MS020006 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACCTCAGCTCGAACATACTTGTGGGATCGATCCCAGCTGGAATTGGGAATCTTACGATTCTTAAAGAGCTTGGTCTTCATGATAATCAACTAAGCGGTCAAATTCCCAGAAGCATAGGAAACTTGAAGCTGCTCGAGCTCATTAGAGCTGGTGGGAACAGAGACATCGAAGGCAATATACCTCTAGAAATTGGGAACTGCACCAATTTGGTTTATGTAGGCTTCGCTGAGACCAGAATTTCAGGCTCTCTCCCACCAAGCTTAGGCCTCCTCAAGAAGCTTAAAACACTCGCATTCTACACAACCCTTCTCTCTGGCAAAGTTCCTCCTGAAATTGGAAACTGCAGTGAGCTCCAATACCTGTTCCTCTACGAGACGTCGCTCACAGGTTCGATTCCAACCAGCTTCGGAAATCTCCAAAACCTGCTAAATCTGTTTCTATATAGGAACAGGTTGACGGGCACGTTGCCAGAGGAGCTTGGAAACTGTTACCAATTATTGGATATTGACATTTCAATGAATTCTTTGACGGGAAGCATTCCAATCACATTTGGTAACTTGACTTTTCTACAAGAACTAAATTTGGGCATGAATAATATTTCAGGCGAGGTGCCCGCAAATATTGGAAATTGGACGGAACTTACTCATTTGATGCTCGACAACAATCAAATCACGGGTTTGATACCTTCGGAACTAGGAAATTTGAAGAATTTGAGAATGTTGTTCTTGTGGCATAACAAGCTCGAGGGAAGTATCCCGTCCTCAATTTCCAACTGCGAGATTCTTGAGGAGGTGGATTTATCGGTAAACGGATTGACGGGTCACATTCCTGGAGAAATTTTCCACCTTAAGAAGCTAAATAGCCTCATGCTCCTCTCCAACAATCTTTTGGGCGTCATACCTCCAGACATCGGCAATTGCTCATCGCTAAATCGTTTCAGAGTCAACAATAACATGCTCTTCGGCGCTCTCCCACCACAGATTGGGAATTTGAATAATCTGAGTTTCTTGGACCTCGGAGAGAATCGGCTCACTGGAGAAATACCTGATGAGATTTCTGGCTGCAAGAATCTAACATTCATCGATATACACTCCAACTCCATTAGTGGAGCTTTACCCTCAGGTCTCGACCAACTTATTTACCTTCAAATAATTGACTTCTCAAATAATCTAATTGAAGGGAATATAGATGCTGGTCTCGGACTGTTAAGTTCACTCACCAAACTCATCCTGTACAACAATCGATTTTCCGGCCCAATCCCGAATGAGCTCGGCTCCTGCTTGAAATTACAGTTGTTGGACCTCAGCGCTAATCAACTTTCTGGTAATCTCCCGTGGAAGTTGGGAGACATTCCAGCACTGGAAATCGCCTTAAACCTAAGCTGGAACCAACTCAATGGCGAGATACCGAGTGAGTTCGCCTATCTAGACAGACTCGGAATCTTGGATCTCTCACACAACCACCTGAGCGGCGACCTCCAAACCATCGCCGTCATGCAAAATCTCGTGGTACTCAACGTCTCCGACAACAATTTCTCAGGCCGAGTGCCGGAGACTTCCTTCTTCAAAAAACTCCCTCCGAGCGTCCTCTCCGGCAATCCGAACCTCTGCTACGGCAGCATATGCACCGATGAAAGGGAAGGAAGAAACTCAAGGCGAGAGTCAGCGCCTCGCGTGGCGGTGGTGGTGCTACTGTGCATAGCTTGCACGCTTCTCATGGCGGCACTTTACATCGCCTTCGGATCGAAAAAAATGGCCGAAAGACGCTTCTACGGGGACCACGACGGTGACGGCGTTGATAGCGATTTGGAGATTGGCCATGAACTTGATTGGGAGATGACGCTCTATCAGAAACTCGACCTATCAATTTCTGACGTGGCAAAGAAGCTTACAGCTGGCAACATCCTCGGTCGTGGCCGATCTGGCGTCGTTTACCAGGTCAACATCCCACCCGGTGTAACAATCGCCGTCAAACGGTTCAAGACATCGGAGAAGTTCGCCGCCGCCGCATTCTCCTCCGAAATCTCCACTCTAGCCAATATCCGGCACCGGAATATCATCCGATTACTCGGCTGGGCGGCGAATCGGAAAACGAAACTGCTATTCTATGACTATTGGCCACATGGAAACCTTGGCGATCTGTTACACGAGCGATGCGCCGGCGGATATGTCATCGATTGGGACGCTCGGTTCAAGATCGCGATCGGAGTGGCGGACGGGTTGGCTTACTTGCATCACGATTGCGTGCCGGCGATCTCGCACCGAGACGTGAAGGTCCAAAATATACTGCTGAGCGATGAATACGACGCATGCCTTACAGATTTTGGATTCGCCAGGTTCATTGAAGACGATCTTAACGACTCCTCGTCGGCCAATCCGCTATTCGTCGGATCTTATGGCTACATCGCACCAGGTGAGTACGATTTTCAGATAACAATCAAATTTAACCCTAACTTTTGGCTAATGTTGATTTTATTGACAGAGTATGGCCGTATGCTGAAAGTAACAGAGAAGAGCGATGTGTATAGTTACGGAATCGTGCTTTTAGAGATGATTACTGGTAAAAAGCCAGCAGATCCTTCGTTTGCAGAAGGTCAACACATAATCGAATGGGTCCGACAGCATCTATACAGCAAGAACAACCCAATCGAGCTTTTGGATCCAAATCTAAAAGTCGATCCCGACGCCGAAATCCAAGAAATGCTTCAGGTGCTGGAAATCGCGCTTCTCTGCACCAACAATCGCGCGGATGATCGCCCTACAATGAAGGACATCGCTGCATTACTGAGAGTAATTCAAACCGAGTCGAGGATGAAGATCAATGGCAAGAAACCTGGTAATGGGTTAAAGAGACTAGAAATTCAGTCGTATTTGTCGTCTTCTTTGGCCTCGACTCGGCTGCAACTTCTTCAATGCGACAACTCTCGCTGCTCGTTTGCTCACTCGTCTTCCTCCGGTTATCCCCATCGTTCGGTAACCTAATTTCAGGCTTCGCGCCATAAAAATTGTTTTTAAAAAATGTTAATGCTATATTTATCTGTTGTTAACTTGTTTGAGAATAGAATGACTCCAGAACTTTTTGAAAATTTTGACTTAAGAATGATACGACGATGACAATAAGTATCTTATTTTAATGTGAAAAAAATATGGTTGATCATATATGATGGATGTATTTATCTTATTTTAACGTGAAAAAAATATGGTTGATCATATATGATGGATGTATTTTTTTTATATAGTAAGATGATTAATATAGACTTTGTCAAAAATATGATATGATATTTTCTATTTTTGACATAATTAGTCTCAATCCTTAATTATATACCAATAATCTTCCCCTAAAACGAGAGGAAAAAAATGGAAGGAAAAAAAAAAAAAAGTCGCGTAGGAATGGCGAAGAAATGGAGCAGCAGCACGCGAGCGGCATATCAGATTTGCCTCTGCCCTGCTTTAATCTTCCACTACTTTTGATGCTTCACCACTTCAAACAAACACCAATTTCTTTCCACTCTCTCCACCATCCGAATCTGTGTACTTCTTCTGCACCATTCTGATTACTCTTTTTCATCAATTTTTAACCACCTTTTTATTATAAAACTACCTCTAATCCAATTCCCCATAAACTTTAATCTCCACCAATGCTGTGATTTGTTCACAAATTTCTTGGGCTTCCCGCTCCTCACGTGCTTCTTTTTAAAAGAATAACATTTACACGTTTGTAGGTTAGTATCTATCTTTCAAAGTTTAATGGTAGTTGGTAAAATATAGATGTTGACTAATAAGTATTTAAGTATTTTTCATTTTGTAATTACTAATAAAAACCTATTTCAACTTTACTCTCACAATTCTGATTAATTTCTATATATGAGGTCCAGAAGAGACCAATGTTAGGTGCTTTGAGTTATCTTTAATGCATTTTAAACTAATTTTTTCTTTTAAATGTCTATTTTTTTTACCAACAGTTAATACAATTTTGTCTTTTACAAGGTCGAAATTCTATATCATATTATCATATTTGTTGTATTTCGAAGGCATTTACTATAGCAATTGGAGGAGGGAAGCATAGGGAAGAGACCACAACCTTCTAATTCTTTGTATTTCCACTCCAATAGTTACAAAATTCCATATCCTCTATGATTAACATTATGAAAAAAAAACAAAACAAACCATAAAAGTGAAACCAGGAGAAAGGAAAAAAAAATTATACATTACATTCTATCCTACAAGCTTTTTTCAATATTATTACAACTTAATTTTTGTTTTCATGGGCATTTTACATTCCTCCCAGGACCTCCATAGTAAAAATAAGTGCCCCAAACATTATTGTTGCCTTGTCTTATATCATAGCAATCAGAATGGTCAGCCAAGAGATGAAGATTTGTTAGAGGAAGCAAATTATTGTCCCAATCAACCACTTGGAGGTTCCTGAAATATGAAGCTTTTCCAAAGCCTTCTTCTGCAAAATGGCCACTCCCCATTTGAGTGGCTGTGTGGAACCCTGATGATCTGCTGTTCACTATCTCCCCTCCAAACTGCACCATGCTCCCATGGCTCCTTAAATGGCTGAACAGAAACGCCGGCCAGTACCCGACTAGCAGACCCGACCCGTATTCCAACCACCAGTGCCCGTGCTTCGGGTCCTGTCCACAAACAAGAAAAACTTTTGGGTTGAGTAAATTTAAGGATGAATAAACCATCACTCAACCCAATTTAAACGGATGAGTTGAGTAAATTTAATTCATATATGGATATCTCAACAATTACCGTGGCATAATTAGATGCATTGAGATTGGAAAAAGGTCCGTCACTTAATATCTATTTATTCAATACCCACCTCCAACTTATGCGTATATGTTATTAACTTTTTGAAAGTAAAATAAACTTACCTTCCAAACCATTAAACCAATATCGAATTGTTTGCCATTATAAGAGGAGATGGGGGAGATTGCTGCTCCAATGGCGATCTTGTTGTTAGTTTGAACAAAGCCAGA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Homology
BLAST of MS020006 vs. NCBI nr
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BLAST of MS020006 vs. NCBI nr
Match: XP_038895914.1 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1459.1 bits (3776), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/841 (86.44%), Postives = 764/841 (90.84%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. NCBI nr
Match: XP_023542226.1 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1441.8 bits (3731), Expect = 0.0e+00 Identity = 719/841 (85.49%), Postives = 762/841 (90.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. NCBI nr
Match: KAG6573074.1 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1440.6 bits (3728), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/841 (85.26%), Postives = 762/841 (90.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. NCBI nr
Match: XP_022994119.1 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1439.9 bits (3726), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/841 (85.26%), Postives = 762/841 (90.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4K6B8 (Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RGI4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 1.6e-234 Identity = 419/847 (49.47%), Postives = 557/847 (65.76%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGR3 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RGI3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 812.0 bits (2096), Expect = 1.0e-233 Identity = 418/847 (49.35%), Postives = 562/847 (66.35%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LHP4 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RGI1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 756.5 bits (1952), Expect = 5.0e-217 Identity = 396/851 (46.53%), Postives = 530/851 (62.28%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGV1 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RGI2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 733.8 bits (1893), Expect = 3.5e-210 Identity = 387/860 (45.00%), Postives = 537/860 (62.