Moc02g14630 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc02g14630
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionRoot meristem growth factor 9-like protein
Locationchr2: 10816481 .. 10823588 (-)
RNA-Seq ExpressionMoc02g14630
SyntenyMoc02g14630
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCAGGCCGAGCTGTTCTCCAAGAATCATAGGCCGACCTCAGAGGTTGGGCCCGGTTACTTAGACACGGATGAGAATCTTTTAAGTACCATGTTCTAAGGCAAGGATGACCAACACGGACCAACAGTCCATAGCAGGTCATCTGACCCCAGAATAGTGAAATACCTCGATGGGATGAGTAACTACTCCTCAAACCCCTATAAATACATCTTCACTCCACCCACTAAGGTATCCAATTTCTGTCTGAAGCTTACCTACCCAGCTCGAACTCGGACTAACTTGAACATCAGAGTGCTCTACTTGTTTTTGTCTACTTGTTTTTGTAGGTCTCCCTTCTCCAGCTCGCTCCACAACTGCTCGCCAGGGCCTATCACAGGTCACTCCACGACATTTTTACAGATTTTTGCATCTAACACATATAAAACTCTCATTGAATATAAACTAAAGTTTTCCAATGTGTAAACTCACAAATCAACAAATACATATAGGGTCTATTTAGGAATGATTTTAGGATCGGTGATTTTAGATAAAAAAGATTTACGATAATTGATTTTGTGAAAGTGATTTTTATATAATTATTTTAACGTTTGATTACACATCTTTTCAAGTGATTTTTGTATCATTAAAAATTATTTTAAATTATTAATATTTAAAGTTTAAATAGAGAATTTGACAAAATAGAAAAAAGTTAAAAAAAACAAAAATCTTGGATAGAGAAATTCTAGAGAGTGAGACAAAAATTTTAGAGAGTGAAATAAACTTAAAAGATAGATGAGAACTAAAAATTTAGAGGGATTACAAAAATTTAAGAGAAAAAAATTAGAGAGAATAAACAAAATTAAATAAAGTTAAAGAGTGATAAAAAATTTAGAAAAGAAAAAAAAATTCTCAAAATCTAAGGTGTAAATAAGGTGGATGGAAAGACAATTTTAAAAATTAAAACAATAAACGTTTTTAAAACTAATTTTCTATTAATTTTTTGGACAAAAATTACCTGGAAAATCATTTTCCAAGTGGTTGACACGGAATCAATTAAAGTAATTTTTTATTTTTCCAAAATCACTCATGAATACTTGCCAAACATTCTAAAACTCGAAATAATTTTGACATGAATAAAAGTAATTTTGGAAGTGATGTAAAAGTGGTTTTAGAAATATTGAAAAGTATTTAAAGTGTTGTATGATTAAGAAAAAACTATATATAGTGGTTTAGACTAAATTATTTTTCAGGAAAATAGTTAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAGCTATTAGGAATATAAAACCAATGTCAAAATAATTTATCATTAAACATTTATTGAAGTACTTAAAATCAAAGTAATTTTGCCAAAATCACTTATTTGACAATAAAACCACTCTCAAGCTCAACTCCAAATTTTCCAATCATGAACTTAACAAACTCAAATTCATAAATTCTTAATTAAAATCGTAAGCTAAATATTAAAAAATAATGTAAAAGAAAAATAATAATACCAGTAGTAGGCATCCATCAATCTTAATGATAGATGACGTGAGGAAATTTTGTTATATTTACCGGTAATTTTGGATTATATTAGATTTAAACGATCTTTACATTTTCAGAAGTCATATTTTGCAACTAAAATGAGTTAGAAAAATGTCGAAAAACAAAATTTTGACTTTGACTTACAAATAATTTGGGATTAATTTGTTTGTATCTTGGGTTTTGGTAAAATAGATCACGTTTTCATTTGCATAGAAAACAGACCAATGAGGCCCACCCATCATCCCACCCACGTGATTTTTACACTCTTTTTTTCTATTTCCCCTTTATATGTAGTCATGGTAGCTCCCACTTGTGCTGGCCTTTGCCCATCCTTCATTTAATGACTATAATTTCTCCATTTATTAATCTCTCCATAATTCTCACAAATATCACTGACAAATTTACTCGTCGATATCTCGAATTTATGTATAATAGGTTTTTGAACTTTAAAAGTGTCTGATAAATCTTTCAATTTTTAATTTTGTATCTAATAAATCATTGAACTTTCAACTTTTGTGTCTAGGTCTATAAGTTTGAGGCAGGATTTTGAATATGTGTTCTAGTGACGAAAGCTCCAACGAACACCTGCAACCCGAGAGAAAACTACAAGTTGGTGTGGTGCTAAGCCTAACACACTTTGATGCCTAAGTCATCAATGGATTCTGTTGAAAAGTAATTGTAAAGGTGGAATGGTGAGAGCGTACCTGGTATCCAAGACCTCTCCTCTTATTTATATGAGGAGTCTCTTTGGATTGGTTCGAATGAACCGACCCGATCAAGTCTTATCGACTTGGCTCGGATGGTCTGACCCTGCTTGGGTCTGATGTGGTCGGGTAGTCCCACATGGATCTGGTCGTGCGTTGTTTGGTCGAGTCAGGTGTTCTTTTCCTTGGGTATGGTATTCCACCCATAACCTATTTAACTGATCTATTATACATTTTTTAAAATTCAAGAGCTTATTACACCACTTCAAAGTTCAAGTACTAAACCTTAATTTAACCTAAAAATAATACTGAAAAGTAATTTTAAATGTTATAGAGGAGGAGTTGTACATACAAGCAATTTGGTCTAAAATAATAAGCAAGTCTAGCATAAGCTAAAAAAAAAATTCCAAATATTTCACAGTTTTTTAAAATGTTCATCAACATACCTATCAACCTCGCATGTCTAATGCTGATAGTCCGATAGTCGTAAATCAGCAATAGATACTGATAGACGTCTATCAATTGATAGATTAGTCTATCGTCTATCATTGATAAACATTGATAGATATCTATCACTCATAGATTCATGTCCGAACAAAATATAATATTTTCAAAATCTCATTCCTTGTGTTATATTTACAAATATGGTAAAAATATTTGCCACTCATTACAATCCCTTATTATTAAAAGTATAACATAAATAAATTATTGAATACTATCATAATAGTTTTTTTTCCAACAATTATAAGGGCATGGATTATCGACCTTTGAGATGGTAATCAATATCTAATTTATCCACTATATAATGCTCAGATTGGCTAATAGTTATAGTCAGTTAATATCTAAGTTAATCGTGGATTAGGTAAATCGCCAATGATTATCACAAAAAAATGAAGATATATACCTCACATAAAATGATAATGTACCAATCCCATACCATCCTGAACATAACTACATGGGTGAGACATTATATCTATCTTCTCTCAAACATTATAGGTTCAATCCCCTATTATTCTATTAAAAGGAAAAAATAACATACTAAAACCATAGCGTGATCTAAGTCAGGTATGAGATTAATGAAAAAATATTAAATATTTTCATGTAATAGTTTTTTTCTATATTATATATTTGTAATTATTTTTATTGAAAGACATATTTGTAAATATTTTAGAAAATGAAGGTACTCACATAGAGTAACTCACTTATATTATAAATCCTTGTTAGGTTTCTTATCTTTTCAAAGTGGGATCCTTAACATGTCCCTTCAAGATGATGTCTTTTTCAGGTTTACAAATATTGGTCGAATTGCAATTTTTTTAGGACCGGATACTCGTTTGAGCTTTTGGGCTCTGATATCATATCAATATATATGAGGTTTCATCTCAAGATCAATTGGCTCGTTTGAAAAGATAATGAGACCTAACAAAATGTTAATAATAGACATGAATTATTCCTCTCATTATTGTCAATTGATTTTGAGATGGAAGCTCGTGAATATTAATATGGTATCAGAGCCCAAAATGCTCACACTAGCATCCGATCCAAAAATGGGATCCGACCAAGATCGATGAGCCAAAAAGAACGACGATCTTGAAGGGACATGTTAAGGATCTCACATTAGATAAGGGACCTAAGAAAGTTTTATAATAGACCCGATTATTGTCCATTGATTTTCAAATGTAACAAAAAAAAAATCATGAATCCAAAGTGAATATTATTTTTAGGGTTAAAGATTGAAGTTGATGGCTATAAAGCCTCCACATAGATGGCTTTCAAGTTGATGTACTAGATCTATGAATATTGGCCACTTGTATGGGAAATTTGTATGTTCTGTTGATGCTAAGTCTTGGAAATAGGTGTTTTGGTTTGGCCTACAAATCTTATATATGCCTCAAAGATGTTCCCTTCTTTCCCACACTCATAGGCCATTGCACATGAAAACATTTAAATAAAATAAACCAAACAAATTTTATTATTATTGCAACTTTTTTTTCTCTTTCTTTTTTTTTCCCCTCATTATTATAAATTCAATAAAGTTTAGGGTTAGGTTTTATGTAATATTGGACCAATGAATACTCCTTCCCAAACATGTGTGTGTCTTGGAGAACAACAAACATTGGCATTTGGGTTTCATCCATTTTCTAGTGAATCATCAAATTGATAGAAGTTTTTGAGGAGAAAACTTAAAAGTTTGATTAAACATATGTCATATTAAATCATTTGATTTGGACTTAGTACTATATGATTTCTTTGAGAAGAGGTTGATATATATCGTTATTTTAAAGGCTAGCAATTATTTGATCGTTAAGATATCGAACTCGTTAACGGGTTGTTTAAGAGTTCGCTTGATAACCACATTTTCGCTTCGAGTTTTGTGTTGGTTTAAGATAAGATTGTTTGTTGACATTAGTTTAATTTTTGTTTATTTATTTGTGTTTTAATCTAAATTAAATTTTGAAAATTTAAAAAGAAAGTGAGATTAAGATGCTCCATTTTTCAAATGGTCTCAAATTTGAAAAATATTTAATTTTTTTTAGTAGAACATCGGGGATCAAACTCACAACCTTTTGGTCGAAGATCCCAATTACAGATATGCTCACTTGATGTCCCATGTTTCAAATTTTAATTTTAAAATTTTTACGATCTCCTCTCAACTTTTAGGATCTCCCTAGCCATCCCAAGTAATATTATTGAGGATTTTATTGTTGAATATTTTTCTATTCCCATAAAAAAAGAGAAAGACAGATATATTATCGAGCAACGCTATTGGTGTCATCCTATGGAACCTTGATTGGAGAGAAACAACCGACTTTTTGGAGTGTTTATAAATCTCTAAATAGTCTAGGTAAGGATATTATTGTCTCTTCTTCTACTTGGTCCTCAAAATCAAGCCTCTTTTGTAATTATGATATATCTACTATTTCTCTCAATTTAAGGAGCCCTCTTTTGTTGTATTTATGTCTCTCACATGCTTTTAATGAAGCGATACCTCTTCTTTGTAAAATTTAATTTTTAAATAAATTTCAACCCAATAATGTCGTGTTGATTATATTTGAGTAATTGAATGGTGACATGATAAATTTAGTTTTAGAGATAAATTTTATTTAATCTTAAATATGTATAACTCCTATTCTCCTCTTGGTGAGGTGTGATATCATAAAATGTTTGATATTTCACTTCATTATTTTAAAACCTTTATGGATCAAAGTGCATGAACCATTATTCAATATTATTTCATGTGGGCAAGTTTTTATCCGACTCAATCAAATTCAAATTTTCTAGCTCTATCTCAGAGTATCCTTTTACTCAAAATTGACCCGCGATCATTGGAGGAATAATACCTAAACCTGAGGATGAATGAGTCGTCGAGAAATCGTATGAGAGTTAGTTAACTGCCGTGAATTGAAAGGAATAAGTTTGACAACAGATCACATATTACATGTTTGCTTTAAAAAAATAACAATAAATAAACTTAGATTAAAAATAAAATGGAGAGTTTCAAAAGAAAAATGTTAACACAAACATTTTAGGCACTAATGGGGTGTGGCTGATTTTTTGTTTTGGTCATTTAGATGCAAAAATGTGCGTTGTTTTTTTCCTTTATCAAAATTAATGGCCAAATTTGGCTGTGTTCTTGAACACTCCACATTATCAAAAAGCTCAAAAACTAAAATTTCAATTTCAATTGCAAAAGGCTTTGTCTCCAACCTCAAAACCCCATCATTTTCATTTCAAGACACTCTCAAAACATTGACATAGACTCTCAACACTATAACTTTTGTTCTCTTTTGAATGATACAAATTTTAGGCTGCTCCACATGTGCCTTTGTACTCAACTCCTACTCAACTTCTTCCTCTCTTAAAACCTCTCTATAAAAAACACCTCAAATTCAACACCTTCCACACAAAAACAAGCCTCCCTTTCGGCAAAATCGCAAGAAATTAAAGCTGAAAACTAAAGAGAAAATCGTAAGCGTTGCAATGGCGGTTCTCCCAAGTAGGCGCCTCCTTCTCGTCGTCCTCATCGTTATTCTCTGTTGTTTCTTAAACACTACTTCTGGTAGATTTCTCGACCTTATAACTTCTTTTTTTCTTTCTTGGTGTTTCGAATTATAGTTAACATCGTGTTGATCACTAACCTATTATGAAATAAGTCCGATCATTTTTTTTTGCATATTTGTTTTCTTCTCTGGTTTTATTTTGAGTTTCAGAATTAGGGTTAGTTCTGATCATGTTTACTTCTTAATTAGGATAAAAAATGGAATAGGTTTAATGATTTGTCTTTGGTGTTTCAAATTATGGTTATTACCGCCAATAATAAATGGATTAAGTTGTCATTGGTTAAAACGTATATTCTTGACCAAAAGATTGTAGTTCTACTCTCTTTTTTCAGTATCTTCTTTTTTTAATAATGTAATGCTTGTTATCCAGTATATATATAACAAATAATAAAGGATTTTTTAATTTTTTTGTTGTGACATATCTTAGAAGGTACATCTGTAAACTAGATGCATATTCAAGAAAATATAAAAACAAACAGAAACAAAAACAACATTTAAATAAGTTCGCTAATTCTTTATGCAATCATTAAGAAAAATTCTTCGCTCTGCAAAATTGAGGTCTCTAGCTTCCTTCTCTTTGAAAACCCGAATCTCACATGTACGACGTTATAATCGGATCGTTGATCGGGTTTTGGGTATTTGGGTTGTGGTTTTTGCAGCAGCAAGAAGTTTGGGAGTGCCTCAGATTGGAAATGTTGATCACAAACAGAAAGCAAATGATGATCTTAAAGTTGTTCATGATGAAGAACATTTTACAAGCACTGATGATTTGGTGGCTATGGATTATACTCCAGCCTCAAAGAAGCCTCCAATTCACAACTGA

