MS003752 (gene) Bitter gourd (TR) v1

Overview
NameMS003752
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Locationscaffold127: 195516 .. 281453 (+)
RNA-Seq ExpressionMS003752
SyntenyMS003752
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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mRNA sequence

TTGCATACCCATACCCTGAAATGTGGATTTGAAGGTGATGTTTTTGCTGGAAATGCTCTGATTACAATGTATTCGAGATGGGAACGTCTTGTGGATGCTAGACAAGTGTTTGATGAAATGCCGTACAGGGATCGGGTGTCGTGGAGCGCAATGATTACTGGGTACGCACAAGAGGGGGATCATGGGTTAGAAGCAATTTCAGTGTTCATTCAAATGGTGAGAGAAGGACTGAAGTTTGACAATGTAGCGATTACTGGAGCTGTTTCTGTCTGTGGTCATGAAAGAAACTTGGAACTCGGAAAGCAGATTCATTGTTTGGCTATGAAAACAGGTTATGGGACTCATACTTCTGTCTGTAATGTTCTGATCTCAACTTACTCCAAGTGTGAGGTCATTGAAGATGCAAAAGCGGTATTCAAACTAATGGACGACTGCAATGTGATCTCTTGGACTACTATGATTTCACTGAATGAAGAAGATGCAGTTGCTTTGTTCAATAAGATGAGAGTAGATGGAGTATATCCAAATGATGTTACATTCATTGGATTACTTCATGCCATCACAATGAGGAATATGGTGGAACAGGGACTGACGGTCCATGGATTATGTATCAAAGCCGACTTTCTATCAGAATTAAGTGTTGGCAATAGTCTAATCACCATGTATGCAAAATTCGAGATGATGCAAGATTCATCAAGAGTGTTCATAGAACTTCCATATAGAGAGATAATATCATGGAATGCTTTAATTTCTGGGTATGCTCAAAATACATTATGTCAAGAAGCTTTGGAGACATTTCTGTGTGCAATAATGGAATCCAAGCCAAACGAATACACCTTTGGGAGTGTCCTGAATGCAATCAGTGCTGGCCAAGACATATCTATAAAGCATGGCCAGAGATGCCATTCTCATTTGATCAAACTTGGATTGAACTCTGACCCCATCATTTCAGGTGCCCTCCTAGACATGTATGCAAAGCGTGGGAGCATTCAAGAGTCCCAAAGAGTTTTCAACGAAACATCCAAAAGAAGTCAAGTCGCTTGGACCGCGTTGATCTCCGGCTACGCACAACACGGGGATTACGATACAGTGATGAAACTGTTTGAAGAGATGGAGAAGGAAAAGATAAAGCCAGATGCACCGAATTCTTATACTTTTCCTTTTCTTTTGAAGTCTTGCGCGAAGCTCACCTCTGCCCGTGAAGGGAAACAGATTCATGCGCATGTTCTGAAGCTTGGGTTTGTTTCTGATGTGTATATTCATACTTCGCTTATCAATATGTATGCGCAGAGCGGTGAAATGAATAGTGCCCAATTGGTGTTTGATAAAAGTAACTTCAGGGATGCGATTTCTTTCACTGCTCTAATAGCTGGTTATGCTTTGTGGGGTTATATGGATCGCGCTCGGCAAATGTTTGATGAAATGCCTGTGAGAGATGTGGTGTCTTGGAATGCAATGATTGCTGGCTACGCACAAACTGGTCGATCGAAAGAGGCGTTGTTGTTGTTTGAGGAAATGAGGGAAGCAAATGTCGCCCCGAATGAGAGTACTATTGTCTCGGTCCTTTCTGCTTGCGCTCAGTCCAATGCTCTAGATTTAGGAAACTTGATGCGCTCTTGGATTGAAGATCGCGGGCTTCGTTCAAATCTCAAGCTTGTTAATGCACTTATTGACATGTACTCGAAGTGCGGTGATCTTCTGACTGCCCGTGAATTTTTTGATGAAATGCCTGAAAGGGATGTGATCTCATGGAATGTTATGATCGGTGGTTACACTCATATATGCAACTATAAAGAAGCCTTGGCGCTCTTCCGCCAGATGCTAGCCTCGGGCATTGAGCCCACTGACATAACCTTCCTTAACATTCTTCCGTCCTGTGCTCATTTAGGTGCCATTGACCTTGGTATGTGGATACATGCTTATATAAACAAAAACTTCAATTCAGCCAGTACCTCTCTTTGGACGAGTCTGATAGATATGTATGCTAAATGTGGTAATATAGACGCGGCGCGACAGGTTTTCGATGGTATGAAAACCAAAAGCTTGGCCTCTTGGAATGCTATGATATGTGGGTTAGCAATGCATGGACAAGCAGAGGAGGCTCTAGAGCTTTTCTCGAAAATGCACAGTGATAGAATTGAACCAAATGAGATAACCTTTGTCGGTGTCTTATCTGCTTGCAAACATGCTGGCTTGGTAGATCTTGGACGCCAATTTTTTAGCTCTATGGTTCAGGATTATAAGATTGCACCGAAATCCCAACATTATGGATGCATGATAGATCTACTCGGGCGAGCTGGGTTGTTTGAGGAAGCAGAGTCCTTGATACAGAATATGGAGATGAAACCAGATGGAGCTATTTGGGGTTCCCTTCTTGGGGCCTGTAGAGACCATGGACGAGTCGAGTTGGGAGAATCAGTTGCAGAACGTTTATTCGAATTGGAGCCAGATAACCCTGGAGCTTATGTGCTTTTATCTAACATATATGCAGGAGCTGGTAAATGGGATGATGTTGCAAGAATAAGAACAAGGCTGAATGACAGGGGAATGAAGAAAGTCCCTGGTTGTACCACCATTGAAGTCGACAACGTCGTTCACGAGTTTCTAGTCGGGGACAAAGTTCACCCACAAAGTGAAGATATTTACAAGATGCTAGAAGAAGTAGATAGACAACTAAAGGTGACTGGATTTGTGCCAGATACATCCGAGGTACTCTATGACATGGATGAAGAGTGGAAAGAAGGAGCTCTAAGTCACCATAGTGAGAAATTAGCAATTGCTTATGGATTGATTAGTACAAAACCAGGAACAACAATTACAATCATTAAGAATCTTCGCGTCTGCCGTAATTGTCATTCTGCCACAAAGCTAATATCCAAGATATTCAATAGGGAGATTATTGCTAGAGATAGAAATCGTTTTCATCACTTCAAAGATGGTTCTTGCTCATGTAACGACTATTGG

Coding sequence (CDS)

TTGCATACCCATACCCTGAAATGTGGATTTGAAGGTGATGTTTTTGCTGGAAATGCTCTGATTACAATGTATTCGAGATGGGAACGTCTTGTGGATGCTAGACAAGTGTTTGATGAAATGCCGTACAGGGATCGGGTGTCGTGGAGCGCAATGATTACTGGGTACGCACAAGAGGGGGATCATGGGTTAGAAGCAATTTCAGTGTTCATTCAAATGGTGAGAGAAGGACTGAAGTTTGACAATGTAGCGATTACTGGAGCTGTTTCTGTCTGTGGTCATGAAAGAAACTTGGAACTCGGAAAGCAGATTCATTGTTTGGCTATGAAAACAGGTTATGGGACTCATACTTCTGTCTGTAATGTTCTGATCTCAACTTACTCCAAGTGTGAGGTCATTGAAGATGCAAAAGCGGTATTCAAACTAATGGACGACTGCAATGTGATCTCTTGGACTACTATGATTTCACTGAATGAAGAAGATGCAGTTGCTTTGTTCAATAAGATGAGAGTAGATGGAGTATATCCAAATGATGTTACATTCATTGGATTACTTCATGCCATCACAATGAGGAATATGGTGGAACAGGGACTGACGGTCCATGGATTATGTATCAAAGCCGACTTTCTATCAGAATTAAGTGTTGGCAATAGTCTAATCACCATGTATGCAAAATTCGAGATGATGCAAGATTCATCAAGAGTGTTCATAGAACTTCCATATAGAGAGATAATATCATGGAATGCTTTAATTTCTGGGTATGCTCAAAATACATTATGTCAAGAAGCTTTGGAGACATTTCTGTGTGCAATAATGGAATCCAAGCCAAACGAATACACCTTTGGGAGTGTCCTGAATGCAATCAGTGCTGGCCAAGACATATCTATAAAGCATGGCCAGAGATGCCATTCTCATTTGATCAAACTTGGATTGAACTCTGACCCCATCATTTCAGGTGCCCTCCTAGACATGTATGCAAAGCGTGGGAGCATTCAAGAGTCCCAAAGAGTTTTCAACGAAACATCCAAAAGAAGTCAAGTCGCTTGGACCGCGTTGATCTCCGGCTACGCACAACACGGGGATTACGATACAGTGATGAAACTGTTTGAAGAGATGGAGAAGGAAAAGATAAAGCCAGATGCACCGAATTCTTATACTTTTCCTTTTCTTTTGAAGTCTTGCGCGAAGCTCACCTCTGCCCGTGAAGGGAAACAGATTCATGCGCATGTTCTGAAGCTTGGGTTTGTTTCTGATGTGTATATTCATACTTCGCTTATCAATATGTATGCGCAGAGCGGTGAAATGAATAGTGCCCAATTGGTGTTTGATAAAAGTAACTTCAGGGATGCGATTTCTTTCACTGCTCTAATAGCTGGTTATGCTTTGTGGGGTTATATGGATCGCGCTCGGCAAATGTTTGATGAAATGCCTGTGAGAGATGTGGTGTCTTGGAATGCAATGATTGCTGGCTACGCACAAACTGGTCGATCGAAAGAGGCGTTGTTGTTGTTTGAGGAAATGAGGGAAGCAAATGTCGCCCCGAATGAGAGTACTATTGTCTCGGTCCTTTCTGCTTGCGCTCAGTCCAATGCTCTAGATTTAGGAAACTTGATGCGCTCTTGGATTGAAGATCGCGGGCTTCGTTCAAATCTCAAGCTTGTTAATGCACTTATTGACATGTACTCGAAGTGCGGTGATCTTCTGACTGCCCGTGAATTTTTTGATGAAATGCCTGAAAGGGATGTGATCTCATGGAATGTTATGATCGGTGGTTACACTCATATATGCAACTATAAAGAAGCCTTGGCGCTCTTCCGCCAGATGCTAGCCTCGGGCATTGAGCCCACTGACATAACCTTCCTTAACATTCTTCCGTCCTGTGCTCATTTAGGTGCCATTGACCTTGGTATGTGGATACATGCTTATATAAACAAAAACTTCAATTCAGCCAGTACCTCTCTTTGGACGAGTCTGATAGATATGTATGCTAAATGTGGTAATATAGACGCGGCGCGACAGGTTTTCGATGGTATGAAAACCAAAAGCTTGGCCTCTTGGAATGCTATGATATGTGGGTTAGCAATGCATGGACAAGCAGAGGAGGCTCTAGAGCTTTTCTCGAAAATGCACAGTGATAGAATTGAACCAAATGAGATAACCTTTGTCGGTGTCTTATCTGCTTGCAAACATGCTGGCTTGGTAGATCTTGGACGCCAATTTTTTAGCTCTATGGTTCAGGATTATAAGATTGCACCGAAATCCCAACATTATGGATGCATGATAGATCTACTCGGGCGAGCTGGGTTGTTTGAGGAAGCAGAGTCCTTGATACAGAATATGGAGATGAAACCAGATGGAGCTATTTGGGGTTCCCTTCTTGGGGCCTGTAGAGACCATGGACGAGTCGAGTTGGGAGAATCAGTTGCAGAACGTTTATTCGAATTGGAGCCAGATAACCCTGGAGCTTATGTGCTTTTATCTAACATATATGCAGGAGCTGGTAAATGGGATGATGTTGCAAGAATAAGAACAAGGCTGAATGACAGGGGAATGAAGAAAGTCCCTGGTTGTACCACCATTGAAGTCGACAACGTCGTTCACGAGTTTCTAGTCGGGGACAAAGTTCACCCACAAAGTGAAGATATTTACAAGATGCTAGAAGAAGTAGATAGACAACTAAAGGTGACTGGATTTGTGCCAGATACATCCGAGGTACTCTATGACATGGATGAAGAGTGGAAAGAAGGAGCTCTAAGTCACCATAGTGAGAAATTAGCAATTGCTTATGGATTGATTAGTACAAAACCAGGAACAACAATTACAATCATTAAGAATCTTCGCGTCTGCCGTAATTGTCATTCTGCCACAAAGCTAATATCCAAGATATTCAATAGGGAGATTATTGCTAGAGATAGAAATCGTTTTCATCACTTCAAAGATGGTTCTTGCTCATGTAACGACTATTGG

