MELO3C033158 (gene) Melon (DHL92) v4

Overview


Name	MELO3C033158
Type	gene
Organism	Cucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Description	Unknown protein
Location	chr08: 28437664 .. 28453675 (-)
RNA-Seq Expression	MELO3C033158
Synteny	MELO3C033158

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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mRNA sequence

AAATTTCCATTTTTCTTTTCTTCTTCTCTTTCCCTCCACCGTCAAGTTTCCCTCATCCATTTCTTCACCATTTTCTTTACCATTTCTGCACCAAATTTCAGAGGAGATTTCACAGGGTAGAAGTCTGAGAAAGAAAGAAGAAGAAGTTCAAAGATGTATGTTGAAGAAGACAAGGAGTTTGAAACATAAACTTCTATGTAGTTCACTACGCACATCTCTGGTTTTCTTATTGATTTTAAGCTACACAAACAGAATTAAGAGGTTAATTTTGACAGAGAAGACAGGGCAGATTGTTTTCACGCGAAATCAGAAGATCTCTGGTTTTTTAGTACTTCAAGGTGTACCGGTGGCGTTAGGATCTATATTTGGGACAAGTTAAAGGGGTCGTGGTATACGCGATTGTTGGAGTGGTTTTGTTTCGACGGATATCTGAGTTATACACAGGGAATCAGAATTTCATGTCTTGAGGCCAAGAGGAAATAGATAGGATTTACACATCAGAAAACTAGTCTTAGACTGTAGAGATCGAGTTCCCGGTGCCTAATAGACTACCTTAGGCTTCTGAAGCTTCAATATCGATTGCCAGAGTCATGCCACCACGTACTAGCAGACGACGCAGGCAGAATCAGGACGAGATGCAAGGTCCTACCCAAGGTCAGTCTGTAGGGGAATCTAGTACCCCAAGAGTTCAGGTTAGGGTAAGAAAGGAGCGGTTTGCGAGAACTGCACAGGAGATAGGAAGGCCAGAGAGAGCAGAGCCTAGTGATCTAGAAAAGGCATATGGAATTGAACGGCTGAAGAAGTTAAGGGCTACAGTGTTTAACGGGTTCTATAGATCCAACTGATGTAGAGGATTGGTTGAATATGCTCGAAAAATGTTTTGACGTGATGAATTGTCCTGAGGAATGAATGGTTAGATTGGCCACATTTTTGTTACAGAAGGAGGCTGAAGGATGGTGGAAATCCATATTAGCTAGACACAGTGATACACATACTTTAGGCTGGCAGACATTTTGAGGCATATTTGAAGATAAGTATTATCCCAGCACATACTGCGAGGCCAAGAGGGATGAGTTTCTAGGGTTGAAACAAGGATCACTTTCAGTGGCTAAGTACGAGAGAAAGTATACTGAGCTTTCATGGTATGCTGATGTTGTTGTGGCATCTGAGAGTGACAGGTTCCGAAGGTTTGGAAGAGGGTTGCATTTTGAAATACGTACCCTAGTTACAGCCATTGCTAAGTGGATAGATTTTTCTCAATTAGTAGAGACTGCCCTTCGCGTGGAGCAGAGTATAACATAAGAGAAATCGGCAGTGGAGCTTCGTCATGGGGCTTCAATAGCTAGCAGGTTTAGAGGTCGTGAGCAGCGAAGGTTCACACTTAGGGTAAATATTTCAGGCCGTCAAGAGTTTAAGAGTCGGTCTAGAGGCCAAGCATCGAGGAACATGAGTTATGGTAGTGTTTTTCAGAGACAGAGCCAGAGAATACCTAGTCAATCCACTAGATCGACAGTAAGATCACAGCCAGCTCAAGAGTCCGTTGCTAGTACAGTCAGGCGAACCGCATGCACAAGTTGTGGTAGGAACCATCGGGGTCAGTGTTTAGTGGGTGCCGGTGTGTGTTACCATTGTGAATAGCCAGGACATTTCAAGAAAGATTTCCCGCAGTTGAACATGACAGTTCAGAGAGATCAGGGAGTTGGGTCCCAGACAGTTAAGCAACCGAGAGTTTCAGTGGTTCCAATAAAGGGCCCCAATGGTGCAAGGCAAAATGGAGTTGTTGGAAGACCCATGCAATAGGGAAATGTCTATGCTATGACTCAACAAGAAGCGGAGGATACACCAGACGTTATTACTGGCGATTTAGGTTACTATCTTCAAAAGAAAGGTCGTTTATCTCCATCTAAAGCCTTGAGATTTGCCGTCGATGTCGCTAGAAGTTATGTTTTTCTTATATCTTATTTTAGCATTTATAAATTTATGATACTAATTTCTTTTATAAAATCTCGTATTGAGCTGACACTTTGTAGATCTCTCAACTTTGAGTGACATTTTATGTGAGCCTCAAATGGCTTTCTTATAGTCAAGCATTTTTATATTCTATACTCTTATAACTTATAATACATTTCCTTTCTATTTTCGAACATTCTAGTAATATTTTGTATCCTATCAGGAGACTTAATCTTCTATATTGTAACTTTATGTAAGTCTTTTTATTATCAGGGGAATGAAGTATCTTCAAGAATGCAAACCAGATCAAATTATTCACTATGGTCTAAAGCCAAAGTAAGGCAACCATATTCAAAAAAATATTTTGCTAGATAATGGAGGACAACTTAAAGTCGTTACCTATGGTTATCAGGGGATTTCAAGACTGAAAGAGGCCGTGACAGGAGATCCGAAAACCTGAACATAAGCAAGGATGTGGATGGAGGATGGTGATGTGGCTTCAGGCCTAGCTTAACCCGTGGTGGGTGGCTCTATGTGCATATAGAAGCAGATATGGATGTTGTTACTATGGTAGAGATCAAATGTTGCCCCCTCTCGGACCACCTGCTGTCTTAGACCCGAAAGACGGTGTGAAGCCAACAGACATCGTCTCCTTTAACGATCCCTGCTGACCCTACTGAACGTTAAGCCCGATAAACATACCAATCTTAGATATAGAATATTCAACATAGAACACCACACAGAGGAAACCACGAAAACTTTCCCAACATACATAAGATGCAGCCCTGACATCACTTGGTTTGTAAAATAACCTGATATAAACATCACGACCAAAACCTATACAACTAGAGTTTTATAACCATGACCTCCAGGACGATATTATTTAAACCTTACAAAACATTTCAACAATGACAGACTCAAATTACAACTCCAACCAGAGTTTGATTCGGAACTTTCAGCAGACGTTGGCAGTGTATCAGGCACCGGGAGCTCAATCTCTACCTGAAAAGTGGGAAACATTTTGAAAAGAATGAGCTACGAG

