MS011062 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGTTTGAGCCGTTTGAATGGTATTGTCGACCAGTTGATGGTGGTGTATGGACGAAGACAGTAGAGAATGCTCTTGGTGCATACACACCGTGTGCCGTTGATTCTCTGGTGATTGTTATTTCTCACCTGGTTGTTCTAGGTCTGTGTATCTACAGAACATGGCTGATTAATAAGGATTTTAAAGTACAAAGATTTTGTTTGAAGTCAAAGATATACAACTATGTGCTGTGTTTATTGGCGGCTTACTGTGCACTTGAGCCTTTATTCAGACTGGTCATGGGAATCTCACTATTGAATTTAGATGGGCAGGATACACTCGCTCCATTCGAGGTAGAGTTTCCTTAAGAAATTTAGAATTATTCCTAAAATTGTATTTCAATACTGAAATTTGAATATTCATGTATTGTAAGCATAATTAAACGGAGAAGGGGCAGTTCCTTTCTACATGGAAATATATCTTCGTGAGAAAAGTCAAAACCTCTTTTGATCATTTACTTTACTTTTCCGTTTGGAGCAGTCAGCTGCTTAAAATAGATACCTGGCTTGCTCACTATTTAGTTTGATAAAAGAACTTGAATTTAGGATGCTTGACCAAAGATATTTCATTAAAATCTTGCAATAGGAGAGGTATGCGAATGGAGTCCTTGCTTTTACACAATAATTTGTTTAGCCAATATTTACTGAGTTTACCCATGATGTAATGGTTTGTTGCTTCTCAAGATTGATAATGTTATTTAAAAGAGCTAAAAAAATATATGAGCTGCTATAAGATTTATAAGATATGTGGGCTACGTAAAAAATGATGACCAAGTGGCAAGTCCATATCATTCCTAAGAACCAAAGAAGATTATGTGCAAAAAAGAATGAGATATTATCTGTTTAACTTCTTGATGTATTGGCTAAGAAGAAGTAATTTTGTTGGTTTTGGACAACGAGTTCACTGATACTAAGCATTATGTCCTTCTATTTTAGGTGGTCGTCCTGATAATTCAAGCTCTTGCTTGGTGCTCGATGCTTGTAATGCTTGTTGTAGAAACCAGAGTTTATATTTTTGAATTTCGATGGATCATCAGGTTTGGAGTTGTTTATTTATTAGTAGCGGATGCTGTAATGGTTAATCTAATTCTTCCCGTGAAGGACTTGTATGAGAGGTATATTTTTCTAGAACTTTTTATTTTCTTAAAAAATATATTTAATTTAATCTTATAAATATTTGTGATAGCTGGATGACATCTTACTGTATTATTCATGCTGTTCTTTCTTTGAATAATTAGTTGTTGTTGAAGTTATAAATTATTGGGAGATGCAAAAAGAACTAAGAAGTGCATCCAAAATATATGCTGTTTGTTAGGACAAAAAGAAAAGAGAAGAAAAGGAAAAAAAAAAGTTAAGATACTAAAAGGAAATTCAACTTAAGTGACATATGATGGGTATTTCAAGTTCAGAAATGTGGAGCATGTATGGAACTAGGATTAAATTGCTGTGATTGTGATGGTCTATCAATCTTATGATTGTTAATTTTTTTTTGTTTGAGCATACATTTAGGTATAACATAGATTGACAGTTGTGTTTTTGTCTTTTCAGAAATGTCCTATATTTGTACATCAGTGAAGTCTTAGTCCAGGTTGGTTTCTTTTCTTCTCTCATTTGTTATGCTATATTTGTACTATTTTGAAATTTATGGTTGGAGAAGAATATAAAGATCTCTAAAGAGTAGTTTGGTGAATTTTTTAGTATGCGCTAAGGCCAAAGTGCTTACCAATATTTTGACGTTGGGCTGTTAAAACTGTTAAAGCTCTCTCTCTCTTTCTCGTCCAGTTTGCATTCTGAAGGTGTTGTTGAATGAGTATGAGTATTATGCCTGAGCAACAAATACTTGAAAGTGTTAGATTCCATTCTTTTGGTTAGCCGTGAAATTGAATATTTAGATATTAAATATATACATTTATATTTTTTATAAGCAACTAAGCTTTCATCGAGAAAAATGATAGAATGTACAAGGGCATAAAAAAACCAGCCCGACAAAAGGAAGCCCACATATAAAAATAGAGGCTCCAATATGTCGTGTTAGTTTGGTTTAAAGGTCACTTTGGTCGATATGTGTTCGCAATATGTTTTTCTTGCTGTTTGTTGCAGTTTCTACTTTTTTCTGTGGGTAATGGGTGCGACTTATATTATGGTCTTGATTAGGTTTCAGGTGTGAGATTTAATCCCATTGGGCTGTTGCTTTTGTAGTCTTACATTTATTTGTAATATTAAAAAAATATTTCACTTAATTTCCAGGAATAAGTAGGTACAAAATTTGCTATATAATTAACTAGTGTCGCAATAGTGGTTTTAATATACAAATACCTTGCATTTTTACTTTTTATTTTCTGAAATTGATTATAAGATTCATTTTTAATATCTTTTCCCCTCTAGCTTGGGAATAGGAAGGACCGAAAATCCACGGTATAGGATTCAAGGATTCTTAGAATTTTTGCAGAGAAACAGAGCTCTATTGAAGAATTTTGTGTGAATATTAGGCATACGGCTTCTTGGTGGGCTTCAATCCACAAGAAGGCTTTCTGTAACTATGGTTTTCTTTTGACTCTTCAGAGTTGGAATTCCTTGATTGTATAGTATCTTAGTTTCTTGGGGGAGGGTCTTCTCGACCCTTCGCCCCTAGATTGTATGCCTCTTTTTTGGACTCCTTTTCTTTTGGAATGAATCTTTGTTTATTATCAAAAAAAAAAAATAATTGCAAAACTTGAAACAAACATGGTTTATTTCTAACAAGCATTGTATGCCATCTATCAAAGTCAACAAACCACATAGCCTATTAGTGTTCGGTTGGGTTTCATCTCATTCCATCTTGTGAACTCTCTTCTGAGATTTTATTCTTGCTGTAGGCTTTATTTGGTGTTCTTTTGGTCGCATATGTGCCTAGCTTGGATCCTTATCCTGGTCATACCCCTCTAAGTAGTGAATCTGTTGATGTTGAGTATGAAGAACTTCCTGAAGGAGAACGTGTATGTCCTGAGCAGCAGGCAAACCTTTTTTCAAGTAAGTATTATTTTCTTAAAATCCCGCGTTACCTTTTTTTTTGAGATGTGGAGTATATAGATTGCTGTTTTATATTATAAGATTCGTAAATAGTGTATAAACACCATGAATTATTGGTAATAGTGCGAGGGAGTGAAACAATGGGAGAAGATGAGTGTGTTCAAATGTAACTATGCAAGGTCCTGGCAACTTATGCGGTGTAGTTCAAGTAGGAAAATGGTTTAGCTTTAAACCCTCGAGGGAATGAACTAGTTACCTGATATGGGTAATGTTCTAACTGCTTTCAATTTTAAATAACAGAGACTATTTATAACATACAAGTAAATGTGCCAACTATTTTACCACTAACGGAGAATACACATAGGTATATGGATAACTATAATCAACCACATCAAACCCCTACCTCTTGACTCAACCCTTGAACTATGAAATCAAGATCTCTTTCAAATTATTTGGTCTATTTTCATAACTTTTGGCAGACATATATCTCATGTTAGCCTGCTGTAAGTTATGTATTACTTTTAGCTGGAGTTTTGGCAGCCCAATCAGTTCGTTTAGAATTGACTGAATGCTCTTCCACAGTTCATTCTGTCTTTTTAGTTATATATTTGCTTTTCCTAATCGCGGTTACTTTTTGCTAGAAATTACTTTTGCATGGATGGATTACATAATGAAGCTAGGATACAAAAGGCCACTTACAGAGAAGGATGTATGGAAACTGGATATGTGGGATAGAACTGAAACATTATACAATAAGTCTGTATATATCTCTCTCAACATTATTTTTGTTGTTTCTTGCTCATTATTTTTGAATCTTATTTAGTGTTCTCTGTAGCTTTCAGAAAACTTGGGATGAAGAATCTCATAAATCCAAACCGTGGCTTCTTAGAGCAATAAACAGCAGCCTCGGAGGAAGGTAAGTAGAAGATGTGTGGCAAATAGTTTCTTCTGAATGGAATGCTATTTCCCCGTTTCTAATAGACAAAAATAGTTTCTTTTGAGTGATAGATATTTGGGCAAATTATTAATTTGCCAGTACTTTTATTTTTCTTTTATCTTCTGGTTTCTTACAACGAAAATATTTCCCTAGTTTTGGGCAACATGCTTATGCTTACTAGTACATTAACACGTGTATTATTCATGACATTGACCATTTCTTTTTGATGAGAAATAGGAAACTAAAAACAACTGTTTTCTATAAATAATCAATGGTGTACTTATTAAAAAATGATGTGCAATTTAATCAATAATTTCACGAATTAAACTTTTATTAGTTGTAGAAATTAAACAAGTGACTAAACATGAATGTTTAGAATATGTTGTTGTTATTCTTTGAGAAGATAATACTCTTAAAACTTTTGTATAGTATTATCTTATAATAATAATAATGAAATAAAGTAGATTATACAGTGATTTTTTTTTTTTGATGAAAAGATTTTATAATAAATAATATTTTAAAGTTGTTATAGTTTTAATTAATGAACAATGAATTGACAAAATGAATTTATCTGAAATTGAATTTATTTTGTAAGGAAAAATATTTGTGAAGCTATTCTAATTTTAATGAAGTACTAATAAATTGGTAATTGTTAAGAGAGACGGAGTGCACATAAAGATTTAAATGATTAATTGGTAATTGTTAATGACATGTTTTGTAAATTTAATTATTGATAAATTGACAGGAAAAAAGAAACTTAAAAAAACTAGCAGAGGATAACGAGTTCTTCTAGGAGAAATAAATCACAATTTTTGGGCGAAGGAATGGAACATTTTGTTAACAAAAGCCAATAGTTCAGAAAAGGGACGTGAAGACAAGGACTCTTTCCTCCAAAGCCTAGGAGCTTGTAAAAAAATTAATTAATCAGGAAAAGTCTAGGAAAGTGAAAGTGGAACCCACCACAATCCATGTAGCCATTTAGGCAATTTAGTCAACTCAGCACCACCTA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Match: XP_023518650.1 (ABC transporter C family member 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2863.6 bits (7422), Expect = 0.0e+00 Identity = 1470/1637 (89.80%), Postives = 1556/1637 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. NCBI nr
Match: XP_023004008.1 (ABC transporter C family member 2-like [Cucurbita maxima] >XP_023004009.1 ABC transporter C family member 2-like [Cucurbita maxima] >XP_023004010.1 ABC transporter C family member 2-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2860.5 bits (7414), Expect = 0.0e+00 Identity = 1469/1637 (89.74%), Postives = 1555/1637 (94.99%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. NCBI nr
Match: XP_022926385.1 (ABC transporter C family member 2 [Cucurbita moschata] >XP_022926386.1 ABC transporter C family member 2 [Cucurbita moschata] >XP_022926387.1 ABC transporter C family member 2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2858.9 bits (7410), Expect = 0.0e+00 Identity = 1468/1637 (89.68%), Postives = 1555/1637 (94.99%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. NCBI nr
Match: XP_038881322.1 (ABC transporter C family member 2-like [Benincasa hispida] >XP_038881323.1 ABC transporter C family member 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2833.9 bits (7345), Expect = 0.0e+00 Identity = 1457/1635 (89.11%), Postives = 1541/1635 (94.25%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42093 (ABC transporter C family member 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 2380.1 bits (6167), Expect = 0.0e+00 Identity = 1217/1636 (74.39%), Postives = 1404/1636 (85.82%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8G9 (ABC transporter C family member 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 2350.9 bits (6091), Expect = 0.0e+00 Identity = 1187/1631 (72.78%), Postives = 1393/1631 (85.