTGGCAACACAATAGAACTTTGGTGAAGCAAGATTTGGACCAACTCAGATCGACACCAACTTCACATTCTGCTGACAGGTCTTCCCGAATACGGAGGTTACGGTGTATACTTCCTTTCTGATTTTTTTTAAAAAAAAGATTTGTTTTAAATAAACAAAACTTTTCAAAACAAGAAAAATTAAAAATACGTTTTAAATGTGTTTTTGAAAAATAAAAAATTTTGATAAATGAAATTTGTTTTTAAACAAAAGTTTTTTTTATTAATAATTTAGGGTGAGATTTAAAAGAGAAGATTTGTTTTAAGTTTTAAACATCTTTTAAATTCAAATAAAATAAAAAGTTTTGTTTTTAAATAAGGATTTTGTTTTAAAAGTCAAAATGAGTTTTCTTTCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTCTTATTTCAAAATAAATAAATGTTTGTTTTAAATTAGAAGAAGAAGACTTTTGTTTTTTTATCTTTTATTTTAAAGGTGCAATTTTGTGAGTTTTTTTTTTAAATCTACCATTTTTTTAAACTTATTAAAATGAATTAATAAAAAAAGCATATTAAAATGAATTAATAAAAAAAGCATAAAACGATAAGTTTTATAAATAAAAGAATAAAATCTTTTTAAACAAGTTTGATAATTATAGTTTTGAAAGGAATCTGAATAACTAAAATTTGTTTTAAATAAAATCTTTTTTTTAATTAAGAAATAAAGTTTTTATTTCAAAGAATCTCTTTAATTTCAAATTAAATAAAAAGTTGTTTTTTTTTTCTAATTTATCAAAATTCGTAAGTTTTTTTTTTTGTTTTAAAAATAAATTAAAAATTTTGGTTTTGTAAAAGAATGTAGTATTTGCATCTTAGGGTGTTGGCATAGTGGTAGGATGCTTGGGATAAATTTCCATGACCTAAGTTTGAGTGTCTGCTTGACTCAAAATAAAATTATTTTATTTTATTTTATTTTTGTATCATTATTTTTACTAAATAACTATTTTAAATAATTTCGTTTAGAGTTTTGCTTTAAACCAAGTTTGAAAATAAAACTTTAGATTTTAAAAAAGAAACTTAAATTGTATTCTAAGGTGTTTGACAGACTGGCAAACAATTTGGATATTAATTAACATGACTCATGAGTCCTTGCGTGCCTCAAAAGTTAAATTGTTTTATTATTTTATTTTTTATCTTTGTTTTTAATTCGAAAACTCCAATGACGGAAATTGGAACCTTCCAATATTCTGGAGGTGATAAAATTTTTTCTAATGGCATTCGTGTCACTTGTACATATTAATTCATATCTTATAACAAAGTGTGAATTAATATAACGTAGGACATTTCAATCAAAACACAAAAATATTTCTTTTTGGACCAAATAAAATAATTGGATAAATTTTTTGACAAAATATGGTACCGTTTTCGAACATAGGGTGCTAACATCTCCCCTACAATCAGTCGACTCCCGAACCAAAAATTCTGTTTTCGTAGACCAATTTTTTTTTTTAAATAGGTGACCAATCACACATCGTAGATGATTGATTGATGGTGACTCAAAACCCTTATCTCGAAAAAGATCCTTCAAGGGATGACGTCAGCCGCTCCGCGTTGCGATGACGTTGCGACAAAAGATATATATATTATATGCTAAAAGGATAAAATAAGAATAATAAAAATTCAGACGTTCTAAAAAAAATAATAATAAAATTTCTGAAAATAAAAATTCAAAAATTTTGCCATATTTGTAAAATACAAAAAACGTTGACATTTTTGCAAACACGGCCAAAGATATTACTACCCAAGGCAATTTCTCAAATAATTACCTCTTCTAGAGGGTTGATGGATCTATTTGTTTGTAAAATTGATTGCTTTTGATTTTGAGTCTATCCTCTGTTCAGGATTGTTTGAATTATAATGTTCTTAATGTTTCTTTCCTACTGGCAAAGATGTAGTTGATTTTAGGCTTAGATTTTAGCCCTTGGAACAGGGAGAATTTAGGCTAGATATTAATAATTCAACATCGGCATGGGTTTGGTTGAGTTGAGAGATCTACAAAATTTTTTGAGGCATCATAAATAGTTTATTCTTAATAAAGTTTCTAATTTTTTATTTCTCTAGATAGAGATATTGGAATTTAATTAGAGACTAGACCAAACTTGCTTAGGACACAAATAATTAGATGAATCAAAATTCTTGCATACAAATCATAATAGAGAATAATTGAAAGTTAATTTGCATGATTTTATAAATCAATTAGGTGAAATATTTTTATTTTATTTTAACTTTTTTAGTTTAAATTTCAAAATCCTTTTAATATTATTTATCTAAACAAAGTTATAACTACTCAATTCAAGTAACATAGAAGATTTTTTTTTTTTCACACCAATGATAGAGGACGATTAGGGATATCCATTTTCCCAATTTCCGTTTGGGGATTTATCATTAAAAATTAAGTATTTAATTAGAAATTGAAAAAAATTATTTAATTGGGAAACTATTTAAAAAAAATAAAAATAATAAATGGAGAATAATTTCTTGTAGGAACCGATTCCCCGAAAATTTAGGGCATGGAATGCCTGCAGCTTTTATTCTTGCAAAATTTCATCAAGATTTTCATGGGACTAAGAATTAAATGGTGGGTGTTTGGCCCTCGAGTTTTAAGACACGTCACAACTCAAGTAAACCAGAAGGAAAAAAGTACTTAGTGAGGGCTACTAGCCGGAACTGAGCGGTTTTATTTCCTACCCACGTGGTGTATCAACCGCCTCCCCCACTAAGCAGGCGACTTCCTACTTTTAAGGAATTGGAACCGTTTCATTCAAACGAGGATCCTTACCTCTCCAACGGTTACTTTTCTCATCCCCTATAAACATCAATTGAAACTAAAGTATCTGGTACACAAAAGAACTGATCAACTCAAATTTTAATTAGTTACTTAGCATAAAGATTAACGAGATCATCGGAGTGCTAACTTGTTTTTGCAGGTTTATTTATCTTGGAGTGTTCT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mRNA sequence

