Moc01g15490 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview


Name	Moc01g15490
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	Unknown protein
Location	chr1: 9835529 .. 9842891 (+)
RNA-Seq Expression	Moc01g15490
Synteny	Moc01g15490

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

ATGGGTTCTCTTTTGGGAGGGAGAAACCCTAGCCACCACTTGAAGCAAGAGAGAGAGATAGAGAAGAATCACGGCCACCCCGTCACCGTCGTCGTTGCCATGAGAGTTACAACTGCTGTTGTTTCCTTTATGAGCATCAACGGGTTGAGGTGTGGGTGTTCAAGATCTGTGGTATTCTTGAACAAGAAGGAATTTCGGATTTGTGCCGTGGGTGTTCTTCGTTGGGTTCGAAGATCGAAAGGAGATCTACAAAGCCGCTCCAATGCTTCAGCTGTTCTTCGCAGTCGCTTTCTCGGCAGTGCCATTGACGCTGTACGTGCCGCCGATTCGGAGCCTCAATCTCTTCGTCGAAACCCTAGAGGATCTTCTTCGTCACACTGCCATTCATACGCTCAGAGTTTATCCTCGGTTTCGCATCGCCTTCTCTCGCCTCTTCCGCTCCGTCTTCAGCGCCTCCTATTCTTGAGTCTACGCAGCCGCTCCAATGCTTCAGCTGTTCTTCGCAGTCGCTTTCTCGGCAGTGCCACTGGCGCTCTATGTGCCGCCGGTTCGGAGCCTCAATCTCTTCGTCGAAACCCTAGAGGATCTTCTTCGTCACACTGCCATCCATACGCTTACACTTTTTCCTCGGTTTCGCATCGCCTTCTCTCGACTCTTCCGCTCCCTCTTCGGCGCCTCCTATTCTTGAGGTTTGATTCTTCAGATTCCGTTGTTCGTTTCGTAGTGCTTGATTTGTGTTTACAATCTTTAATTTCCGTTCGCTGTTGTATATGGAAGTGCGATTTTGCTTCGCGATTCTGGATTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGTTCTCTTTTGGGAGGGAGAAACCCTAGCCACCACTTGAAGCAAGAGAGAGAGATAGAGAAGAATCACGGCCACCCCGTCACCGTCGTCGTTGCCATGAGAGTTACAACTGCTGTTGTTTCCTTTATGAGCATCAACGGGTTGAGGTGTGGGTGTTCAAGATCTGTGGTATTCTTGAACAAGAAGGAATTTCGGATTTGTGCCGTGGGTGTTCTTCGTTGGGTTCGAAGATCGAAAGGAGATCTACAAAGCCGCTCCAATGCTTCAGCTGTTCTTCGCAGTCGCTTTCTCGGCAGTGCCATTGACGCTGTACGTGCCGCCGATTCGGAGCCTCAATCTCTTCGTCGAAACCCTAGAGGATCTTCTTCGTCACACTGCCATTCATACGCTCAGAGTTTATCCTCGGTTTCGCATCGCCTTCTCTCGCCTCTTCCGCTCCGTCTTCAGCGCCTCCTATTCTTGAGTCTACGCAGCCGCTCCAATGCTTCAGCTGTTCTTCGCAGTCGCTTTCTCGGCAGTGCCACTGGCGCTCTATGTGCCGCCGGTTCGGAGCCTCAATCTCTTCGTCGAAACCCTAGAGGATCTTCTTCGTCACACTGCCATCCATACGCTTACACTTTTTCCTCGGTTTCGCATCGCCTTCTCTCGACTCTTCCGCTCCCTCTTCGGCGCCTCCTATTCTTGAGGTTTGATTCTTCAGATTCCGTTGTTCGTTTCGTAGTGCTTGATTTGTGTTTACAATCTTTAATTTCCGTTCGCTGTTGTATATGGAAGTGCGATTTTGCTTCGCGATTCTGGATTTAG

Protein sequence

MGSLLGGRNPSHHLKQEREIEKNHGHPVTVVVAMRVTTAVVSFMSINGLRCGCSRSVVFLNKKEFRICAVGVLRWVRRSKGDLQSRSNASAVLRSRFLGSAIDAVRAADSEPQSLRRNPRGSSSSHCHSYAQSLSSVSHRLLSPLPLRLQRLLFLSLRSRSNASAVLRSRFLGSATGALCAAGSEPQSLRRNPRGSSSSHCHPYAYTFSSVSHRLLSTLPLPLRRLLFLRFDSSDSVVRFVVLDLCLQSLISVRCCIWKCDFASRFWI

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Moc01g15490 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Moc01g15490 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Moc01g15490 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Moc01g15490 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 109..128
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..22

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Moc01g15490.1	Moc01g15490.1	mRNA