Moc06g10520 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc06g10520
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6: 7782249 .. 7790221 (-)
RNA-Seq ExpressionMoc06g10520
SyntenyMoc06g10520
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGTTGACTTGTGTAGGGAAGTAAGGCAGAGAAGGGAAAAGGATCCTCCAAATCTGGCATGCACGTTTGCAATGGAAAAGAGCATGAGTAGAGGTCTCCCGCCTTGCGCCACAATGAGTACAGCAGGTAACACATCGATTCCTCTTGAATGTAGATTTTGGGCTGTAAGAATGTGTTCATGTGCTGCTCTCCGAATCAAGATCTTTATTTTTGTAGGAACATTAAGCTTCCAAATAGAGTTTCATTACGCCCCCTGCAATCCGTGCTAGTAGAAGTTTTGTTACATTTTAGATGCAGCTTTGTACCCATTACGAATACTATAGTTTCCTCTCTTATCATAGTGTCAAAGCCACGAATCTTGTAGGTTGTCACAAAAGAAATGTGAAATCAATGTAGCATCCCAATTTTCGTCTGGAGCAATCAAATTTGCCACTGTGATATCCAAAGCTCCATTGTTGACCGATAAATGTTTGAAAGTAGGGGATCTTGTAAGCCATGGATCAGATAACACCTTAATTAATTGAAGATCCATTTCCCACACGTAATCTTAAACCTTTCACTAGAAGATCTCGTCCCCACAGAAAGCCTCTCCAAAAATAGGAGGAATTGGTAGATTTTGTGGCTTGAAGAAGAGTAGTGTCCTTAAATACTTAGATTTCAAAACCTTAGAAGCTAAAAGGTTTGGGTATCGGAGGATATTAATCAAAACTTAATTATATATTTTTATTGATAATTGATCAATTTGGACGGAGAATTCGAACTCATGATCTTTTAATAGGTATCAATCAAAATAGGTATCTCAATCAGTTGAGTTATATTCAGGTAAGCAACAATTAACAATGACTCTAAATAAGTAATTACCAAAATTATTTCTCGGTTACAATTAACCATTTAGGGTTGCTTTTCTAAAGTTTGATTAAATTATAGTTATAATGTTTTTTTTTTCAATATGATCGGTAGGAGTGGGAATTCGAATTTAAAAGCTTTTGTCGGACATAAAGTATCTTAACCCACTCAGATCAACTTGATCAATGTTATTTAATTTGTTTTATTTTAGCTATTACATTTTTGTAAATATCTTCTTTTTAGTACAACGCGTAGGAATGAGAAATCGAACTCACAACCTCTTGGTTGTAAATATCTTAAATCTGAATCTATCTTAAAATTTAATTAACTAATTAAATAGTGCTATATAAAAATCTGTGCGGTACTATTTTGACTTTCAATTTTAATTTATGCTAGTGTGTAATATCAATTTTATATTTTCCAAAGCAAGTATAGCTCAACGGTAATTGACATATATATCAAACTAAACTAAGAGGTTGCGAGTTCGATCCATCATCTCCACATATACTACAAAAATATCAATTTTATAATTTCATTTAATTAGATAATTAACATTGAAGACTAAATAAATAGTTAAATGAATGTTATATTCACTAAAAAAGAAAAGGAAAAAAAAACATAGTATAGATACTAGAATTGTAAAGGTCCCTTTTTTTTTTGATAATAGAATTGTAAAGTTAGAAGTTATTTATAACGGTTTCATTCTTGTTTCCAATTTGAAAAAAAAAAAAGAATAAAAATAAGAATTTTGTAACTATTTCTAACTATTTCTATTTTTTATTATTCATTTTTAAGAAATGTTCTTTTTTTTTTTTGAAATCATTTTTAAGAAATGTTCTAAAGCATATACAAATTTTGGAAACGATAAGATCTGGTTTATGGTTTTTTCTTCCAAAATTTTAAAAATATAAATAAAAGTATTAATTATTCTATATTTTTTACTCCTAAGATGAATAATAAATATAAAAAATTAAAGTATACAGAAAATAATTTTGAATATTACATTTTTAAGAAATTAGTTTAGTATGCAATTTTTTTTTAATTTAAGATTTTAGAAAATATGATAGAACTATAAATTTTGGTCAATCATAAACGATGTCAAAATTATATTTTATTAAATTTGGGGACGATTATAAATAATCTGTAAATTAAAATAATGACAAGTATCTTTCATGGGCTCTTTACTGCTTTAGGTTGGATAATCCATTGAATGATATTTTGGTTTGAAATCCAAATTACCATAACACTATTATGATGAATAATAAATATAAAAAATTAAAATATATAGACAATAATTTTGAATATTACATTTTTAAGAAATTAGTGTAGTATGCATTTTTTTGGTAGACACCGTATTTGGTCCGGCTCGCTTTCGTTTAAAAAAAATTATTACCTTTTTCTTTTTTACCGTTATTTAAGTGTATTTAAAGAGGGCTGCAATGGAGAGGAGGGGAAGATGCCAGAGAGGAGAAAAAAATCAAATCATTCACTTCTTTTTTTTTTACCATCATCTTCTTTTCTTCTTCACCTACACGGTGACCTCTGACCACGATCAACTCCGATCAACTCTGGCAGTGACGCAAATTAATTCCGACGAACCCGTTCGGATATACACCTCATCGACCCGCAACATTCCGGAACCTCTGTTTAAAACTACCTAGGTGAGAAGGTGAGTTCGGGATAGAAAAAAAGGAAACTTTTTAGCTTTAAACAGAATATTTCTTTAAGAGAAGAAGATAACGTTTTTTCAAAACTATATTATGGAGAATGCAAGTGTTTTTTATTAAATAATAATAATAAGAAAACGTTGTTTTCAGAAGAGAATTATTTTTTATAAAGGTTTTTATTAAAAACGACAAAGATTTTTTAAAAAGAAAGAAAATAAAAGATTTTGAAAATTTAAATTTTTATTTAAAATAGTAAGATTTGTTTCTTTCCTTCATTTTTTTTAAGATTTTGTTTTACATCTTAAATAATAATTTTTAAAAAGTAAGTAGAGATTTGTTATTTAGTTGGTAAAAAGTGAATAAGATTTTTTTAAAAAAAAATATATTTGATTTTAAATAGAAGATTCTTTTTTTAAAACGAATTTCAAATCCCTAAAATAATTTTTTTTAATTTTCATTAATATTTTTGTCTTTTTTTAAAATACAAATTTTGAAGATAAACTTTGTTGTTTAAAAAGACATTTGTACGGTATAGTGGCAAAAGCATTGGGTATTGAAATAACAAGCCGAAGTCTTCATGTGTACCTCAAAATGATTTTTTTTACTTTATTTCATTTTTTTCATTGTTTTTACCAAATAATCATTTTAAATAAAAGTTTTTTTTATTCTTTCTAAATAAAGGATTTTCATTTAATTTTTTTAAACAAAATTTAAAAATAAAAAGTTTGAATTATAAAAGAATTTAAAGTTCATAGGTGATGACGCATTGGCAAGGCACTTGGTTATTAATACTCATAGCTCAAGTTTGAATCGGGCCTCAAATTAAATTTTATTTCATTTTTTTAATCATTTTTTAAATAATTATTTTGGAAGCTCGAAATTGGGACTTTCCAATATTCTCGGGGATAATTTGTTTTTTAATGGTCTTTGCGCCACTCATGCTTGGTTCATATTTTGCGAAATATGAACCAATAAATTTGGGACATTTAAAATCAAACACAAAACTATTTTTTCTTTTTTGACCAAATATAATAGGATAATTTTCGACAAAATATGGTACCGTTTTCGAACGGGTGTCGTAGGGTGCTAACACCCCCTATGCTCAACCAACTCTAGAACCAAAATTCTGTTTTCGTATACTAAGTTTTTTTAAATAGGTGATCAATCACACCTTGTAGATGATTGGTGGCGATTCCAAACCCTAATCTCATCAGGGGATGACGTCAGCCGCTCCACGTCGCAATGACGTTGCGACATTTTTAATTTAAAATTTTAGAGGATATTGTAAACAACCACTGCCAAAATTATATTTTGGGGCCGATTATAAATTATTCCTAAATTAAAATAGTGACAAGTGTTTTTCATAGGTTCTTTGGATTTGATTTAATTAGTCGAAATGGACCATAAAAAATTAGGTTCATAATCAATTTAATTCACAAATCTATGGATGATATTTTGGTCTGAAATCCAAATTACCATATAACTATTATGGTGAATTGATATTCAAATTTGCACAAGTCTAAATCAACTCAAAGAACTGGGTTGAGTCCAAAATCACCCAAGTCCAATACCCACTACTTTGATCTAGCATAACTCTTAGATACTTACCCTAGAGGAACTCAAATGAGAATTGCTTGATTTCTCAAATGAACACAACAACAACTATTTATAATTGTTCAAAACAAGTAGCATCTCACAATGTAATGTTTTTACATATGTAACTTAACACATCCAAAGTTACAAATATGTAACTTTGTAAGCTTAACAAAATGAAGAAAAAAAAATTTCATTTAAATAGATAACTAAATTTAATAAAAAAATTCATTTAAATAGATAACTAAGTTTAATAAGTAAAGAAATAGAAGAGACGATCATATCTTGATTTCTTAAAAAATTCAGGATCGTCTTTGAAGAGAAAACCAACCGCTGAAACTCGAACCGACAAAGAAAAAGAAGAAAACTGGGTCAACAACCACTATCCAATACAGTATTCTACTATTTAATTTGTAATATATTATAGTATTTGTTTTTTCCTTAAATGATCAAAGGCGGCGAACCACAAAGACAACCATGCCTTGATTTTTTAAAAAATCAGGGTTGTCTCTAAGAGAAAACCAACTGCCATTTTTCCTTTAATTTTATTTAATGCAGTATTATTTTAAAAATAATCTTAAATAAAAACGTTATAAAAAAAATCCAGCAAAATCATGTTACTTTATTGTTATTTTTTTAATAATAAGTCCAAAATAAAGTTTGGGGTTTTTGGTTGAAAATTTCAATATATTTTTTTCTATTAAAAAAAAGTGGTACGGAAATTTTATTGACCATACAATTACATTAACCATCAAAGAAAATTAGAAAAATAATACACAAAACAAAAAGAACACGGTTTTTTTCTTCTAAAAAATATCTTTCATTTTTTCCTCTATTTTTATAATTTCTCATCTATTATGATGTACATGCATTTCCATGTTGTCAAAAATCGA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mRNA sequence

ATGGTTGACTTGTGTAGGGAAGTAAGGCAGAGAAGGGAAAAGGATCCTCCAAATCTGGCATGCACGTTTGCAATGGAAAAGAGCATGAGTAGAGGTCTCCCGCCTTGCGCCACAATGAGTACAGCAGCCGGAGAACTTCACAAGTTACAAAGTCGAAGAACTTCAACAAACTGCAAAGTCAAAGCACTTCACAAGCTGCAAAGTCGAAACACTTCACAAGCTACAAAACCAAAGAACTTCAACAAGCTGCAAAGTCGAAGTACTTCACAAGCTGCAAAGTCGAAACACTTCACAAGCTGCAAAGTCAAAGAACTTCACCAGCGCAAAGCCGAAGACTTCACAAAGTCTTCATCAAGCTACAAGCTAAAGAACTTCATCAACAAGTCAAAGTCTTCAAACAAACTCAAAGCCGAAGACTTCAAAGATCCTTCGTCAAGCGAGAAGCGGAAGACATCAACCATTCAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTTGACTTGTGTAGGGAAGTAAGGCAGAGAAGGGAAAAGGATCCTCCAAATCTGGCATGCACGTTTGCAATGGAAAAGAGCATGAGTAGAGGTCTCCCGCCTTGCGCCACAATGAGTACAGCAGCCGGAGAACTTCACAAGTTACAAAGTCGAAGAACTTCAACAAACTGCAAAGTCAAAGCACTTCACAAGCTGCAAAGTCGAAACACTTCACAAGCTACAAAACCAAAGAACTTCAACAAGCTGCAAAGTCGAAGTACTTCACAAGCTGCAAAGTCGAAACACTTCACAAGCTGCAAAGTCAAAGAACTTCACCAGCGCAAAGCCGAAGACTTCACAAAGTCTTCATCAAGCTACAAGCTAAAGAACTTCATCAACAAGTCAAAGTCTTCAAACAAACTCAAAGCCGAAGACTTCAAAGATCCTTCGTCAAGCGAGAAGCGGAAGACATCAACCATTCAATAA

Protein sequence

MVDLCREVRQRREKDPPNLACTFAMEKSMSRGLPPCATMSTAAGELHKLQSRRTSTNCKVKALHKLQSRNTSQATKPKNFNKLQSRSTSQAAKSKHFTSCKVKELHQRKAEDFTKSSSSYKLKNFINKSKSSNKLKAEDFKDPSSSEKRKTSTIQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 64..96
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 64..100
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 132..155
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 124..155

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc06g10520.1Moc06g10520.1mRNA