MELO3C026663 (gene) Melon (DHL92) v4
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTTCTGTATCATTCTTTACAACACATCCAATTTCTTATGCAATTTCGAAGTTTTTTTAGTTTCAATTTTCAAATATTGGTAGGCGGCTCGGTCTTGGCTCGAAAATTTGGGTGCAACCAAGTGTAAGCAGAGGGCAGGGCGGCAGTTTGAATTGAAACCCAGTGTGTTCCAATCTCAAAACCTATACTTTCGATACCATTTAGTGTAGATTGGACGGAGTTTGTAAGAATCACAATGAAGGAAGGCGAGAAGGAGACTGAGTTCGTCACTCCAGGTGAAATTCTCGGTAACTTTTCGGATTTCAAACCTGGAAGAGGCGCCTATGTCGCCGACAACACTGTTTATGCTTCTCTTTCTGGTTTCCGCCGCATTATTCCTCCTCCCTCTGACTCTTCGGATTTGGTACCCTCTTTTACTTCATCTTTTTATGTTTCGAGTTTATTGTTACTGTTGTATATTTTGCATCCCTGTTAGTTTTACTTGACAATGTTTGGTCTTTGGACGAAAGGAATTGCTTTCTTTAAACCCCGTTTGAGTTTTTTGCTTTCTTTGGAAAAGGAAAATAATTATACGATGTATTTCAACATCTAATGTGCTTTCTTCCGAACCCTGTTATAGTTTCTTGGGTAATTGATACTTGGTCGGTTTAATTTGATGCTGTCGCCGTCTTAGATTTAACCATGGAAACTACTAGGCAAGGCTCATAATCATGTCTATGGTAATGTATTACGTATGTACATCTCTTTCCCGTTATAAATTTACTCTCTATTTTTGTGATTACAACTTTACTTCCCTCATATCACAACGGACTTTCTATTTGCAATCTCTCATGGCTATTTCTACTTTTTCGTAATATCATACTATCAATGAGTTCTGATTAACTATAATTTCTCACTTAAAAACTCTTCAGTTAGTTTTTCAAAATTTAATTTAATTGATTAATTATTTTTTTTAATTTTTGTTTTTATACCAGAACATTCATTGTCAACAAAATTTGTTCTATAGCATGTGCTCAAACCCTCAAAAGGAGAAAATCCACAAAAAAAGGTCTTAACCTTTTGATTTTTGATAAGCTTAGGAAATTGAAAAAGCTTCTCCACTTTCAAGTATCCCCAGTTTCACATCTTCCCAGTTATATAGGCTAGTACCAGACAACTTATTTGAGGGAACGACCCACTGTTCAACCTCGAAGTCACTGAAATTTGTTCTGAATTTCAAACCTCAATTATTATGAGTTGTAGTCTGGGAATGGCTCACCATCAAATCCTTCAAGTCAACAATTTCGTACAGTTAAGGGAAGTCAACATACACGGACAATTAATCAGACACTCATCATTCCAAAAGTGTTTTCTGTTCCCTATGCCTTTCTTAATTTTGTTTCAATCGTTGTGGAGAAGAATGGTCTGCATGGTTTGGGATCAAGGACCTTTAAACAAGCTAGCACTTCTCATAGAAGTTTACCACAGTTTCTCTTCCCATTGGTATTTATAAGCAATGAAATTTTTTTTTCAGCCTCATTTAGCTAAGAGATCAATTTTGAATGGCAAGATGATCAATGCCCAAGCCTCCCATCGTTGTTGGAAGAGAGGTGGTTTCCTAGTTAATAAGATTGACAACACCCTCTCTTTATTTCTTCTAAAAAAAAGTTGTCTAATCATCTCCTCCGAGAGTTAAGAACCTGTCTAGGGCAAGAAAAAAATTTGAAAGTAGTACAATGGTATATTTGTGCGGACTCATTTAGCCATGGTGATTCTACCACCACTTGAAAACCAAAGAAAACACATTTGCAAAGATTCCACAATAACACAAACACCATTGCTAACCAAAGAAAATGACCTTTATCTTTGACGTCCGGACGGAGGAGGAACTCTCCAATCATCAACCAAACATCCCTTTATCGGGCAAGCATAATATCAACCTCTTGAAAGAAACCATTTCACGCAAATCTTGCAAACTGACACTCCCAGAGAAGAGGTGATATAGATTTTCCTCCCCCTTTAGCCTTTTGACAAAGGTTACAAAAAAAGAACCCATCAATGGTGGCATCTTTCTCAACATCTTATCCATAGTATTCGCACGACCAAGCAAAACTTGCTAGGGAAAGAACTTAACTTTTGTTGGAATCTTGATCATCCATGAAACATCGAAGATCAACTCAAGAATAGGAGAGATGTTCACTAAAATTCTAAAGAACGACTTGCAAGAAAAGCTCTTCAAAGGTTTAGGACTCCGAAGACGAATATCCCTTCTCCCCATCCTAAAGTCCAACCCTCAATCAAGTAAGGAAAAGAGGCTACTCCCATTGTTTCCCTATTGGACGGAAACCAAAGGACAAGACAAATGTTATAATCGAGGAAATGTAGAAGATGGGGTTCATCCCCTACCCAATGATCTTCCTAAAATACGTTTCCTTGCCATCTCCCTCAACCCATAAAACAAGACGTGCCTTTTGCTACCCTCTCATAAAGATTGGACCATGTTTGCTAATAATAATCTTCTGCCAAAAGGATTTGGGCTCAAGGGGAAAATGTCACAATCATTTTTCCAACAAGGCTTTGTTGCATAATCCTAAATTTTCGAACTTTAACACCCCCCCCAGTTTCCCCACAACTTCCCAGCTAACCAGATGTGACCCTTTCCCTTCCTCAACCTCGAAGTCTCTCTTGAGCTTCTCAATACTTTTGCAAACCGAGATAGTTGCATAAAAGAGAAAAGTAATAAATGAGAATACCACTTAGCACCAATTGGATTAGCGTCAATCTCCCAACTTTGAAAAAGAAGCTTTTCTTCCATGAGCTAACCTCTTTTTTTCTTCTCCATGGGGGATCCCTAGGAGTTCAAAGGGAGGTTGAGATAGGAAGAGGAAATGGAACCAACCTCGCAACGAACCGGATTCACCCATATTATAAGCCTTTCCTACTCAATTAATGCCCAAAATTTGACACTTACTCCTTTTAATTTTAAGCCTCACATTGCCTCCAAGAATCCCAAGAATGTGATTAAGGATAAAAAAGGAATCCTCTTTACCGAAGCAAAACAACATTGTATCCTCCTTAGCACCCACCTTAAAGGGCTCAAGAATGCCTCTAGCCACCCCATTTAAATGATACCACTTGTTGACAACCAAGAGTTATAAAAAAAGGAGATAAAGGATCCCCTGACTCAAAACTTCTAGAGACCTTTATTGAGCCCTTCGGATAGGGGTGTTCAAAAACCCGGTAACCCGATGAACTTGGATTACCCAACCCAAACTGTAAGGGTTGGGTTAGGATGAAAAATCTTAAATTTTGATTTTTGGGTTGGGTCTCAAGTTACTAAATTTATCGGTCAAGTTGACCCAACTATACATATACAAACATAATGTCACAATTCACGCGTTTTTCTCTATCGTTGCATCTCCCTCCCTTCTCCCACCTCACAAACTATGTTGCGTCTTTGTCTCCCAGAGTTCGTAGTTGCCTCCTCTCTTAGTTCATCATTCTCGCTGTCTCCTCCTTCAATTGGATGTTGCTGCCGCCTTCTCCCTCAATTCGCCGTTGCCGTCTCTCTTAGTTTGCCTCACGGTTTCCATCTTAGATTCATAGTTCTCAGCTCTCCTTCTCACGATCTCCATCTCCATCTCAAATTATCGGTTCTCACGATCTCACATCTTAGTTCTTGGCTTCCCTCCTCAGTCTAGGTGCTTCTTAAGTTTTTGCTTATATTTTTTTTTCTATTTATTTGTTACTTTAGAACCCAATGTATGCAAATCTGAGGCTAAGACAAGTTTATTAGGTCATAAATCTTTTGGATTGACCACTCTATTTTATCTTATTTTGTTTTTGGATGACTATATGTTGAGATTCTTCTTTCAATGCATCAAATGCACCTTCTTTATTTCCATAACTTCTTTAGGTTATATGATTTTGTGTATGGGAGAAGAAAATTGTATTGGAGAAGGAAAAGAAAAGAGAAAAATACAACCTGATGAGCCAACCTAAAAATTTTAGGTTGGTTTGACCTTACAAAATGGAACCGGTAGGGTTTGGGTTTATAGCCGACCCGGATTTTTGAGTTGGTCTAAAAAATGTATCTGACACCTGCCTTCAGATAGCCACCAATTAGAATCAAATAATCACATTCTTGACACATCCTCACATCCACATTCTCTATTTATATCGGAAACCCTTTGTCTCCAGCACCTTATCCAGGAAGTCCTTGGCTACATGGTCGTAAACTTTCTCGTTGACTCTAAAAATCATACTCTCCGTATTCTTAGCTCTAGGGCTCGATCAATAATTGGTCTCATCTCGACTATAAAAGATAAATGGTTGAAGGAAGCACTTTTCATAAACAATTAGCAAGGATCTTGTAGACACTGGCGATAAGATTGATAGGTTTGAAATCTTTAACCCTAACTACGTGCTCATTTGTGAGAATAAGGCATACGAAGTTTTCTGAGAGGGAATAATTTAATATGCTCTTCCAAAGAATTCTTTAAAAGCATTTTCCAACTCCCTCTTTATAAGATTCCACTTATCTTGGAAGAAAGGCATGGAGAAACCATCCTGTCTTGAAGATTTACCTTACCCCTACCAAAAACTGGTTTCCTAATTTCTTCCAAAGAGGATGGGGCTACCAACTCCTCACCATCCCAGGAAAAATAGGACACCAATCAATAACTTGAATAAATGGTTTTGGCATGACAACGTGACTATGGAGATTAGAGAACATCGACAGAACCTTCTCTTCCACTTCCTTGTCACTATTTGTTCTCTTCCCATTACTCATAACCAAAGGACTTATGTAGTTCTTATGTCTCCTATCACATAAAACGATAACCTTTCTTACCAAGGACTCAAATATTCCACCAAGAGGAAATGTTAGCTCGAAGGAAGGGTGATCAATATTTTCAAAATAGTAGGAACCAAGGCCGCATCTTTTAGAGCTCGAAGTTAAGACTATAGGCCAACGTTTTGAAGTAATTCGGCCCAAGGAGTTTGTGGGAGTTCG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BLAST of MELO3C026663 vs. NCBI nr
Match: XP_008465048.1 (PREDICTED: exosome complex component CSL4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 386.7 bits (992), Expect = 1.2e-103 Identity = 196/196 (100.00%), Postives = 196/196 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. NCBI nr
Match: XP_004144376.1 (exosome complex component CSL4 [Cucumis sativus] >KGN58353.1 hypothetical protein Csa_000995 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 377.5 bits (968), Expect = 7.1e-101 Identity = 190/196 (96.94%), Postives = 193/196 (98.47%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. NCBI nr
Match: XP_038879159.1 (exosome complex component CSL4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 359.0 bits (920), Expect = 2.6e-95 Identity = 182/197 (92.39%), Postives = 191/197 (96.95%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. NCBI nr
Match: KAG7020862.1 (Exosome complex component CSL4 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 4.5e-95 Identity = 179/196 (91.33%), Postives = 189/196 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. NCBI nr