mRNA sequence

ATGCAGGCCGAGCTGTTCTCCAAGAATCATAGGCCGACCTCAGAGGTTGGGCCCGGTTACTTAGACACGGATGAGAATCTTTTAAGTCTCCCTTCTCCAGCTCGCTCCACAACTGCTCGCCAGGGCCTATCACAGTCCCACATGGATCTGGTCGTGCGTTGTTTGGTCGAGTCAGGTGTTCTTTTCCTTGGAATTAGGGTTAGTTCTGATCATGTTTACTTCTTAATTAGGATAAAAAATGGAATAGCAGCAAGAAGTTTGGGAGTGCCTCAGATTGGAAATGTTGATCACAAACAGAAAGCAAATGATGATCTTAAAGTTGTTCATGATGAAGAACATTTTACAAGCACTGATGATTTGGTGGCTATGGATTATACTCCAGCCTCAAAGAAGCCTCCAATTCACAACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCAGGCCGAGCTGTTCTCCAAGAATCATAGGCCGACCTCAGAGGTTGGGCCCGGTTACTTAGACACGGATGAGAATCTTTTAAGTCTCCCTTCTCCAGCTCGCTCCACAACTGCTCGCCAGGGCCTATCACAGTCCCACATGGATCTGGTCGTGCGTTGTTTGGTCGAGTCAGGTGTTCTTTTCCTTGGAATTAGGGTTAGTTCTGATCATGTTTACTTCTTAATTAGGATAAAAAATGGAATAGCAGCAAGAAGTTTGGGAGTGCCTCAGATTGGAAATGTTGATCACAAACAGAAAGCAAATGATGATCTTAAAGTTGTTCATGATGAAGAACATTTTACAAGCACTGATGATTTGGTGGCTATGGATTATACTCCAGCCTCAAAGAAGCCTCCAATTCACAACTGA

Protein sequence

MQAELFSKNHRPTSEVGPGYLDTDENLLSLPSPARSTTARQGLSQSHMDLVVRCLVESGVLFLGIRVSSDHVYFLIRIKNGIAARSLGVPQIGNVDHKQKANDDLKVVHDEEHFTSTDDLVAMDYTPASKKPPIHN
Homology
[Close]
BLAST of Moc02g14630 vs. NCBI nr
Match: KAG6571377.1 (hypothetical protein SDJN03_30292, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 6.0e-14
Identity = 44/55 (80.00%), Postives = 46/55 (83.64%), Query Frame = 0 

