MELO3C034954.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAACTCTGCCTCTAAAATTATCAATGGCGAAATCTCTCCCACTTTACGAAAAGACAAATATCAAGAGGCCAACCCAAAGAGTATTGGATATTACCATATTCATCCTATTAGTTTCTCTCAATGCTTATCGAGTATTGTTGATCTACAATCATGGCTTCTCCTATCTCCAAATCATTGCATTCCTTTGTGAATTTTGGTTCTCTTTCATTTGGTTTCTTACTATTATCATCAAATGGAACCCCGTCCATTATGAAACTTACCCTCAACGCCTTCTCGAACGGTAAATACATAACTCTTTCTTTTTATTTGTTACATCTCTGTGGAACAACACTATTTATAATTATTTTTTAAAAATATATATATTTTTAATTACTTAATATTAACAATTCATTCCAAATATATTTTGTGTAGGGATGCTTTAGTCCGATTTAGCAACTCATTTGTCTTTTTTTTTTCCTCTTTTGAAAGTTAAACTTACATGCACATCTTCCACTACTATACACTCTACCTTTAAGAAGGGAAATATAATAATTTTTGTGTACTGAAGGGAGATGGAATATCCGGCGGTGGATATATTTATAACGACGGCAGATCCGGTGTTGGAACCGCCGATAATAACAGTAAACACCGTGTTGTCTTTGATGGCGTTGGATTATCCGGCAAACAAACTTGGTTGTTATGTGTCCGACGACGGCTGCTCTGCTCTAACGTTGTATGCATTAAAAGAAGCATTGAAATTTGGAAAGATTTGGGTTCCATTTTGCAAAAAATATGAAATTCAAGTTAGAGCTCCGTTTAGGTATTTCTCGAATGACTCAATGCCGCCTCATCTTCCTTCCTCCACACAATTCCTAAATGATTGGTATACGGTGAAGGTAATGATCGACAACGACACAACCCAAATTCTCTCTCTCTTTTATTTTCTTCAACTAACGATATAAACCACTTTAATTTTGGTTGTTGGATTTTAAATATTGATTGACAAGAAGCATATCAAGACAATCTCTGAATTTTTATAATTTATTATTTAATTTTTATGCACGTTTTATTGAAAATTATTTTTAAAGATAAAATATACCAAAGTATTTTATGTTATAGGAAAAAAATATTTAACCACTTATCTTTATGTATTGAAATTCAAGGTAGATACCAATTTGAAAATTGTCCATGGTAATTTGAAGACTGAAAAGTAATAATATTTATATGTATGGAAAGCGAAGGTAGAGTATGAGAAGCTTGAAGGAAAAATAAAGGAAGCAGAAGAAAGCAGATCATTTGGTATAGAAGAAGAAGATGGAATTGACCTGGCAGCTTTCTCCAATCTCCACACCAAAAATAACCATCCCACCATAGTTAAGGTGTACTCCTCTCTTCTTCTACTTATATATACCCGTGATCCCTTTTCTTTGGCGTTTTCTCTTTTCTTTGGGAGTTCTAGAATAGGTATAACTCTCTTGGTCGATAAGATTTTAGTTAATTAGTTTGAAGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTTATATGGTCCATAATCTCATATTTCTCATTTACTTCTATTTTCACACCAAACACCATTGACCATCTCCCCCGTGATAAAGCCAATCCTTTCTAGTACTTCCAACATTCACCATTTCTTGGCTTTATTTTTGGAGAGAAAAAACCAATGTACAAAAAGAATGAGAAAAATAAAAGATATGAAATGAAAAGTTGAGTACCATTTTCGTCCCATTTTGATGAGTTTGGATTAATTCAAATCTTGAATTTCCGTAAACATATTTATTTACACAATTTCCCAAACTAGAGTTAAAAATGAATAAATGATTTTAAAAGTGATTGTAATTAAATGTTTTATATTATTAGATTTAGATGTTTAATTAATTAATACAATTAGAAGTTATATAATTTTTTTATTTTTTTTTTTGAAAAGGAAAGGACAAAAAATTTGTTATTTTTAATCCTCGACTCTTGTCGAGGAAGGTACCTTTTTATTCCTCTTTTCGTTCTACTGAGAAAATAGGTTTACATGATTCTAAAAATTTTGTCATAACTATTTTTAGTGACTCATGAAAGAATATAGATGACATGTGAAAGATATGTAATAATTAGTTGTTTCTTGACTTACATATTTAGTCAACAAATATCATTAATTGATATTTATTATCTATCACAATAATATTGATTATGAAAAATTATCATATTGTCATTGCACAATCAAAGATTTAAACCTTTGATCACATGAAGTATATATCATATGTCATTTAAGCCATATCATCATGTTCGTTTGTTTACTGAATAAATGAGAACTGTAAGTTTTATTTCCATCAGTATATTTAATAAATATTTGTTTCTTGTATTGGACTCAAAGGGATTTCAAATATTTATTTTGTTAAGCTCATCACAACAAACATAATATATAGTGGCCATATTTTATATAACTTATAAGTGTGTATTTATTTACAGATACTGTGGGAGAACAAAGAAGTATTAGATGAATTGCCACATCTAATATATGTATCAAGGGAGAAAAGTTTCAAACATCACCACCATTATAAAGCTGGTGCTATGAACGTTTTGGTAATTTAGTTTCTATAAATTATAATTAAAATTTATTCTCACCATTTAATTTAACTTTCATAGATAGTTCTGTTCGTTTTTTCCACTAATTTTGGTCATGGAGCAAAATGGTCATTTGACCATTCTAGTAAAAGTCAAACTGTGACTTTTTTAAGTCAAAAATCAACATTTTGGCTTTTTACCATTTTGTCCATCTTGACTAATTCCAACCTCCTAAACATGAATCCGTATTCATTTTTTTCAAATTCAAATCACATTTGAATATAAATCCGGTCAAAGTTTGACTTTTTAAAGTCAAAAGTCAACATTTTGACTTTTTATAATTTTGACCATTTCCATTAATTCCGAGCTTTCGAATATGAATCCCTATTCATATGTTTAACATTTAAATCACATTTAAACATAAAACTCTTACTTAAAGCTATAATCGACGACTATATCACATATAGTTGTCGATTTCTGTCTCTTTACATTAATCAAACAATTCGAATTATTCCAACATGTTGTTTTAAGTTAATTTCTTATGAGCTAGCAGAGGAACCTAATGTATCAATAGATCATGGCCTCCAACGATCCGAGATTAACTGGCCAAGCTAATCAACATTCGTTAACTAACGAGTCATTCCACTAAAGTCTCGTAGTTGCACTCCCCTCACTATAGATATATTTCTGTTCATATGATATAACTATGATCAGTAAGTTAATCCTTCACAGGTTTTTCGTAATCTCGGCTGGGTCAAAATACTGTTTTACACCTTGACCAAAGTTAGTGGGAAAATCCAACATTTTGTTGGATAATTCTACTAACTCTTGGTGAGCTTTCTGGAAGCTTATGTGGTTATGACACCAAGCCCACTAAGAGAAAATGGAATAGTGATTAATTCCACTAAATGTTAGTGGAATGCTAGGTGTTGAAATTTTGGCCAAATAATTACATGCAATTTTGCATGTAATTAGGTTATAAATAGTCCTCTTTTAAATTTGAAAAAAACTTTTGGCCATTTTGATGATTTTTTAATTTCAAAATCATTTTTTCTCTCTTTAAAAATTATACCTATCTCAACCTAATTCCCTTCAAATTTCCACATCTCTCTCTAATTCCTTCAATTAACGAGTCCCACAACCCGGTTATGAGTCTTGAGAATAGCGGGTCAACACTAGTGGTGGTCCCAGATTCGTGATCGTGAGGAGTTTTCGAGAAGAATTGGAGGATCGAGAGCTTCAAAGGTAATGTTTTCTTTTAACCCTAATTAGTGTAATTAGGGTGTCTTAAGCATGATTCACATCTAAATTAGTTTAGATGCATCTAGGGTAAATTTTTGATCCGTATTTCCGCTGTGTTTGTATGCTTTACATCAAGTTCATGTCAGAATAAATGGTTATTGTTCGTGTTTCTTCATGAATGTATCATGAATGGATGCATCATTAGTAGATGCATCACTTCATGAAAGTATTATAGAAAAAGGACACGACTTTTCAAATGACCATGAATAAGTCTATAAATACGGTCCTTTTTTATTTGGTTGGAGAAGAGAAACATTTCCATAGTCATTTGTCTTCTTCCGAATCGATTTCCTCTCCATTATCTAGAATTTTGACCTTCGGTAGATCCACAAAGTTTTGTTCGTTGATCTTCTAGACGGGGTGCTACTCTTAGAAGAAAGGTAATCTGTTCTATCTTGGGAGACAATTACTCTCAAAACTCAAGCACTAAGGTGAGTAAATTTGTATTAAGGAGACAACGTGAATTTGTTGGGCTCAGATCTATATCATGAAAGCGAGACGGGCCCTTTGATGATTCGATTCGTAAGAAAGCTAGTGGAGAATACCTCTTTGAATTGTATTCACTCCGGATTTCCCGTCTGCTTAGTTGACCAGGAGGAATTCGATGAAGGATGGGTCCTCCGATCTTAATACTCTGAAGCAAAAACAGAGGTTCAGATGCTCAAAGAACAAAGAATTTGAGGTGAGACTGAATCATTGAACAAAGGTTTGAGCCTCCGCAGTCAAACCTACTGAGCGGTGAGGATCGAAGCGGTTGAGGCAAGAATATGGCCAGGTAATTTCTCGATTATGTGTAATGGATACTGTACAAGCCTAATGCTCTTCGTTCGAGGGTGCAGAAAAAGCTTCTACTTTTCTAATGGAAACTACTTAAACAACCGTCTCAATGAACAAGGTGAAAAGAAGATGGAATCGCTCAATTACAACCTTGTTCATTGATTTCTCCGTAGCTCCGCGTAACGGACAAACTGAAACCTTTTATCATTGATTCTTTAGAAGCGGAAGCGGCTCAACTGTCAGGAGAGGCTCAATGCAATATGAGTTAGGACCAAAGAATTTGCGAAGGACTTGTTCATTCTACCATATTAATCTCTTCTTGTGGGATTTGTGAATGGAATTGATTTGAGCCACAGGT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ATGGCGAAATCTCTCCCACTTTACGAAAAGACAAATATCAAGAGGCCAACCCAAAGAGTATTGGATATTACCATATTCATCCTATTAGTTTCTCTCAATGCTTATCGAGTATTGTTGATCTACAATCATGGCTTCTCCTATCTCCAAATCATTGCATTCCTTTGTGAATTTTGGTTCTCTTTCATTTGGTTTCTTACTATTATCATCAAATGGAACCCCGTCCATTATGAAACTTACCCTCAACGCCTTCTCGAACGGGAGATGGAATATCCGGCGGTGGATATATTTATAACGACGGCAGATCCGGTGTTGGAACCGCCGATAATAACAGTAAACACCGTGTTGTCTTTGATGGCGTTGGATTATCCGGCAAACAAACTTGGTTGTTATGTGTCCGACGACGGCTGCTCTGCTCTAACGTTGTATGCATTAAAAGAAGCATTGAAATTTGGAAAGATTTGGGTTCCATTTTGCAAAAAATATGAAATTCAAGTTAGAGCTCCGTTTAGGTATTTCTCGAATGACTCAATGCCGCCTCATCTTCCTTCCTCCACACAATTCCTAAATGATTGGTATACGGTGAAGGTAGAGTATGAGAAGCTTGAAGGAAAAATAAAGGAAGCAGAAGAAAGCAGATCATTTGGTATAGAAGAAGAAGATGGAATTGACCTGGCAGCTTTCTCCAATCTCCACACCAAAAATAACCATCCCACCATAGTTAAGATACTGTGGGAGAACAAAGAAGTATTAGATGAATTGCCACATCTAATATATGTATCAAGGGAGAAAAGTTTCAAACATCACCACCATTATAAAGCTGGTGCTATGAACGTTTTGACAAGAGTGTCTGGTGTATTAACAAATGCTCCATACATATTAAACGTGGATTGCGACATGTTTGCCAATAATCCCCAAGTTGTATTACATGCAATGTGTGTATTTCTCAACTCGAAAGATGATTTGGAAGATATCGGATATGTTCAAACTCCCCAATGCTTCTACGATGGCCTTAAGGATGACCCCTTTGGAAATCAACTAGTGGTTGTATTCCAGTACTATTCACGTGGGGTCATGGGACTTCAAGGACCTCTCTATAACGGGACTGGATGTTTCCATAGACGAAATGTTTTATATGGCCAATTTCCTCACCACACCACACATTTCATGGACGGAAAAGCTTCTGAACAAGAATTAATGAAACTATTTGGATACTCAAAATGTTTTGCAAAGTCAGCAAGTTATGCTTTTGAAGAAACCACACATGGCTATCATCCAAATGGCCTTTTCAATGATAATCTTGAAGCTGCTAAACAAGTTGCTGGATGTGGCTATGAGATCAACACTACTTGGGGTTCAAAGATAGGGTGGATATATGGATCTACAACTGAGGATATTTTAACGGGCTTAGTTATTCAAACAAGAGGGTGGAGATCCATTTACATTGCATTAAACCCTCCAGCATTCCTAGGTTGTGCAGCCTCACAACTTGTTGCTTCATTAACTCAACAGAAACGATGGGTCTCTGGTTTACTTGAAATTTTATTCAGCAAACACTTCCCTGTTTTTGGTACACTATTTGGGAAGCTACAATGGAAGCAATGTGCAGCCTACTTATGGCTCCTCACTTGGGGCCTTCGTTCCATTCCAGAGCTTTCCTATGCTTTACTTCCACCCTATTGTCTCATCACTAACTCCTCTTTCTTCCCGAATATGGAAGAAAGATCAATCTCCATCCCAATTTTTCTGTTCATCATTTACAACTTTCAACAATTATTACTATACAAAGAAACAGGACAATCAATAAGAGCTTGGTGGAATAACCAAAGAATGGGAAGGGTAAACACAATGTGTGCATGGTTGTTTGGATTAGGGAATGTGGTTCTAAAGTTTTTGGGTGTAAGGGAAGTTGTGTTCGAAGTAACAAAGAAAGAGACATATTGTGAGGCAGACTTGGTGGGGCATTTCATGTTTGATGAGTCCGCAATGTTTGTGCCAGCGACGACCCTTTTATTGCTCCAACTTATTGCTTTGCTTATGAGCTTCATAAGACAAGCTGGGAGAATGAGAAATACAGTGCTTGAGGTGATTTGTAGTGTATGGTTAGTTTTATGCTTTTGGCCATTTTTAAAGGGAATCTTTGTGTTTGGTAAAGGAAGATATGGACTTCCTTTCAGCACCATCTACAAATCAGCTGCCTTAGCATTGTTGTTTGTGCTTTTGTGCCAAAGAACAACCGTGAATTAA MAKSLPLYEKTNIKRPTQRVLDITIFILLVSLNAYRVLLIYNHGFSYLQIIAFLCEFWFSFIWFLTIIIKWNPVHYETYPQRLLEREMEYPAVDIFITTADPVLEPPIITVNTVLSLMALDYPANKLGCYVSDDGCSALTLYALKEALKFGKIWVPFCKKYEIQVRAPFRYFSNDSMPPHLPSSTQFLNDWYTVKVEYEKLEGKIKEAEESRSFGIEEEDGIDLAAFSNLHTKNNHPTIVKILWENKEVLDELPHLIYVSREKSFKHHHHYKAGAMNVLTRVSGVLTNAPYILNVDCDMFANNPQVVLHAMCVFLNSKDDLEDIGYVQTPQCFYDGLKDDPFGNQLVVVFQYYSRGVMGLQGPLYNGTGCFHRRNVLYGQFPHHTTHFMDGKASEQELMKLFGYSKCFAKSASYAFEETTHGYHPNGLFNDNLEAAKQVAGCGYEINTTWGSKIGWIYGSTTEDILTGLVIQTRGWRSIYIALNPPAFLGCAASQLVASLTQQKRWVSGLLEILFSKHFPVFGTLFGKLQWKQCAAYLWLLTWGLRSIPELSYALLPPYCLITNSSFFPNMEERSISIPIFLFIIYNFQQLLLYKETGQSIRAWWNNQRMGRVNTMCAWLFGLGNVVLKFLGVREVVFEVTKKETYCEADLVGHFMFDESAMFVPATTLLLLQLIALLMSFIRQAGRMRNTVLEVICSVWLVLCFWPFLKGIFVFGKGRYGLPFSTIYKSAALALLFVLLCQRTTVN Homology
