MS019670 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGATGGGGCAGGTATTGAACCTGATGTGGTTTCTTATAACATATTGATTGATGGATGCATACTGGTCGACGATAGTGCAGGAGCTCTTGCCTTCTTTAATGAGATGCGGTCGAAAGGAATAGCACCCACCAAGGTTAGTTACACCACTCTGATGAAAGCTTTTGCTCAGTCAGGTCAGCCAAAGCTGGCGAGGAAAGTATTTGATGAAATGCTGAATGATCCTAGGGTGAAAGCTGATATAGTAGCCTGGAATATGTTGATTGAAGGGTATTGTAGACTAGGATTGATAGAAGAAGCAAAGCAATTAGTTCAGAAAATGAAAGAGAGTGGATTTTTCCCAGATGTTTCTACATATGGAAGTCTTGCCAATGGAATTTCTTTAGCTAGAAAACCAGGTGAAGCCCTTCTGCTATGGAATGAAGTAAAGGAGAGATGTGCAGTGAAGGGAGGAAACAAGCCTGATTCTTCGTCTCCCCCTCCCTTGAAACCAGATGAAGGACTGTTGGATACTCTGGCTGATATATGTGTCCGGGCTGCTTTTTTTAGGAAGGCTTTAGAAATTGTGGCTTGCATGGAAGAGAATGGGATACCACCCAATAAGACAAAGTACAGTAGAATTTATGTTGAAATGCATTCTAGGATGTTTACTAGTAAACATGCATCAAAGGCCAGACAGGACAGAAGGATTGAGAGGAAGAGAGCAGCAGAGGCTTTCAAGTTTTGGTTGGGTTTGCCCAATTCTTATTATGGGAGTGAGTGGAGATTGGATCCCTTAGATCGTGATGATTAAGGTTTCAGATCATTTCAACTGATGGTCGGTCATTCACTGTCTTCTACCTCAACTATTCAGTAGGTCACTACAATACATTGTCAAGGACTCCAATAGAAAATAATGGGAAAAAGTAAAGACGAAAAACTCAAAATTTTTATAGTGCATATGTGATTTTGTAGAAGTTTTCTGAGGGAAGATAATACATTGGGCTACATAGTGCCAAAAAAAAAAGTGCTTATATGTATATGTTACCTGTGCGTGTCTAAACTAGTTTGTTACACTTGGTGACCATCCTAATTTGGCTATATGACCTGAAAGTTATTTGAATTTACAATTTATCTCAAGGGAACAACAATGCCCGAACTGTAAAGCTATAATTAATTATCAAGCCAGACAGCATCCCTTTTGTACCATTTAAATATTTCGTTCATTGGAACGTACTATACAACTATTTCAGCATCAACCAAAAATACATGCTTTGTATAGTGGAAGAGCCACTTCTAGCCTAGAGATATTGTGAGAGGAAAATTAATGAGTTGAAAAAGATTGACCTCTCAATATCGCCAATTTTAACCCCTTGACCTTGATGATTGACTGGTGTAAGAGGAGGACAACACCTGTTTGGGAATGTATGGGTCAGTGCAAAGATTTGATAATGATTTGGTTATTTAACTGGTTTTACAGTTGTTATGAGAATTATCCACTACCTGATATGTCTTTGGCCCCTTCTTAAGCAGATATCCAACACTGTTAAGATTTTCTATAAAGGTGTCAATATCAGGTACTCGTAGACCGATCCTATCAGCCAAGCTATATATTTCCTGCAGGACATCGAATATATGGATGGCTCAAAGCCGAAAGCAATTAGTTGTAACTGCGACAAAAATGTGTAGCTTTAGCTTACTGAGATTGAGAAAAAATCTTTCTGCTGCAACTCCGTTTGCTTGTTGAGTGCACTCAGAAATCGCTTGGCTTCTTTCTGTCGACTCATTCCCCCACTTCGACCAAAATCCAGGACCCCATGTTCATCTACGTACTTATCATAAAGGGATTCCTTCATTATTTCTACCACATCCTGCAAAGTAAATGACCCAGATATGAAATAAGCAATTTAGCACTTAAAAACCCGTGCAAGGTAGTGAAACAGGGTTGTATTTCATAGGAATCGTATACAAATTTGTTTTTAAAAATTAAGCTACCTACCAACGATATTTATATTTTTAACTAATTAAATAAAAGAGGTTTTTGGAATTCTAACCTAACCACATGTTAGAAATTATAAAAAGTAGCACTTTCTTTCCACGGCCCTTTTCGTTTTTAAAAAATGTTCTTCAAAAGAGGAAAAACAAAAGAAAAGTTAGTAATAAACGAGCTTAATTTTTAAAAACAAAGCCATTTTCGAGTCGGAGAAATCAAAATTTGGGTACATAAGTCTATAACTAACCATGGCATCTTGTACTGCAATTTCTTCTCTAAGGTCTACCCGTGCTCGAGCTTCTGCCAGCCTCACCAGACTTTCCAGTTGCCTTGCTGTAATCGGTGTACCATCCCCTGATGTATTCTGGTCTCGTAGTCGTAAGTAAAATTTCTGCAAGATGTCTGCTGCTGGCTTTGACATTCTAATTCCAACAAGAGATGGGTTTGGATAGATTACGAGAAAAGAGGCTTGCACGGTTCGGAAGTAGAGATTTGCATCAAATAAAATGGTAGAGAGAGCATGTAAGTTTACCTGGGGAACACAAAGGTTCTTGCATAGGCTATATATTTTCGAAGAAGTTGGCCAGGTAATGGCACAAAATCGCCATCTTTCGCTCGGTCCAATCTCAGTCTTGAAACTAAAGACTCGCGTCTTGAACAAGCATCTCCGTTTCCAACATTCTCCATTGCTGCCTTCTTTGAAGCCAACGGGGATATATCTGGTTCGAGAGAAACTCCTTCCTCAGTGGAAAATTGAGCGTAAAAAGAAAAAGGAATAGATATGAAATAAGACGGAAACCTTTACGTAGTCTTTTTGCTGCAGAGGCGCGTTCCCCATATCCAGCATGAAGCTGCAAAGAAATAGAATTCCATCAAATCCTACCAAGTTACAACATGTTGCGAATTGGGCGAACTCGAACAATTTGTTGTTTGTTCAACAAATCTTATACATATTCACACTTGATATAGATGCCAAAATATGAGACATCCTTATTCCTTAATTTCTTCAAGTACATTGCTTCATTTCCCTTGTATTCTTCTGTTCGAAAGTCTTACTGGTATCAGAGCGGACGTATCATGAATTGTTTACTAACGTCATTTCTTTCATGTCAAGCTAACAGTAAAGGTAACTTCATGATTGGAATGTTCTTTCACCCTCTCATGGAGCTGCCCAAGAGCACGTTCTCAGTAGTTCTAAGTTCCAACTAAATTAGACAGGGTAACAAGAGAGATTGCCGTAGCATAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGCAGAAGTATAACTTACCGACATGATGTGCTCCGAGACTCTCTTATCCAGAAGTTCGTCCGGTTTATCCAGCAATATGAAAACTAAATCAAATCTCGAGAGAAGAGGGGCACTCATCTTCAAGTTCTCATTCACAGTTTTTGACCGGCTGCAAGTTTTATTTTTAGAATTAATAAATACCACCGGTATAAAAGAACAGTCACAATTTGTAGTTAGATACCGTATTTTCCCTTTACCGTAATAGTTCCTATCATTACCATTCATTTGGACTGGACTAGAAGAACTGAATTATGGTTCCTTGGAAAAGGGGAACATAGAAATTTTCCTCTAGAAACAATACTCTATAAATAGAAAACGGGAAAATGTCGACTTCCTATTTTGAAGAAGGGCTATGAAAGAGACCCAATCATATAGATGTTTATTAGTCACGAAATCAAATAGCCAGTCACAAAAGCAAATGATTGAAACGAGTACATTTATGAACAACTAAATTTACTTGTAATGACCACCAACAGGGTTAGCTGCTGCTAAAACAGAAGTGCGTGCTGATAGACTTGCTACCAGTCCAGCTTTTGCAATAGATACACATTGTTGTTCCATGGCTTCCAGTAGGGCCTGCAATAATCTAACGTAAGAAAATATAGCCACGAAAAGTGAAGAGTTCAGGTGAAATGTAGGTATCAGTTCAAAAACCTGATGTTCTGCAGACATTTTATCAAACTCGTCTATACAGCATAATCCACCATCTGCAAGTACCATAGCCCCTGTGAAAAAAGTAAATTATCAATCAAGGGGAAACCAATATGTTTACTATCATGCGCTTTCAACGTAGAAGCATTTGAGCACCATTAAGTATCGGCTGAGATATAAGTTTTTAAGAATCGGATGAGTTTTCATAAAGAACGCACTCCAACCAGCGAAGTTCTATGTCATTATAGGCCATCGAAAATTTAGATCCAATGCCGTTCTACTGTAATCAACTTGTGAAATCTATACATGCAATCAAATTGTGAAATCTATACATGCAATAAGCCCTTGAAAGATTTGAGCTATGTTATAACTAGTATAGGAATAAGCATCTGCCAGTTCCCAAATGTAAGAACTTATTCAATACTGAGCAATCAAGAAATAAAAAAGGAACGCCTGAAATCTATGAAATACTTTCAAATTCATCAAAGCAGCCACTACAATTTGTTTCAAAGATAAAAACGAGAGGATCACGACAAGTATAATAAGTAATTCTTCAAATTTGAAAGATAGGAAATGTCGTGATAATTTTTTTAAAAGAAGACAGCTACCGGCCTCAAACGCATAGTCATTTGTCATGGAATCCTTCACAACAGCTACAGTTAGGCCCGCCTTGGTTGTTGCATTACCACAAACATAAATGCCACGTGGAGAAACAGCTGCAGCCGCTTGTAGTAACTGACTTTTGCCCAGTCCAGGATCACCTGAGAAATTGACAATGAAAAATCATCATTTTGTTCATTGATCACACCATTCTTTCCAAAATAACTGAGCATGGAAAGAGAACGAATATAGAAACATACCAACAACTATGACATGAATATCCCCTCTAACAGGAACTTTATTCTGATCTTTTGAATGCTTTCGTACACCACCAAATAGTGCTAGTGTTATTCCCGCTTTTCAGATATAAGTTGATTCACCAAATATAGTTAGTCAAAGAAATTGGTGGCAAGCAGCAATTCTGAATTTGTATAAATTTACCTTTAACAAGTTCATGTCCATAGATGG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BLAST of MS019670 vs. NCBI nr
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BLAST of MS019670 vs. NCBI nr
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BLAST of MS019670 vs. NCBI nr
Match: XP_038903429.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1151.0 bits (2976), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/676 (83.28%), Postives = 606/676 (89.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. NCBI nr
Match: XP_022947264.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1140.6 bits (2949), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/676 (82.84%), Postives = 602/676 (89.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. NCBI nr
Match: XP_023005822.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1136.3 bits (2938), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/676 (82.25%), Postives = 604/676 (89.35%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LFI1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-E86 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 820.1 bits (2117), Expect = 2.1e-236 Identity = 395/680 (58.09%), Postives = 508/680 (74.71%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SS83 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g09040, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-E88 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 484.6 bits (1246), Expect = 2.1e-135 Identity = 261/764 (34.16%), Postives = 421/764 (55.10%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SS60 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g03580 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H23 