MS001474 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCCCCATTTTGGAAATTGGTTTTGAAGCAGTTTGATGATTTACTAGTAAAGATATTAATTGTTGCAGCAGTTGTTTCTTTCCTTCTGGCTCTGATAAATGGAGAGACAGGCGTTACAGCATTTTTGGAGCCTTCAGTAAGATATAATTCCTCGCTTCTCTTATTTATTCTTGTCTGTCATATTAATAGTTGGTTTTATGTTTTAATTTTTGAGCTATAAGTTTCCAACCATCATGGGATGATCCAAGTGGTCAATGAGGGTCAATGTAAATAGCAAAGACTTAGAGGGAATGAGTTCAAACCATGGTGGCCACCTATCTAGGATTTAATATCCTACGAGTTTCCTTGTCAACCAAATGTAGTAGGGTCAAGCAGTTGGCTCGTGAATAGTCGAGGCCTGCGTAAGCTGGTCCGGACACACGGATATCAAAAGAAAAAAAAAAGCTTATAAGTTTCCATATTTCTTATGCACATTGTTTAGTTCTTTATGTGCACTCTCCTTCTTTTGTCTCTCTTTTTTCATCCTTCGTGTGCATGGATATGAAACTAAAACCTTTCATTAAAGAGAGGGAACATATACAAATGAGGGAAGGAAGATTAGACATTTTCCCTACCAAGGGTCAAAGAAGATTACAGAACACTCTTTAGTTAGCATTGATTTTGAGGGGCCATTTGTAAACGAGAGGCTCCATGAGCAGGCTACAAAACATATGTGCTCCAAAAAATCAAAGATATTATTTGCCCTTCAAAAAGTTCTATTGTTACTTTTTGACAGGAGTGAGTTAACTGCAATCCACCATAAAACTAGGTGTTTATCTTTGTCCTTATGAAGATGGCTGCATCACCATTGAACTCTGATAAGAGCCATCAGCGGCTGTAGAAAAACTTGATTTAAGTCCTCACTGCTATTTTTGTAGAGCAGCCGCCTAGGAGAAAGATAAATTTCCAAGTTTTTTCTAGTTATCTTAATCCAGTCGCAAGTATTAATGCATTATGAAGTAATAATCCATTATGATGATTTGAATTTCTTACGACTTTTAACACTTTTAAGCCAACTCAGTGGGGCATGCTAAATGAGGAATTTATCTTATTTTATCAATAAACTTTTTCCATGTTAGACATCTAGATTCTAACCTAAGGGTTCTAAGATATTGTAATGTTCAATAACTTGTAAGCTGTAATGTTCTAATATGTTAGCATGCTGTTTTGAGATTTTTATCCTCATGAAGATAAAGACATTGAAGAGAAAAGTTTCAAAATTTTCAGCAAGCTTTACCATAAACAATGAGGTAAAATTTGTTTGAGGGTTGGTTAAAAATTGGCAACCCATTCAATTGGAGCTTGTAGTTGCGTTGAGAGAGACCATTTTATTGTGCTAGCGTTGAAGTATTTAGGGAGGGGGTTCTAAGGCTCTGGGGCTGCATGGTTTCACTGAGGAATTTCTAAAAGAATTTGGGAATATTTTAAAAAATAACATATTGGAGGTATTGCATGAATTGAAGGGAGACAAATAATTTATCCTATACTCGTTGCCAGTGTGGTTGCAGAGGATTATAGAAATTTGAAACAAATTGATAGCTAATTAAATCTGCCTAAGCTTGTGATATGGTTGATTGGAGAAGTCTTGTTAATGATGTTGGAAAGGAAAGGCTTTGGAATAAGATGGATAAGGTGGATAAAGGATGCATTTATGGAGGAAGATTTTTAGCTTTTCATAATTGAAGGCTAAGAGGGCGTATAAGGGCTACTAGGGGCTACTAGAGGCTCAAGAGAAGGAGATCCACTTCTTTTCTATTTGTCTTGGTTGGCAATACGTTGAGTATGTTGATTGAACATGTTATTCATGGGACTTCTTGAAGGTTTTTTCCCTGGGAAAAACAAGGAGCATACATTTTTTTTTTTTTATAAGAGACAAAAGAGGTATATTAGAGAAAACACCCAAAAAACAGGGCTAAACAACCTAAAAGCGGAGGGTGGAGATAACCCTCCCCAAAGGACTATACAACCACAGCTTTCCAATCTTGCATAATAAGAAAAAAAGACTGTAATTACAAAAAGCCTTTTTGTGTGTGGAAGCCCACCAAGAAGCCGTATGCCTGATATTCACAAAAAAATAATCTATCAAGATAACTTTATCCTAAAAAATTCGACTATTCCTTTTTTTCCAAAGAAGCCAAGGACCGCCCTAGCAGCACAATTCCACATGATAAAAGCTTTTCCTTTGAGAGCTTTTCCACCAAAACCTTCTGAAATAAAATCTTCAATATGCTGAGGGAGACAAAAGGATAAGTCTAATAGAGAAGCCACATAATTCTAAGCTGTGGAAGCATAAGTACAGTGCATAAAGAGATGGTCCACATTCCCTGAGTTCCTCAAGCATAAGCTGCAGACTGCCGGGGAGAGCACCAAGTGGGGGAGTTTCTTCTGAATATACTTAATATATTCAATTTGTGCAGATGAGCTTCATGATTTATTTTGGAAGAAAGGTTGCTCCTTGTGGTTGGTTCTCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTGGTTAAGAGAGTTTGAAGGTTTCTTTCATGGGCAAAGCAGTGTGTAGATTTAGTGCTTTCTTCTTGCTTTTTGCAGGGTAAAGATTTGTTGGTTTCTTCAATTCATTTCACTTCTTTCTCTCGGGATGTTTTCAAGTTCTTGGTTATTTGTATGGCTCCAGTTTGTGGATAGTTTTGGTAGCCCATTTCCTCATATGGAAATGCTTTTGTAAGGGATTATCTGAAATTGTTATCTTCTAGAAGCTTTTTAGTCAGATGGTTTGAGTCCTTTGAAGGACAGGTTTTTATGCATCAATGGCATCATAGTTATCTTCTTTGCAAATTTCGACTCTGCTAGACTTTCTGGTGTTGTTAAAGTTAAAGTGGTTTTGCCAAGAGAGGGTTTTCTATGTTGGTTGCTTGAAGGCCTGTTATGATGGTTTACTGCTATAGCTCCTTGGGAGGTTTTTGCTTTGGCTGTTTCCAATGCTGATTTTATGTTGGTTATTTTTGTTTCTTCCTGGTCGGGGTCTTTATTTGTGGCTGTTTATTGGATATTTTTTGAAACTTCGTTGGGATTACTGTTCATTCTCGTTGTTTTATTTTTATTATTATTATTATAATTTTTTTCATTCTCCTTTGTGCGCTTGGTACTTTACTTCTATGCAATGATGACAGAGAAGTGTTGGACAATTTCTTCTATGTACTTCAGATTTTTGAGACTTTGCCTAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAAGTAATAAGGTGTAAAATATGAAGGGAATCCTTCCAATTGATTAACGGCAAAATGCCCTCCAATTAGCACATATATCACTAAAAGAATAATTACAAAAAAAACATTGTTTAGCTTGAACCGAAGCAGCAGGGTATCTAATGAGGTTAAAAAGATCAACGTAGTCCCTTTCTTTTTCATTTAAGAGTCTATTGTTCTTTCCATCCATGTAGTTTAGAGGAAGCTAATGGGTGCATAGCTTGCCCACCTTTTGGAAGCTGAAGTAATGGTAAGTTCGGCGAGAAAGTTGAGGATTTTTTTAACGTGATGGTAATAAGCTTAACCCATCTAGTCAACTAAAGGGTGGAGTCTTGGAGGCTTTGCCTATCGATTGTGGTAGATTGGAAATTGGCAACTTGAAGAAGAACAATAATAAAGCATATGGAAAAATAGGTGTGTTCTTCAGTAAATAAAATCAAATTTGATGTAGAATGGTCTCTAGAATTTATGGAAGAAAGGAAGATGAGCGGTATACTTATGGTAATAAAGGGGAAAGCAACTGTAATCCTTGGAGGAATATTGTACAGAGAGGCGTGTGTTGATTCACTCACAAATCAAATTAGGAGATGTTAAGATGATGAAATTTTGGGAGGATGCTTGGTTGGTCTCTTAACCTTTGATGGTAATATTTTATGTCTTTCTATTGTGGCGGAACAAAAAGTGACGATTGTTTTTTAATTTTGGATCAGCACTCCATGTGCTTAACAACAGATCTTCCCTTGGAAATTTTGAAAGGCAAGTACCTTAAAGAGGTTAAAGTATTTTCATGGATGGCCTGTCTTCGTGGCCCTAACACAGTTGATAGATTATTTTCTATATGCCCCACCATGGCTTTATATCCATCTTGGTGTTCTCCTTGCTTGAGAGAGCTGGAAGGAATGGACCTCATTTTCCTTTGTTCCTTTAGCAAGATATGGGACTGTCTACTACAAATTATTTTATTTACCTTGAGTTCATCACTCATCTTTAGATGGAAACCTGGTGCCATTTTTTTGCAGCCATCCTTTTAAGTGGAACTCAGAGATATTGTGCTGGGGCATTTGGTTGAAAGACACAACAGAATGTTCAATGAAAAAGCTACTGTTAGGTTTCCATTGATAGAGAAATTATAGATTATGCTCCCTTTGTAATTAACACAAATTGGGAGGGGGGAATTTTGTAAGATATATTGGGGAGTCATCTTTTGTTTGTATTACTTAGTGTTTTGGATGTTGGTATTACTATGTAATTTCTTGCTTATCAATATTTTATTTTCAATTTAGAAAAGAAATATACTGATCTATGTGTCAAGTAAAGGAATGGAGCATTTGTTTATTTATTTTTCCTTTCTGTCCAGGTAATATTACTAATATTGGCTGCAAATGCAGCAGTAGGAGTGATTACGGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAGGTTAGTTCTAAAACATTTGAATGTCATCTTGAGTTTGAAGTCCAAATCATGAGATCTATTTCTATTTTTGGCTTCATGATAAGGACAACTTGATCAATTTAATAGTGTAGTTTTCTATTTCAGCTTCATGATGAGGATAACTTGATAGCGTAGTTCTTATAATCCCTTTTAATGAGGGGACACTATGTTCCCTTTTCTTTTTGTCCTTGTGGCAGATACCCTTAGTGGAT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APFWKLVLKQFDDLLVKILIVAAVVSFLLALINGETGVTAFLEPSVILLILAANAAVGVITETNAEKALEELRAYQADVATVMRNGCFSILPATELVPGDIVEVVVGCKIPADMRMIEMLSNQIRVDQAILTGESCSVEKELESTRAINAVYQDKTNILFSGTVVVAGRARAIVVGVGANTAMGNIRDSILQTDDEATPLKKKLDEFGTFLAKVIAGICALVWIVNIGHFRDPSHGGVVSGAIHYFKIAVALAVAAIPEGLPAVVTTCLALGTKRMARLNAIVRSLPSVETLGCTTVICSDKTGTLTTNMMSVSKICVVHSVLHGPQLSEYSVSGTTYAPDGIIFDSSGVQLEFPAQLPCILHMAMGSALCNESTLQYNPDKGSYEKIGESTEVALRVFAEKVGLPGFTSMPSALNMLSKHERASYCNHHWESQFKKISVLEFSRDRKMMSILCSRNQSHILFSKGAPESIISRCSSILCNEDGSTSVLTASIRTELEARFQSFAGNEMLRCLAIAFKLIPASQQSLSFGDEQDLTFIGLVGMLDPPREEVRNAMLSCMTAGIRVIVVTGDNKSTAESLCRKIGAFDHLVDLTDHSFTASEFEELPAMQQTIALQRMALFTRVEPSHKRMLVEALQHQNEVVAMTGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTAVAKSASDMVLADDNFASIVAAVAEGRAIYNNTKQFIRYMISSNIGEVVCIFVAAVLGIPETLAPVQLLWVNLVTDGLPATAIGFNKQDSDVMKAKPRKVNEAVVTGWLFFRYLVIGAYVGLATIAGFIWWFIYSDSGPKLTYNELMNFDTCSTRETTYPCSIFEDRHPSTVSMTVLVVVEMFNALNNLSENQSLLVIPPWSNLWLVASIFLTMILHMLIMYVRPLAVLFSV Homology
BLAST of MS001474 vs. NCBI nr
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BLAST of MS001474 vs. NCBI nr
Match: XP_038886243.1 (calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1674.4 bits (4335), Expect = 0.0e+00 Identity = 867/900 (96.33%), Postives = 883/900 (98.11%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. NCBI nr
Match: XP_023002575.1 (calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1671.8 bits (4328), Expect = 0.0e+00 Identity = 862/900 (95.78%), Postives = 884/900 (98.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. NCBI nr
Match: KAG6585710.1 (Calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1671.4 bits (4327), Expect = 0.0e+00 Identity = 861/900 (95.67%), Postives = 884/900 (98.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. NCBI nr
Match: XP_022951259.1 (calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1671.0 bits (4326), Expect = 0.0e+00 Identity = 860/900 (95.56%), Postives = 884/900 (98.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SY55 (Calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ECA3 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 1493.0 bits (3864), Expect = 0.0e+00 Identity = 764/899 (84.98%), Postives = 832/899 (92.55%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P54209 (Cation-transporting ATPase CA1 OS=Dunaliella bioculata OX=13790 GN=CA1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 998.4 bits (2580), Expect = 5.1e-290 Identity = 521/900 (57.89%), Postives = 667/900 (74.11%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O77696 (Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3 OS=Sus scrofa OX=9823 GN=ATP2A3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 911.0 bits (2353), Expect = 1.1e-263 Identity = 501/920 (54.46%), Postives = 655/920 (71.20%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P18596 (Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Atp2a3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 909.8 bits (2350), Expect = 2.4e-263 Identity = 500/920 (54.35%), Postives = 651/920 (70.76%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O14983 (Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2A1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 