MS010496 (gene) Bitter gourd (TR) v1

Overview


Name	MS010496
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Pentatricopeptide repeat-containing protein
Location	scaffold35: 85098 .. 178750 (-)
RNA-Seq Expression	MS010496
Synteny	MS010496

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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mRNA sequence

TGGAACTCCAACATAAGGGACGCTGTAAATCATGGCCATCCGTTCAAAGCCCTCGTCCTTTTCCGTCAAATGAAACTAAATGGTCTGCAACCCAACAATTTCACATTTCCCTTCATAGCAAAAGCCTGCGCGAAGCTCTCCAATCTTTGTAACACCCAGATCATCCACACCCATGTCGTCAAATCCCCATTCCACTCTGATATCTTTGTTCAGACGGCCATGGTCGATATGTATGTCAAGTGTTGTAAAGTGGAGGATGCGTATAACCTGTTTGAGAAAATGCCTGTTAGGGATATTGCATCGTGGAACGCTATGATTATTGGTTTTGCCCAATTTGGCTCCCCTGATCGAGTTTTTCATCTGTTTGTAGGGATGGGATTAGTGGGAATTCGGCCAGATCCAGCTACTGTCATTGGGTTGACTCGAGCAGTTTTATCTGCCAAAAGTTTAAGATTCTTGAAAGCTGTTCATGCTATTGGGATTGAAACAGGATTAGATGCTGATGTCTCAGTTGCTAACACTTGGATTGCTGCTTATTCCAAATGCGGTGAACTGCAGGTAGCAGAGATGGTATTCAAGGGGATTCAAAAGCATGCAAGATCTTCTGTCTCGTGGAATTCATTAATTTCATGCTATGCAAAGTTTGAGAGATATTTAGATGCTGTAAATACCTACAAAGGATTGATCTGTGATGGATTTAAGCCTGATGCAAGTACGATTATTAGCCTGCTTTCCTCTTGCATGCAACCTGAAGCACTAGTTTATGGTTCCCTTATTCATGGCCATGGTGTACAATTGGGCTGCGATTCAGATATTTCATTAACTAACACCCTTATATCAATGTATTCAAGGTGTGGAGATATTTGCTCGGCTAGAACTTTATTTGATGGCATGTCCATTAGAACTTGTGTTTCATGGACTGCCATGATTAGTGGGTATAGTGAGGTGGGGCGCATTGATGAGGCCTTAGTATTATTTAATGCTATGGAAGAAGCTGGTGAGAAACCTGATTTAGTTACAGTTCTTTCCCTGATATTAGGTTGTGGTAAAGCAGGGGCACTTGAGCTAGGACATTGGATCGAACGCTATTCATATTTACATGGATTGAAACAAGATGTGGTTGTTTCCAATGCATTAATAGACATGTATGGAAAATGTGGAAGCATGAGTGATGCTCGAGACGTATTTTACGGTTTGCCTAATAGAACCATCGTCTCTTGGACGGCCATGATTGCAGCTTGTGCTTTGAATGGGGAATTTAGAGAAGCCTTAGATATCTTCCATCTGATGTCAGAGTCGGGAATAAAGCCAAACCATGTCACGTTTGTAGCTGTTCTTCAAGCTTGCTCTCATGAAGGCTATCTTGAGAAAGGGAGGGAATGTTTTATGATGATGACTGAAAGATATGGTATAAATCCTGGTTTGGATCATTATTCCTGCATGATAGACCTGCTTGGACGGAAAGGGAAGCTAATTGAAGCCTTGGAGGTTATTCAAGATATGCCTATGGAGCCTGATGTGGGCATATGGGGTGCATTGCTTGGTGCTTGTAAGATTCACCGCAACATGCAAATCGGTGAATATGTGTCTCGTAATCTCTTTGAATTGCAGCCGCAGGTTGCAGTTTCGTTTTCGGCCCTTGCTAATGTGTATTTGGCTTGTGGGAAATGGGAAAATGCTGCCAAAACTAGAAAGCTAATGAAGGATAGACGAGTAAAGAAAAATGAAGGATTTAGTTGGATTCACATTCAGAATAAAGTTCACGCATTTGGAGTCGAAGATGTAGTTCGTCCATGGAAAAATGAAATCTACAAGATAATGGATGAAATATGGAAGGAGATAAAAAGGATGGGTTTTATCCCAGACACCGAGTCAGTACTGCATGACCTTGAAGAAGAGGTAAAGGAGCAGACGCGTAAGCATCACAGTGAGAAACTT

Coding sequence (CDS)

TGGAACTCCAACATAAGGGACGCTGTAAATCATGGCCATCCGTTCAAAGCCCTCGTCCTTTTCCGTCAAATGAAACTAAATGGTCTGCAACCCAACAATTTCACATTTCCCTTCATAGCAAAAGCCTGCGCGAAGCTCTCCAATCTTTGTAACACCCAGATCATCCACACCCATGTCGTCAAATCCCCATTCCACTCTGATATCTTTGTTCAGACGGCCATGGTCGATATGTATGTCAAGTGTTGTAAAGTGGAGGATGCGTATAACCTGTTTGAGAAAATGCCTGTTAGGGATATTGCATCGTGGAACGCTATGATTATTGGTTTTGCCCAATTTGGCTCCCCTGATCGAGTTTTTCATCTGTTTGTAGGGATGGGATTAGTGGGAATTCGGCCAGATCCAGCTACTGTCATTGGGTTGACTCGAGCAGTTTTATCTGCCAAAAGTTTAAGATTCTTGAAAGCTGTTCATGCTATTGGGATTGAAACAGGATTAGATGCTGATGTCTCAGTTGCTAACACTTGGATTGCTGCTTATTCCAAATGCGGTGAACTGCAGGTAGCAGAGATGGTATTCAAGGGGATTCAAAAGCATGCAAGATCTTCTGTCTCGTGGAATTCATTAATTTCATGCTATGCAAAGTTTGAGAGATATTTAGATGCTGTAAATACCTACAAAGGATTGATCTGTGATGGATTTAAGCCTGATGCAAGTACGATTATTAGCCTGCTTTCCTCTTGCATGCAACCTGAAGCACTAGTTTATGGTTCCCTTATTCATGGCCATGGTGTACAATTGGGCTGCGATTCAGATATTTCATTAACTAACACCCTTATATCAATGTATTCAAGGTGTGGAGATATTTGCTCGGCTAGAACTTTATTTGATGGCATGTCCATTAGAACTTGTGTTTCATGGACTGCCATGATTAGTGGGTATAGTGAGGTGGGGCGCATTGATGAGGCCTTAGTATTATTTAATGCTATGGAAGAAGCTGGTGAGAAACCTGATTTAGTTACAGTTCTTTCCCTGATATTAGGTTGTGGTAAAGCAGGGGCACTTGAGCTAGGACATTGGATCGAACGCTATTCATATTTACATGGATTGAAACAAGATGTGGTTGTTTCCAATGCATTAATAGACATGTATGGAAAATGTGGAAGCATGAGTGATGCTCGAGACGTATTTTACGGTTTGCCTAATAGAACCATCGTCTCTTGGACGGCCATGATTGCAGCTTGTGCTTTGAATGGGGAATTTAGAGAAGCCTTAGATATCTTCCATCTGATGTCAGAGTCGGGAATAAAGCCAAACCATGTCACGTTTGTAGCTGTTCTTCAAGCTTGCTCTCATGAAGGCTATCTTGAGAAAGGGAGGGAATGTTTTATGATGATGACTGAAAGATATGGTATAAATCCTGGTTTGGATCATTATTCCTGCATGATAGACCTGCTTGGACGGAAAGGGAAGCTAATTGAAGCCTTGGAGGTTATTCAAGATATGCCTATGGAGCCTGATGTGGGCATATGGGGTGCATTGCTTGGTGCTTGTAAGATTCACCGCAACATGCAAATCGGTGAATATGTGTCTCGTAATCTCTTTGAATTGCAGCCGCAGGTTGCAGTTTCGTTTTCGGCCCTTGCTAATGTGTATTTGGCTTGTGGGAAATGGGAAAATGCTGCCAAAACTAGAAAGCTAATGAAGGATAGACGAGTAAAGAAAAATGAAGGATTTAGTTGGATTCACATTCAGAATAAAGTTCACGCATTTGGAGTCGAAGATGTAGTTCGTCCATGGAAAAATGAAATCTACAAGATAATGGATGAAATATGGAAGGAGATAAAAAGGATGGGTTTTATCCCAGACACCGAGTCAGTACTGCATGACCTTGAAGAAGAGGTAAAGGAGCAGACGCGTAAGCATCACAGTGAGAAACTT