Protein sequence

LHTHTLKCGFEGDVFAGNALITMYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGDHGLEAISVFIQMVREGLKFDNVAITGAVSVCGHERNLELGKQIHCLAMKTGYGTHTSVCNVLISTYSKCEVIEDAKAVFKLMDDCNVISWTTMISLNEEDAVALFNKMRVDGVYPNDVTFIGLLHAITMRNMVEQGLTVHGLCIKADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDSSRVFIELPYREIISWNALISGYAQNTLCQEALETFLCAIMESKPNEYTFGSVLNAISAGQDISIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLKLGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Homology
BLAST of MS003752 vs. NCBI nr
Match: KAG6589865.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 1184.9 bits (3064), Expect = 0.0e+00
Identity = 584/697 (83.79%), Postives = 624/697 (89.53%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           SI+  ++ H+ +IK GL++       L++  A  +   I  +  +FN   + +   W ++
Sbjct: 38  SIRTLRQIHAQIIKTGLHNTQFALSKLIEFSAVSRYADISYAVSLFNSIEEPNLFIWNSM 97

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCAKL SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 98  IRGLSISLSPVLALVFFVRMIHAGVE---PNSYTFPFLLKSCAKLASAREGKQIHAHVLK 157

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGE+N AQLVFD+SNFRDAISFTALIAGY LWGYMDRAR++
Sbjct: 158 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEINYAQLVFDQSNFRDAISFTALIAGYVLWGYMDRARKL 217

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMR+ANV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 218 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMRKANVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 277

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDL TARE FDEMPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 278 DLGNSMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLQTARELFDEMPERDVISWNVMIGGY 337

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR MLASGIEPTDITFLN+LPSCA LGAID+G WIHAYINKNFNSAST
Sbjct: 338 THMCSYKEALALFRGMLASGIEPTDITFLNVLPSCACLGAIDVGKWIHAYINKNFNSAST 397

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVF+GM  KSLASWNAMICGLAMHGQA EALELFSKM SD
Sbjct: 398 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFNGMNFKSLASWNAMICGLAMHGQANEALELFSKMSSD 457

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAG VDLGR FFSSM+QDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 458 GIEPNEITFVGVLSACKHAGFVDLGRLFFSSMIQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 517

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNME+KPDGAIWGSLLGACR+HGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 518 AESLIQNMELKPDGAIWGSLLGACREHGRVELGEIVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 577

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVARIRT+LND+GMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSE+IYKMLEEVDRQ
Sbjct: 578 AGKWDDVARIRTKLNDKGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSENIYKMLEEVDRQ 637

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LK  GFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIA+GLISTKPGT ITIIKNLRVCRNC
Sbjct: 638 LKEFGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPITIIKNLRVCRNC 697

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           H+ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 698 HAATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 731

BLAST of MS003752 vs. NCBI nr
Match: XP_022961045.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 1182.2 bits (3057), Expect = 0.0e+00
Identity = 584/697 (83.79%), Postives = 623/697 (89.38%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           SI+  ++ H+ +IK GL++       L++  A  +   I  +  +FN   + +   W ++
Sbjct: 38  SIRTLRQIHAQIIKTGLHNTQFALSKLIEFSAVSRYADISYAVSLFNSIEEPNLFIWNSM 97

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCAKL SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 98  IRGLSISLSPVLALVFFVRMIHAGVE---PNSYTFPFLLKSCAKLASAREGKQIHAHVLK 157

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGE+N AQLVFD+SNFRDAISFTALIAGY LWGYMDRAR++
Sbjct: 158 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEINYAQLVFDQSNFRDAISFTALIAGYVLWGYMDRARKL 217

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMR+ANV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 218 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMRKANVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 277

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGL SNLKLVNALIDMYSKCGDL TARE FDEMPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 278 DLGNSMRSWIEDRGLCSNLKLVNALIDMYSKCGDLQTARELFDEMPERDVISWNVMIGGY 337

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASGIEPTDITFLN+LPSCA LGAID+G WIHAYINKNFNSAST
Sbjct: 338 THMCSYKEALALFREMLASGIEPTDITFLNVLPSCACLGAIDVGKWIHAYINKNFNSAST 397

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVF+GM  KSLASWNAMICGLAMHGQA EALELFSKM SD
Sbjct: 398 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFNGMNFKSLASWNAMICGLAMHGQANEALELFSKMSSD 457

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAG VDLGR FFSSM+QDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 458 GIEPNEITFVGVLSACKHAGFVDLGRLFFSSMIQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 517

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 518 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGEIVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 577

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVARIRT+LND+GMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVH QSE+IYKMLEEVDRQ
Sbjct: 578 AGKWDDVARIRTKLNDKGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHLQSENIYKMLEEVDRQ 637

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LK  GFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIA+GLISTKPGT ITIIKNLRVCRNC
Sbjct: 638 LKEFGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPITIIKNLRVCRNC 697

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           H+ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 698 HAATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 731

BLAST of MS003752 vs. NCBI nr
Match: XP_023515625.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 1181.8 bits (3056), Expect = 0.0e+00
Identity = 583/697 (83.64%), Postives = 623/697 (89.38%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           SI+  ++ H+ +IK GL++       L++  A  +   I  +  +FN   + +   W ++
Sbjct: 38  SIRTLRQIHAQIIKTGLHNTQFALSKLIEFSAVSRYADISYAVSLFNSIEEPNLFIWNSM 97

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCAKL SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 98  IRGLSISLSPVLALVFFVRMIHAGVE---PNSYTFPFLLKSCAKLASAREGKQIHAHVLK 157

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGE+N AQLVFD+SNFRDAISFTALIAGY LWGYMDRAR++
Sbjct: 158 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEINYAQLVFDQSNFRDAISFTALIAGYVLWGYMDRARKL 217

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMR+ANV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 218 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMRKANVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 277

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDL TA E FDEMPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 278 DLGNSMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLQTACELFDEMPERDVISWNVMIGGY 337

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASGIEPTDITFLN+LPSCA LGAIDLG WIHAYINKNFNSAST
Sbjct: 338 THMCSYKEALALFREMLASGIEPTDITFLNVLPSCACLGAIDLGKWIHAYINKNFNSAST 397

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVF+GM  KSLASWNAMICGLAMHGQA EALELFSKM S+
Sbjct: 398 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFNGMNIKSLASWNAMICGLAMHGQANEALELFSKMSSN 457

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAG VDLGR FFSSM+QDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 458 GIEPNEITFVGVLSACKHAGFVDLGRLFFSSMIQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 517

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLF+LEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 518 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGEIVAERLFKLEPDNPGAYVLLSNIYAG 577

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVARIRT+LND GMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQ+E+IYKMLEEVDRQ
Sbjct: 578 AGKWDDVARIRTKLNDMGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQTENIYKMLEEVDRQ 637

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LK  GFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIA+GLISTKPGT ITIIKNLRVCRNC
Sbjct: 638 LKEFGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPITIIKNLRVCRNC 697

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           H+ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 698 HAATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 731

BLAST of MS003752 vs. NCBI nr
Match: XP_022987625.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 1181.4 bits (3055), Expect = 0.0e+00
Identity = 582/697 (83.50%), Postives = 623/697 (89.38%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           SI+  ++ H+ +IK GL++       L++  A  +   I  +  +FN   + +   W ++
Sbjct: 38  SIRTLRQIHAQIIKTGLHNTQFALSKLIEFSAVSRYADISYAVSLFNSIEEPNLFIWNSM 97

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCA+L SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 98  IRGLSISLSPVLALVFFARMIHAGVE---PNSYTFPFLLKSCARLASAREGKQIHAHVLK 157

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGE+N AQLVFD+SNFRDAISFTALIAGY LWGYMDRAR++
Sbjct: 158 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEINYAQLVFDQSNFRDAISFTALIAGYVLWGYMDRARKL 217

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMR+ANV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 218 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMRKANVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 277

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCG L TARE FDEMPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 278 DLGNSMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGALQTARELFDEMPERDVISWNVMIGGY 337

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASGIEPTDITFLN+LPSCA LGAIDLG WIHAYINKNFNSAST
Sbjct: 338 THMCSYKEALALFREMLASGIEPTDITFLNVLPSCACLGAIDLGKWIHAYINKNFNSAST 397

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SLWTSLIDMYAKCGNI+AARQVF+GM  KSLASWNAMICGLAMHGQA EALELFSK+ SD
Sbjct: 398 SLWTSLIDMYAKCGNIEAARQVFNGMNIKSLASWNAMICGLAMHGQANEALELFSKLTSD 457

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAG VDLGR FFSSM+QDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 458 GIEPNEITFVGVLSACKHAGFVDLGRLFFSSMIQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 517

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 518 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGEIVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 577

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVA IRT+LND+GMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSE+IYKMLEEVDRQ
Sbjct: 578 AGKWDDVATIRTKLNDKGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSENIYKMLEEVDRQ 637

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LK  GFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIA+GLISTKPGT ITIIKNLRVCRNC
Sbjct: 638 LKEFGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPITIIKNLRVCRNC 697

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           H+ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 698 HAATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 731

BLAST of MS003752 vs. NCBI nr
Match: KAA0046752.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK29694.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 1179.5 bits (3050), Expect = 0.0e+00
Identity = 580/697 (83.21%), Postives = 622/697 (89.24%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           +I+  ++ H+H+IK GL++       L++  A  + G I  +  +F+     +   W ++
Sbjct: 41  NIRTFKQIHAHIIKTGLHNTHFALSKLIEFSAVSRSGDISYAISLFSSIEDPNLFIWNSM 100

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCAKL SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 101 IRGLSMSLSPVLALVFFVRMIYSGVE---PNSYTFPFLLKSCAKLASAREGKQIHAHVLK 160

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGEMN+AQL+FD+SNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQ+
Sbjct: 161 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEMNNAQLIFDQSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQL 220

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPV+DVVSWNAMIAGYAQ GRSKEALLLFE+MR+ NV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 221 FDEMPVKDVVSWNAMIAGYAQMGRSKEALLLFEDMRKENVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 280

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDL TARE FD+MPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 281 DLGNSMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLPTARELFDDMPERDVISWNVMIGGY 340

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASG+EPT+ITFL+ILPSCAHLGAIDLG WIHAYINKNFNS ST
Sbjct: 341 THMCSYKEALALFREMLASGVEPTEITFLSILPSCAHLGAIDLGKWIHAYINKNFNSVST 400

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SL TSLID+YAKCGNI AARQVFDGM  KSLASWNAMICGLAMHGQA+EA ELFSKM SD
Sbjct: 401 SLSTSLIDLYAKCGNIVAARQVFDGMNIKSLASWNAMICGLAMHGQADEAFELFSKMSSD 460

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLG Q FSSMVQDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 461 GIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGHQIFSSMVQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 520

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNME+KPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 521 AESLIQNMEVKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGELVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 580

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVD+Q
Sbjct: 581 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDKQ 640

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LKV GFV DTSEVLYDMDEEWKEG LSHHSEKLAIA+GLISTKPGT I IIKNLRVCRNC
Sbjct: 641 LKVFGFVADTSEVLYDMDEEWKEGTLSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPIRIIKNLRVCRNC 700

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 701 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 734

BLAST of MS003752 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LN01 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H12 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 877.9 bits (2267), Expect = 1.1e-253
Identity = 415/692 (59.97%), Postives = 536/692 (77.46%), Query Frame = 0

Query: 302 HSHLIKLGLNSDPIISGALLD---MYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALISGYAQH 361
           H+ +IK+GL++       L++   +      +  +  VF    + + + W  +  G+A  
Sbjct: 53  HAQMIKIGLHNTNYALSKLIEFCILSPHFEGLPYAISVFKTIQEPNLLIWNTMFRGHALS 112

Query: 362 GDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLKLGFVSDV 421
            D  + +KL+  M    +    PNSYTFPF+LKSCAK  + +EG+QIH HVLKLG   D+
Sbjct: 113 SDPVSALKLYVCMISLGL---LPNSYTFPFVLKSCAKSKAFKEGQQIHGHVLKLGCDLDL 172

Query: 422 YIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVR 481
           Y+HTSLI+MY Q+G +  A  VFDKS  RD +S+TALI GYA  GY++ A+++FDE+PV+
Sbjct: 173 YVHTSLISMYVQNGRLEDAHKVFDKSPHRDVVSYTALIKGYASRGYIENAQKLFDEIPVK 232

Query: 482 DVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMR 541
           DVVSWNAMI+GYA+TG  KEAL LF++M + NV P+EST+V+V+SACAQS +++LG  + 
Sbjct: 233 DVVSWNAMISGYAETGNYKEALELFKDMMKTNVRPDESTMVTVVSACAQSGSIELGRQVH 292

Query: 542 SWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYK 601
            WI+D G  SNLK+VNALID+YSKCG+L TA   F+ +P +DVISWN +IGGYTH+  YK
Sbjct: 293 LWIDDHGFGSNLKIVNALIDLYSKCGELETACGLFERLPYKDVISWNTLIGGYTHMNLYK 352

Query: 602 EALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSA--STSLWTS 661
           EAL LF++ML SG  P D+T L+ILP+CAHLGAID+G WIH YI+K       ++SL TS
Sbjct: 353 EALLLFQEMLRSGETPNDVTMLSILPACAHLGAIDIGRWIHVYIDKRLKGVTNASSLRTS 412

Query: 662 LIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRIEPN 721
           LIDMYAKCG+I+AA QVF+ +  KSL+SWNAMI G AMHG+A+ + +LFS+M    I+P+
Sbjct: 413 LIDMYAKCGDIEAAHQVFNSILHKSLSSWNAMIFGFAMHGRADASFDLFSRMRKIGIQPD 472

Query: 722 EITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLI 781
           +ITFVG+LSAC H+G++DLGR  F +M QDYK+ PK +HYGCMIDLLG +GLF+EAE +I
Sbjct: 473 DITFVGLLSACSHSGMLDLGRHIFRTMTQDYKMTPKLEHYGCMIDLLGHSGLFKEAEEMI 532

Query: 782 QNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWD 841
             MEM+PDG IW SLL AC+ HG VELGES AE L ++EP+NPG+YVLLSNIYA AG+W+
Sbjct: 533 NMMEMEPDGVIWCSLLKACKMHGNVELGESFAENLIKIEPENPGSYVLLSNIYASAGRWN 592

Query: 842 DVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTG 901
           +VA+ R  LND+GMKKVPGC++IE+D+VVHEF++GDK HP++ +IY MLEE++  L+  G
Sbjct: 593 EVAKTRALLNDKGMKKVPGCSSIEIDSVVHEFIIGDKFHPRNREIYGMLEEMEVLLEKAG 652

Query: 902 FVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATK 961
           FVPDTSEVL +M+EEWKEGAL HHSEKLAIA+GLISTKPGT +TI+KNLRVCRNCH ATK
Sbjct: 653 FVPDTSEVLQEMEEEWKEGALRHHSEKLAIAFGLISTKPGTKLTIVKNLRVCRNCHEATK 712

Query: 962 LISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           LISKI+ REIIARDR RFHHF+DG CSCNDYW
Sbjct: 713 LISKIYKREIIARDRTRFHHFRDGVCSCNDYW 741

BLAST of MS003752 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIB2 (Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g09950 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H35 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 640.2 bits (1650), Expect = 3.9e-182
Identity = 366/1007 (36.35%), Postives = 563/1007 (55.91%), Query Frame = 0

Query: 2   HTHTLKCGFEGDVFAGNALITMYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGDH 61
           H+   K   + DV+  N LI  Y      V AR+VFDEMP R+ VSW+ +++GY++ G+H
Sbjct: 24  HSRLYKNRLDKDVYLCNNLINAYLETGDSVSARKVFDEMPLRNCVSWACIVSGYSRNGEH 83

Query: 62  GLEAISVFIQMVREGLKFDNVAITGAVSVCGHERNLEL--GKQIHCLAMKTGYGTHTSVC 121
             EA+     MV+EG+  +  A    +  C    ++ +  G+QIH L  K  Y     V 
Sbjct: 84  -KEALVFLRDMVKEGIFSNQYAFVSVLRACQEIGSVGILFGRQIHGLMFKLSYAVDAVVS 143

Query: 122 NVLISTYSKC-EVIEDAKAVFKLMDDCNVISWTTMISL-----NEEDAVALFNKMRVDGV 181
           NVLIS Y KC   +  A   F  ++  N +SW ++IS+     ++  A  +F+ M+ DG 
Sbjct: 144 NVLISMYWKCIGSVGYALCAFGDIEVKNSVSWNSIISVYSQAGDQRSAFRIFSSMQYDGS 203

Query: 182 YPNDVTFIGLLHAITMRNMVEQGLTVHGLCI--KADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDS 241
            P + TF  L+         +  L    +C   K+  L++L VG+ L++ +AK   +  +
Sbjct: 204 RPTEYTFGSLVTTACSLTEPDVRLLEQIMCTIQKSGLLTDLFVGSGLVSAFAKSGSLSYA 263

Query: 242 SRVFIELPYREIISWNALISGYAQNTLCQEALETF--LCAIMESKPNEYT-FGSVLNAIS 301
            +VF ++  R  ++ N L+ G  +    +EA + F  + ++++  P  Y    S     S
Sbjct: 264 RKVFNQMETRNAVTLNGLMVGLVRQKWGEEATKLFMDMNSMIDVSPESYVILLSSFPEYS 323

Query: 302 AGQDISIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPI-ISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVA 361
             +++ +K G+  H H+I  GL    + I   L++MYAK GSI +++RVF   + +  V+
Sbjct: 324 LAEEVGLKKGREVHGHVITTGLVDFMVGIGNGLVNMYAKCGSIADARRVFYFMTDKDSVS 383

Query: 362 WTALISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHA 421
           W ++I+G  Q+G +   ++ ++ M +  I    P S+T    L SCA L  A+ G+QIH 
Sbjct: 384 WNSMITGLDQNGCFIEAVERYKSMRRHDI---LPGSFTLISSLSSCASLKWAKLGQQIHG 443

Query: 422 HVLKLGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDR 481
             LKLG   +V +  +L+ +YA++                               GY++ 
Sbjct: 444 ESLKLGIDLNVSVSNALMTLYAET-------------------------------GYLNE 503

Query: 482 ARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRS-KEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACA 541
            R++F  MP  D VSWN++I   A++ RS  EA++ F   + A    N  T  SVLSA +
Sbjct: 504 CRKIFSSMPEHDQVSWNSIIGALARSERSLPEAVVCFLNAQRAGQKLNRITFSSVLSAVS 563

Query: 542 QSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPE-RDVISWN 601
             +  +LG  +        +       NALI  Y KCG++    + F  M E RD ++WN
Sbjct: 564 SLSFGELGKQIHGLALKNNIADEATTENALIACYGKCGEMDGCEKIFSRMAERRDNVTWN 623

Query: 602 VMIGGYTHICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKN 661
            MI GY H     +AL L   ML +G       +  +L + A +  ++ GM +HA   + 
Sbjct: 624 SMISGYIHNELLAKALDLVWFMLQTGQRLDSFMYATVLSAFASVATLERGMEVHACSVRA 683

Query: 662 FNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELF 721
              +   + ++L+DMY+KCG +D A + F+ M  ++  SWN+MI G A HGQ EEAL+LF
Sbjct: 684 CLESDVVVGSALVDMYSKCGRLDYALRFFNTMPVRNSYSWNSMISGYARHGQGEEALKLF 743

Query: 722 SKMHSD-RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLG 781
             M  D +  P+ +TFVGVLSAC HAGL++ G + F SM   Y +AP+ +H+ CM D+LG
Sbjct: 744 ETMKLDGQTPPDHVTFVGVLSACSHAGLLEEGFKHFESMSDSYGLAPRIEHFSCMADVLG 803

Query: 782 RAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGA-CRDHGR-VELGESVAERLFELEPDNPGAY 841
           RAG  ++ E  I+ M MKP+  IW ++LGA CR +GR  ELG+  AE LF+LEP+N   Y
Sbjct: 804 RAGELDKLEDFIEKMPMKPNVLIWRTVLGACCRANGRKAELGKKAAEMLFQLEPENAVNY 863

Query: 842 VLLSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIY 901
           VLL N+YA  G+W+D+ + R ++ D  +KK  G + + + + VH F+ GDK HP ++ IY
Sbjct: 864 VLLGNMYAAGGRWEDLVKARKKMKDADVKKEAGYSWVTMKDGVHMFVAGDKSHPDADVIY 923

Query: 902 KMLEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGT-TITI 961
           K L+E++R+++  G+VP T   LYD+++E KE  LS+HSEKLA+A+ L + +  T  I I
Sbjct: 924 KKLKELNRKMRDAGYVPQTGFALYDLEQENKEEILSYHSEKLAVAFVLAAQRSSTLPIRI 983

Query: 962 IKNLRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           +KNLRVC +CHSA K ISKI  R+II RD NRFHHF+DG+CSC+D+W
Sbjct: 984 MKNLRVCGDCHSAFKYISKIEGRQIILRDSNRFHHFQDGACSCSDFW 995

BLAST of MS003752 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SVP7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g13650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H42 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 632.5 bits (1630), Expect = 8.1e-180
Identity = 350/995 (35.18%), Postives = 540/995 (54.27%), Query Frame = 0

