MELO3C019064.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATAACTCTTGAAGTTGAAATATGTCTTAAAGAAGAGGATGATTTGAGATGCAAAAGTTACATGAAGAGAAGTAATCAGTCGAGGTTGTCCATTGGAAGTATTAACATAGATCTTGATGTCGATGAGGATATGGGCAACACACCTAGCAACAAAGGAGTGGAGGTAATTGACTTTGTTATTACTTTTAATTTTTTAACGATATAGGATCAATTGTTCTTAGCGATGCTTTTAATATTTGTAAAGGGAACACCATGCCAGTTCTCTATATGATCCATTAATAATATTGTTGCAGTAGCCACGGTAGTCGATGATAACATTGGTTGTCCCAGTGTTAAAGTTTTAGTAGACGTGGTTAGGGAAGAAAATTTGATGATACCCAATCCAATGAAGGACAAGATAGAGACCTTAAATCAAGCATTGAGTAACATTATTGAATGACCTCGTTGGCTTGTTTCTACGAATCAATGAAAAACAAGTGTGTCTCTTTTTCACTATTTAAGTTTTGATTTTATTTGTGGATGTATTTTGGATTTTGAACCTTTGTTGAGGTAAGAGAATTCAACCATGAAGGATGTCATGTATTCTTCAAATTACACAGACGTTAACAGGACTATTAAGCTCTTACGTTGAAGTGTCGTGAACTACATGAAGGATGTAGACATGATTTGCATCTCACTGAACGAGCTAATATTTGAAAGAGATAAATTTGTTTATTTAGCTCATGAAGACTTGTTGCATTACTGTGACATGGTTGAAATAGGTTATAGTGTATACTAGCGTACATTACCTAAGTATAAGACAACTTTTACTCATCTTTATCTCCAATACCATTGTTGTAGTTATTTTGCTCATGTTTTAACTATGGTTGCTTTTACTTAGATATCTTTGGGATGAATGTGACTATGCAAGGAAGTTTGTTGTTATTGACCAATTAAAAATATCGTCACATATCAAGGATTGTGATCTTCGATCCAGAAATCTAGCCAACCAATTAGGAGCAGCTAGCTTGGAACAAATAGTTCTAATTTCATATAATACCGGGTAAATAAAGAAGAGAAACACATTAATTTTTTTTCCATTAAGCTTAAATGTGTACTCACATTGAAGAAGTTGCTTATTGTGGTTTTCATTGGATGTTGCATGTCATCGATCTTCAAGAAAATTGTATTTATCTCTTGGACTCTCTTTGGAGTAAAGTCAATGAAGACAATCATGAGTCATAAATGTGTAAGTATATTCACTCTATTACTTCTTATCTCACTTTATTGTCTTATAATGTTTCAAAATATTTAGAGGGTTGAAGACATGGCAAGCTAAACATGATTTACAACTCTATCGGTCAACTCCAAAATGGAAACATGTAAAGGTAATTTGCATTGACACATAATTATTTTCGATGGTACATAAGAATAATTTGTATCCAATTTATATACATGCAGTGCCCTCGTCAATTGGATTCTGTAGGGTGTGGGTACTATGTTGCAAAAGTACATACAAGAGATAGTGCATAATTCTAGTATTCATATTACTAGCCTTGTAAGTTTCTACTTTCAGTTTTTATATATTACAATTTACGATCTAAACTCATTCTTTCCATATCTTTCTCTCTGTGTGTAGTTCAATACAAAAAATGCATATAGGCAAAAGGAGATTGACGAGATTCTAACAAAATGGGCAAGCTTTGTTGGCTGATTTATGTAAGCTTTTACATGTTTTTTTTTTTTTTTACGTCGAGTTAAGTTAGTATTTGACTTTAGTTTGTGAAGGAACTAGTTGTTATATATACTTAGTTTTGGGTTCTTCCGCTTGAACTTTTGAATTAAGTTTTTGTAGGGACGGGAGGTCATATAGTTTTTGGAAGGGCGGACGGTCCCATACTAATTGTTGTTTGTTATATAGTTTGCACATATACTTTAGTTAGTGGATGAACTTGCTGTTGTACATATACATTAGTTATTAATCATGATCTTACATATTATCTTTAGATTTTGAGTTTTTACTTAGAGTGCTTGGATATAGTGTGTTTATTCAAATATGTGATTATATATAGGTGTTTGATGATTGTATTTGTTGTAGTATTCTATGGAAGTGTAGAAAAGTGTGCTAGTATTTTAGGTGTTGGATGATCATATTTGTTGTAGTACTATATGGAACTGTGGAAAAGTGTGCTGGTATTTTAGGTGTTGGATCATGTGCATTGAAAGTGTTTGTTATTGGTTTGCCATAGAGGACAATATACGTTGTTTGATATGAGATTATATATAGGTGGATATATTTGGCAGATTTGGAGTAGTTGGTCATATGGTGTTGATTATATGTAAGTGTTTGGATGATGTGTATTTGTTGTAGTTCTATATGGAAGTATGGAAAAGGGTATGTTGGAATTATAGGTGTTGGACCTTGTGTGCATTGCAGGTGAAATAGAAATATAAGGTTTCCCACTAACTAACAGGCATTCTATAGCTAGAGTGCAAGCAATTGTTTTTATATTTTTCATAATATACGATGAGGAACATTTTCAGACGTATTTCGAGACAAATAATGTCGATTTCGTTGTCATAAAAATTTGACAATAATGAAACAATTTGATAAAAATAAATTTGAAAACACGGACCCAGAAACAAGGCATTGATGTCATTTTTAAACTGACATTAAAGAGGCCTTTAATGTCGGTTTTAAATTGACATTAAAGGCATCCTTAATATTGGTTTAAAAATGACATGAAAGGCATCTTTAATGTTGGTTTAAAAATGACATTAAAGACATCTTTAATGTTGGTTCAAGAAGACATCAAAGACATATTTAATGTCGGTTTTAAACCGACATCAAAGGCCAACCGACATTAAAGGTCTTCAATAACACTATCAAAGATGTTGGTTTATAACCGACATTGAAGGCCTTTAATGGTTTATAACTGACATTAAAGAGGGCTTTAATGTTGTTTTTAAACCGATATTGAAAACATTTAATAACACTAGCAAAAATGATGGTTGATGCTTTACCTCCATTAAAGGCCACATTTCATCTAGTGATACTTTACAATAGTATACCAATCCTATTTATGGAATTACGAGGATCCATAGCTTCACATAACAATTAATTTTCTATTTAATTCATCAACATATCTAATTTAAACAATCTTGCAAACTATTCATCAATTAATATATTACTTTCACATGTCTTAATTTTTATGTGTAACCTATTTCAATTAAACATGCTTTAACTTTTTCATCAATTACTTCAAGACTCTAAACCTTGGTGAAGTCTGAATAGTAATACAACAATGATGATGGTTGATCTCACCTCCAAACTAAAGTATGAAAAGTTCATCGTATCTTCTCATAATCCGTTTCTACTATAGAGAAACTAGCATACATCTTCATCAAGATTTTGTCACCAGTCAATTCAATCCGTCTATTTCATAAATTTAAATGTGTTACACAAGTCTATCATCTTGAATTTAAAGGAGGGTATTACCATATATGTTCTATAGGTTTCTTAATTAGAAATATCTCAGGCTTTTTCCTAATGTATAATTTCCTTTCTTTGGAATCTCCTTTGTGTATACTTACACATTTGTATTCCTCATTGGAAGTAAAATAGTTATTCCAATAACTCAAAAAATATACCAAAGTTCACAACTAACATGCACTCTTTGTTACTCAAATTGTAATTAAAATCGATGGTTACAATAATTAGCATATCAAACCAACTACATAAACATAATTTAATTTTTAATTTTAACATATAAATGAGATAAGTTTCAACTCACGAAATTATTTGTGATGCAATTTTCATGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATCCAACCCATTATTGAAAATTTCAATTCCCAACATTGAGAATTTGACTACCAAATGTAAAGAGAGAATGTTGTAATGTCAACTAATAATTGAGGATATTATATGTATTTGACTTTTTTTGTCAACAACGTTTTATTGTATATACAACAAGCGACGTTGTATTAGTCAACTTTGACATTTTGTTTAATTGGTTCAAATTTATTATTTGAAAATTTCTGTTACCGTCCACGTGGCTTATAGAATATTTTATTTTCCTACATACTGACACCATTTTTAACATGCAAATGGACTTTTACACTTCAATTTATAAAAAAGAGTATATGTTTTTCAACATTTTACAAAGCACATGGAATCACATTTTAGACTTTATGTTTGGAAAAAAAAATCATTTTATTTAAACTATTTAAAAAAAACATTTAAAATACACTTCAAAATATATTTTAATTTTTTTTCCAAACACTATTAATTTTTTACCAAAATAACTTATTTTTTAAATATTAAACACTTAAGAATTATTTATGTTGTTGCACTTCGGTGGAGCTAATCGTCATAGTGAGAAAACCAGCAAAACAGAAGCACGTTAATAACAGGATGAGTCGCGAATCTTACTCTCTTTAAAACGTTTCACGGTCCTGCTTGGATGTGCAAATAGATATCACATGCCCCATCGTCCTTAAGATATAAAACAACCTCTAATTTTGTCGATAGAAACTGCACTAAAACCAAACTGTTGACAACACTTGATAGATACTAGTATTCTCGAAAAGTAAAAAGACAAAATAATTTTGTTTTGGAAAGTACAACAATAAACAAAATGGGAATAAGGAGAATTCGTGAGAGAAAGAAGAGAGTTTGAGATATTGGTGGTGTATCAAATGAGAAGGGAAGGATTTTATATATGGTGGATGTTCAATGTGATAAATGGTGTAAAATTAATTAAGGAACGCTTGTAACGATCGTAACGATCAAAAGATAATTTAAAAAACAAATAAACGTTTCAAAATTAATTTTAGTAAAAATATAAATCTATCATTATTTTTATGTCACACCATACCACATTCATTTAAACAATTTTTTTTATCAACAATCTCTCACATGAAAATTTTACTAAAAGTCCCCGGCCCACTTAAAAATTTTAAAACATTTTC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BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004144366.2 (transcription factor bHLH101 [Cucumis sativus] >KAE8649686.1 hypothetical protein Csa_012494 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 367 bits (943), Expect = 1.19e-125 Identity = 195/210 (92.86%), Postives = 199/210 (94.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038882377.1 (transcription factor bHLH101-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 284 bits (727), Expect = 3.79e-92 Identity = 167/232 (71.98%), Postives = 182/232 (78.45%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. NCBI nr
Match: TYK21927.1 (transcription factor bHLH101-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 220 bits (561), Expect = 1.71e-67 Identity = 118/119 (99.16%), Postives = 118/119 (99.16%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAA0026016.1 (transcription factor bHLH101-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 220 bits (561), Expect = 9.98e-67 Identity = 118/119 (99.16%), Postives = 118/119 (99.16%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FYE6 (Transcription factor bHLH101 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH101 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 8.0e-25 Identity = 71/176 (40.34%), Postives = 113/176 (64.20%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZVB5 (Transcription factor bHLH100 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH100 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 106.3 bits (264), Expect = 6.3e-22 Identity = 76/183 (41.53%), Postives = 114/183 (62.30%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1K1 (Transcription