MELO3C018332.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTCTCACAGTCGAACCCCTCGCAAGTTCTTGCTTTCTGCTCCCTCTTTAGTTCCTCTTCGTCCTCAATTTCTCTTTATCTCCCAGTATAATCGTCAACTTTTTGGAATTTCCAGACTGTGAACCACACATTCACTGCCGGCAAGGTGTTTTCTCTTCACTTTCTAGCTTCTAAATGTTCAAATAGGTCTAATTTTGGATTTATGATGCTTCACAAGGTCTTGTTTGCATTTGTATTCATACGCGCCATGGACGGACGCCTATTTTTCTTATTTGCAGACTTATGCAACCGCAATTCTACTTTATCTGCACACTCAATTAAGTCATTTGAGTAGATGTATATGCTGAATTTGTATAGACCCTCTTTCGGGCATCTCTGGCAATGCTGTGAACATAAGGATTTGTGGGGTTGTTCTAGAGGGTTAACACGCATTCCAATCTCTACTGCTCGCTGCTTAGGTTCCAGGTATTTGCATGGTTTCCTAGAATCATCGTGTATGTTTCAAAGAAGTTCTTGGTTTATGCAATATGAATAGGAAAACAAAGAATTTAAGATCATGCGCCCTAGTGGTAAAGGAGGGTCTTGTTTAATACAAGAACTTGGAGGGAATGAGTTCAATCCATAATGATCACTTATTTGGGATTTAATTTCCTAGAGTTTATTTGGCTCCAAAATGCTACGGGCCAGGAAGGTTGTGTCGCGAGATTTTTGTATGTGACCTAATCTGATTTAGACACTTTTGAATAAAAATAAAAGGAAATTCAATAGATATTGAGTGTGTTTATGTGTAAACTAGAGACAAGTTGGTAAGAAGCAAGGACAACTTTGGGAACAAAGTAACTGTTACGAAGTGATGGAATAGTTGGCCTCTTTTTGAGTTGATTGTTATTTAGTTTGGATTATATTAACATGTGCATTATTGCTGTTTTTGGATGATTACTAGTTAATAAGTACACTAATTCATGTATCTTAGGATGTGAAATCGTTGATATGTGTTAGACCTCAATCTCAATTATAGTTGATGGTGTATCAGATGTTAGACGTTTGTCGAACTCGTGATCCACTTCTTAATATTTTCTTGTTCATAGTGATTTAATAGCATGTTAAAAGAGTAAGATCTTTTAGTTTGGCCCAACTTCTAATCGCTTTTATATCTTTAGGCCCAACTTCCAGGTCTTAGACATTAACAGTGTTTGTCAAACTTGTGATCCACTTTTAGTACTATCTTGTTCGTAATTATATAGTAAAACATTTGATGTCAAGAAAATTAGACATCCTGTAAAATTTTCATGTAAAGTTTCTTTTATTTTAGTATAGTGCTCATCTATTTATGCTCTAAAGATTCGTAGTGACTTGTTAGTTTTTCTCTTTGTTGATGACTCAACAACTTTAGGAAAATTATTGCCATGTCTGCATCTGTATCAAACGATTCTGGGATATCAGTTGCATCAGTAGCAATCCAGCCTCCATCTCACCCTACCTATGATCTGCGTGGCATCATCAAGTTAGCCCTTGCAGAAGATTCTGCTGACTTTGGTATGAAAATATTATTTTATTATTTAATATTTTGAAGATTCTATGGTGATGTTTGGGATGACGTCCCATTCAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAATAAAAATACAAATAAAATAAAATAAAAAACTAGTTGCTGAAATTTTCATCTGCCTAGTAATCCTTAGCGTAATTTTTGCTTCTGGTATGGGTTTGATCTTGAGTCTTATTTTGGTTGGATAAGAAGTTTATAGAAGCATTCTGTGAGATTCCTCACTCCTTTCTATACTAATTTAACTATCTTAATGGCAGAAACAGAGGCAGCACTCTGTATTTATATATTTATAATGCCAAATAACAGTAGCTACAATATGAAAAAGGAAAATAACAAGGAAATAACAACAGAAAACGTAAGAACATACCAACTACTCTCTCTAGAGCTAGGGCAGACTCCCTCAGCCGCCAAAGGCTCTCCTCACCATTACATTCATCATATTTTTCATACCTACCCTGATCCCCTCCCCCTACTATTTATAGGACAAGTGCCTGAATAGGACAAAAGATAATATCCTGTTGGGCCCACCTGCTGTTCCACTCTCCCACTACCCCATTTTAATTCTTTCTTTCATCCTTGTTGTCTTGTGTAATTACTTTCTTGCCCTTTCTCTTATACACATTAATAATAGGAGGGCTTACAATACCCCTAGGTTCCAAAGTCACCTTGTCCTCAAGGTGGAATGAAGGAAACTGTTGGTTTATTGAGTACACGGACTCCCATGTTGCTTCACTTTCGGGTAATCCTTTCCACTTCACCAGCCATTCATTTGCTCCCAATTCTGGACTCCAGCGAATGCCCAATACTGGTTCAGGCCATAGTTGTAACTTAAATTCAGCTGTGAGCTTCGGTTGTTGTACTTGTACCGTGTGATGTTTGCCCAGTTTAAGTTTTAGCTGGGAGATTTGGAAAAATTGTGAATTGATGCTTCTGAAGGAAGATCAAGTCTATAGGCAACCTCCCCTATGGTTTCAGTGATGCGATACGGACCATAGTACCTAGGAGCTAATTTTTCGGCCCTTTTCTTTGTTAATGAGCGTTGACGGTATGGCCTCAGCTTGAGATAGATTTCATCTCCTACTTTAAACTTGAGTTCCCTTCTCTTCGTGTCTGCCAACTTCTTCATTCTGTTTTGAGCTATAGTTAGTTTTTCCTTTAACGCATTAATGGCCAAGTCCTTCTCCTTCAACAATACTTCGACCTTATTATTAGGTGTCTTCTTCTCTCCGTAGGATATTAAGGGTGGTGGAGGTCTACCATAAACGGCTTGGAAGGGAGTTGTGCGTGTGGAAGCATGGAAGGTGGTATTGTACCATAATTCAGCCCATGGTATGAACTGGTTCCATTTACTAGGCTGCTCATTACAGAAACACCTTAAATATGTTTCCAAACACTGGTTAACTCTTTCCGTCTGTCCATCTGTTTGTGGATGAAACGCCGTGCTTCGTTTAAGTATTGTATCCATAGTATAGAACAGCTCCTTCCAAAAGTTGCTAAGAAAGATTTTGTCCCTATCCGATATGATCGACTTAGGAATGCCATGCCTTCTGACTATCTTATCAATGAATTCCGCTGCTACTTGCTTTGCTGAGAAAGGATGTTTCAAAGTGATAAAGTAAGTGTATTTGCTCAACCGATCGACCACGACCATAATAACATTCATGCCCCCTGCTTTAAGAAGCCCTTCTATGAAGTCCATAGTCCAATCTTCCAAGATGCGGTTGGGTATGGGTAGCGGTTGAAGAACTCCCGCCGGTTTGGTCGCTTCATATTTATTTCGTTGGCAGATCTCACATTGTTCTACATAATTCTTAACATCTGTCTTCATTCCTTTCCAATAAAGCTCGCCATTCATCCGTTTGTATGTCCTTAGAAAACCTGAATGGCCTCCAAAGATAGAGTCATGAAAGGTGTGTAAGAGGCTGGGTATAAGTGAAGATGATTTAGACAAGACTACCCGTCCCTTGTACAGTAACTTGCCATTCACCAATGAGTATTTCCCTTCCGGTGGATGGTCAGCTTGAAGCTGTTGTGCTATTTGTTGGAGTTCTTCATCTTTCTCAACTTCCTTTGTAACTATTTCCATATCCGCAATTCCTGATGTGGACATTGTATTTAGCTCCAATGGATGTTCCACTCTTGAAAGTGCATCGGCTGCTTTATTTTGTAGTCCTGGTTGATATATAATCTCAAAGTCATATCCCAACAGTTTGGTTAACCATTTTTGGAACTGTCATATCCAATGGATGGCCGTTCTGAGATAGGACTGCTCCTAAACCGCTGCCTGAAGCATCAGTTTCTATCATAAAGGGTAAGGACCAATCGAGTAGTGCTAGCACAGGTATTGTAGTCATAGCTGTTTTCAAACTTTCAAATGCAAGTGTAGCGTCTTCATCCCATTTGAAAGCGTTTTTCTGCAACAGTTTGGTTAAGGGTGCTGCGATCTCTCCTTAACTTTTGACAAAGCGTTTATAGTACCCCGTCAGCCCTAAAAATCCTCTTAAACCTGTTATATCCTTAGGCTGGGGCCATTGTAGCATGCTTCGTACTTTATCCTGATCTGCTTATACCCCATTTTTTGAAATGATATGGCTTAAGTATTGTATTTAGGAATGGGCGAACACACATTTTTTTCGATTAGCATACAACTGGTTATCCCTCAATATTGCAAAAACCATCCCTAAGTGTCTCTCATGCTCAGTTATGTCCGAACTATAGACAAGTATATCATCAAAGAAAACCAGTACACAACGTCTGAGGAAGGGCTTAAATACCTGATTCATGAGAGATTGGAAGGTGGCGAGAGCGTTTGTCAATCCCAACGGCATGACCAGGAATTCATAGTGGCCTTCATGTGTTTTAAACGCAGTCTTCTCAATATCTTCTTCCTTCATTCGGATTTGATGATAGCCTGACTTTAAGTCCAACTTGGAGAACACCGTGGCCCCATGTAATTCATCAAGAAGTTCTTCAATGATCGGAATGGGAAATTTATCGGCTATTGTGATTTTGTTCAGTTTCCTGTAGTCCACACAAAACCTCCAGCCACCATCTTTTTTCTTTACCAACAACACGGGACTTGAAAAGGGGCTGTGGCTGGGCCTGATTATTCCGGTCTGAAGCATTTCTGTAACCAGTTTCTCTATCTCTTCCTTTTGATTATGGCCGTACTTATATGGTCTCACATTGATTGGTTTTTGTTCTGGCAAAGTGAAGATGCGATGATCTACAGCTCTCTTGGGTGGTAAGGTTTTAGGAATGTCAAACAAATCAGAATATTGGTTTAGTAAGAATTGAATCATTGGCAATTCTTCCTCATCACCATGCTGGCTCTGTGTTTTGCTTTCCTTGGACTCATTTTCTGTCTCATAATTTTGCCAATCAATCAGAAAACCCTGGTCTTCATCATCCCATGTTTTTTCTAAAGTCTT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MSASVSNDSGISVASVAIQPPSHPTYDLRGIIKLALAEDSADFGDVTSLATIPSDMLVDAFFLAKEDGIVAGIALADMVFQEVDPSIRVEWSKKDGDYIRKGLQFGKVSGKAQSILVAERVALNFMQRMSGIATLTKAMADAASPACILETRKTAPGLRLVDKWAVLIGGGQNHRMGLFDMVLIKDNHISAAGGISNAIKSVDLYLQQRKLKMNVEVETRTLEEVHEVLRYATQNKTSLTRMMLDNMVVPLPSGDVDVSMLKEAVDIINGRFETEASGNVTLHTIHKIGQTGVTYISSGALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA Homology
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008454775.1 (PREDICTED: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008454776.1 PREDICTED: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016901657.1 PREDICTED: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 733 bits (1893), Expect = 1.58e-266 Identity = 376/377 (99.73%), Postives = 376/377 (99.73%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_011659842.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_011659843.1 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Cucumis sativus] >KAE8648128.1 hypothetical protein Csa_021520 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 713 bits (1840), Expect = 1.89e-258 Identity = 368/377 (97.61%), Postives = 371/377 (98.41%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_031745411.1 (LOW QUALITY PROTEIN: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 709 bits (1830), Expect = 6.31e-257 Identity = 366/377 (97.08%), Postives = 370/377 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038892237.