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 457.6 bits (1176), Expect = 2.8e-127 Identity = 230/687 (33.48%), Postives = 383/687 (55.75%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SVA5 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g39530 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-E52 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 444.5 bits (1142), Expect = 2.4e-123 Identity = 243/722 (33.66%), Postives = 408/722 (56.51%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SVP7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g13650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H42 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 443.0 bits (1138), Expect = 7.1e-123 Identity = 237/728 (32.55%), Postives = 398/728 (54.67%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVF9 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015138 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1295.0 bits (3350), Expect = 0.0e+00 Identity = 642/676 (94.97%), Postives = 646/676 (95.56%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CXM2 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015138 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1259.2 bits (3257), Expect = 0.0e+00 Identity = 620/625 (99.20%), Postives = 621/625 (99.36%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6A4 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1140.6 bits (2949), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/676 (82.84%), Postives = 602/676 (89.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KU81 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53360, mitochondrial-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498713 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1136.3 bits (2938), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/676 (82.25%), Postives = 604/676 (89.35%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LDF3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G736910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1136.3 bits (2938), Expect = 0.0e+00 Identity = 555/676 (82.10%), Postives = 606/676 (89.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. TAIR 10
Match: AT3G53360.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 820.1 bits (2117), Expect = 1.5e-237 Identity = 395/680 (58.09%), Postives = 508/680 (74.71%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. TAIR 10
Match: AT3G09040.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 484.6 bits (1246), Expect = 1.5e-136 Identity = 261/764 (34.16%), Postives = 421/764 (55.10%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. TAIR 10
Match: AT3G03580.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 457.6 bits (1176), Expect = 2.0e-128 Identity = 230/687 (33.48%), Postives = 383/687 (55.75%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. TAIR 10
Match: AT4G39530.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 444.5 bits (1142), Expect = 1.7e-124 Identity = 243/722 (33.66%), Postives = 408/722 (56.51%), Query Frame = 0
BLAST of MS019670 vs. TAIR 10
Match: AT4G13650.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 443.0 bits (1138), Expect = 5.0e-124 Identity = 237/728 (32.55%), Postives = 398/728 (54.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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