Protein sequence

WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVVKSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFHLFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYSKCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTIISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSIRTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWIERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEFREALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSCMIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQVAVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWKNEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVLHDLEEEVKEQTRKHHSEKL

Homology

[Close]

BLAST of MS010496 vs. NCBI nr
Match: XP_022133316.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X1 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 1154.8 bits (2986), Expect = 0.0e+00
Identity = 563/615 (91.54%), Postives = 581/615 (94.47%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH
Sbjct: 80  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS
Sbjct: 140 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI
Sbjct: 200 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDI SARTLFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDIFSARTLFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLI GCGKAGALELGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLISGCGKAGALELGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALDIFHLMSESGI PNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDIFHLMSESGIMPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           AVSF  +AN+Y + G+W+  A  RK+M+  +V+K+ G S + +  K H F VED      
Sbjct: 560 AVSFVEMANIYASVGRWDRVADMRKMMRSNKVRKSPGKSTVQVNGKSHVFIVEDRGHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIK 616
             IY +++ +  ++K
Sbjct: 620 LLIYAVLENLTLQLK 634

[Close]

BLAST of MS010496 vs. NCBI nr
Match: XP_004143574.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031743718.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031743719.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 993.0 bits (2566), Expect = 1.2e-285
Identity = 478/619 (77.22%), Postives = 541/619 (87.40%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IR AVN G+  KAL LF Q+KLNGLQPNNFTFPF++KACAKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRGAVNQGNASKALALFHQLKLNGLQPNNFTFPFLSKACAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF+SDI+VQTAMVDMYVKC KV+DAYNLF+KMPVR+IASWNAMIIGF+Q GS DRVF+
Sbjct: 80  KSPFYSDIYVQTAMVDMYVKCGKVDDAYNLFDKMPVRNIASWNAMIIGFSQIGSLDRVFN 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVG RPD ATVIGLTRAV+SAKSLRFLKAVHAIGIETGLDAD SV+NTWIAAYS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGTRPDAATVIGLTRAVISAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADTSVSNTWIAAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK ARSSVSWNSLI+CYA F +Y+DAV +YKGL+CDGFKPDASTI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFHGIQKTARSSVSWNSLIACYAHFGKYVDAVKSYKGLLCDGFKPDASTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLLSSC QPEAL+YG LIHGHG QLGCDSDISL NTLISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLSSCQQPEALIYGFLIHGHGFQLGCDSDISLINTLISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGR+D+ALVLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GAL LGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRVDDALVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALGLGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ LH LK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR++FY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASLHELKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDAREIFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F L+SESGI+PN++TF+AVLQAC H GYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFSLLSESGIEPNNITFLAVLQACCHGGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPM+PD GIWGALLGACKIH NM+IGEYVSR LFELQP+V
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMKPDEGIWGALLGACKIHNNMEIGEYVSRYLFELQPRV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           AVSF  +AN+Y + G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +    H F VED      
Sbjct: 560 AVSFVEMANIYASVGRWDEVAAMRKTMRSNQMRKSPGKSVVQVNGMSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKRMGF 620
             IY+ +  +  ++K+  F
Sbjct: 620 LLIYEALGNLAMQMKQKEF 638

[Close]

BLAST of MS010496 vs. NCBI nr
Match: KAA0036256.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK12650.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 992.3 bits (2564), Expect = 2.0e-285
Identity = 478/627 (76.24%), Postives = 543/627 (86.60%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IR AVN G+  KAL LF Q+KLNGLQPNNFTFPF+AKACAKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRGAVNQGNASKALALFHQLKLNGLQPNNFTFPFLAKACAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF+SDI+VQTAMVDMYVKC K EDAYNLF+KMPVR+IASWNAMI+GF+Q GS DRVF+
Sbjct: 80  KSPFYSDIYVQTAMVDMYVKCGKAEDAYNLFDKMPVRNIASWNAMIMGFSQIGSLDRVFN 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVG RPD ATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDAD SV+NTWI+AYS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGTRPDAATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADNSVSNTWISAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK+ARSSVSWNSLI+CYA F + +DAVN+YKGL+CDGFKPDA TI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFHGIQKNARSSVSWNSLIACYAHFGKNVDAVNSYKGLLCDGFKPDACTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLL SC QPEAL+YGSLIHGHG QLGCDSDISL NTLISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLCSCQQPEALIYGSLIHGHGFQLGCDSDISLINTLISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGR+D+ALVLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GAL LGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRVDDALVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALGLGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ LHGLK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR+VFY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASLHGLKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDAREVFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F L+SESGI+PN++TF+AVLQAC H GYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFSLLSESGIEPNNITFLAVLQACCHGGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPM+PD GIWGALLGACKIH NM+IGEYVSR+LFELQP+V
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMKPDEGIWGALLGACKIHNNMEIGEYVSRHLFELQPRV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           A SF  +AN+Y   G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +    H F VED      
Sbjct: 560 AASFVEMANIYALVGRWDEVAAMRKRMRSNQMRKSPGKSVVQVNGMSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVL 628
             IY+ +  +  ++K+  F    + ++
Sbjct: 620 LLIYEALGNLAMQMKQKEFSSHAQRII 646

[Close]

BLAST of MS010496 vs. NCBI nr
Match: XP_008440672.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 991.9 bits (2563), Expect = 2.6e-285
Identity = 481/640 (75.16%), Postives = 551/640 (86.09%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IR AVN G+  KAL LF Q+KLNGLQPNNFTFPF+AKACAKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRGAVNQGNASKALALFHQLKLNGLQPNNFTFPFLAKACAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF+SDI+VQTAMVDMYVKC K EDAYNLF+KMPVR+IASWNAMI+GF+Q GS DRVF+
Sbjct: 80  KSPFYSDIYVQTAMVDMYVKCGKAEDAYNLFDKMPVRNIASWNAMIMGFSQIGSLDRVFN 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVG RPD ATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDAD SV+NTWI+AYS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGTRPDAATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADNSVSNTWISAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK+ARSSVSWNSLI+CYA F + +DAVN+YKGL+CDGFKPDA TI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFHGIQKNARSSVSWNSLIACYAHFGKNVDAVNSYKGLLCDGFKPDACTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLL SC QPEAL+YGSLIHGHG QLGCDSDISL NTLISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLCSCQQPEALIYGSLIHGHGFQLGCDSDISLINTLISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGR+D+ALVLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GAL LGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRVDDALVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALGLGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ LHGLK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR+VFY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASLHGLKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDAREVFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F L+SESGI+PN++TF+AVLQAC H GYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFSLLSESGIEPNNITFLAVLQACCHGGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPM+PD GIWGALLGACKIH NM+IGEYVSR+LFELQP+V
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMKPDEGIWGALLGACKIHNNMEIGEYVSRHLFELQPRV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           A SF  +AN+Y   G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +    H F VED      
Sbjct: 560 AASFVEMANIYALVGRWDEVAAMRKRMRSNQMRKSPGKSVVQVNGMSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVLH---DLEEEVKEQ 638
             IY+ +  +  ++K+  F    + ++    DL ++++E+
Sbjct: 620 LLIYEALGNLAMQMKQKEFSSHAQRIIELDTDLLKDMQER 659

[Close]

BLAST of MS010496 vs. NCBI nr
Match: XP_038881350.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 990.7 bits (2560), Expect = 5.8e-285
Identity = 479/616 (77.76%), Postives = 537/616 (87.18%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IRDAVN G+ +KALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPF+AKA AKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRDAVNQGNAYKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFLAKASAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKC KVEDAYNLF+KMPVRDIASWNAMIIGF+  GS DRVF 
Sbjct: 80  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCGKVEDAYNLFDKMPVRDIASWNAMIIGFSHIGSLDRVFS 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVGIRPD ATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAI IETGLDAD SV+NTWIA YS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGIRPDAATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIAIETGLDADTSVSNTWIAGYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK+ RSSVSWNSLI+CYA F +Y+DAVNTYKGL+ DGF PDASTI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFYGIQKNVRSSVSWNSLIACYANFGKYVDAVNTYKGLLSDGFTPDASTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLLS C QPEAL+YGSLIH HG QLGCDSDISL N LISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLSCCQQPEALIYGSLIHAHGFQLGCDSDISLINALISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGRID+A+VLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GALELGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDDAMVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALELGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ ++GLK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR VFY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASVYGLKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDARKVFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F+LMSESGI+PN++TF+AVLQACSH G+LEKG+E FMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFYLMSESGIEPNNITFLAVLQACSHGGFLEKGKEYFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGR+GKLIEALEVI DMPM+PD GIWGALL ACKIH NMQIGEYVS +LFELQP V
Sbjct: 500 MIDLLGRRGKLIEALEVIHDMPMKPDEGIWGALLSACKIHNNMQIGEYVSHHLFELQPLV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           AVSF  +AN+Y + G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +  K H F VED      
Sbjct: 560 AVSFVEMANIYASVGRWDEVAAMRKTMRSNKMRKSPGKSVVQVNGKSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKR 617
             IY ++  +  ++K+
Sbjct: 620 LHIYAVLGNLAMQMKQ 635

