MELO3C012309.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41

Overview
NameMELO3C012309.jh1
Typegene
OrganismCucumis melo var. reticulatus cv. Harukei-3 (Melon (Harukei-3) v1.41)
DescriptionDNA repair REX1-B protein
Locationchr10: 1318236 .. 1328301 (+)
RNA-Seq ExpressionMELO3C012309.jh1
SyntenyMELO3C012309.jh1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTCTAAGTTGGGAGTCCACTGATGAGCGCGCCAGCCCCATCCAAGAGCCGAGGCGGGATTCGAAGGCGGCAATCGCTTCCGGTGAAGGCGTTATTCAGAAAGAACCCCGGCGGCGGCGCTATGGCAAACCGGAGCTTCCGCCATGTCTGAATCTTCTCCGTTAGAATGCACAATTTCAAGCTACTCCCACACTTTCTCCTACTATCATCGAAGAACATCGATTGCAACAGTTCCAGCCTTCATAAACTTCTTCTACCGTCTCTTTCCTCTGCCGCTTCCCGTGCTAGGCGAGGATTCTATCAGTACGCTCCAGGGCCATTATCAGGGGATGAGTACGAGTGCTATAATGAAAACAATAAGGTTTGTTCTTTGTTTCTCTTCTTGTTTGTTCATATGTTAATTTCATGGAGTATAATGTCCGTAAACTGTTTTCAATTTTCTTTCGAAGACACTAACTGTACTCTTTGAGTAACTAATTGAATCGTTGGTGATCCCTTGCAAACAATTTAGCTTCCTATAAGATTTAGTAGCCTTTGGTTCATTGGGGATGAGATGGAGAATTTGCTCATTAGTCGTTCTAATTTTGGAGAGGAATGGATGTTCTCGTGATTGGTTGGAATGAGGATAAATTGGAAGTATCTGAATGAAAGAGCCCTATTTTCTAGACCCAAGATTTTATTATTCTAAGTAGGATCTTTGAAGCTGCTTGAGCCAACATTGGTGATCCATGGTGACTTATTATTGTCCAGTGAGAAATTTAAGGGCACTAGGCTTGGATTGTACATCATTCAATTCTTGTTAAATTGAGTAGTACAGATATAGGCGACCTTCCTTTTTTCTTTAGCATCATTGAATCATTGATGTCTTGAGCTGACTGGTGTCCGAAGGCCCATAATTATCACTTAGCTCGGGGTTTAGTGTGTGGAGAAAGAAGTCTCATCTTACTCATTTTGATTCTCTTTTGTTTTGGTAGGGAGGAACCGGGAGTGTTTTGAATAAAATTACTACTTTCATTGAATTGATCTTCAACCTCAAACGTAATAGAAACAACCCCTTTGCCTCTATAGTCAGAGTAGATTGTGATATTGTTAAGCTGTAGGCAAACGATGTAAATTTCTACTTATTATCTTGATATGAAATATGTAAAAGTCAGTATGTCCTAAACTTCAACATTTTAATTTGTCCTTGCCAAATTGTGCCCCATTATGTTATTTATGTAATATCTAGACATATTGTTTGATTTGAAAGGTATCTGTTGAACAATTATACTTTCCAGTTTTAGATAGGTAAAGATCTTTGATGCTTAAGTGTAGTTTGAGCTTCAGAACCGAGGCCCTGACATTCACAAGGAAGGCAAGTGCCTTGTGCTTCCTGTTCAAGATGCCATGTCAGATGACAAATTCGAAGAGAGAGTTGTTATTGGTGATGAAAAAAAGAGCAAATTCACAAACGTTGGCAGCTCCCCGGAGAGCTCACAACATACCTTCCTAATGACGGCAGGGCATTGCTATGTGGACCAAGCGAGAATTGTCGCTAACCTATTGATGAACTGTACTAATTTATTAGAATTGTACCAAATTCATGCCCATGTTTTAAGAACCAACATGTTGGAAAACCACCCTTCTTCATTTTACTGGAACATCATTGTTAGATCATACACTAGGCTTGAGGTCCCAAGAAAAGCCCTCTTTGTATACATCGCCATGTTGCGAGCAGGCATTTTGCCTGATTCTTACACACTTCCAATTGTATTTAAGGCTTTATCTCTAGCTTATGCTTTTGATTTAGGATTACAATTACATTCAGTTGCTATACGGCTTGGTCTTGAGTTCGACCAATATAGCGAAAGTGGCCTCATCAGTCTGTACTCAAAGGTAGGAGATCTTGAGTGTGCATGTAAGGTCTTCGAGCAAAACCAAAACAGGAAGTTGGGTTCTTGGAATGCCATTATAGCTGGTTTATCTCAAGGTGGGCATGCTAAAGAGGCAGTCAATATGTTCATTAAGTTAAGACAAAGTGGGCTCGAACCAGATGATTTTACAATTGTTAGCGTAACATCAGCTTGTGGTAGTCTGGGCAACCTAGAACTGTCTCTCCAAATGCACAAATTTGTGTTTCAAGTGAAAGTCGTGGGGAAATCAAACATTTTGATGTTAAATTCCCTCATCGACATGTATGGAAAATGTGGTAGGATGGACTTAGCAATGAAAGTATTTTCAAACATGGATCATAGAGATGTATCATCCTGGACATCGCTGATTGTAGGTTATGCAATGCATGGACAAGTGAAACAAGCGCTCGAGAACTTCCGATTCATGAGAGAAGCAGGAGTTCCTCCTAATCAAGTTACATTTGTCGGGGTACTAAGCGCTTGTGTACACGGTGGGATAATCAACGAGGGAAAATATTACTTCGATATGATGAAAAATGTTTACGGTTTCAAGCCACAACTGCCACATTATGGATGCATGGTTGATTTGCTCGGTAAAGCAGGGTTGCTTGAAGAGGCGAGAAGGATGATTGAAGAGATGCCGATGAAGGCGAATTCGGTAATATGGGGATGTTTGATTGGAGGTTGTGAGAAACATGGGAATGTGGAGATTGGGGAATGGGCAGCTAAACATTTGCAAGAATTGGAGCCTTGGAATGATGGTGTTTATGTGGTTTTGTCCAATATTTATGCTACAAATGGCATGTGGAAAGAGGCTCAAAAGATGAGAGATGTTATGAAACAAAGGCAACTTGCTAAAGTTCCTGGATATAGCTTGGCTACAACATTAGATTGAACTCTTTTCTTACGTCTTTTTTGTGTTTCTCATAATCATTTTCTCTAAATTAATTTACAATATTCTTTTTAATCTCAAGTTTTTCACAATCTCTCTATATGTAATCTCTATATGTAATTTGGTCTGAACTTCCAAAATAATTACAAATTAGTGATACAGGATTTGATCGATCAATCCATTTTTAAATTTCCTTAATATATGTAAAGCTCAAGATTGAATGTGTGTGGTTTGTTTTAGAACTCCCTACGGCAAGGAACTGGAGGCAATTTTGTGAAATTGATTTCTAAACAATCAAATTTATGTTTGATAACAAACTTTTAATTTTCAATTAATATGTTTGATAATAAAAATGATTTAAAACTATCAAATACTAAATGACAATTGTTATTTTTCTAAAATCACTTTCATTAAGTTGTCAAAACCATATTTTTGTGCCAAAGTGATTTTGGCTGCCAAATGCAATTTTTATAGTTTAGTTTTTTAACCTTAGACTTTGGAGATAATTTAAAATTTGCATGAAAAATCAAGAGAAAATTTCCATACCTTTTGCATACAATGAGTGTTGAAAAATTTCTCGTGAACTAAAAAAATCAAATGTCATTTGGTTAATTATATGTTTTATGTTATTTTACATCACTATTATTAGTCAAATTACCTATAAATAATAATGAGTTATTTATTTTATGTCAATTTTTAAATTTTTCTTTGAGATCATAACTTTTTTGAATTTTTTCAAAAATAAAAAAATTTACCATCTGTTTACAATTCATAAAACAAATTGGTAGAGATAAAATTTATTACACCTAATATCTTTAAGGTAAATATTTTTGTTATATGTTTTACTTTTTACCATTTACCTTTTTTTTTTTCCCTCCTCTTTAGGACTAATGGAGTAATATTGCAATTTTGAAAATAACATGAAATCCTTTGAACACTTTCAAGTTCACGGAGGTATATATATAAAGAAGTATGAGACCAATTGAGGCTTCATTACATCGCTGAACTAAACTAAAGAATGGAAGATTTTGAGAAGAAGCTCTCTCTCGATGAACAAATGGAGGAAGACCGGAGAACCGATTCCTCTAACACTCTCTCTTTGCTCCGTCAGTTTCTCGAAATCCAGCAGCGCAGAGCTGAAGCTTATTCCAAGCTTAAAAGGTACCATTGATTTTGGTTCTTGATTTCGTTTTCCTTTGAAATCTTGATCGCAGTTTTTGAAAACAAATGAAGGATTCGATTGTTCGAGTTATGTGTATGCGTACTACTTCTGTTATACTGTTCTTCCACGCCGCAGGATTTTGTCCTAAACCTCGTTCGAGGTACATTTTCTTTCGCAGTGGTTCCATACAGATCGATGATTATAAAATCCTAAACGAATTCTGTTAGTCTTAGTCCTTAACGAGCTTAGCGACGAAGTTTCGAGTGTGTTTTTGCGAATTATTTATGGAATCTTTGAAGTCTTTATCGTTTTGTTAATTCGCAGGGGGTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGATATCTTACCAACAGCTTTGCAGTGAGATCACTACGGAATTCAGTAATTGCTCTAAACAAGTTCGTTGCACAATTTTCACAGTATTTCGTTGAGGCGTGATGTTCTTTAAGCTTCCTTGTGAGATTTTCCTTTTTGGACTCTCTTTTGTTGTAGGTCATTGACATCGAATCGAATTTCCGGAATTCAGATCATAACAGGCTCGAGTTAGCCAACCTGCTTAGATCTGTTCAAGAACAAGAGAAACAGAAATTGCACCTGGTATGTCATGTCCAGAAAGTTCTCTAGAAAAATTTGGATTTATTTTTTGGCAGCATCCTTTCCGCCTCTGCAAAGATTAAGTTTGGCTAATTGTATAATTTTAGACTTCAAAACCATGCCGTGCTTTCATTCCATCCCGATCAGTCAGTTAAACTTGTAATTCTAAAAATTACTAAAAAATAGTAGGATTGCCGATTGCTAAGTATGGAAATAATGCATAAATGTTTATCACATTAAGACAATAATCCTTAAGGCGTAAGATACAAAAGATCTTTGAGACGTTGTTCAGACCAGAAACTCTGCCTATTAGTAAATCTAAATTGTGTAAAGCATAATATTCCGAAGTCCAAGCTCCAATTCTAGCGAATTGAAGTAAGATGAATATTCGGTTCACATTTTCTAAGGGATTCTGGATTTGGTACAAGTATCATTTTATTTTTTAACGGTAAAATGGTTGTTCTTATGCATGTTAATAGATTGATAAACCTTCACATCAATGGATATATGGAAATATTCAATGAAATGTTTCTTATCTAAAAAAATGGATATATAAAAATATTTGTGGTCTGTCATGTCTTCACAAGTAAGTTACCTCCAGTGGATTTGAGTGATCGCTCTTAAATATCCATCAATGATGCACTGGTTTTCCTTTAACTCTATCTTATTATCCAAACAAGTTTTAAGCACGAGTAACTACCGATCATTTCATCAAAGAATTCTAGCCAGAAAAATGCAGGGTATAGGAGATAAGATAATGGCATTGGTGTAAGGAATTTCGACCATCTAAACTGCATTGAACCAACTTTTCTTTGTATTACAATGAGCTGCATTTCTAGAAGTTAGTCTTGGAACGAAATGATTCTACTACTGTTATTCTCCACTCATCAGATGATTATTTCCTGTTTTCAAAAGCAGCTTTAGCGAACTTTTCTAGACGTGAAATGACACCTTGATTTCCCCTTTTTCCTCTTTAAATTGCTGAACTCAATGACGTAGATTTTCATTTTAATTGCCCAAGTTCTTCAGTAGTGGTATGTAGCTTACCTTTGACTGCTTTCTCATATGTCTAATGCCATAAGGTTGAATGCTAATAGTCGAGACAAGAAATCTTGTCCGTGAATGTGCTTTTGTTGGACATAAAGTTTAGTAGTTGAGTGATCTTGGATTATCTTCACCTAACTATTATTTCCTTATAGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAGGCCGGCCGCCCATCAGAGCGCTTGGTGAGCCACGAGAATTGTAGAATCAATGCACCTCGAGAGCATGAGTGTGTGCATGTCCATGAGATAACTGAAGCTTCGGGTACCGAGGAAGCAGAAGCAGATGCGGAATACGACAATGCTTTAAAGGAAGCAATCAAAGGTGTGCAGGATGCTGTGACGACCATAAATGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATCGAAGCTCTTGAAGATAAGTAATCTTACAATACATCTATGATATTTTGAATATCTTTCTTTCTCTGCAATTGAATTGGTTACCATTTACCTATAAATGAAATGAAGCACATCAAAAAAGAATTGATAAAACAAATCAAATTCCAATTCACTTTTGTTCATCTCTAGTTGCTCCCTAGAATTCCTACATAGAATAATTCTTGAGAAATTGACTAATGGTGTTTGTCTCGCTCACTACAAAAATCCAATACTGCCCCTATATACTAAGAACAGGCAAAAGAAAAGGTTCTATTTTCTACTCGATTTTCTTGATATTTCACCTTTTACGACACATATCAACTAAATTCTCAAATTTTAGCCCCAGTTTTTGTGAAATAAATCAGGGACAGACAGATATTGGGAGAAGGTCAAGAACACTCTTTCAAGTGTATGGTAAGAAGCTTACGGTAATCCTATTTTAAAAAATAAATTCGTAAGATATACAAAGCAAATCGTAAATATAGAATTAATGCTATATAATGTCTCATAACATTATTGAAATTTATTTTATTTTAAACTCAAATCAGGGATCGAGGAACTGAAGCTCACGCGATCATCAGAAAAAGTACCCACTCTTTCCCTTCCTTATTTCACACATCTACCCTCCTTTTATTTCTATATTTTAAATCCTATCATTCATTTAAATTGTAAATAGTAACCATCTCATCTTTTGTTTTTAATTTTTTAAAATTCAACTTATTTTTTCGATTTCTAACCGCGATTTGCATTCTTTTTAGGTATAGTTATTAAATTTTAAACTAAATTCTAAAAACAAACACAATTTTTTGGAAGTTAATTTTTTTTTTTAGTTTTTAAATTTTTATTTGTTTTCTAAACTATTGGTTGAATGTAGCTAACAAATAAATGGTTAAATTTTCAAAAATTAAACAAAATAGTTATCGAAAAAAGTCTTAATTAATCGGCACCTTGGAATTAAAACTTTCCTTTAATTAAAATTTGAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATGGTTGAACCTCAATTCTCTCGATAGAGAGTAGCTTGGTTTAAAACAATACAAAACTATTTCATATATTTCCCGAAAAAGAAAACTAAACGAAGTAGTGTAGACCCTAATATTTACTTATTTAGAAAAGTGATAGATATGATAAAACCATTTTCCTTTTAAATTATTTTAGTTCATTTTTTATTAATTCAAAACTTAATTAGTTTACCAAATGATTTACACTTGCCTGTTATTTAGTGATTTTTTTTCTTCCGGAAATTAGTTTTTTAAAATTATCATTCCCGAAAAGAAAACCATTCCTACTTTATTAACTTCGATTATTACTTTAGTTAAAATTTAATAATTTTAGTCCTTATGATCGAAAGCCTTTCAACAGCCGGTACCACTCAGTACTCACCCAGGGAAAAACACGCACACACGGTCTTTTATCTTGTTTTTTTTTTCCGATCTTCCTCCTATATATTTTGCACTCACACAAGGCTGAGTGGAAATGGTTCGGTTACCGAACAAAAGACTTTTAAATCTCTACCTATCAAACCAAACTGATTAATTGTTTTGAACCGAACTGTGCTTCTGCTATTCGTTCGATTTTGGTATTTTTTAAAAATTCAAAAACAATTTAGTTCGATGTAGTTTTAAATTGTAGTTTTAAATTCAATTCTATTTTTTAAATCAGAGACCTTTCGATTTTAAATTTGATTTTATTCTTTAAATTATATAAAAAAAAAAACTCGATTTTAAATTCGATTTTACTTTTTTTTTTTAATATATAGATATATAAATAAATATACATAGTAGTTAAAAATGATTTGATTGAGTTTCAAATTTTAGTTTTAAAATATGAATACGAATAGAATGGATTCGGTTTTTAATATTAATTTAAATCAAGCTGAACTGCATTTTTCAATTTTAATGATATCTCTGGTTTGGTTAGATTTTAAGAAGGTTGGAATGGCCGCACATCCCTACAATCTGATATATTAGGATGGATGCTGGATTTGTTGGGAATCTGATATTTAACCAAATATAGTAAAATTATTTATATATCATATCTTTACAAAGCCAAATATAGTAAAATTCCAGCCAAGCATGCTTTCTTTAATTACAATCAAACGAAACCTGTGCCTTTGACACTCATCAGATGATAGAAGCATAGTAGGAGGAACAAGCAGTAGAATTTACACCGCACAGTAGTAAACTACCCGATTCTATTCTATTCTTGAAAACAACTCGATCCAACAGCACTCTCTCCGTGGCGTTTTTCAAATTTGTATCATTCAAAATATTGCAATGCTTTGCACTTACTACTTGCGATTCTGTGGTGTCGTCTTTCTGAATGTACTTCCCAATGTCGTGTTTGAATCCGTAGCTTTCATGTGGTTTCTTGGTGAAGGAAAATTGAGCTTTGCCTTCCCCAAGTTTGCTTAGGTTACTGCTTTTGTAAGATGTCTGTCCTAAATTGTATTGCTCAACCTCGGTTGAAGTTCCAATTGCTGGTTCCTGAATGTCCAGAAAAATGCATTATTTTTCAAATGCATTCAAGAAAGTTGAAGAAATAATTTTAAATTAATTGTTTTGTTTTGCTATGAACGAGAAAGATTTGAAATAAATATGTTCTAAATTTCATGTTTGGTTTGGTTGGCAATTAAACTAGCAAAAGAAAACTAAGAATTTACTAATATATGTTTGCCTAGGATGTGTTAATTGAAAAACAAAAAACGATGAGGTTAATTACATAATTTTACTTTTATATCCTACGAAATTCGACGAACTCTAAGTATTTTTTAGCCAAGAAAGTTTTTAAATAAAAAACATGAATTGAAATCGTTTCAGATTCTAAAATCACTCATGTAGAACCAAATAGGGGAGAACATGATAGACCGAAGAATGGTCGATCAGGTTCATTTCGGAAAGTTTCAAATCAAAAAATTACCAAAAAATTATTTTTAAGTGTTAAATCAACACGACTTTGACCGATCCTTACTCATCGATATCGAGGTCGGTTTGACACATAACCAAACCGACTATGGTCGGTTCGGTTCGGGATGACCGACCGATGATAACCCCACTAGCAAATAACGAAATTTATTTAAAACCCGTTATGAATTAGAATCACTCAAAATCTTGAGGTTCCAAACATAGCATCTTTTATTTCCATGAAAAGAGTAAAGATGACTAAACAGGAAGAGCACAATTGATATGTTTGCAATAGAGGAAACTTGGAAGTAGAACTGATACTACAGTGGGAGAAGTGGTGTTAGTAAATGGGTTCTCACGCAAATTCCCCTTTTCATGATTTCATATAATACGGAACCCTATTTGTTTGAGAATCAAGTTTTTAAGGAAAATAGGAAAAGTTGAAAAGTGTTCGGATTATCTATGAAAAACAAAGTTTTACAAGATTACATTTTTTAAAATAAATACTTACATGATTAGGATCTTTTCATAAGTGTTTATATATGTAATTTTTAAGTTTCGAATATTTTCCTTAAAATAGATTATTTTTCAATTTCATTTTTTTAAATGCACTTTAAAAAATTATCATACACTTTATTTTTTTAAAATGATTTTTTTTCTCAAATTTAAGTTCCATTTTCGATTAACTTAAGAAAAAAAAACTTTTTTTAAGAAACTCATTTTTGTTTAAACTAGTTTTTGTGAAAATTGTTTAAAATACATTTAAAAAGTTTGAAGTAGCTTCCAAACACTCTCATTGTTTTCAAAAATAACTTATTTTTTCAAGAACTAATTTTTCTGTGTCTAATGGGCGCACCTACATTATCGTGGCTTAACTAATAAGACAGAGCAACCTCGTGAAGGACTTAATTGAGGCATGAAAGAAAAGGTTATATGAGAAGAATATATTAACCGATTATACGATCTCCTCGGAAGGCTACCCCTAGTTGTCGACGTGAAAAGGGAAAAAGAAAAAAAGGAAATCATGATAAGTGATTCGAAAGTGACGAAATTCTCAAAGAAACAAAAGCTCAAGTAATGACGGAAAGCACTTCGAACTTACCTGGGGGGTGGTGCCATCTTCC

