Moc04g27210 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc04g27210
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 20042390 .. 20046866 (-)
RNA-Seq ExpressionMoc04g27210
SyntenyMoc04g27210
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTTGGAGAGCTTACCGAAGGAAGGACGAGCCGGGGAAGAAGCAAAGCCCGGCATGGAAATGGAGAGCTCTAAGCTGGATGAGTTGATTGGTGAAACCGCCATGGAAGTTGTGGAGAGGATAAAGAAGAAGAAGAAGAAAGGAAGAAGAAAGGGAAAGATGGAGAGATTTAAAGGGTAATTAGGTGAAGAAAGGGTCATACAAAAGGGGGAGAGGAAAAAAATGAAGGTTTTAGAGTTGGGTTAGGGTTTTATTGACTAAGGTGGTCAAAGTCAAAGGATTGGGAATGAGTTCCGTCTAATGGATGACACGTGTAACAATGATGGCTGTGGAAAAAATCATTAAAAAAAAAGAATTTCCAAAAGGCATACTACTCTTATTCATTTTCATTGTTAGCGATGTCAACAATATGTGTGAGAAAATTTTTATTACTATGATAGTTGTACGATCATAATGCTTCAATTTTTTTCCTCTTCATATTATTCTCATTTATTATAAATCAGTTGTTAACTCTTAAAAGTAACGTGAAGTCTAATAGTATTTAAGAATTATTTATTTATTTCAAGAAATAGAAATATTCTCGATTCATACAATAAAGTAACATACTAAAAAAGAGTGCGTAGAGGAAGAACAAGCAGGGAGAGATTTTGTTGGGGGAGGTCATTGTTATCCCGTGTATTTTTTTAAAAAGGATGATTTTGGTCACTTCATATTCATTTTTATCTCGTTTCTTTGGATCAAAATTTTAACATATACATCACTCATTAAACTTCTTGAAATTTAACTCCAAATTTGTTTAAAAAGATCTGGATAAATTTGTATTGAAATTTGACCAAAACCATTGTTTGAAAAATACTAAAATAAATCAAATAAAAAAAATAGATCATAATAGTACTTGAAGAATAAAATAACATATAAAAGAGAGAGATTTTGTTGGGAAGGCAAAAAGTGGCTTAAAATTTGGTTGTCGGTTAGAAAAAAAGGTCAGCTGGAGAAATGATTGGGTGTTGCTCCTAAAAACCACTACTCCGTGGACCCTTTTATCTCCACCTTTAATTTTCCAATCTCATCATCTGGTCTCCTCTGCTCCCTTTTATACACACAATTTCCATCCAAATTTATATTATTAATATTAATAATATTGCTCCTACTATCACCTGAAGAGACCTTGTTTATTTCACATTGAGATTTATTTTCTTAATCGAGTTTTTAGTTTTATAATCTTTAATTTTATTTCTATTTTTTTTTCTTTTTTTCCTTTTGTTTGTTTGGTGTTGTCCTTGTCACTTTGGATTCCTAGTTTTTTTTAGAGGTCTCTTCTTTTTTTTTAGTCTTGATCTTGAGATTGTTCTAAAAAAAAATTGTCAATTGATCGAGTTCAAATGGTATAGTTTTACTCCTATCCTGAACTTAGCATGATATATCAATAAATTTTATTTGGAAACTTATAATTTCTTTAAAGTGAATTTGTGAACTTAGATAAATAGTGTTGTAATTTTTATTTTATGTTCAATTTTTAGGTTTACTTCACCCACTAATCTTAACAACATTAATGTAAAATTCTCATAGCACTAATTTCATTGAAAATAAAGTTTTGCACCATATTAATTTTGATCAAGTTTAAGTTTAAGTTTAATGTAAAAATTGCTGCACTCTCTCAAAGTTTAAGGCAGCAAAGATTGGGACAATTTTTTAAATTAAAGTTAAAGATTTTAACCATTGTCTAAATTTAAGGTGAAATTTGATGAAATTAATTGTTTAGAAAACTTAATTCCTCAATTTTTATTCATGTTTGAAATATTCTCAAAGTTTATCGATATAATAAATCACTTATAAAAAAAAAATAGTTCATCTCAATAATCTTAGAGTTAGTAGAAAATATAAATGTAAAAATGTTATCCTATTTGTTAATTTTCTTGGTGAGAACTTTATCAATTTAAGCTTAATTCAACAGGTTAAAGCATTTATCTCCGATCAAAATGTTTTAATTCTAACCCCACTTATTATATTTAAAATATATATATATTAGACAACTTTTTCCTGCGAGAGGACAAGTGGGAGTTTGAGAGATTTAACCCTTATATGGAAACCTTAAAATCAACTTAACATTACCAATTATATCACCACTAGTTATATTATTCAATTTGAAATTCATGTAAAAAAATTAGCTTAGAGATTCTCCCTAGATTTGGACAAACAACAGTTAGGGTTTAGGAACTAAAGATTAATAATGAGGTCATATAATTAAATTCAAACTATTATTAAATTTCAAAATGATATGAATGGTAACCTTAGCATAAAGAGAAGAGTAAACCCTTCCTACCATTCATGCTGATAGGAAGAAAACAATGAATAGGGTTTCAAAACTTAATCAATGAAAGAGACAATCAAGAGAGCCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAAAACAAGTAGGTAGGGGGATTACTGCTGAACTATGCTCGCTTTCGACGTATCAAGAATATATACCTTAATCAATATTTAGTTATACTCAGATTTGCATTAATATATATTTTCCTTTACGCCCTTTCCATTGTATTCTTTATTGTTTTTATATAATGGGTTTAACTGAGCGTGAGAGATTTGAATAAAAATTAATAATAATAATAATAATAATAGTTGAATCAATTGGATTTATTTGTGTTCTAGAGATAGCTTGATCAATGGGAGAAAATAACCATACATGTGAATTTTGTTGTGTAACTTTTCTAATCATATATGTGAATCTCTTCATCAATTACTTGTTAAAATTTTTTTTTGTCAATTTGAAGGCTACTAATCATAATTTATTACTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAGTAATTAAGTTTTGCTTTTGTTGATGCGTGGATTTTGGTCCTCCGGTTCTCCTCCTTGCACCCACCAAACTTGTTGATTCGGGACTAGTACCTACAAAACCAAATCGAGCTAAACCTGCAAAACCAAATCGAGCTAAACCGGGGTGACTCTAGTCACACGGGCTCCGATGCTTAAGTTAGCAAGAGAATAACGCAAATGTAGTCAACTTTTAGATGCCCCTACCTCTAAGGCTGGATTGCTACTTATAGCGTGAAGTTGTTCCAGAACTTTCCGTAGCTAACCCTAATTCACCGTTGCTGGGCCTGGACGAAACCGTCGATCGAAGATGGGGGATCATTGGCTGGGCCGTGGGCCGAGCCCCGGGTCGGGTCCGAGCACCGGGTCGGGACAGAGCCTCGGGTCGGGACCGAGCACCTAGTCTGGACCGAGCACCGGGTCGGGACCGAGCACCTAGTGGCCCAGCGGGCTTCCCTCCGATCGTAACCTGTAGCTCGACTATCGATTCTCGTTGCATAACAGTTGCCCCCTACTCCCAATGCGATGCTTTCGATCTCATTGGGAGTGTAGCTTTTGTAGTGACTTATCTTGTCATGTAGGCCCGTGATCCAGGAGAATGCAAGTTTTTTCGAGGTTCGCACCGAGAATGTTTCGGTCTAACGGTCAAGGATAGTGGCTCGAGCCGATTGAGTTGTCGAATCATTGTGGGGCTCATGGCACCCTAGTCGCAGTGTGTTGTCTTATCTTCACGAGACACAGAAAAGTGTATGTCGATTTCGAATGGACCTCCTCGGATGATGGGTCATCGTCGCATCCTTCGTCAGAATCTCACCCCACTCTTACGGCGAGGGACCTACGTCGCTTGTGTTCGAAATACCGTATCCCGGATTCGGTTAGCCTTCGTCTTCCGAATCCGAGAGAGAATATCGATGGCTTTTATCCCGGTGAAGTAGTATTTTATGCCACGATGTTCTAATTTGGAGTTCGCCTACCGTTGCCTCTTTTCCTTCAACACTTTTTAGCTTTTAATCAAGTAGTTCCTTCCAAATCCTCCTACATAGGTGATCTACTTTGATCAGTTGCTTTATTTTGTGGTCGTACCTCGGGGGCGAGCAGCCTCTAACCGCCGCGGATTTTATGTCGCTTTATCACTACGTTGCTCGTAGTTCTTTTCTTTGGATTTATCAATTAACCCTCTTACCAATCACTTATTGGCTTACGGCTCTAACTCTGATGGAGTTTTGTTGCTTTCATTTCCGTAGATTTCTAACCCGTTGGCCATAGCCAATGGTTTTACACCTGCTGTCGTTTTTGGCCTTTTACTCCATCTCATGTTTTAATCGTGCTAGGTCAATCGACCCGCTTCTGGTTTGGCCGTGTTGAGATTGTTTAATTGTTCTTTCCAAATGTGTCGATTAAAGTAGATTCGTGCTTCGTCGCCCGTGGTCGGCGTCGAGTGGTGGTCGGACTCGAGCCCTGCTCAGTCGAAAATAAGACCTATTGGTAAAAATATGTTATCTTATAAAACTGCCAATTAATGTAGATTGGTGCCTGTTTGCACTTGGTCTACGTCGAACAGTGATTGGACTCGAGCAGTGGTTGGCCACGAGCCCTGCTCGGCCTGCTCGGCTAGAGTTGGTTTTACCGTAG

