MS022079 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTGACTAACTTGACCTTTTTGCAGTCCTTTAATGCTTCAAATTTATTGCTTCCGGGTGTCGTTCCTGAGTGGTTCGGGCAGCGTCTCGGCTTGCTGCGAGTGCTTGATCTGCGGTCTTGTTCCATATTTGGTTCTATTCCATTGAGTCTGGGGAATTTGAACAACCTGACTGGTCTTTATCTGTCTGATAATAGACTTACTGGGACACTGCCTTCTAATTTGGGCAAACTGTTCAGCCTTTCATTTCTTGATTTGTCACATAATACATTCACAGGAATGATTCCTCCCTCGCTTGAATCTCTTGGCAATCTTTCTCTGCTTGACCTTTCATCTAATTACTTAGCAGGGTCGATCCCTCCAGGCATTGGGAGCCTATTGAAGCTTCGGTATCTAAATCTTTCAAATAACAGTTTGTCTTCTTCAATACCTGCTCAATTTGGAGGGCTTGTTAGCTTAGTTGACCTTGACCTTAGTGTCAATTCTTTGTCTGGACCATTGCCTACGGATTTAAGAAAATTAACGAGCTTGCGAAGCATGGTATTCAGGAGAAATTTTCTTGTTGGTTCCTTGCCTGACACTTTGTTCCGCACTTTAACACAGTTGCAATCCTTGGTTCTGAGAAGTAATAACTTTTCTGGCTCGATCCCTGATGTGTTCTGGTCAATGCCCAGATTGAAGCTTGTTGATGTTTCCGGGAATAGTTTAACGGGAATGCTGCCTAATTCTAGCTCAAGTTTGAATATTACTGGTGCTGTACTTAATGCATCTCAGAATATGTTTTATGGGAGCCTTACACCCATATTGACAAGATTTAGTGCCATTGATCTGTCGGGAAACTACTTTGAAGGCAGAATTCCTGAATATCTACTCGCCAACCTATCTTTCGTGAGTAACTGCCTCCAAAATGTGGCTAACCAGAGGACACTGGCTGTATGTACATCTTTCTATTCTGCAAGGGGCCTCACTTTCGATAATTTCGGCTTGCCCAAGGCGACAGGCCCAACACAACCTCCGCCAGCAGAAGAATCCAAGAAGAGCAGTAGAAATGCTATTATCTTGGGCAGTGTTATTGGTGGAAGTGCTCTTATCTTGCTACTAGTGTTGCTGATACTTTTCTTCCTGTGGAGGCGGAAGAGAAGCACTACTAATCAAAGAGGAGGAGGGGGTGTTGTGGGACCAGTTCTCTCTGGGGATGCCGAACCACCTCCCGAATTGTCGATCAACTTTTCGAGTTTAGGAGAAGCATTCAAGTTCCAGCAGTTGCTTCAAGCAACTAACGATTTTAGCAATTTGAACCTTATCAAACGTGGCCATTCGGGGGATCTTTTCCATGGTGTATTGCAAAACGGGATCCGTGTTGTTATCAAACGGGTCAATCTGCGTACAATTAAAAATGATGCTTACTTGGTGGAATTAGAATTCTTTAGTAAGGTTTCACATGTAAGATTAGTTCCCCTTGTTGGCCACTGCTTGGAGAATGAAGACGAGAAGTTCCTGGTGTACAAATATCTGCCAAATGGTGACTTGTCATCTTCCTTGTTCAAGGAAGTTAAGGCAGATGATGACAGTTTGCAGTCACTGGATTGGATTACAAGACTAAAAATTGCATTAGGAGCTGCTGAGGGCCTTTCTTTCCTGCATCATGATTGTACTCCACCCCTTGTGCACAGGTACCACAAAATTTTTCCTTTTTCTTTTGCATTCATCTTTTCCATAGCTTTCCCATTTAGATAATCATACTTATTTTTGCTCCACAAATTGCAACATTGTCTTGCATCTCCTTCATTAGCCTTAATTTTCTTCCTAACCATCATGTTTGGCTGTCTATTGGATGTTTGGGATAGCTTCCAAAGCCCCCTTAGGCCATAGGTGAAAAACTCGACAATTTAAAACCGTTGTTGTCGTCTCCTGAAACTAGCTTTTAGATGGGAGAAACCTCTCAAAGATTAGTGCGGTGGGCCATGAGCATAATTCAGGGTGTGAGGCCCCTCGGTACCTGGTCGTAAAAATTAGATACATATTTGGCTGCTTAATGTGCATCACTGCATCTTAAGGATTCTGCACTAGCATAGTAGATTACCGACAATAATAGTATTGACTTTGATTTCTTTTGGTAATCAAGAGATGTTCAAGCAAGTAGCATACTTCTTGATGATAAATTTGAAGTGCGGCTCGGAAGCTTGAGCGACGTGTGTGCCCAAGAAGGGGATGGCCAACCGAGCAGACTTACCAAGTTGCTGAGGTTGCCACAGTAAGTAGTTTCTGAACAGACGAGTCTATCTGTTTTCATCATTTTTATGTTCTCTATTTGTGATCATGGTGAAAGAACTGTTGCAAAGATTTGACTATTGTGTGATATTATTCTTTTATTATTTTCTGATAATTGTTTTCTCCAAATGATGTGCAGGTCATCTGATCAAGGCTCTTCAGGTATGTAGAAAACTAGCCGATTTTTCGTCTTTGTATCTGTTTTCCACCAACAGTTTCATGAATCATAGTGTCGTGGATGTAGTAATAAACTTAGCATTTCATTCAACTCATGTCATGGTCTTGCTTAGCATATAACATCAAAGTTTAGTTAGAAAGGAAATTTTAATTCATTTTCGTTTGGCTGAAACTACAAACCCCTTGAAATTAGTAAATTACAAAACTATCTAGTTTTCCTGAACTAGTTGTCTAATTGGTTTGCACTCTTGGGTCTGGCTACCCATTTCTCAAACATGAGGTGAAGGGTAGGGTCGTCTTCGAGAATTAACAACAAAAAGTTGAATCCATATGAACAGTGTTGCACCAGGCTCTTAGATATATCGGTTGCCCACGGGCTTCACATTGGAGAATTGTTGTTGTCATTTACTTCTCTCTGGTATTAGTGATCACATTGATAGGCATAACACTATTGAGTGGCTATGCCTATTTGAGAATGAGTTGTAAAATTCGACCCAAAAAAGTAGCCATTTTAAAGTTCTCAGTAAACATAGTTGAATATGTCCTACCATAGTCTAGTCCAACTTTGCTGAACTTTTCTTTGTTCAATCAAAAATTACCTACCCAACAGAAAAATCCTCATTTTCTACGGTTTCGGTATTCGAACACCGCACTTTGTTTTACTTGTTCCACTGACAGCATAGAACTCTGTATAAGTATATACTAAATTCATCCATTTCCACAACCAGGTTTGCAGACAGCAGTATGTACCTATGATGTTTACTGCTTTGGCAAGGTGTTGCTTGAGCTGGTGACAGGAAAGCTCGGGATTAGTGCCTCGGCCGACGCCCAAATCAGAGAATGGTTAGATCAGACCTTACCGTGCATCAGCATAAACAACAAGGAACTCATGATGAAGATACTGGATCCATCCTTGATTGTGGACGAGGATCTATTGGAAGAAGTGTGGGCTGTGGCTGTTGTCGCCAAGTCCTGCCTCAATCCGAAACCTTCAAGGCGGCCCTTAATGAAATACATCCACAAGGCTTTGGAAAACCCATTGAAGGTAGTTAGGGAAGAGAATTCAGGCTCAGGACGGTTTAGATCGACTTCCATCGGCAGTTCTTGGAATGCTGCTTTGTTCGGTAGCTGGCGTCAAAGCCTGTCTGATCTAACAGTGCTTCCATCGGCCTCCTTATCAAAAGCAGGCGGGAGCAGTTTCAAAAGATCAGGAACAATGGGTTCACAAGGAAGCGGTCAGAACGGCGGTGGTGAACATTCGTCGTCTCGTCGACAGCATTCGAAGGAGATATTCCCGGAACCGTCGGACGTGCAAGACATTGAAAGATTGGAGAATGAGTAGGCAGAAAGACATTGATTTGGTGTTGATTCTTTGTTAATAACACAGCACAGTTTCAGATTGAGCCCATTTTAGCTTGGTTTTGCAGCAAATGGTGACACAATCACTGTCTTGTTCTACTGTTTTATTGGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGTTCTGTTTTGAGAGCTTGTTTTTTATAAGAACAAGCTGCATTTTTTCTGTAATTGATCATTTGTTTGTTGTAGCTTTTGGAATGTAAATTGTAACTTGTTTTCTTTTTGAGGCCAATTCTCTTTTGTTGGGAAAGGAAAGTTCAGTCTATAAACAAATCATACTTTTGTTTTGCCCTTGGAATTCAATTCTATTTCATCCATTTTTCCTCTAATAAAAAGTTAGCTTCATTCATCACATCACTATATACAAATATCATTTTTAAGTAGAATTTTATTTTGTATTTTTACCCCTTTTTTTTAGTTTTTTTCTTCTAAATTAGTGGCATTTGTCGTGAAAAAAATTTCACTTTAAACTCCCAATTTCATCGAATTTGAACCATCGTTTTAAAAAAGTAATAATAATAATAAAGAAGATCTTTAAAAAAATCATTAATTTAATGAAAATTATATTTGGCATAAAATTAAATTTGATTATTGCTCAAAATGGATTAATGAATNTATTGAAATCACGTGAAATAAAATTTTCAATTACTTTTCAAATGGAAGTTTATCAGAATGTAGAAATTGAAAATTCTGTTCAAGTTTAAGATAAAGTTGCAATATTTTTTCAGACAGGCTACTTTTATCCGAATTTAGACATAATTGGATGAAATTGAACTCACCAATTTTAACCCAAAAAAAAGTGCTACTATTTCTCTTAATCATATCAATTTCATAGCAAATATATACTTTATAATTCATTCAACATAAAAGAAAATACATCTTTCAACAATTTTTTTGACGAAAATTTATTAGAAAGTAAAAACGGAAATGCTTATTTAAGTTTAAGGTAAAGGTTGTTACACTTATTTAAATTTAAGTGTGTATTTGATAAAATTAAAAGTTTATGGTAAAATTTGATATAATATCCCAAGTTTGAGGTAAAAATGATATTTTTCCACAACAAAATTCATATGAAACAAGCCTTATGGTGAAAACATTTTGATGGTTAATTCTTAAAGATTAAAAAAATTAAAATACACTTTTGGTCCATCGACTTTCATTAAAGTAAAAAAT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LTNLTFLQSFNASNLLLPGVVPEWFGQRLGLLRVLDLRSCSIFGSIPLSLGNLNNLTGLYLSDNRLTGTLPSNLGKLFSLSFLDLSHNTFTGMIPPSLESLGNLSLLDLSSNYLAGSIPPGIGSLLKLRYLNLSNNSLSSSIPAQFGGLVSLVDLDLSVNSLSGPLPTDLRKLTSLRSMVFRRNFLVGSLPDTLFRTLTQLQSLVLRSNNFSGSIPDVFWSMPRLKLVDVSGNSLTGMLPNSSSSLNITGAVLNASQNMFYGSLTPILTRFSAIDLSGNYFEGRIPEYLLANLSFVSNCLQNVANQRTLAVCTSFYSARGLTFDNFGLPKATGPTQPPPAEESKKSSRNAIILGSVIGGSALILLLVLLILFFLWRRKRSTTNQRGGGGVVGPVLSGDAEPPPELSINFSSLGEAFKFQQLLQATNDFSNLNLIKRGHSGDLFHGVLQNGIRVVIKRVNLRTIKNDAYLVELEFFSKVSHVRLVPLVGHCLENEDEKFLVYKYLPNGDLSSSLFKEVKADDDSLQSLDWITRLKIALGAAEGLSFLHHDCTPPLGLEPKVVHRDVKSSNILLDRKWNAKVSDFGLAKLLQPEATYVTTRVMGTFGYVSPEYASTGMLNEGSDVYSFGVLLMEIITGRSPIDYS Homology
