MELO3C030296 (gene) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C030296
Typegene
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionATP synthase subunit a-like
Locationchr03: 24253197 .. 24257385 (-)
RNA-Seq ExpressionMELO3C030296
SyntenyMELO3C030296
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TCTTATATTTGACGTTTCTTATATAAAAAAATATTACAAACTTCTTTTGACATTGTTATGCGTGACGTCAGGACAAGTCTGTAATTTTTCTATTAAATTACCATATATCGACGTTGCCTTATGTTGAGTTAGGCTTGCTAACCTTTTCCGATAGAGCTCCTACATAGGAAAGTACATATTTTCTTGTAGTGTATGTTTGTAAATCTTTTGACCCTAAAAGTTATATAATTAGTTTGTGTCCTTTTATTTGAGGGGTCGTTTGGTGGAAGGGTTGGATTATGGAGGGATAACATGTGTTTGGAGGAAGAGTTTAGAAAGATAGTTTTATGGGAGAGTTGAAAAGATAGGGTTATTAGGAATTGAAAAAGGTTTAAAAAGGAGAGAGAAGGAAGAAAGGTTATGATAACCCTAAAACAACGTTTATGATCTTTTCCCCAAACACGGGTTGGGTTACTATAATTCTGATGGAAAGCATACCAGTGCAACGGAAGAAAAGATCGAGATTTTACTTTGGATGCATCTAAACTAATTTAGATGTTAACATGCTTAAGACAAAAATGCCTTAATTACATTATTCAGGGTTAAGATAAAACACTTAGGGCCCGTTTGGGGTTAGGGTTGGGACTGTGGGCTTAGGTTAGCCCAACCCTAACCCCTGTTTGGGCCAATTTCGTCTGCCCCTTAATTCGGCGATACGTCTATTCCCCATTTCGTTAACCCGGTTTTGGCGTTCCTCTCAATCCCGCGATACATCTCTTTAATTTTCGTGTTGAACCCGTGTTAAATCTTCTTCTGTGTTCTCCCTTAAGGAATTGAGCTCTCCTTTTTTCGTTTCGTCTTCTCCCTCATTAAATCAATTTCGAGTTTTTATTCTTTCGTTCTGTCTTCTCTGTAATGAAATCAGCTTCTCCTTCTATCGTTTTATGTTCTCCCTCAATCCATCTGCATGCAAAATCGATGGATCCTAACTCGCATTTTGTCGATATTTTCTTCATTCATTCGTCCGTTGCGTTTTCGCGATGAAATCCGATTTCGTGACGCCGAATCTTTATCTGCATCTCTCTCATCCATCTCTCTCACTCCCGAAAGGTTTTTCGTGTTTGTTGAAGCCGACTGTTCGACATCGTTGGCTCTAAACACGATTTCCTTTTGGAATCTAGGGTTTTGCCTCCATAGTCATTTTATTGAAGGTGACCCTGTAATTTACTCCTTGCCGCTCGCGGTTCTATTGTTGCGGCTGGGTGTTTCGCTTGCCATTTGGTCATTCCCTTCACTGATAAGACAAAAACTTCACACCGTTGTCTGCCATTGGATGTCGACGGAGCTTGGTAGGGAGGTATTTGAGTCTTGAATCCAATTTTTTTTAGCCAATGATGAGTTTCCATTTTCAATTCAAACTTATTTCTTTTGGAATTTTGGTATTTGTTTGCATTTTGTTCTGTGTTGATTGAAATAATTTAGCACTCGTGTTTTTCATATATGTATGTAAACGGGTTATCCATGCTTTTGCGGCCTTCCATTCTATCTTATTGCTTTAGCTTTACATTGTTGTACCTTCTTTTGGCCTTCCATTCTATCTTCTTGCTTTACATTTTACATTGTTTTGATAACATTTGCTTACCTTTTACATTGGTTTACATTGCTGCATTGTTTTCATACCACGGGTCTTGCCTCATTTCGTATTCACAACATTTGTTTGAAGTTCTTTACACACTTTTCTTCCATAGTATTGTTCATTCCATCCTTTGGGTTCAAAATTATATGGCTGCATACTATTGTCTCTTCCATCTGTTTACATTGTATGCTTTCTTGTTTATTTTTTGGCTTGCCTCCATTAAAGCCCTCCCAACTTGCCCCATCTTTTTCCTATATATAACCATGTTTCCTATTTTCATTCACTCCATTGTTGTCTCTGTTTGTATCTTCTCTTTTGTAAGTTATCTTTTTTTTTTTTTAATTCTGTTCATTTAATCTGCCTTAATTTTTTGCTAATTCTTCATTTTTTTTTGTCGATTCTTCATTTAAGTTACCATATATGTTTCATATTTGGTTTTGTTATATGTTTGTGTTCTTCTTTTGTTATATGTTTGTGTCCTCCTTTTGCTATATGTTTGTGTCCTTTTGTTATATGTTTTTGTCCTCTGCTATATGTTTGTGTCCTCCTTTTGCTATACGATTGTGTCCTCCTTTTGCTATACATTTGTGTCCTCTTTTTGCTATACGTTTGTGTCCTCCTTTTGCTATACGTTTCTGTCCTCATTTTGCTATACGTTTCTGTCCTCATTTTGCTATATGTTTCTCTCCTTCTTTGTCTGTTATCGTTTCATGTTTACTTCTTTATTTTTTATGTGTCCACTACGATGGAATTCTATTCATTATTTTGAATGGTTTCAGAACTCTGAGGCTACGAATTAAATGTTGATTTCGGGTAATATTTGTCGTCATATAAGGTATGTATATGTAATATTCTTTTATTTTTTTACCTTTTATATCGTGTCTTATGTACAAATATTAACCATGTTTTTTGTCTTATGTAGAACATCGCGATTAACCATGTTTTTTTTAAATATTGTTCGGTTTATAATGTGTATATACAAATAAATGTAATGATCAACGTTGGAAGTGTTTCGAGGTGGGCATGATAGAAGTTCATTGTATTTGACCTTTACGTACATCGCACTTATTTCAGCGTGTTTATTTGAACCTGCAGAATTGCCTTGGCGCGTTAGACGAAACGTACATAAAGGTCAACGTCCCCGCAGAAGATCGGCCTACATTTAGAACACGTAAGGGGGGAATTGCCACAAACGTTCTGGGGGTGTGTGACACGAAAGGGGATTTCGTTTATGTCCTCGCCGGTTGGGAAGGATCTGCAGCAGACTCGTGGATCCTACGTGATGCCCTTTCACGAGAAAATGGGCTACAAGTGCCAAAGGGTATATCTTATTTATAATAAAACATCGTCGCTTCCTACTTACCTATTCAAAGCGCTTAAACAAATGATTAAATAACAAGATATTATTATCTGTGCGATGCGGGTTATCTAAACGCGGAGGGGTATATCTCCCCGTATAGAGGCCAGCGGTACCATTTGCAAGAGTGGCGTGGTGCTGTAAATGCGCCAACAAATCCAAAGGAGTACTTCAACATGAAGCACTCCTTGGCAAGGAATGTCATTGAGCGCGCGTTCGGTGTTCTTAAGGGTCGTTGGGCCATTCTTCGTGGGAAGTTGTACTATCATCTGCAAGTCCAGTGTCGCACCATACTAGCATGTGTCTTGCTTCACAATTTGATCAACAAGGAAATGATATATTGCGAGGACGTTGACGACGTGGACGAGGGGGACTCAACGTACGCGATGAGCACCGCTTCGGAAGACATTCACTACATTGAGACAACAAACGAGTGGTCTCAGTGGCGTGACTAACTAGTCGAATCGATGTTCACTGATTGGTAGTTGTGTAACGCTTAGATAAGACAATTTTACATTACAAGTCATCGATTGTAATGTTGAATTTCTATCATGTGTAAAATGTACTGTAAAAAGTAATTTCGGGTGTTGCATATGAAATGTACGTGTACCTTTTGTTATTAACTGTTAAATGTGAAATTGTGAAATTATTAACGTACTCCATGTATTTTTTATAATTTGTCATTCTCAGTATGTCAACCTCAAATCGTGTCCCGAGACATGTCTGGACGAAGGAGGAGGGCACTCTTGTGGAATTTTTAATGGAGTTGGTGTCAATGAGGGGATGGAAATCAGATAATGGTACGTTCCGCCCAGGTTACCTTGCGCAGTTGGTACGCATGATGGTGGAGAAACTATCTGGTTGAGCAACGACTGTAATTGATTGTAGAATTAAGACACTGAAGCGAACATTCCAGGCCATTGTCGAAATGCGGGGGCGAACGAGCAGTGGCTTTGGATGGAACGATGAAGAGAAATGTATCATTGCAGAGAAAGAATTATTTGATAATTGGGTTAAGTTAAATATAATAATATAAACGTCATACAACGTTCACAATGTACATTTACTTAATAATTTTTCAATCAGTAATTATACGTGATATTTTTTTCCCCGCAGTCGCATCCTGCAGCGAAGGGACTCCTGAACAGACCATCCCGTATTACGACGAACTTACATATGTCTTCGGTCGCGATAGGGCGACGGGTCGGTTCGCCTAG