Query: 1    LHTHTLKCGFEGDVFAGNALITMYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGD 60
            LH+  LK G + +      L   Y     L  A +VFDEMP R   +W+ MI   A    
Sbjct: 107  LHSQILKLGLDSNGCLSEKLFDFYLFKGDLYGAFKVFDEMPERTIFTWNKMIKELASRNL 166

Query: 61   HGLEAISVFIQMVREGLKFDNVAITGAVSVC-GHERNLELGKQIHCLAMKTGYGTHTSVC 120
             G E   +F++MV E +  +    +G +  C G     ++ +QIH   +  G    T VC
Sbjct: 167  IG-EVFGLFVRMVSENVTPNEGTFSGVLEACRGGSVAFDVVEQIHARILYQGLRDSTVVC 226

Query: 121  NVLISTYSKCEVIEDAKAVFKLMDDCNVISWTTMIS-----LNEEDAVALFNKMRVDGVY 180
            N LI  YS+   ++ A+ VF  +   +  SW  MIS       E +A+ LF  M V G+ 
Sbjct: 227  NPLIDLYSRNGFVDLARRVFDGLRLKDHSSWVAMISGLSKNECEAEAIRLFCDMYVLGIM 286

Query: 181  PNDVTFIGLLHAITMRNMVEQGLTVHGLCIKADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDSSRV 240
            P    F  +L A      +E G  +HGL +K  F S+  V N+L+++Y     +  +  +
Sbjct: 287  PTPYAFSSVLSACKKIESLEIGEQLHGLVLKLGFSSDTYVCNALVSLYFHLGNLISAEHI 346

Query: 241  FIELPYREIISWNALISGYAQNTLCQEALETFLCAIMES-KPNEYTFGSVLNAISAGQDI 300
            F  +  R+ +++N LI+G +Q    ++A+E F    ++  +P+  T  S++ A SA  D 
Sbjct: 347  FSNMSQRDAVTYNTLINGLSQCGYGEKAMELFKRMHLDGLEPDSNTLASLVVACSA--DG 406

Query: 301  SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALIS 360
            ++  GQ+ H++  KLG  S+  I GALL++YAK   I+ +   F ET   + V W  ++ 
Sbjct: 407  TLFRGQQLHAYTTKLGFASNNKIEGALLNLYAKCADIETALDYFLETEVENVVLWNVMLV 466

Query: 361  GYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLKLG 420
             Y    D     ++F +M+ E+I    PN YT+P +LK+C +L     G+QIH+ ++K  
Sbjct: 467  AYGLLDDLRNSFRIFRQMQIEEI---VPNQYTYPSILKTCIRLGDLELGEQIHSQIIKTN 526

Query: 421  FVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFD 480
            F  + Y+ + LI+MYA+ G++++A                        W  + R      
Sbjct: 527  FQLNAYVCSVLIDMYAKLGKLDTA------------------------WDILIR------ 586

Query: 481  EMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDL 540
                +DVVSW  MIAGY Q     +AL  F +M +  +  +E  + + +SACA   AL  
Sbjct: 587  -FAGKDVVSWTTMIAGYTQYNFDDKALTTFRQMLDRGIRSDEVGLTNAVSACAGLQALKE 646

Query: 541  GNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTH 600
            G  + +     G  S+L   NAL+ +YS+CG +  +   F++    D I+WN ++ G+  
Sbjct: 647  GQQIHAQACVSGFSSDLPFQNALVTLYSRCGKIEESYLAFEQTEAGDNIAWNALVSGFQQ 706

Query: 601  ICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSL 660
              N +EAL +F +M   GI+  + TF + + + +    +  G  +HA I K    + T +
Sbjct: 707  SGNNEEALRVFVRMNREGIDNNNFTFGSAVKAASETANMKQGKQVHAVITKTGYDSETEV 766

Query: 661  WTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRI 720
              +LI MYAKCG+I  A + F  + TK+  SWNA+I   + HG   EAL+ F +M    +
Sbjct: 767  CNALISMYAKCGSISDAEKQFLEVSTKNEVSWNAIINAYSKHGFGSEALDSFDQMIHSNV 826

Query: 721  EPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAE 780
             PN +T VGVLSAC H GLVD G  +F SM  +Y ++PK +HY C++D+L RAGL   A+
Sbjct: 827  RPNHVTLVGVLSACSHIGLVDKGIAYFESMNSEYGLSPKPEHYVCVVDMLTRAGLLSRAK 886

Query: 781  SLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAG 840
              IQ M +KPD  +W +LL AC  H  +E+GE  A  L ELEP++   YVLLSN+YA + 
Sbjct: 887  EFIQEMPIKPDALVWRTLLSACVVHKNMEIGEFAAHHLLELEPEDSATYVLLSNLYAVSK 946

Query: 841  KWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLK 900
            KWD     R ++ ++G+KK PG + IEV N +H F VGD+ HP +++I++  +++ ++  
Sbjct: 947  KWDARDLTRQKMKEKGVKKEPGQSWIEVKNSIHSFYVGDQNHPLADEIHEYFQDLTKRAS 1006

Query: 901  VTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHS 960
              G+V D   +L ++  E K+  +  HSEKLAI++GL+S      I ++KNLRVC +CH+
Sbjct: 1007 EIGYVQDCFSLLNELQHEQKDPIIFIHSEKLAISFGLLSLPATVPINVMKNLRVCNDCHA 1064

Query: 961  ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
              K +SK+ NREII RD  RFHHF+ G+CSC DYW
Sbjct: 1067 WIKFVSKVSNREIIVRDAYRFHHFEGGACSCKDYW 1064

BLAST of MS003752 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SMZ2 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g33170 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H53 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 596.7 bits (1537), Expect = 4.9e-169
Identity = 341/985 (34.62%), Postives = 542/985 (55.03%), Query Frame = 0

Query: 15  FAGNALITMYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGDHGLEAIS---VFIQ 74
           F  N LI+MYS+   L  AR+VFD+MP RD VSW++++  YAQ  +  +E I    +  +
Sbjct: 75  FLINNLISMYSKCGSLTYARRVFDKMPDRDLVSWNSILAAYAQSSECVVENIQQAFLLFR 134

Query: 75  MVREGLKF-DNVAITGAVSVCGHERNLELGKQIHCLAMKTGYGTHTSVCNVLISTYSKCE 134
           ++R+ + +   + ++  + +C H   +   +  H  A K G      V   L++ Y K  
Sbjct: 135 ILRQDVVYTSRMTLSPMLKLCLHSGYVWASESFHGYACKIGLDGDEFVAGALVNIYLKFG 194

Query: 135 VIEDAKAVFKLMDDCNVISWTTMISLN-----EEDAVALFNKMRVDGVYPNDVTFIGLLH 194
            +++ K +F+ M   +V+ W  M+        +E+A+ L +     G+ PN++T      
Sbjct: 195 KVKEGKVLFEEMPYRDVVLWNLMLKAYLEMGFKEEAIDLSSAFHSSGLNPNEITL----- 254

Query: 195 AITMRNMVEQGLTVHGLCIKADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDSSRVFIELPYREIIS 254
                                  L+ +S  +S       F    D+S V       EII 
Sbjct: 255 ---------------------RLLARISGDDSDAGQVKSFANGNDASSV------SEIIF 314

Query: 255 WNALISGYAQNTLCQEALETFLCAI-MESKPNEYTFGSVLNAISAGQDISIKHGQRCHSH 314
            N  +S Y  +      L+ F   +  + + ++ TF  +L   +A +  S+  GQ+ H  
Sbjct: 315 RNKGLSEYLHSGQYSALLKCFADMVESDVECDQVTF--ILMLATAVKVDSLALGQQVHCM 374

Query: 315 LIKLGLNSDPIISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALISGYAQHGDYDTV 374
            +KLGL+    +S +L++MY K      ++ VF+  S+R  ++W ++I+G AQ+G     
Sbjct: 375 ALKLGLDLMLTVSNSLINMYCKLRKFGFARTVFDNMSERDLISWNSVIAGIAQNGLEVEA 434

Query: 375 MKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSARE-GKQIHAHVLKLGFVSDVYIHTS 434
           + LF ++ +  +KPD    YT   +LK+ + L       KQ+H H +K+  VSD ++ T+
Sbjct: 435 VCLFMQLLRCGLKPD---QYTMTSVLKAASSLPEGLSLSKQVHVHAIKINNVSDSFVSTA 494

Query: 435 LINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSW 494
           LI+ Y+++  M  A+++F++ NF                                D+V+W
Sbjct: 495 LIDAYSRNRCMKEAEILFERHNF--------------------------------DLVAW 554

Query: 495 NAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMRSWIED 554
           NAM+AGY Q+    + L LF  M +     ++ T+ +V   C    A++ G  + ++   
Sbjct: 555 NAMMAGYTQSHDGHKTLKLFALMHKQGERSDDFTLATVFKTCGFLFAINQGKQVHAYAIK 614

Query: 555 RGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYKEALAL 614
            G   +L + + ++DMY KCGD+  A+  FD +P  D ++W  MI G       + A  +
Sbjct: 615 SGYDLDLWVSSGILDMYVKCGDMSAAQFAFDSIPVPDDVAWTTMISGCIENGEEERAFHV 674

Query: 615 FRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSLWTSLIDMYAK 674
           F QM   G+ P + T   +  + + L A++ G  IHA   K   +    + TSL+DMYAK
Sbjct: 675 FSQMRLMGVLPDEFTIATLAKASSCLTALEQGRQIHANALKLNCTNDPFVGTSLVDMYAK 734

Query: 675 CGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRIEPNEITFVGV 734
           CG+ID A  +F  ++  ++ +WNAM+ GLA HG+ +E L+LF +M S  I+P+++TF+GV
Sbjct: 735 CGSIDDAYCLFKRIEMMNITAWNAMLVGLAQHGEGKETLQLFKQMKSLGIKPDKVTFIGV 794

Query: 735 LSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLIQNMEMKP 794
           LSAC H+GLV    +   SM  DY I P+ +HY C+ D LGRAGL ++AE+LI++M M+ 
Sbjct: 795 LSACSHSGLVSEAYKHMRSMHGDYGIKPEIEHYSCLADALGRAGLVKQAENLIESMSMEA 854

Query: 795 DGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWDDVARIRT 854
             +++ +LL ACR  G  E G+ VA +L ELEP +  AYVLLSN+YA A KWD++   RT
Sbjct: 855 SASMYRTLLAACRVQGDTETGKRVATKLLELEPLDSSAYVLLSNMYAAASKWDEMKLART 914

Query: 855 RLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTGFVPDTSE 914
            +    +KK PG + IEV N +H F+V D+ + Q+E IY+ ++++ R +K  G+VP+T  
Sbjct: 915 MMKGHKVKKDPGFSWIEVKNKIHIFVVDDRSNRQTELIYRKVKDMIRDIKQEGYVPETDF 974

Query: 915 VLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATKLISKIFN 974
            L D++EE KE AL +HSEKLA+A+GL+ST P T I +IKNLRVC +CH+A K I+K++N
Sbjct: 975 TLVDVEEEEKERALYYHSEKLAVAFGLLSTPPSTPIRVIKNLRVCGDCHNAMKYIAKVYN 990

Query: 975 REIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           REI+ RD NRFH FKDG CSC DYW
Sbjct: 1035 REIVLRDANRFHRFKDGICSCGDYW 990

