MS006550 (gene) Bitter gourd (TR) v1

BLAST of MS006550 vs. NCBI nr
Match: XP_022141921.1 (serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 6.4e-140
Identity = 276/278 (99.28%), Postives = 278/278 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 240
           DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRS+SRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 240

Query: 241 ESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 279
           ESPVRNGDGGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Sbjct: 241 ESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 278

BLAST of MS006550 vs. NCBI nr
Match: XP_038888048.1 (serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 459.9 bits (1182), Expect = 1.5e-125
Identity = 259/285 (90.88%), Postives = 267/285 (93.68%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAF K RY+SRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYKSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRS DRSDRDRRGRE+ERER+YRRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSFDRSDRDRRGREKEREREYRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQR 240
           DYSKGRGRGRYDDERRSRSRS SRSRSRG+SRSVDS SPG      RRS SPRRSLSP+R
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRQSPSPRRSPSPRRSLSPRR 240

Query: 241 SPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 279
           SPSPRG SP RNG+ GGRSPT RSVSPRG+P DSRSPSPQNSDVD
Sbjct: 241 SPSPRGGSPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPTDSRSPSPQNSDVD 285

BLAST of MS006550 vs. NCBI nr
Match: XP_008455209.1 (PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 454.5 bits (1168), Expect = 6.5e-124
Identity = 259/283 (91.52%), Postives = 265/283 (93.64%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAF K RYRSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQR 240
           DYSKGRGRGRYDDER  RSRS SRSRSRG+SRSVDS SPG      RRS SPRRSLSP+R
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYDDER--RSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRR 240

Query: 241 SPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD 277
           SPSPR ESP RNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Sbjct: 241 SPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD 281

BLAST of MS006550 vs. NCBI nr
Match: KAG7011405.1 (Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 3.6e-122
Identity = 255/286 (89.16%), Postives = 261/286 (91.26%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGK+SE+F K RYRSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKVSESFPKSRYRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRR+RDD+RDRDYRRRSRSRSRSRSLDR D DRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSR--------SRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSP 240
           DYSKGRGRGRY DERRSRSRS SR        SR RG+ RSVDSASPGR+S SP RS SP
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSP-RSASP 240

Query: 241 QRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 279
           QRSPSPRGESP RNGDGGRSPT RSVSPRGQPADSRSPS  NSDVD
Sbjct: 241 QRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD 285

BLAST of MS006550 vs. NCBI nr
Match: XP_022927926.1 (serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] >KAG6588771.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 3.6e-122
Identity = 258/296 (87.16%), Postives = 265/296 (89.53%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE F K R+RSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKGKISEPFPKSRHRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRRYRDD RDRDYRR  RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPR------------- 240
           DYSKGRGRGRY DERR+RSR  S SRSRG+SRSV+SASPGRRS SPR             
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYVDERRNRSR--SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRR 240

Query: 241 -----RSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 279
                RSLSP+RSPSPRGESP RNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Sbjct: 241 SLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 292

BLAST of MS006550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMG4 (Serine/arginine-rich splicing factor SC35 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SC35 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 9.9e-67
Identity = 189/313 (60.38%), Postives = 206/313 (65.81%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDISDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFAKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTK-------- 120
           FVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E   K        
Sbjct: 61  FVRYKYKDEAHKAVERLDGRVVDGREITVQFAKYGPNAEKISKGRVVEPPPKSRRSRSRS 120

Query: 121 -------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG 180
                        PR RS  RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS          DRR 
Sbjct: 121 PRRSRSPRRSRSPPRRRSPRRSRSPRRRSRDDYREKDYRKRSRSRS---------YDRRE 180

Query: 181 RERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVD 240
           R  E++RD+RRR+RS   R  SPD  K R RGRYD+E RS SRS S S +R   +S S  
Sbjct: 181 RHEEKDRDHRRRTRS---RSASPD-EKRRVRGRYDNESRSHSRSLSASPARRSPRSSSPQ 240

