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MS022050 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGACGGATTTCAACGATTACAAATTGCGGTGCGAGCTCACGGGCCATGAAGATGATGTAAGAGCTCAATTACATTCTCTTATTTGATCTGTTAATTGCTTTCTCAGTTATCATCGTTTTCGAATTGCGCGTTTATAGAAGGTAGTGGTTGGGCTAATTCCTGCTGAACTTGATAATTAGGTTCGGGGGATTTGCGTGTGCGGGAATGCGGGGATAGCCTCTTCGTCGAGGGACAAAACTGTGAGGTTTTGGAATTTGGATGGACGCAAGTATGTAGAATCGAAAATCTTGCTGGGGCATACGAGTTTTGTGGGTCCTTTGGTTTGGATTTCGCCGGACGAGGAGTTCCCGGAGGGGGGGATTGTGTCTGGTGGCATGGATACACTCGTCATTGTTTGGGACTTGAGAACGGGTGAGAAGGTTCGGACGCTTCAGGGCCATCAGCAGCAAGTAACTGGCATCGCCTTGGATAATGGTGACATCGTGTCATCCTCTGTTGACTGGTAATTTGATTTCTGAGCTGTGATTGTCCACTGGGTTTCGGAATAAATTTTACAAGGTGTTGCAAAATATAGTCCTTAGAGAATTTGGTGGGTTTTTTTTAGTGTTGATGAAATCTATTGCAATTTGCAACAGACAGAACCCGAATATTGAGGTTCTTGAATGGTAGGATGTTGATCTCATACATCTTCTCTTTTATTTGGAAGGGTTTTTGATATGAGTTTCCTCCTCATAGTTGCCTGTCGACTCGTAGTTGCCTATTGCTAGTTTCAGACTAATATGTCATGTACGGAGTCCTGGAATAGCTGGGTGTTAAAATTACAAAATACCAAGGAAAAAAAAGGATCTATATGGTGGATCTTACACGTTAGTTTCACGTTGCATATTGTTGTTAATGCAATTTATTCGGAGGTATTGAAGTAGAGTACCTAATTGGCTTTTCCTTTTGGAAGAAAACGTTCACACTTGCATATTGTAAGTTATCTTGAAAAGTCATAACATACAAAAAGACTTAACTTGTCCAACATCGAGGGTCTTTAACGACTGAGTGTGAACTGTGAAGAGAAGAAGGTTTTTCTAGAATTTTGCTTTAGATTAAATGAATTGGTACGTGTTGTAGTGTTTTTTTCCATTTAGGTGTCAACAATGGAGTTGGGCTGTTTCTCTTAATTAGTTGCAACTTTAACGATTATCGGCGCTGTGTCATGATACAATTATCTTAGACTATGTATCACTGTGATTTTACTCTCAACAATGAGAAGTTGTAGGGTAAAGCTTGTCTCACCCTCTTTTCAGGAGTTATTTTTGGTTCCATTGTACTGAAAGTTATTCCTTCAAATCAAGCCACTTATCTTCTACTCGATGGAAGCTTGAGTATTCTACATGCACGATCACTCTCTTGCCCGCTCTTGGCTTTGTTTAAAACTTATGCTCACAACTCCAATGAAATTGTTTCTTGTCCACACACACACAAAAATTCATTTATATATAATTTCACTAATCTTTTTACTGTCAACAATTGCAACTTCTTTTTTTGTTTTGCCGGCTCTTGTTCGGGCGGTTTATTTTGTTTGTAGGCAGTATCTTTTGTATTTTCATTCATCATTAATTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTAAAATTTTAAAGGAAAATAGCAGATAGCCATCTAATGATGTTGAACATTGTCATTCATCATTAATAAAAGTTGGTTTATATTGTAGCTATTTCTGAGTATGAACTTAACAATTCTTTTTGTAGTTATGGTACTACCATGCGTTGTACCCATTGGAAGACTTCATATGTAACTTCCCCAGTTTCATTTGATGCTTTCATTTATCAATGAAATTTTTGTTTCTTAAAAAATAATAATTACAGCCTTGTAAATTTCAATGCCATTGGAATCTTTTGGTAGTTGGGGGCTGGTTTGGGGATGTCTTTTCCCCCTCCTTTGTATCTCGTTCTTTTGACAATGAAATTCTCCGTGTCTTATAAAAAAAATAATAAAAATAAACATGCATGCTTGTACACAGTTCTAATTTTGATTTAGCCTTCATCGAAACTGAAGCTGATTTTCAATTGGTGCACAAATCTTTTTGATGTAGTTTTGCAGCCTAGTGTTTGAGGAACTTGAAAACCATCTTGCTTTGAGACACTCTAATTGCATTGTTCTAATTTATAAGACAAAATGTGTGATATTGGCTCTTTAACTCCAGTACATTAAGGAGATGGAGAAATGGCAAAGTGATGGAGTTTTGGGGTGCTCATAATGCTGCCATTCAATCAGTTATAAAGCTTCCATCAGGCGAGCTGGTCTCAGGTACCACTTCAAATGGGGACTGGAGTTGTAGTTACCATAGAATTTAGATTAACTTTTTCCTCATTCTGCCTTCGTATATGATGGTTTCAAATATGAGTGCTTTCACTGTGATTGAGGCTTTGAGCCTTGTTTTGTTAGAGTGGCATTTATGTTGCATTTCAAACTGTAATATTTTGGTAACAATTTACATATTGTTGGACTTTGTTCTTTGATTCTTCCTCATGACAGTTTCATTCTAATGATATAGGTTATTTTACTTTGTTAGTCTTATGTATGGCCATGGGCAAATGCAAAAGTATTTGGCTTTCATCTTAGGCTCTGATTGTATTATATTTTCCCTGTTCTTGTCTAGGTTCAAGTGATGCAAGTTTGAAGCTTTGGAGAGGGAAAACATGTTTAAAGACTTTTTCAGGACATACAGGTTTAGTCTCCCCCCCTGTGTGCATGCATATGCATTTAATTTTTAAGTTGCAAGTGGTGGATTATTATTTGGAATTATGGTATCTTCATTTTCTTCTTGTATATAATTTTTATATTTTTATGATGGTGAGTAAATTGATTAAACTTGATATTTTCATATAAAGTGTGATGTATGGCTTTGCACCAGATTTTGGATTTGAAGGTTAGAGGTTTAAATGCAGGAATGTTATAAGGGTTTCTCAAGGGGTATTTAATCTGATGTTTTTTAATTACCAAGACTTAATCTAAAATCATGTGTTTATTTTTAAACTTGATTTTTTTATTTTGATTATTTTTATTTTTAAAGTTGACTTGGCTCCACTGTTTCAGTTATTACAAATTGTACCAATTCCATTCCTCATTCACATATAAACTACAAATTTACTTCTTATTCCTTCTAATTTATCGTAATAAGTAACTATTGTGTTGGGACATGAAGCTAAATGTGAAAGATCAATTCTAGAAGTGACTATTTCATATCTGGAAATTTTGGTTAAGAAATCCTGCCGTCACAACCTACCTTTCTTCAGTCTTATATAAACTCATGATCTCCGAAATCTTCAAAATTCGTCTTTAACTTGGATTGTAGGGCATTTCCTTTGTCCTTTAGGTTGTTCTTTGGTTGGCTTTGGCTGTTATTTTGAATGAATCTCCAGTTTATCAATAAAAAAAAATATTCTTCAGTGGATTGTGGACAAAAATAGAGTATATTTTATTTCACTTTTCAGCCCGTGATATAATTTTATCAATTGATGAATTTTTCTACATTTCTTGTTTATACTTTTGTTAGCAGGAAAACATGTTCTCATGCCTTGTATTTATTTCTGCAGATACGGTCCGAGGTTTGTCAGTGATGTCTGATATGGGAGTGCTCTCTGCATCTCATGATGGGTAAATCTATACCTATTTATCAGTGTATACTCTTATACTTTTTAATAATTTTACTATTTTTATTCTTGCTTAAATATGAATTCTGTCTTTGGGATATAATTTTATTTATGGAGGACTTACTTGTCGTTGTCTGTCTAATTAGTGGATTGAATAATTGAAAAATCCATTGGTATCATGCTAGATTATCATACTAAAAGACTGCACCTTTCGAAGATACAATATAACTCTTTTTTCTTTTCAGAACAATGTTTTCAGTTAAATGAGCACTGAAAGTAAATTTCTAGTTTCAATTGTTTGCTTCAAAATAAAGACACGTGTCTTGAGTAGAGTTCAACTTTAACATGAGTAGTACACTGTTGTATCATAGCCGAAGGATAGAATGTTGGAATACAAGTCATTATCATAAAGTTAGAGTACCAACAAAGTCAACTATTCTCTCTTGCTTCCTCTCTCGTTTCCCTCCCTCTAAACTGTTAAAATTGAGGCTAAATGATACAGTTTAGGAGTTGAAGCATGGAAAATAACTAATCTTCCATTAGTTTTGTATTTTGTTCCTGGGTTTTGAGTTCAAATTGGAGGAGGAGAGAGTTCTCATTTTATTTTTTATTTTTGTAATAGATTGTTTCAAAAGCAGGTGAAATGGCTGGAATGGTCTTTAGTAGAGCTTTTTCAATGCCCTTGAATTCCAAAATTTTCAAGAAGTTAAGTTTTGATAGGGTATGATTTTGCTGGAAAAAAAGGTGGACCAACAGAGTTGTTTGATGTTTTTTTTTTACTAGAAATGGGGAATGTAGTTCTATGTTGGAGGAGGTCTTTGGGTTGGATCTCGTGGCATGCTATCATTTTTTGAAGTTTTGTTGGGGACTTTTGATAGAGAGAAATAATAGGATCTTTTAATGGTTTCAAGAGATGTTGTAGGATGTTCTCTTGTAGGATGTTCCATCTCTTGCCAGGTTTAATACTTCTCTTTGGGCATCAGTCTCCAAAGATTTTTATAATTATTCATTGGGTCTTATTTTCTTGGATTGGAGCCATTTTCTACACAGTTATTTGCATGTTGGTGGCATCGTTTTTTTGGGTTTGTCTCTAGGATCACAAAATTTTTTGGTTAGAGCCAAAGGACTGATTTCTGGGTGGAATAGCTGAAAAGGGAGAGCTTGATTGAGCAATGTGGATCCAATTCAATTTTAACTCTGGGAAAAATCACATGCAAAGGCTACTGGTGATTGAGCAGGCTAGAACGAGATAGCCCATATCCTCTTCTGCATGCTTACAAAGGACGCACCAGTTCGGAAAGATGGCCATAGTCGAGAACTCTTGTGGTTATG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METDFNDYKLRCELTGHEDDVRGICVCGNAGIASSSRDKTVRFWNLDGRKYVESKILLGHTSFVGPLVWISPDEEFPEGGIVSGGMDTLVIVWDLRTGEKVRTLQGHQQQVTGIALDNGDIVSSSVDCTLRRWRNGKVMEFWGAHNAAIQSVIKLPSGELVSGSSDASLKLWRGKTCLKTFSGHTDTVRGLSVMSDMGVLSASHDGSIRLWALSGQTLMEMVGHTSIVYSVDSHASGLIVSGSEDCSAKIWKDGFCVQSIEHPGCVWDAKFLENGDIVTACSDGVVRVWTAVQERIAEPEELESFASSLSQKRVGGLKLEELPGMEALQIPGTSNGQTKVIREGDNGVAYSWNSKDYKWDKIGEVVDGPDDNGRNHVLDGVEYDYVFDVDIGDGEPIRKLPYNLADDPYTTADKWLIKENLPLAYRQQVVDFIFQNSGKKNFVLDSSFRDPYTGSSAYVPGGPSNASAESNKPIFKHIPKKGVLVFDVAQFDGILKKIVEFNNVLLADPGKKNCALPELEVSRLGAIAKILKDTSHYHSTKFADADIVLLLKLLRSWPRESLFPVIDILRMTVLHPDGAILLLKLVGSDDILLELIQKVTTTPVIAANLLTSIRLMVNLFKNSGYYNWLQKHRSEILDAFSSSYSSANKAVQLSFSTLILNFAVLLIEKKDLDGLGQVLSAALEIAEEENLEADSKFRALVAIGSMMLEGGDDVKRTALDFDVQSIARKAKTSKDSKIAEVGADIELLTK Homology