BLAST of MS003752 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SHZ8 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g22070 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H41 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 577.8 bits (1488), Expect = 2.4e-163
Identity = 300/704 (42.61%), Postives = 420/704 (59.66%), Query Frame = 0

Query: 320 LLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPD 379
           +L  Y+KRG +  +   F++  +R  V+WT +I GY   G Y   +++  +M KE I+  
Sbjct: 86  VLSAYSKRGDMDSTCEFFDQLPQRDSVSWTTMIVGYKNIGQYHKAIRVMGDMVKEGIE-- 145

Query: 380 APNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLKLGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQL 439
            P  +T   +L S A       GK++H+ ++KLG   +V +  SL+NMYA+ G+   A+ 
Sbjct: 146 -PTQFTLTNVLASVAATRCMETGKKVHSFIVKLGLRGNVSVSNSLLNMYAKCGDPMMAKF 205

Query: 440 VFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEA 499
           VFD+   RD  S+ A+IA +   G MD A   F++M  RD+V+WN+MI+G+ Q G    A
Sbjct: 206 VFDRMVVRDISSWNAMIALHMQVGQMDLAMAQFEQMAERDIVTWNSMISGFNQRGYDLRA 265

Query: 500 LLLFEEM-REANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALID 559
           L +F +M R++ ++P+  T+ SVLSACA    L +G  + S I   G   +  ++NALI 
Sbjct: 266 LDIFSKMLRDSLLSPDRFTLASVLSACANLEKLCIGKQIHSHIVTTGFDISGIVLNALIS 325

Query: 560 MYSKCGDLLTAREFFDE---------------------------------MPERDVISWN 619
           MYS+CG + TAR   ++                                 + +RDV++W 
Sbjct: 326 MYSRCGGVETARRLIEQRGTKDLKIEGFTALLDGYIKLGDMNQAKNIFVSLKDRDVVAWT 385

Query: 620 VMIGGYTHICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKN 679
            MI GY    +Y EA+ LFR M+  G  P   T   +L   + L ++  G  IH    K+
Sbjct: 386 AMIVGYEQHGSYGEAINLFRSMVGGGQRPNSYTLAAMLSVASSLASLSHGKQIHGSAVKS 445

Query: 680 FNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMK-TKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALEL 739
               S S+  +LI MYAK GNI +A + FD ++  +   SW +MI  LA HG AEEALEL
Sbjct: 446 GEIYSVSVSNALITMYAKAGNITSASRAFDLIRCERDTVSWTSMIIALAQHGHAEEALEL 505

Query: 740 FSKMHSDRIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLG 799
           F  M  + + P+ IT+VGV SAC HAGLV+ GRQ+F  M    KI P   HY CM+DL G
Sbjct: 506 FETMLMEGLRPDHITYVGVFSACTHAGLVNQGRQYFDMMKDVDKIIPTLSHYACMVDLFG 565

Query: 800 RAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVL 859
           RAGL +EA+  I+ M ++PD   WGSLL ACR H  ++LG+  AERL  LEP+N GAY  
Sbjct: 566 RAGLLQEAQEFIEKMPIEPDVVTWGSLLSACRVHKNIDLGKVAAERLLLLEPENSGAYSA 625

Query: 860 LSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKM 919
           L+N+Y+  GKW++ A+IR  + D  +KK  G + IEV + VH F V D  HP+  +IY  
Sbjct: 626 LANLYSACGKWEEAAKIRKSMKDGRVKKEQGFSWIEVKHKVHVFGVEDGTHPEKNEIYMT 685

Query: 920 LEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKN 979
           ++++  ++K  G+VPDT+ VL+D++EE KE  L HHSEKLAIA+GLIST   TT+ I+KN
Sbjct: 686 MKKIWDEIKKMGYVPDTASVLHDLEEEVKEQILRHHSEKLAIAFGLISTPDKTTLRIMKN 745

Query: 980 LRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           LRVC +CH+A K ISK+  REII RD  RFHHFKDG CSC DYW
Sbjct: 746 LRVCNDCHTAIKFISKLVGREIIVRDTTRFHHFKDGFCSCRDYW 786

BLAST of MS003752 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HAU9 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461670 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 1182.2 bits (3057), Expect = 0.0e+00
Identity = 584/697 (83.79%), Postives = 623/697 (89.38%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           SI+  ++ H+ +IK GL++       L++  A  +   I  +  +FN   + +   W ++
Sbjct: 38  SIRTLRQIHAQIIKTGLHNTQFALSKLIEFSAVSRYADISYAVSLFNSIEEPNLFIWNSM 97

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCAKL SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 98  IRGLSISLSPVLALVFFVRMIHAGVE---PNSYTFPFLLKSCAKLASAREGKQIHAHVLK 157

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGE+N AQLVFD+SNFRDAISFTALIAGY LWGYMDRAR++
Sbjct: 158 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEINYAQLVFDQSNFRDAISFTALIAGYVLWGYMDRARKL 217

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMR+ANV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 218 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMRKANVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 277

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGL SNLKLVNALIDMYSKCGDL TARE FDEMPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 278 DLGNSMRSWIEDRGLCSNLKLVNALIDMYSKCGDLQTARELFDEMPERDVISWNVMIGGY 337

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASGIEPTDITFLN+LPSCA LGAID+G WIHAYINKNFNSAST
Sbjct: 338 THMCSYKEALALFREMLASGIEPTDITFLNVLPSCACLGAIDVGKWIHAYINKNFNSAST 397

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVF+GM  KSLASWNAMICGLAMHGQA EALELFSKM SD
Sbjct: 398 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFNGMNFKSLASWNAMICGLAMHGQANEALELFSKMSSD 457

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAG VDLGR FFSSM+QDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 458 GIEPNEITFVGVLSACKHAGFVDLGRLFFSSMIQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 517

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 518 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGEIVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 577

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVARIRT+LND+GMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVH QSE+IYKMLEEVDRQ
Sbjct: 578 AGKWDDVARIRTKLNDKGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHLQSENIYKMLEEVDRQ 637

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LK  GFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIA+GLISTKPGT ITIIKNLRVCRNC
Sbjct: 638 LKEFGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPITIIKNLRVCRNC 697

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           H+ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 698 HAATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 731

BLAST of MS003752 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JHE6 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485125 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 1181.4 bits (3055), Expect = 0.0e+00
Identity = 582/697 (83.50%), Postives = 623/697 (89.38%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           SI+  ++ H+ +IK GL++       L++  A  +   I  +  +FN   + +   W ++
Sbjct: 38  SIRTLRQIHAQIIKTGLHNTQFALSKLIEFSAVSRYADISYAVSLFNSIEEPNLFIWNSM 97

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCA+L SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 98  IRGLSISLSPVLALVFFARMIHAGVE---PNSYTFPFLLKSCARLASAREGKQIHAHVLK 157

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGE+N AQLVFD+SNFRDAISFTALIAGY LWGYMDRAR++
Sbjct: 158 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEINYAQLVFDQSNFRDAISFTALIAGYVLWGYMDRARKL 217

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMR+ANV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 218 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMRKANVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 277

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCG L TARE FDEMPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 278 DLGNSMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGALQTARELFDEMPERDVISWNVMIGGY 337

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASGIEPTDITFLN+LPSCA LGAIDLG WIHAYINKNFNSAST
Sbjct: 338 THMCSYKEALALFREMLASGIEPTDITFLNVLPSCACLGAIDLGKWIHAYINKNFNSAST 397

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SLWTSLIDMYAKCGNI+AARQVF+GM  KSLASWNAMICGLAMHGQA EALELFSK+ SD
Sbjct: 398 SLWTSLIDMYAKCGNIEAARQVFNGMNIKSLASWNAMICGLAMHGQANEALELFSKLTSD 457

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAG VDLGR FFSSM+QDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 458 GIEPNEITFVGVLSACKHAGFVDLGRLFFSSMIQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 517

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 518 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGEIVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 577

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVA IRT+LND+GMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSE+IYKMLEEVDRQ
Sbjct: 578 AGKWDDVATIRTKLNDKGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSENIYKMLEEVDRQ 637

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LK  GFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIA+GLISTKPGT ITIIKNLRVCRNC
Sbjct: 638 LKEFGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPITIIKNLRVCRNC 697

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           H+ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 698 HAATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 731

BLAST of MS003752 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TTJ1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold64G00470 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 1179.5 bits (3050), Expect = 0.0e+00
Identity = 580/697 (83.21%), Postives = 622/697 (89.24%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           +I+  ++ H+H+IK GL++       L++  A  + G I  +  +F+     +   W ++
Sbjct: 41  NIRTFKQIHAHIIKTGLHNTHFALSKLIEFSAVSRSGDISYAISLFSSIEDPNLFIWNSM 100

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCAKL SAREGKQIHAHVLK
Sbjct: 101 IRGLSMSLSPVLALVFFVRMIYSGVE---PNSYTFPFLLKSCAKLASAREGKQIHAHVLK 160

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGEMN+AQL+FD+SNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQ+
Sbjct: 161 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEMNNAQLIFDQSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQL 220

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPV+DVVSWNAMIAGYAQ GRSKEALLLFE+MR+ NV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 221 FDEMPVKDVVSWNAMIAGYAQMGRSKEALLLFEDMRKENVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 280

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDL TARE FD+MPERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 281 DLGNSMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLPTARELFDDMPERDVISWNVMIGGY 340

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASG+EPT+ITFL+ILPSCAHLGAIDLG WIHAYINKNFNS ST
Sbjct: 341 THMCSYKEALALFREMLASGVEPTEITFLSILPSCAHLGAIDLGKWIHAYINKNFNSVST 400

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SL TSLID+YAKCGNI AARQVFDGM  KSLASWNAMICGLAMHGQA+EA ELFSKM SD
Sbjct: 401 SLSTSLIDLYAKCGNIVAARQVFDGMNIKSLASWNAMICGLAMHGQADEAFELFSKMSSD 460

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLG Q FSSMVQDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 461 GIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGHQIFSSMVQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 520

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESLIQNME+KPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 521 AESLIQNMEVKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGELVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 580

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVD+Q
Sbjct: 581 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDKQ 640

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LKV GFV DTSEVLYDMDEEWKEG LSHHSEKLAIA+GLISTKPGT I IIKNLRVCRNC
Sbjct: 641 LKVFGFVADTSEVLYDMDEEWKEGTLSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPIRIIKNLRVCRNC 700

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 701 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 734

BLAST of MS003752 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LU28 (DYW_deaminase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G306800 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 1178.7 bits (3048), Expect = 0.0e+00
Identity = 580/697 (83.21%), Postives = 624/697 (89.53%), Query Frame = 0

Query: 294 SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYA--KRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTAL 353
           SI+  ++ H+H+IK GL++       L++  A  + G I  +  +FN   + +   W ++
Sbjct: 41  SIRTFKQIHAHIIKTGLHNTLFALSKLIEFSAVSRSGDISYAISLFNSIEEPNLFIWNSM 100

Query: 354 ISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLK 413
           I G +        +  F  M    ++   PNSYTFPFLLKSCAKL SA EGKQIHAHVLK
Sbjct: 101 IRGLSMSLSPALALVFFVRMIYSGVE---PNSYTFPFLLKSCAKLASAHEGKQIHAHVLK 160

Query: 414 LGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQM 473
           LGFVSDV+IHTSLINMYAQSGEMN+AQLVFD+SNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQ+
Sbjct: 161 LGFVSDVFIHTSLINMYAQSGEMNNAQLVFDQSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQL 220

