
MS001244 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTGGCCTCTCTCCCGAGTCTCAGGACTCTGAGCTTCATGAACAACAGGCTGGGGGGCCCACTGCCGGACGTGAAGAAAATTGGGGCCCTGAAAGCGCTGTATCTGTCGAACAATAATTTCTCCGGCACGATTTCCGGCGACGCCTTCGAGGGGATGGGGTCCCTGCGGAAGGTGTATCTCAGCCAGAATCGATTTTCCGGCAAGATTCCGACGTCGTTGGCGGAATTAAAGGGGTTGGTGGAGCTGGGATTGGAGGAGAATGAATTTAGTGGAAGAATTCCGGATTTTGAAGAGAGGGATTGGAAGTATTTGAATCTTTCGGATAATCAATTGGAGGGGCCGCTTCCTTCTGCCTTCAAGAACTCCAACTTCACTTCATTTCTTGGTAAGTTCCTAATTCCAAAAAAATCCCCAAAAAATATATATTTTTTACTTTTTTTTTAACGATAAATAAAAAATATTTATGAAAATGTTGTTTTCATAAAAGTCCCTTTTAAAATGTCGTTAAAATTTACGCACTTACTAAGACCTACTTAACAGTGACATGTCGGAAAATTGACAACTATCTATTTTATTTTAATTTTTTTATGTTTTCAACTTTTTTTTTTTAATGGTAAGTGTTTTAAAAGTGGTAGGTACCTGCTTAACAAGCTAAGCTTTATTGTTTTTTAATTATGTTTACTTGAGTATGGTAAGTAAAATTGGTGTTTTATATTTATAAAAAAATTATTTTAAATTTATTGTAAATAAATAGATAAAATAAAAAATTTACCTCTAACCATAAAATTTTAATTTCATCATATTAGAACTCTGAATTGGAAAAATATTGCCATCTTTGCAAATTTTACCTTATGATCGGTTTTTCTAGGTATATTTAATGATGAAAATTTGATGATAATTCTGAAAAAAAAAACAATGGAAATATATATATATATTAATTTGGTGAATTTTAGGATATTTGTTTAATGATGCATTGGAGAGTAGTTTTGTGTGAGGATCGAGTTTGGAAAGTTTTCTTACCCTAAAAAAAAAAGTGGATAAATGTAGCAAAATTGAATGATAAACATTGTACTCTTACAAATTTATAGTTTTTTTTTTAATATATGTAAGTTTAGAGTTCGATTTAATAAAAATAAAATTTTTGGAAATATGGATTACATTGAACCGAGTGGATATATGGTGTCATTTATATGTAGTGCAACCTAACTATTAAATAATTATTTTTACTAAATAGCTCGTCCGTTATTTTTAATTATTAATAATGTAATTGAATTTATGTCGCGTCATAAATATTTTTCCACGTGTCGAAATTGAAATGTACTTTAGTTTTTTTTTTAAATTTATTATAAGCATCATTTTAACTATATTAAACCAAAATCTCTTTCCCCTTCACACCATTAATAATTTACAATTTTTTATTCTAAAAAATGCAATTTTCATTTTCCATATATTATTTAATTTGAGAAACCAATGTAACAAAATTAGTCGGTCACACTCATCGCTCAGGTGATAACTCATATCTTACTTACATTTGTCAGCAGAAAAAAATAAAAAAAATTAGATAAAAACAAAGTAAAACATTGTTATTTAAGAAGATACAAATAAATAAGCAAAATAAACTGTTTCTCAAAAGAAATAATGCATGCCATTAATCTAACTCACAGAATATTTTCTAAGTGTCACGCACGTCGGTCCAAATATCTCAATTAACATTTAAATTAATAGGATAGCAGAAGATTCTTGTGTGGTAGCATCACCCAATTTTATAAATTCTTTATTTTATGTTTATTGTTGCATTATCCACTATGTTTTAATTTATTTTCATTCAAATTCATTATTTCTACTTTCATTTTTTCCTCAATAACTCATGTTGAATACCCGATATCCACTTTCATTTTCTCGTCCATTTTGGTTCTATACTTTCAACTTTGATTTATTTTAATTAAATTTTCAAAATATTTGTTTTGACATTTATTTGTAAAATTTTAACACAAATTTTATACACAATTGAAACATTTTAATACAATTTTATAACTACATTTTCAAAAAATTTAGGTAATGAAGAATCATACTTTTTTATCAAAATAAATGAGATAAAAATGAAAATTTGGGACCAAAATAATAATTATTTTTTTAAAGTATAGTAATTAAAAACAAACATTTTAAATTTATATTAATTAAAATAAAAAAAGTTGAAACTTGAAAGTATAGAGGTTAAAATAAACATCTGAAAATATAGATTACTAAAATGTAAAGTAAAAAATATAAGAATTAAAACGGTGTTTAAATCAATAATCTGAAACACATTTTTTTAAGAAAATTATACTGCATAAAATAAATATGTATTTATAGAAATATTATTACCTTTTGTTTTTTTACTTAAATATCGCAAAGATGACTTTTAGTTGGTCTCATGTGATAATGGTATAAATTTGTAATTTGTGTTATTTTTATAAAATTTTTTAAATCAAAGCTATATATATAAATATAAATTTATTTTTTGTGCTATTTTTTAATTCATTTTTTTCCTTTCAATTCAGCCTTAATTAAATCTGGAAATTTTTGTTTAGGAAACAGCGGTTTATGTGGGGAGCCACTGGCACCATGCAATAATAAATCTTCCGCAAAGAAGTGGTACATTCTGATCGGAGTATTCTCCGGCGCTGCCGCCTTGATCCTCCTCCTCCTCATCATCCGCCGCTTTCTCCGGTCGTCCAAATCATCCGCCGCCGTATTCGACGACCCAAAGCCCAAAACCAAATTATTCTCTCCCAAAAACATCTTCAAAAAGGAGAGGTCCCACTCCCACCCATATTCCTCGACCGACTCGGACGAGAACCCGAAGAATGGCGGTCCGACCGGGTCGGCTTTGTGCTTCTTGCGAACCGACCGTCCGCGGTTCGGATTTCAGGAACTGCTCGGCGCCTCCGCCGAAGTTCTGGGCAGCGGGAGCTTCGGGTCGTCTTACAAGGCGTTGCTGGCGAATGGGTCGGCGGTGGTGGTGAAGAGATTCCGGCAAATGAACGCCGTCGGAAGAGATGAATTTTACGGCCATATGCGGCGGCTCGGCCGGATTTCGCACCCCAATTTGCTGCCGCTTGTGGCGTTCTATTATGGGAAGGATGATAAGCTTCTGGTTTCTGATTTTGTTGAAAATGGCAGCTTGGCTAGTCACCTGCATGGTAAGTTTCAAAAATTTGACCTTTCTTTGGGGGTTAAATTGGTAATTTAAAATTTTAGTTTTTTATGATTTGTTCAAATTTCACAAATTATTATAAAAATTATGAAATTTGGTATTATAGTTTTGAGCTTAATTTTAAGTTGACCCATATGGTTTTTAAAATTTTAAATGAGTTATTACCATTTGAATTTAGTTTAAAGCGGTCCAATGGTTTTGAAAATTGGACAATATTTACTCATACACCGATCAGTAGAAACTCATATTAAGTTTATGATACGGTTTAGTTTAATGTGAATGTCTCTGAAAATTTTATATAGCTATAATATAATATACCTAAAAGTTTGTTGGAGATTTCACTAATCTATCTATATATAGGCGAACATTTTTATGTAAAAAAGCCAATTAAGTCTCTATGAACTCATTAAACCGCATACTATTTTGATCTCTGTATTCTTGGCTGCTTGGATTTGGATTCATTTTGGTTTGTACTTTTTGTCCAGCCCGACGAAAACCAGGAGATCCAGGCATGGACTGGCCAACTCGTCTTAAAATCATAAAGGGAGTAGCTAGAGGCTTATTCCATCTCCACAAAGAACTCCCTCACTTGAGCCTTCCCCACGGCCACTTAAAATCCTCCAACATCCTCCTCGGCCAACACTTCACCCCAATGCTCTCCGACTACGCCCTCTCTCCCCTCCTCAACAAGGACCACGCCCACCACCACATGGCTGCCTACAAGTCCCCGGAGTTTGCTCGCCACGATCGAGCCTCCAAGACTGCAGACGTCTGGAGCCTCGGCATCCTCATCCTTGAGGTCCTAACGGGCAAGTTCCCAGCCAACTATCTCCGCCAAGGGAAAGGTGCGAACGCCGACTTGGCTGCCTGGGTTGACGCTGTGGTTCGGGAGGAGTGGACTGCAGAGGTGTTCGACAACGACATGATCGGGGTCGGGGTCGATGACTGGGATGGGGAGATGTTGAAGCTTTTGAAGATTGGGATGTGTTGTTGTGAATGGGAGGTGGGGAAGAGGTGGGGGTTAAAAGAAGCTCTGGAGAGGATTGAGGAGTTGAGCGAGAGAGGTCATAATTTTGAGGGCGAAGATGATGAGTATTACTCTTCTTATGGGAGTGAGAAGGATTTGCGTTCTTCCTCTTTTCATAGGAGATCAGATGACGAGTCTTCTTTTTTGAATTGACTAGAGCTAGATGAACTTAAAATATATATTCAACGATTATTAGGGATAGTCATATTGTGTTGGTTATATTCAATAATTTTTTAAAATTTGGTGGATTTTTTTTATTACTTTCCAAACTATAGGGTTTTTCCTTTTCCTTTGTATTTTAATGGGCTGATGTCTATTGATTAGTTTATACAAAAATGTATACTTCTTTCTTTGTTGTAATGCTATATACTTTTATTATGTTAGTAATAATAATAATGAAGAGTTCATTACTATTGGAAATTTGTAGGTGGAACTTGTTTGGATTTCTTTTATTAGGCAAATAATAGAATGTGATCAATATCTCAGATGAGCTCTTACATTATCACTTATTTTAAAAATATTGTCTATCTATTATTATTAGTATAATAAATCAGGCAAAATTCGATTAATAAAATACTCATATTAAAAACAAAGGTTAAATTATGAGTTAGTTTATATGTGATTGTAGTCTAATCGAAAGTACTTTTGCCATGACCAGGAACTATTCTCGCTCAAAGTTTTCATGCTTGTATATGAGAAAATACTCGTCATTTTCATGACTAAAGTATGTGATAATGAAATACTAAAAAACACTAAAAAAAGCATAAAATC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BLAST of MS001244 vs. NCBI nr
Match: XP_022131589.1 (U-box domain-containing protein 35-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 504.6 bits (1298), Expect = 8.4e-139 Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 252/256 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. NCBI nr
Match: XP_022131588.1 (U-box domain-containing protein 35-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 504.6 bits (1298), Expect = 8.4e-139 Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 252/256 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. NCBI nr
Match: XP_022951423.1 (U-box domain-containing protein 35-like isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 483.8 bits (1244), Expect = 1.5e-132 Identity = 239/256 (93.36%), Postives = 247/256 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. NCBI nr
Match: XP_022951421.1 (U-box domain-containing protein 52-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 483.8 bits (1244), Expect = 1.5e-132 Identity = 239/256 (93.36%), Postives = 247/256 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. NCBI nr
Match: XP_023002231.1 (U-box domain-containing protein 52-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 483.8 bits (1244), Expect = 1.5e-132 Identity = 239/256 (93.36%), Postives = 247/256 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8S8S7 (U-box domain-containing protein 34 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB34 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 289.3 bits (739), Expect = 7.3e-77 Identity = 142/244 (58.20%), Postives = 181/244 (74.18%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FKG6 (U-box domain-containing protein 52 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB52 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 276.2 bits (705), Expect = 6.4e-73 Identity = 140/249 (56.22%), Postives = 176/249 (70.68%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SW11 (U-box domain-containing protein 35 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB35 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 