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MS010823 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAACCGACGAGGCCGAGCGTGTGCTTCCTTTTCAGCTCCAATTTGACAAGCCTATTGCTTCTCAGGTTTCATTTTCTTACTTCACCATTGCTCTCCTGCTTAGTTCCACATATATTTGCCCATTTTTGGGGAAATGATCCTTCTGCTATTGTGTGTGGTGTCTCAGTTGTTTTCTGCTCTGAATATTTGATGATTTGCAAATGCAAGGTTAAAATTGCTGAGTGGAACCCCGAAAAAGATTTGCTCGCCATGGTCACTGAAGACTCGAAGATTTTGCTCCACCGTTTCAACTGGCAGAGGTTGTGGACTATATCGCCTGGTGAGTTATCTGTCTCGTTCAGTTTTCCTTAGCTTAGTATTTGCACTTGCTGAATTCTTTAAGATAGTGAATTTTACCAGTTCTCTTCTAGTTTTCTGTTTCAAACTCGCTGATTTCATCTGGATATAGTGGTTTTTTGGTCTTAAAGAAGTGCATCTAATATATGTTGAAGTTTGAAATTTTTTGTTGCTGTGCATAAGTTAAATAGATTAATATCAAAATACCACCTTTAATTTATTTCAATTATAATTTAGTGATTCTTGGACTATAGGTGTCTTTTATACTAAACTCTTTGAACGGTTCTGGTTAAATGAAACTGCATACAAGAGGAGAACCTGCATACAGCAAGAGAACGGCATTGATGAAAAGAAAGACTTCTGCTTCAAGAATTCGTGTTTTGTACTTTGTTATACTGTTTTTCTGCTATGAATGATTGTGTAAATTCTATTTAGGAAGATCCATAAAATCGTTATGTTGGAGGCCTGATGGTAAGGTGATAGCAGTTGGACTTGAAGATGGGACAATTTCATTGCATGATGTTGAAGTGAGTAGGCTTACTTTAAATTTAAAAAGTAATTTTTCTATTCATCGGTTAATCGCCAGATTCTTGCACCCAACACTGGTGGTCTAGATACCTGCATAATCTAGACACCCATTAGATTTTCAGCTTCAATGAGTCTAATATAGATTTTTTTTTTCTCATCTCCTTTAAAAAAATATATAGATTTATTTTTTTTAATAATTCCAACATGATTCCGATAATGTTATATACTAGTTAGTAATTCCTACATAATCTCTTCTCAACTTTTCCTGTTGTAGATTATTGTTTCTGGTCAGTTACTTCAGTAGAAGTTCTATTTTAAAATGTAATTCTTGTTTTGATGTTTTACTTGAAATCAGAATCAAATTGCATCTAACTGCATTCATTTATGTTCACAGCAACGTTTAGAGTCAAAGATAGAAGTGAGAGATGCAACTTTTATTCTATTATTCTCTCTTCGCTGCTCTTTAGACCTTTTATATTTCATGTCAAACAGAATGGGAAGTTGTTGAGAAGCATGAAGTCTCACGAAGTTGCTGTGGTTAGTCTAAACTGGGTGGAGGATAGCCAGTTAATTACAGTATGTAACTCACCATTAATTTACGTAGCGTTTTCCATGATTTTTTATTTTATTGGGAAATCATTTTGCTAACATTATGCAGGATGTGCAACATGAATTATGATTTAAAGTATTAGTTTTTTTTTTCCTTCTCATTGCTTCATCCTTTTCCAAAATCGTGGTGCAGGACATAAATGAAAACTTGTCAGCTTATGAAGATCGTACTAGTCGTATTTTCCCTCCTGCTCCTACTGTTCCTCGAATGCATGGACTTGTTTCGGGGGACACTGGTTTCATTGATGACAGTGAGGACTCGTTTACGGAGTTGTCAAATTCTTCACAACAACGGTTTAACATCTTGTGCAGTGGTGACAAAGATGGAAGCATCTGTTTTAGTATATTTGGCATTTTTCCAATTGGAAAAATAGTAAGCAACTGATTACAATCATGGACCTTTATTGTCCCTCTTTGGGAAAATAGTTAGTTAACTTATTAGAACCGTGGACCTTCTTTCCCACCCTACTCCGTTGTAAATATAATTCTCAAATACACTAATAAAATTGTACCATTTCACTTCTCTGGCGTTGTTATAAAAATTTATTGTGGTATGTTACTTTCAAAACTGTATTTTTCTGATCTGGTTGTCGTGGCTTCCTGATCACTTGAAGCCTAAAAATAAAAACCTGGCCCCTAGCTTTTCCCAGTTCTGCTGATCCACTCTAGATATGTGTATCCATAAGGTCGTCTATTTTTTGTAATAGAAAAAGTAAAAACTGTATAATTTCATTCAATTTAAAAAAAATTTTCTTTAATCATAACAAGTTGTTATTGTAATGAATAATATAATAGTAATTATAGTTAGAAACTCGAAATTTTAAATTATATAGTGGCATATTTGTTTATTTTTAGATTCTAGAATTCATAAAGAAATTTGTAATTTCTCTGTCCTTATTTGTGTATGTGTATTTTTCTTTTAAATTGTTTTTTAAACGCATGCAGTTTTTTTTGTTGTATTGATCCATTGGGTGCCTCTTCTATTGATGTGATTTTTTTTTTTTAATGTCACAGAACATACACAAGCTTCATATTCCTCTTCAAGTTCAAGATGCTGGTGCTTCATATCACCTTCTGAATGCTGAAATTTACAAGGTACGAGAGAACACTTGGGTGATTGCTATTTTATGCTTATAGATTTTATTTGTCTATATGACCTTTTCTTTTAGGGCTATAATTGTTAATTTGTTGTCAATAGTTCTAGCATAGATCTTTGTTGGAGTCCTGGTGAGGTCTTCTTGGAACTTAACCCATTCATTAGGTCTAAATTATTTAGTTAGTTGTGCAAGGATCAGGAGAATTAATTCACAGGTTCGATATAAGTCCATGATGATTGTTAGTTGATCTGCGCATCAATATTTTTATTTCATTTTTAAGTTAAGGATTGATCTCTCAAAATGGTAATTACTTGTTGTTGCTACCCTTTAACTTCTCAAGTTTGGAGAGATCCATAGTCAACATTTGTCTGACTCTGAGCAGCAATATGGTGAAATTCTGACAAATAGAATCTCCGAGAGTTTTAATTTTTCTAATTTTCATACTTATATTGGTTCAAGTGAATTAGAGAGTTTTAATTAGTCCTTATCCAGGCATAAATACGTTCCATGGTGTTCCTATATCAACATGTAACATATCAAGGAGCGCTAATGGTTTGCTTCAAAGATCTTGCTCATTTGAAAGTTCAGGCAGAAGATTGTGGGAGTTCGCTTTCTACTGGGTAGCTGCTACGGAGCCTCAAGTTCAAAACTCTCCACTTAATCATTAAAACATCTGAGCTGATATTAAATGATTTAGTATTGAGAATTTTTCATTCAGTCATTGAAATGTCTAGTTCTTAGATTAATAGCTAATTTAATGTTGAGAGTTCTGATTTCAAGTTTCAGAAATATCTACGGGTTTTTGAGCAACTTCAGTAATCTAGCTAATTTGTTTTACGTTTGATGTCACTAGGTTGCTTTATCAAAAGATCTTTGTCGTTTGATAGTCATGTGCTCAGGAGAACTTGTTGGAGATGGACATGATCCAAGAAATAGACAGACTAACGTTCAAGGTGTGCATGGCATGCATTCTTTAGTGCTTGATACTTCAATATTTAGGAAGAGGTAATATTACTGCAAAGAATGTGCATATTGCTCATTATTTTAACATAATATGTGCTGAAATATCTGCCCTAAGATTTACATTTCTTGTGTTCTATCCATTGGATTCTGATAGGATCATGGTAGGAAGATGATTATGGATATTATTAGGGGCATATTAGTTATTAGCTCGGTTATTAGCTGGTAGATTTATTATAGTTGAATGATCATAAGTAGGATTTAGAGGGAGGGAAAGGCAAGCAAATTTTACAAATGCTAATTATCCCCTAGTAATTTTCTTCGATATTAAAATATATTTCCACTCCTATTTTTCTTGATTTCCAGTCTCTGGTTCTGGTTCCTATCAGATTTTTGTTATGCTACTTTTCAACTGTTTGGATATTCCTCTCATGAAAATTAAAAAAAAAAAACTGCTTTGATATCTGGAGCCACTTTTCTTGTCAAGACTGGTACTGTTTCAACTCAACTAATACTACCTTATCTTGTATCTTCCCATCATATCCTTTCTAATGTTTGTGTTCCTGGAAAAGATATTAAAAACTGATTTTCTGCCTCTTGTTGCAGGAAAAGTGAGCTGCATCAGGTAGCTCAACAAGCTTCTAATATTGGGGAGTTGATTGAGGTAATCAGGGCATCATTATCAGTTATGAGTAAGCAGTGGTCTGATGCCATGCACACTTTCCGGGAGAAGTTTGATGCTTTATCCATGCTGATTATTAACCATGGTAGTAATAGATATTATAGATATTCATTTGCTACTCTTATTTTTCCCTTACTAATGTTGTTCCTTCTCTTGTAGGACTTGACTCATCTCCTCAAGAAGAATTTCTTAGCCTGTTGGGTGGTGCACGGACTAGTCAATCGATTCACCAATTTTTAGTTAACTCTCTTGGTGAAGTGGTACAGTCTTCTCTTTGGTCATGTCAGAGGTTAATGATTGTTTTGCTATTTCACTGACTGCTTTGGTTTAAATAGGGTGCAAAGCGTGTGTCTAAGGCTATTTCTAGTGCTGGAAGTGAACTCCAACTTATTGTCCTCGATCACCTTCAGGTGAAAGTGCAACACCTTAATTTTTCTTAATTGAAAAATTTAACATGATACCAGATTGAAATAATTTAGTGAAATACAAGTTATTCAATTGGTGTATTTAGTTGAAAATAAATATATATGTATTTTCTTGAGTTCAACAATTGTAGAGGAAGGATTGAATCATCGAATTTTAGGATGGTAATAAGTACTTATCGACTAAGATATGCTGGGATTGACTAGTTGAAAGTAAATAATTTTTTTTGAACAAGAAACGAATTTTCATTGATAAATGAAAATGAACAAAAATTGTTCAAAGATACAAACCCCCAAAGGGGTGAAATGAAGGGGGATGAAGAAGGAAAAAAATAAAAAATAAAAAGATACAAACA