Query: 241 SASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP 273
             SP R          RS SPRRSLSP RSP     SP  E         RSP+P S +P
Sbjct: 241 KTSPAREVSPDKRSNERSPSPRRSLSP-RSPALQKASPSKEMSPERRSNERSPSPGSPAP 299

BLAST of MS006550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q06A98 (Serine/arginine-rich splicing factor 2 OS=Sus scrofa OX=9823 GN=SRSF2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 127.1 bits (318), Expect = 3.1e-28
Identity = 111/239 (46.44%), Postives = 138/239 (57.74%), Query Frame = 0

Query: 4   FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVR 63
           +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR
Sbjct: 3   YGRP-PPDVEGMTSLKVDNLTYRTSPDTLRRVFEKYGRVGDVYIPRDRYTKESRGFAFVR 62

Query: 64  YKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSRS 123
           +    +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG  P++    +G     +    Y  RSRS
Sbjct: 63  FHDKRDAEDAMDAMDGAVLDGRELRVQMARYGRPPDSHHSRRGPPPRRYGGGGYGRRSRS 122

Query: 124 PRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPD 183
           PRR           RRRSRSRSRSRS  RS R R  R + R R  R RSRS         
Sbjct: 123 PRR-----------RRRSRSRSRSRSRSRS-RSRYSRSKSRSRT-RSRSRST-------- 182

Query: 184 YSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 241
            SK R   R   +  S SRS SRSRSR +SRS   AS  R S S  RS SP +SP   G
Sbjct: 183 -SKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPASK-RESKSRSRSKSPPKSPEEEG 217

BLAST of MS006550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P30352 (Serine/arginine-rich splicing factor 2 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=SRSF2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 5.3e-28
Identity = 110/239 (46.03%), Postives = 137/239 (57.32%), Query Frame = 0

Query: 4   FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVR 63
           +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR
Sbjct: 3   YGRP-PPDVEGMTSLKVDNLTYRTSPDTLRRVFEKYGRVGDVYIPRDRYTKESRGFAFVR 62

Query: 64  YKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSRS 123
           +    +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG  P++    +G     +    Y  RSRS
Sbjct: 63  FHDKRDAEDAMDAMDGAVLDGRELRVQMARYGRPPDSHHSRRGPPPRRYGSSGYGRRSRS 122

Query: 124 PRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPD 183
           PRR           RRRSRSRSRSRS  RS R R  R + R R  R RSRS         
Sbjct: 123 PRR-----------RRRSRSRSRSRSRSRS-RSRYSRSKSRSRT-RSRSRST-------- 182

Query: 184 YSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 241
            SK R   R   +  S SRS SRSRSR +SRS    S  R S S  RS SP +SP   G
Sbjct: 183 -SKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPTSK-RESNSRSRSKSPPKSPEEEG 217

BLAST of MS006550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3MHR5 (Serine/arginine-rich splicing factor 2 OS=Bos taurus OX=9913 GN=SRSF2 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 9.0e-28
Identity = 110/239 (46.03%), Postives = 137/239 (57.32%), Query Frame = 0

Query: 4   FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVR 63
           +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR
Sbjct: 3   YGRP-PPDVEGMTSLKVDNLTYRTSPDTLRRVFEKYGRVGDVYIPRDRYTKESRGFAFVR 62

Query: 64  YKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSRS 123
           +    +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG  P++    +G     +    Y  RSRS
Sbjct: 63  FHDKRDAEDAMDAMDGAVLDGRELRVQMARYGRPPDSHHSRRGPPPRRYGGGGYGRRSRS 122

Query: 124 PRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPD 183
           PRR           RRRSRSRSRSRS  RS R R  R + R R  R RSRS         
Sbjct: 123 PRR-----------RRRSRSRSRSRSRSRS-RSRYSRSKSRSRT-RSRSRST-------- 182

Query: 184 YSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 241
            SK R   R   +  S SRS SRSRSR +SRS    S  R S S  RS SP +SP   G
Sbjct: 183 -SKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSK-RESKSRSRSKSPPKSPEEEG 217