Coding sequence (CDS)

AATTTCCATTTTTCTTTTCTTCTTCTCTTTCCCTCCACCGTCAAGTTTCCCTCATCCATTTCTTCACCATTTTCTTTACCATTTCTGCACCAAATTTCAGAGGAGATTTCACAGGGTAGAAGTCTGAGAAAGAAAGAAGAAGAAGTTCAAAGATGTATGTTGAAGAAGACAAGGAGTTTGAAACATAAACTTCTATGTAGTTCACTACGCACATCTCTGGTTTTCTTATTGATTTTAAGCTACACAAACAGAATTAAGAGGTTAATTTTGACAGAGAAGACAGGGCAGATTGTTTTCACGCGAAATCAGAAGATCTCTGGTTTTTTAGTACTTCAAGGTGTACCGGTGGCGTTAGGATCTATATTTGGGACAAGTTAA

Protein sequence

NFHFSFLLLFPSTVKFPSSISSPFSLPFLHQISEEISQGRSLRKKEEEVQRCMLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKRLILTEKTGQIVFTRNQKISGFLVLQGVPVALGSIFGTS

Homology

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. NCBI nr
Match: KAA0065537.1 (putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 2.1e-37
Identity = 90/90 (100.00%), Postives = 90/90 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 34  EEISQGRSLRKKEEEVQRCMLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKRLILTEK 93
           EEISQGRSLRKKEEEVQRCMLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKRLILTEK
Sbjct: 189 EEISQGRSLRKKEEEVQRCMLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKRLILTEK 248

Query: 94  TGQIVFTRNQKISGFLVLQGVPVALGSIFG 124
           TGQIVFTRNQKISGFLVLQGVPVALGSIFG
Sbjct: 249 TGQIVFTRNQKISGFLVLQGVPVALGSIFG 278

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. NCBI nr
Match: XP_016903349.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 5.0e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. NCBI nr
Match: XP_016903351.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X3 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 5.0e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. NCBI nr
Match: XP_016903350.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 5.0e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. NCBI nr
Match: XP_016903352.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X4 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 5.0e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VEM3 (Putative Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold638G00410 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 1.0e-37
Identity = 90/90 (100.00%), Postives = 90/90 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 34  EEISQGRSLRKKEEEVQRCMLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKRLILTEK 93
           EEISQGRSLRKKEEEVQRCMLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKRLILTEK
Sbjct: 189 EEISQGRSLRKKEEEVQRCMLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKRLILTEK 248

Query: 94  TGQIVFTRNQKISGFLVLQGVPVALGSIFG 124
           TGQIVFTRNQKISGFLVLQGVPVALGSIFG
Sbjct: 249 TGQIVFTRNQKISGFLVLQGVPVALGSIFG 278

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5U6 (uncharacterized protein LOC107992139 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC107992139 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.4e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E554 (uncharacterized protein LOC107992139 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC107992139 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.4e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E542 (uncharacterized protein LOC107992139 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC107992139 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.4e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

[Close]

BLAST of MELO3C033158 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E544 (uncharacterized protein LOC107992139 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC107992139 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.4e-07
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 53 MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 88
          MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR
Sbjct: 1  MLKKTRSLKHKLLCSSLRTSLVFLLILSYTNRIKR 35

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of MELO3C033158 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAA0065537.1	2.1e-37	100.00	putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
XP_016903349.1	5.0e-07	100.00	PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X1 [Cucumis melo]	[more]
XP_016903351.1	5.0e-07	100.00	PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X3 [Cucumis melo]	[more]
XP_016903350.1	5.0e-07	100.00	PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X2 [Cucumis melo]	[more]
XP_016903352.1	5.0e-07	100.00	PREDICTED: uncharacterized protein LOC107992139 isoform X4 [Cucumis melo]	[more]

BLAST of MELO3C033158 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MELO3C033158 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5A7VEM3	1.0e-37	100.00	Putative Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27...	[more]
A0A1S4E5U6	2.4e-07	100.00	uncharacterized protein LOC107992139 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]
A0A1S4E554	2.4e-07	100.00	uncharacterized protein LOC107992139 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]
A0A1S4E542	2.4e-07	100.00	uncharacterized protein LOC107992139 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]
A0A1S4E544	2.4e-07	100.00	uncharacterized protein LOC107992139 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]

BLAST of MELO3C033158 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
MELO3C033158.1	MELO3C033158.1	mRNA