mRNA sequence

GTCTAAGTTGGGAGTCCACTGATGAGCGCGCCAGCCCCATCCAAGAGCCGAGGCGGGATTCGAAGGCGGCAATCGCTTCCGGTGAAGGCGTTATTCAGAAAGAACCCCGGCGGCGGCGCTATGGCAAACCGGAGCTTCCGCCATGTCTGAATCTTCTCCGTTAGAATGCACAATTTCAAGCTACTCCCACACTTTCTCCTACTATCATCGAAGAACATCGATTGCAACAGTTCCAGCCTTCATAAACTTCTTCTACCGTCTCTTTCCTCTGCCGCTTCCCGTGCTAGGCGAGGATTCTATCAGTACGCTCCAGGGCCATTATCAGGGGATGAGTACGAGTGCTATAATGAAAACAATAAGTTCACGGAGGTATATATATAAAGAAGTATGAGACCAATTGAGGCTTCATTACATCGCTGAACTAAACTAAAGAATGGAAGATTTTGAGAAGAAGCTCTCTCTCGATGAACAAATGGAGGAAGACCGGAGAACCGATTCCTCTAACACTCTCTCTTTGCTCCGTCAGTTTCTCGAAATCCAGCAGCGCAGAGCTGAAGCTTATTCCAAGCTTAAAAGGGGGTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGATATCTTACCAACAGCTTTGCAGTGAGATCACTACGGAATTCAGTAATTGCTCTAAACAAGTCATTGACATCGAATCGAATTTCCGGAATTCAGATCATAACAGGCTCGAGTTAGCCAACCTGCTTAGATCTGTTCAAGAACAAGAGAAACAGAAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAGGCCGGCCGCCCATCAGAGCGCTTGGTGAGCCACGAGAATTGTAGAATCAATGCACCTCGAGAGCATGAGTGTGTGCATGTCCATGAGATAACTGAAGCTTCGGGTACCGAGGAAGCAGAAGCAGATGCGGAATACGACAATGCTTTAAAGGAAGCAATCAAAGGTGTGCAGGATGCTGTGACGACCATAAATGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATCGAAGCTCTTGAAGATAAGTAATCTTACAATACATCTATGATATTTTGAATATCTTTCTTTCTCTGCAATTGAATTGGTTACCATTTACCTATAAATGAAATGAAGCACATCAAAAAAGAATTGATAAAACAAATCAAATTCCAATTCACTTTTGTTCATCTCTAGTTGCTCCCTAGAATTCCTACATAGAATAATTCTTGAGAAATTGACTAATGGTGTTTGTCTCGCTCACTACAAAAATCCAATACTGCCCCTATATACTAAGAACAGGCAAAAGAAAAGGTTCTATTTTCTACTCGATTTTCTTGATATTTCACCTTTTACGACACATATCAACTAAATTCTCAAATTTTAGCCCCAGTTTTTGTGAAATAAATCAGGGACAGACAGATATTGGGAGAAGGTCAAGAACACTCTTTCAAGTGTATGGGATCGAGGAACTGAAGCTCACGCGATCATCAGAAAAAGTACCCACTCTTTCCCTTCCTTATTTCACACATCTACCCTCCTTTTATTTCTATATTTTAAATCCTATCATTCATTTAAATTGTAAATAGTAACCATCTCATCTTTTGTTTTTAATTTTTTAAAATTCAACTTATTTTTTCGATTTCTAACCGCGATTTGCATTCTTTTTAGGTATAGTTATTAAATTTTAAACTAAATTCTAAAAACAAACACAATTTTTTGGAAGTTAATTTTTTTTTTTAGTTTTTAAATTTTTATTTGTTTTCTAAACTATTGGTTGAATGTAGCTAACAAATAAATGGTTAAATTTTCAAAAATTAAACAAAATAGTTATCGAAAAAAGTCTTAATTAATCGGCACCTTGGAATTAAAACTTTCCTTTAATTAAAATTTGAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATGGTTGAACCTCAATTCTCTCGATAGAGAGTAGCTTGGTTTAAAACAATACAAAACTATTTCATATATTTCCCGAAAAAGAAAACTAAACGAAGTAGTGTAGACCCTAATATTTACTTATTTAGAAAAGTGATAGATATGATAAAACCATTTTCCTTTTAAATTATTTTAGTTCATTTTTTATTAATTCAAAACTTAATTAGTTTACCAAATGATTTACACTTGCCTGTTATTTAGTGATTTTTTTTCTTCCGGAAATTAGTTTTTTAAAATTATCATTCCCGAAAAGAAAACCATTCCTACTTTATTAACTTCGATTATTACTTTAGTTAAAATTTAATAATTTTAGTCCTTATGATCGAAAGCCTTTCAACAGCCGGTACCACTCAGTACTCACCCAGGGAAAAACACGCACACACGGTCTTTTATCTTGTTTTTTTTTTCCGATCTTCCTCCTATATATTTTGCACTCACACAAGGCTGAGTGGAAATGGTTCGGTTACCGAACAAAAGACTTTTAAATCTCTACCTATCAAACCAAACTGATTAATTGTTTTGAACCGAACTGTGCTTCTGCTATTCGTTCGATTTTGGTATTTTTTAAAAATTCAAAAACAATTTAGTTCGATGTAGTTTTAAATTGTAGTTTTAAATTCAATTCTATTTTTTAAATCAGAGACCTTTCGATTTTAAATTTGATTTTATTCTTTAAATTATATAAAAAAAAAAACTCGATTTTAAATTCGATTTTACTTTTTTTTTTTAATATATAGATATATAAATAAATATACATAGTAGTTAAAAATGATTTGATTGAGTTTCAAATTTTAGTTTTAAAATATGAATACGAATAGAATGGATTCGGTTTTTAATATTAATTTAAATCAAGCTGAACTGCATTTTTCAATTTTAATGATATCTCTGGTTTGGTTAGATTTTAAGAAGGTTGGAATGGCCGCACATCCCTACAATCTGATATATTAGGATGGATGCTGGATTTGTTGGGAATCTGATATTTAACCAAATATAGTAAAATTATTTATATATCATATCTTTACAAAGCCAAATATAGTAAAATTCCAGCCAAGCATGCTTTCTTTAATTACAATCAAACGAAACCTGTGCCTTTGACACTCATCAGATGATAGAAGCATAGTAGGAGGAACAAGCAGTAGAATTTACACCGCACAGTAGTAAACTACCCGATTCTATTCTATTCTTGAAAACAACTCGATCCAACAGCACTCTCTCCGTGGCGTTTTTCAAATTTGTATCATTCAAAATATTGCAATGCTTTGCACTTACTACTTGCGATTCTGTGGTGTCGTCTTTCTGAATGTACTTCCCAATGTCGTGTTTGAATCCGTAGCTTTCATGTGGTTTCTTGGTGAAGGAAAATTGAGCTTTGCCTTCCCCAAGTTTGCTTAGGTTACTGCTTTTGTAAGATGTCTGTCCTAAATTGTATTGCTCAACCTCGGTTGAAGTTCCAATTGCTGGTTCCTGAATGTCCAGAAAAATGCATTATTTTTCAAATGCATTCAAGAAAGTTGAAGAAATAATTTTAAATTAATTGTTTTGTTTTGCTATGAACGAGAAAGATTTGAAATAAATATGTTCTAAATTTCATGTTTGGTTTGGTTGGCAATTAAACTAGCAAAAGAAAACTAAGAATTTACTAATATATGTTTGCCTAGGATGTGTTAATTGAAAAACAAAAAACGATGAGGTTAATTACATAATTTTACTTTTATATCCTACGAAATTCGACGAACTCTAAGTATTTTTTAGCCAAGAAAGTTTTTAAATAAAAAACATGAATTGAAATCGTTTCAGATTCTAAAATCACTCATGTAGAACCAAATAGGGGAGAACATGATAGACCGAAGAATGGTCGATCAGGTTCATTTCGGAAAGTTTCAAATCAAAAAATTACCAAAAAATTATTTTTAAGTGTTAAATCAACACGACTTTGACCGATCCTTACTCATCGATATCGAGGTCGGTTTGACACATAACCAAACCGACTATGGTCGGTTCGGTTCGGGATGACCGACCGATGATAACCCCACTAGCAAATAACGAAATTTATTTAAAACCCGTTATGAATTAGAATCACTCAAAATCTTGAGGTTCCAAACATAGCATCTTTTATTTCCATGAAAAGAGTAAAGATGACTAAACAGGAAGAGCACAATTGATATGTTTGCAATAGAGGAAACTTGGAAGTAGAACTGATACTACAGTGGGAGAAGTGGTGTTAGTAAATGGGTTCTCACGCAAATTCCCCTTTTCATGATTTCATATAATACGGAACCCTATTTGTTTGAGAATCAAGTTTTTAAGGAAAATAGGAAAAGTTGAAAAGTGTTCGGATTATCTATGAAAAACAAAGTTTTACAAGATTACATTTTTTAAAATAAATACTTACATGATTAGGATCTTTTCATAAGTGTTTATATATGTAATTTTTAAGTTTCGAATATTTTCCTTAAAATAGATTATTTTTCAATTTCATTTTTTTAAATGCACTTTAAAAAATTATCATACACTTTATTTTTTTAAAATGATTTTTTTTCTCAAATTTAAGTTCCATTTTCGATTAACTTAAGAAAAAAAAACTTTTTTTAAGAAACTCATTTTTGTTTAAACTAGTTTTTGTGAAAATTGTTTAAAATACATTTAAAAAGTTTGAAGTAGCTTCCAAACACTCTCATTGTTTTCAAAAATAACTTATTTTTTCAAGAACTAATTTTTCTGTGTCTAATGGGCGCACCTACATTATCGTGGCTTAACTAATAAGACAGAGCAACCTCGTGAAGGACTTAATTGAGGCATGAAAGAAAAGGTTATATGAGAAGAATATATTAACCGATTATACGATCTCCTCGGAAGGCTACCCCTAGTTGTCGACGTGAAAAGGGAAAAAGAAAAAAAGGAAATCATGATAAGTGATTCGAAAGTGACGAAATTCTCAAAGAAACAAAAGCTCAAGTAATGACGGAAAGCACTTCGAACTTACCTGGGGGGTGGTGCCATCTTCC