factor ORG2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ORG2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 7.0e-21 Identity = 66/163 (40.49%), Postives = 102/163 (62.58%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1K0 (Transcription factor ORG3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ORG3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 98.6 bits (244), Expect = 1.3e-19 Identity = 68/165 (41.21%), Postives = 103/165 (62.42%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2WZ60 (Protein IRON-RELATED TRANSCRIPTION FACTOR 2 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=IRO2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 6.5e-19 Identity = 66/181 (36.46%), Postives = 102/181 (56.35%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1M0 (transcription factor bHLH101-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495812 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 399 bits (1026), Expect = 1.35e-138 Identity = 210/210 (100.00%), Postives = 210/210 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KYH3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G434980 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 242 bits (618), Expect = 1.40e-77 Identity = 130/141 (92.20%), Postives = 134/141 (95.04%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DDY1 (Transcription factor bHLH101-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1479G00120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 220 bits (561), Expect = 8.29e-68 Identity = 118/119 (99.16%), Postives = 118/119 (99.16%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SJN9 (Transcription factor bHLH101-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold34G003420 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 220 bits (561), Expect = 4.83e-67 Identity = 118/119 (99.16%), Postives = 118/119 (99.16%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HRN3 (transcription factor bHLH101-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 213 bits (542), Expect = 1.15e-64 Identity = 129/221 (58.37%), Postives = 153/221 (69.23%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT5G04150.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein ) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 5.7e-26 Identity = 71/176 (40.34%), Postives = 113/176 (64.20%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G41240.1 (basic helix-loop-helix protein 100 ) HSP 1 Score: 106.3 bits (264), Expect = 4.5e-23 Identity = 76/183 (41.53%), Postives = 114/183 (62.30%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G56970.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein ) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 5.0e-22 Identity = 66/163 (40.49%), Postives = 102/163 (62.58%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G41240.2 (basic helix-loop-helix protein 100 ) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 1.4e-21 Identity = 76/183 (41.53%), Postives = 113/183 (61.75%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019064.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G56980.1 (basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein ) HSP 1 Score: 98.6 bits (244), Expect = 9.3e-21 Identity = 68/165 (41.21%), Postives = 103/165 (62.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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