MELO3C031967.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41

Overview
NameMELO3C031967.jh1
Typegene
OrganismCucumis melo var. reticulatus cv. Harukei-3 (Melon (Harukei-3) v1.41)
DescriptionUnknown protein
Locationchr06: 11701304 .. 11706068 (+)
RNA-Seq ExpressionMELO3C031967.jh1
SyntenyMELO3C031967.jh1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCAAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGCTATTGATCCCAATAAGGTTCTCTTTCTTTTCTCTCAATTCATTTTAAGGAAGTCTTTTGAGGTAGAAAGAGGGAGCATAGTGAGATTTGGTCTTTGGTTAGGTTTCTCGTCACCCTTTAGGGTGTTTTGGTGGCATGTTTTCTTTTTGTATGTCTTTTTATTCTTTCACTTTTTTCCAATGAAAGTCGTTGATATCATAAAAAAAAATCACAAAGAAAACGGTCGTGCAGACTAGGTAACAATTGTTTTTGTCGAGCTTGATTGAATGTAGATAACTGTATATCCTTCACATAAGCATAATTTGTCGAGGTTGATTGAAAGTACACATACAATTTCTAGCTTCTTCAGACGATACAAAGATATGGTGTACATATCATTCAGGAAAGAAATTCTGTGTATTATATTCATGTGTTTATTCAAGATATTTCTAAAGGTTTATTTATGACTAATAATTGTTCTCATATACCAAGTGACTTGAAATTGGACATTCATTTTCTTTGCTTGGGTTGTCATTTCAGATTTTCTGTAGTTTTAAAAAGATAGTTATTAATTAAGTGTTGAATAAAATGCATTAATCTTTAAGTTCATATGTTAGACTTCTGTTACAATATAAATGAAGATTCATACTTGATGAGCAAATACAGGACATGCTTTGGTGATATCTACTGGAACTCTATTGAAGAAAATAGCTTATGAGCATAATATAGCAGATGCACAGTCTTAGTATATTAGGTGTTGTTATGATATGTGGTGCCTTTAGGCAACTTGTAGGAAGCCATTTTTACTACGAATCGTGATATTACACAGGTAATCTTCAACCCTCTTCAGTTTTACTCATTCTTAAAGCCAACAATGAAAAATGTACTTCAGATAACCATTATGTTCTTTCCATTCTCCTCTTTATTGCTAGCCTAATTTACCTTCACCTATCACCTCATCCTCATTTCTGCAAATTTTTTAAAGTTCCTCATTTTTGCTCCTTAACGTTCTTCAGTTTTATTTGAAATATAAATAAAGATTATCTTATTCAAAAACATTTCTAACTCGTAATTACATTTTTGTATATTTGAATGTATCCAATAATAGATGCTTAAAATTCAATCAATGGTTAAAAGCATAGTTTTTATCTAAGGTTGAGACAGTGGCACAATTTAGTGTTGTATTTCTTATATTTGCTCTAGGACTGGAGTTTTCTTTGACAAAGGTACACTTTTTAATTGGGAGTTTTATTTCTTTACTTAATGAATGTGTTAAAATTTTCCTTATGAGTTAAATACCTAGACTTATAGATAATTTTCTCTGCAATTAAAAGTTGTGGGAGCTTTGACTGTTTTTTGAGGTTTTCTACGGATCATCATATTTATGTTCTTGATTTTTACTGTTGTTATAGGTCATTCTTCTAGTAGTGTCTCCATATAAATTTTTAGTTTTGGCTTCTGCATAGAAAATTTTGTATTGATGATAGTTATTAATCCTATTGATTTAAAACTAGATATGTGCCTATGATTTATATGTGTTTTTTTAAAGGATATGGTATTGTTCGTGTTGAATTTATCACTAAAAAACGTTTGCTGTAAGAGACAAAGTAAGAAATTGTTATTACATCAAGTTTTGGAAATATCTCCTATCTTTCATTTATATTTGTTGTTTAATTTCAAGTTTAGAAAAAAGTAACAACTTGATCTACTTTTAAGAGTTTTGATTTTTTTTTTTTAGAATTAAAAGTTTTGATTTAGTACTTATAGTTTGGTTAAATTTTCAATGTCGACTCTATGGTTTGAATTTAATTTTAAGTCTCTATGATCTAAAATTTCATTTTTTGTATTCCATAATTTAGTATGTGGTTTTTTTTTCACTGTTACTGAGGTGGTTATTGAAGGCTTAAAAATTTGAGGAAAAATTGAGATTCTCTATAGGATAGAAATAATATTGTGATCCAGAAGTTACGGGGTTGAAAATGATATGTCTGATTTTTATGGATTGTGTTCTTTAATTATTGGGTAAGTCAAGATTTTTAGGTTTAGTTTGGTCCTTGGAACTATTTTCTTTTCTGACTTCACTATGTGAATGACTTTTTAAAATGAAAATATGATTGTTGTTGTAAGTTCTTATTACCTTCTCTATCATTAAATTGGCCTCTCTATATATAAATGCATGTATTATTAAAAGTAGTATGCTGTTATCTTTATATACAATGGTACTTTTGAGCAAAGAAACTTTGACGCTTGGATCTGGTTATATCCTAATGATAGTAGTAGTTGGTAATATATTTTTCCAGGTCATTTTCTACTAGAGGAGGATGATAAGTTTCTAAATAAGGTTTGAGCTACAGTTCAGGAAGAGGAACGTCAAGCCCTTGCTGCAGCTGATATAGATGCTGTCAAGGATGCCATTGCTACTATTGAGGTCTCTAGGAAGACTATTCCAACTTACCCTGAATCAAGGAATCCAATATTTAAGTCTCTATCAACTATGGTTAGTGGAATGGCGAATCATCCCTTCATTTGGTGCCTTTTCATTATGGCTCTTTGGCGTAAATTTTTCTAACTTTTAACTTGACAAGGCGGATGTGTGTTTCTAAGAGAATCATTGCCGATCTGTATAAAATGAGTGTGTGCTATTAATAATGTAGGAAGGAAGTTGCATTACGTCAGAGAGAGGTAGTTACAACATCAAATACGTAACATTTATGATCGTGAACATAAGGAAGGTTAGCTCTCACCATTGAAATAATTAGTGCATTGAAGTTGCTAAGATGCCATATTTTTTTGCAACTTTTATCAATGGATGGAACTATAAAGATCCTGAAAACTCCTTAGTAAGTAACATCATCTCTCAACACTCCTTGTAAAATTGATGTATGCATTCTTCAAATGATTTAGATTGTGTTGAGAAATGATGGATGATTAATAATGTGAACAAGTTCATTGGATTCAAAAGCATATATTCATCAATGTGTGACATTCAAGAAAATTGCGGACTTTGCTATATGTGATATTTGCTAAAATAGCATTCTGGACAATAGTAGCTGGAATTTTTTATTTGATTACGGATGAGTACAAATCATTACTCGTAAGCTTTCTTTTTCATTTGTTATGTTTTGAAGATTTGAATGAAGGCTACCTAAATAGTCTTTCCATTATTCTTTCTTGTGGTGGGTGGTCCTCCAAGTTATTTATAAGTTAGAAATTTTGTTTTAGTTTAAGAAAAAGTTACAGAACTTATATATTCATCTTGAATTAGGACAAAATAGTAAGGCTTTTTTTTTTTTAATTTTATTGACCACCTCTTGCAGGGCCTGTTATCGAACAATTTTTTTTATTTTTAAATTAACTTCAAGTTCTGCTACTTTTTGTTTTTTAAAATTTTAAAATTTCTTTTTTGATATTTTTATACATTCGTAAAAAGTATATTATAAAAAGTTTATCAAACACCTTTTGTAGGGCCTATTAACGAGCATGGTTCTTCAAGTAGGCAATCTGATGCTAAAGCTTAAGCTCATAACGACTTAGTTTAAGGTAAAAGGATTGGACATGACACATAACATAGCTGAGACTTGAGATTCTTCATATTATCTTTGCGTTTAATTTGAACTTTTTAGAATATTTTCTTTTGGGAGAGTATGTCTTCTCTTTACGTCTAGTTTTAGGAATGTTGCATTTCTTTCATAGTAATGAGTAATGGTTTATTAATTGATGATGATGTTGGATATTGATTATGCCCGTCTTTCCTCTCTTAATTATTGCAGTTTTTCTTCCCATATTTTCTTGTCCAAAGATCACCATTTGTGCATCCAATTGCAGTTCTTCAGCTAATTTGGTTTCTGTAGGTTTTGGTTTCCATTAATATTTTAATTCTGCATTGCTAAATGCAATATATCACTCTTCATAAAAAAATTTGAAGAACTTATCAAGAAAGCTATGTTTTCCTCTCCCTTTCTCATACCCAATTGTTGATAACCTTGGCTTTTTCCTTTTCATTTTCATGTTTTGTAGCTATTTACCCAAGGCATACTGGAAATGTTTTTCATGTAATAGCCAATAGGATGCCATATTTATTATTTATTCACAAAGTTCATTTGTTGTTTGCAGTCTGTTGCCACATTTTTCAATCAGGTTATGGTAGCAATAGGAGAAAATACCGTGGGCCCTGGTGTGGTGTTTTTTTTTTTTAAGATTTTAAATAAAAATCTTTGTGATAATGTGGTTTGCTTTGAACCTTTTTTTTTTCAAATAAGCTGGATTCTGTTTTTTACATTTTTGTTTTGTTTGTGATATGTGTATTGAATTATGCAGGTTTTGGTTGCGAGGAGTTGCAATGGTATATTTGTATATATTTTTTACTTCAGTAGAGGTAGCTTGACATTGAGTTTAGGGAATCTGCTAATGAACAGGGACGGAGGTAATGGAATTTTCTAAAGTTAATATATTTCTTGTAGTACTTGTTAGAATTCTAAAGATTAAATGGTTTATTTTGATATTGTTTGTAGAATGATTGAAGTCATATCGGGTTGAAAGCTAAGCCACTGTGTAGATAGCCAGACGATCGTTGAAGGTTGAAGACTGAGAAAGCATTTAGGATTTCTTATTTAAATCTTGTATTAGGATCTTTTTTCATGTACTGTTGTAGAATGTATATATAAATACAATATTAAGATTTCATTTTGTGTATGCAAATGTAAAAGACAAATATTAAAGTTTCTAAAATAATATTAATTTTATTGA

