MS000279 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAAACGGCGTTTGTGATGCCGGTGTGTGCTCATCAGAGTCGGTGAACGGAAGCCAAGACGTCTGGAGCTCTAAGGAGAGTGATTCTCTCTCCGCCGACCATCTTGTTGTCATGGTCAATGGCATAATGGGGAGGTCGGAGTTCTCTGCTCCCTCATAATTATATCTTTTCTCGATTTCCCCATTTTCATTGTTCGAAAGATGAATCACCCATTAAGATTCTAATTCAATTGCATTTGGAGAGGATTTCCCCCTCTTAATTTGATGGTCTGTTCTCGTATGAAATTTTGATTGAAGTACTTTGTTTATCCAAATTTAAGAGTCCCACGAAGTATCGTTCTGCTGTGGAATTGGGGTTTTAAATTCGTTTGGTGGGTTCTTTAGTTTCATGATTTATGTTCCGGGATAAGATTGTTTGTCGTTTGATCAGTATCTGAATTTACTTTTGAAGCTATGTTTCAATTTCCAAGCTTATAACGGTTCCACTTCCATATGGATGAAAAATGAACAAGATATTTATGCCCAAACCACGCCGACTTCAATATATTATTCTCTCATCGGCTCAGGACATCGTAGATTTTCAAGATATTTATGCCCAATTTTTTTTCCCCGCTCTAGTGGGTAGTGATTTGATTTTTTGGAAATGGAATATCAACTTAGCGTTGCTTGAATTGGACTGATCAGCCAATCGGGTAATGGCTGTTCTTTAATCATCTGTTCCAAGTCAACTGTTCACCTAACATTTTAGCACAAACAACCTGCGGAAAGCTTATGTCATTTGATTATTCAAATTGTTTTAAACTTGTCTGTGCAGTATCACTGATTGGCAGTACGCGGCAGAGCGATTCGTTAAAAGGCTTCCTGACAAGGTTTTTGTTCATCGTAAGTAGCATTGTCACTTCCCGATCTCATGTTCTAGAAACCAAGGCTTTATTGGACGTTGAAGCATACATGGTCCAGGTTGAGTTAGATTAAGAGATGTTTCAGAATCAACTTAATTGTATGTGTTACAAATTTGTCCATCTAAATGAACATAGTTAGATGATGAATTCAACTTAACCCATCCTTGTAAATTTTAATATTGTCACTACTTTTTATATGGGTCATTTGTTTCATTTATCAATGAAATTGTTTCTCACCTTACAAATAGTCATTTCTATAGTTTAAAGTCTTAACTACCTGGTACGACGATAAACATTTAGTTAATTTATTTCTTTGCCTCTCTCGTCTTCTCAGTATTAATAATTTATTTGTAGGTAGTGAGCGAAATGTGTCTAAATTGACACTAGATGGCGTTGATGTGATGGGTGACCGATTGGCTGAAGAGGTCAGGTTGCATTTAGGCTTGATATTTCATTTGATTAGCATTTGACTAATTGATTGCAGAGTCTCTTTCTGTTACATTAGTACCCAAATCTGATGATTGTTTTTGAACATTCCAGGTTCTTGAAGTGATTCAAAGAAAGCCCAATCTGCGGAAGATCTCCTTTGTTGCACATTCTGTGGGAGGATTAGTGGCACGGTATACCATTGGGAAACTGTATAGACCGCCTGAGACTGAGAAATTAGAGGCTTCATCCGAAAACGGACACCTGCAAGAGTCATATGGTACAATAGGTGGTCTAGAGGCTGTGAACTTCATCACTGTTGCCACACCGCACCTTGGTTCAAGGGGTAATAAGCAGGTATCTAGACATCCTTTTCCTGTTCGTGCATTTGAGAGTAATTTATTTTTAAACGTCAGCGGCAACTTGTGCATCATTTTCCGGATATGGTAAGTAACAAAGTGGGCCTTCAAGTGCCGTAGTAGTTGGCTTTGGATATTTGAAGAGGTTGGATTAGTCTGTTGGCACCGTTTGGAAAAGTAAAAAAGTTCCATTCCAGGATGTAATGGATATTGGATTCTTTTTATTCTTTTAACTTATCTCAATGAAAGTTTGGTTTCCCATAAAAATAGTATTTCAACTCAAGAAACTCATTTGCAACTTGGCAAGTTATTTCCCAGTAATGGTTATTACTGATCCGAAAAGAGAAAACACAGAAATATTATAAAATAAAGGCAGGATCTTGTTATTATGAGAATTTTTATTTTTTTTCCCTCCGAAATAATGTCTTGTAGAATAAAAAGGCTAAAAGAAAACTGAAAGCTAAGGTTAAAAATCGTTTTCTGAATTGGAGTGATTTTTTGTAACCCGTTTACCAGGTTCTCTCCCTTTTGTTCCTAATTTCATTTCATCTGAAATTGTTTACTCTAAAAAAAAATAAAAAAATAAAATTGTTTTCTGAATAGCTCCTTAGAAAATATTGATAACATTTTATTCTTGAAATTTGGTTCTTATAAAAGCATACCAATAGACGTAGCTCTCTCACTATTAATTTTACCCATAACCCTCTCATACTTTATTGTGGGTGGGCGTCTTGAACAGTGGGGTGTCCTTTGGTTTTCTTTTTATTAAAGATGTTTAGCATTTTGCAGGCTATCTTTTGTTGAGTATTCTTTTATGGAAAGTTCTGTTTATTACACTAATAACAGGTAGCTCATTCAGGATTATAACATTAGTCGGAATTATATTTTCATTACAATTATTTTCCAGTTTTCACTACAAATATTGTGACAATATATGGTATGAGCTACATTAAGACACTGTAAGTCAAAAAATCTTATGATTGATGGTAGTTATACACTTATACTCCAACCATTTATAGTTAATGAAGGTTGTGTGACTTCTCTCCCTCTCTTCTCCTTCTGGAGGGGATCTTCTTGGCTCTTGGCTATTTATGTTTTTTAGTCAGCATCTCATCGCAATAGCGATTATTATCCTTGGTGTTCTGCAATATCTGTTGTCTGATTTTGTCAATATTGTCGACGTACTTGCAACATCTGTGCTGTTCTATCACATCTTTATTAGCTGTAAAAATAGTTATTTCCATCATTGGTGAATCTATCAAGTTTCACAGTAGGTTAAAAATTATTGGAAACTTATCTATAACCCTTCCATTACACTAAGTTAAATAATCTATTATTAGAACCGATACATGGAATGTGTTGTGAGAACAAACTAAAGGTGGAGGGTAGAGAGAACCCTCCCCAAGAAACTACTCCCCAAGAAACTATACAATCAAGGCTTTCCAATCTTGTATAATCAAAAGCAAACCATAGTTACAAAAAACCTTCCGGTGGATTGAAGCCCAAAAATAAAAAACCCCAAACCATTAAATAACATTTGTAGATCTAATGGTTTGGCGTTTTCTCCCCTTTTATATATTTCTCCAAATCAATAAAAATTGTTTCTTATAGAAAAAATTAAAATATAACTTTTCCAAGCATCTATCCATGTTGTAATTCTAGTGATATTTTCTTCAGATACTTTTTTTAAGTATCAGCTGTTGACGTGTTAGTCAATACAACTTTTCATGTCTATGGTCTTGTACTATTGTTAATCTTGGTTTTTCTTGCCAGGTACCGTTTCTTTTTGGTCTAACTGCGATTGAGAAAATTGCAAGTTTGATTATATATTGGATATTTAGAAGAACAGGCCAACATCTTTTTCTGACTGATGATGATGGAGGAAAGCCTCCACTCGTTCAACGCATGATCGAAGACCAAGGGGAATACTACTTCATGTAATTATCAACATTTATTTATTGAGCACGATCTTTTGAGTGGCAAAATTCTTGGAGTTTCATGATAGAGTGACGAAAATTTGTCTATATGCAGGTCTGCGTTGAAGTCATTCAAACGTAGGGTCGTCTATTCTAATGTTGACTATGACTGTATCCTTTCTTTTTCTGCCCATATAGCCAATATCAATTCTTTTAAGGTTATTGATTGATGTTCAAATTATTATTTTTTGTTTTCCATTACAATTTATTGTAAAGCTTTTGTTGGTTGGAGAACATCATCAATTAGACGTATTAATGAGTTGCCAAAGGTACTTTTCCCCACCTTTTTCTGTAGTAGTTTAACCACTTGATATTTTGATAACCAATTGCTGAATTTGACTATTATGACCAATGATCACTCCGTATTATTTTCAAAATTTCTGGATTATCAGTGGGAAGATGCCGTCAATGAAAAGTATCCTCATGTTGTTTATGAAGAACACTGCAAGGGTACTGATCCTGAGAAGTGTGAACCAGCCTCGACAGAAGTTAGCTATCCTGAAAGGCTGGAAGGTTTGTATTTTCTCTCCTGTTGAAGTTACATGCATTTTGTATCGTATGCCAATGTCGACATCTAAATATTGGAAGCTTTAGTTGTCTAACATGGTTAGTTTGTTCATGGATTTGGTCCTTCAGAGGAACTGGTGACAGGTCTATCTCGTCTGTCATGGGAAAAAGTAGATGTTAGCTTTCATCGCTCAAGACAGAGGCTTGCAGCTCACAGCATTATTCAGGTAGCTCTCTCTATCTTTCTTTCCCATGCACACAGACACACACACTCTCTCTCTCTTACACACCCTCTTTATAGCACTTCCGACACCTAAACATTCCTGTCGTAGTTCATTCAATATCTTCCGATGGTCAATCTTCTTACACCACAACAGATAACACAGCCTCCATTCTTTACCATAGGCCCGCCCTTTGTTGACTGTAATGGCATAGTATTTCTATATTATTGCTGTCTGCTTTTCTTCTCACTAGATTTCCACCTTTAAGTGATTATTTTCCTTGAAATACCTAGAAAAGCCTTTAATTCAAATAGAATACATCTTTTGTAAAATATAAAACTTCTGTTGCAGCATTCTGTGCTGTACTTGGTGTCTGGCATAACTAGAGTTATCTACTATTTCTGATGTCAGAGACTGGAATTCCTTGTTGGTTTTGTTCTTTACTGATAAGGGCTTCGGGCCTTGATAACATTTTTCTTGTTATGATTTCCTGTTTTTAAAGAGTTTTTACCCTAATCTACTCTCAAAATAGTTTTTTAAATCATAACAAAATTTTTAAGTCTAAAATCAAAAAGGTTTAACAAAACACTTACTTCTTCTT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ATGGAAAACGGCGTTTGTGATGCCGGTGTGTGCTCATCAGAGTCGGTGAACGGAAGCCAAGACGTCTGGAGCTCTAAGGAGAGTGATTCTCTCTCCGCCGACCATCTTGTTGTCATGGTCAATGGCATAATGGGGAGTATCACTGATTGGCAGTACGCGGCAGAGCGATTCGTTAAAAGGCTTCCTGACAAGGTTTTTGTTCATCGTAGTGAGCGAAATGTGTCTAAATTGACACTAGATGGCGTTGATGTGATGGGTGACCGATTGGCTGAAGAGGTTCTTGAAGTGATTCAAAGAAAGCCCAATCTGCGGAAGATCTCCTTTGTTGCACATTCTGTGGGAGGATTAGTGGCACGGTATACCATTGGGAAACTGTATAGACCGCCTGAGACTGAGAAATTAGAGGCTTCATCCGAAAACGGACACCTGCAAGAGTCATATGGTACAATAGGTGGTCTAGAGGCTGTGAACTTCATCACTGTTGCCACACCGCACCTTGGTTCAAGGGGTAATAAGCAGGTACCGTTTCTTTTTGGTCTAACTGCGATTGAGAAAATTGCAAGTTTGATTATATATTGGATATTTAGAAGAACAGGCCAACATCTTTTTCTGACTGATGATGATGGAGGAAAGCCTCCACTCGTTCAACGCATGATCGAAGACCAAGGGGAATACTACTTCATGTCTGCGTTGAAGTCATTCAAACGTAGGGTCGTCTATTCTAATGTTGACTATGACTCTTTTGTTGGTTGGAGAACATCATCAATTAGACGTATTAATGAGTTGCCAAAGTGGGAAGATGCCGTCAATGAAAAGTATCCTCATGTTGTTTATGAAGAACACTGCAAGGGTACTGATCCTGAGAAGTGTGAACCAGCCTCGACAGAAGTTAGCTATCCTGAAAGGCTGGAAGAGGAACTGGTGACAGGTCTATCTCGTCTGTCATGGGAAAAAGTAGATGTTAGCTTTCATCGCTCAAGACAGAGGCTTGCAGCTCACAGCATTATTCAGATTGTAGTTACGAAAGATAGCTCTAGAGGAGTACATTTTCGGCGTGCAGGTCCCCGTGAAAAGGTTTATTTCAAGTCAGATGAGGTGCGTGCTTGTGTAGTAACATGTGGGGGATTATGCCCTGGGATTAACACAGTGGTTCGGGAGATAGTCTGTGGCTTGAACTATATGTATGGTGTTAATGATATACTTGGAATTGAGGGAGGATATAGAGGGTTTTACTCCAAAAATACATTAAAATTGACACCTAAAGTTGTCAACAATATCCACAAACACGGTGGTACTTTTCTTCGTACTTCACGAGGAGGCCATGATACAAATAAGATTGTTGATAATATCCAGGATCGTGGAATAAATCAGGTGTATATCATAGGTGGTGATGGTACTCAAAGAGGAGCAGCTTTGATTTATCAGGAAGTTGCAGAACGTGGTCTTCAAGTTGCTGTTGCTGGGATCCCCAAGACAATTGATAATGACATTGCTGTGATAGACAAATCTTTTGGTTTTGATACTGCGGTCGAAGAAGCCCAGAGGGCCATTAACGCTGCTCATGTTGAGGTCGAAAGTGTAGACAATGGAGTTGGAATTGTTAAACTCATGGGTCGATATAGTGGTTTTATTGCCACCATTGCAACTTTGGCAAGTAGAGACGTGGATTGTTGCTTAATACCAGAATCTCCATTCTACTTGGAAGGGACTGGAGGGCTCTTTGAATTTATAGAACAGCGGCTTAAAGAGAACGGGCATGTGGTTATTGTGTTAGCAGAAGGAGCAGGACAGGACTATGTAGCTCAAGACATGCATGCATTTGAGGAGAAAGATGCATCAGGAAATAGATTACTACTAGATGTCGGTCCGTGGTTATCTCAAAAGATTAAGAATCATTTTACAAAGGTTCAGAAGATGGCAATAAATATGAAATACATAGATCCTACATATATGATTCGAGCTATCCCCAGTAATGCTTCGGATAATGTATATTGCACCCTTCTTGCTCAGAGTGCTGTTCATGGTGCCATGGCTGGATACACTGGATTCACTGTTGGACCTGTTAATAGCAGACACGCTTATATTCCAATTTCTCGTGTTACGGAGACGCAAAACACGGTGAAGTTAACCGGCAGAATGTGGGCAAGGCTTCTTGCATCTACGAATCAACCTAGTTTCGTGACAGATAATGAAGCACTGAACGGAGAAAAGGCTGCTGGTATCAACAACGTCGAGATTTCTACTCAGAGT 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BLAST of MS000279 vs. NCBI nr