BLAST of MS022079 vs. NCBI nr
Match: XP_022136042.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1106.7 bits (2861), Expect = 0.0e+00 Identity = 579/646 (89.63%), Postives = 599/646 (92.72%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. NCBI nr
Match: XP_038887953.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 894.8 bits (2311), Expect = 4.3e-256 Identity = 479/648 (73.92%), Postives = 537/648 (82.87%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. NCBI nr
Match: XP_008447027.1 (PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 889.0 bits (2296), Expect = 2.4e-254 Identity = 476/648 (73.46%), Postives = 529/648 (81.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. NCBI nr
Match: KAA0036193.1 (putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK19737.1 putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 886.3 bits (2289), Expect = 1.5e-253 Identity = 475/648 (73.30%), Postives = 528/648 (81.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. NCBI nr
Match: XP_004149417.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 [Cucumis sativus] >KGN44361.1 hypothetical protein Csa_016082 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 877.9 bits (2267), Expect = 5.5e-251 Identity = 470/648 (72.53%), Postives = 525/648 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGK4 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g16250 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 616.7 bits (1589), Expect = 3.0e-175 Identity = 333/642 (51.87%), Postives = 439/642 (68.38%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42371 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERECTA OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ERECTA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 324.7 bits (831), Expect = 2.3e-87 Identity = 240/681 (35.24%), Postives = 348/681 (51.10%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RZV7 (Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MSP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 317.8 bits (813), Expect = 2.9e-85 Identity = 233/677 (34.42%), Postives = 337/677 (49.