MELO3C029766 (gene) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C029766
Typegene
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionUnknown protein
Locationchr02: 26251223 .. 26256358 (+)
RNA-Seq ExpressionMELO3C029766
SyntenyMELO3C029766
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATTTATACGTTGATGAAAATCTGTTACAATGACATTAATTTTAATTTCGATTGGGGGGAGCAATCGCCAAATTTGAAGAATAAGAATAAAAATTTTTATGGCGCGAAGGCTCATGACTGTTTCTTCCTCCAGTTTCCGGCATCCATTGTAGCGATTTCAGTTCGTTGTTTCTCAGTCAATGCTACGATAGTCGATTGCCGAGAGATTGGTTTGATTGTTCCATCATCTTACCTCAGCGATTTCTTTGGCAGGTCAGGTCAGGTATCATCCAATCAAGATGTTCAACGAAGGTATGTTTGGTTTTCGTTAATGCTCTAAAATAACTATTGCCATTCTATTTATTGGTATGATGGACTTCATCGTTTATGTTTCTCAAAAATTAGAGTGCGTATAATTCCCTTCAAATAGATATCCCTCCAAATAGATATCCCTCGTAGAAGTTGAAGCATTTCTCCCATCGGTCCTATATATATACACAAGCGGATAGATTAAGGTAAATTTGATTACAAATATATATCATGAGGAAAATTTGATTCCCATGATTGCAAGGTTGGGCACAAAATTTGTTTAGCAGTGATTTTATTAAATTTACCTTAACTCATCAAGATTTCTAGTTCGTGATTTAACACGGAATCACGGGGTGGAACATAATAGATTGTAAAACCGAGTCGACCAGGTGGTAGGTCAGCTAAAAATTTTGCGTCGGTTTGGAAAAATCTAAATTGACAAATCAATAAACAACATCTAAAGAATTAAACTGACCAAATCTAATCGATCTACCCATTTCTACTCCATGACGATTGAGATGTGTTTGAACATTTATTAACCGACCATAGTTAGTTCGGTGGTAATTTGGTCGAAAAATGGATTCAAACTGACCGATGCACACCTCTAGTGGTATTAAAGTAGGAGTTACTTTGTTCAAGTTCTTTAATGTCGTTTTCTTCTAATAATATTGATTTCTAGTTGTTTGGTTTTCGGTCCAAGTAAGGGAGTAGCGCTCGAATATGGATATTATAATTTATACGTTCATAGAAGAGAAAGAATGTTGAAGTATTGATATTATTAAATTTAACATAATCTATTAACTTAAGATTTTTGGTTCGTTGGTGATTAACAAAATTTGGATGGTGGATGTTACTGTCTACTGATGTGCTAGAGTCCCATAATGCAACTTAGATCATATAAGAACTTGGACATTATTGATATATAAGTTATACCTTCTTATGTTAGTGACTAGTGTTTGGTGAAACTGAGTATAGGTATAACTTGAACAATAATTATCATCCTATTCTAAATTTAAATCGCAAGAAATCAATCTAGGACTATCATTAAACTGTCTGATCGACTAGCCCTATCTATCTATCATTAAGCTCAATTATCTTTCTGTTAACTGATGGGAGGATTAACCTTCTCTTTTCATCTTTTGTAGCACTTCTCAAAATCCCAGTCTTGAACAAAAAATGTTAACCTTTAGGACCATGCCAACGTAATGATAATAAGAATAACAACATTTGGGTTGAAACGAAGGGTGGGCGTGCAAAGGTAACACAACCTTCCTGGACACATTTACAACTAGTAACAGTTCAATTGGCATTTCATTATTTGTTCTTAATTCTAATGTAGTATTGAGAATTCTGTTTTCATGCCTATTTCATTGGCAAGTTACTTACAGACGCATTTATGAGAAGTTTCTATCTGCTGTTCCTTCTTACTGGTCATGATTCTCAAGCTTTGCCTCAGTATGTCGATTTCTCTGTTCCTCTTATATTTGTCTTGCTCCATTGAAACTACTTGTTCTTTGAGGGATTTTATGGTCTCCTCCTTTGCTTGTAATTGTGTTTTTAGTGCTTCCGTCCTCTCAGTCGCTCCCCAATGTAATCCATCTCCTATCAAAGTAAATGATAAGTGCCTGTTAGTTATGGAAAATCTAGTTTGCATTTATTGAAATTCTTTAGTCTTAGTTTTTTGCTACCCCTATGACAGATCTTGTTCAAGTAAGGTCGTCCTTCACTCATCTCTAATCTTGGGCTAAATTGAAAGACAATCGATAGAAAATTCAGAAGCAAAGGGAAGATAAGATAAGTTCATACACATACCATTATGTGTCCTCTGAATGAGGTCATCAAGTTCAATCTTGATAGCGTGATAAAGTTGTTTCCACTTCTCAACGGCTTCATCTCTTCGTGCTCTTTCCTGTTGTATCTGCTCAAAGATTGTATTTGGAGTTCCCTCCATTTCCCATTCTGTTGCAATCTTCTCTCCAAAATTTCCTTCTTCAATCTCTGTAAAACTCTCTTTTACCTTCTTCCTCAACATCTTCACCTCCTCTCTGAGTCTCTTTTTCTCTGTTTTCCAACTTGCCTCCTTAAATGCAAAAACCACCATGTCTTTCTCATGTGCTTTAGTCTCTTTATCCATTTCAGTGATTACTCCCCTCACTTCCTCTCTAAGTAGCCTTATCTTTTCTTTCAATCCTTTAACATCATCATAAAAAATTTCACTCCCATCTTTGCTTGAGCATACACCCATTTTACTGAAGGGCTTTGCTTCTTTAGCCTTTCTGGGTTACTGAGTGAGTTGTTCAAGAAGGTCTTATAGACAGGAAATAAGAAAGAGAGATGCGTTTGATGTGAACTCTGAACAAAAGCTCCTCCATAAAAGAGCTGCATTTGGGGTACCTATATTGGCTGTGCTTATCCTTTGCTCTATTTGACTAGCTCTCTCTCAGAGTTAATGATTAGTGGAAACGTCTATGAGGCTCGTGAATGGCTGTCATTTTATACAAGAAAATACAGACAGATTTGACCTGTGACCCCATTAGAATTGAGAATCTGATCTGTGTTAACTCACACGAGAAAGTTTTGCAAAAACTAAATCATCACTCTCATATTATTTGGTAACTTTGAGTAGATAGATTTGCAGAACTTTTTAAAAGGCCCTACAAGCTTTGAAACTTGGAAAAAGTATTAATAGTAGTGCTGTACTTGGAACAATTTTTCCCATGCTATAGATATTCATTGAGATCAATTATGCATCTCAATTGCAAAGATGTCACCACTTTTCTTTTCCCCTTTTCTTTTATCCTTCTTTTTTTGCCTTCTTACCCTTGTTGCATGACAGGTAAATTTCTCTTGTCCACACGTACCATAGCCAAAAGGACAACTTTATATATCTAATACCTTAGAGTCTGGCGCTAGGATAAGACTATTCTTTTACATTCATATGATGTTGTCCATTTTAAATTGAACTTATATCCAACATAGCTTGACATGAGTTTTCAAGAAGTAAAGTTTGTTTGTTTTTGCAATATGAAGAGATGTTCAAACGTCTAACTTCGAGGTTGTCTATACATTCTTTATGCTTCTTGAACTATTGTTATAATATTATTCTGTTGCTTGGTTACATAGTTAGAAGTGCTTCTAGGGTGTAAAGAATATTTACAGGACACAATCATCTAAAAATGCTAACCATTCCAGTTACTTTTAAGATTCTTTCTTAAAAAACTTTATCTGAATTATGGAGATGTATTCCTTAAAAACTCAAGGTTTTTGTCATCCCTTAGCTCACACTTTCAGCAACAAGAAAATTCTTCCTTACCAACCACCCCCAGAAAATGGTAATAAGTTGGTAAAAGAAGAGATTGATTTAATGGTCAATACTAAATTCAGTAACTTACAGTAGAATGACATAAATTTCTGAGGCTAAATAACGACGAATTTGAATGGGGATGGTTACCGACAACTCATAAAAAGATTAGGTTATAATTTGTCATAGGATTCCTTTGCTGAAAACGACCTGCAGTGCTATGGTGAATTGGAATCAAACTTCAATTCAAGAATGGATTTTTGAGGTTCAAAGTGATGGTTACACATTTATCCTAAACGACACGACCTTACTTGAACAAGACTTGTTTTATAGGTCGTACAACTGTTTTTAATTCCTAATATTCACCATAAGTTACTAGTAAGAGTAAAGATGATTGAAATTCAAATTGTTTGATTTTCAACAGAATAAAAGAAGAGTGGAGAACCCATAAATTCTGAGAACAACTTCCTTTAATGTTACAGATTTTTGCGTAGAGATGAGGGCTGTGGTGGCCAACCGACAGTGACAAAAAGAAAAGAAAATGGTAGCTTGGCTGCTCAAACAACACAACAAACAGGTACTTACTCGTTATAAATTCATCTTGTTAGTTAATGCATTACCCATGTGATATTAAAACCAGCGAATATTTTTCCAAATTTCATTCTGATTTTGATGAGTACTTTTGTGTGTGGCTGTGGACCACTTAGTCTTACAATTGGCTAAGATTTTATCAAAATTCTCTCGAGGAACTTGCATTTACTGTTTTAGGGAGAGTTTAGAATTCTAAATTCCTTAATTATAATTCGTGAGTTATAATAGTTTGTTTTCAAGACGTAGACTACTTTCGTATGGATACGAGATATTACTTGAGTTGAAGTTGGACCCAAATGGCCTTTATAACCTATAATTATATGGCATCTTCTCAAAGGAGGATATGCTTTTTGGAGACAATATAATTGCAAGAGAAGTTGACATTTTAGTGCAGTTGCTGTAGATTATGACTTGATCATACGGGCAACGAATAATTAACATTATTCTTTGATATTTATTTTGGAATCATCTAGAATCCGTTTCCATGTGCTTTTCTTTATCAAAACAAAAATGTAAAACTTTAACCTATCAGAATTTTTGTTTGATAATTGAGAGTTGGAGTTCTGCTCCTCTGGGGAAATATTAGGAATTTTTTTTGAACTTATTTTTTTTAATCTTATTTTCTTTTAATTTGCTCTTGTGGTGTTGAAAAATTCAAACATATGATCTCTTCATACCCATATTCATTAATTGATTTGTTATACACTATCTAGTAACTTACTACATTATCTACGTATGTACTTTGTGTTAAAAATATACATACATGTCCACGGTTTGTCATTGGCTTTATTTTCCTTAATTTGAAATTACTCAGCATTTTGGATCCTCCACTTAATTGTAGATGAATCAATGGGCCCATTGGGCCATGGTGAGCCCAAAATGTTACTTGTTTGGGCTCAACCTCTGGTCCAATATACAAGAGTGCCATTATTGCCAAAATCACGCTTGTTTTGA

