MELO3C018973.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDSstart_codonstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAATTGGGCAAGCCGAATGGGTCGTCAAAACAAAATTTCCTTCCTTGAAAATTCGAACACCGTTCTACGGCAGTAAAGAAAGGAAAAAAAGAAAAAAAAGAACAAAAAACTCACATCTCGTCCTCCAACTCCTCTTGCGCCTCTCTAATCCGGTGACGCTCTGACGACATCACGACGGCGACCCAACTTCTTCAACAACTTCTTCCAACGCAAGCGAAGACACACCCACGTGAGCGAAGCTGAAGCGTTCGAACGTTTGCGTAGACCTACGGCGTTCTCCGGCCACTGTGGTGTAGACCTACGGCGACTCGAGGGTTCCAACGTCTGTTCTGTAACGTGGGACGTCAGCTTTTGAACTCACGAACAGCGTGTGAATTCCCCTGAAACTCTCAAAAAAGACGTATAGGAAGCGGAAAAGTGGCATCTCAAGCAGAGGTCAATGTTTGGATCTAAGTTTTCCATTTTTGGAACCGGTACTGCTGCTGATAAGGTCGAGAAGTCAGCGAAGAGCGAGTTTTTTCCTGGCCTGAAACTTCGTTCTGATAAAGATGTGTATCGTCCTGGCGATCCGGTTGTTGTTACTATTGAAATTTGTTCCTCTGTCCCTCAATTGGACTGCTCTCTTTTGATCGAACGACTTCGTTTTGAGATTATTGGGCTCCAGAAGTTGGACGCCCAGTGGTTTAGCACTCAGAAGCCAATTCCTGGATCGAAACAACGGAGAGGTTCCAAGTCCATTCTATATGATATTTCTCTCAACCGTTGCCTTCTCCTTGTGTAATGTGTGATTGTTATTTGTCGCATTGTTATTAGCTTTTATTCTGTTCCTTTTTGTAATGTTTCCAGTAAACTCTCTATTTGACAGAGGGACTTTTCATCCTAAGGCAGTATTCCTTTTTGGAGAAATGAATGGAAACCAGTACTTGTCACGTTGTAGAATTTGCATGGTTCTGCAAAATTTTTAATTGTTCATCTATTGTCTTTTTAAGAATTGCATCTGTTTTCCTAGCTGATGTAGTTCAATTTCATGTCTTTTGGTCTTGTCAGGTGAATACATTTTCATGGACTGCTCGGTACAGTCAATAGTTTCAAATCAGATAATATCTTCGGGGGCTATGAAGTCATGTAAGCCCATGTTGTTTTTGTATGCACAACATTTCTGTATCTCAGTTGTTGATATGCATGCCGTTCACTTGAATATTTTACTCAATTCACATCCTGGGACTGTTGTCCCTTTAGTTGATTTATAGAGTCTGAATTTAAAGGAGTTTTTGAGAAAGAGTAAATGCTCTCTTCCAATATTGTTGATTGAAAACTCAATTTTCAAGCAGAGGTCCGGCCTCTTAAATATACAATCAATGAAGAAAAAAATGAAGGAAAATCAAACTTATCAAAGGGTTAGGAAGTATATATAAAGAAGTAGACTACGATACCTAATGCAAATAAATGCTGAAGAAAGTCGAGCATGGAAGATGATAAATACAAAAGTGAGAAATGATGTACAGAGACAAAACATAATTGTCTAAACAACCCCTCTCAAACAAGGAGAGGGAGGGAATCGAAGCCAGAGATTTGTCATGAAGCACCGAAGAAAGATGAGGAGTTAATGTTTAGTTAGACAATCGACTAGTTGATGTGGAGAACGAATATGCTGGATAATGAGCTTATAGGAAAGAACTTGATTACAAATGAAGTGAGCATCAATTTTTATTTGCTTGGTGCAAGCATGATGAATGAGCAATAGCTACAGCAAAAATGTTATCATACTGTGTAGTTGAGGGAGAACAGAGGTTCACACAAAAATCATGAAGATGGAGGGGATCAAAGAAAGACACAATAGCCTCTGGCCAACTTGCGATCATCAGGAAACGATGCCAATTTACATTGCAAAGCTTGAAAGACAGAGGACAAAAGTAGGATGAAGGAGGAGACTGAGTTGAAGAGTTCTGTAAATAACGAATGGTACACTTGAGAGCACACTAGTGAGGAAGAGTGGGTTCTTGATTTAATTGATTCAGTTTGTTGACCCTAAAAGCATCTTAACTAAGTTGATCTCCATAGCGCTTGGATCCCCTTCCTTTGGTTGGGGGTTTTTTTGTTGGACTTGTTTTTTTTGTATGCCCCCTTGTGTTTGTTCATTTATTCTTAATAAAAGCCGTCTATAAAAAAAAGTTAAGATTCCACTTGAGACCAATCAACAGGAGGGTAAGTTGAGTGAGTCTACCAAAAAATTGTCGCTGCTTGATAAATGCCAGACTTAGCACAGGTGACCATGGGATGGGCATTAAGGGGAGGGTGGAGGAAAGGAGGACTAGAGGTCGATGATGAGGAGAAGGACAAAGGTAAGAGGGACAATGGACATACAAAATTAAAGGGTATACGGGAAGTTGTGCTAATATTGGTTGGAAGGTGATGACAAGGTTAATGTGGTGACTGAGATTGGTTGAAATGAATTTTTAGTTGGGAAAGTGGGTGGTAGAGGAAGGCAAGATAGGGTAATATTAGTGGTAGTAGGTAAAGTATTGGGGTCCTTGGAGAATAATTTAATGCAAGGAAACTCATTGTCGTTGAAACAACCATGGCGAGAGGCAAATTATTCCGTTTGGGGTAAGACATCGATAGCCCTTTTAGTCATCATTGTAGCCAATGGACGCACATTATTGTAATTGTAAGTAGACAAAAGTCGACCTTTTCTTGTTGAAAGGGCCTCAAACAAGGGTAGCAACTAACAAGTTGTTCCAAAGGTTTTGAGTTGGTGAAAAGTCTGGTTGATGGACTTTAAAAGTTTTGCAAGGACTTCAATTGTGAATCATGGGTGATGATAATTGTTGATGAGATATGTGGCAGCATGAAAGGCATCCCACCAATAATGCAAAGACATAGGAGCTTGAGCTTAAAGAGCAAGACTAATTTCAACCCTGTGTGGTCTAGGAGTTTTTGTTCTTTTTCTTTTGTGTTTTCTCTCTTTCCGATAGAGAAGTGACAAAAGTGACCGCTCTTCTTTCTTTACTTGAGGACTACCCTTTATGTGTGGGAGAGAGGATGTTTAGGATTTGGAGCTCCAATGCTTTGGAGGGATCTCGTGGAAGTCTTTTTTGTAGTTGGTTGATTCTTCTTCCTTAGGAGTGTCGGCCTTTTTGTTGTTAACACGATGGAAAATGAGGTTCTTTACTTGAAAACTTTTACACGTCCGTGCTAACATGATGAATTAGCTTGTGAGGAAGATGCCGTTGTTTGTTGGTTCTTTATGTTGTATTCTTTGTCAAATGGTGGAGGAAGACCTGAACCATATTCTATAACATTGTGAGTTTGTATTTGTGATTCTTTCTTCCCAACGTTTGGTATCATGTATGGTTGTCACGGTGACACTAGTGTTAGTTTCTTCTTAATCTGCTTTATGGTAAGATCTTTAAGTTCATTCGGAAATGGAGATGATGAGTTAAGGGGGCGTCAACCTAGTTGAGATGTGCGGACGCACTTCTGATATATAGTTACTTTCATTTCTTTTTGTTTCCTATATACTTTGAGCATTAGTCTCATTTCACTATCCTAATGAAGAGGCTTGTTTCTTGTTCAGAAAAAAAAAAAAAGTTTTTATAATGATATTGTGCTACTTCTTCTCCCAGAAAGGAAGATTTTAGTTTTACCCACACTTGCAATGTAACTCTGTGAAACATGAGCATGAAGCTATATGAATATTCTTCCGGTGCTTCATTTTGTTGAAAGCTACTATCTGTTTTTCTTTAAAAGTTCAGATATATGGAATGAGTATTGATTAAAAAAAAAATACTCATTTTTCTCATATCCAAGATGACAAATTGTTTCTTTGTGGCCTTATTTTCCACAGATTTGACAGGTTGATAGCTTTTCTGGTCTCCGTTTGGAACTTTTTGTAACAATATTTATGTTTTATTTCTTTATTATTTAAGCCAAGTTGGCTTGGGTTGGTTCCTCATAACCTTTGTTTCTTCTGATATACATATGTGTACCTGTCTTTCAATCTAATGTTCCACTATCAAAGAAATCTGTGAATGATGATGTCTTATATATGGTTGGTTTCCCATGATTGGTATGTAATATGGTGTACTGTCGTCATTCCTGAGTCTGTTTATGTTTATATTTGGAGCTCACGATAAAGCTCTTTCATAGTAATGATTTTAAAAACAAAGCCACCCGACACAAGTCTTATATTAAGGTTTCATTTGTATTTCACTGCTTTAATTTACCATTCTGGTTATGTATGGTGATTCTGAAAATGTTAATTCTTATTACAGATGTGGTTCGATCAACGCTTCCTACATGCATACCACCATCTTACAAGGGTGCCACTATTCGCTATATGTATTGTGTTAAAAGCACATTAGTAGGACGATGGCTATCACAGGAAAATTGTCGATCTCATAAAGAGTCGCCAATGGATCAAATAGAAATGGTTTGTGTACTTGTTTCAAAGATGAGCGAACAATCCTTCTTTGATTTGAATTGAATAAACATTAGGTGAACTGCATTAGGAAAAAAAAAAAAAACATTAGGTGAACTGCAACTAGAATTTGTTTTTGACTTCATTTTTTCTTTTAGAAGAACAATGCTCTTTTCAGTCCTACTTACTATTGCTACATTTACTATTCTTCTCACATACCTTTCATGCCTGAATCCCTGTAACCAACTAAGTGCTTTATCCAAGTATACGCTCATTGAATGGGTACTTCTTATCAATAGCAATAAACATAGGTTCTTAAATTTTATTTTTTACAATGCATTGCTTTTCAGTGGTAATGGATGTTTTTTCTATTTCTCCACCACAAGATTTATATTCTTTTCTTTTTGTGGATTTTATTTTCAAATCTTATGTACATAAACATAGTTGTTAAAATTAAGTTTTCAATTACAGACAAGAAATCATTGCATGGATTTATGATTGGACTAGAGAATTGGAGGATAGTACCTGACCCTTTCCTCCCTATGCATGTTTTCTGTATTTCTTGTTAAGATA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ATGTTTGGATCTAAGTTTTCCATTTTTGGAACCGGTACTGCTGCTGATAAGGTCGAGAAGTCAGCGAAGAGCGAGTTTTTTCCTGGCCTGAAACTTCGTTCTGATAAAGATGTGTATCGTCCTGGCGATCCGGTTGTTGTTACTATTGAAATTTGTTCCTCTGTCCCTCAATTGGACTGCTCTCTTTTGATCGAACGACTTCGTTTTGAGATTATTGGGCTCCAGAAGTTGGACGCCCAGTGGTTTAGCACTCAGAAGCCAATTCCTGGATCGAAACAACGGAGAGGTGAATACATTTTCATGGACTGCTCGGTACAGTCAATAGTTTCAAATCAGATAATATCTTCGGGGGCTATGAAGTCATATGTGGTTCGATCAACGCTTCCTACATGCATACCACCATCTTACAAGGGTGCCACTATTCGCTATATGTATTGTGTTAAAAGCACATTAGTAGGACGATGGCTATCACAGGAAAATTGTCGATCTCATAAAGAGTCGCCAATGGATCAAATAGAAATGGAAGCTCGGGTTCCATTACAAGTGTGGGTCACTCAGAAAACTAATGGCATGCTAATGGAAGAAGGTCAAAATGATGCCTTTCAAATGGATGTCTTTTGGAAAGAGATGGAAAGTGACACTGACTGGATCAGAGCAAATGATATATATGCTGGCATTGATGAAGGATATGATAGCTCAAGGGATGAGATCTCATCTGTCTCGTCATACAATCCTATGAGAGAACCTTTTCATAGAACATTTGGAAGTTCACTGTCATTGCAGTCATCGGCTGGAAGATCTTCAATAAAGATTGCTCCTTTTATTGAAGGAGAGCGATTAAGTTTATCTTCTAATGTTGCACGTCCTAGGGTCTCTGTTGCTGAGGTCCTATATGAATCTACGGATGTTGCATCACCTCAGAAGTCATTTGCAGCTGTCTCTCCCAGCCAGGTGTTGAACTTTGAGAAGAATCAGTCAACGGATGATGATGCTGGAGTAGCAACTTCACCTAGGCCTAAAATTATTGAACCTGTAGCATCGGAAGGTTTTATTCGAGGAAGATCTTACAATATCAGGGTAGATGACCAAGTATTGCTTAGGTTTTGTCCAAAAAACTCTGATTCAACCTATTATTTTAATGAACCAGATAGGTGGAACTCTTACCTTTTTTCATGA MFGSKFSIFGTGTAADKVEKSAKSEFFPGLKLRSDKDVYRPGDPVVVTIEICSSVPQLDCSLLIERLRFEIIGLQKLDAQWFSTQKPIPGSKQRRGEYIFMDCSVQSIVSNQIISSGAMKSYVVRSTLPTCIPPSYKGATIRYMYCVKSTLVGRWLSQENCRSHKESPMDQIEMEARVPLQVWVTQKTNGMLMEEGQNDAFQMDVFWKEMESDTDWIRANDIYAGIDEGYDSSRDEISSVSSYNPMREPFHRTFGSSLSLQSSAGRSSIKIAPFIEGERLSLSSNVARPRVSVAEVLYESTDVASPQKSFAAVSPSQVLNFEKNQSTDDDAGVATSPRPKIIEPVASEGFIRGRSYNIRVDDQVLLRFCPKNSDSTYYFNEPDRWNSYLFS Homology
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008455604.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016901787.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1057 bits (2733), Expect = 0.0 Identity = 527/531 (99.25%), Postives = 529/531 (99.62%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_011653362.1 (uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >XP_031739927.1 uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >KGN53681.2 hypothetical protein Csa_014549 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1026 bits (2654), Expect = 0.0 Identity = 515/532 (96.80%), Postives = 521/532 (97.93%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038904898.1 (uncharacterized protein LOC120091119 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 992 bits (2564), Expect = 0.0 Identity = 498/537 (92.74%), Postives = 513/537 (95.53%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008455605.