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGATTTTGAGAAGAAGCTCTCTCTCGATGAACAAATGGAGGAAGACCGGAGAACCGATTCCTCTAACACTCTCTCTTTGCTCCGTCAGTTTCTCGAAATCCAGCAGCGCAGAGCTGAAGCTTATTCCAAGCTTAAAAGGGGGTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGATATCTTACCAACAGCTTTGCAGTGAGATCACTACGGAATTCAGTAATTGCTCTAAACAAGTCATTGACATCGAATCGAATTTCCGGAATTCAGATCATAACAGGCTCGAGTTAGCCAACCTGCTTAGATCTGTTCAAGAACAAGAGAAACAGAAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAGGCCGGCCGCCCATCAGAGCGCTTGGTGAGCCACGAGAATTGTAGAATCAATGCACCTCGAGAGCATGAGTGTGTGCATGTCCATGAGATAACTGAAGCTTCGGGTACCGAGGAAGCAGAAGCAGATGCGGAATACGACAATGCTTTAAAGGAAGCAATCAAAGGTGTGCAGGATGCTGTGACGACCATAAATGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATCGAAGCTCTTGAAGATAAGTAA

Protein sequence

MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREISYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQDAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK
Homology
[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008446706.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489347 [Cucumis melo] >KAA0034618.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold65G006350 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK09169.1 uncharacterized protein E5676_scaffold475G001610 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 377 bits (967), Expect = 3.25e-131
Identity = 201/203 (99.01%), Postives = 202/203 (99.51%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60
           MEDFEKKLSLDEQMEEDR TDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI
Sbjct: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRGTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60