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004151936.2 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucumis sativus] >KGN63235.1 hypothetical protein Csa_022495 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1399 bits (3622), Expect = 0.0 Identity = 684/748 (91.44%), Postives = 717/748 (95.86%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004151897.1 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucumis sativus] >KGN63234.1 hypothetical protein Csa_022325 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1269 bits (3284), Expect = 0.0 Identity = 627/750 (83.60%), Postives = 680/750 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004151937.3 (cellulose synthase-like protein H1 [Cucumis sativus] >KGN63423.2 hypothetical protein Csa_022385 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1255 bits (3248), Expect = 0.0 Identity = 611/750 (81.47%), Postives = 675/750 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038902792.1 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1226 bits (3172), Expect = 0.0 Identity = 604/746 (80.97%), Postives = 659/746 (88.34%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038900388.1 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1221 bits (3159), Expect = 0.0 Identity = 601/747 (80.46%), Postives = 659/747 (88.22%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q339N5 (Cellulose synthase-like protein H1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CSLH1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 668.7 bits (1724), Expect = 7.7e-191 Identity = 365/757 (48.22%), Postives = 475/757 (62.75%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80891 (Cellulose synthase-like protein B4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 624.8 bits (1610), Expect = 1.3e-177 Identity = 355/765 (46.41%), Postives = 466/765 (60.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX83 (Cellulose synthase-like protein B3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 616.7 bits (1589), Expect = 3.5e-175 Identity = 349/764 (45.68%), Postives = 469/764 (61.39%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80899 (Cellulose synthase-like protein B2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSLB2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 569.7 bits (1467), Expect = 4.9e-161 Identity = 331/768 (43.10%), Postives = 460/768 (59.90%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7PC71 (Cellulose synthase-like protein H2 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=CSLH2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 