Query: 474 FDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNAL 533
           FDEMPV+DVVSWNAMIAGYAQ GRSKEALLLFE+MR+ANV PNESTIVSVLSACAQSNAL
Sbjct: 221 FDEMPVKDVVSWNAMIAGYAQMGRSKEALLLFEDMRKANVPPNESTIVSVLSACAQSNAL 280

Query: 534 DLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGY 593
           DLGN MRSWIEDRGL SNLKLVNALIDMYSKCGDL TARE FD+M ERDVISWNVMIGGY
Sbjct: 281 DLGNSMRSWIEDRGLCSNLKLVNALIDMYSKCGDLQTARELFDDMLERDVISWNVMIGGY 340

Query: 594 THICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSAST 653
           TH+C+YKEALALFR+MLASG+EPT+ITFL+ILPSCAHLGAIDLG WIHAYINKNFNS ST
Sbjct: 341 THMCSYKEALALFREMLASGVEPTEITFLSILPSCAHLGAIDLGKWIHAYINKNFNSVST 400

Query: 654 SLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSD 713
           SL TSLID+YAKCGNI AARQVFDGMK KSLASWNAMICGLAMHGQA++A ELFSKM SD
Sbjct: 401 SLSTSLIDLYAKCGNIVAARQVFDGMKIKSLASWNAMICGLAMHGQADKAFELFSKMSSD 460

Query: 714 RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 773
            IEPNEITFVG+LSACKHAGLVDLG+QFFSSMVQDYKI+PKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE
Sbjct: 461 GIEPNEITFVGILSACKHAGLVDLGQQFFSSMVQDYKISPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEE 520

Query: 774 AESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 833
           AESL+QNME+KPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGE VAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG
Sbjct: 521 AESLLQNMEVKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGELVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAG 580

Query: 834 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQ 893
           AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIY+MLEEVD Q
Sbjct: 581 AGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYRMLEEVDEQ 640

Query: 894 LKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNC 953
           LKV GFV DTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIA+GLISTKPGT I IIKNLRVCRNC
Sbjct: 641 LKVFGFVADTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAFGLISTKPGTPIRIIKNLRVCRNC 700

Query: 954 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 701 HSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 734

BLAST of MS003752 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CUC8 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014429 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 1139.4 bits (2946), Expect = 0.0e+00
Identity = 554/558 (99.28%), Postives = 557/558 (99.82%), Query Frame = 0

Query: 431 SGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGY 490
           SGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALI+GYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGY
Sbjct: 122 SGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALISGYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGY 181

Query: 491 AQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNL 550
           AQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNL
Sbjct: 182 AQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNL 241

Query: 551 KLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYKEALALFRQMLAS 610
           KLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYKEALALFRQMLAS
Sbjct: 242 KLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYKEALALFRQMLAS 301

Query: 611 GIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAA 670
           GIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAA
Sbjct: 302 GIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAA 361

Query: 671 RQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRIEPNEITFVGVLSACKHA 730
           RQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAE+ALELFSKM+SDRIEPNEITFVGVLSACKHA
Sbjct: 362 RQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEDALELFSKMYSDRIEPNEITFVGVLSACKHA 421

Query: 731 GLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGS 790
           GLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPK QHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGS
Sbjct: 422 GLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKFQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGS 481

Query: 791 LLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGM 850
           LLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGM
Sbjct: 482 LLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGM 541

Query: 851 KKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDE 910
           KKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDE
Sbjct: 542 KKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDE 601

Query: 911 EWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARD 970
           EWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARD
Sbjct: 602 EWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARD 661

Query: 971 RNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           RNRFHHFKDGSCSCNDYW
Sbjct: 662 RNRFHHFKDGSCSCNDYW 679

BLAST of MS003752 vs. TAIR 10
Match: AT1G08070.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 877.9 bits (2267), Expect = 7.8e-255
Identity = 415/692 (59.97%), Postives = 536/692 (77.46%), Query Frame = 0

Query: 302 HSHLIKLGLNSDPIISGALLD---MYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALISGYAQH 361
           H+ +IK+GL++       L++   +      +  +  VF    + + + W  +  G+A  
Sbjct: 53  HAQMIKIGLHNTNYALSKLIEFCILSPHFEGLPYAISVFKTIQEPNLLIWNTMFRGHALS 112

Query: 362 GDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLKLGFVSDV 421
            D  + +KL+  M    +    PNSYTFPF+LKSCAK  + +EG+QIH HVLKLG   D+
Sbjct: 113 SDPVSALKLYVCMISLGL---LPNSYTFPFVLKSCAKSKAFKEGQQIHGHVLKLGCDLDL 172

Query: 422 YIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVR 481
           Y+HTSLI+MY Q+G +  A  VFDKS  RD +S+TALI GYA  GY++ A+++FDE+PV+
Sbjct: 173 YVHTSLISMYVQNGRLEDAHKVFDKSPHRDVVSYTALIKGYASRGYIENAQKLFDEIPVK 232

Query: 482 DVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMR 541
           DVVSWNAMI+GYA+TG  KEAL LF++M + NV P+EST+V+V+SACAQS +++LG  + 
Sbjct: 233 DVVSWNAMISGYAETGNYKEALELFKDMMKTNVRPDESTMVTVVSACAQSGSIELGRQVH 292

Query: 542 SWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYK 601
            WI+D G  SNLK+VNALID+YSKCG+L TA   F+ +P +DVISWN +IGGYTH+  YK
Sbjct: 293 LWIDDHGFGSNLKIVNALIDLYSKCGELETACGLFERLPYKDVISWNTLIGGYTHMNLYK 352

Query: 602 EALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSA--STSLWTS 661
           EAL LF++ML SG  P D+T L+ILP+CAHLGAID+G WIH YI+K       ++SL TS
Sbjct: 353 EALLLFQEMLRSGETPNDVTMLSILPACAHLGAIDIGRWIHVYIDKRLKGVTNASSLRTS 412

Query: 662 LIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRIEPN 721
           LIDMYAKCG+I+AA QVF+ +  KSL+SWNAMI G AMHG+A+ + +LFS+M    I+P+
Sbjct: 413 LIDMYAKCGDIEAAHQVFNSILHKSLSSWNAMIFGFAMHGRADASFDLFSRMRKIGIQPD 472

Query: 722 EITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLI 781
           +ITFVG+LSAC H+G++DLGR  F +M QDYK+ PK +HYGCMIDLLG +GLF+EAE +I
Sbjct: 473 DITFVGLLSACSHSGMLDLGRHIFRTMTQDYKMTPKLEHYGCMIDLLGHSGLFKEAEEMI 532

Query: 782 QNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWD 841
             MEM+PDG IW SLL AC+ HG VELGES AE L ++EP+NPG+YVLLSNIYA AG+W+
Sbjct: 533 NMMEMEPDGVIWCSLLKACKMHGNVELGESFAENLIKIEPENPGSYVLLSNIYASAGRWN 592

Query: 842 DVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTG 901
           +VA+ R  LND+GMKKVPGC++IE+D+VVHEF++GDK HP++ +IY MLEE++  L+  G
Sbjct: 593 EVAKTRALLNDKGMKKVPGCSSIEIDSVVHEFIIGDKFHPRNREIYGMLEEMEVLLEKAG 652

Query: 902 FVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATK 961
           FVPDTSEVL +M+EEWKEGAL HHSEKLAIA+GLISTKPGT +TI+KNLRVCRNCH ATK
Sbjct: 653 FVPDTSEVLQEMEEEWKEGALRHHSEKLAIAFGLISTKPGTKLTIVKNLRVCRNCHEATK 712

Query: 962 LISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           LISKI+ REIIARDR RFHHF+DG CSCNDYW
Sbjct: 713 LISKIYKREIIARDRTRFHHFRDGVCSCNDYW 741

BLAST of MS003752 vs. TAIR 10
Match: AT5G09950.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 640.2 bits (1650), Expect = 2.8e-183
Identity = 366/1007 (36.35%), Postives = 563/1007 (55.91%), Query Frame = 0

Query: 2   HTHTLKCGFEGDVFAGNALITMYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGDH 61
           H+   K   + DV+  N LI  Y      V AR+VFDEMP R+ VSW+ +++GY++ G+H
Sbjct: 24  HSRLYKNRLDKDVYLCNNLINAYLETGDSVSARKVFDEMPLRNCVSWACIVSGYSRNGEH 83

Query: 62  GLEAISVFIQMVREGLKFDNVAITGAVSVCGHERNLEL--GKQIHCLAMKTGYGTHTSVC 121
             EA+     MV+EG+  +  A    +  C    ++ +  G+QIH L  K  Y     V 
Sbjct: 84  -KEALVFLRDMVKEGIFSNQYAFVSVLRACQEIGSVGILFGRQIHGLMFKLSYAVDAVVS 143

Query: 122 NVLISTYSKC-EVIEDAKAVFKLMDDCNVISWTTMISL-----NEEDAVALFNKMRVDGV 181
           NVLIS Y KC   +  A   F  ++  N +SW ++IS+     ++  A  +F+ M+ DG 
Sbjct: 144 NVLISMYWKCIGSVGYALCAFGDIEVKNSVSWNSIISVYSQAGDQRSAFRIFSSMQYDGS 203

Query: 182 YPNDVTFIGLLHAITMRNMVEQGLTVHGLCI--KADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDS 241
            P + TF  L+         +  L    +C   K+  L++L VG+ L++ +AK   +  +
Sbjct: 204 RPTEYTFGSLVTTACSLTEPDVRLLEQIMCTIQKSGLLTDLFVGSGLVSAFAKSGSLSYA 263

Query: 242 SRVFIELPYREIISWNALISGYAQNTLCQEALETF--LCAIMESKPNEYT-FGSVLNAIS 301
            +VF ++  R  ++ N L+ G  +    +EA + F  + ++++  P  Y    S     S
Sbjct: 264 RKVFNQMETRNAVTLNGLMVGLVRQKWGEEATKLFMDMNSMIDVSPESYVILLSSFPEYS 323

Query: 302 AGQDISIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPI-ISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVA 361
             +++ +K G+  H H+I  GL    + I   L++MYAK GSI +++RVF   + +  V+
Sbjct: 324 LAEEVGLKKGREVHGHVITTGLVDFMVGIGNGLVNMYAKCGSIADARRVFYFMTDKDSVS 383

Query: 362 WTALISGYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHA 421
           W ++I+G  Q+G +   ++ ++ M +  I    P S+T    L SCA L  A+ G+QIH 
Sbjct: 384 WNSMITGLDQNGCFIEAVERYKSMRRHDI---LPGSFTLISSLSSCASLKWAKLGQQIHG 443

Query: 422 HVLKLGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDR 481
             LKLG   +V +  +L+ +YA++                               GY++ 
Sbjct: 444 ESLKLGIDLNVSVSNALMTLYAET-------------------------------GYLNE 503

Query: 482 ARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRS-KEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACA 541
            R++F  MP  D VSWN++I   A++ RS  EA++ F   + A    N  T  SVLSA +
Sbjct: 504 CRKIFSSMPEHDQVSWNSIIGALARSERSLPEAVVCFLNAQRAGQKLNRITFSSVLSAVS 563