Query: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120
           SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL
Sbjct: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120

Query: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180
           LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ
Sbjct: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180

Query: 181 DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           DAVTTIN+HMEEVRYEIEALEDK
Sbjct: 181 DAVTTINDHMEEVRYEIEALEDK 203

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004135056.1 (uncharacterized protein LOC101210078 [Cucumis sativus] >KGN52147.1 hypothetical protein Csa_009032 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 374 bits (959), Expect = 5.39e-130
Identity = 199/203 (98.03%), Postives = 201/203 (99.01%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60
           MEDFEKKLSLDEQMEEDR+TDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI
Sbjct: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRKTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60

Query: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120
           SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFR+SDHNRLELAN LRSVQEQEKQKLHLTAQIQL
Sbjct: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRSSDHNRLELANQLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120

Query: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180
           LKKAGRPSERLVSHENCR NAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ
Sbjct: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRFNAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180

Query: 181 DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK
Sbjct: 181 DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038892275.1 (uncharacterized protein LOC120081463 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 351 bits (901), Expect = 4.15e-121
Identity = 188/206 (91.26%), Postives = 199/206 (96.60%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTD---SSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSG 60
           MEDFEKKLSLDEQMEED+RTD   SSNTLSLLR+FLEIQQRRAEAY++LKRGFDEYMTSG
Sbjct: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDASDSSNTLSLLREFLEIQQRRAEAYARLKRGFDEYMTSG 60

Query: 61  REISYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQ 120
           REISYQQLCS+ITTEFSNCSKQVIDIESNFR+SDHNRLELANLLRSVQE+EKQKLHLTAQ
Sbjct: 61  REISYQQLCSQITTEFSNCSKQVIDIESNFRSSDHNRLELANLLRSVQEKEKQKLHLTAQ 120

Query: 121 IQLLKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIK 180
           IQLLKKAGRPSER+VSHENCR NAPREHECVHVHE+T ASGTEEAEA+AEYDNALKEAIK
Sbjct: 121 IQLLKKAGRPSERVVSHENCRFNAPREHECVHVHEMTGASGTEEAEAEAEYDNALKEAIK 180

Query: 181 GVQDAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           GVQD VTTINE+MEEVRYEI ALEDK
Sbjct: 181 GVQDTVTTINEYMEEVRYEIAALEDK 206

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_023541138.1 (uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 336 bits (862), Expect = 3.90e-115
Identity = 182/208 (87.50%), Postives = 192/208 (92.31%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTD-----SSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMT 60
           MEDF+KKLSL EQMEED RT      SSNTL+LLR+FLEIQQRRAEAY++LKRGFDEYMT
Sbjct: 1   MEDFDKKLSLAEQMEEDGRTSGDSSGSSNTLTLLRKFLEIQQRRAEAYARLKRGFDEYMT 60

Query: 61  SGREISYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLT 120
           SGREISYQQLC EIT EFSNCSKQVIDIESNF + DH+R+ELA+LLRSVQEQEKQKLHLT
Sbjct: 61  SGREISYQQLCGEITAEFSNCSKQVIDIESNFCSPDHDRIELASLLRSVQEQEKQKLHLT 120

Query: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180
           AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCR   PREHEC+HVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA
Sbjct: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRFKTPREHECLHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180

Query: 181 IKGVQDAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           IKGVQDAVTTINEHMEEVRYEI ALEDK
Sbjct: 181 IKGVQDAVTTINEHMEEVRYEIAALEDK 208

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_022945518.1 (uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita moschata] >XP_022968603.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita maxima] >KAG6573912.1 Required for excision 1-B domain-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 336 bits (861), Expect = 5.54e-115
Identity = 182/208 (87.50%), Postives = 192/208 (92.31%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTD-----SSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMT 60
           MEDF+KKLSL EQMEED RT      SSNTL+LLR+FLEIQQRRAEAY++LKRGFDEYMT
Sbjct: 1   MEDFDKKLSLAEQMEEDGRTSGDSSGSSNTLTLLRKFLEIQQRRAEAYARLKRGFDEYMT 60

Query: 61  SGREISYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLT 120
           SGREISYQQLC EIT EFSNCSKQVIDIESNF + DH+R+ELA+LLRSVQEQEKQKLHLT
Sbjct: 61  SGREISYQQLCGEITAEFSNCSKQVIDIESNFCSPDHDRIELASLLRSVQEQEKQKLHLT 120

Query: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180
           AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCR   PREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA
Sbjct: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRFKTPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180

Query: 181 IKGVQDAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           IKGVQ+AVTTINEHMEEVRYEI ALEDK
Sbjct: 181 IKGVQEAVTTINEHMEEVRYEIAALEDK 208

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CFT2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold475G001610 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 377 bits (967), Expect = 1.57e-131
Identity = 201/203 (99.01%), Postives = 202/203 (99.51%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60
           MEDFEKKLSLDEQMEEDR TDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI
Sbjct: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRGTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60

Query: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120
           SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL
Sbjct: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120

Query: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180
           LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ
Sbjct: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180

Query: 181 DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           DAVTTIN+HMEEVRYEIEALEDK
Sbjct: 181 DAVTTINDHMEEVRYEIEALEDK 203

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGI9 (uncharacterized protein LOC103489347 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489347 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 377 bits (967), Expect = 1.57e-131
Identity = 201/203 (99.01%), Postives = 202/203 (99.51%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60
           MEDFEKKLSLDEQMEEDR TDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI
Sbjct: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRGTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60

