MELO3C033218 (gene) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C033218
Typegene
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionLEA_2 domain-containing protein
Locationchr08: 10654842 .. 10669702 (+)
RNA-Seq ExpressionMELO3C033218
SyntenyMELO3C033218
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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TTCGCTTACACTTGGGCAAGTAATAAGAAAACTTGTACTTAACGTAGATGAAGTAGTTATGCGTGGAAAGGATGTGTACCTTTTATTGCACAATCCTCGCCTAAAGACACAACGAGCATATCATATGCAATGATCATGTCTTATGACGTATTAACGAATTTACCATCAAACAAGTCGAGTAGCAAGTCTAACAACAAGCATGTTTTTTGCTTCGTTGTCTAGGAATTTCTTTTTTCAAAACTAGGCACCATGTTTTACTTTGATTTCAGTAAAACACTCAATTTATGTATGAGTTGAGTTGGGTTAAATTTTTTGTTGAGTTGGGTTGGATTTGAAAATTGGAGAGAAAAAAAGTTAAGTCGGGTTGCAAGTTGTGCAAGTAAGGGGTCGGGTTGACTCGGTCCAACTCGATTATATGTGTGTGTATATATAAACCTAAAACCTAAACGTAAATCTCTTTTTTAATGGACATGTAGACTTGAAATTTTCAATGTATACCATATATATGTCACCTTGCACCTTGAATGACAATTTGTCCACCTTGCATAATGAAAAACAATATGAAAATTTGTCTAAATTGTGAAAAAATGAAAAAAAAAACCAACCCGCCAACCCAACCCGAATTGTTTTGGTTGGTTAGGGTTGTGTTGGCCTTGCAATATAGGGTTCATTTTCAACCTAGATATGTTGGGTTGGTTCATAATTTTTCTCCAACTTGGCTTATGTACAATTCTAACAATGATGAATAATTCCACTAATATTAAATGGAAAGTGAGGTGTTGAGAGTTAGGTGAACTAATTGGGTGAAGTTATTAAAGAATTTTTTTTTCAAAGTACGAAAGACTCTTGATAATTAAAAAAAAGAAAAAACTTTTCAAATGTTATTCTCCACCAAACCAAACTCCTATCTGCAACCTTAAAAAAAGTGCTCACCTTCATCTATTGGGTCCCCCAACCCGATTCTGAGTCTGGAAGATAGTAGGTGACTACTAGTGGTGGTCCGATCAAGATTGCGTAAAGATTTTTGAGTGATTCGGAAGCTACAAAGGTAGTTTCTTGTAAAACCTTAATTCATGTAGTTTAAGGTTATGTATGCTAACTAGGTGTAATTAGGGTAAGATATCGATTCTATTTCCACTGTGCATGTCTATTTTCTAGCATCAAGATGTTATGCCAGACAATTTGCCTAAGTATCTACCTCCCCGGAGAATGATTGATCATGAAATTGAAATGTTACCAGGGGTAAAATCATCCGCCAAGAAATACATATCAATTGGCACTCCCAGAGTTAGCTAAACTTTAGAAAGAGTTGGATGAGTTACTAAGTGCAGGGTTCATCAGATTGGCAAAAGTTCCCTATGGGGCAAGAGTTCTATTCCAAAAGAAGAAAGATGGAAGCTTACGGTTGTGCATCAACTATCGAGCCTTGAAAAAGCTCATGATTTGCAACAAATACGCATTTCCTATAATCACTGACGTATTTGACTGCTTGCATGGAATTAAGTATTTCTCAAAGCTAGGCTTGCAATTGGGATACTATATCAAGAGTGAATTGCTGAATAAGACGAGCAAAAAACAACGTGTGTCACAAGGTAAGGGGCATTTGAATTTCTCATAATGCCTTTTAGTCTTACTAACGTTCCCCTCGCCCAACCTTCTACACACTGATGAACCAAGTCTTCCATGAATATCTCTACAAATTGTCATAGTTTATTTAGACGACATAGTAGTCTATAGCTCCACGATGGAAGAATACAAGAATCACCTTCAAATGGTTTTTCAAAAACTGAAGGAAAACCACTTGTATGTCAAGCAAGAAAAGTGCTCCTTTGCTCAACAAAGAATACACTTCTCGGGTCATGTGATAGAGTATAAGGTATGGAAGAAAGCAAGATTGTGGTGGTATGTGATCGAAAAATACCAACGACAGTTACAGTACTATGCTTTTTCCTTGAATTAGCCAATCACTATAGGCGATTCATGGAAGGATTTTCTAAAAGAGCAAGACGGTTGATCGAACTGCTGAAGGAAGACCTAATGGATCCAGTTGTACCCCAAAATGTGAAATCGCCTTTGGTGGTTTAAAACAAGTTATGATCAAGGGGTCGGTCCTTAGGGTTGCTAATGTAACTAAACTTTTGAGTTCGAAACTAATGTATCTAACTTCACTTTAGAGGTGTTCTTCTACAAAACGATCACCCCGTCGCATATGGAAGTTGAAAGTTAAACGCAACTGAGAAAAGATATTCAATTTACAAAAATAAAATGCCAGTCATAGTCTATTGTTTGAAGGCCTAAAGATAGTATTTGTTGGGGTCTTCATTTGTTGTGAAGATAAAGAACAGTGCCACGTGTCACTTCTTTAGTCAATCAAAATTTACTTCAAAACAGACTATATGTAAAGAATTCCTAGTTGAGTTTGACTTTGAATTTGAACATAAGAAGGGAACAAGTAACAAAACTGTTGATACCTTAAGTTGGAAAACGAAAAATGTGGCCCAATGCATGTTAGCTCGCCTTTAGACAAGTAAGGTTGATGAATCAATGTGCGATGTCCTAAAAACGTTCATGCAGAAGGATCATTTTCCCAAATTGTCATGAACTTACCTAGAGTTGTAAAACAAGACAATTTTAGGTAAAAGAAGGTATATTGATGATAAGAGGAAGTCGGTTATACAACCCTAGGGTGAAGACTTGAGGAAAAGTTTGTTATTCAAATGTCATAAAACCTTATGGGTTAGTCATCCAGGTTGGCAAAGAACTTATGCCCTGTTGAAAAAGGGATACTTCTGGCCAAAAATGTGAAATGACGTGATGCTAAGACCTCTATAGTTTGCCAATAAGATAAAGTCGAGAAGGCAAAGATTTATGAACTTCTTGAACCCTACCAGTTTTGACAAGACTTTATTACCCATCCGCTTAAGGTAGGTGTTCTTGATGTTTTTATTATTACATGTAATGCTAAAAGGAAGTTGTTTATTACGTTACACAATATGCATTACAAAATTCATTTGTTGATGTATTATGAAAGGATCTAATAATGTAACTAAACAGACGTATAACTTATGGTTATGCAATAAAAGATACATGTCTTACCTATACGTTGTTAAATTTATGATGATCTACGTTTAGTATAAGTTTTCCTCTTTCTCATCCAAGTGTAAGCGACGAAAGAGGTTTCCTGGGTAAGCTAGGGTCGAATACAGGAAATTTCGATCCAACTTAGTTATAATGTTTACTCCTAAACTAGGTGATATAAATTCTATACAGTATAAAGTAAAACTCTACTAATCTAATATTTACATTAAGGATTCTGTAGAGGGGAATGGAATGGAATGATTATGGGATGCAGACTAACTTGCATTAAGAAAAATGCTTGAAAGTCTCTGCATTGTAGGCGATTTAAGCAATGCGATGTTCATGATGAAATATAGATTGTTTAACCATCTTATATTCAAGGCAAGCAACCTCTCGGTACCTAAACACCACACTTGTTCTTCTTTTGGGACACATATGGTAAAGATAAATCAAGTGGTATATATCTAGGCTTCCTTATTTATAAGCTTCACATTTCCCTTGCTATTTAAGGCGCACAACTTTCCAGTGCCTAAAGACGACACTTCTCCTCTTGGCACACAAATGATCGGAGGGAAAAAACCATAAAGAAGTTTGTTTCCAAACTCCCTTATGTGCGTGTTTAGCAAAGTCTTTGCTACTTACTCTCTCGAGCACCAATCAGGCGATGAGTTAAGCTTAAGCTAAACACGATGAGTGTTATAATCAAAGAATCCTTGTCAAGCACATAACATACACTTAAACTACTTACAACACTTCAACAAGATGAATAGTAATGAAATGAGAGAAAGACAGTGGTTAAACATGCGTTGTATTGATAATTGTAAGCCTCTCAACAATGAGATTAATACAGTCAAACAATATATTACAAAGTACAAGAATAGAAAGTAAAGAGGTGAGTCGAGCCACATAATGCATTGTCATGCATTCTTTGCCTCTTTTACAAGTTAGGGGAATAATTGGTGAGATTCTCTCTCTAATCTCTCTCTAAGCTCTCACTCAGAAGTTAACTAGAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAACTACTGCTACAGATAAGGAAGAACTCTAAAACTCATTCTTCCTTGGACCTCCTTAAGGAAGGCTCCCTCTTTTTTGTTCAAGGTGGGATTGGAAGTACTTATAGGCATTCTTAGGTGAGATATTAATTATGTCATGGTGCACATTTGTCCTTCCTATAATGCACATTCGTCCTTGCCTACAAATGTCAGCGTAGAAAGTAGTTGCTTCTTATCACATCAGCTCCAACTACACTCTTGTCTTTTGGCGAATCATCTCGCGTGATGTGTTGGCATCTCACCTTACAATGTAAATCACAAGGCTTCTTGCTTATTACTGAGTTCTTGCACAAGATTCTTCTTGCGATCCGTTTCCTTTATTCTTCTCCCCATCCTACGTGGAAAAACACTTAAAAGCATAATTAATTAGGCATGATGACTTATGTAAGGTGCATTCTCTTAATCATTATAAATTTGCAGTAAAGCTACGCATTTTTGTCTTTTATCTCGCATTATGACTTCATTGTTTTACCTAAAAGATCACAATAACTTGTATTTCATTACAAGAATTGGGGGCTATTCCGATGTTGGAATACGTCAGAATATATAATAAATGACGTTGGAAAAGACTCTCCCGATGCACATAGTGCCGTCGGAAAGAACATCGGTAGCAGTATGTTGGCTTCGATATTCGCAATGTGCAAACGGGACAACATTGAGAATGCCCTACTCCTGATGCCTTACATGTCAATGGACGATGTATGTCGACAATAG

