MELO3C020035.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDSstart_codonstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACATGATTTAACCTAAAATGTGGAGGCTCAATTTTGTAGAATTTATGTAAAACATTTTGTAAAAAAGAGTCAAATTTCCGTCCATCTGTCAAGAAGGAAAAAGGAAGAGACGCTGATCGAAGAAAAAGGCGACAGAATTCCTCATTTCGAAGAAGCTTGAATTTCGTAGTTCACCGCCGACTTCGAAGCTTTCAATCTATAAGAACTCCTGTATGAAGTCTCGGATGCATGAAGAAATTCTCAAATTCTGGTGCAAAATTTCAGTATGATTGATGGTTCCAGGCATCATAATGCAGCAGCAATCCTCTTCTGCAGTTTCTCCACACCATATCAATCCTCCGCCTTCCTCTCTTAGGTCACCTTCATCCACACCTCCCTCCGCCCACTCTCCGCTGCCTCTCACCACTCACGTCTCCAATTCCCACCGGGAGCCATGCGACCATGTTGCCGGACCAGTGCTGCAATCCGCCGCTGACTCTGCTGTAGCTATGGCTTGCCCACTCGCCAGGGTCCGCTTATCTGATATTGCCCCTTACGACGGTGCGCCTGCGGGGTCCTACGTGAGGGCGGTTGAGGCTTTGTCCGGATCCTTGACGAGGTATAATGCGGCTGTGATTGAATTGGAGAATGAAGCTGCTGCTCTCACTCGTTGCGGTCTTGAAGCGGCTAGGTTGTTTTTCAAAAGTAGAGCGCAAAGTGGAGGAAAGGGGCGCAGTGTTTATATGTATAGAGCTGGAAGGTGGTTAGCTTATACTCTCTTTTTACTGTACTACTTGTTTAGTTCTCATTTTTAAGCCAGTTATTTTCTGATACTTCCTGAGTTCTTCCTTCAAGGATCTGTTTCTGGAACAAGGAAAATATTCATGTTGATTTATGCAGCTTTACATAAGCTCGAGTAGAATTATTAGTCAACCAATTTACTGTAATTAAAGGGAAAATCATAACAAAGTGGCTTCCTGGTTTTGGCTTCTGTCGGCTAGATTGGAGCTTGAGATTAATTTGAACAAAAACAAATCAATTTTTTAACCTCCCCCTTAAGTTGCACCCTTTTCATACAGTGAAATTGGCAAATTGTCTAACCGAGTATTAGTGATAGGGTTCAAATAAGGAGCCCGTTCCACGCATTATCTCCTTTGCCTACAATGACTAGTCCATCTTGTAGAAAGTATCCTATGCATACATAAAGGGCAAGGACATAAGTTTTGTTTTCTGAGGTTATGGTTTGAGAGGAACAATCGTAACGTCAAGATTGAGAGGAGGTAAGATCATTTGCATGAAGGATAGTGAGAAAATAAAGAAAACCTCTTTCTGGATAGAAAGAATTAAATGGGAAAAGGAAAACTTAACTTGATTGTTTTGGGCAAAAATTATTAAACAAACTTCCAGCTGAGGTATGATCAATCTTCCTCCTAAACGGTTGCAGGTTGAAGTCTGTCCTACCTTCCAGACGCTGTCACTTGATATTGGGCATCCATCTTTGTCCTTTGAAAGAGAACTTCCTGTTGCCATTTGAGTTTGACTCCGTTGAGTCTTAATGGTTCCACTTCTTGCTCTATGTTAGCTCCAATTCCGTTTGGTATACTCCTTTAGTCTTTAGATGCTTTAAGGGATCTACCTTAGAGAAAATGTTTATTGAATCATTCAGCTTTTCATAAGCTTAAATAGATTTATTAACCAACTTACATTTATAAATCAAGGAGAAAAACTTAACAAGTTGGTTAAGTTTATTTGTGACTTCCTGTCATTGGGTTCTAGCTTGATAAATTCAATTAATTTAAAGAAATGATAAACATAGAAATATTAACAAAGTACTCTTCCCTAACTATCGTCCCTTCCCTCAAGTGGACCCCAAATTGAAGGATCAGTGGCAGCTTTAGGAATCTGTGGAAAACAATTGCATTGGTTTCTAGGAGATCTCTTTGTGAGGTTCTCAGTCAAGGATCGTTTGTCTATTTATTTATAGGAGGATAGCCTTCTTAGCCATCTTTATACCCATCTCTATTAATTGTGCAATTTTGGTTTAGAGAATTGCCTCTATCCTTGCCTTTTCTGATAATTACATTTTGTTCATTTTGTTTTAGTTGCCCTTTGTTTTGCTGCAATTTTTTTGGATTTCATTTTGCTGCTCTCTATGGTGGCTAAATTTTGTCCCAACCTGACGTTTTGGGATCTTTGTTTTTGGTGTCCTAATCCTTTTGGGCAGTTAACACCACTGATTGTATCGACAGGCCATCTTCTGTTTTACTGGGCCTTAATGGTGCAGTTTATATGTGATGGATTTTGAAAGGTTCGATAGTTTCTACTTTCTTTGGAGGCATTGTTGGTGCTTGTCTTATGTTATAGATTTTATTCCCCCTCCATTTTAGATAGAGGCATTGCTTTTTGGCGTACAGCCTTCATTGTGATTTATGGCATATTTGACTTGAGAGAAAAGAACCGGTTTTAGTGATGTGGAAAAGCTCTTTCTAGGAGGTTTGGGTTATGGCTAGCTTTGTTGTCTCCCATCAAGTCTCGGTTACTAAGGAAGTTTGTGACTAACCTCTATCTCTCATTATTTTTGAATTGGATCTCATTAGTTAGAGGGCGTTTGGTTAGCGATAAAAACAAAGAGTTGAGTTGATAATAACTATAGAGAAGTTATTGGGGGAGTTGACATGAATAACGTCGTGAGAAATGTGAGTATTTTTGTGAGAAATGTGAGTTGATGTGAATAACAAGGTACTAAACTTCCTTGCTTATTGGTGAACCAAACAGGGGTTGGTTTTTTTTACCCAACCCAACTCTCCCAAATTATTTAAGTTGCCAAACACCCCTTTAGTTTTTTGTTTTTGAAGCATGCTTGTTGTCTTCCCATTTCTTTAGCACAATTGTTATCTTTCCAAACTAAACACTTGAAGTCTTAGCATTAGTATTAGTTCTAATTTTTTGTTAAGGTAAGTTTGCTCTTCTCTCTCCTTTCTCTCCTCTCTCTCCCTCGTCCTCTACCCTGTTTGTAGAGAATGCTTGAATTGATATTGATCAACGATCACTTTATGAAGTGATAAAGCAACCTGGGAAAGGGCAGGAGGTTGGTGCCTTTCGCTTAAAGTTTGAAAAATGGGATAAGCTAATCCGTAGCAAACATGTGTATGCGAGGATATGATGGATGGATTGCGATTAAGAACCTACTGCTATATTGCTGGAATAACCAAACTTTTGAAGTTCTTGGGGGCTACTTTGGGTGTCTACTAGACATTTCCGTGAAACTTTGAACTTCATAAATGTATCACACGCCAAAATTCAAGTTAAAGAGATTCTTTTTTGGTTCATTCTGGCAATGATTGAAATTAACGATGAGAAGAGAGGAAATATTTTCTTGAACTTTTGATAGTTCATCAGTCAACCAGCATCGTAAAGTCAGAGGGGGTTTATTTGTTTATGATTTTTCAAATCCAGTTGATATTGTTAGATTAAATCAAGTTTTGAAGGATGGAGGGGTTGAATGTGGTTTGTTAAACAATCTGTCAATTTTCTTCTTCTAGCAAGGATGCATTCACAGGATACCAGAAACCCTTTTGTTCAGTGTGATTATTTCCTTTTTTGTATTATATTTTATTGTCCAGAAATCCCTTTTGTCCATTATCCGCATCCTTCACTCTAATAATGACACTGGATATTTCAATGAACAATTAACCAGTTTCTTAGACGAGGAGGGTATTTTTCATCAAGCTACATGTCCTGATACTCCTCAGCAAAATAGAATTGCTGAGCGAAAGAATAGATATTTACTTGAAGTTGCTTGTGTTTTCTATGAATGTCCCAAAATATTTGTGCGGTTACGGAGTCCTTATAGAGGTTTTGAATTTCAAAACTTCTCTGAATCATTTAAAAAATTCTTTTTCTACTGTTTGGTTGTTCTTTGACTTACCCATTAAATTATTTGGTTGCACCACTTATATTCATAATCCCAACCCTACTCGCACTAAACTTAACCTTCATGCTGTTAAATGCATTTTTGTTGGTTATGTCTCCCATAAGAAGGCTACAAATGTTTTGACCCTTCGACTAAAAAGTATTTTGAGAGTATGGATGTGTCTTTTCTGGAAAATAAACCTTTTTTAGCCAAAATTCTCTTCTAGGGGAGCCACCTAACCTTGAAGATAATTTTTGGGACGCTCCTATCCCAAACATCATTCATTCCGAAATTATGAGTTCTAATCCTTTGATGCCAAGCGTGGAGGGTTCTTCTTCAAGGGGAGAAACATTACAAATTGACTTGACAAGTAAAAACCCTGAACTAGGGTTTATAAATGAAGAGACTTGGCTCATAGGAATTTAGAACAAATAGTTGATCTATCACATAACCAATTTAATGTCTCGATAAATCATTTTGAAGATCTAGGTAACATACATTTTCCTTTCACAAGCGTAGTTGCATTGCAGGCTATAGTGCCAAAGCATCCTCCGTCTGCATCTGATGCATGTTTGCTCCGCTGCGCTCTCTTCATTTGATGTCTACTGCCTTTTAGCTTAGCGCACAACATCAAACTGGCACCCCCTACACTCCCTTTAGGGGCAGAATTGTCTTTGTACCCTTCGGTTGCTATTCAGTGCTCCGTTTTGATTCAAATTGCACCCAGAATGTCTCGATGGTCTCCTTTGCTCATTTTCCTGTCAAAATGCTCAAATAAACATTAAGGGGGCATTTGGGGTGAGGAGTGACTTATAATAGTCTGAGTTTGGGGTGCGGACTATTGTAATCAGTGTTATTATAAGTTATGTTTGGGGTGCAGACTATTATAGTCTGTGTTATTATAAGCTAAACATGTGTGGATTATTATAAGCTGGGTTTGGGGTGAAGACTATTATAATTTGGGTTTTTCACTACTCTTTTTTTGTCTACATATATATTATACATGAAATACACATTTTTCTTCAATTGATTTGATTAAATCTTGTTAATTATAATGTTCATTTAATAAATTTAGCTTCTCTTGCCAGTAGCCATTGAATTC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ATGGTTCCAGGCATCATAATGCAGCAGCAATCCTCTTCTGCAGTTTCTCCACACCATATCAATCCTCCGCCTTCCTCTCTTAGGTCACCTTCATCCACACCTCCCTCCGCCCACTCTCCGCTGCCTCTCACCACTCACGTCTCCAATTCCCACCGGGAGCCATGCGACCATGTTGCCGGACCAGTGCTGCAATCCGCCGCTGACTCTGCTGTAGCTATGGCTTGCCCACTCGCCAGGGTCCGCTTATCTGATATTGCCCCTTACGACGGTGCGCCTGCGGGGTCCTACGTGAGGGCGGTTGAGGCTTTGTCCGGATCCTTGACGAGGTATAATGCGGCTGTGATTGAATTGGAGAATGAAGCTGCTGCTCTCACTCGTTGCGGTCTTGAAGCGGCTAGGTTGTTTTTCAAAAGTAGAGCGCAAAGTGGAGGAAAGGGGCGCAGTGTTTATATGTATAGAGCTGGAAGAGCAGTGGAAGATTGGGACTCTTGTCCTCCCTGTATGGCTGATATTTTTAGATGCATGGGTAAAGCAGCTCGGGCTGCCTTGTGTGCAATAGCTAGGCATCTTCGTTTGAGAAGCGATGTTTTCAATAATTTGCTCGATGACACTCCACTTCCTGCTACTGATGTGTCCTCATCAGTGCTTGTTGCAATGCTCTTGCATAATAGCTCTTTGCACAATTGCAAGGGTTCTATTGGAGGAGGAAAGTCAGCAATGAATGTTGAGGTGGAGAAGGGGTTATTGACATTGTTTTCCTCAGACAATCCTGGTTTACAGGTTTGTGATCCCAATGGTCGCTGGTACCTAGCAGACGCTGTCTTGGCACCTGGAGATCTGTTACTGATTACCGGAAAGGCACTTAGCCATGCTACAGCTGGCCTTCGGCCTGCTGCATCATATAGAGTTGCTCCTGATCATTCCTTGGGCTCAAATTGTGTTGGGAGGACTTCCCTTGCATTTAGACTCATGCCCCAGACGAATGCCATACTAGACTGTTCTCCCATTGCAGCAGCTGGTCATGTCATCCCCCAAAGATATGGTCCAGTCTCTGTTAGCCAATTCATGGATGATCTTTCTGCTGAGGAAGATGTATTGTGCACTCATCTGGATAAGGATAATAATTGTATAGCTCGAAATGATCAAAACAAGGAAGCCTCGCTAAGAAGTGTTCTCTCAGATCCACTATCAGGTGCATTCCTTGAGGATGCGATGTTTGTTTCATGTGGACATTCATTTGGTGGTCTCATGCTGAGGAGGGTCATTGAGACGTCAAGGTGCACCATTTGCAACTCAGAAATTGATGCTGGGTCCTTGATTCCTAATCTAGCACTTAGAGCGGCAGCCTCAGCTGTGAAGCATGAAGATGATAGGAGGCTATTCCACAATGCTGCAGTGAGGAAGCGTCGGAAAGAAATGGGAGACCATATGGATCCAATGAGAAGATTAAACAGGGAAAATGGTGATCTTGCCATTGATGATGGCATCCATCGAGGAGTGCAGTATCCTTTTGCAGAAAATGAAAAGGTTCTAATTAAGGGAAACAGGAGAACACCAGAAAAATTTGTTGGGAAAGAAGCAGTCATCACATCCCAGTGTCTCAATGGCTGGTATTTGCTAAAGATCATTGGTACTGGAGAGAATGTTCGGTTGCAATATCGATCTCTTAGGAAGATCCTTAACACGACACCAGCTAATGATAATAGCGGTCCTCCACAGCCACTTCAGCACACTTGCTCATAA MVPGIIMQQQSSSAVSPHHINPPPSSLRSPSSTPPSAHSPLPLTTHVSNSHREPCDHVAGPVLQSAADSAVAMACPLARVRLSDIAPYDGAPAGSYVRAVEALSGSLTRYNAAVIELENEAAALTRCGLEAARLFFKSRAQSGGKGRSVYMYRAGRAVEDWDSCPPCMADIFRCMGKAARAALCAIARHLRLRSDVFNNLLDDTPLPATDVSSSVLVAMLLHNSSLHNCKGSIGGGKSAMNVEVEKGLLTLFSSDNPGLQVCDPNGRWYLADAVLAPGDLLLITGKALSHATAGLRPAASYRVAPDHSLGSNCVGRTSLAFRLMPQTNAILDCSPIAAAGHVIPQRYGPVSVSQFMDDLSAEEDVLCTHLDKDNNCIARNDQNKEASLRSVLSDPLSGAFLEDAMFVSCGHSFGGLMLRRVIETSRCTICNSEIDAGSLIPNLALRAAASAVKHEDDRRLFHNAAVRKRRKEMGDHMDPMRRLNRENGDLAIDDGIHRGVQYPFAENEKVLIKGNRRTPEKFVGKEAVITSQCLNGWYLLKIIGTGENVRLQYRSLRKILNTTPANDNSGPPQPLQHTCS Homology
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008456842.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496673 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1144 bits (2959), Expect = 0.0 Identity = 580/580 (100.00%), Postives = 580/580 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004140426.1 (uncharacterized protein LOC101206682 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648109.1 hypothetical protein Csa_004712 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1123 bits (2906), Expect = 0.0 Identity = 570/580 (98.28%), Postives = 573/580 (98.79%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038891861.1 (uncharacterized protein LOC120081226 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038891862.1 uncharacterized protein LOC120081226 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038891863.1 uncharacterized protein LOC120081226 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1075 bits (2780), Expect = 0.0 Identity = 551/587 (93.87%), Postives = 560/587 (95.40%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_022942565.1 (uncharacterized protein LOC111447566 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1030 bits (2662), Expect = 0.0 Identity = 532/589 (90.32%), Postives = 549/589 (93.21%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAG6599871.1 (U-box domain-containing protein 62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1024 bits (2648), Expect = 0.0 Identity = 532/592 (89.86%), Postives = 549/592 (92.74%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DBN5 (U-box domain-containing protein 62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB62 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 1.3e-31 Identity = 73/193 (37.82%), Postives = 113/193 (58.55%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q58FY4 (U-box domain-containing protein 63 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB63 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 5.3e-30 Identity = 70/173 (40.46%), Postives = 102/173 (58.96%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3S2 (uncharacterized protein LOC103496673 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496673 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1144 bits (2959), Expect = 0.0 Identity = 580/580 (100.00%), Postives = 580/580 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FWI9 (uncharacterized protein LOC111447566 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447566 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1030 bits (2662), Expect = 0.0 Identity = 532/589 (90.32%), Postives = 549/589 (93.21%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JTN9 (uncharacterized protein LOC111487410 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487410 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1018 bits (2632), Expect = 0.0 Identity = 530/595 (89.08%), Postives = 547/595 (91.93%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DMB0 (uncharacterized protein LOC111022323 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022323 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 882 bits (2278), Expect = 0.0 Identity = 439/472 (93.01%), Postives = 454/472 (96.19%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SSH6 (RING/U-box superfamily protein isoform 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold452G001180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 856 bits (2211), Expect = 1.28e-310 Identity = 424/424 (100.00%), Postives = 424/424 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G19895.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 656.8 bits (1693), Expect = 1.7e-188 Identity = 358/557 (64.27%), Postives = 423/557 (75.94%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G12940.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 3.0e-36 Identity = 110/324 (33.95%), Postives = 159/324 (49.07%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT5G05230.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 9.0e-33 Identity = 73/193 (37.82%), Postives = 113/193 (58.55%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G40640.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 3.8e-31 Identity = 70/173 (40.46%), Postives = 102/173 (58.96%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020035.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G40640.2 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 3.1e-25 Identity = 62/154 (40.26%), Postives = 87/154 (56.49%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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