MS010316 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCTCGAGACAAGCTGCCAATGGAGCCGTCTCCAGACTCTGCTTCCTACTACACGCCTGAATCATCTTCTTCCCCTGCTGGCCGCATATCCGATCCCAGCGAGACATCTTCTTCGCCGAACGGTTTTCACCAGGACGTCGAAATTGAGGTAGATACTGCCACCTCTCTTTCCTTTCTAAATTAGTACCCGTCTCCGAGAATTATTGAATCACCTTAATTTTGGTTGTCGAGAAACCATCATAAGGGTAAAAGAAATGTCAAATTCCAATTTTCTTGTCCGCAATTCTTGTTTCGGTTTATGTTAATAGAAGCTGCCGATTATCATCATCGTCACCATCTTCTTCTAAAATGCCACCCTCAAAGGTGAATTTTATAAAAATTATTTGCTTCCCCAATTTTCATGTGCTTTTAGTCACGCCCCTTTCCAATAAGGATCTCATCTCATATTTTTCACATTCTCGCTATCTTTCTTATTGTCATCTCTACTCAGTGTTCATCATATCCTCTTCGGTTTTTTTTTTGTTGGTTGAAGAGTACTTTCTTTCTTTAATAATTTATTTATTTAATATTTTTTTAAAAGCATATATGGATAAATTTGTTTATTTATGTATCTGATGCATGAGTTTAATGGGTGAACATAAAATTGAATTAGAATAGTGAGGAAGAAAGAATAAAAGAAAGGAAAATTCGTGTGAAAAAGAATGGGTCAGACTAGTCCCATAAATCTAGATTCATTCGAGAAAAAGAGAAAAAAGAATAAAGCGTTGTTTTTGGCGGGGAAGGGAGGGGGTTGGTTCCCTCCATTATTTGCCTATTTACCACTGAACTTATTGCTTGTTTTTTTAAAAACAAAAAATAAAAAGAGCTTATTCTGAGAAATTTTATTTTGCTCCCTAAGTGGTATCAGTGATCTTCTTAGAACGATTGACTTGGTTCAGGAAAATTAACAGGGGTAATTCTTTAATAAAGGTAACTTTAATTGTTCTTAAAAATAAGTCATCCTTAAAAACCTGCATGGGACCAAAAAGAGCATACTTCATGTTGAAGCAGGCTTCAACAATTCAATTGTGATGGTTACAGATATATGGAGTCGGGTAATTTGTTCGTCCACAGACTAGAAAGAGAAATAAAGAAATACTCTATCAAACACGTTTTCAATTAATATTTGTATTAAAAAAAACACAAATGTTTTTCATATCACTTTCAAACAACCTCTAGATTTCTTGCATAGTCCTTCAAAAATGACAGGGAGATTGTAATGGTAAATTTCTTTTAGTTGAACTCGCTGGTTCATTTTTTTATATTATATATATTTATTAAGGTATAACCAGCTTATATTATCTTATATATCTATGAAGTGAGTGTCTCTGAGAAAGTGGGAATGGAAGAAAACTAAAAAAAAAAAAGTGACAAAAAGCACAGGAAGTGAATGTTCTTGATTTCTAGGACCAGTCTTAGAAATGATGTTGTGGTATAAGAAAAGTGGAACAAGTTTTTTGAAGTTGTACTAAAATTCTAATACAATTTCTAGTACTCTAAACGGAATTCTCAGATGCATAATGTCATGTCAAGTACAGGATAGACCAGAAAGTTCTTAAATCAATCTCGAGAGACTGGTAGAAACTCATATAATGAGAATTGGTTGTACACTTGTACAGTTGTACTTGATTTTCATGAGCTCTTAGACGCAACTTTATCATGCTTGTAATTATTAAACAGTTCTACACTAAAGAATTATATAGGTTGTACCTCATTGTCATTGAGTTCTACAGAGTTCTATCCTATCAACCATTCTTAGGACATCGATAACAACATCAACAAGCAACTTTCTCTTTATTCACATGAAATCATCTCATAGAATATGTCAGAATAAGTTCAATGACATTATAGCCATCGTCTCTTGGACTAAAGCTTTGAAAACCTTTATCTAGTTCAAGTTTTTTAGAATCACGCTCCCAGTAAAGTACTGGTCTGACAGCCTATTTCCTTTCAATACACCGAACTTATATTATTTTACATGAACCCTATACAACCCAGCTGAAGCTAGAAAGAGTGTAACGTAAATCTAAAAGTCTCTTTCTCTATTTGGTAAATGTCTTTCTTACTCCGTAGAGCATGCTACTCATTAATACATACGTGCAATTTGACTCATTTCTCAAGAGTTTTTTCCATCTCACCTTTTGCGCAACATAGAAAAAATAACGGCAAAACCAAGTCAAGGCAGGATGTAACACTTTAGAACTGCTTGCTTTAGAGTTCTGCTAATTGACATCAAATCATCTTCTTCAGTCAAATGCTACATTATGTATTACCAAACCAAGTAGCATGCTTTAGAGAGTTGAAATGCATTTTTTGCTAGGAGAAAGAGACACTGACATTTTTACACTCGGTGCTTTCTGCATTGGTAAGTAGATTGTGTAGGGAAACACAAGTGAAAATAACAGAAATTTGGTAGATTTTTAAAAGGAAATAGATTGATAAACAAATTATTTGAAGGGAACATGGATCTGAATTTTGTTTTTTGTTTTTATTTTTAACTAGATAAAGTTTAGGAACTTGCTTTATGTATTTGTAGGAGATGATTTTTATAAGAATCGAGAGAGTTGTTTGACAATGTTTATGTCCTATGAATAACTGATGATATAGAGCAGGTTAACTTACAAGCAGGTAGTATATTCTACAAGTGCACAATTCCTTCAAAAGAAAGCTTATAAACATGATGCATGTAAGTCTACTGGAAAAATGATAAATACCAAGTCCAAGATTTGTTTGGATTTCTACGAGAGTTTTACCTATCTTTCTTTAAAGTATCTTCAGGAGAAACAGTGAGATTTTGGGAGGATCCATGGATTGATTCTTCCCCTCTATCCTCCTATTTCTCTGATATTTATAGATTGTCCTCTAAGAAAGAGATGTCTATAGCTGATTGTTGGGTTGCCGAGGTCGGAACATGGGACTTGGGCTTAAGAAGAAATCTGTTTGAAAGGGAGGTGGACAGATGGGCAGCAATGATTGGAAAGCTTGATGGGGCGATAATTGGTCAAGGCAGAGACCAAATCTGGTGGAAGGCTGACAGTAAAGGTATTTTCACTGTAAAATCAGCTTTTTTGGCCATTACTTCCCTTCACCTAAGCTGAATTCAGAGACAGCAGCTCTCATTTGGAATTTTAGAGTTCCTAAAAAGGCCAAGGTTTTCCTGTGGACGCTTTTCTACAGAGGCACAAACACGGCAGAGAAAATTCAGCGGAAACTCCCCCATTGGGCCCTCTTTCCAGCTGCTTGTGGTATGTGTTGGAAGGATAATGAAAATGTGGATCACCTCTTCTTGCACTGTCCTTGCGCTACCAAGGCTTGGAATTATGTGGCAGAACTTTTAGATGTTTCCTTCTGTCCCCCAAGGAAAATTGATCATTTTATTATGGAAGGCTTCGGTGGCACCGCTCTCAAAGGAAAAATCTTTGTCCTTTGGAATTGTGCGGCGAGGGCTCTCCTTTGGCTCCTTTGGAGGGAGAGGAATGGTAGGCTTTTTGAGGATCAAAAAGGTTTCGATAGACATGTTTTGTGTGAATATAAAGCATACGGCTTCTTGGTGGACATCCATCCACAAAAAAAGTTTTTTGTAACTATGGTTTTCGTTTGATTATACAAGATTGGAAAGCCGCGATTGTATAGCTTTTTGGGGAGGGTTCTCTCTACCCTCCGCCTTTAGGGTGTTTTTTCCCTCTTTTTGGGGCGTTCTTTTGCTGAATATATTCTCTTATGTTTCTTATAAAAAAAAAAGGACTGGTCCATGAATTTTAGTCTCTCCTGGATATGACACAATGCATAAGAGGACCCTATCATAGTTAGATTCTTGTTATTGTGCTTTTTTTTTTTTAATTATCCAAAGACCTGGAAAGAGAAAAGTTCTCATATGGTTCTTTGATCCGCTCCACTTTGAATATATTTGAATGTGTATAGTATATACACTGCAAGCAGAAAATGTATGAGACCTTTCCTAATGATTTTATTTTATTCACTTTCTTCTGCTGCTTATTTTCTATGCAGTCACCTGCTTTATTGAGAAGTGAAGAGTATCGGCAGTTGTTTCGTCTTCCACCTGATGAAGTAAGTAACTACTACATCTAGTCTTGAGAGTGTATAAGTTTATTGATTGATGCTGAAGTTGACAATAGGATCTTCTGTGTCATTCTAAAGAATTCAATAGAGCCTCTAGGCCAACCAAAAAGTAATAATAATAATTAAAAAAGACAAAAGAAAAGGAAACCTTGCCTCTGACATAGTTCTGGAACATTCATGTATACGGTGGTTTCTTGGTGAGGTTTCTGAAGTTTTCTCCTGGTTTGGAATAAGACAAACAACCTATACAGAAAACATTTCAGAAGGGAGATATTATGCTGTGAATTAATTCATTGCATTTTTCTCCTTATCATATATTAATGAAAAGTTGTTTCTTGTTTAAGAAAAAAAAATCATAACATTTTAATGAAGTATTTTCTACTTATTTCAGTACTAAATGAAGAATTTTCTGCTTCTTTCAATGCTTCCTGTGACCATTTACTACATTTTATTGTTTTTCAAGTTATTAACATACAATAGCATACAAACCTACCGCATGATGGGGCTTTTGAGTAAGGTGTAAAGCTTGCTTCTGCAGTGTAAAAAGATTGAATATAGCTTCTACGATATGGAATATGAGAAGTTGGTTGCTAGTCACTTTGGAATCATTTCAATATATTATTTATTGGATTATTTGATGAATATTTTTCTGTCCAAGGATGAGAGAATGTGTAGCTTTTTAGGGTTTTGAAATGACAAAAAGGGTTGCAGATTGTCGTAATTGATAATCTAGAGATATCTGCTTTATGGAGGTTTACTATGGAGATCATATTGTCTGAAGACTCGACTTATCTCTAGGGATAGTTTTATATCTGGGAAGCAATAACAATCTAAATCTTGGTTGTATCATGTTAAATGGAGCCTTATTTGGAGGGT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CCTCGAGACAAGCTGCCAATGGAGCCGTCTCCAGACTCTGCTTCCTACTACACGCCTGAATCATCTTCTTCCCCTGCTGGCCGCATATCCGATCCCAGCGAGACATCTTCTTCGCCGAACGGTTTTCACCAGGACGTCGAAATTGAGTCACCTGCTTTATTGAGAAGTGAAGAGTATCGGCAGTTGTTTCGTCTTCCACCTGATGAAGTCCTTATTGAAGACTTTAATTGTGCTTTCCAAGAGAACATACTAATTCAGGGCCACATGTATCTGTTCATGCACTATATTTGCTTCTACTCCAACATCTTTGGGTTTGAGACAAAGAAAGTAATCCCATTACAAGAAATAACAGCTGTACGTAAAGCAAAGACAGCAGGGATCTTCCCTAATGCCATCGAGATATTTGACGGAGAGAAAAAGTATTTCTTTGCATCTTTTCTGTCTCGTGATGAGGCCTTTAAGCTTATTGATGACGGATGGTCGCAGCATGCTAAAGGGACCGAAGGAAATATGGAAAATCAGAAATCAATAAATGAATCTAGCAGACAGGAAGATGGTATCCTTGGCATTGAAAATGCCACGGAGCTGGATTCTTCTACAGATTCTTTTGACAGGAGTATGAATACTCCCATTCCTGATGTTTCTATGGTTCAAGCCAATGTTGAAGAGGAAAATGGGCCAAAGACACTACCAGTAGTACCTATTAATGTAATTCAGGAAGCAGAGCCAATTCTTGATAGTCATGCTTCAAGTTCAAGAAAGACATTGACATGGAAGCTGGAAAATGTGGATGCTCCCAAGGTACCGGATTGTTTTACCAAGGTTGCAGAATCAAAGTTTCCGATACAGGTGGAGGATTTCTTTAGTTTCTATTTTTCAGATGATGCAATTAATTTTCTTTCTTCATATCATGAACAATGTGGAGATAAAGAGTTCAAATGTTCTCCATGGCGTCCTGATGACATATTTGGGCATACACGTCATTTATCATTTAAACATCCAATAAAATTATATTTTGGTGCAAAGTTTAGTGGCTGCTCGGAGATCCAGAAATTTCGAGTTTATCGAGATAGGTTTGACAATCATTTGGTCATTGAGCTAATGCAAGAAGTCAATGAGGTTCCATATTCAGATTATTTCCGTGTTGAGGGATATTGGGAGGTGAAGAAAGATGCTGATGAATCAAATAAATGCTGCATCTTGAGGGTATATGTGAACGTGGCATTTCTGAAAAGAACTGTTTGGAAAGGGAAAATAGTGCAGTCTACTATTGAAGAATGCCGAGAGGCCTATGGAATGTGGGTTCAGATGGCAAGGGAATTGTTGAAGCAGAAACTTAAAGAATTTGAAGAGGGAAGTCCTAGTGGTAGTACATCGTATAGTGGTAAAGATCATCATATTGAAGAAGAAACGAATAACAGCAAATCATTGGAAAGGTCAAATGAGAAGATTGACGCTAGAAGATTAACTGAGATGCCATATTCCACTGACGTTGATCAACAAGCTGAAAACTTTACTCGAGGAGTTCATTCTACTACGTTTGCTTCTTGGTCAAGAGGATACATGAAGAAGTTTTGGTCTTTGTTACGAAGTCAGAATTATCTTCCTCTTGCACTAGTTATCACTTTTGCTGTGATTTTCCTAATGCAGTTGAGCATAGTTATGCTGTTATCCAGACCCCAACACATCCACGTCAGTTCAACCGAGTATGCGAATGCGAAGGGCCTAAAATTCAGTGGTGGAAGATCGAGTGATGGCATGGCATGGTTGGAAAAGAGAATGCACCACCTCAAGGATGAGATGTACATGATCGAGGCTCGGCTAGAGATGATGCGACGCGAGCATGCACACTTAAAAGCACAGCTAAGAGATTTTGAGGAA PRDKLPMEPSPDSASYYTPESSSSPAGRISDPSETSSSPNGFHQDVEIESPALLRSEEYRQLFRLPPDEVLIEDFNCAFQENILIQGHMYLFMHYICFYSNIFGFETKKVIPLQEITAVRKAKTAGIFPNAIEIFDGEKKYFFASFLSRDEAFKLIDDGWSQHAKGTEGNMENQKSINESSRQEDGILGIENATELDSSTDSFDRSMNTPIPDVSMVQANVEEENGPKTLPVVPINVIQEAEPILDSHASSSRKTLTWKLENVDAPKVPDCFTKVAESKFPIQVEDFFSFYFSDDAINFLSSYHEQCGDKEFKCSPWRPDDIFGHTRHLSFKHPIKLYFGAKFSGCSEIQKFRVYRDRFDNHLVIELMQEVNEVPYSDYFRVEGYWEVKKDADESNKCCILRVYVNVAFLKRTVWKGKIVQSTIEECREAYGMWVQMARELLKQKLKEFEEGSPSGSTSYSGKDHHIEEETNNSKSLERSNEKIDARRLTEMPYSTDVDQQAENFTRGVHSTTFASWSRGYMKKFWSLLRSQNYLPLALVITFAVIFLMQLSIVMLLSRPQHIHVSSTEYANAKGLKFSGGRSSDGMAWLEKRMHHLKDEMYMIEARLEMMRREHAHLKAQLRDFEE Homology