mRNA sequence

ATGTTTGGTGGAAGCGAAGAGGAAGGTAATCCCTTTCAACCTCCCCAAACGTGGCCGACCAAATCACGATTCCAACATCTAGCCTTCGGCCATTCCTCGCCCACCGTCCGTCACGAGCATTCCTCTCTAGTCGTCCATCACCGGCATTCCTCGCAGCTATCGACCATTCCTCAGCTGACGAAGAATGTGACGGATATAAGTATTTTGTTGAGTGGGAATAGTGAATTTGGAAGTGAGTTACAAGAGGCGTTGATGCAGAAAGACATAGTGGGAAAATTTCGCTGCTTGTTGAGCCTTTATAGCCTCGGGCAAGTTTTTTCAGTGCCAGTGAATGGTGTTGCGCCCACAACAAAAAATAACTCTCAATCAACAGCGTCGGTATCATCAGCTACTCCTTTGCAATCGGAAGAGTATGATTTCTCCTCTTTAACACAAGACTCTCCCGATGCACATAGTGCCGTCGGAAAGAACATCGGTAGCAGTATGTTGGCTTCGATATTCGCAATGTGCAAACGGGACAACATTGAGAATGCCCTACTCCTGATGCCTTACATGTCAATGGACGATGTATGTCGACAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTTGGTGGAAGCGAAGAGGAAGGTAATCCCTTTCAACCTCCCCAAACGTGGCCGACCAAATCACGATTCCAACATCTAGCCTTCGGCCATTCCTCGCCCACCGTCCGTCACGAGCATTCCTCTCTAGTCGTCCATCACCGGCATTCCTCGCAGCTATCGACCATTCCTCAGCTGACGAAGAATGTGACGGATATAAGTATTTTGTTGAGTGGGAATAGTGAATTTGGAAGTGAGTTACAAGAGGCGTTGATGCAGAAAGACATAGTGGGAAAATTTCGCTGCTTGTTGAGCCTTTATAGCCTCGGGCAAGTTTTTTCAGTGCCAGTGAATGGTGTTGCGCCCACAACAAAAAATAACTCTCAATCAACAGCGTCGGTATCATCAGCTACTCCTTTGCAATCGGAAGAGTATGATTTCTCCTCTTTAACACAAGACTCTCCCGATGCACATAGTGCCGTCGGAAAGAACATCGGTAGCAGTATGTTGGCTTCGATATTCGCAATGTGCAAACGGGACAACATTGAGAATGCCCTACTCCTGATGCCTTACATGTCAATGGACGATGTATGTCGACAATAG

