Moc04g05180 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc04g05180
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 3404773 .. 3415049 (+)
RNA-Seq ExpressionMoc04g05180
SyntenyMoc04g05180
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCCTACAGTTCCCGAAGATGCTTCGTTGGTGAATCCCCCACCGCCTTCACCACCATCGCCGGCGCTTTCGACTGGATCTCAGTCTTCTTCTATACCTTCGGCGAGCGTTGATTCACCTCTCAGTCCGTATTATCTCCATTATACCGATAATACAGGACTTGTTCTAGTTACTCATTTACTCACCGAAGAAAACTACATCGTGGAATCGATCGATGTTGATTGCTTTGTTGGTGAAGAACAAACTAGGATTCATCGACGGATCTACTTTATATAGAAAGCTTGTTGGTAAGCTTTTGTATCTCACTATCTCGCGTCCTGACATTACATTTCCAGTCCACAAACTCAGCCAATTTGTCTCTCGTCTGGGCAAAGAGCATCTTGCAGCAGTCTATCATCTTTTGCGTTATTTGAAGAAGGTCCCTGGTGGTGGCATTTTTCTTTTTGCCTCTAATTCTTTCCAGCTCAAAGCTTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCCTGTGTTGACAATCAAAAGTCTACCATTGGTTTTTGTGTTTTTCTAGATGATTCTATGATTTCTTGAAAAACTAAGAAGCAATCCACCATCTCTCGGTCTTCAGCAGAAGCAGAGTATCGTGCCTTAGCAGCCACCACCTGTGAAATCATTTGGTTGATCCATCTTTTAACTGAGTTGCAGGTTTCGTTTGTGCCTCCCGCTCTTCTTTTCTGTGACAATAATGCAGCCATTCATATTGCCTCTAACTCAAGTTTTCATGAGCGCACAAAACACATTGATCTCGATGTCATTTTGTTCGAGAAAAGCTTCTTGATGGCTCCATTCGACTGCTCCCTATCAGGTCTTCTTTGCAATTAGCCAATGCTTTCACCAAGCCGTTGTCTGCTGCTGTGCTTGACAATTTTGTGTCCAAGATGGGATTGATTGATATTTTTGCTCCATCTTGAGGGGAGTATTAGACTCTAACTATAGTCAGTTAGTTAGTTTTCTATTATGGTTGCTTATTGTGTATAGTTAAGTTGTGTATATAAAGGACTTTGTATCTGTTGGGTTTGTAAGGTGATTGCAAACAAAGTCCCACATTGGTTAGGGAAAGGAATGATCATGAGTATATAAGAGAGACAATTATCCCCATTGGTGTGAGACCTTTTGGGTGAAACCAAAAGCAAAGCCGTGGAGACTATGTAAATAAAATTTAAAATTTTAGCAGATGAAGAAATTGAAAAATGGACTATTACTATAAACAATAATTTTACTCGTAGTTTTTTTTTTCCTAAAAAAATAAACGAAACTTTGAAGTTGTTTGAATGCTGTTGAGTTGTAAAACAATTAAAGAAATAATTTTTAACATAAAAAACTGCAAAACAATATTTTACTAATCGATTAATTACCATGTATAACCATTATTTACCTTTTTTTTTGGTAAGTGTTGGTCACAAATTTAAATATTACTAAAGAAAGTAACTCATTTAAGTACGTTATACTTATGATAAATATTAACAAAAATACAATTATGAATATATATATTTATGTATTTATTTATTTATCACCTTTTTCAATTTTAATATATTATATAATTTATATTCCTTTAATCATCTTGTTTCAAATTAAATCCTCCTTGGGGTGAATCATTAGCATTCTTTGTTGTCGACTACTTTTCTCTTTTTCTTTTTCTTTTCATATTGTTTTTCAACTTCGTAGGTCAAATGTTCTATTTTGTTTAGAAAAATCAAAAAGAATATTTAAAAAGTTTTGATATATATATATATATATATATTAATACAATTTAGAGATTCGAACTCACGATCTCTTTGTTAGATACATGTGCATCAATCAATTGAATTAAGTTCAGGTTCACAGTTTTGATATATAGTATTTATATTTATAGATATTTTGTATATTTTATTATTTATAAATATATTGGTTAACAAAACGATTATTTGAATTGTTAGAATGTTTAATACTAAAAATCTCATTTTTCTATATTAGCATTTTACATGTATAACTCAACGGGTTAAGACATATATAATCAGTGACAAAAATGTCGAAGATTTTGACTCTTCACCCACATTATTGTCAAACTCAGGAAAAAGAAAAAATAGCTACAATTATTGACTGTACAATTCAACTTGTTAAAACATTACTTACCTTCCCAGAAGTTGGAGGTTCAAATCCTTGTACTCAACTAAAAAACCACAAATTCTTTGAAAACAGAAATAACAAAAGGGTAATAATTTAAACTTTTTTTTAGTACAACATGTGGGGGTGGGAGATCGAACTCTCACAACCTCTTGATTGGAGATGTATGCCAATTTACGCTGAGCTATGTTCAATCTGACAATAATTTAAACTTAACCATCCATTTAAGTTGATTATGGTTCAATTATAGAAATAGAATTTTTCATAGATTAAGTTATAAGAGCGATAATTAAAAAAGAAAAAAATTTGTCAACCTGAACATAACTTAGCTTATTAAAATATATATCATCAATCAAAAAATCGACCGTAGAGCATTAAAAAAGAATGATTAATGAAATGATGTCTTTCTCTAGGGTTTGGTATGTGTAAAAGGGAAGAAGAAAAGAGAATTAAATAAGATGGGGACAAGATGTCTAAAGCCATCAATATAATTATTCAGTGCAAAGAGAAGAGAGAGATTTTTCAAATTTTATTAATTATTATGCCTTTACCCTTCATATTTTCCAGTTGTCTTCAATTTCACCTTGTCCCCACTCCCCATTTTCTATCAACTTTCCAATTTTTTTTTATTTTTCTCTTTTCACACTAATAATAATATTCAATCATATGTATTCAACCTCAAACTCTCTATAACTACCTTTTATAACCCTTTTCAAACCTCTCTTTCAAAAATCAAGATGTAAGTTTGATTTATCACGAGTTAATTGATCGCGAAATCATACAATCGTCTGATCCTACCACATTTGGTTACCAAATAAACACTATTCTTATATAGATAACCTGGCCATCATGAAATTACGAGTCATTTTAATTTATACAGACATTTTGTTGAAATAATTCAAGTTTTTATACAACCATTCCGTTGTAATTGTGACGCCCGACTAGAAAGGAGGGGTACATGAATGAACCGATATCACATCCAAATGAGAGAAATCTTGAGATCATGGAAGAATGGTCAATAAAAGCTTAAAAGAATTGATACTCACTATCTATACCAACAAGTTGCACCTTCCTTTTCGGTGGCTCAATCATAAGAACTCCAAAATTAAATATTATTTATATATTAGGAAAAATTAGAAACATAAATTGAGGTTTTTGAAATTGACCCATCTAAATTCCAAGTCAAGGCATAGCAACTAAAATAAAATAAAAAAATAAATTTATGAGGATTGATAGAGTTGGATAAGGTAGTTAATATTTATGATATATATTATTGCATGTGCACCTATCACCTATGCTCCTTTATTTGACTCTCTTTTCTTGCGCTAATTAAGTTTGTTGATTGCCTTCAATTCCGCCTCTGCTTCTAAATTATTTTTCTCCCAAAATTGGTTTAATGGGTCATCTGAAAACATAAATCGCATTCAAATGAAAAGCAGTTTATGTTTTATTTCAGTGTTTTCAAATACGTGTTTAATAATATATTTAGAAATTGAATTTTAATTTAATAATATATTTATAAGTTACTGATTAAATATTTAGTTTCAATCTAAAATAATAATAATTAATTTATTAACATTTTTTAATAAATTTTGCAGAATTATTGTTTTACAATATCATATAAATTATAATATATTTTATTTTACCTGTTTTAATTTTAAGAAAAATAAAATGAGTTTATAAGTATCAAAGTTTTTTTTATCTTCTTTTTAATGTATTTATGCATTTTAAACTAGTTTCAAATTTAAAATTTGAAAACACTAAAATCGAAGATGATTCATTTGATTCAAATTCAGGAAATCAATAATTGCATACCAATTAGGCCTCCCCTTATATTTCAGTCTTTGAAAAAACGTATAAATTTGGTTTTGAGGTGGAAGGCATATCTTTAATTAGCTTCACCCTCTTCCCTTTTTTTCTAGTTTTGAACATGACGTGGAGGTGGGGCGAAATTCGAACTCACTGACAACCTTCAGTCGGAGATAGGTGTTTTAACTAGTTCCAGTTCCAATTTCTCTAGGTTATTGGGCAAATTTTTCTCCCTTTATTTTCAATGGTTCTAATTATTACCTATATTTTGTACTTGACCTATGCACGTGATCTCAAATTGTGTAGTTTCTTTTCAAACCCGTAATTGATGGATGTGTAATGTGTTTAACAAAATGACAAAAAAAATTTCATTCATGTGTCACGTGGGCCAAGTTTAGAAAAAGCAATAATATTTTACTTGTTCTTCCCGATTCCTACCCCAATCGATTGCGGTGAAAGAAAGTTTAAATCAGTTGCTCAATAATGTTAAGGATCTCACATCAAAAAGATCAAGAGACTTTAGAAACGAAAGTCTAAAATCAGTATAATTTGTTGATATACAGAAATGAATGGGAGAAGACAATGAGGAAGAAAAGAGTGTTATTTGAGAGAGATGGATGTGGGGTTTGTTTTATGGGGAGAAAGGCAACATTGCATGCTGCCTCTATTTTGTGCCTATTTATTTTACTTTGGAAGAGGAAACCCAACAAAATGGTAGGGTATCTCTTGTCTCATTTTATTTTCTAATAGTTTTTCATATCTCTCTCTCTTCTTGACTTTATCTCTCTTCTCATTTTTCTATATTTTAAGTCATATAGAGTCTCGGACCTGATACAAATCATCACTGTAGCAAAAGAAAGTTCAAGCACTCATTCAAGAACGCAAAATTACAGAGATAATCACCCACATCGAACGGGGAAGAATGCACTTTCCCATGTATTTTCTTGCTAGTAGAGCTTCGTTATTGGGTCTATCGAAGAGATGTGAGAAGTTGGTCGAAGAAGCTAGCTTAATTAACACGATGTTTCTTCCTTGATGTAAGTTTAGTTTTTCATGA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GGCCGGCGGGGACGTCGGAGGGAGCGGCGGCGGCGCCGCTGCGAGTGGAGGCGGTGACGCGAGCCTTCTTGCGCCAGCGCTGGAGCATCTGGCGGATGCTGACGATGCGGCGGATGTTGTTGGATTTTCCGATTCCGGTCGACATTTTCTCGGGCAAGTGAGGGAAAATCGTGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAAGTTTGTTGGGAAGTTGGGGAATCGGTTTGGGGATTGGTTGGGGGTTATGAAGTGGGGAGGAAAAGAAAATGGGGTTGA