BLAST of MS010316 vs. NCBI nr
Match: XP_022144568.1 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1223.8 bits (3165), Expect = 0.0e+00 Identity = 617/621 (99.36%), Postives = 618/621 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. NCBI nr
Match: XP_038874389.1 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 971.5 bits (2510), Expect = 3.6e-279 Identity = 506/628 (80.57%), Postives = 554/628 (88.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. NCBI nr
Match: XP_038874406.1 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 967.2 bits (2499), Expect = 6.7e-278 Identity = 504/628 (80.25%), Postives = 551/628 (87.74%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. NCBI nr
Match: XP_038874398.1 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 964.9 bits (2493), Expect = 3.3e-277 Identity = 505/628 (80.41%), Postives = 553/628 (88.06%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. NCBI nr
Match: XP_011650617.2 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 953.7 bits (2464), Expect = 7.7e-274 Identity = 496/628 (78.98%), Postives = 543/628 (86.46%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HVW5 (Protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 493.4 bits (1269), Expect = 3.7e-138 Identity = 295/634 (46.53%), Postives = 398/634 (62.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96CP6 (Protein Aster-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GRAMD1A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 111.7 bits (278), Expect = 3.0e-23 Identity = 179/676 (26.48%), Postives = 264/676 (39.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q06681 (Membrane-anchored lipid-binding protein YSP2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=YSP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 6.3e-21 Identity = 107/439 (24.37%), Postives = 192/439 (43.74%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CI52 (Protein Aster-C OS=Mus musculus OX=10090 GN=Gramd1c PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 102.1 bits (253), Expect = 2.4e-20 Identity = 53/107 (49.53%), Postives = 72/107 (67.29%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3KR56 (Protein Aster-A OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Gramd1a PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 1.2e-19 Identity = 68/171 (39.77%), Postives = 97/171 (56.73%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CTM4 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014217 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1223.8 bits (3165), Expect = 0.0e+00 Identity = 617/621 (99.36%), Postives = 618/621 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L3J6 (VASt domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G116750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 936.8 bits (2420), Expect = 4.7e-269 Identity = 491/628 (78.18%), Postives = 539/628 (85.83%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F4N9 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442129 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 934.5 bits (2414), Expect = 2.3e-268 Identity = 484/627 (77.19%), Postives = 540/627 (86.12%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IFM2 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472873 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 2.6e-267 Identity = 485/627 (77.35%), Postives = 538/627 (85.81%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3U9 (protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442129 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 927.9 bits (2397), Expect = 2.2e-266 Identity = 483/627 (77.03%), Postives = 539/627 (85.96%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. TAIR 10
Match: AT1G02120.1 (GRAM domain family protein ) HSP 1 Score: 493.4 bits (1269), Expect = 2.6e-139 Identity = 295/634 (46.53%), Postives = 398/634 (62.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. TAIR 10
Match: AT3G59660.1 (C2 domain-containing protein / GRAM domain-containing protein ) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 9.7e-17 Identity = 90/408 (22.06%), Postives = 160/408 (39.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. TAIR 10
Match: AT5G50170.1 (C2 calcium/lipid-binding and GRAM domain containing protein ) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 1.6e-06 Identity = 80/395 (20.25%), Postives = 158/395 (40.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS010316 vs. TAIR 10
Match: AT1G03370.1 (C2 calcium/lipid-binding and GRAM domain containing protein ) HSP 1 Score: 47.0 bits (110), Expect = 6.5e-05 Identity = 41/170 (24.12%), Postives = 78/170 (45.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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