BLAST of MS006550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q01130 (Serine/arginine-rich splicing factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF2 PE=1 SV=4)

HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 9.0e-28
Identity = 110/239 (46.03%), Postives = 137/239 (57.32%), Query Frame = 0

Query: 4   FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVR 63
           +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR
Sbjct: 3   YGRP-PPDVEGMTSLKVDNLTYRTSPDTLRRVFEKYGRVGDVYIPRDRYTKESRGFAFVR 62

Query: 64  YKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSRS 123
           +    +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG  P++    +G     +    Y  RSRS
Sbjct: 63  FHDKRDAEDAMDAMDGAVLDGRELRVQMARYGRPPDSHHSRRGPPPRRYGGGGYGRRSRS 122

Query: 124 PRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPD 183
           PRR           RRRSRSRSRSRS  RS R R  R + R R  R RSRS         
Sbjct: 123 PRR-----------RRRSRSRSRSRSRSRS-RSRYSRSKSRSRT-RSRSRST-------- 182

Query: 184 YSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 241
            SK R   R   +  S SRS SRSRSR +SRS    S  R S S  RS SP +SP   G
Sbjct: 183 -SKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSK-RESKSRSRSKSPPKSPEEEG 217

BLAST of MS006550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKN2 (serine/arginine-rich splicing factor SC35 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012175 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 3.1e-140
Identity = 276/278 (99.28%), Postives = 278/278 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 240
           DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRS+SRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG 240

Query: 241 ESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 279
           ESPVRNGDGGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Sbjct: 241 ESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 278

BLAST of MS006550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C0I4 (serine/arginine-rich splicing factor SC35 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495427 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 454.5 bits (1168), Expect = 3.1e-124
Identity = 259/283 (91.52%), Postives = 265/283 (93.64%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAF K RYRSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQR 240
           DYSKGRGRGRYDDER  RSRS SRSRSRG+SRSVDS SPG      RRS SPRRSLSP+R
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYDDER--RSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRR 240

Query: 241 SPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD 277
           SPSPR ESP RNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Sbjct: 241 SPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD 281

BLAST of MS006550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K7C0 (RRM domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G062820 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 1.7e-122
Identity = 255/283 (90.11%), Postives = 265/283 (93.64%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAF K RYRSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRR+RDD RD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQR 240
           DYSKGRGRGRYDDER  RSRS SRSRSRG+SRSVDS SPG      RRS SPRRSLSP+R
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYDDER--RSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRR 240

Query: 241 SPSPRGESPVRNGDG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD 277
           SPSPR ESP RNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Sbjct: 241 SPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD 281

BLAST of MS006550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIV3 (serine/arginine-rich splicing factor SC35-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434683 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 1.7e-122
Identity = 258/296 (87.16%), Postives = 265/296 (89.53%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE F K R+RSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKGKISEPFPKSRHRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRRYRDD RDRDYRR  RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPR------------- 240
           DYSKGRGRGRY DERR+RSR  S SRSRG+SRSV+SASPGRRS SPR             
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYVDERRNRSR--SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRR 240

Query: 241 -----RSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 279
                RSLSP+RSPSPRGESP RNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Sbjct: 241 SLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 292

BLAST of MS006550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HFC7 (serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463797 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 448.4 bits (1152), Expect = 2.2e-122
Identity = 255/286 (89.16%), Postives = 261/286 (91.26%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSR 120
           FVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGK+SE+F K RYRSRSR
Sbjct: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKVSESFPKSRYRSRSR 120

Query: 121 SPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180
           SPRRR+RDD+RDRDYRRRSRSRSRSRSLDR D DRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Sbjct: 121 SPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP 180

Query: 181 DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRS--------RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSP 240
           DYSKGRGRGRY DERRSRSRS SRSRS        RG+ RSVDSASPGR+S SP RS SP
Sbjct: 181 DYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRSRSRSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSP-RSASP 240