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BLAST of MS000279 vs. NCBI nr
Match: KAF2311682.1 (hypothetical protein GH714_025904 [Hevea brasiliensis]) HSP 1 Score: 1153.3 bits (2982), Expect = 0.0e+00 Identity = 575/759 (75.76%), Postives = 638/759 (84.06%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. NCBI nr
Match: KAF3433191.1 (hypothetical protein FNV43_RR24293 [Rhamnella rubrinervis]) HSP 1 Score: 1142.9 bits (2955), Expect = 0.0e+00 Identity = 599/930 (64.41%), Postives = 658/930 (70.75%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. NCBI nr
Match: KAF9686017.1 (hypothetical protein SADUNF_Sadunf03G0114700 [Salix dunnii]) HSP 1 Score: 1138.3 bits (2943), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/733 (76.67%), Postives = 630/733 (85.95%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. NCBI nr
Match: KAG5558283.1 (hypothetical protein RHGRI_008269 [Rhododendron griersonianum]) HSP 1 Score: 1130.2 bits (2922), Expect = 0.0e+00 Identity = 577/850 (67.88%), Postives = 651/850 (76.59%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of MS000279 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94AA4 (ATP-dependent 6-phosphofructokinase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PFK3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 624.0 bits (1608), Expect = 2.2e-177 Identity = 299/401 (74.56%), Postives = 348/401 (86.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5J7 (ATP-dependent 6-phosphofructokinase 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PFK7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 619.0 bits (1595), Expect = 7.0e-176 Identity = 301/401 (75.06%), Postives = 344/401 (85.79%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M076 (ATP-dependent 6-phosphofructokinase 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PFK6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 615.9 bits (1587), Expect = 5.9e-175 Identity = 297/391 (75.96%), Postives = 341/391 (87.21%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M0F9 (ATP-dependent 6-phosphofructokinase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PFK1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 607.4 bits (1565), Expect = 2.1e-172 Identity = 291/405 (71.85%), Postives = 348/405 (85.93%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6MD93 (Uncharacterized protein OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_025904 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1153.3 bits (2982), Expect = 0.0e+00 Identity = 575/759 (75.76%), Postives = 638/759 (84.06%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498KQA5 (Uncharacterized protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_022778 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 574/844 (68.01%), Postives = 642/844 (76.07%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A1UWC6 (6-phosphofructokinase 4, chloroplastic OS=Morella rubra OX=262757 GN=CJ030_MR8G004035 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1108.2 bits (2865), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/962 (61.33%), Postives = 665/962 (69.13%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6EWJ7 (ATP-dependent 6-phosphofructokinase OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=PFK PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1097.4 bits (2837), Expect = 0.0e+00 Identity = 596/978 (60.94%), Postives = 657/978 (67.18%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N6R865 (ATP-dependent 6-phosphofructokinase OS=Carpinus fangiana OX=176857 GN=PFK PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1049.7 bits (2713), Expect = 5.9e-303 Identity = 537/756 (71.03%), Postives = 600/756 (79.37%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. TAIR 10
Match: AT5G61580.1 (phosphofructokinase 4 ) HSP 1 Score: 699.1 bits (1803), Expect = 3.8e-201 Identity = 347/415 (83.61%), Postives = 377/415 (90.84%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. TAIR 10
Match: AT5G61580.2 (phosphofructokinase 4 ) HSP 1 Score: 694.1 bits (1790), Expect = 1.2e-199 Identity = 347/415 (83.61%), Postives = 376/415 (90.60%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. TAIR 10
Match: AT4G26270.1 (phosphofructokinase 3 ) HSP 1 Score: 624.0 bits (1608), Expect = 1.6e-178 Identity = 299/401 (74.56%), Postives = 348/401 (86.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. TAIR 10
Match: AT5G56630.1 (phosphofructokinase 7 ) HSP 1 Score: 619.0 bits (1595), Expect = 5.0e-177 Identity = 301/401 (75.06%), Postives = 344/401 (85.79%), Query Frame = 0
BLAST of MS000279 vs. TAIR 10
Match: AT4G32840.1 (phosphofructokinase 6 ) HSP 1 Score: 615.9 bits (1587), Expect = 4.2e-176 Identity = 297/391 (75.96%), Postives = 341/391 (87.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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