Query: 542 QSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPE-RDVISWN 601
             +  +LG  +        +       NALI  Y KCG++    + F  M E RD ++WN
Sbjct: 564 SLSFGELGKQIHGLALKNNIADEATTENALIACYGKCGEMDGCEKIFSRMAERRDNVTWN 623

Query: 602 VMIGGYTHICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKN 661
            MI GY H     +AL L   ML +G       +  +L + A +  ++ GM +HA   + 
Sbjct: 624 SMISGYIHNELLAKALDLVWFMLQTGQRLDSFMYATVLSAFASVATLERGMEVHACSVRA 683

Query: 662 FNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELF 721
              +   + ++L+DMY+KCG +D A + F+ M  ++  SWN+MI G A HGQ EEAL+LF
Sbjct: 684 CLESDVVVGSALVDMYSKCGRLDYALRFFNTMPVRNSYSWNSMISGYARHGQGEEALKLF 743

Query: 722 SKMHSD-RIEPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLG 781
             M  D +  P+ +TFVGVLSAC HAGL++ G + F SM   Y +AP+ +H+ CM D+LG
Sbjct: 744 ETMKLDGQTPPDHVTFVGVLSACSHAGLLEEGFKHFESMSDSYGLAPRIEHFSCMADVLG 803

Query: 782 RAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGSLLGA-CRDHGR-VELGESVAERLFELEPDNPGAY 841
           RAG  ++ E  I+ M MKP+  IW ++LGA CR +GR  ELG+  AE LF+LEP+N   Y
Sbjct: 804 RAGELDKLEDFIEKMPMKPNVLIWRTVLGACCRANGRKAELGKKAAEMLFQLEPENAVNY 863

Query: 842 VLLSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIY 901
           VLL N+YA  G+W+D+ + R ++ D  +KK  G + + + + VH F+ GDK HP ++ IY
Sbjct: 864 VLLGNMYAAGGRWEDLVKARKKMKDADVKKEAGYSWVTMKDGVHMFVAGDKSHPDADVIY 923

Query: 902 KMLEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGT-TITI 961
           K L+E++R+++  G+VP T   LYD+++E KE  LS+HSEKLA+A+ L + +  T  I I
Sbjct: 924 KKLKELNRKMRDAGYVPQTGFALYDLEQENKEEILSYHSEKLAVAFVLAAQRSSTLPIRI 983

Query: 962 IKNLRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           +KNLRVC +CHSA K ISKI  R+II RD NRFHHF+DG+CSC+D+W
Sbjct: 984 MKNLRVCGDCHSAFKYISKIEGRQIILRDSNRFHHFQDGACSCSDFW 995

BLAST of MS003752 vs. TAIR 10
Match: AT4G13650.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein )

HSP 1 Score: 632.5 bits (1630), Expect = 5.7e-181
Identity = 350/995 (35.18%), Postives = 540/995 (54.27%), Query Frame = 0

Query: 1    LHTHTLKCGFEGDVFAGNALITMYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGD 60
            LH+  LK G + +      L   Y     L  A +VFDEMP R   +W+ MI   A    
Sbjct: 107  LHSQILKLGLDSNGCLSEKLFDFYLFKGDLYGAFKVFDEMPERTIFTWNKMIKELASRNL 166

Query: 61   HGLEAISVFIQMVREGLKFDNVAITGAVSVC-GHERNLELGKQIHCLAMKTGYGTHTSVC 120
             G E   +F++MV E +  +    +G +  C G     ++ +QIH   +  G    T VC
Sbjct: 167  IG-EVFGLFVRMVSENVTPNEGTFSGVLEACRGGSVAFDVVEQIHARILYQGLRDSTVVC 226

Query: 121  NVLISTYSKCEVIEDAKAVFKLMDDCNVISWTTMIS-----LNEEDAVALFNKMRVDGVY 180
            N LI  YS+   ++ A+ VF  +   +  SW  MIS       E +A+ LF  M V G+ 
Sbjct: 227  NPLIDLYSRNGFVDLARRVFDGLRLKDHSSWVAMISGLSKNECEAEAIRLFCDMYVLGIM 286

Query: 181  PNDVTFIGLLHAITMRNMVEQGLTVHGLCIKADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDSSRV 240
            P    F  +L A      +E G  +HGL +K  F S+  V N+L+++Y     +  +  +
Sbjct: 287  PTPYAFSSVLSACKKIESLEIGEQLHGLVLKLGFSSDTYVCNALVSLYFHLGNLISAEHI 346

Query: 241  FIELPYREIISWNALISGYAQNTLCQEALETFLCAIMES-KPNEYTFGSVLNAISAGQDI 300
            F  +  R+ +++N LI+G +Q    ++A+E F    ++  +P+  T  S++ A SA  D 
Sbjct: 347  FSNMSQRDAVTYNTLINGLSQCGYGEKAMELFKRMHLDGLEPDSNTLASLVVACSA--DG 406

Query: 301  SIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPIISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALIS 360
            ++  GQ+ H++  KLG  S+  I GALL++YAK   I+ +   F ET   + V W  ++ 
Sbjct: 407  TLFRGQQLHAYTTKLGFASNNKIEGALLNLYAKCADIETALDYFLETEVENVVLWNVMLV 466

Query: 361  GYAQHGDYDTVMKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLKLG 420
             Y    D     ++F +M+ E+I    PN YT+P +LK+C +L     G+QIH+ ++K  
Sbjct: 467  AYGLLDDLRNSFRIFRQMQIEEI---VPNQYTYPSILKTCIRLGDLELGEQIHSQIIKTN 526

Query: 421  FVSDVYIHTSLINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFD 480
            F  + Y+ + LI+MYA+ G++++A                        W  + R      
Sbjct: 527  FQLNAYVCSVLIDMYAKLGKLDTA------------------------WDILIR------ 586

Query: 481  EMPVRDVVSWNAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDL 540
                +DVVSW  MIAGY Q     +AL  F +M +  +  +E  + + +SACA   AL  
Sbjct: 587  -FAGKDVVSWTTMIAGYTQYNFDDKALTTFRQMLDRGIRSDEVGLTNAVSACAGLQALKE 646

Query: 541  GNLMRSWIEDRGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTH 600
            G  + +     G  S+L   NAL+ +YS+CG +  +   F++    D I+WN ++ G+  
Sbjct: 647  GQQIHAQACVSGFSSDLPFQNALVTLYSRCGKIEESYLAFEQTEAGDNIAWNALVSGFQQ 706

Query: 601  ICNYKEALALFRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSL 660
              N +EAL +F +M   GI+  + TF + + + +    +  G  +HA I K    + T +
Sbjct: 707  SGNNEEALRVFVRMNREGIDNNNFTFGSAVKAASETANMKQGKQVHAVITKTGYDSETEV 766

Query: 661  WTSLIDMYAKCGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRI 720
              +LI MYAKCG+I  A + F  + TK+  SWNA+I   + HG   EAL+ F +M    +
Sbjct: 767  CNALISMYAKCGSISDAEKQFLEVSTKNEVSWNAIINAYSKHGFGSEALDSFDQMIHSNV 826

Query: 721  EPNEITFVGVLSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAE 780
             PN +T VGVLSAC H GLVD G  +F SM  +Y ++PK +HY C++D+L RAGL   A+
Sbjct: 827  RPNHVTLVGVLSACSHIGLVDKGIAYFESMNSEYGLSPKPEHYVCVVDMLTRAGLLSRAK 886

Query: 781  SLIQNMEMKPDGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAG 840
              IQ M +KPD  +W +LL AC  H  +E+GE  A  L ELEP++   YVLLSN+YA + 
Sbjct: 887  EFIQEMPIKPDALVWRTLLSACVVHKNMEIGEFAAHHLLELEPEDSATYVLLSNLYAVSK 946

Query: 841  KWDDVARIRTRLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLK 900
            KWD     R ++ ++G+KK PG + IEV N +H F VGD+ HP +++I++  +++ ++  
Sbjct: 947  KWDARDLTRQKMKEKGVKKEPGQSWIEVKNSIHSFYVGDQNHPLADEIHEYFQDLTKRAS 1006

Query: 901  VTGFVPDTSEVLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHS 960
              G+V D   +L ++  E K+  +  HSEKLAI++GL+S      I ++KNLRVC +CH+
Sbjct: 1007 EIGYVQDCFSLLNELQHEQKDPIIFIHSEKLAISFGLLSLPATVPINVMKNLRVCNDCHA 1064

Query: 961  ATKLISKIFNREIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
              K +SK+ NREII RD  RFHHF+ G+CSC DYW
Sbjct: 1067 WIKFVSKVSNREIIVRDAYRFHHFEGGACSCKDYW 1064

BLAST of MS003752 vs. TAIR 10
Match: AT4G33170.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 596.7 bits (1537), Expect = 3.5e-170
Identity = 341/985 (34.62%), Postives = 542/985 (55.03%), Query Frame = 0

Query: 15  FAGNALITMYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGDHGLEAIS---VFIQ 74
           F  N LI+MYS+   L  AR+VFD+MP RD VSW++++  YAQ  +  +E I    +  +
Sbjct: 75  FLINNLISMYSKCGSLTYARRVFDKMPDRDLVSWNSILAAYAQSSECVVENIQQAFLLFR 134

Query: 75  MVREGLKF-DNVAITGAVSVCGHERNLELGKQIHCLAMKTGYGTHTSVCNVLISTYSKCE 134
           ++R+ + +   + ++  + +C H   +   +  H  A K G      V   L++ Y K  
Sbjct: 135 ILRQDVVYTSRMTLSPMLKLCLHSGYVWASESFHGYACKIGLDGDEFVAGALVNIYLKFG 194

Query: 135 VIEDAKAVFKLMDDCNVISWTTMISLN-----EEDAVALFNKMRVDGVYPNDVTFIGLLH 194
            +++ K +F+ M   +V+ W  M+        +E+A+ L +     G+ PN++T      
Sbjct: 195 KVKEGKVLFEEMPYRDVVLWNLMLKAYLEMGFKEEAIDLSSAFHSSGLNPNEITL----- 254

Query: 195 AITMRNMVEQGLTVHGLCIKADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDSSRVFIELPYREIIS 254
                                  L+ +S  +S       F    D+S V       EII 
Sbjct: 255 ---------------------RLLARISGDDSDAGQVKSFANGNDASSV------SEIIF 314

Query: 255 WNALISGYAQNTLCQEALETFLCAI-MESKPNEYTFGSVLNAISAGQDISIKHGQRCHSH 314
            N  +S Y  +      L+ F   +  + + ++ TF  +L   +A +  S+  GQ+ H  
Sbjct: 315 RNKGLSEYLHSGQYSALLKCFADMVESDVECDQVTF--ILMLATAVKVDSLALGQQVHCM 374

Query: 315 LIKLGLNSDPIISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALISGYAQHGDYDTV 374
            +KLGL+    +S +L++MY K      ++ VF+  S+R  ++W ++I+G AQ+G     
Sbjct: 375 ALKLGLDLMLTVSNSLINMYCKLRKFGFARTVFDNMSERDLISWNSVIAGIAQNGLEVEA 434

Query: 375 MKLFEEMEKEKIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSARE-GKQIHAHVLKLGFVSDVYIHTS 434
           + LF ++ +  +KPD    YT   +LK+ + L       KQ+H H +K+  VSD ++ T+
Sbjct: 435 VCLFMQLLRCGLKPD---QYTMTSVLKAASSLPEGLSLSKQVHVHAIKINNVSDSFVSTA 494