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C8Q2 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-E1 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 678.7 bits (1750), Expect = 6.4e-194
Identity = 324/593 (54.64%), Postives = 422/593 (71.16%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WN  IR+AVN   P ++L+LFR+MK  G +PNNFTFPF+AKACA+L+++   +++H H++
Sbjct: 20  WNLQIREAVNRNDPVESLLLFREMKRGGFEPNNFTFPFVAKACARLADVGCCEMVHAHLI 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF SD+FV TA VDM+VKC  V+ A  +FE+MP RD  +WNAM+ GF Q G  D+ F 
Sbjct: 80  KSPFWSDVFVGTATVDMFVKCNSVDYAAKVFERMPERDATTWNAMLSGFCQSGHTDKAFS 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF  M L  I PD  TV+ L ++    KSL+ L+A+HA+GI  G+D  V+VANTWI+ Y 
Sbjct: 140 LFREMRLNEITPDSVTVMTLIQSASFEKSLKLLEAMHAVGIRLGVDVQVTVANTWISTYG 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCG+L  A++VF+ I +  R+ VSWNS+   Y+ F    DA   Y  ++ + FKPD ST 
Sbjct: 200 KCGDLDSAKLVFEAIDRGDRTVVSWNSMFKAYSVFGEAFDAFGLYCLMLREEFKPDLSTF 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           I+L +SC  PE L  G LIH H + LG D DI   NT ISMYS+  D CSAR LFD M+ 
Sbjct: 260 INLAASCQNPETLTQGRLIHSHAIHLGTDQDIEAINTFISMYSKSEDTCSARLLFDIMTS 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWT MISGY+E G +DEAL LF+AM ++GEKPDLVT+LSLI GCGK G+LE G WI
Sbjct: 320 RTCVSWTVMISGYAEKGDMDEALALFHAMIKSGEKPDLVTLLSLISGCGKFGSLETGKWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQD-VVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGE 420
           +  + ++G K+D V++ NALIDMY KCGS+ +ARD+F   P +T+V+WT MIA  ALNG 
Sbjct: 380 DARADIYGCKRDNVMICNALIDMYSKCGSIHEARDIFDNTPEKTVVTWTTMIAGYALNGI 439

Query: 421 FREALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYS 480
           F EAL +F  M +   KPNH+TF+AVLQAC+H G LEKG E F +M + Y I+PGLDHYS
Sbjct: 440 FLEALKLFSKMIDLDYKPNHITFLAVLQACAHSGSLEKGWEYFHIMKQVYNISPGLDHYS 499

Query: 481 CMIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQ 540
           CM+DLLGRKGKL EALE+I++M  +PD GIWGALL ACKIHRN++I E  + +LF L+PQ
Sbjct: 500 CMVDLLGRKGKLEEALELIRNMSAKPDAGIWGALLNACKIHRNVKIAEQAAESLFNLEPQ 559

Query: 541 VAVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGV 593
           +A  +  +AN+Y A G W+  A+ R +MK R +KK  G S I +  K H+F V
Sbjct: 560 MAAPYVEMANIYAAAGMWDGFARIRSIMKQRNIKKYPGESVIQVNGKNHSFTV 612

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SHZ8 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g22070 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H41 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 449.9 bits (1156), Expect = 4.9e-125
Identity = 257/703 (36.56%), Postives = 370/703 (52.63%), Query Frame = 0


Query: 39  IAKACAKLSNLCNTQIIHTHVVKSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPV-- 98
           + K+  K +     Q++H  V+KS     +++   ++++Y K      A  LF++MP+  
Sbjct: 20  LQKSVNKSNGRFTAQLVHCRVIKSGLMFSVYLMNNLMNVYSKTGYALHARKLFDEMPLRT 79

Query: 99  -----------------------------RDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFHLFVGMGL 158
                                        RD  SW  MI+G+   G   +   +   M  
Sbjct: 80  AFSWNTVLSAYSKRGDMDSTCEFFDQLPQRDSVSWTTMIVGYKNIGQYHKAIRVMGDMVK 139

Query: 159 VGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYSKCGELQV 218
            GI P   T+  +  +V + + +   K VH+  ++ GL  +VSV+N+ +  Y+KCG+  +
Sbjct: 140 EGIEPTQFTLTNVLASVAATRCMETGKKVHSFIVKLGLRGNVSVSNSLLNMYAKCGDPMM 199

Query: 219 AEMVFKGI-----------------------------QKHARSSVSWNSLISCYAKFERY 278
           A+ VF  +                             Q   R  V+WNS+IS + +    
Sbjct: 200 AKFVFDRMVVRDISSWNAMIALHMQVGQMDLAMAQFEQMAERDIVTWNSMISGFNQRGYD 259

Query: 279 LDAVNTYKGLICDG-FKPDASTIISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNT 338
           L A++ +  ++ D    PD  T+ S+LS+C   E L  G  IH H V  G D    + N 
Sbjct: 260 LRALDIFSKMLRDSLLSPDRFTLASVLSACANLEKLCIGKQIHSHIVTTGFDISGIVLNA 319

Query: 339 LISMYSRC---------------------------------GDICSARTLFDGMSIRTCV 398
           LISMYSRC                                 GD+  A+ +F  +  R  V
Sbjct: 320 LISMYSRCGGVETARRLIEQRGTKDLKIEGFTALLDGYIKLGDMNQAKNIFVSLKDRDVV 379

Query: 399 SWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWIERYS 458
           +WTAMI GY + G   EA+ LF +M   G++P+  T+ +++       +L  G  I   +
Sbjct: 380 AWTAMIVGYEQHGSYGEAINLFRSMVGGGQRPNSYTLAAMLSVASSLASLSHGKQIHGSA 439

Query: 459 YLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLP-NRTIVSWTAMIAACALNGEFREA 518
              G    V VSNALI MY K G+++ A   F  +   R  VSWT+MI A A +G   EA
Sbjct: 440 VKSGEIYSVSVSNALITMYAKAGNITSASRAFDLIRCERDTVSWTSMIIALAQHGHAEEA 499

Query: 519 LDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSCMID 578
           L++F  M   G++P+H+T+V V  AC+H G + +GR+ F MM +   I P L HY+CM+D
Sbjct: 500 LELFETMLMEGLRPDHITYVGVFSACTHAGLVNQGRQYFDMMKDVDKIIPTLSHYACMVD 559

Query: 579 LLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQVAVS 638
           L GR G L EA E I+ MP+EPDV  WG+LL AC++H+N+ +G+  +  L  L+P+ + +
Sbjct: 560 LFGRAGLLQEAQEFIEKMPIEPDVVTWGSLLSACRVHKNIDLGKVAAERLLLLEPENSGA 619

Query: 639 FSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWKNEI 647
           +SALAN+Y ACGKWE AAK RK MKD RVKK +GFSWI +++KVH FGVED   P KNEI
Sbjct: 620 YSALANLYSACGKWEEAAKIRKSMKDGRVKKEQGFSWIEVKHKVHVFGVEDGTHPEKNEI 679

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3E6Q1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g11290, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H40 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 1.0e-122
Identity = 227/631 (35.97%), Postives = 358/631 (56.74%), Query Frame = 0


Query: 16  KALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVVKSPFHSDIFVQTAMV 75
           KAL  F +M+ + ++P  + F ++ K C   + L   + IH  +VKS F  D+F  T + 
Sbjct: 118 KALQFFVRMRYDDVEPVVYNFTYLLKVCGDEAELRVGKEIHGLLVKSGFSLDLFAMTGLE 177

Query: 76  DMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFHLFVGMGLVGIRPDPA 135
           +MY KC +V +A  +F++MP RD+ SWN ++ G++Q G       +   M    ++P   
Sbjct: 178 NMYAKCRQVNEARKVFDRMPERDLVSWNTIVAGYSQNGMARMALEMVKSMCEENLKPSFI 237

Query: 136 TVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYSKCGELQVAEMVFKGI 195
           T++ +  AV + + +   K +H   + +G D+ V+++   +  Y+KCG L+ A  +F G+
Sbjct: 238 TIVSVLPAVSALRLISVGKEIHGYAMRSGFDSLVNISTALVDMYAKCGSLETARQLFDGM 297