Query: 241 QRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD 279
            RSPSPRGESP RNGDGGRSPT RSVSPRGQPADSRSPS  NSDVD
Sbjct: 241 HRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD 285

BLAST of MS006550 vs. TAIR 10
Match: AT5G64200.1 (ortholog of human splicing factor SC35 )

HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 7.0e-68
Identity = 189/313 (60.38%), Postives = 206/313 (65.81%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDISDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFAKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTK-------- 120
           FVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E   K        
Sbjct: 61  FVRYKYKDEAHKAVERLDGRVVDGREITVQFAKYGPNAEKISKGRVVEPPPKSRRSRSRS 120

Query: 121 -------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG 180
                        PR RS  RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS          DRR 
Sbjct: 121 PRRSRSPRRSRSPPRRRSPRRSRSPRRRSRDDYREKDYRKRSRSRS---------YDRRE 180

Query: 181 RERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVD 240
           R  E++RD+RRR+RS   R  SPD  K R RGRYD+E RS SRS S S +R   +S S  
Sbjct: 181 RHEEKDRDHRRRTRS---RSASPD-EKRRVRGRYDNESRSHSRSLSASPARRSPRSSSPQ 240

Query: 241 SASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP 273
             SP R          RS SPRRSLSP RSP     SP  E         RSP+P S +P
Sbjct: 241 KTSPAREVSPDKRSNERSPSPRRSLSP-RSPALQKASPSKEMSPERRSNERSPSPGSPAP 299

BLAST of MS006550 vs. TAIR 10
Match: AT5G64200.2 (ortholog of human splicing factor SC35 )

HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 7.0e-68
Identity = 189/313 (60.38%), Postives = 206/313 (65.81%), Query Frame = 0

Query: 1   MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFA 60
           MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFA
Sbjct: 1   MSHFGRSGPPDISDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFAKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFA 60

Query: 61  FVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTK-------- 120
           FVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E   K        
Sbjct: 61  FVRYKYKDEAHKAVERLDGRVVDGREITVQFAKYGPNAEKISKGRVVEPPPKSRRSRSRS 120

Query: 121 -------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG 180
                        PR RS  RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS          DRR 
Sbjct: 121 PRRSRSPRRSRSPPRRRSPRRSRSPRRRSRDDYREKDYRKRSRSRS---------YDRRE 180

Query: 181 RERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVD 240
           R  E++RD+RRR+RS   R  SPD  K R RGRYD+E RS SRS S S +R   +S S  
Sbjct: 181 RHEEKDRDHRRRTRS---RSASPD-EKRRVRGRYDNESRSHSRSLSASPARRSPRSSSPQ 240

Query: 241 SASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP 273
             SP R          RS SPRRSLSP RSP     SP  E         RSP+P S +P
Sbjct: 241 KTSPAREVSPDKRSNERSPSPRRSLSP-RSPALQKASPSKEMSPERRSNERSPSPGSPAP 299

BLAST of MS006550 vs. TAIR 10
Match: AT1G55310.1 (SC35-like splicing factor 33 )

HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 1.3e-13
Identity = 106/276 (38.41%), Postives = 130/276 (47.10%), Query Frame = 0

Query: 17  SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVER 76
           SLLV N+      +DL   F ++G V DI++PRD  TGD RGF FV++    +A  A   
Sbjct: 37  SLLVRNLRHDCRQEDLRKSFEQFGPVKDIYLPRDYYTGDPRGFGFVQFMDPADAADAKHH 96

Query: 77  LDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYR 136
           +DG ++ GRE+TV FA+                      R +    R R R   R RD R
Sbjct: 97  MDGYLLLGRELTVVFAE--------------------ENRKKPTEMRARERGGGRFRD-R 156

Query: 137 RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------P 196
           RR+  R  SRS  RS   RRGR R R  DY      R   RSISPR             P
Sbjct: 157 RRTPPRYYSRS--RSPPPRRGRSRSRSGDYYSPPPRRHHPRSISPREERYDGRRSYSRSP 216