mRNA sequence

TCTTATATTTGACGTTTCTTATATAAAAAAATATTACAAACTTCTTTTGACATTGTTATGCGTGACGTCAGGACAAGTCTGTAATTTTTCTATTAAATTACCATATATCGACGTTGCCTTATGTTGAGTTAGGCTTGCTAACCTTTTCCGATAGAGCTCCTACATAGGAAAGTACATATTTTCTTGTAGTGTATGTTTGTAAATCTTTTGACCCTAAAAGTTATATAATTAGTTTGTGTCCTTTTATTTGAGGGGTCGTTTGGTGGAAGGGTTGGATTATGGAGGGATAACATGTGTTTGGAGGAAGAGTTTAGAAAGATAGTTTTATGGGAGAGTTGAAAAGATAGGGTTATTAGGAATTGAAAAAGGTTTAAAAAGGAGAGAGAAGGAAGAAAGGTTATGATAACCCTAAAACAACGTTTATGATCTTTTCCCCAAACACGGGTTGGGTTACTATAATTCTGATGGAAAGCATACCAGTGCAACGGAAGAAAAGATCGAGATTTTACTTTGGATGCATCTAAACTAATTTAGATGTTAACATGCTTAAGACAAAAATGCCTTAATTACATTATTCAGGGTTAAGATAAAACACTTAGGGCCCGTTTGGGGTTAGGGTTGGGACTGTGGGCTTAGGTTAGCCCAACCCTAACCCCTGTTTGGGCCAATTTCGTCTGCCCCTTAATTCGGCGATACGTCTATTCCCCATTTCGTTAACCCGGTTTTGGCGTTCCTCTCAATCCCGCGATACATCTCTTTAATTTTCGTGTTGAACCCGTGTTAAATCTTCTTCTGTGTTCTCCCTTAAGGAATTGAGCTCTCCTTTTTTCGTTTCGTCTTCTCCCTCATTAAATCAATTTCGAGTTTTTATTCTTTCGTTCTGTCTTCTCTGTAATGAAATCAGCTTCTCCTTCTATCGTTTTATGTTCTCCCTCAATCCATCTGCATGCAAAATCGATGGATCCTAACTCGCATTTTGTCGATATTTTCTTCATTCATTCGTCCGTTGCGTTTTCGCGATGAAATCCGATTTCGTGACGCCGAATCTTTATCTGCATCTCTCTCATCCATCTCTCTCACTCCCGAAAGGTTTTTCGTGTTTGTTGAAGCCGACTGTTCGACATCGTTGGCTCTAAACACGATTTCCTTTTGGAATCTAGGGTTTTGCCTCCATAGTCATTTTATTGAAGGTGACCCTGTAATTTACTCCTTGCCGCTCGCGGTTCTATTGTTGCGGCTGGGTGTTTCGCTTGCCATTTGGTCATTCCCTTCACTGATAAGACAAAAACTTCACACCGTTGTCTGCCATTGGATGTCGACGGAGCTTGGTAGGGAGGTATTTGAGTCTTGAATCCAATTTTTTTTAGCCAATGATGAGTTTCCATTTTCAATTCAAACTTATTTCTTTTGGAATTTTGGTATTTGTTTGCATTTTGTTCTGTGTTGATTGAAATAATTTAGCACTCGTGTTTTTCATATATGTATGTAAACGGGTTATCCATGCTTTTGCGGCCTTCCATTCTATCTTATTGCTTTAGCTTTACATTGTTGTACCTTCTTTTGGCCTTCCATTCTATCTTCTTGCTTTACATTTTACATTGTTTTGATAACATTTGCTTACCTTTTACATTGGTTTACATTGCTGCATTGTTTTCATACCACGGGTCTTGCCTCATTTCGTATTCACAACATTTGTTTGAAGTTCTTTACACACTTTTCTTCCATAGTATTGTTCATTCCATCCTTTGGGTTCAAAATTATATGGCTGCATACTATTGTCTCTTCCATCTGTTTACATTGTATGCTTTCTTGTTTATTTTTTGGCTTGCCTCCATTAAAGCCCTCCCAACTTGCCCCATCTTTTTCCTATATATAACCATGTTTCCTATTTTCATTCACTCCATTGTTGTCTCTGTTTGTATCTTCTCTTTTGTAAGTTATCTTTTTTTTTTTTTAATTCTGTTCATTTAATCTGCCTTAATTTTTTGCTAATTCTTCATTTTTTTTTGTCGATTCTTCATTTAAGTTACCATATATGTTTCATATTTGGTTTTGTTATATGTTTGTGTTCTTCTTTTGTTATATGTTTGTGTCCTCCTTTTGCTATATGTTTGTGTCCTTTTGTTATATGTTTTTGTCCTCTGCTATATGTTTGTGTCCTCCTTTTGCTATACGATTGTGTCCTCCTTTTGCTATACATTTGTGTCCTCTTTTTGCTATACGTTTGTGTCCTCCTTTTGCTATACGTTTCTGTCCTCATTTTGCTATACGTTTCTGTCCTCATTTTGCTATATGTTTCTCTCCTTCTTTGTCTGTTATCGTTTCATGTTTACTTCTTTATTTTTTATGTGTCCACTACGATGGAATTCTATTCATTATTTTGAATGGTTTCAGAACTCTGAGGCTACGAATTAAATGTTGATTTCGGGTAATATTTGTCGTCATATAAGTATGTCAACCTCAAATCGTGTCCCGAGACATGTCTGGACGAAGGAGGAGGGCACTCTTGTGGAATTTTTAATGGAGTTGGTGTCAATGAGGGGATGGAAATCAGATAATGGTACGTTCCGCCCAGTCGCATCCTGCAGCGAAGGGACTCCTGAACAGACCATCCCGTATTACGACGAACTTACATATGTCTTCGGTCGCGATAGGGCGACGGGTCGGTTCGCCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTATGTAAACGGGTTATCCATGCTTTTGCGGCCTTCCATTCTATCTTATTGCTTTAGCTTTACATTGTTGTACCTTCTTTTGGCCTTCCATTCTATCTTCTTGCTTTACATTTTACATTGTTTTGATAACATTTGCTTACCTTTTACATTGGTTTACATTGCTGCATTGTTTTCATACCACGGGTCTTGCCTCATTTCGTATTCACAACATTTGTTTGAAGTTCTTTACACACTTTTCTTCCATAGTATTGTTCATTCCATCCTTTGGGTTCAAAATTATATGGCTGCATACTATTGTCTCTTCCATCTGTTTACATTGTATGCTTTCTTGTTTATTTTTTGGCTTGCCTCCATTAAAGCCCTCCCAACTTGCCCCATCTTTTTCCTATATATAACCATGTTTCCTATTTTCATTCACTCCATTGTTGTCTCTGTTTGTATCTTCTCTTTTGTAAGTTATCTTTTTTTTTTTTTAATTCTGTTCATTTAA