Query: 196 QKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTIISLLSSCMQPEALVY 255
            +  R+ VSWNS+I  Y + E   +A+  ++ ++ +G KP   +++  L +C     L  
Sbjct: 298 LE--RNVVSWNSMIDAYVQNENPKEAMLIFQKMLDEGVKPTDVSVMGALHACADLGDLER 357

Query: 256 GSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSIRTCVSWTAMISGYSE 315
           G  IH   V+LG D ++S+ N+LISMY +C ++ +A ++F  +  RT VSW AMI G+++
Sbjct: 358 GRFIHKLSVELGLDRNVSVVNSLISMYCKCKEVDTAASMFGKLQSRTLVSWNAMILGFAQ 417

Query: 316 VGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWIERYSYLHGLKQDVVV 375
            GR  +AL  F+ M     KPD  T +S+I    +        WI        L ++V V
Sbjct: 418 NGRPIDALNYFSQMRSRTVKPDTFTYVSVITAIAELSITHHAKWIHGVVMRSCLDKNVFV 477

Query: 376 SNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEFREALDIFHLMSESGI 435
           + AL+DMY KCG++  AR +F  +  R + +W AMI     +G  + AL++F  M +  I
Sbjct: 478 TTALVDMYAKCGAIMIARLIFDMMSERHVTTWNAMIDGYGTHGFGKAALELFEEMQKGTI 537

Query: 436 KPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSCMIDLLGRKGKLIEAL 495
           KPN VTF++V+ ACSH G +E G +CF MM E Y I   +DHY  M+DLLGR G+L EA 
Sbjct: 538 KPNGVTFLSVISACSHSGLVEAGLKCFYMMKENYSIELSMDHYGAMVDLLGRAGRLNEAW 597

Query: 496 EVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQVAVSFSALANVYLACG 555
           + I  MP++P V ++GA+LGAC+IH+N+   E  +  LFEL P        LAN+Y A  
Sbjct: 598 DFIMQMPVKPAVNVYGAMLGACQIHKNVNFAEKAAERLFELNPDDGGYHVLLANIYRAAS 657

Query: 556 KWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWKNEIYKIMDEIWKEIK 615
            WE   + R  M  + ++K  G S + I+N+VH+F       P   +IY  ++++   IK
Sbjct: 658 MWEKVGQVRVSMLRQGLRKTPGCSMVEIKNEVHSFFSGSTAHPDSKKIYAFLEKLICHIK 717

Query: 616 RMGFIPDTESVLHDLEEEVKEQTRKHHSEKL 647
             G++PDT  VL  +E +VKEQ    HSEKL
Sbjct: 718 EAGYVPDTNLVL-GVENDVKEQLLSTHSEKL 745

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LN01 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H12 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 426.0 bits (1094), Expect = 7.5e-118
Identity = 229/648 (35.34%), Postives = 351/648 (54.17%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WN+  R       P  AL L+  M   GL PN++TFPF+ K+CAK       Q IH HV+
Sbjct: 102 WNTMFRGHALSSDPVSALKLYVCMISLGLLPNSYTFPFVLKSCAKSKAFKEGQQIHGHVL 161

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           K     D++V T+++ MYV+  ++EDA+ +F+K P RD+ S+ A+I G+A  G  +    
Sbjct: 162 KLGCDLDLYVHTSLISMYVQNGRLEDAHKVFDKSPHRDVVSYTALIKGYASRGYIENAQK 221

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF                                                          
Sbjct: 222 LF---------------------------------------------------------- 281

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
              E+ V ++            VSWN++IS YA+   Y +A+  +K ++    +PD ST+
Sbjct: 282 --DEIPVKDV------------VSWNAMISGYAETGNYKEALELFKDMMKTNVRPDESTM 341

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ++++S+C Q  ++  G  +H      G  S++ + N LI +YS+CG++ +A  LF+ +  
Sbjct: 342 VTVVSACAQSGSIELGRQVHLWIDDHGFGSNLKIVNALIDLYSKCGELETACGLFERLPY 401

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           +  +SW  +I GY+ +    EAL+LF  M  +GE P+ VT+LS++  C   GA+++G WI
Sbjct: 402 KDVISWNTLIGGYTHMNLYKEALLLFQEMLRSGETPNDVTMLSILPACAHLGAIDIGRWI 461

Query: 361 ERY--SYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNG 420
             Y    L G+     +  +LIDMY KCG +  A  VF  + ++++ SW AMI   A++G
Sbjct: 462 HVYIDKRLKGVTNASSLRTSLIDMYAKCGDIEAAHQVFNSILHKSLSSWNAMIFGFAMHG 521

Query: 421 EFREALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHY 480
               + D+F  M + GI+P+ +TFV +L ACSH G L+ GR  F  MT+ Y + P L+HY
Sbjct: 522 RADASFDLFSRMRKIGIQPDDITFVGLLSACSHSGMLDLGRHIFRTMTQDYKMTPKLEHY 581

Query: 481 SCMIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQP 540
            CMIDLLG  G   EA E+I  M MEPD  IW +LL ACK+H N+++GE  + NL +++P
Sbjct: 582 GCMIDLLGHSGLFKEAEEMINMMEMEPDGVIWCSLLKACKMHGNVELGESFAENLIKIEP 641

Query: 541 QVAVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRP 600
           +   S+  L+N+Y + G+W   AKTR L+ D+ +KK  G S I I + VH F + D   P
Sbjct: 642 ENPGSYVLLSNIYASAGRWNEVAKTRALLNDKGMKKVPGCSSIEIDSVVHEFIIGDKFHP 677

Query: 601 WKNEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVLHDLEEEVKEQTRKHHSEKL 647
              EIY +++E+   +++ GF+PDT  VL ++EEE KE   +HHSEKL
Sbjct: 702 RNREIYGMLEEMEVLLEKAGFVPDTSEVLQEMEEEWKEGALRHHSEKL 677

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LFL5 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g16860 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H92 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 4.9e-117
Identity = 235/696 (33.76%), Postives = 375/696 (53.88%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS IR   ++G   K L LF  M      P+N+TFPF+ KAC ++S++   +  H   +
Sbjct: 95  WNSLIRSYGDNGCANKCLYLFGLMHSLSWTPDNYTFPFVFKACGEISSVRCGESAHALSL 154

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
            + F S++FV  A+V MY +C  + DA  +F++M V D+ SWN++I  +A+ G P     
Sbjct: 155 VTGFISNVFVGNALVAMYSRCRSLSDARKVFDEMSVWDVVSWNSIIESYAKLGKPKVALE 214

Query: 121 LFVGM-GLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAY 180
           +F  M    G RPD  T++ +     S  +    K +H   + + +  ++ V N  +  Y
Sbjct: 215 MFSRMTNEFGCRPDNITLVNVLPPCASLGTHSLGKQLHCFAVTSEMIQNMFVGNCLVDMY 274

Query: 181 SKCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTY-------------- 240
           +KCG +  A  VF  +    +  VSWN++++ Y++  R+ DAV  +              
Sbjct: 275 AKCGMMDEANTVFSNMS--VKDVVSWNAMVAGYSQIGRFEDAVRLFEKMQEEKIKMDVVT 334

Query: 241 ---------------------KGLICDGFKPDASTIISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGV 300
                                + ++  G KP+  T+IS+LS C    AL++G  IH + +
Sbjct: 335 WSAAISGYAQRGLGYEALGVCRQMLSSGIKPNEVTLISVLSGCASVGALMHGKEIHCYAI 394

Query: 301 QLGCD-------SDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMS--IRTCVSWTAMISGYSE 360
           +   D        +  + N LI MY++C  + +AR +FD +S   R  V+WT MI GYS+
Sbjct: 395 KYPIDLRKNGHGDENMVINQLIDMYAKCKKVDTARAMFDSLSPKERDVVTWTVMIGGYSQ 454

Query: 361 VGRIDEALVLFNAM--EEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWIERYSYLHGLKQDV 420
            G  ++AL L + M  E+   +P+  T+   ++ C    AL +G  I  Y+  +  +Q+ 
Sbjct: 455 HGDANKALELLSEMFEEDCQTRPNAFTISCALVACASLAALRIGKQIHAYALRN--QQNA 514

Query: 421 V---VSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEFREALDIFHLM 480
           V   VSN LIDMY KCGS+SDAR VF  +  +  V+WT+++    ++G   EAL IF  M
Sbjct: 515 VPLFVSNCLIDMYAKCGSISDARLVFDNMMAKNEVTWTSLMTGYGMHGYGEEALGIFDEM 574

Query: 481 SESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSCMIDLLGRKGK 540
              G K + VT + VL ACSH G +++G E F  M   +G++PG +HY+C++DLLGR G+
Sbjct: 575 RRIGFKLDGVTLLVVLYACSHSGMIDQGMEYFNRMKTVFGVSPGPEHYACLVDLLGRAGR 634