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8H0 (ABC transporter C family member 12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 2055.8 bits (5325), Expect = 0.0e+00 Identity = 1039/1498 (69.36%), Postives = 1255/1498 (83.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8H1 (ABC transporter C family member 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC11 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1981.1 bits (5131), Expect = 0.0e+00 Identity = 1004/1503 (66.80%), Postives = 1236/1503 (82.24%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q28689 (ATP-binding cassette sub-family C member 2 OS=Oryctolagus cuniculus OX=9986 GN=ABCC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 881.7 bits (2277), Expect = 1.3e-254 Identity = 528/1370 (38.54%), Postives = 807/1370 (58.91%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CYS4 (ABC transporter C family member 2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015826 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3120.1 bits (8088), Expect = 0.0e+00 Identity = 1623/1634 (99.33%), Postives = 1624/1634 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KUZ1 (ABC transporter C family member 2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497451 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2860.5 bits (7414), Expect = 0.0e+00 Identity = 1469/1637 (89.74%), Postives = 1555/1637 (94.99%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EES4 (ABC transporter C family member 2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111433549 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2858.9 bits (7410), Expect = 0.0e+00 Identity = 1468/1637 (89.68%), Postives = 1555/1637 (94.99%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CN23 (ABC transporter C family member 2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold255G009470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2796.9 bits (7249), Expect = 0.0e+00 Identity = 1431/1635 (87.52%), Postives = 1531/1635 (93.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AZ12 (ABC transporter C family member 2-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484325 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2796.9 bits (7249), Expect = 0.0e+00 Identity = 1431/1635 (87.52%), Postives = 1531/1635 (93.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. TAIR 10
Match: AT2G34660.1 (multidrug resistance-associated protein 2 ) HSP 1 Score: 2380.1 bits (6167), Expect = 0.0e+00 Identity = 1217/1636 (74.39%), Postives = 1404/1636 (85.82%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. TAIR 10
Match: AT2G34660.2 (multidrug resistance-associated protein 2 ) HSP 1 Score: 2380.1 bits (6167), Expect = 0.0e+00 Identity = 1217/1636 (74.39%), Postives = 1404/1636 (85.82%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. TAIR 10
Match: AT1G30400.1 (multidrug resistance-associated protein 1 ) HSP 1 Score: 2350.9 bits (6091), Expect = 0.0e+00 Identity = 1187/1631 (72.78%), Postives = 1393/1631 (85.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. TAIR 10
Match: AT1G30400.2 (multidrug resistance-associated protein 1 ) HSP 1 Score: 2350.9 bits (6091), Expect = 0.0e+00 Identity = 1187/1631 (72.78%), Postives = 1393/1631 (85.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS011062 vs. TAIR 10
Match: AT1G30410.1 (multidrug resistance-associated protein 13 ) HSP 1 Score: 2009.2 bits (5204), Expect = 0.0e+00 Identity = 1026/1501 (68.35%), Postives = 1237/1501 (82.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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