Query: 197 SPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSP 256
           + D S+GR       + RS S S  RS SR   RS   +    RS SPRRS+  SP+RS 
Sbjct: 217 ASDGSRGRSLTPVRGKSRSLSPSPRRSISRSPRRSRSPSPKRNRSVSPRRSISRSPRRSR 276

Query: 257 SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS 272
           SPR        +  RS   RS SP  GQ  + RSPS
Sbjct: 277 SPRRSRRSYTPEPARS---RSQSPHGGQYDEDRSPS 286

BLAST of MS006550 vs. TAIR 10
Match: AT3G13570.1 (SC35-like splicing factor 30A )

HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.9e-13
Identity = 108/284 (38.03%), Postives = 137/284 (48.24%), Query Frame = 0

Query: 4   FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVR 63
           FG S   D+    SLLV N+      +DL   F ++G V DI++PRD  TGD RGF F++
Sbjct: 27  FGGSRDSDLPT--SLLVRNLRHDCRQEDLRRPFEQFGPVKDIYLPRDYYTGDPRGFGFIQ 86

Query: 64  YKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKP-RYRSRSRSP 123
           +    +A +A  ++DG ++ GRE+TV FA+              E   KP   R+R R  
Sbjct: 87  FMDPADAAEAKHQMDGYLLLGRELTVVFAE--------------ENRKKPTEMRTRDRGG 146

Query: 124 RRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG-RERERERDY------RRRSRSISP 183
           R      NR +D RRRS  R       RS   RRG R R R R Y      R +SRS+SP
Sbjct: 147 R-----SNRFQD-RRRSPPR-----YSRSPPPRRGRRSRSRSRGYNSPPAKRHQSRSVSP 206

Query: 184 RRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGR---RSASPRRSLSP 243
           +                D R  + RS SRS     SR V S SPGR    S SPRRS+SP
Sbjct: 207 Q----------------DRRYEKERSYSRSPPHNGSR-VRSGSPGRVKSHSRSPRRSVSP 261

Query: 244 QRSPS-----PRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS 272
           +++ S      R +SPV      RSPTP    PRG     RSPS
Sbjct: 267 RKNRSYTPEQARSQSPVPR--QSRSPTP---VPRGAQNGDRSPS 261

BLAST of MS006550 vs. TAIR 10
Match: AT1G55310.3 (SC35-like splicing factor 33 )

HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 3.2e-12
Identity = 108/289 (37.37%), Postives = 133/289 (46.02%), Query Frame = 0

Query: 17  SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRY 76
           SLLV N+      +DL   F ++G V DI++PRD  TG            D RGF FV++
Sbjct: 37  SLLVRNLRHDCRQEDLRKSFEQFGPVKDIYLPRDYYTGSHLCTDTCKASRDPRGFGFVQF 96

Query: 77  KYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKP-RYRSRSRSPR 136
               +A  A   +DG ++ GRE+TV FA+              E   KP   R+R R   
Sbjct: 97  MDPADAADAKHHMDGYLLLGRELTVVFAE--------------ENRKKPTEMRARERGGG 156

Query: 137 RRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR 196
            R+RD       RRR+  R  SRS  RS   RRGR R R  DY      R   RSISPR 
Sbjct: 157 SRFRD-------RRRTPPRYYSRS--RSPPPRRGRSRSRSGDYYSPPPRRHHPRSISPRE 216

Query: 197 ------------PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSAS 256
                       P+ D S+GR       + RS S S  RS SR   RS   +    RS S
Sbjct: 217 ERYDGRRSYSRSPASDGSRGRSLTPVRGKSRSLSPSPRRSISRSPRRSRSPSPKRNRSVS 276

Query: 257 PRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS 272
           PRRS+  SP+RS SPR        +  RS   RS SP  GQ  + RSPS
Sbjct: 277 PRRSISRSPRRSRSPRRSRRSYTPEPARS---RSQSPHGGQYDEDRSPS 299