Query: 541 LIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQVAVSFSALANV 600
           L  AL +I++MPMEP   +W A L  C+IH  +++GEY +  + EL      S++ L+N+
Sbjct: 635 LNAALRLIEEMPMEPPPVVWVAFLSCCRIHGKVELGEYAAEKITELASNHDGSYTLLSNL 694

Query: 601 YLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWKNEIYKIMDEI 647
           Y   G+W++  + R LM+ + VKK  G SW+        F V D   P   EIY+++ + 
Sbjct: 695 YANAGRWKDVTRIRSLMRHKGVKKRPGCSWVEGIKGTTTFFVGDKTHPHAKEIYQVLLDH 754

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BUQ5 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005926 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1154.8 bits (2986), Expect = 0.0e+00
Identity = 563/615 (91.54%), Postives = 581/615 (94.47%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH
Sbjct: 80  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS
Sbjct: 140 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI
Sbjct: 200 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDI SARTLFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDIFSARTLFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLI GCGKAGALELGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLISGCGKAGALELGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALDIFHLMSESGI PNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDIFHLMSESGIMPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           AVSF  +AN+Y + G+W+  A  RK+M+  +V+K+ G S + +  K H F VED      
Sbjct: 560 AVSFVEMANIYASVGRWDRVADMRKMMRSNKVRKSPGKSTVQVNGKSHVFIVEDRGHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIK 616
             IY +++ +  ++K
Sbjct: 620 LLIYAVLENLTLQLK 634

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KK94 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G501860 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 993.0 bits (2566), Expect = 5.7e-286
Identity = 478/619 (77.22%), Postives = 541/619 (87.40%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IR AVN G+  KAL LF Q+KLNGLQPNNFTFPF++KACAKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRGAVNQGNASKALALFHQLKLNGLQPNNFTFPFLSKACAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF+SDI+VQTAMVDMYVKC KV+DAYNLF+KMPVR+IASWNAMIIGF+Q GS DRVF+
Sbjct: 80  KSPFYSDIYVQTAMVDMYVKCGKVDDAYNLFDKMPVRNIASWNAMIIGFSQIGSLDRVFN 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVG RPD ATVIGLTRAV+SAKSLRFLKAVHAIGIETGLDAD SV+NTWIAAYS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGTRPDAATVIGLTRAVISAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADTSVSNTWIAAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK ARSSVSWNSLI+CYA F +Y+DAV +YKGL+CDGFKPDASTI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFHGIQKTARSSVSWNSLIACYAHFGKYVDAVKSYKGLLCDGFKPDASTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLLSSC QPEAL+YG LIHGHG QLGCDSDISL NTLISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLSSCQQPEALIYGFLIHGHGFQLGCDSDISLINTLISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGR+D+ALVLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GAL LGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRVDDALVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALGLGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ LH LK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR++FY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASLHELKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDAREIFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F L+SESGI+PN++TF+AVLQAC H GYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFSLLSESGIEPNNITFLAVLQACCHGGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPM+PD GIWGALLGACKIH NM+IGEYVSR LFELQP+V
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMKPDEGIWGALLGACKIHNNMEIGEYVSRYLFELQPRV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           AVSF  +AN+Y + G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +    H F VED      
Sbjct: 560 AVSFVEMANIYASVGRWDEVAAMRKTMRSNQMRKSPGKSVVQVNGMSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKRMGF 620
             IY+ +  +  ++K+  F
Sbjct: 620 LLIYEALGNLAMQMKQKEF 638

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CMI9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold255G002380 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 992.3 bits (2564), Expect = 9.7e-286
Identity = 478/627 (76.24%), Postives = 543/627 (86.60%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IR AVN G+  KAL LF Q+KLNGLQPNNFTFPF+AKACAKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRGAVNQGNASKALALFHQLKLNGLQPNNFTFPFLAKACAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF+SDI+VQTAMVDMYVKC K EDAYNLF+KMPVR+IASWNAMI+GF+Q GS DRVF+
Sbjct: 80  KSPFYSDIYVQTAMVDMYVKCGKAEDAYNLFDKMPVRNIASWNAMIMGFSQIGSLDRVFN 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVG RPD ATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDAD SV+NTWI+AYS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGTRPDAATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADNSVSNTWISAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK+ARSSVSWNSLI+CYA F + +DAVN+YKGL+CDGFKPDA TI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFHGIQKNARSSVSWNSLIACYAHFGKNVDAVNSYKGLLCDGFKPDACTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLL SC QPEAL+YGSLIHGHG QLGCDSDISL NTLISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLCSCQQPEALIYGSLIHGHGFQLGCDSDISLINTLISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGR+D+ALVLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GAL LGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRVDDALVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALGLGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ LHGLK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR+VFY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASLHGLKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDAREVFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F L+SESGI+PN++TF+AVLQAC H GYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFSLLSESGIEPNNITFLAVLQACCHGGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPM+PD GIWGALLGACKIH NM+IGEYVSR+LFELQP+V
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMKPDEGIWGALLGACKIHNNMEIGEYVSRHLFELQPRV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           A SF  +AN+Y   G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +    H F VED      
Sbjct: 560 AASFVEMANIYALVGRWDEVAAMRKRMRSNQMRKSPGKSVVQVNGMSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVL 628
             IY+ +  +  ++K+  F    + ++
Sbjct: 620 LLIYEALGNLAMQMKQKEFSSHAQRII 646

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B296 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485014 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 991.9 bits (2563), Expect = 1.3e-285
Identity = 481/640 (75.16%), Postives = 551/640 (86.09%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IR AVN G+  KAL LF Q+KLNGLQPNNFTFPF+AKACAKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRGAVNQGNASKALALFHQLKLNGLQPNNFTFPFLAKACAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF+SDI+VQTAMVDMYVKC K EDAYNLF+KMPVR+IASWNAMI+GF+Q GS DRVF+
Sbjct: 80  KSPFYSDIYVQTAMVDMYVKCGKAEDAYNLFDKMPVRNIASWNAMIMGFSQIGSLDRVFN 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVG RPD ATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDAD SV+NTWI+AYS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGTRPDAATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADNSVSNTWISAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK+ARSSVSWNSLI+CYA F + +DAVN+YKGL+CDGFKPDA TI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFHGIQKNARSSVSWNSLIACYAHFGKNVDAVNSYKGLLCDGFKPDACTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLL SC QPEAL+YGSLIHGHG QLGCDSDISL NTLISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLCSCQQPEALIYGSLIHGHGFQLGCDSDISLINTLISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGR+D+ALVLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GAL LGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRVDDALVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALGLGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ LHGLK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR+VFY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASLHGLKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDAREVFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F L+SESGI+PN++TF+AVLQAC H GYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFSLLSESGIEPNNITFLAVLQACCHGGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPM+PD GIWGALLGACKIH NM+IGEYVSR+LFELQP+V
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMKPDEGIWGALLGACKIHNNMEIGEYVSRHLFELQPRV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           A SF  +AN+Y   G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +    H F VED      
Sbjct: 560 AASFVEMANIYALVGRWDEVAAMRKRMRSNQMRKSPGKSVVQVNGMSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVLH---DLEEEVKEQ 638
             IY+ +  +  ++K+  F    + ++    DL ++++E+
Sbjct: 620 LLIYEALGNLAMQMKQKEFSSHAQRIIELDTDLLKDMQER 659

[Close]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B2E4 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485014 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 990.7 bits (2560), Expect = 2.8e-285
Identity = 481/639 (75.27%), Postives = 547/639 (85.60%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS+IR AVN G+  KAL LF Q+KLNGLQPNNFTFPF+AKACAKLS+L N+QIIHTHVV
Sbjct: 20  WNSSIRGAVNQGNASKALALFHQLKLNGLQPNNFTFPFLAKACAKLSHLTNSQIIHTHVV 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF+SDI+VQTAMVDMYVKC K EDAYNLF+KMPVR+IASWNAMI+GF+Q GS DRVF+
Sbjct: 80  KSPFYSDIYVQTAMVDMYVKCGKAEDAYNLFDKMPVRNIASWNAMIMGFSQIGSLDRVFN 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF+GM LVG RPD ATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDAD SV+NTWI+AYS
Sbjct: 140 LFMGMRLVGTRPDAATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADNSVSNTWISAYS 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCGELQ+A+MVF GIQK+ARSSVSWNSLI+CYA F + +DAVN+YKGL+CDGFKPDA TI
Sbjct: 200 KCGELQLAKMVFHGIQKNARSSVSWNSLIACYAHFGKNVDAVNSYKGLLCDGFKPDACTI 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ISLL SC QPEAL+YGSLIHGHG QLGCDSDISL NTLISMYSRCGDI SA  LFDGMSI
Sbjct: 260 ISLLCSCQQPEALIYGSLIHGHGFQLGCDSDISLINTLISMYSRCGDISSATILFDGMSI 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWTAMISGYSEVGR+D+ALVLFNAMEE GEKPD+VTVLSLI GCGK GAL LGHWI
Sbjct: 320 RTCVSWTAMISGYSEVGRVDDALVLFNAMEETGEKPDIVTVLSLISGCGKTGALGLGHWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEF 420
           + Y+ LHGLK+DVVV NALIDMY KCGS++DAR+VFY LPNRT+VSWTAMIAACALNGEF
Sbjct: 380 DNYASLHGLKKDVVVCNALIDMYAKCGSLNDAREVFYSLPNRTVVSWTAMIAACALNGEF 439