1.6e-71 Identity = 138/249 (55.42%), Postives = 178/249 (71.49%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LU47 (Putative U-box domain-containing protein 53 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB53 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 4.7e-68 Identity = 130/257 (50.58%), Postives = 184/257 (71.60%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FKG5 (U-box domain-containing protein 51 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB51 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 253.8 bits (647), Expect = 3.4e-66 Identity = 134/254 (52.76%), Postives = 176/254 (69.29%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BQN6 (U-box domain-containing protein 35-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004731 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 504.6 bits (1298), Expect = 4.1e-139 Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 252/256 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BTT1 (U-box domain-containing protein 35-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004731 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 504.6 bits (1298), Expect = 4.1e-139 Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 252/256 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KND3 (U-box domain-containing protein 52-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496144 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 483.8 bits (1244), Expect = 7.5e-133 Identity = 239/256 (93.36%), Postives = 247/256 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KIX5 (U-box domain-containing protein 35-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496144 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 483.8 bits (1244), Expect = 7.5e-133 Identity = 239/256 (93.36%), Postives = 247/256 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KKQ7 (U-box domain-containing protein 52-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496144 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 483.8 bits (1244), Expect = 7.5e-133 Identity = 239/256 (93.36%), Postives = 247/256 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. TAIR 10
Match: AT2G24370.1 (Protein kinase protein with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain ) HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 4.8e-124 Identity = 220/256 (85.94%), Postives = 235/256 (91.80%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. TAIR 10
Match: AT4G31230.1 (Protein kinase protein with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain ) HSP 1 Score: 407.1 bits (1045), Expect = 1.7e-113 Identity = 206/256 (80.47%), Postives = 225/256 (87.89%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. TAIR 10
Match: AT5G26150.1 (protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 387.9 bits (995), Expect = 1.1e-107 Identity = 192/256 (75.00%), Postives = 215/256 (83.98%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. TAIR 10
Match: AT5G12000.1 (Protein kinase protein with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain ) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 3.1e-107 Identity = 194/256 (75.78%), Postives = 217/256 (84.77%), Query Frame = 0
BLAST of MS001244 vs. TAIR 10
Match: AT5G35380.1 (Protein kinase protein with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain ) HSP 1 Score: 382.9 bits (982), Expect = 3.4e-106 Identity = 191/241 (79.25%), Postives = 210/241 (87.14%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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