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 956 bits (2470), Expect = 0.0 Identity = 479/483 (99.17%), Postives = 481/483 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAG7013397.1 (hypothetical protein SDJN02_23563 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 950 bits (2456), Expect = 0.0 Identity = 473/527 (89.75%), Postives = 497/527 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0M0 (uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495739 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1057 bits (2733), Expect = 0.0 Identity = 527/531 (99.25%), Postives = 529/531 (99.62%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1F5 (uncharacterized protein LOC103495739 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495739 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 956 bits (2470), Expect = 0.0 Identity = 479/483 (99.17%), Postives = 481/483 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L132 (uncharacterized protein LOC111499409 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499409 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 946 bits (2446), Expect = 0.0 Identity = 471/527 (89.37%), Postives = 497/527 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H364 (uncharacterized protein LOC111460073 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460073 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 939 bits (2428), Expect = 0.0 Identity = 468/527 (88.80%), Postives = 494/527 (93.74%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HKY7 (uncharacterized protein LOC111464493 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464493 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 914 bits (2361), Expect = 0.0 Identity = 464/536 (86.57%), Postives = 486/536 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018973.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT1G50120.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rgp1 (InterPro:IPR014848), Immunoglobulin E-set (InterPro:IPR014756); Has 144 Blast hits to 140 proteins in 61 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 86; Fungi - 10; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 627.5 bits (1617), Expect = 9.9e-180 Identity = 327/542 (60.33%), Postives = 404/542 (74.54%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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