Query: 421 REALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 480
           REALD+F L+SESGI+PN++TF+AVLQAC H GYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC
Sbjct: 440 REALDLFSLLSESGIEPNNITFLAVLQACCHGGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSC 499

Query: 481 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQV 540
           MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPM+PD GIWGALLGACKIH NM+IGEYVSR+LFELQP+V
Sbjct: 500 MIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMKPDEGIWGALLGACKIHNNMEIGEYVSRHLFELQPRV 559

Query: 541 AVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWK 600
           A SF  +AN+Y   G+W+  A  RK M+  +++K+ G S + +    H F VED      
Sbjct: 560 AASFVEMANIYALVGRWDEVAAMRKRMRSNQMRKSPGKSVVQVNGMSHVFFVEDRSHHDS 619

Query: 601 NEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVLHDLEEEVKEQTR 640
             IY+ +  +  ++K+  F    + ++     + KE  R
Sbjct: 620 LLIYEALGNLAMQMKQKEFSSHAQRIIELDTMKSKEPRR 658

[Close]

BLAST of MS010496 vs. TAIR 10
Match: AT4G19191.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 678.7 bits (1750), Expect = 4.6e-195
Identity = 324/593 (54.64%), Postives = 422/593 (71.16%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WN  IR+AVN   P ++L+LFR+MK  G +PNNFTFPF+AKACA+L+++   +++H H++
Sbjct: 20  WNLQIREAVNRNDPVESLLLFREMKRGGFEPNNFTFPFVAKACARLADVGCCEMVHAHLI 79

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           KSPF SD+FV TA VDM+VKC  V+ A  +FE+MP RD  +WNAM+ GF Q G  D+ F 
Sbjct: 80  KSPFWSDVFVGTATVDMFVKCNSVDYAAKVFERMPERDATTWNAMLSGFCQSGHTDKAFS 139

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF  M L  I PD  TV+ L ++    KSL+ L+A+HA+GI  G+D  V+VANTWI+ Y 
Sbjct: 140 LFREMRLNEITPDSVTVMTLIQSASFEKSLKLLEAMHAVGIRLGVDVQVTVANTWISTYG 199

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
           KCG+L  A++VF+ I +  R+ VSWNS+   Y+ F    DA   Y  ++ + FKPD ST 
Sbjct: 200 KCGDLDSAKLVFEAIDRGDRTVVSWNSMFKAYSVFGEAFDAFGLYCLMLREEFKPDLSTF 259

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           I+L +SC  PE L  G LIH H + LG D DI   NT ISMYS+  D CSAR LFD M+ 
Sbjct: 260 INLAASCQNPETLTQGRLIHSHAIHLGTDQDIEAINTFISMYSKSEDTCSARLLFDIMTS 319

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           RTCVSWT MISGY+E G +DEAL LF+AM ++GEKPDLVT+LSLI GCGK G+LE G WI
Sbjct: 320 RTCVSWTVMISGYAEKGDMDEALALFHAMIKSGEKPDLVTLLSLISGCGKFGSLETGKWI 379

Query: 361 ERYSYLHGLKQD-VVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGE 420
           +  + ++G K+D V++ NALIDMY KCGS+ +ARD+F   P +T+V+WT MIA  ALNG 
Sbjct: 380 DARADIYGCKRDNVMICNALIDMYSKCGSIHEARDIFDNTPEKTVVTWTTMIAGYALNGI 439

Query: 421 FREALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYS 480
           F EAL +F  M +   KPNH+TF+AVLQAC+H G LEKG E F +M + Y I+PGLDHYS
Sbjct: 440 FLEALKLFSKMIDLDYKPNHITFLAVLQACAHSGSLEKGWEYFHIMKQVYNISPGLDHYS 499

Query: 481 CMIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQ 540
           CM+DLLGRKGKL EALE+I++M  +PD GIWGALL ACKIHRN++I E  + +LF L+PQ
Sbjct: 500 CMVDLLGRKGKLEEALELIRNMSAKPDAGIWGALLNACKIHRNVKIAEQAAESLFNLEPQ 559

Query: 541 VAVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGV 593
           +A  +  +AN+Y A G W+  A+ R +MK R +KK  G S I +  K H+F V
Sbjct: 560 MAAPYVEMANIYAAAGMWDGFARIRSIMKQRNIKKYPGESVIQVNGKNHSFTV 612

[Close]

BLAST of MS010496 vs. TAIR 10
Match: AT2G22070.1 (pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein )

HSP 1 Score: 449.9 bits (1156), Expect = 3.5e-126
Identity = 257/703 (36.56%), Postives = 370/703 (52.63%), Query Frame = 0


Query: 39  IAKACAKLSNLCNTQIIHTHVVKSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPV-- 98
           + K+  K +     Q++H  V+KS     +++   ++++Y K      A  LF++MP+  
Sbjct: 20  LQKSVNKSNGRFTAQLVHCRVIKSGLMFSVYLMNNLMNVYSKTGYALHARKLFDEMPLRT 79

Query: 99  -----------------------------RDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFHLFVGMGL 158
                                        RD  SW  MI+G+   G   +   +   M  
Sbjct: 80  AFSWNTVLSAYSKRGDMDSTCEFFDQLPQRDSVSWTTMIVGYKNIGQYHKAIRVMGDMVK 139

Query: 159 VGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYSKCGELQV 218
            GI P   T+  +  +V + + +   K VH+  ++ GL  +VSV+N+ +  Y+KCG+  +
Sbjct: 140 EGIEPTQFTLTNVLASVAATRCMETGKKVHSFIVKLGLRGNVSVSNSLLNMYAKCGDPMM 199

Query: 219 AEMVFKGI-----------------------------QKHARSSVSWNSLISCYAKFERY 278
           A+ VF  +                             Q   R  V+WNS+IS + +    
Sbjct: 200 AKFVFDRMVVRDISSWNAMIALHMQVGQMDLAMAQFEQMAERDIVTWNSMISGFNQRGYD 259

Query: 279 LDAVNTYKGLICDG-FKPDASTIISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNT 338
           L A++ +  ++ D    PD  T+ S+LS+C   E L  G  IH H V  G D    + N 
Sbjct: 260 LRALDIFSKMLRDSLLSPDRFTLASVLSACANLEKLCIGKQIHSHIVTTGFDISGIVLNA 319

Query: 339 LISMYSRC---------------------------------GDICSARTLFDGMSIRTCV 398
           LISMYSRC                                 GD+  A+ +F  +  R  V
Sbjct: 320 LISMYSRCGGVETARRLIEQRGTKDLKIEGFTALLDGYIKLGDMNQAKNIFVSLKDRDVV 379

Query: 399 SWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWIERYS 458
           +WTAMI GY + G   EA+ LF +M   G++P+  T+ +++       +L  G  I   +
Sbjct: 380 AWTAMIVGYEQHGSYGEAINLFRSMVGGGQRPNSYTLAAMLSVASSLASLSHGKQIHGSA 439

Query: 459 YLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLP-NRTIVSWTAMIAACALNGEFREA 518
              G    V VSNALI MY K G+++ A   F  +   R  VSWT+MI A A +G   EA
Sbjct: 440 VKSGEIYSVSVSNALITMYAKAGNITSASRAFDLIRCERDTVSWTSMIIALAQHGHAEEA 499

Query: 519 LDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSCMID 578
           L++F  M   G++P+H+T+V V  AC+H G + +GR+ F MM +   I P L HY+CM+D
Sbjct: 500 LELFETMLMEGLRPDHITYVGVFSACTHAGLVNQGRQYFDMMKDVDKIIPTLSHYACMVD 559

Query: 579 LLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQVAVS 638
           L GR G L EA E I+ MP+EPDV  WG+LL AC++H+N+ +G+  +  L  L+P+ + +
Sbjct: 560 LFGRAGLLQEAQEFIEKMPIEPDVVTWGSLLSACRVHKNIDLGKVAAERLLLLEPENSGA 619