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ATGGAAACCGACGAGGCCGAGCGTGTGCTTCCTTTTCAGCTCCAATTTGACAAGCCTATTGCTTCTCAGGTTAAAATTGCTGAGTGGAACCCCGAAAAAGATTTGCTCGCCATGGTCACTGAAGACTCGAAGATTTTGCTCCACCGTTTCAACTGGCAGAGGTTGTGGACTATATCGCCTGGTGAATCCATAAAATCGTTATGTTGGAGGCCTGATGGTAAGGTGATAGCAGTTGGACTTGAAGATGGGACAATTTCATTGCATGATGTTGAAAATGGGAAGTTGTTGAGAAGCATGAAGTCTCACGAAGTTGCTGTGGTTAGTCTAAACTGGGTGGAGGATAGCCAGTTAATTACAGACATAAATGAAAACTTGTCAGCTTATGAAGATCGTACTAGTCGTATTTTCCCTCCTGCTCCTACTGTTCCTCGAATGCATGGACTTGTTTCGGGGGACACTGGTTTCATTGATGACAGTGAGGACTCGTTTACGGAGTTGTCAAATTCTTCACAACAACGGTTTAACATCTTGTGCAGTGGTGACAAAGATGGAAGCATCTGTTTTAGTATATTTGGCATTTTTCCAATTGGAAAAATAAACATACACAAGCTTCATATTCCTCTTCAAGTTCAAGATGCTGGTGCTTCATATCACCTTCTGAATGCTGAAATTTACAAGGTTGCTTTATCAAAAGATCTTTGTCGTTTGATAGTCATGTGCTCAGGAGAACTTGTTGGAGATGGACATGATCCAAGAAATAGACAGACTAACGTTCAAGGTGTGCATGGCATGCATTCTTTAGTGCTTGATACTTCAATATTTAGGAAGAGGAAAAGTGAGCTGCATCAGGTAGCTCAACAAGCTTCTAATATTGGGGAGTTGATTGAGGTAATCAGGGCATCATTATCAGTTATGAGTAAGCAGTGGTCTGATGCCATGCACACTTTCCGGGAGAAGTTTGATGCTTTATCCATGCTGATTATTAACCATGGTAGACTTGACTCATCTCCTCAAGAAGAATTTCTTAGCCTGTTGGGTGGTGCACGGACTAGTCAATCGATTCACCAATTTTTAGTTAACTCTCTTGGTGAAGTGGGTGCAAAGCGTGTGTCTAAGGCTATTTCTAGTGCTGGAAGTGAACTCCAACTTATTGTCCTCGATCACCTTCAGCCTGCTGTAGAAATCATTGGATTCCGGATGGGTGAACTACTAGGCCTTTCAAGATGGCGTGCACGTTTTCAGGGAGTTGGTTTGGACGAGGAGCTTATAAATAATGCAATGGAAAAAGCTGGTATGTTACTTGTGCAAGTTGACCGTTTTATGAGGGTGCTTTCAACAGTGTTGCAGCAGTTCTCAAATTTCTTTAACTGGCTTATAAGATGTATAAAACTACTTATGTCGGAGCCAAGCGATCAGCTTCTACCATATAATAGTGAGCTTGTTATCATTTTCTTGAAGTTTTTGTACAATCAGGACCCTGTCAAGAAGCTGCTTGAAGCATCTGAAAATGACGACAATATTGAGATTGACTTGGAAATTATTGAAAGAGTAAGAGAATTAACTCTATTTGGGGGATTCTCAGATTGTGGATTTTTAAGGAGAACGCTTGGTATGGAATTTCAGCAGATGGAATCTAGTTTTAAGGAAGCTTTCCTTATGCCCTTTAGTACAATCTCAAGGAAAATACTTTGTGAAGACCTGTTGTCCCTGTTCCCCTTTCAATCCTCGTCTAGCTGCTTGTCTTCCAGTGTTCCTCTTTCAGTATCATACTATGAGGATTCCTCTGAAGCTGTTTTTGCCCCTCAGAGTTGTCAGCAGAAGTTTATCGATTATATATCTTTCAAAATCCCAGATGACTCTTCTGCAGATATTGCAAATTGTGTAGGCATAGCCAGGGGATTTGTTCATGATCTGAGCTGCTCAAACGAGGATTACTCTTCATTTGAAGCAATCTTAGTATCTATTCCTGATGGATCCAAGTGTGTTGATCTGTCTTTGTATAAGGATGGACAAATTGTTTTGTTATTAAATGAAACTGCTTCTACTTCTGAAAGCTGTGTTAGTTCCTATATGATGGTTGTGCAAGCAAATGACCTTCCATTTGCACCTATGTCAAGATCTCCCAGTCTGGACGATTGGAAGGTTCATCAACTTAAGGACTATGTTGTCCCATTGCAAATGGAGAATGAAAAAGTCCGCAACATTCCTCATGCTGTTGTTCCTCCTCTGGCTGTTAGTGCATCCAGAGGAGTGGCTTGTGTTTTTGGTGCAAGAAAACGTGCACTGGTCTACATCTTAGAGGAAGATGAAGATGAGGCATCAGATGCTGAA