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MELO3C033218 (gene) Melon (DHL92) v4
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTGGTGGAAGCGAAGAGGAAGGTAATCCCTTTCAACCTCCCCAAACGTGGCCGACCAAATCACGATTCCAACATCTAGCCTTCGGCCATTCCTCGCCCACCGTCCGTCACGAGCATTCCTCTCTAGTCGTCCATCACCGGCATTCCTCGCAGCTATCGACCATTCCTCAGGTTAAGTTTTTTTTTTCACTTGCATCCTTAGGTTAGTTTTGCATGCTCTATTCGGCATCGTCTATTTCCTTTACTATTATTACGACCTCCAAATCTGTAACGCCCCAACAATTTTGTTTTTTTTTTCATTTATTATTAATGTTAAGTGCGGTTATGGAAAATTCGAATTTTGAGGAACTTTATCATTTTGATTTGTGATTAATCAAGGTTTAGAGGCATATTATTTTGATTTGGATAATTAAATTGGTAAAGGTTGTTATGAGGATAAAATAATTGAGTTAAGCTAAGGTGATATTTGAGTTCGAGTGGGACGACCTAGACTCAAACAGTATAAAAGCATAGTGCGCGAGTGGGACGACCCAGAGTCAAATAGTATAAAAGCATAGTGCCCCAAGATTGGGAGTGTACCTGTCACCACTGTATCAACTCACTCGGCCTCCTGACGGGTAGTGGCAAAAACTCTTCCCTACTGGGAAGCAGAAGGCTTGTGCGTCGTCGTCTCAAAGGGCTTCAGAGGACACGCGTCAGCGGTCCCCGGTTATCTGCACCTGAAGCAAACTCCACTCCCGGCCAAGCATCGACCTCCATGGGCTTTCCCACAGGTAGTACAGACGGGTAGCTCTCTCAGGGTCCTCCCAACTGCTGCAAGCTCTCGTCGGTGTCTCTGAAAGACACCTCCTGACCTCAGAGTTCGCTGCGGTATCACGTCAGGCTGCGACTCAACCTTTCTCTTCTGCCCCAGGGCTGACCCTCTGCCGGCAGCCTTAGACGAATCAGCTCTCTCATGCAGGCTCAAATCCAGTGCTATGCGTAGTGCATCCGCATGAGTGGCTGGCCGGAGGGCTCGGACAATGCCCTGAAGGTCTAGTCTAAGACCTCTAACGAATTTCTCAGTCCTGGCAGCCTCATACCTTACCACATCGGGAGCAAAACGGGATAGCATGTCGAACTCGGCGTCGTACTGCTCCACGGTCATGTCGCCTTGCTCTAAGTTTAGGAACTCTTGCAGCTTGGCGTGCTTCACATTGGCAGAGAAGAACTTAGCGTAAAAGTTCTCCTTGAACTGCTCCTAGGTTATCTTGCTGAAGTCGCCCCCCAGCATCCTCTCAGCAGTCTCCCACCAGGCGGTGCCCCTATCCTCCAGGAAGAAAACTGCACACTGCACCTTCTGGTCTTCTGGGCACTTCATGTATCGAAAGATAGTCTCTATGGACGTCAACCACATTTGGGCCTTTGTGGGGTTGTCCATGGATCCGTCAAAAGTCTTAGGATTATACTTCCTAAAGTCTCTTAAGTGCTTGGCCTCAGCCGACAGTTGAACTAGCACGGGCTGAGCTTCCACCGGGGCTGAAGGAATGACGGTCTGGGCCTGAACAGGGGCGGCCTGGTTCTGCTAGGCAGCGAGGAAAGGCGCTAGAGCAGCTTGCAGCATGTCCTGATAACGCTGCTCCATTGCGGCGAGATCCGCCTGGGTGACCGGTGCGTTAGGGTCGACCGCCGGCACAACATGTTGCTCCTCCGGCTGGCCACGATCGGCTCCTCTGCCTCCCCTACCACCTCCTCGGCGTGTACCTCTACGTGGCGACATTCTCCCTAAATTTCACCGACAAAACTTTTCACCACAAGAACATAACACTCAGATTTCTATGTCTAGTCTATTCAGGCAAGATTATAATCTTAACATTAGCAAGGCTTTGAGACATACCTGGCGAGTGACGTAGGACTGTATAGCCATATGGTGCAGTAAAAACAAAAACAAAACAATGACTTACATCGTAGGTCAGTCTACTGAACCTAAAACCCTGGGCTCTGATACCAACTGTAACGACCCAACTCCTTATTCTGAGCCGAAGTCATTACTAAATGTAGACAACATGATTTAAGTCATAAAGTTTAGTTAAAACGAATAAAACCTCATAATTTTATTTATAAAATCAAATCAGGGTAATATGCAAAATGTAAATAATGTTAAAATCCTACTCGGGCCCTATCTACTTTGAAAGAAATGAAATAGTAACTAAGGAAGAAAATAAAACTCAAGTACTAGGAACGAAAATCGGGTCTTTGGTGTCTCGGGGAGCACCTAGGACATACTAGTCTGTAGTGAACCCGGAAGAAACACTAAGACAATCGGGCTGCGAGGATCCCGTCGAATCACTCGAATCATATCTATATCCATGCTAGACTGGCGTCCCATAGGACCACGCAGTCCTAAATAGGTGGTGATCCCGAAGGACACCCATGCAGATACGACTCTAATAGGCTAAGCTAACAGGTACCCTAACCATAGCATACATATACATAACATCATCATGTAATCAATCAGTCTAATCATCATCTCACATCCCATCACAATATCCAACATACAGTCATAACAAGTCATGTCATCACATTACCATGCCATCATATAACCACATCATCAGTCACATCATGCTCCCATAAATTTACATATGTTATACAGTCTAGTCCTTAAACATGAATAACTGGAGGTGTATGCGGTCTTATGGTTTTAATCATAGGGCTAGTAGGAGAAATCTCTTACCTGGAGATTTGCTCGACGAGTCCTAACAGTAACAACACGCTTCCCCAAGCGGCACAAGTCCTAAAGGGTCAAAAGTTCACAATTTAGTAATTTACCCACAAGGGAAAATTTGGTCAAACTTACTTGAGGCGACTTACCCACGGTCGAGGTTGCAACGCTTGAGCCCCTACTGAATTTATCCGACACTCCAAGGTCACTCGGTCCAAGACGTTCCTTAAGCGATAATTTAATTTAGTCCAAATAAAATTATTTAGATTAAAGTTTCATTTAAGCGCGGGTCGGGTTGCGGCAGGGACGCGAGTTGGGCAACTTCGCGCGACTGCGGACCTGCAGACGTGCGGGTTGCGTCTTCGCGCTCGAAGTCTTCAGGACGGGTAGAAGACGTGGTCGACGGAGCGTTTCGCTCGGCTACCCGATCGGCGGTGCGGTCAAGTTTTCGATCCGCGGGGAAACGATCCGTTGGCGACGTAGGGGTGGAGCGGCGGGGCTTCACGACTACAGTTGGAGACGCGGCTGAGCTGATGGAAGAGCTTGGGCAAATCGGTTACGCGACGGCGGCGACGACGAGCGGCGGCGAGGTTTCTTCCTCTTCCTTTTCTCTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTGATTTTCTGGTGCACGGGTCCCAAGGCTCATTTATAAAAAAAAAAACCCTTTATCTTTCCCTTCCATTAAATCAAAACAAACTTTCTCTCTCTCCAACCAAAACTCCCAATATCTTATTTTTTCAAAAAAAATCATCCAATTACAACATTCCCTTAAAAATGAATCTATTCTTTTCCAACTCAGATATCACCCTAGCTTAACTCAATTATTTTATCCTTACAACAACCTTACCAATTTAATTATCCAAATCAAAACAATATGCCTCTAAACCTTGATTAATGACAAATCAAAATGATAAAGTTCCTCAAAATTTGAATTTTCCATAACCGCACTTAACATTAATAATAAATGAAAAAAATCAAAATTGTTGGGGCCTTACAATAGGAAGTCTCTGATTTCAGTGTTCATGCCTTCAATGTCAAATCCGATTTCAGTTTATACACTGAATTCATCGTTATCATTAAAGCAGATAACCCAAATGAAAACATTGGTTTTATTTATGGGAAAGATACCTCTGTTTTTTGTTATGTACTCTAAATCGGAGCTCTTTTCTGGGTGCAGCTGACGAAGAATGTGACGGATATAAGTATTTTGTTGAGTGGGAATAGTGAATTTGGAAGTGAGTTACAAGAGGCGTTGATGCAGAAAGACATAGTGGGAAAATTTCGCTGCTTGTTGAGGTGAAAGTGCTAGTGACGGTGGTGATCGGGAGATTGTTGTTGAACCAGGTTAACGTGTTTGTTAATTGTTCATTGGTGGTTGATAATTTGTCGCTGAATAAGAAAGTTGAGATTTTGTCGAGTAATTATACTTACGGTGCTTTGTGAATTTTAAAGCTTTACCCATAGTTTTGTTGCTCTTTCGTTTTTGTGCTATTTAATGGGAATTCCTTTTTTCACTCTTGCTATGTTCTTATTAATCTTATATATTGCGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTACTTGCTTGTGATAGATTGGTGTGGAAATAGGTAAGAGGAAAAGCCTTTTTCTTCCTGCATCTTTTTCTTTGTTTCGAAATGTCAGGATACAAACAGAGGAATCTAACTTCGATTTTAAAATTGATAGTTTGAGTTCATGTAGATTGAGTTATGCTCAAGTTGGTGTTAGTTTATAATTATTAAAAAATTAGGGAGGAAAGCTGTGCCTCTCACAATTGAAAATCCAATCCAACATTTTGTTCAAGGGAATGCATCTATTTGTTTTTTCGGCCGTGGAAGAAGTTCTGACATCTGAGATCTATTAGAAAACGTTTTCAGTCCTCTCTATGGTTTCTATCTTCCTAGACAACTGTGTTGATTCTTCTTATCTGAGATTAAAAGATGGAAAAGGTAAAAGAAAGTGAACCTCTCAAATTCTCCTAGTAACTATTAGTTGCCTAAAATATGTCATGAGGAACTGTAAAGAACATAAGTTTTCAACATTTTTCTGGTGAATGAAATCGTTCAGATTCATCAATCAGATAATTTTTTATATTTTTCTTGCAGCCTTTATAGCCTCGGGCAAGTTTTTTCAGTGCCAGTGAATGGTGTTGCGCCCACAACAAAAAATAACTCTCAATCAACAGCGTCGGTATCATCAGCTACTCCTTTGCAATCGGAAGAGTATGATTTCTCCTCTTTAACACAAGGTATGTTTTCAA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ATGTTTGGTGGAAGCGAAGAGGAAGGTAATCCCTTTCAACCTCCCCAAACGTGGCCGACCAAATCACGATTCCAACATCTAGCCTTCGGCCATTCCTCGCCCACCGTCCGTCACGAGCATTCCTCTCTAGTCGTCCATCACCGGCATTCCTCGCAGCTATCGACCATTCCTCAGCTGACGAAGAATGTGACGGATATAAGTATTTTGTTGAGTGGGAATAGTGAATTTGGAAGTGAGTTACAAGAGGCGTTGATGCAGAAAGACATAGTGGGAAAATTTCGCTGCTTGTTGAGCCTTTATAGCCTCGGGCAAGTTTTTTCAGTGCCAGTGAATGGTGTTGCGCCCACAACAAAAAATAACTCTCAATCAACAGCGTCGGTATCATCAGCTACTCCTTTGCAATCGGAAGAGTATGATTTCTCCTCTTTAACACAAGACTCTCCCGATGCACATAGTGCCGTCGGAAAGAACATCGGTAGCAGTATGTTGGCTTCGATATTCGCAATGTGCAAACGGGACAACATTGAGAATGCCCTACTCCTGATGCCTTACATGTCAATGGACGATGTATGTCGACAATAG MFGGSEEEGNPFQPPQTWPTKSRFQHLAFGHSSPTVRHEHSSLVVHHRHSSQLSTIPQLTKNVTDISILLSGNSEFGSELQEALMQKDIVGKFRCLLSLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQSEEYDFSSLTQDSPDAHSAVGKNIGSSMLASIFAMCKRDNIENALLLMPYMSMDDVCRQ Homology
BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: KAA0036779.1 (putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.8e-09 Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: XP_008454632.1 (PREDICTED: probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.8e-09 Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: TYJ95847.1 (putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.8e-09 Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: XP_004150098.1 (ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN59876.1 hypothetical protein Csa_001028 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 6.3e-09 Identity = 42/55 (76.36%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: XP_031738942.1 (ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 6.3e-09 Identity = 42/55 (76.36%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3B9N9 (Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold110G001380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.4e-09 Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T5X5 (Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold20G00650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.4e-09 Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZ67 (probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494997 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.4e-09 Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LIL4 (Arf-GAP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G851770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 3.0e-09 Identity = 42/55 (76.36%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FEN5 (probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443384 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.7e-07 Identity = 38/57 (66.67%), Postives = 42/57 (73.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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