Query: 639 FSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWKNEI 647
           +SALAN+Y ACGKWE AAK RK MKD RVKK +GFSWI +++KVH FGVED   P KNEI
Sbjct: 620 YSALANLYSACGKWEEAAKIRKSMKDGRVKKEQGFSWIEVKHKVHVFGVEDGTHPEKNEI 679

[Close]

BLAST of MS010496 vs. TAIR 10
Match: AT1G11290.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein )

HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 7.2e-124
Identity = 227/631 (35.97%), Postives = 358/631 (56.74%), Query Frame = 0


Query: 16  KALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVVKSPFHSDIFVQTAMV 75
           KAL  F +M+ + ++P  + F ++ K C   + L   + IH  +VKS F  D+F  T + 
Sbjct: 118 KALQFFVRMRYDDVEPVVYNFTYLLKVCGDEAELRVGKEIHGLLVKSGFSLDLFAMTGLE 177

Query: 76  DMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFHLFVGMGLVGIRPDPA 135
           +MY KC +V +A  +F++MP RD+ SWN ++ G++Q G       +   M    ++P   
Sbjct: 178 NMYAKCRQVNEARKVFDRMPERDLVSWNTIVAGYSQNGMARMALEMVKSMCEENLKPSFI 237

Query: 136 TVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYSKCGELQVAEMVFKGI 195
           T++ +  AV + + +   K +H   + +G D+ V+++   +  Y+KCG L+ A  +F G+
Sbjct: 238 TIVSVLPAVSALRLISVGKEIHGYAMRSGFDSLVNISTALVDMYAKCGSLETARQLFDGM 297

Query: 196 QKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTIISLLSSCMQPEALVY 255
            +  R+ VSWNS+I  Y + E   +A+  ++ ++ +G KP   +++  L +C     L  
Sbjct: 298 LE--RNVVSWNSMIDAYVQNENPKEAMLIFQKMLDEGVKPTDVSVMGALHACADLGDLER 357

Query: 256 GSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSIRTCVSWTAMISGYSE 315
           G  IH   V+LG D ++S+ N+LISMY +C ++ +A ++F  +  RT VSW AMI G+++
Sbjct: 358 GRFIHKLSVELGLDRNVSVVNSLISMYCKCKEVDTAASMFGKLQSRTLVSWNAMILGFAQ 417

Query: 316 VGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWIERYSYLHGLKQDVVV 375
            GR  +AL  F+ M     KPD  T +S+I    +        WI        L ++V V
Sbjct: 418 NGRPIDALNYFSQMRSRTVKPDTFTYVSVITAIAELSITHHAKWIHGVVMRSCLDKNVFV 477

Query: 376 SNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEFREALDIFHLMSESGI 435
           + AL+DMY KCG++  AR +F  +  R + +W AMI     +G  + AL++F  M +  I
Sbjct: 478 TTALVDMYAKCGAIMIARLIFDMMSERHVTTWNAMIDGYGTHGFGKAALELFEEMQKGTI 537

Query: 436 KPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSCMIDLLGRKGKLIEAL 495
           KPN VTF++V+ ACSH G +E G +CF MM E Y I   +DHY  M+DLLGR G+L EA 
Sbjct: 538 KPNGVTFLSVISACSHSGLVEAGLKCFYMMKENYSIELSMDHYGAMVDLLGRAGRLNEAW 597

Query: 496 EVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQVAVSFSALANVYLACG 555
           + I  MP++P V ++GA+LGAC+IH+N+   E  +  LFEL P        LAN+Y A  
Sbjct: 598 DFIMQMPVKPAVNVYGAMLGACQIHKNVNFAEKAAERLFELNPDDGGYHVLLANIYRAAS 657

Query: 556 KWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWKNEIYKIMDEIWKEIK 615
            WE   + R  M  + ++K  G S + I+N+VH+F       P   +IY  ++++   IK
Sbjct: 658 MWEKVGQVRVSMLRQGLRKTPGCSMVEIKNEVHSFFSGSTAHPDSKKIYAFLEKLICHIK 717

Query: 616 RMGFIPDTESVLHDLEEEVKEQTRKHHSEKL 647
             G++PDT  VL  +E +VKEQ    HSEKL
Sbjct: 718 EAGYVPDTNLVL-GVENDVKEQLLSTHSEKL 745

[Close]

BLAST of MS010496 vs. TAIR 10
Match: AT1G08070.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 426.0 bits (1094), Expect = 5.3e-119
Identity = 229/648 (35.34%), Postives = 351/648 (54.17%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WN+  R       P  AL L+  M   GL PN++TFPF+ K+CAK       Q IH HV+
Sbjct: 102 WNTMFRGHALSSDPVSALKLYVCMISLGLLPNSYTFPFVLKSCAKSKAFKEGQQIHGHVL 161

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
           K     D++V T+++ MYV+  ++EDA+ +F+K P RD+ S+ A+I G+A  G  +    
Sbjct: 162 KLGCDLDLYVHTSLISMYVQNGRLEDAHKVFDKSPHRDVVSYTALIKGYASRGYIENAQK 221

Query: 121 LFVGMGLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAYS 180
           LF                                                          
Sbjct: 222 LF---------------------------------------------------------- 281

Query: 181 KCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTYKGLICDGFKPDASTI 240
              E+ V ++            VSWN++IS YA+   Y +A+  +K ++    +PD ST+
Sbjct: 282 --DEIPVKDV------------VSWNAMISGYAETGNYKEALELFKDMMKTNVRPDESTM 341

Query: 241 ISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGVQLGCDSDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMSI 300
           ++++S+C Q  ++  G  +H      G  S++ + N LI +YS+CG++ +A  LF+ +  
Sbjct: 342 VTVVSACAQSGSIELGRQVHLWIDDHGFGSNLKIVNALIDLYSKCGELETACGLFERLPY 401

Query: 301 RTCVSWTAMISGYSEVGRIDEALVLFNAMEEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWI 360
           +  +SW  +I GY+ +    EAL+LF  M  +GE P+ VT+LS++  C   GA+++G WI
Sbjct: 402 KDVISWNTLIGGYTHMNLYKEALLLFQEMLRSGETPNDVTMLSILPACAHLGAIDIGRWI 461

Query: 361 ERY--SYLHGLKQDVVVSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNG 420
             Y    L G+     +  +LIDMY KCG +  A  VF  + ++++ SW AMI   A++G
Sbjct: 462 HVYIDKRLKGVTNASSLRTSLIDMYAKCGDIEAAHQVFNSILHKSLSSWNAMIFGFAMHG 521

Query: 421 EFREALDIFHLMSESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHY 480
               + D+F  M + GI+P+ +TFV +L ACSH G L+ GR  F  MT+ Y + P L+HY
Sbjct: 522 RADASFDLFSRMRKIGIQPDDITFVGLLSACSHSGMLDLGRHIFRTMTQDYKMTPKLEHY 581

Query: 481 SCMIDLLGRKGKLIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQP 540
            CMIDLLG  G   EA E+I  M MEPD  IW +LL ACK+H N+++GE  + NL +++P
Sbjct: 582 GCMIDLLGHSGLFKEAEEMINMMEMEPDGVIWCSLLKACKMHGNVELGESFAENLIKIEP 641

Query: 541 QVAVSFSALANVYLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRP 600
           +   S+  L+N+Y + G+W   AKTR L+ D+ +KK  G S I I + VH F + D   P
Sbjct: 642 ENPGSYVLLSNIYASAGRWNEVAKTRALLNDKGMKKVPGCSSIEIDSVVHEFIIGDKFHP 677

Query: 601 WKNEIYKIMDEIWKEIKRMGFIPDTESVLHDLEEEVKEQTRKHHSEKL 647
              EIY +++E+   +++ GF+PDT  VL ++EEE KE   +HHSEKL
Sbjct: 702 RNREIYGMLEEMEVLLEKAGFVPDTSEVLQEMEEEWKEGALRHHSEKL 677

[Close]

BLAST of MS010496 vs. TAIR 10
Match: AT5G16860.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 3.5e-118
Identity = 235/696 (33.76%), Postives = 375/696 (53.88%), Query Frame = 0


Query: 1   WNSNIRDAVNHGHPFKALVLFRQMKLNGLQPNNFTFPFIAKACAKLSNLCNTQIIHTHVV 60
           WNS IR   ++G   K L LF  M      P+N+TFPF+ KAC ++S++   +  H   +
Sbjct: 95  WNSLIRSYGDNGCANKCLYLFGLMHSLSWTPDNYTFPFVFKACGEISSVRCGESAHALSL 154