BLAST of MS022050 vs. NCBI nr
Match: XP_022136219.1 (phospholipase A-2-activating protein [Momordica charantia] >XP_022136220.1 phospholipase A-2-activating protein [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1485.7 bits (3845), Expect = 0.0e+00 Identity = 747/755 (98.94%), Postives = 749/755 (99.21%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. NCBI nr
Match: XP_038887808.1 (phospholipase A-2-activating protein [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1367.4 bits (3538), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/755 (90.73%), Postives = 709/755 (93.91%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. NCBI nr
Match: XP_031744253.1 (phospholipase A-2-activating protein isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8645890.1 hypothetical protein Csa_017692 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1360.1 bits (3519), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/755 (90.07%), Postives = 708/755 (93.77%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. NCBI nr
Match: XP_008454875.1 (PREDICTED: phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo] >KAA0031249.1 phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1350.1 bits (3493), Expect = 0.0e+00 Identity = 673/755 (89.14%), Postives = 704/755 (93.25%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. NCBI nr
Match: KAG6588627.1 (Phospholipase A-2-activating protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1331.2 bits (3444), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/755 (87.42%), Postives = 702/755 (92.98%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P54319 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Plaa PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 391.3 bits (1004), Expect = 2.4e-107 Identity = 263/792 (33.21%), Postives = 404/792 (51.01%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P27612 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Mus musculus OX=10090 GN=Plaa PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 391.0 bits (1003), Expect = 3.1e-107 Identity = 264/799 (33.04%), Postives = 408/799 (51.06%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y263 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLAA PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 1.8e-102 Identity = 257/792 (32.45%), Postives = 400/792 (50.51%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6GM65 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=plaa PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 3.0e-102 Identity = 254/779 (32.61%), Postives = 394/779 (50.58%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O94289 (Ubiquitin homeostasis protein lub1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=lub1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 315.5 bits (807), Expect = 1.7e-84 Identity = 217/713 (30.43%), Postives = 364/713 (51.