Protein sequence

MFGGSEEEGNPFQPPQTWPTKSRFQHLAFGHSSPTVRHEHSSLVVHHRHSSQLSTIPQLTKNVTDISILLSGNSEFGSELQEALMQKDIVGKFRCLLSLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQSEEYDFSSLTQDSPDAHSAVGKNIGSSMLASIFAMCKRDNIENALLLMPYMSMDDVCRQ
Homology
BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: KAA0036779.1 (putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.8e-09
Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLYSLGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 482 SLYSLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 536

BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: XP_008454632.1 (PREDICTED: probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.8e-09
Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLYSLGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 456 SLYSLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 510

BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: TYJ95847.1 (putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.8e-09
Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLYSLGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 554 SLYSLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 608

BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: XP_004150098.1 (ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN59876.1 hypothetical protein Csa_001028 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 6.3e-09
Identity = 42/55 (76.36%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLY+LGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 456 SLYNLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 510

BLAST of MELO3C033218 vs. NCBI nr
Match: XP_031738942.1 (ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 6.3e-09
Identity = 42/55 (76.36%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLY+LGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 405 SLYNLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 459

BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3B9N9 (Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold110G001380 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.4e-09
Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLYSLGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 554 SLYSLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 608

BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T5X5 (Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold20G00650 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.4e-09
Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLYSLGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 482 SLYSLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 536

BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZ67 (probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494997 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.4e-09
Identity = 43/55 (78.18%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLYSLGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 456 SLYSLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 510

BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LIL4 (Arf-GAP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G851770 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 3.0e-09
Identity = 42/55 (76.36%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQS-EEYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLY+LGQV SVPVNGV PT KN SQSTASVSSATP QS +EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 456 SLYNLGQVSSVPVNGVTPTAKNKSQSTASVSSATPSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 510

BLAST of MELO3C033218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FEN5 (probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443384 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.7e-07
Identity = 38/57 (66.67%), Postives = 42/57 (73.68%), Query Frame = 0

Query: 98  SLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQSE---EYDFSSLTQDSPDAH 152
           SLYSL QV SVP NGV PT KN +QS+AS+ SATPLQS+   EYDFSSLTQ     H
Sbjct: 427 SLYSLSQVSSVPANGVTPTAKNKTQSSASIPSATPLQSQSGKEYDFSSLTQGMFSKH 483

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0036779.12.8e-0978.18putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucu... [more]
XP_008454632.12.8e-0978.18PREDICTED: probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isofo... [more]
TYJ95847.12.8e-0978.18putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucu... [more]
XP_004150098.16.3e-0976.36ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis sativ... [more]
XP_031738942.16.3e-0976.36ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X2 [Cucumis sativ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3B9N91.4e-0978.18Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cu... [more]
A0A5A7T5X51.4e-0978.18Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cu... [more]
A0A1S3BZ671.4e-0978.18probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cu... [more]
A0A0A0LIL43.0e-0976.36Arf-GAP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G851770 PE=... [more]
A0A6J1FEN51.7e-0766.67probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 OS=Cucurbita mos... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C033218.1MELO3C033218.1mRNA