568.2 bits (1463), Expect = 1.4e-160 Identity = 330/772 (42.75%), Postives = 443/772 (57.38%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LMT9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G416250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1399 bits (3622), Expect = 0.0 Identity = 684/748 (91.44%), Postives = 717/748 (95.86%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQD3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G416240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1269 bits (3284), Expect = 0.0 Identity = 627/750 (83.60%), Postives = 680/750 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C389 (cellulose synthase-like protein H1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495979 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1219 bits (3153), Expect = 0.0 Identity = 602/751 (80.16%), Postives = 665/751 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G5L2 (cellulose synthase-like protein H1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451107 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1051 bits (2719), Expect = 0.0 Identity = 521/750 (69.47%), Postives = 608/750 (81.07%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CHW9 (cellulose synthase-like protein H1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011082 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1044 bits (2699), Expect = 0.0 Identity = 525/754 (69.63%), Postives = 608/754 (80.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G32540.1 (cellulose synthase-like B4 ) HSP 1 Score: 624.8 bits (1610), Expect = 9.1e-179 Identity = 355/765 (46.41%), Postives = 466/765 (60.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G32530.1 (cellulose synthase-like B3 ) HSP 1 Score: 616.7 bits (1589), Expect = 2.5e-176 Identity = 349/764 (45.68%), Postives = 469/764 (61.39%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G32620.1 (cellulose synthase-like B ) HSP 1 Score: 569.7 bits (1467), Expect = 3.5e-162 Identity = 331/768 (43.10%), Postives = 460/768 (59.90%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT4G15290.1 (Cellulose synthase family protein ) HSP 1 Score: 545.8 bits (1405), Expect = 5.3e-155 Identity = 323/772 (41.84%), Postives = 451/772 (58.42%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C034954.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G32610.1 (cellulose synthase-like B1 ) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 1.7e-148 Identity = 311/772 (40.28%), Postives = 446/772 (57.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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