MS026253 (gene) Bitter gourd (TR) v1

Overview
NameMS026253
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold63: 528369 .. 536468 (-)
RNA-Seq ExpressionMS026253
SyntenyMS026253
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGAGAAGAAACAGATTGTACCTACGTTGGTGGTGGTGACGATAATGATTATGGCGTTTTTGGGCAAGGCAGAGGAAGAAGACGATCTCCTTCAACTCGAACTTCCATCTTCTAGGGATGAAGATGATCTGGTCGAACTTGAACTCGAACTTGAACTCGAACTCGAACTCGAACTTTCATCCGATGCTGAGAAAGAAGATGTGACCATGAATGAAAACAAGTACTTGTTTCCAAGAAAATCTTTAGGTGGTGGCCTGAAATACAAATCAGATGATAAATGTAGGGGACAGGCATGCGGCAACTTTTTAACATCCCATTGTCCCCAAGGTTGTAGATGTCGTAAAATGGATCACATGAGCTTTCATTATATGACCTTTTATGCTTGTGTCGATCGGTAATTAGCCTCTCTTCTAATCTACTTCTTTTTTTTCTATTTAAAGCTAATTTGTGTCTTAACTTTTTAATCTTCCACCTACATTTAATAAATTACGAGTCATGTTGTTGTTGTTGTTAGTTTTACTTTATTTATATATATATGGGTTACATTTCTTTGTCTAATGCTGAGAATTTGTACCAACCAAGTTAAATCTCTTTATTTAGGCTAATTTCAAAAATTAGGACATAAATCACGGAAAAAAGGAGAGAGAATTTGCATTTTTTGAGGATTACTAAAAAATATTGAAATAAAGAATTAGGACATAATTATTATTATTATTTTTTTTTTGTGAAAAAGCAAAAAGGATGGGAAGAATTCGAACGTTTAATTTTTAGGGAGGTAAGCAATGTCTTGATCAATTGAGCTTTCAATTTTTTTTTCACTTAACATGAGATAAAAATAAAATAAAAGAGAATATTAATTTATGGTTAAATTACAAAACTTAGTCTCTAAACTTTCTAGTATCTAATATGTCATGAGACTTAAAAAGACATAAATTTGAAGTGCAATAACTTAATATACACTTTTCTAAAGTCAAGAAATCTATTAGACACCATGCTAAAAATTTATATGCTAAATTTGTAATTTAATTTTAGTTTATCGAAAGAATTAGTTTCTTTTACGCGGTCCTTTCTATTGGATTAAATATATGGTTAGAATAATCAACATATTTAAACTCAAACAAAAAGGCAAAAACAAAAAACAATTGGAGCAATATTATAACACTCATGGAATAAACTTTGTAGTATAATTGTGCATGGCCGGTGCTATAAAATAGTCCCAAGAGGCAATGGAAAAAACATAACCCTAAAACAAAGCAAATAAGGGCATAGAGAGAGTGAAAGGAGAAGAAAAATATTGTCTCCGCGTTGGTTATGGCCATGATATTGCTTCTGGTCACTTTGGTTCAGGCAACCATTGTCACCACTGCAAAAAATAGACAATATCATATCATTGTGAAAATACTTATGCTACATGAGTAGATCATTAACAGAATGGTTGCAATTATTTTTTAAGAATCAATTATAATTGAGATAAAGATGCATAAAAATTAAAAGCTATAGAAAATATGATGATGAATAAAGAATTAAATTCTTACAAAATACAAAACTTAAATCTCCTTGAAATGTCGCTTAAGTATAAATGTCTACATATAAATATTACATCACATTTGTTATTTTGAAAAAGGAGATGGAATTTACGTTATATATACATTGTATGACAAGCTTGTTGCAACTAATTAATTATTTGAAAACATTTAGGTTAAATTATCTAAATTAGAATAGAATCTTAGTAAAAACTATCAAATACCTAGTAATTGTTTACGGTATTGTAAAACTGAAGAATACTTGGTTCACATAGTTATTTTATTTATTGACTCTATATATTATTTTTAAATGTGGTTGATATGATTAATTGAAAATAAAAAAGTTTATACTCAAGCAAACAAATTTTAAAGAAAAGAGAGAGTCCCAATTTAAACATAGGTTAGATTGGAACTAGAGATAGATAAAAAAAAACAAAGAAAATTAGTTTAATAAAAAGGCCCTTAGATTTTTTCAATAGTATTTGGTTAAATCATTAAAGTAATTTTAAAAATTTTAAGTAAACTTAAAAAAGTACTTAATTAATGATTCTTCCAAAAACTACCTCATGAAAGAAGCATTTTTCACTTATAAAGAAATAGCTATTTTAAAAGTCATCGAAAACTCATCCTAACTCTGTCTTCTAAGATAAATTTTATTCTACTGTCCCATGAACTTCAATTTTTCTAGGGTAACGAGCAATTTAAAAGGGTACGGATCGTAGGGTGGTTTTAAGCAAGATTTTAATTATCGATATCGATGGAGATGTCGTCTCTCTTGTTATTGGTTCGAGTCTTACACTATGCGATATCGATAAAAATGTCCGAAACCTCACTTTCATGGAAATATCGATAAAATGTCGATGTAAAAGTTCTAATAATAAAAAATCTAGTGTTAATAATCCCATCTTACTAAGATAGTAAAGACCTAACAAAGGGTTTTATATCACTCCTCTCATTGTCGATGAGTTTTGGGATGAAACCCATCATTATTATTTAAACATTTCATCTTTTCTAAATAAGTTGAAAATAATTAATATAAATATTATGTCTATATTAGTGAGACGTTGTTGATATTTTTTTAATATTATGGAAATAGAGATAATGTCTTCGAAGGGCTGTTTTAGAAATTTATTTACACAAATGTCTAAATTTTTCTAATTTTACACTTTTAGATTTCTAGGATTTTATTTTAATTCCGATTTTACCTCATTTATATTTATTATAGTTATTTGTTTTTTTTGAAATATAAAAGATTTAATTTCATAAATTATTATCATAATCCTTTAATTATTGCGGGCCCTATACTAATTTTCAACACAAATCCCTTAATTCACTCATTCAAAATCTTAATTTACTCCTTCAAAAAATTAATTTTCCCTTAATTCACTCCCACTCAATCTTCAAACACAATTCAAAATCACAGAAACATCTTTTGAAGTCTCAATAAACATATATCCGCATATTTAAAAAATATATTCAAAATTACAGTATATATCCACTTATATATCGGCATATGTATATTAAAAATCACTATAGTATATATCCGCATATTCGCATATATAAAAGTTGAGTTATAAAATATATCCTAATCAAATCACTATAATATATATCCTCATATATACAATATTTCACACGAAATCAGAAATTGAAAACAACTGTTGGAATGCAAACCTTTCAATCGGGAGATGAACTGCTCTGACCACTAGAAAAAATGGAGGCGGCCAGAGATGAAGGCAGGCAGACGCTGGCCGGAGATGAAGGCAGGCAGAAACGACGTGAAGAATCGACAGAAATCTCCTTTCGAAGGGGATAAACGCAAACGAAATGCTCTTTCGACAGAGAAAAACGGAGCCGGTTGGAGAGGAAGGCAGACAGCGACGGACGGTCGGATAAGAAAAGGGAGGGTCGGAACCGGTTGAAAAGTATCATTAGCACATTTTGAGGGATTTGACCTCCCAATTTACCAATTCTAGATTTTAATAATTATTTAATATTGAGATGGATCCTTAAAAGGATATACTAGTAATTTGTGTGATGACTACCATCTAATTAGGGTTGTTTCATGACAAAATGGTAAATTCTATACTTTTACCTAATTATGATTTCTAAATAGACATGTATGTAGTAATCCCATGGAAATATCAATTTATCTTTTGTGTCGATGTCGAATCCATGGATACAAGAAAATGTTGATAGAAATATAGACATCTCGAATAATATTTAATACCATGATTTTAACTGTCATTTTTATTCATTTATTCTTTGTCCTTAAATTATCATAAGTATTCGATTTTATGGAACTTTTATCCACTTTGTAATGTGAAGTTTTGAAATGTAATTAATATTACTTTTTCTTTCTTTCTCCTTTTAAGATAGGAAAAATTATTCGAATCTTTAGAGAAATAAGTATTGTTATATGTCCATCTTTTTTTTTTTTTCACAAACATCAGTTTACTCTAGAATTAGTTTTTTAATGTGTCCCTACACATTTTCGAGCAATATTATAATATTTTAGCAAACATTTGAAGTAAAATAATGTTGCATCCGGGTGCTATAAAATAGTCCCAAGAGGCCATGGAAACAACACACAACTCTCAAACGCAAAGCAAATAAGTGCATAGAGAGATCAGAGAGATGGAGAAGAAACAGATTGCATCCACGCTGGCGGTGGCGATGATTCTGCTTACGGCCACTTTTTGTAATTAAGGCAGAGGCTGCCACCGGCGACGGCCATCTGCTTGAACTTCCCTCTGAAGCTGCTGCAACGAATGCCAACAAGTAGTTGTTCTCAATAAAATCTTTAGGCGGTGGCCTGAAACCAAGCTCTGAACCTGGGACATGTGTGGGATCTATTTGCGGCGATATGCTGGAATTGCTTGTGACTCGGGTTGTACTTGCTACATGGTTGCCATGGGCATTGGTGCATGCATATGATTATAAGAATTAACAATCTATGATCATTCTTGTTGATGGTTTGTTTTGTTAATTTTATGGTGTTTTATGTGTGCTTAACGAAACTTTTGTGGGTAAGTTTTGTTAACAGTTGTCTTGTAATCTTAGAGCTACAATCAATAAATTACAAGTCATGTTGTTGTTCTCTGTCAAATCTTTTGAGTTGAAACGGTCAAAATTACTTCTCTTTTCATTATCATGTTTGAAAAATTAGAAAATTGAATTTAAAAAAGCACCTTAAAATAAGTTTAAATTGATTTTTAAGGATTGATCACTTATATGGTGATTATGGAAAATCAGACGAGTAGCCCATGTCATTATAAATCCTTGCTAGATCCATTTTCTTTTCAATGTGGGATCCTTAACATGTCCCTCAAGATCGTGGCTTATTTGACAAATCGATCTTTGACCGGATCTTATTTTTGGATCGGATGCTCGTTTGAGCTTTTGAACTCTTATACTAATAGATGTTTCATCTCAAAATTAATTGATAATGAAAACAATAATTCAAATCTATTATAAAC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mRNA sequence