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGF5 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RGI5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 677.6 bits (1747), Expect = 3.0e-193 Identity = 374/921 (40.61%), Postives = 529/921 (57.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C6J9 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008872 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1634.4 bits (4231), Expect = 0.0e+00 Identity = 816/841 (97.03%), Postives = 816/841 (97.03%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K210 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489949 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1439.9 bits (3726), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/841 (85.26%), Postives = 762/841 (90.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GU55 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457146 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1436.4 bits (3717), Expect = 0.0e+00 Identity = 718/843 (85.17%), Postives = 763/843 (90.51%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQY8 (Protein kinase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G046270 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1424.5 bits (3686), Expect = 0.0e+00 Identity = 706/841 (83.95%), Postives = 760/841 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UKZ0 (Putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold80G00890 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1422.9 bits (3682), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/841 (84.07%), Postives = 758/841 (90.13%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. TAIR 10
Match: AT5G56040.1 (Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 817.8 bits (2111), Expect = 1.3e-236 Identity = 415/821 (50.55%), Postives = 554/821 (67.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. TAIR 10
Match: AT5G56040.2 (Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 1.1e-235 Identity = 419/847 (49.47%), Postives = 557/847 (65.76%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. TAIR 10
Match: AT4G26540.1 (Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 812.0 bits (2096), Expect = 7.1e-235 Identity = 418/847 (49.35%), Postives = 562/847 (66.35%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. TAIR 10
Match: AT3G24240.1 (Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 756.5 bits (1952), Expect = 3.6e-218 Identity = 396/851 (46.53%), Postives = 530/851 (62.28%), Query Frame = 0
BLAST of MS020006 vs. TAIR 10
Match: AT5G48940.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 733.8 bits (1893), Expect = 2.5e-211 Identity = 387/860 (45.00%), Postives = 537/860 (62.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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