Moc04g04330 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTCAACATATTCAAATATCTGCACACCAGTATGATTCTAAACTCAACATATTTTGATGCCTAAATGTTTAGTTGAGAGTAGCAAGAAATACGTTGATAAGACCCACCCTTGTGCCTAAATAAGACAATTTAATTGAGAATAGAAAGAAGTAGAATTGTGTAGAACGTACCTTGCACATTTAAGTTAGACAAAGTGTTCACTCTTATTGATAGAAGATCGAGTTCGATTGGCTCAACCTAGTTAGATTTGGTTTGGTCTTATCAGATGGTTCGACCTAATCGGCTTGATTTAATGAGCTTGACCCACGACACTTCCCTGACCTCACTTTAGGTGAATCTAGTGTGGTAATTTCACTCTGACATTGAAGAAAAAATCAGTTTTTATTTGAAAGTAGGTGAGTAAATTTTTATTTATCTCCAAGGTTGAAAAGGAAAGCTCTTTTCAGTGGGTGGAAAAGAGGTACTTCTTAAATCCGTGACTCAGGCTATTCCTTGTTATTCGATGAACTGATTTAGATTTCCAAAGAATTTAATTCATGAGATGCATATGGTAATGGCTCGGTTTTGGTGGAGGGATGGGGATGAAGATCACAAGATCCATTGGGTGAGTTGGAAACGCATGTGTTTACTGAAGTGTATGGGTGGTTTGGGGTTCCGTGATTTGGAACTCGTTAACCCGGCCTTACTTGCTAAACAGGGGTGGTGGATTTTCTCCGATCCTTCATCTCTTCTTGCTCGGGTGTTGAAATTTAAGTATTTTAAAAATTGTGATTTCATGGAGGCATCTGTTGGTTCTCGTGCTTGATAACACACTTTGTGAGCTACATTTCATGAGATTTATATTGAAATTATTTGTTAGTTTTTGTTTCTTCATGACAAATTTAAGCAGAGATGGAATAACAACAATATTTGGAGCTAAAAACCTGAGAAGATAGCGTCACGGCGCTAGCCTAGAGCGCCGCGGCACTCCGAAGTTTAAATTTCGCATTTATGAATAGTGTAGCGCCATGGCCCTATATATAGCGCCATAGCACTACCGCGACAACTTTTTATAAAAATAGGGTTGTGTAGCCGCCGAAAGGGGGAGTTTTGAAGAGGTTTTATGGCAGTTTGCCTTTTTGGCCAAATTGGAGGGCAAGGAGACCATTGGAGAGCTTAGAAAAGTGATTTTCAAGGCTCGGGATCGTGGAGGTCGCTTCGGGGACGGACGATTGACACGCCGAACATAGTTTCTTCTCCTTTCCCTTGATTTTTCTAGTTTTGTTATGGACTTCTCATTGTGATTTTATTGTTTTCCATTGAATATGAGAAGCTAAACCTCTCATCTTAGGGATTGATGTAGTCATTGAACTTTATGCATTGATTGTTTAGTTTTCTTGGTTGAATGTTTATGAATGTTCTATTTAGGCTTCTCTATGCTTAATGCCTTGAATCTACTGGCCACAGATTGATTGATTTTAGACTTGAAATCTTACGCTTGGGAGAGGTGGTTCAGAGTTAGAATTGGGATGCATAACTAAATGAGTTTTAAGATCGGGAGATTTAGAAGTCTTTTAGAGGTCGTTAAAAGACTTGTTCAATAAAGTCTTTAGTTGTTATTGAAACTAGATAGGGATATTGGTTTCTTAATTCGTAAGGAGAATTAGCTTGCGCTCAGGAGAGATAGTTGAGATTTGAGAGTTCTTGGCCTATATAATTAATAATTCGTCCAATTAAGTAGTTGATTCATAGATTCAATAGGTGAAATCAATTCCCTAGACCTTTTCCCCATTGTTTTTATGTTTATTATTGCATGTTTATTTTCTTTGATTATATTCTCCCATTTGATTTTGATTCTCTAAATAAAATTGAGCAATTGTATCTGTGGTACCCAATCCAGAGGACGATATCGGTATTGACTTACCACTTTATTAAAGCTTGATCCGTACACTTGCAGTAAGCAATTTCTGCTACAATGCTTTCTTTTATTTGACGAAGCCTTTTGTGGGGGCATGACCTTCTACGGGTTGGTCTCTGATGGCGGGTGGGTAACGGGGCTAATATCAGAATTTATGAAGATAACTGGATTCCTCGTGACGAGATACTTTCGGTTCAATCAGTACCTTCGCTTCCTAAGGATAGTCTAGTCCGTGATCTTTGGACCCCTCCCGGTCAATGGGATGAGGATAAATTAACATTGCACTTTTCAGAAGAGGAGGCCATCTTGATTCAGTCCATACCTCTAGGGTCAGTTTGGTTGATAAACGTTATCTGTCATTTTGAAAAAAGAGGACTGTACACGGTAAACGGTAAAGAGTGGTTATCGGGTGGCTCAACAGGAGCTTATTCATCAATTCCCATCATCTTCATCTTTGGATTCTCTGCTTACATGGTGGCGAGGTTTTTGGAAGCTTCAAATCCCGAGTAAAATTAAACTGTTTGGGTGGTGTATGTGTTTGGATCATTTGCCAACCGGGGACAATTTATCTGTAAGGGGGATTGATACGCTCTCTATTTGCAGATTTTGTGGTCAAAAGGGGGAAAATGCACTTTATATTTTTTGGCGGTGTAAAAAAATGCAACAGATTTGGGCCTGCTCCAAGTTTTCTCACCTCATCCCTATTCTAGGGGGTGGGGTGTCCTCTGCTATGCTGGATTTTATTCGGGGGTGGAAGGTGCTAATTCCTTGGGCTGACTTGGAGCTTTTGTTGGTTATGTTATGGTCGATTTGGTGCGCACGGAATCGATCTATTTCGGTTTCTCATGCGGGTGGCTTACTCGAGGGGATCAGAGCATGGTCGGATAATTATCTTAGTATATATAAGCAGGCGCAGGGCGTTTCTCTCCATGAGGTGGATCAACCAAGGCAGCTTTGGGCCGGAGGTTGGAACCCACCGTTGAACCCCTTTCTCAAGGTGAATGTAGACGCGGCCGTCTCGAAAGAGGAGGGAGCAGGAGTGGGGGTTATCCTCCGAGATTCTTATGGGGTCGTCTATCTTGCTGCGGTTTGGCCCCTTTCTTTCATTCCAAGCGTCGATTGGGCGGAATGTTTCGCGGTTTTTGACGGTTTGCGACTAGGAGTGGAGGCTGGTTTGGACGATTCGGAGGTTGGGGTCCTGATTTCTGTCATCAAAGAATTTCTTCATTCTCATAATATTCATGTCACGTTTAGTTTTACTCGCAGAGCCGGCAATACCGCTGCTCATATGCTTGCTCGCCGGGCCGTATCTTCTCCTGGATTTCAAGTTTGGTTGGAGGAAGCGCCTCTGGAGCTTTCTGGAGCGTTGGAGGAGGACCGCGAGTTTTGTTTTCGCTTTATTTAATTTCTGTTTTACCTTTGCGCTGTTTTGTTCTGTAAGTTTCTGTTTCTGTAAAATATATATATATATTTATTTATTTATTTTTAATTAGACCTTAGACTGAAACTAAGTATTTTAGGCTTTTACCTTTTATTAGATTTCATTACATTCTCCCACTACTCTAGACATCAAGTTATGTAAAAAAAAGAGAAAAAAAAATCCCTCTGAAACACACTTAATTTAAACGATCATACAAATTAACGTAAAAGATAAAAATCTTAACCAATCAACACATAAATTTAAGCCAAAGCGAATATAGCTCTTGACATATATCTCCAACCAAAAAGTTGTGAGTTTAATCCTCCACCCAGACACATTGTACTAAAAAACAGAAACACATAAATTCAACATTCTATCAAAGTTCACCAATTTTTCGATGCAACCCACGTTTCAACTTTATCTTGATCAGTTTCATCAACTTCTTGCCAAATCTTTGTATGTGATCGGTTTAATATATGCACTTTTTCTTTCATCAAATTTTTAAATGAAAGTATAACACAAAAAAGTTAAAATTGTAACATTTTTCCCTTTTATTTTATTTTTATTTATTACAACACGTAGGTGAAAAAATTTGAATTTACAATCTTCTTGTGAAACATAGATACCTTAACCCATTGAATTAGGCTCAAGTTAGCTTATAACCTCTCTCAGAGAGGTGTCTAATTTAATAAATAAACTTTAGTTTATAAATTCAACATTTTATAAAAATCAAGATAAAAATAGACAAAATCAAGGTCTAATTTAATAAAATTAGAAGTCTAAGATAAAAGTTTTTTTTTAGAGTACGGGGAAGGGATTTGAACTCATAAACTCTTACTTAGAGGTATAAGTTAATTACCACTAAACTATGTTCGCTTTGACTAAAAATTACATCAGTCTCCCATAAAATCTACAACACATTTACCAACAATTCCAAAGCATAAGAAATGTATCTAACTCCCTAAAAATTCCTCAATCCCACGCCAAACAAAAAGGCTAAATTTAGTGTGCTTTTGACGATGTATGCATTTTTGTACTCCAAAAACAAAAAAATTAGATAATCAGAATTGGTTTGAGAAATCCTAAATATCTCACCAACAACTCAATTGGATTTGATTAAAGAAGTAAATAATTAAGATTAATTACAACAAAGAACAAAAATTAGTTTACAAAATCGTGTTTATATATATATATATTGTTTTTTATCCCACTAAACTCAAAACCCACAAACCATCACTGAGAAGAAACCACTAGAACCAAAGGAGCATGTAGCCGGCGGAGGAGCAAGCGACAATAGCAGAGCCTTCTCCACGTCCCGGTCGACATGTCGTCGGATCAAAGACAAGGCATATTCCACAAACGCCGCCTCACACGGCAGCGTTATCGGCCCATCCCTCGGCAGCCCAAATTCCTCCTCCGACATCTTCAACAGCTCCCTGAAAACGTGGCTCCCCAGATACCCTATTGGCAAAACGTACCGTTTTTGGTCCACCGTGTACGCCACGAAGTGCCCCTTGTCCGCCACCGTGGCCGTGGAGGAGCTTTTTCTGGTTCTCGGCAGCAAGATCCGCCGCCGCCGCTGCGTGGCGGCCGCCGCCTTCTGCCACCTCTTGGCTATTCTAATTAGGGGTTTGGGGGTGGCCATATATTATATAATATTGTGAAAATAAAATT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ATGCTTCAACATATTCAAATATCTGCACACCAAATTTATGAAGATAACTGGATTCCTCGTGACGAGATACTTTCGGTTCAATCAGTACCTTCGCTTCCTAAGGATAGTCTAGTCCGTGATCTTTGGACCCCTCCCGGTCAATGGGATGAGGATAAATTAACATTGCACTTTTCAGAAGAGGAGGCCATCTTGATTCAGTCCATACCTCTAGGGTCAGTTTGGTTGATAAACGTTATCTGTCATTTTGAAAAAAGAGGACTGTACACGGTAAACGGTAAAGAGTGGTTATCGGGTGGCTCAACAGGAGCTTATTCATCAATTCCCATCATCTTCATCTTTGGATTCTCTGCTTACATGGTGGCGAGGTTTTTGGAAGCTTCAAATCCCGAATTTTGTGGTCAAAAGGGGGAAAATGCACTTTATATTTTTTGGCGGTGTAAAAAAATGCAACAGATTTGGGCCTGCTCCAAGTTTTCTCACCTCATCCCTATTCTAGGGGGTGGGGTGTCCTCTGCTATGCTGGATTTTATTCGGGGGTGGAAGGTGCTAATTCCTTGGGCTGACTTGGAGCTTTTGTTGGTTATGTTATGGTCGATTTGGTGCGCACGGAATCGATCTATTTCGGTTTCTCATGCGGGTGGCTTACTCGAGGGGATCAGAGCATGGTCGGATAATTATCTTAGTATATATAAGCAGGCGCAGGGCGTTTCTCTCCATGAGGTGGATCAACCAAGGCAGCTTTGGGCCGGAGGTTGGAACCCACCGTTGAACCCCTTTCTCAAGGTGAATGTAGACGCGGCCGTCTCGAAAGAGGAGGGAGCAGGAGTGGGGGTTATCCTCCGAGATTCTTATGGGGTCGTCTATCTTGCTGCGGTTTGGCCCCTTTCTTTCATTCCAAGCGTCGATTGGGCGGAATGTTTCGCGGTTTTTGACGGTTTGCGACTAGGAGTGGAGGCTGGTTTGGACGATTCGGAGGTTGGGGTCCTGATTTCTGTCATCAAAGAATTTCTTCATTCTCATAATATTCATGTCACGTTTAGTTTTACTCGCAGAGCCGGCAATACCGCTGCTCATATGCTTGCTCGCCGGGCCGTATCTTCTCCTGGATTTCAAAAACCACTAGAACCAAAGGAGCATGTAGCCGGCGGAGGAGCAAGCGACAATAGCAGAGCCTTCTCCACGTCCCGGTCGACATGTCGTCGGATCAAAGACAAGGCATATTCCACAAACGCCGCCTCACACGGCAGCGTTATCGGCCCATCCCTCGGCAGCCCAAATTCCTCCTCCGACATCTTCAACAGCTCCCTGAAAACGTGGCTCCCCAGATACCCTATTGGCAAAACGTACCGTTTTTGGTCCACCGTGTACGCCACGAAGTGCCCCTTGTCCGCCACCGTGGCCGTGGAGGAGCTTTTTCTGGTTCTCGGCAGCAAGATCCGCCGCCGCCGCTGCGTGGCGGCCGCCGCCTTCTGCCACCTCTTGGCTATTCTAATTAGGGCTGGGGCTTGTGGCTATGGCTCCTTGGCTCTTGGTTTCCTCGACGGGCACCTCGCCGCCGGTGTCCCTTCCCTCTATAAGGAGGGAGTTCGTTGCGGCGCATGCTATCAGGTAAGGTGTAAAGACAAGAAAGTTTGCAGCAGAGGTGGCACAAAAGTAATTTTGACTGATCTGAATCTACACAGCAATACCACTGATTTTGTTTTGAGTAAGAAAGCTTTCTCTGCCATGGCTCTCAAGCCCAGAGATAAGAATATTTTGAAAACTGGGACTGTGGACGTCGAATACAAGAGGATTCCTTGTGAATACAAAAAACAAAATGTGTCAGTACGAACTGAAGAATCAAGCCAAAAGCCACATCATTTGGCTGTCAAGTTCTTGTTCCAAGGTGGCCAGACTGATATAGTACTAGTTCATCTTCATCCGGTGAATTCAGGGAGAACGAGGTTCATGAACAGAAGGCATGGGACAGCGGTGTGGGAGACAGATGCGGCGGTGGAAGGGGCGGTGGTTTTTCAGTTAAGGGTGATCTCGGGGTTCGACGGGATGTGGGTCAGGGCGGAGCGAGAGATGCCGGCGAATTGGAGGCCGGGGATGATCTACGACCTTGGAATTCAGATCGACGCCATTGCCAAAGGCCAAGAAAGTTGCACACCATGCGACGAAGGCCAATGGTAA MLQHIQISAHQIYEDNWIPRDEILSVQSVPSLPKDSLVRDLWTPPGQWDEDKLTLHFSEEEAILIQSIPLGSVWLINVICHFEKRGLYTVNGKEWLSGGSTGAYSSIPIIFIFGFSAYMVARFLEASNPEFCGQKGENALYIFWRCKKMQQIWACSKFSHLIPILGGGVSSAMLDFIRGWKVLIPWADLELLLVMLWSIWCARNRSISVSHAGGLLEGIRAWSDNYLSIYKQAQGVSLHEVDQPRQLWAGGWNPPLNPFLKVNVDAAVSKEEGAGVGVILRDSYGVVYLAAVWPLSFIPSVDWAECFAVFDGLRLGVEAGLDDSEVGVLISVIKEFLHSHNIHVTFSFTRRAGNTAAHMLARRAVSSPGFQKPLEPKEHVAGGGASDNSRAFSTSRSTCRRIKDKAYSTNAASHGSVIGPSLGSPNSSSDIFNSSLKTWLPRYPIGKTYRFWSTVYATKCPLSATVAVEELFLVLGSKIRRRRCVAAAAFCHLLAILIRAGACGYGSLALGFLDGHLAAGVPSLYKEGVRCGACYQVRCKDKKVCSRGGTKVILTDLNLHSNTTDFVLSKKAFSAMALKPRDKNILKTGTVDVEYKRIPCEYKKQNVSVRTEESSQKPHHLAVKFLFQGGQTDIVLVHLHPVNSGRTRFMNRRHGTAVWETDAAVEGAVVFQLRVISGFDGMWVRAEREMPANWRPGMIYDLGIQIDAIAKGQESCTPCDEGQW Homology