mRNA sequence

ATGTTGGAGAGCTTACCGAAGGAAGGACGAGCCGGGGAAGAAGCAAAGCCCGGCATGGAAATGGAGAGCTCTAAGCTGGATGAGTTGATTGGTGAAACCGCCATGGAACTAACCCTAATTCACCGTTGCTGGGCCTGGACGAAACCGTCGATCGAAGATGGGGGATCATTGGCTGGGCCGTGGGCCGAGCCCCGGGTCGGGTCCGAGCACCGGGTCGGGACAGAGCCTCGGGCCCGTGATCCAGGAGAATGCAAGTTTTTTCGAGTCGCAGTGTGTTGTCTTATCTTCACGAGACACAGAAAAGTGTATGTCGATTTCGAATGGACCTCCTCGGATGATGGGTCATCGTCGCATCCTTCGTCAGAATCTCACCCCACTCTTACGGCGAGGGACCTACGTCGCTTGTGTTCGAAATACCGTATCCCGGATTCGGTTAGCCTTCGTCTTCCGAATCCGAGAGAGAATATCGATGGCTTTTATCCCGATTGGTGCCTGTTTGCACTTGGTCTACGTCGAACAGTGATTGGACTCGAGCAGTGGTTGGCCACGAGCCCTGCTCGGCCTGCTCGGCTAGAGTTGGTTTTACCGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGGAGAGCTTACCGAAGGAAGGACGAGCCGGGGAAGAAGCAAAGCCCGGCATGGAAATGGAGAGCTCTAAGCTGGATGAGTTGATTGGTGAAACCGCCATGGAACTAACCCTAATTCACCGTTGCTGGGCCTGGACGAAACCGTCGATCGAAGATGGGGGATCATTGGCTGGGCCGTGGGCCGAGCCCCGGGTCGGGTCCGAGCACCGGGTCGGGACAGAGCCTCGGGCCCGTGATCCAGGAGAATGCAAGTTTTTTCGAGTCGCAGTGTGTTGTCTTATCTTCACGAGACACAGAAAAGTGTATGTCGATTTCGAATGGACCTCCTCGGATGATGGGTCATCGTCGCATCCTTCGTCAGAATCTCACCCCACTCTTACGGCGAGGGACCTACGTCGCTTGTGTTCGAAATACCGTATCCCGGATTCGGTTAGCCTTCGTCTTCCGAATCCGAGAGAGAATATCGATGGCTTTTATCCCGATTGGTGCCTGTTTGCACTTGGTCTACGTCGAACAGTGATTGGACTCGAGCAGTGGTTGGCCACGAGCCCTGCTCGGCCTGCTCGGCTAGAGTTGGTTTTACCGTAG

Protein sequence

MLESLPKEGRAGEEAKPGMEMESSKLDELIGETAMELTLIHRCWAWTKPSIEDGGSLAGPWAEPRVGSEHRVGTEPRARDPGECKFFRVAVCCLIFTRHRKVYVDFEWTSSDDGSSSHPSSESHPTLTARDLRRLCSKYRIPDSVSLRLPNPRENIDGFYPDWCLFALGLRRTVIGLEQWLATSPARPARLELVLP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 109..128
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 109..126
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..23
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 57..77

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc04g27210.1Moc04g27210.1mRNA