mRNA sequence

ATGCCTACAGTTCCCGAAGATGCTTCGTTGGTGAATCCCCCACCGCCTTCACCACCATCGCCGGCGCTTTCGACTGGATCTCACCCGATTGGAAAGCTTTCAGTTAGTTCAGCAGACGGATTTATCGGCGTAATCAAAAAGCAAGGGCCGAGATTCACGGAGGAGAGAACTCCGGGAGGCCACGTGGCAGTGTCGCCGGAGATCGGAATCGGAGCCGGCGACGGTCCGGAGAACCTCCTCGAAGACGGATTCGTCACAGGGGATGGCGAGAGGGCCGTGGTTGACGAATCCGTACTCTTCCTCCGCTTCCAACAGAAGCTTCTGGAAGATCGGATGGTTCAGGTAAGTGGCGCGGACGACGAATCTTCTGGAACTGCTGCCGACGCAGACGGCGACGTGGCCGGCGGGGACGTCGGAGGGAGCGGCGGCGGCGCCGCTGCGAGTGGAGGCGGTGACGCGAGCCTTCTTGCGCCAGCGCTGGAGCATCTGGCGGATGCTGACGATGCGGCGGATGTTGTTGGATTTTCCGATTCCGGTCGACATTTTCTCGGGCAAGTGAGGGAAAATCGTGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAAGTTTGTTGGGAAGTTGGGGAATCGGTTTGGGGATTGGTTGGGGGTTATGAAGTGGGGAGGAAAAGAAAATGGGGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCCTACAGTTCCCGAAGATGCTTCGTTGGTGAATCCCCCACCGCCTTCACCACCATCGCCGGCGCTTTCGACTGGATCTCACCCGATTGGAAAGCTTTCAGTTAGTTCAGCAGACGGATTTATCGGCGTAATCAAAAAGCAAGGGCCGAGATTCACGGAGGAGAGAACTCCGGGAGGCCACGTGGCAGTGTCGCCGGAGATCGGAATCGGAGCCGGCGACGGTCCGGAGAACCTCCTCGAAGACGGATTCGTCACAGGGGATGGCGAGAGGGCCGTGGTTGACGAATCCGTACTCTTCCTCCGCTTCCAACAGAAGCTTCTGGAAGATCGGATGGTTCAGGTAAGTGGCGCGGACGACGAATCTTCTGGAACTGCTGCCGACGCAGACGGCGACGTGGCCGGCGGGGACGTCGGAGGGAGCGGCGGCGGCGCCGCTGCGAGTGGAGGCGGTGACGCGAGCCTTCTTGCGCCAGCGCTGGAGCATCTGGCGGATGCTGACGATGCGGCGGATGTTGTTGGATTTTCCGATTCCGGTCGACATTTTCTCGGGCAAGTGAGGGAAAATCGTGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAAGTTTGTTGGGAAGTTGGGGAATCGGTTTGGGGATTGGTTGGGGGTTATGAAGTGGGGAGGAAAAGAAAATGGGGTTGA

Protein sequence

MPTVPEDASLVNPPPPSPPSPALSTGSHPIGKLSVSSADGFIGVIKKQGPRFTEERTPGGHVAVSPEIGIGAGDGPENLLEDGFVTGDGERAVVDESVLFLRFQQKLLEDRMVQVSGADDESSGTAADADGDVAGGDVGGSGGGAAASGGGDASLLAPALEHLADADDAADVVGFSDSGRHFLGQVRENREEEEEGEGEVCWEVGESVWGLVGGYEVGRKRKWG
Homology
[Close]
BLAST of Moc04g05180 vs. NCBI nr
Match: KAF3446758.1 (hypothetical protein FNV43_RR11938 [Rhamnella rubrinervis])

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 9.2e-12
Identity = 50/109 (45.87%), Postives = 70/109 (64.22%), Query Frame = 0 

Query: 70  IGAGDGPENLLEDGFVTGDGERAVVDESVLFLRFQQKLLEDRMVQVSGADDESSGTAADA 129
           +G+G+ PE  LE  FV  +GER +V E+V F    +K+LED +VQV  AD+ESS T  DA
Sbjct: 37  LGSGNEPEEFLEKRFVARNGERTLVGEAVFFFGLDKKVLEDGVVQVRRADNESSATPTDA 96

Query: 130 DGDVAGGDVGGSGGGAAASGGGDASLLAPALEHLADADDAADVVGFSDS 179
           DG V+GGD+G        +G G + L+APA + L++  + AD+  FSDS
Sbjct: 97  DGHVSGGDIG------RYAGCGHSGLVAPAPQQLSEPHNVADLAAFSDS 139

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Moc04g05180 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAF3446758.19.2e-1245.87hypothetical protein FNV43_RR11938 [Rhamnella rubrinervis][more]
BLAST of Moc04g05180 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Moc04g05180 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Moc04g05180 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 114..152
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 7..23
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 47..75
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..31

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc04g05180.1Moc04g05180.1mRNA