Match: XP_023530831.1 (exosome complex component CSL4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 4.5e-95 Identity = 179/196 (91.33%), Postives = 189/196 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y3B2 (Exosome complex component CSL4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 145.2 bits (365), Expect = 7.8e-34 Identity = 83/186 (44.62%), Postives = 113/186 (60.75%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9DAA6 (Exosome complex component CSL4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Exosc1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 5.0e-33 Identity = 81/186 (43.55%), Postives = 116/186 (62.37%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O59821 (Exosome complex component csl4 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=csl4 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 4.3e-24 Identity = 70/184 (38.04%), Postives = 108/184 (58.70%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P53859 (Exosome complex component CSL4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=CSL4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 3.5e-18 Identity = 62/173 (35.84%), Postives = 86/173 (49.71%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P38792 (Exosome complex component RRP4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RRP4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 47.8 bits (112), Expect = 1.7e-04 Identity = 44/163 (26.99%), Postives = 74/163 (45.40%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CMV8 (exosome complex component CSL4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502755 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 386.7 bits (992), Expect = 5.7e-104 Identity = 196/196 (100.00%), Postives = 196/196 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L935 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G627150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 377.5 bits (968), Expect = 3.4e-101 Identity = 190/196 (96.94%), Postives = 193/196 (98.47%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F6G8 (exosome complex component CSL4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441251 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 1.1e-94 Identity = 177/196 (90.31%), Postives = 188/196 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IH52 (exosome complex component CSL4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472912 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 355.5 bits (911), Expect = 1.4e-94 Identity = 178/196 (90.82%), Postives = 188/196 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DE54 (exosome complex component CSL4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019593 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 342.8 bits (878), Expect = 9.4e-91 Identity = 174/196 (88.78%), Postives = 185/196 (94.39%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026663 vs. TAIR 10
Match: AT5G38890.1 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein ) HSP 1 Score: 273.5 bits (698), Expect = 1.3e-73 Identity = 134/188 (71.28%), Postives = 159/188 (84.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (DHL92) v4
Date Performed: 2022-08-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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