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 694 bits (1791), Expect = 5.54e-251 Identity = 359/377 (95.23%), Postives = 365/377 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008454777.1 (PREDICTED: nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 684 bits (1764), Expect = 3.40e-247 Identity = 356/377 (94.43%), Postives = 356/377 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZU32 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=QPT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 508.1 bits (1307), Expect = 8.8e-143 Identity = 259/334 (77.54%), Postives = 299/334 (89.52%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0IZS0 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os09g0553600 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 476.9 bits (1226), Expect = 2.2e-133 Identity = 237/316 (75.00%), Postives = 283/316 (89.56%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P77938 (Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Rhodospirillum rubrum OX=1085 GN=nadC PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 201.8 bits (512), Expect = 1.3e-50 Identity = 129/301 (42.86%), Postives = 174/301 (57.81%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P30819 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) OX=208964 GN=nadC PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 4.3e-41 Identity = 110/292 (37.67%), Postives = 164/292 (56.16%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P30012 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) OX=99287 GN=nadC PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 165.2 bits (417), Expect = 1.4e-39 Identity = 107/293 (36.52%), Postives = 158/293 (53.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZD2 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495096 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 733 bits (1893), Expect = 7.64e-267 Identity = 376/377 (99.73%), Postives = 376/377 (99.73%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C051 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495096 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 684 bits (1764), Expect = 1.65e-247 Identity = 356/377 (94.43%), Postives = 356/377 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQC2 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447821 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 670 bits (1729), Expect = 7.50e-242 Identity = 347/377 (92.04%), Postives = 359/377 (95.23%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ILM4 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477549 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 660 bits (1704), Expect = 4.83e-238 Identity = 343/377 (90.98%), Postives = 357/377 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM89 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022503 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 633 bits (1633), Expect = 3.16e-227 Identity = 331/377 (87.80%), Postives = 349/377 (92.57%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.1 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 508.1 bits (1307), Expect = 6.2e-144 Identity = 259/334 (77.54%), Postives = 299/334 (89.52%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.4 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 505.8 bits (1301), Expect = 3.1e-143 Identity = 258/329 (78.42%), Postives = 297/329 (90.27%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.3 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 492.7 bits (1267), Expect = 2.7e-139 Identity = 256/334 (76.65%), Postives = 294/334 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C018332.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.2 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 456.1 bits (1172), Expect = 2.8e-128 Identity = 230/281 (81.85%), Postives = 262/281 (93.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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