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69SP5 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ER1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 7.8e-83 Identity = 231/670 (34.48%), Postives = 343/670 (51.19%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: I1Z695 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ER2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 306.2 bits (783), Expect = 8.6e-82 Identity = 225/672 (33.48%), Postives = 341/672 (50.74%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C4G3 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1106.7 bits (2861), Expect = 0.0e+00 Identity = 579/646 (89.63%), Postives = 599/646 (92.72%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BH20 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489578 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 889.0 bits (2296), Expect = 1.2e-254 Identity = 476/648 (73.46%), Postives = 529/648 (81.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SZY6 (Putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold214G00460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 886.3 bits (2289), Expect = 7.5e-254 Identity = 475/648 (73.30%), Postives = 528/648 (81.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K977 (Protein kinase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G270550 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 877.9 bits (2267), Expect = 2.7e-251 Identity = 470/648 (72.53%), Postives = 525/648 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I513 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471067 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 863.2 bits (2229), Expect = 6.8e-247 Identity = 460/649 (70.88%), Postives = 526/649 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. TAIR 10
Match: AT2G16250.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 616.7 bits (1589), Expect = 2.1e-176 Identity = 333/642 (51.87%), Postives = 439/642 (68.38%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. TAIR 10
Match: AT4G39270.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 526.6 bits (1355), Expect = 2.9e-149 Identity = 307/656 (46.80%), Postives = 412/656 (62.80%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. TAIR 10
Match: AT4G39270.2 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 516.5 bits (1329), Expect = 3.0e-146 Identity = 292/601 (48.59%), Postives = 389/601 (64.73%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. TAIR 10
Match: AT2G26330.1 (Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 324.7 bits (831), Expect = 1.7e-88 Identity = 240/681 (35.24%), Postives = 348/681 (51.10%), Query Frame = 0
BLAST of MS022079 vs. TAIR 10
Match: AT1G34110.1 (Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 1.4e-82 Identity = 219/681 (32.16%), Postives = 335/681 (49.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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