908.7 bits (2347), Expect = 5.3e-263 Identity = 501/921 (54.40%), Postives = 652/921 (70.79%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BVC5 (Calcium-transporting ATPase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005059 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1727.2 bits (4472), Expect = 0.0e+00 Identity = 900/900 (100.00%), Postives = 900/900 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KPB7 (Calcium-transporting ATPase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496395 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1671.8 bits (4328), Expect = 0.0e+00 Identity = 862/900 (95.78%), Postives = 884/900 (98.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GI63 (Calcium-transporting ATPase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1671.0 bits (4326), Expect = 0.0e+00 Identity = 860/900 (95.56%), Postives = 884/900 (98.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BAL0 (Calcium-transporting ATPase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487824 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1668.7 bits (4320), Expect = 0.0e+00 Identity = 862/900 (95.78%), Postives = 889/900 (98.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DWF4 (Calcium-transporting ATPase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487824 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1609.0 bits (4165), Expect = 0.0e+00 Identity = 828/864 (95.83%), Postives = 854/864 (98.84%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. TAIR 10
Match: AT1G10130.1 (endoplasmic reticulum-type calcium-transporting ATPase 3 ) HSP 1 Score: 1493.0 bits (3864), Expect = 0.0e+00 Identity = 764/899 (84.98%), Postives = 832/899 (92.55%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. TAIR 10
Match: AT1G07670.1 (endomembrane-type CA-ATPase 4 ) HSP 1 Score: 737.6 bits (1903), Expect = 1.2e-212 Identity = 453/962 (47.09%), Postives = 611/962 (63.51%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. TAIR 10
Match: AT1G07810.1 (ER-type Ca2+-ATPase 1 ) HSP 1 Score: 736.5 bits (1900), Expect = 2.6e-212 Identity = 453/962 (47.09%), Postives = 611/962 (63.51%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. TAIR 10
Match: AT4G00900.1 (ER-type Ca2+-ATPase 2 ) HSP 1 Score: 722.2 bits (1863), Expect = 5.0e-208 Identity = 456/977 (46.67%), Postives = 606/977 (62.03%), Query Frame = 0
BLAST of MS001474 vs. TAIR 10
Match: AT3G63380.1 (ATPase E1-E2 type family protein / haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein ) HSP 1 Score: 311.2 bits (796), Expect = 2.7e-84 Identity = 252/805 (31.30%), Postives = 402/805 (49.94%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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