mRNA sequence

ATGGCAAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGCTATTGATCCCAATAAGACGATACAAAGATATGGTGTACATATCATTCAGGAAAGAAATTCTGTGTATTATATTCATGTGTTTATTCAAGATATTTCTAAAGGTCATTTTCTACTAGAGGAGGATGATAAGTTTCTAAATAAGGTTTGAGCTACAGTTCAGGAAGAGGAACGTCAAGCCCTTGCTGCAGCTGATATAGATGCTGTCAAGGATGCCATTGCTACTATTGAGGTCTCTAGGAAGACTATTCCAACTTACCCTGAATCAAGGAATCCAATATTTAAGTCTCTATCAACTATGGAAGGAAGTTGCATTACGTCAGAGAGAGGTAGTTACAACATCAAATACGTAACATTTATGATCGTGAACATAAGGAAGCTATTTACCCAAGGCATACTGGAAATGTTTTTCATGTTTTGGTTGCGAGGAGTTGCAATGCTTGACATTGAGTTTAGGGAATCTGCTAATGAACAGGGACGGAGAATGATTGAAGTCATATCGGGTTGAAAGCTAAGCCACTGTGTAGATAGCCAGACGATCGTTGAAGGTTGAAGACTGAGAAAGCATTTAGGATTTCTTATTTAAATCTTGTATTAGGATCTTTTTTCATGTACTGTTGTAGAATGTATATATAAATACAATATTAAGATTTCATTTTGTGTATGCAAATGTAAAAGACAAATATTAAAGTTTCTAAAATAATATTAATTTTATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGGAAGTTGCATTACGTCAGAGAGAGGTAGTTACAACATCAAATACGTAACATTTATGATCGTGAACATAAGGAAGCTATTTACCCAAGGCATACTGGAAATGTTTTTCATGTTTTGGTTGCGAGGAGTTGCAATGCTTGACATTGAGTTTAGGGAATCTGCTAATGAACAGGGACGGAGAATGATTGAAGTCATATCGGGTTGA

Protein sequence

MEGSCITSERGSYNIKYVTFMIVNIRKLFTQGILEMFFMFWLRGVAMLDIEFRESANEQGRRMIEVISG
Homology
[Close]
BLAST of MELO3C031967.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAA0037113.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold379G00140 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK13963.1 hypothetical protein E5676_scaffold832G001670 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 6.52e-09
Identity = 27/27 (100.00%), Postives = 27/27 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEGSCITSERGSYNIKYVTFMIVNIRK 27
          MEGSCITSERGSYNIKYVTFMIVNIRK
Sbjct: 70 MEGSCITSERGSYNIKYVTFMIVNIRK 96

[Close]
BLAST of MELO3C031967.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CQ23 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold832G001670 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 3.16e-09
Identity = 27/27 (100.00%), Postives = 27/27 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEGSCITSERGSYNIKYVTFMIVNIRK 27
          MEGSCITSERGSYNIKYVTFMIVNIRK
Sbjct: 70 MEGSCITSERGSYNIKYVTFMIVNIRK 96

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C031967.jh1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0037113.16.52e-09100.00hypothetical protein E6C27_scaffold379G00140 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK1396... [more]
BLAST of MELO3C031967.jh1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C031967.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3CQ233.16e-09100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
BLAST of MELO3C031967.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C031967.jh1.t1MELO3C031967.jh1.t1mRNA