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C3A1 (phospholipase A-2-activating protein OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007968 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1485.7 bits (3845), Expect = 0.0e+00 Identity = 747/755 (98.94%), Postives = 749/755 (99.21%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SPK0 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold139G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1350.1 bits (3493), Expect = 0.0e+00 Identity = 673/755 (89.14%), Postives = 704/755 (93.25%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C0S7 (phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495187 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1350.1 bits (3493), Expect = 0.0e+00 Identity = 673/755 (89.14%), Postives = 704/755 (93.25%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZ65 (phospholipase A-2-activating protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437774 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1329.7 bits (3440), Expect = 0.0e+00 Identity = 658/755 (87.15%), Postives = 703/755 (93.11%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C5T3 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold13G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1317.0 bits (3407), Expect = 0.0e+00 Identity = 661/755 (87.55%), Postives = 692/755 (91.66%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. TAIR 10
Match: AT3G18860.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 1047.7 bits (2708), Expect = 4.3e-306 Identity = 510/759 (67.19%), Postives = 627/759 (82.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. TAIR 10
Match: AT3G18860.2 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 1045.8 bits (2703), Expect = 1.7e-305 Identity = 509/759 (67.06%), Postives = 626/759 (82.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 1.4e-25 Identity = 81/254 (31.89%), Postives = 128/254 (50.39%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. TAIR 10
Match: AT4G02730.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 2.6e-16 Identity = 76/235 (32.34%), Postives = 110/235 (46.81%), Query Frame = 0
BLAST of MS022050 vs. TAIR 10
Match: AT1G21651.1 (zinc ion binding ) HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 4.4e-16 Identity = 83/312 (26.60%), Postives = 140/312 (44.87%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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