Query: 82  IAARSLGVPQIGNVDHKQKANDDLKVVHDEEHFTSTDDLVAMDYTPASKKPPIHN 137
           IA RSLGVPQI   DHK K NDDL  VH+EEHF+STDDL AMDYTPASKKPPIHN
Sbjct: 23  IATRSLGVPQIKKDDHKLKGNDDL-AVHEEEHFSSTDDLGAMDYTPASKKPPIHN 76

[Close]
BLAST of Moc02g14630 vs. NCBI nr
Match: KAG6605281.1 (hypothetical protein SDJN03_02598, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 2.2e-08
Identity = 40/57 (70.18%), Postives = 41/57 (71.93%), Query Frame = 0 

Query: 82  IAARSL--GVPQIGNVDHKQKANDDLKVVHDEEHFTSTDDLVAMDYTPASKKPPIHN 137
           I ARSL  GVPQI   DH  K + DL  V DEEHF ST DLVAMDYT ASKKPPIHN
Sbjct: 26  IEARSLGVGVPQIKKDDHSLKVDGDLN-VDDEEHFMSTVDLVAMDYTQASKKPPIHN 81

[Close]
BLAST of Moc02g14630 vs. NCBI nr
Match: KGN62102.1 (hypothetical protein Csa_006036 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 8.3e-08
Identity = 39/61 (63.93%), Postives = 44/61 (72.13%), Query Frame = 0 

Query: 82  IAARSLGVPQIGNVDHKQKA---NDDLKVVH--DEEH-FTSTDDLVAMDYTPASKKPPIH 137
           IAARS+GV ++ N    +K    NDD   VH  DEEH F+STDDL AMDYTPASKKPPIH
Sbjct: 28  IAARSVGVAEMKNESQNEKVINMNDDAYKVHNNDEEHYFSSTDDLGAMDYTPASKKPPIH 87

[Close]
BLAST of Moc02g14630 vs. NCBI nr
Match: KAA0045905.1 (Root meristem growth factor 9 -like protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK13684.1 hypothetical protein E5676_scaffold299G002040 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 1.4e-07
Identity = 39/63 (61.90%), Postives = 47/63 (74.60%), Query Frame = 0 

Query: 82  IAARSLGVPQIGN-VDHKQKA---NDDLKVVH---DEEH-FTSTDDLVAMDYTPASKKPP 137
           IAARS+GV ++ N +  ++K    NDD+  VH   DEEH F+STDDL AMDYTPASKKPP
Sbjct: 28  IAARSVGVAEMKNEISQREKVININDDVNKVHNNNDEEHYFSSTDDLGAMDYTPASKKPP 87

[Close]
BLAST of Moc02g14630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LMV6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G297260 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 4.0e-08
Identity = 39/61 (63.93%), Postives = 44/61 (72.13%), Query Frame = 0 

Query: 82  IAARSLGVPQIGNVDHKQKA---NDDLKVVH--DEEH-FTSTDDLVAMDYTPASKKPPIH 137
           IAARS+GV ++ N    +K    NDD   VH  DEEH F+STDDL AMDYTPASKKPPIH
Sbjct: 28  IAARSVGVAEMKNESQNEKVINMNDDAYKVHNNDEEHYFSSTDDLGAMDYTPASKKPPIH 87

[Close]
BLAST of Moc02g14630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TWX6 (Root meristem growth factor 9-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold299G002040 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 6.9e-08
Identity = 39/63 (61.90%), Postives = 47/63 (74.60%), Query Frame = 0 

Query: 82  IAARSLGVPQIGN-VDHKQKA---NDDLKVVH---DEEH-FTSTDDLVAMDYTPASKKPP 137
           IAARS+GV ++ N +  ++K    NDD+  VH   DEEH F+STDDL AMDYTPASKKPP
Sbjct: 28  IAARSVGVAEMKNEISQREKVININDDVNKVHNNNDEEHYFSSTDDLGAMDYTPASKKPP 87

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Moc02g14630 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6571377.16.0e-1480.00hypothetical protein SDJN03_30292, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
KAG6605281.12.2e-0870.18hypothetical protein SDJN03_02598, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
KGN62102.18.3e-0863.93hypothetical protein Csa_006036 [Cucumis sativus][more]
KAA0045905.11.4e-0761.90Root meristem growth factor 9 -like protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK13684... [more]
BLAST of Moc02g14630 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Moc02g14630 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LMV64.0e-0863.93Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G297260 PE=4 SV=1[more]
A0A5A7TWX66.9e-0861.90Root meristem growth factor 9-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=119469... [more]
BLAST of Moc02g14630 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..22

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc02g14630.1Moc02g14630.1mRNA