mRNA sequence

ATGATTTATACGTTGATGAAAATCTGTTACAATGACATTAATTTTAATTTCGATTGGGGGGAGCAATCGCCAAATTTGAAGAATAAGAATAAAAATTTTTATGGCGCGAAGGCTCATGACTGTTTCTTCCTCCAGTTTCCGGCATCCATTGTAGCGATTTCAGTTCGTTGTTTCTCAGTCAATGCTACGATAGTCGATTGCCGAGAGATTGGTTTGATTGTTCCATCATCTTACCTCAGCGATTTCTTTGGCAGGTCAGGTCAGGTATCATCCAATCAAGATGTTCAACGAAGTTGTTTGGTTTTCGGTCCAAGTAAGGGAGTAGCGCTCGAATATGGATATTATAATTTATACGTTCATAGAAGAGAAAGAATGTTGAACACTTCTCAAAATCCCAGTCTTGAACAAAAAATGTTAACCTTTAGGACCATGCCAACTATTGAGAATTCTGTTTTCATGCCTATTTCATTGGCAAGTTACTTACAGACGCATTTATGAGAAGTTTCTATCTGCTGTTCCTTCTTACTGGTCATGATTCTCAAGCTTTGCCTCATGCTTCCGTCCTCTCAGTCGCTCCCCAATGTAATCCATCTCCTATCAAAGAAATAAGAAAGAGAGATGCGTTTGATGTGAACTCTGAACAAAAGCTCCTCCATAAAAGAGCTGCATTTGGGATAGATTTGCAGAACTTTTTAAAAGGCCCTACAAGCTTTGAAACTTGGAAAAAGATTCCTTTGCTGAAAACGACCTGCAGTGCTATGGTGAATTGGAATCAAACTTCAATTCAAGAATGGATTTTTGAGGTTCAAAGTGATGGTTACACATTTATCCTAAACGACACGACCTTACTTGAACAAGACTTATTTTTGCGTAGAGATGAGGGCTGTGGTGGCCAACCGACAGTGACAAAAAGAAAAGAAAATGGTAGCTTGGCTGCTCAAACAACACAACAAACAGCATTTTGGATCCTCCACTTAATTGTAGATGAATCAATGGGCCCATTGGGCCATGGTGAGCCCAAAATGTTACTTGTTTGGGCTCAACCTCTGGTCCAATATACAAGAGTGCCATTATTGCCAAAATCACGCTTGTTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGAAGTTTCTATCTGCTGTTCCTTCTTACTGGTCATGATTCTCAAGCTTTGCCTCATGCTTCCGTCCTCTCAGTCGCTCCCCAATGTAATCCATCTCCTATCAAAGAAATAAGAAAGAGAGATGCGTTTGATGTGAACTCTGAACAAAAGCTCCTCCATAAAAGAGCTGCATTTGGGATAGATTTGCAGAACTTTTTAAAAGGCCCTACAAGCTTTGAAACTTGGAAAAAGATTCCTTTGCTGAAAACGACCTGCAGTGCTATGGTGAATTGGAATCAAACTTCAATTCAAGAATGGATTTTTGAGGTTCAAAGTGATGGTTACACATTTATCCTAAACGACACGACCTTACTTGAACAAGACTTATTTTTGCGTAGAGATGAGGGCTGTGGTGGCCAACCGACAGTGACAAAAAGAAAAGAAAATGGTAGCTTGGCTGCTCAAACAACACAACAAACAGCATTTTGGATCCTCCACTTAATTGTAGATGAATCAATGGGCCCATTGGGCCATGGTGAGCCCAAAATGTTACTTGTTTGGGCTCAACCTCTGGTCCAATATACAAGAGTGCCATTATTGCCAAAATCACGCTTGTTTTGA

Protein sequence

MRSFYLLFLLTGHDSQALPHASVLSVAPQCNPSPIKEIRKRDAFDVNSEQKLLHKRAAFGIDLQNFLKGPTSFETWKKIPLLKTTCSAMVNWNQTSIQEWIFEVQSDGYTFILNDTTLLEQDLFLRRDEGCGGQPTVTKRKENGSLAAQTTQQTAFWILHLIVDESMGPLGHGEPKMLLVWAQPLVQYTRVPLLPKSRLF
Homology
[Close]
BLAST of MELO3C029766 vs. NCBI nr
Match: XP_023530769.1 (uncharacterized protein LOC111793219 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 9.7e-05
Identity = 36/71 (50.70%), Postives = 42/71 (59.15%), Query Frame = 0 

Query: 75  TWKKIPLLKTTCSAMVNWNQTSIQEWIFE----VQSDGYTFILNDTTLLEQDLFLRRDEG 134
           ++ +IP LK T + MV+WNQTS QE I         DGY F LN +       F R DEG
Sbjct: 97  SYGRIPWLK-TIALMVSWNQTSTQECILSFFPATCCDGYVFALNCS-------FWRSDEG 156

Query: 135 CGGQPTVTKRK 142
           CGGQ TVTKRK
Sbjct: 157 CGGQLTVTKRK 159

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C029766 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_023530769.19.7e-0550.70uncharacterized protein LOC111793219 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
BLAST of MELO3C029766 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C029766 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C029766 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C029766.1MELO3C029766.1mRNA