Protein sequence

MYVNGLSMLLRPSILSYCFSFTLLYLLLAFHSIFLLYILHCFDNICLPFTLVYIAALFSYHGSCLISYSQHLFEVLYTLFFHSIVHSILWVQNYMAAYYCLFHLFTLYAFLFIFWLASIKALPTCPIFFLYITMFPIFIHSIVVSVCIFSFVSYLFFFLILFI
Homology
[Close]
BLAST of MELO3C030296 vs. NCBI nr
Match: XP_008445357.1 (PREDICTED: ATP synthase subunit a-like [Cucumis melo] >XP_008445358.1 PREDICTED: ATP synthase subunit a-like [Cucumis melo] >XP_016899949.1 PREDICTED: ATP synthase subunit a-like [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 8.6e-76
Identity = 158/158 (100.00%), Postives = 158/158 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MYVNGLSMLLRPSILSYCFSFTLLYLLLAFHSIFLLYILHCFDNICLPFTLVYIAALFSY 60
           MYVNGLSMLLRPSILSYCFSFTLLYLLLAFHSIFLLYILHCFDNICLPFTLVYIAALFSY
Sbjct: 1   MYVNGLSMLLRPSILSYCFSFTLLYLLLAFHSIFLLYILHCFDNICLPFTLVYIAALFSY 60

Query: 61  HGSCLISYSQHLFEVLYTLFFHSIVHSILWVQNYMAAYYCLFHLFTLYAFLFIFWLASIK 120
           HGSCLISYSQHLFEVLYTLFFHSIVHSILWVQNYMAAYYCLFHLFTLYAFLFIFWLASIK
Sbjct: 61  HGSCLISYSQHLFEVLYTLFFHSIVHSILWVQNYMAAYYCLFHLFTLYAFLFIFWLASIK 120

Query: 121 ALPTCPIFFLYITMFPIFIHSIVVSVCIFSFVSYLFFF 159
           ALPTCPIFFLYITMFPIFIHSIVVSVCIFSFVSYLFFF
Sbjct: 121 ALPTCPIFFLYITMFPIFIHSIVVSVCIFSFVSYLFFF 158

[Close]
BLAST of MELO3C030296 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BC16 (ATP synthase subunit a-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488415 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 4.2e-76
Identity = 158/158 (100.00%), Postives = 158/158 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MYVNGLSMLLRPSILSYCFSFTLLYLLLAFHSIFLLYILHCFDNICLPFTLVYIAALFSY 60
           MYVNGLSMLLRPSILSYCFSFTLLYLLLAFHSIFLLYILHCFDNICLPFTLVYIAALFSY
Sbjct: 1   MYVNGLSMLLRPSILSYCFSFTLLYLLLAFHSIFLLYILHCFDNICLPFTLVYIAALFSY 60

Query: 61  HGSCLISYSQHLFEVLYTLFFHSIVHSILWVQNYMAAYYCLFHLFTLYAFLFIFWLASIK 120
           HGSCLISYSQHLFEVLYTLFFHSIVHSILWVQNYMAAYYCLFHLFTLYAFLFIFWLASIK
Sbjct: 61  HGSCLISYSQHLFEVLYTLFFHSIVHSILWVQNYMAAYYCLFHLFTLYAFLFIFWLASIK 120

Query: 121 ALPTCPIFFLYITMFPIFIHSIVVSVCIFSFVSYLFFF 159
           ALPTCPIFFLYITMFPIFIHSIVVSVCIFSFVSYLFFF
Sbjct: 121 ALPTCPIFFLYITMFPIFIHSIVVSVCIFSFVSYLFFF 158

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C030296 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_008445357.18.6e-76100.00PREDICTED: ATP synthase subunit a-like [Cucumis melo] >XP_008445358.1 PREDICTED:... [more]
BLAST of MELO3C030296 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C030296 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3BC164.2e-76100.00ATP synthase subunit a-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488415 PE=4 SV=1[more]
BLAST of MELO3C030296 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C030296.1MELO3C030296.1mRNA