METDEAERVLPFQLQFDKPIASQVKIAEWNPEKDLLAMVTEDSKILLHRFNWQRLWTISPGESIKSLCWRPDGKVIAVGLEDGTISLHDVENGKLLRSMKSHEVAVVSLNWVEDSQLITDINENLSAYEDRTSRIFPPAPTVPRMHGLVSGDTGFIDDSEDSFTELSNSSQQRFNILCSGDKDGSICFSIFGIFPIGKINIHKLHIPLQVQDAGASYHLLNAEIYKVALSKDLCRLIVMCSGELVGDGHDPRNRQTNVQGVHGMHSLVLDTSIFRKRKSELHQVAQQASNIGELIEVIRASLSVMSKQWSDAMHTFREKFDALSMLIINHGRLDSSPQEEFLSLLGGARTSQSIHQFLVNSLGEVGAKRVSKAISSAGSELQLIVLDHLQPAVEIIGFRMGELLGLSRWRARFQGVGLDEELINNAMEKAGMLLVQVDRFMRVLSTVLQQFSNFFNWLIRCIKLLMSEPSDQLLPYNSELVIIFLKFLYNQDPVKKLLEASENDDNIEIDLEIIERVRELTLFGGFSDCGFLRRTLGMEFQQMESSFKEAFLMPFSTISRKILCEDLLSLFPFQSSSSCLSSSVPLSVSYYEDSSEAVFAPQSCQQKFIDYISFKIPDDSSADIANCVGIARGFVHDLSCSNEDYSSFEAILVSIPDGSKCVDLSLYKDGQIVLLLNETASTSESCVSSYMMVVQANDLPFAPMSRSPSLDDWKVHQLKDYVVPLQMENEKVRNIPHAVVPPLAVSASRGVACVFGARKRALVYILEEDEDEASDAE Homology
BLAST of MS010823 vs. NCBI nr
Match: XP_022142094.1 (anaphase-promoting complex subunit 4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1516.9 bits (3926), Expect = 0.0e+00 Identity = 772/777 (99.36%), Postives = 773/777 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. NCBI nr
Match: XP_023545048.1 (anaphase-promoting complex subunit 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1390.2 bits (3597), Expect = 0.0e+00 Identity = 704/777 (90.60%), Postives = 730/777 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. NCBI nr
Match: XP_022949706.1 (anaphase-promoting complex subunit 4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1389.4 bits (3595), Expect = 0.0e+00 Identity = 704/777 (90.60%), Postives = 731/777 (94.08%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. NCBI nr
Match: XP_022977972.1 (anaphase-promoting complex subunit 4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1388.2 bits (3592), Expect = 0.0e+00 Identity = 704/777 (90.60%), Postives = 728/777 (93.69%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. NCBI nr
Match: KAG6603721.1 (Anaphase-promoting complex subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1387.9 bits (3591), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/777 (90.35%), Postives = 730/777 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65418 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=APC4 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1018.5 bits (2632), Expect = 4.1e-296 Identity = 512/772 (66.32%), Postives = 616/772 (79.79%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UJX5 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 167.9 bits (424), Expect = 4.4e-40 Identity = 124/473 (26.22%), Postives = 226/473 (47.