BLAST of Moc04g04330 vs. NCBI nr
Match: XP_022135692.1 (expansin-like A2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 468.4 bits (1204), Expect = 1.1e-127 Identity = 223/227 (98.24%), Postives = 225/227 (99.12%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. NCBI nr
Match: XP_038888869.1 (expansin-like A3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 392.1 bits (1006), Expect = 1.0e-104 Identity = 176/227 (77.53%), Postives = 201/227 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. NCBI nr
Match: XP_011658619.1 (expansin-like A3 [Cucumis sativus] >KGN43330.2 hypothetical protein Csa_020273 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 391.3 bits (1004), Expect = 1.8e-104 Identity = 180/227 (79.30%), Postives = 202/227 (88.99%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. NCBI nr
Match: XP_022928449.1 (expansin-like A2 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 5.6e-103 Identity = 181/227 (79.74%), Postives = 201/227 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. NCBI nr
Match: XP_023529769.1 (expansin-like A2 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 383.3 bits (983), Expect = 4.8e-102 Identity = 184/255 (72.16%), Postives = 213/255 (83.53%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SVE5 (Expansin-like A2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXLA2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 244.6 bits (623), Expect = 3.5e-63 Identity = 119/233 (51.07%), Postives = 162/233 (69.53%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LZT5 (Expansin-like A3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXLA3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 5.0e-62 Identity = 120/228 (52.63%), Postives = 160/228 (70.18%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LZT4 (Expansin-like A1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXLA1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 238.4 bits (607), Expect = 2.5e-61 Identity = 118/234 (50.43%), Postives = 160/234 (68.38%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XCL0 (Expansin-like A2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=EXLA2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 227.3 bits (578), Expect = 5.7e-58 Identity = 124/272 (45.59%), Postives = 165/272 (60.66%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10S70 (Expansin-like A1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=EXLA1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 222.2 bits (565), Expect = 1.8e-56 Identity = 117/245 (47.76%), Postives = 156/245 (63.67%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C3F9 (expansin-like A2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007589 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 468.4 bits (1204), Expect = 5.5e-128 Identity = 223/227 (98.24%), Postives = 225/227 (99.12%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EKV9 (expansin-like A2 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435259 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 2.7e-103 Identity = 181/227 (79.74%), Postives = 201/227 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A515EIV5 (Expansin A10-like protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=EXPLA10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 377.9 bits (969), Expect = 9.7e-101 Identity = 173/227 (76.21%), Postives = 198/227 (87.22%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BIH4 (expansin-like A3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490243 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 375.6 bits (963), Expect = 4.8e-100 Identity = 172/227 (75.77%), Postives = 197/227 (86.78%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C225 (uncharacterized protein LOC111007754 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007754 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 372.9 bits (956), Expect = 3.1e-99 Identity = 177/177 (100.00%), Postives = 177/177 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. TAIR 10
Match: AT4G38400.1 (expansin-like A2 ) HSP 1 Score: 244.6 bits (623), Expect = 2.5e-64 Identity = 119/233 (51.07%), Postives = 162/233 (69.53%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. TAIR 10
Match: AT3G45960.2 (expansin-like A3 ) HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 3.6e-63 Identity = 120/228 (52.63%), Postives = 160/228 (70.18%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. TAIR 10
Match: AT3G45970.1 (expansin-like A1 ) HSP 1 Score: 238.4 bits (607), Expect = 1.8e-62 Identity = 118/234 (50.43%), Postives = 160/234 (68.38%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. TAIR 10
Match: AT3G45960.1 (expansin-like A3 ) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 1.1e-59 Identity = 114/215 (53.02%), Postives = 152/215 (70.70%), Query Frame = 0
BLAST of Moc04g04330 vs. TAIR 10
Match: AT4G17030.1 (expansin-like B1 ) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 3.0e-30 Identity = 72/204 (35.29%), Postives = 100/204 (49.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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