ATGCAATTTAATATGAGTACAGCTTTCCACCACCTCCATTCAGATCTCATCCTTTATGATCTCTCGACATTCCAATCGTTAACTTCTCAGCTGCTACGGCCGTTTCTAGGACTGACCGACACCTCACCTACCCAGAGTGTTTTCTCCTACTGGTTTCCTACTCCGCACGTTTCATCTCATCCTCAAGTTAAATCGGACTCGATTGTGGTCGAGGTTGATGCTTGTGTAAAAATCAGGTCCGTTGCATTATATTTTTCGGTTAAATCGAACCCGATCCAAGTCGAGATCGAAGCCTATGTTAAAGCTAGGTCTGTTGCATTCTATCTTTCGGTTAAATCGGACCCGATCGTGGTCGAGGTCGAAGCCTGTGTTAAAGCTAGCAATGGCGGACGATGGAATGTCTTAGCGATCATTCACGAGCAGCCGGACCCAAAACACTACGCCACCCAAACTCATGGACGGGGAAGACCACCCTTGATGTGGGACGATGGAGCAAGGAGAAACGCCGTTCGTCCCAGTACTTCAAGTATAGCCAGACAGATGGGTCAAGAGTTGGTAGAGTTGCGTGCGGATCTTAATGAAGTTAATTCTGAACTAGGAGGAATCACCCACTTGAGGGCGGAGATAGCGGAATTGACTGCGGCACCAATGTGGGCGGAGATAGTCAAATTCCAGAGGCACCAATGTGGGGTACTTCTAGATCGTCGATCAGGGTCCAAGAGATTGATGTACACGAGCATACTGGCGAATCCCCCATTCCCCGAGATCCTACGTGTGGAAAAGCTCCTGCATTATCAGGAGATGAAGATGTTCAACCTCGTGTGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCAATTTAATATGAGTACAGCTTTCCACCACCTCCATTCAGATCTCATCCTTTATGATCTCTCGACATTCCAATCGTTAACTTCTCAGCTGCTACGGCCGTTTCTAGGACTGACCGACACCTCACCTACCCAGAGTGTTTTCTCCTACTGGTTTCCTACTCCGCACGTTTCATCTCATCCTCAAGTTAAATCGGACTCGATTGTGGTCGAGGTTGATGCTTGTGTAAAAATCAGGTCCGTTGCATTATATTTTTCGGTTAAATCGAACCCGATCCAAGTCGAGATCGAAGCCTATGTTAAAGCTAGGTCTGTTGCATTCTATCTTTCGGTTAAATCGGACCCGATCGTGGTCGAGGTCGAAGCCTGTGTTAAAGCTAGCAATGGCGGACGATGGAATGTCTTAGCGATCATTCACGAGCAGCCGGACCCAAAACACTACGCCACCCAAACTCATGGACGGGGAAGACCACCCTTGATGTGGGACGATGGAGCAAGGAGAAACGCCGTTCGTCCCAGTACTTCAAGTATAGCCAGACAGATGGGTCAAGAGTTGGTAGAGTTGCGTGCGGATCTTAATGAAGTTAATTCTGAACTAGGAGGAATCACCCACTTGAGGGCGGAGATAGCGGAATTGACTGCGGCACCAATGTGGGCGGAGATAGTCAAATTCCAGAGGCACCAATGTGGGGTACTTCTAGATCGTCGATCAGGGTCCAAGAGATTGATGTACACGAGCATACTGGCGAATCCCCCATTCCCCGAGATCCTACGTGTGGAAAAGCTCCTGCATTATCAGGAGATGAAGATGTTCAACCTCGTGTGTTAG

Protein sequence

MQFNMSTAFHHLHSDLILYDLSTFQSLTSQLLRPFLGLTDTSPTQSVFSYWFPTPHVSSHPQVKSDSIVVEVDACVKIRSVALYFSVKSNPIQVEIEAYVKARSVAFYLSVKSDPIVVEVEACVKASNGGRWNVLAIIHEQPDPKHYATQTHGRGRPPLMWDDGARRNAVRPSTSSIARQMGQELVELRADLNEVNSELGGITHLRAEIAELTAAPMWAEIVKFQRHQCGVLLDRRSGSKRLMYTSILANPPFPEILRVEKLLHYQEMKMFNLVC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 178..198
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 145..164

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc06g13310.1Moc06g13310.1mRNA