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RAQ5 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=ANAPC4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 7.6e-40 Identity = 125/473 (26.43%), Postives = 224/473 (47.36%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91W96 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Anapc4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 1.7e-39 Identity = 125/473 (26.43%), Postives = 225/473 (47.57%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54NI1 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=anapc4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 9.9e-24 Identity = 117/557 (21.01%), Postives = 241/557 (43.27%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKL4 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1516.9 bits (3926), Expect = 0.0e+00 Identity = 772/777 (99.36%), Postives = 773/777 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GCS1 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453021 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1389.4 bits (3595), Expect = 0.0e+00 Identity = 704/777 (90.60%), Postives = 731/777 (94.08%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IJW1 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111478105 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1388.2 bits (3592), Expect = 0.0e+00 Identity = 704/777 (90.60%), Postives = 728/777 (93.69%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TZ68 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold114G001730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1346.3 bits (3483), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/777 (87.64%), Postives = 719/777 (92.54%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJ41 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501540 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1345.5 bits (3481), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/777 (87.52%), Postives = 719/777 (92.54%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. TAIR 10
Match: AT4G21530.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 1018.5 bits (2632), Expect = 2.9e-297 Identity = 512/772 (66.32%), Postives = 616/772 (79.79%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. TAIR 10
Match: AT5G25150.1 (TBP-associated factor 5 ) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 1.5e-06 Identity = 29/107 (27.10%), Postives = 49/107 (45.79%), Query Frame = 0
BLAST of MS010823 vs. TAIR 10
Match: AT4G29830.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 1.4e-04 Identity = 20/46 (43.48%), Postives = 29/46 (63.04%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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