Query: 61  KSPFHSDIFVQTAMVDMYVKCCKVEDAYNLFEKMPVRDIASWNAMIIGFAQFGSPDRVFH 120
            + F S++FV  A+V MY +C  + DA  +F++M V D+ SWN++I  +A+ G P     
Sbjct: 155 VTGFISNVFVGNALVAMYSRCRSLSDARKVFDEMSVWDVVSWNSIIESYAKLGKPKVALE 214

Query: 121 LFVGM-GLVGIRPDPATVIGLTRAVLSAKSLRFLKAVHAIGIETGLDADVSVANTWIAAY 180
           +F  M    G RPD  T++ +     S  +    K +H   + + +  ++ V N  +  Y
Sbjct: 215 MFSRMTNEFGCRPDNITLVNVLPPCASLGTHSLGKQLHCFAVTSEMIQNMFVGNCLVDMY 274

Query: 181 SKCGELQVAEMVFKGIQKHARSSVSWNSLISCYAKFERYLDAVNTY-------------- 240
           +KCG +  A  VF  +    +  VSWN++++ Y++  R+ DAV  +              
Sbjct: 275 AKCGMMDEANTVFSNMS--VKDVVSWNAMVAGYSQIGRFEDAVRLFEKMQEEKIKMDVVT 334

Query: 241 ---------------------KGLICDGFKPDASTIISLLSSCMQPEALVYGSLIHGHGV 300
                                + ++  G KP+  T+IS+LS C    AL++G  IH + +
Sbjct: 335 WSAAISGYAQRGLGYEALGVCRQMLSSGIKPNEVTLISVLSGCASVGALMHGKEIHCYAI 394

Query: 301 QLGCD-------SDISLTNTLISMYSRCGDICSARTLFDGMS--IRTCVSWTAMISGYSE 360
           +   D        +  + N LI MY++C  + +AR +FD +S   R  V+WT MI GYS+
Sbjct: 395 KYPIDLRKNGHGDENMVINQLIDMYAKCKKVDTARAMFDSLSPKERDVVTWTVMIGGYSQ 454

Query: 361 VGRIDEALVLFNAM--EEAGEKPDLVTVLSLILGCGKAGALELGHWIERYSYLHGLKQDV 420
            G  ++AL L + M  E+   +P+  T+   ++ C    AL +G  I  Y+  +  +Q+ 
Sbjct: 455 HGDANKALELLSEMFEEDCQTRPNAFTISCALVACASLAALRIGKQIHAYALRN--QQNA 514

Query: 421 V---VSNALIDMYGKCGSMSDARDVFYGLPNRTIVSWTAMIAACALNGEFREALDIFHLM 480
           V   VSN LIDMY KCGS+SDAR VF  +  +  V+WT+++    ++G   EAL IF  M
Sbjct: 515 VPLFVSNCLIDMYAKCGSISDARLVFDNMMAKNEVTWTSLMTGYGMHGYGEEALGIFDEM 574

Query: 481 SESGIKPNHVTFVAVLQACSHEGYLEKGRECFMMMTERYGINPGLDHYSCMIDLLGRKGK 540
              G K + VT + VL ACSH G +++G E F  M   +G++PG +HY+C++DLLGR G+
Sbjct: 575 RRIGFKLDGVTLLVVLYACSHSGMIDQGMEYFNRMKTVFGVSPGPEHYACLVDLLGRAGR 634

Query: 541 LIEALEVIQDMPMEPDVGIWGALLGACKIHRNMQIGEYVSRNLFELQPQVAVSFSALANV 600
           L  AL +I++MPMEP   +W A L  C+IH  +++GEY +  + EL      S++ L+N+
Sbjct: 635 LNAALRLIEEMPMEPPPVVWVAFLSCCRIHGKVELGEYAAEKITELASNHDGSYTLLSNL 694

Query: 601 YLACGKWENAAKTRKLMKDRRVKKNEGFSWIHIQNKVHAFGVEDVVRPWKNEIYKIMDEI 647
           Y   G+W++  + R LM+ + VKK  G SW+        F V D   P   EIY+++ + 
Sbjct: 695 YANAGRWKDVTRIRSLMRHKGVKKRPGCSWVEGIKGTTTFFVGDKTHPHAKEIYQVLLDH 754

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of MS010496 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022133316.1	0.0e+00	91.54	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X1 ...	[more]
XP_004143574.1	1.2e-285	77.22	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial [Cucumis sa...	[more]
KAA0036256.1	2.0e-285	76.24	pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK12650...	[more]
XP_008440672.1	2.6e-285	75.16	PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial ...	[more]
XP_038881350.1	5.8e-285	77.76	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial [Benincasa ...	[more]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
P0C8Q2	6.4e-194	54.64	Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial OS=Arabidop...	[more]
Q9SHZ8	4.9e-125	36.56	Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g22070 OS=Arabidopsis thaliana OX...	[more]
Q3E6Q1	1.0e-122	35.97	Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g11290, chloroplastic OS=Arabidop...	[more]
Q9LN01	7.5e-118	35.34	Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Arabidop...	[more]
Q9LFL5	4.9e-117	33.76	Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g16860 OS=Arabidopsis thaliana OX...	[more]

BLAST of MS010496 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1BUQ5	0.0e+00	91.54	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X1 ...	[more]
A0A0A0KK94	5.7e-286	77.22	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G501860 PE=4 SV=1	[more]
A0A5D3CMI9	9.7e-286	76.24	Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=11946...	[more]
A0A1S3B296	1.3e-285	75.16	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X1 ...	[more]
A0A1S3B2E4	2.8e-285	75.27	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial isoform X2 ...	[more]

BLAST of MS010496 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT4G19191.1	4.6e-195	54.64	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein	[more]
AT2G22070.1	3.5e-126	36.56	pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein	[more]
AT1G11290.1	7.2e-124	35.97	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein	[more]
AT1G08070.1	5.3e-119	35.34	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein	[more]
AT5G16860.1	3.5e-118	33.76	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 620..646
None	No IPR available	PANTHER	PTHR24015	OS07G0578800 PROTEIN-RELATED	coord: 1..625
None	No IPR available	PANTHER	PTHR24015:SF1993	REPEAT-CONTAINING PROTEIN, PUTATIVE-RELATED	coord: 1..625
IPR002885	Pentatricopeptide repeat	TIGRFAM	TIGR00756	TIGR00756	coord: 304..337 e-value: 9.1E-9 score: 33.0 coord: 478..501 e-value: 0.0029 score: 15.6 coord: 203..237 e-value: 2.5E-5 score: 22.1 coord: 405..438 e-value: 5.5E-10 score: 36.8 coord: 71..99 e-value: 0.0021 score: 16.1
IPR002885	Pentatricopeptide repeat	PFAM	PF01535	PPR	coord: 477..502 e-value: 3.2E-4 score: 20.7 coord: 101..125 e-value: 0.012 score: 15.9 coord: 203..233 e-value: 0.0011 score: 19.1 coord: 376..397 e-value: 0.022 score: 15.0 coord: 72..98 e-value: 0.0056 score: 16.8 coord: 173..197 e-value: 0.084 score: 13.2 coord: 542..571 e-value: 0.31 score: 11.4 coord: 276..298 e-value: 0.99 score: 9.8
IPR002885	Pentatricopeptide repeat	PFAM	PF13041	PPR_2	coord: 403..450 e-value: 1.5E-10 score: 41.1 coord: 304..349 e-value: 3.6E-10 score: 39.9
IPR002885	Pentatricopeptide repeat	PROSITE	PS51375	PPR	coord: 302..336 score: 12.035565
IPR002885	Pentatricopeptide repeat	PROSITE	PS51375	PPR	coord: 201..235 score: 9.96388
IPR002885	Pentatricopeptide repeat	PROSITE	PS51375	PPR	coord: 403..437 score: 12.199985
IPR002885	Pentatricopeptide repeat	PROSITE	PS51375	PPR	coord: 98..132 score: 9.832344
IPR011990	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	GENE3D	1.25.40.10	Tetratricopeptide repeat domain	coord: 457..638 e-value: 1.6E-13 score: 52.8
IPR011990	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	GENE3D	1.25.40.10	Tetratricopeptide repeat domain	coord: 355..456 e-value: 4.6E-27 score: 96.5 coord: 52..151 e-value: 8.0E-17 score: 63.2 coord: 152..255 e-value: 6.8E-17 score: 63.4 coord: 257..354 e-value: 5.8E-22 score: 79.9
IPR032867	DYW domain	PFAM	PF14432	DYW_deaminase	coord: 577..646 e-value: 1.8E-9 score: 37.6

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
MS010496.1	MS010496.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0005515	protein binding
molecular_function	GO:0008270	zinc ion binding