Query: 435 LINMYAQSGEMNSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSW 494
           LI+ Y+++  M  A+++F++ NF                                D+V+W
Sbjct: 495 LIDAYSRNRCMKEAEILFERHNF--------------------------------DLVAW 554

Query: 495 NAMIAGYAQTGRSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSACAQSNALDLGNLMRSWIED 554
           NAM+AGY Q+    + L LF  M +     ++ T+ +V   C    A++ G  + ++   
Sbjct: 555 NAMMAGYTQSHDGHKTLKLFALMHKQGERSDDFTLATVFKTCGFLFAINQGKQVHAYAIK 614

Query: 555 RGLRSNLKLVNALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYKEALAL 614
            G   +L + + ++DMY KCGD+  A+  FD +P  D ++W  MI G       + A  +
Sbjct: 615 SGYDLDLWVSSGILDMYVKCGDMSAAQFAFDSIPVPDDVAWTTMISGCIENGEEERAFHV 674

Query: 615 FRQMLASGIEPTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSLWTSLIDMYAK 674
           F QM   G+ P + T   +  + + L A++ G  IHA   K   +    + TSL+DMYAK
Sbjct: 675 FSQMRLMGVLPDEFTIATLAKASSCLTALEQGRQIHANALKLNCTNDPFVGTSLVDMYAK 734

Query: 675 CGNIDAARQVFDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRIEPNEITFVGV 734
           CG+ID A  +F  ++  ++ +WNAM+ GLA HG+ +E L+LF +M S  I+P+++TF+GV
Sbjct: 735 CGSIDDAYCLFKRIEMMNITAWNAMLVGLAQHGEGKETLQLFKQMKSLGIKPDKVTFIGV 794

Query: 735 LSACKHAGLVDLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLIQNMEMKP 794
           LSAC H+GLV    +   SM  DY I P+ +HY C+ D LGRAGL ++AE+LI++M M+ 
Sbjct: 795 LSACSHSGLVSEAYKHMRSMHGDYGIKPEIEHYSCLADALGRAGLVKQAENLIESMSMEA 854

Query: 795 DGAIWGSLLGACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWDDVARIRT 854
             +++ +LL ACR  G  E G+ VA +L ELEP +  AYVLLSN+YA A KWD++   RT
Sbjct: 855 SASMYRTLLAACRVQGDTETGKRVATKLLELEPLDSSAYVLLSNMYAAASKWDEMKLART 914

Query: 855 RLNDRGMKKVPGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTGFVPDTSE 914
            +    +KK PG + IEV N +H F+V D+ + Q+E IY+ ++++ R +K  G+VP+T  
Sbjct: 915 MMKGHKVKKDPGFSWIEVKNKIHIFVVDDRSNRQTELIYRKVKDMIRDIKQEGYVPETDF 974

Query: 915 VLYDMDEEWKEGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATKLISKIFN 974
            L D++EE KE AL +HSEKLA+A+GL+ST P T I +IKNLRVC +CH+A K I+K++N
Sbjct: 975 TLVDVEEEEKERALYYHSEKLAVAFGLLSTPPSTPIRVIKNLRVCGDCHNAMKYIAKVYN 990

Query: 975 REIIARDRNRFHHFKDGSCSCNDYW 989
           REI+ RD NRFH FKDG CSC DYW
Sbjct: 1035 REIVLRDANRFHRFKDGICSCGDYW 990

BLAST of MS003752 vs. TAIR 10
Match: AT1G16480.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 591.7 bits (1524), Expect = 1.1e-168
Identity = 322/975 (33.03%), Postives = 530/975 (54.36%), Query Frame = 0

Query: 23  MYSRWERLVDARQVFDEMPYRDRVSWSAMITGYAQEGDHGLEAISVFIQMVREGLKFDNV 82
           MY+++ R+  AR +FD MP R+ VSW+ M++G  + G + LE +  F +M   G+K  + 
Sbjct: 1   MYTKFGRVKPARHLFDIMPVRNEVSWNTMMSGIVRVGLY-LEGMEFFRKMCDLGIKPSSF 60

Query: 83  AITGAVSVCGHERNL-ELGKQIHCLAMKTGYGTHTSVCNVLISTYSKCEVIEDAKAVFKL 142
            I   V+ CG   ++   G Q+H    K+G  +   V   ++  Y    ++  ++ VF+ 
Sbjct: 61  VIASLVTACGRSGSMFREGVQVHGFVAKSGLLSDVYVSTAILHLYGVYGLVSCSRKVFEE 120

Query: 143 MDDCNVISWTT-MISLNE----EDAVALFNKMRVDGVYPNDVTFIGLLHAITMRNMVEQG 202
           M D NV+SWT+ M+  ++    E+ + ++  MR +GV  N+ +   ++ +  +      G
Sbjct: 121 MPDRNVVSWTSLMVGYSDKGEPEEVIDIYKGMRGEGVGCNENSMSLVISSCGLLKDESLG 180

Query: 203 LTVHGLCIKADFLSELSVGNSLITMYAKFEMMQDSSRVFIELPYREIISWNALISGYAQN 262
             + G  +K+   S+L+V NSLI+M      +  ++ +F ++  R+ ISWN++ + YAQN
Sbjct: 181 RQIIGQVVKSGLESKLAVENSLISMLGSMGNVDYANYIFDQMSERDTISWNSIAAAYAQN 240

Query: 263 TLCQEALETF-LCAIMESKPNEYTFGSVLNAISAGQDISIKHGQRCHSHLIKLGLNSDPI 322
              +E+   F L      + N  T  ++L+ +  G     K G+  H  ++K+G +S   
Sbjct: 241 GHIEESFRIFSLMRRFHDEVNSTTVSTLLSVL--GHVDHQKWGRGIHGLVVKMGFDSVVC 300

Query: 323 ISGALLDMYAKRGSIQESQRVFNETSKRSQVAWTALISGYAQHG-DYDTVMKLFEEMEKE 382
           +   LL MYA  G   E+  VF +   +  ++W +L++ +   G   D +  L   +   
Sbjct: 301 VCNTLLRMYAGAGRSVEANLVFKQMPTKDLISWNSLMASFVNDGRSLDALGLLCSMISSG 360

Query: 383 KIKPDAPNSYTFPFLLKSCAKLTSAREGKQIHAHVLKLGFVSDVYIHTSLINMYAQSGEM 442
           K    + N  TF   L +C       +G+ +H  V+  G   +  I  +L++MY + GEM
Sbjct: 361 K----SVNYVTFTSALAACFTPDFFEKGRILHGLVVVSGLFYNQIIGNALVSMYGKIGEM 420

Query: 443 NSAQLVFDKSNFRDAISFTALIAGYALWGYMDRARQMFDEMPVRDVVSWNAMIAGYAQTG 502
           +                                +R++  +MP RDVV+WNA+I GYA+  
Sbjct: 421 S-------------------------------ESRRVLLQMPRRDVVAWNALIGGYAEDE 480

Query: 503 RSKEALLLFEEMREANVAPNESTIVSVLSAC-AQSNALDLGNLMRSWIEDRGLRSNLKLV 562
              +AL  F+ MR   V+ N  T+VSVLSAC    + L+ G  + ++I   G  S+  + 
Sbjct: 481 DPDKALAAFQTMRVEGVSSNYITVVSVLSACLLPGDLLERGKPLHAYIVSAGFESDEHVK 540

Query: 563 NALIDMYSKCGDLLTAREFFDEMPERDVISWNVMIGGYTHICNYKEALALFRQMLASGIE 622
           N+LI MY+KCGDL ++++ F+ +  R++I+WN M+    H  + +E L L  +M + G+ 
Sbjct: 541 NSLITMYAKCGDLSSSQDLFNGLDNRNIITWNAMLAANAHHGHGEEVLKLVSKMRSFGVS 600

Query: 623 PTDITFLNILPSCAHLGAIDLGMWIHAYINKNFNSASTSLWTSLIDMYAKCGNIDAARQV 682
               +F   L + A L  ++ G  +H    K      + ++ +  DMY+KCG I    ++
Sbjct: 601 LDQFSFSEGLSAAAKLAVLEEGQQLHGLAVKLGFEHDSFIFNAAADMYSKCGEIGEVVKM 660

Query: 683 FDGMKTKSLASWNAMICGLAMHGQAEEALELFSKMHSDRIEPNEITFVGVLSACKHAGLV 742
                 +SL SWN +I  L  HG  EE    F +M    I+P  +TFV +L+AC H GLV
Sbjct: 661 LPPSVNRSLPSWNILISALGRHGYFEEVCATFHEMLEMGIKPGHVTFVSLLTACSHGGLV 720

Query: 743 DLGRQFFSSMVQDYKIAPKSQHYGCMIDLLGRAGLFEEAESLIQNMEMKPDGAIWGSLLG 802
           D G  ++  + +D+ + P  +H  C+IDLLGR+G   EAE+ I  M MKP+  +W SLL 
Sbjct: 721 DKGLAYYDMIARDFGLEPAIEHCICVIDLLGRSGRLAEAETFISKMPMKPNDLVWRSLLA 780

Query: 803 ACRDHGRVELGESVAERLFELEPDNPGAYVLLSNIYAGAGKWDDVARIRTRLNDRGMKKV 862
           +C+ HG ++ G   AE L +LEP++   YVL SN++A  G+W+DV  +R ++  + +KK 
Sbjct: 781 SCKIHGNLDRGRKAAENLSKLEPEDDSVYVLSSNMFATTGRWEDVENVRKQMGFKNIKKK 840

Query: 863 PGCTTIEVDNVVHEFLVGDKVHPQSEDIYKMLEEVDRQLKVTGFVPDTSEVLYDMDEEWK 922
             C+ +++ + V  F +GD+ HPQ+ +IY  LE++ + +K +G+V DTS+ L D DEE K
Sbjct: 841 QACSWVKLKDKVSSFGIGDRTHPQTMEIYAKLEDIKKLIKESGYVADTSQALQDTDEEQK 900

Query: 923 EGALSHHSEKLAIAYGLISTKPGTTITIIKNLRVCRNCHSATKLISKIFNREIIARDRNR 982
           E  L +HSE+LA+AY L+ST  G+T+ I KNLR+C +CHS  K +S++  R I+ RD+ R
Sbjct: 901 EHNLWNHSERLALAYALMSTPEGSTVRIFKNLRICSDCHSVYKFVSRVIGRRIVLRDQYR 937

Query: 983 FHHFKDGSCSCNDYW 989
           FHHF+ G CSC DYW
Sbjct: 961 FHHFERGLCSCKDYW 937

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6589865.10.0e+0083.79Pentatricopeptide repeat-containing protein, chloroplastic, partial [Cucurbita a... [more]
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XP_022987625.10.0e+0083.50pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic [Cucurbita ... [more]
KAA0046752.10.0e+0083.21pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK29694... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
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Q9FIB23.9e-18236.35Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g09950 OS=Arabidopsis th... [more]
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A0A6J1JHE60.0e+0083.50pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Cucurbit... [more]
A0A5A7TTJ10.0e+0083.21Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=11946... [more]
A0A0A0LU280.0e+0083.21DYW_deaminase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G3068... [more]
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Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
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NoneNo IPR availablePANTHERPTHR47924PENTATRICOPEPTIDE REPEAT-CONTAINING PROTEINcoord: 1..75
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Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MS003752.1MS003752.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0005515 protein binding
molecular_function GO:0008270 zinc ion binding