ATGGAGAAGAAACAGATTGTACCTACGTTGGTGGTGGTGACGATAATGATTATGGCGTTTTTGGGCAAGGCAGAGGAAGAAGACGATCTCCTTCAACTCGAACTTCCATCTTCTAGGGATGAAGATGATCTGGTCGAACTTGAACTCGAACTTGAACTCGAACTCGAACTCGAACTTTCATCCGATGCTGAGAAAGAAGATGTGACCATGAATGAAAACAAGTACTTGTTTCCAAGAAAATCTTTAGGTGGTGGCCTGAAATACAAATCAGATGATAAATGTAGGGGACAGGCATGCGGCAACTTTTTAACATCCCATTGTCCCCAAGAGGCTGCCACCGGCGACGGCCATCTGCTTGAACTTCCCTCTGAAGCTGCTGCAACGAATGCCAACAACCGCCGCAACCCGAAGGAAGGAAGGAACGAAGAACCGAAGGAACGAAGGAATGACGATTTAGGCGACACGAGACGGCATCATGCGGCGGCGACCTCCACGGCTGCAGACGACAACGACCTCCACAGCCGCAGGCAACGACAACCTCCACAGCAGCCGGTGACAGCGACCCGAATAGCAGAAAAGCGGCGGGCGGCAGAAATTAAGCAAACAGTAGCAGAATCCCAAGCGGTGGCCCCAAACAGCAGCAGGCGGCACCGCCACAACGGCAACACGCGGGGGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGAAGAAACAGATTGTACCTACGTTGGTGGTGGTGACGATAATGATTATGGCGTTTTTGGGCAAGGCAGAGGAAGAAGACGATCTCCTTCAACTCGAACTTCCATCTTCTAGGGATGAAGATGATCTGGTCGAACTTGAACTCGAACTTGAACTCGAACTCGAACTCGAACTTTCATCCGATGCTGAGAAAGAAGATGTGACCATGAATGAAAACAAGTACTTGTTTCCAAGAAAATCTTTAGGTGGTGGCCTGAAATACAAATCAGATGATAAATGTAGGGGACAGGCATGCGGCAACTTTTTAACATCCCATTGTCCCCAAGAGGCTGCCACCGGCGACGGCCATCTGCTTGAACTTCCCTCTGAAGCTGCTGCAACGAATGCCAACAACCGCCGCAACCCGAAGGAAGGAAGGAACGAAGAACCGAAGGAACGAAGGAATGACGATTTAGGCGACACGAGACGGCATCATGCGGCGGCGACCTCCACGGCTGCAGACGACAACGACCTCCACAGCCGCAGGCAACGACAACCTCCACAGCAGCCGGTGACAGCGACCCGAATAGCAGAAAAGCGGCGGGCGGCAGAAATTAAGCAAACAGTAGCAGAATCCCAAGCGGTGGCCCCAAACAGCAGCAGGCGGCACCGCCACAACGGCAACACGCGGGGGTGA

Protein sequence

MEKKQIVPTLVVVTIMIMAFLGKAEEEDDLLQLELPSSRDEDDLVELELELELELELELSSDAEKEDVTMNENKYLFPRKSLGGGLKYKSDDKCRGQACGNFLTSHCPQEAATGDGHLLELPSEAAATNANNRRNPKEGRNEEPKERRNDDLGDTRRHHAAATSTAADDNDLHSRRQRQPPQQPVTATRIAEKRRAAEIKQTVAESQAVAPNSSRRHRHNGNTRG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 135..176
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 125..225

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MS026253.1MS026253.1mRNA