Query: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120
           SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL
Sbjct: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120

Query: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180
           LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ
Sbjct: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180

Query: 181 DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           DAVTTIN+HMEEVRYEIEALEDK
Sbjct: 181 DAVTTINDHMEEVRYEIEALEDK 203

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KUN3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G612270 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 374 bits (959), Expect = 2.61e-130
Identity = 199/203 (98.03%), Postives = 201/203 (99.01%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60
           MEDFEKKLSLDEQMEEDR+TDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI
Sbjct: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRKTDSSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMTSGREI 60

Query: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120
           SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFR+SDHNRLELAN LRSVQEQEKQKLHLTAQIQL
Sbjct: 61  SYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRSSDHNRLELANQLRSVQEQEKQKLHLTAQIQL 120

Query: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180
           LKKAGRPSERLVSHENCR NAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ
Sbjct: 121 LKKAGRPSERLVSHENCRFNAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKGVQ 180

Query: 181 DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK
Sbjct: 181 DAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HYI6 (uncharacterized protein C19orf60 homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467775 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 336 bits (861), Expect = 2.68e-115
Identity = 182/208 (87.50%), Postives = 192/208 (92.31%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTD-----SSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMT 60
           MEDF+KKLSL EQMEED RT      SSNTL+LLR+FLEIQQRRAEAY++LKRGFDEYMT
Sbjct: 1   MEDFDKKLSLAEQMEEDGRTSGDSSGSSNTLTLLRKFLEIQQRRAEAYARLKRGFDEYMT 60

Query: 61  SGREISYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLT 120
           SGREISYQQLC EIT EFSNCSKQVIDIESNF + DH+R+ELA+LLRSVQEQEKQKLHLT
Sbjct: 61  SGREISYQQLCGEITAEFSNCSKQVIDIESNFCSPDHDRIELASLLRSVQEQEKQKLHLT 120

Query: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180
           AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCR   PREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA
Sbjct: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRFKTPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180

Query: 181 IKGVQDAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           IKGVQ+AVTTINEHMEEVRYEI ALEDK
Sbjct: 181 IKGVQEAVTTINEHMEEVRYEIAALEDK 208

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G147 (uncharacterized protein C19orf60 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449729 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 336 bits (861), Expect = 2.68e-115
Identity = 182/208 (87.50%), Postives = 192/208 (92.31%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEDFEKKLSLDEQMEEDRRTD-----SSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYSKLKRGFDEYMT 60
           MEDF+KKLSL EQMEED RT      SSNTL+LLR+FLEIQQRRAEAY++LKRGFDEYMT
Sbjct: 1   MEDFDKKLSLAEQMEEDGRTSGDSSGSSNTLTLLRKFLEIQQRRAEAYARLKRGFDEYMT 60

Query: 61  SGREISYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLT 120
           SGREISYQQLC EIT EFSNCSKQVIDIESNF + DH+R+ELA+LLRSVQEQEKQKLHLT
Sbjct: 61  SGREISYQQLCGEITAEFSNCSKQVIDIESNFCSPDHDRIELASLLRSVQEQEKQKLHLT 120

Query: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180
           AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCR   PREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA
Sbjct: 121 AQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRFKTPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEA 180

Query: 181 IKGVQDAVTTINEHMEEVRYEIEALEDK 203
           IKGVQ+AVTTINEHMEEVRYEI ALEDK
Sbjct: 181 IKGVQEAVTTINEHMEEVRYEIAALEDK 208

[Close]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT5G04910.1 (unknown protein; Has 71 Blast hits to 71 proteins in 36 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 17; Fungi - 0; Plants - 40; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 247.3 bits (630), Expect = 1.1e-65
Identity = 134/217 (61.75%), Postives = 164/217 (75.58%), Query Frame = 0 

Query: 2   EDFEKKLSLDEQMEEDRRTD-----------------SSNTLSLLRQFLEIQQRRAEAYS 61
           EDF+KK+SL + +  D   +                 +S TL LLR  LEIQQRRA+AY+
Sbjct: 4   EDFQKKVSLRDSLSGDIENECGGSGVGSTSSTVGSGVASQTLVLLRSLLEIQQRRAQAYA 63

Query: 62  KLKRGFDEYMTSGREISYQQLCSEITTEFSNCSKQVIDIESNFRNSDHNRLELANLLRSV 121
            LK GF EY+ SG E  YQ+LCSEITTEFS CSKQV ++ES F N +  R +LA LL  +
Sbjct: 64  NLKSGFSEYVESGAEALYQKLCSEITTEFSECSKQVREMESLFLNPEVGRADLAKLLSDI 123

Query: 122 QEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRINAPREHECVHVHEITEASGTEEAEA 181
           Q QEKQKLHLT  IQ+LKKAGRPSER+++HENC+   P +HECVH+HEITEA+GTEEAEA
Sbjct: 124 QTQEKQKLHLTVTIQVLKKAGRPSERMLTHENCKFKKPMQHECVHLHEITEAAGTEEAEA 183

Query: 182 DAEYDNALKEAIKGVQDAVTTINEHMEEVRYEIEALE 202
           DAE+DNALKEAI+GVQDAVT+INE++E++RYEIEALE
Sbjct: 184 DAEFDNALKEAIRGVQDAVTSINEYLEDIRYEIEALE 220

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_008446706.13.25e-13199.01PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489347 [Cucumis melo] >KAA0034618.1 unc... [more]
XP_004135056.15.39e-13098.03uncharacterized protein LOC101210078 [Cucumis sativus] >KGN52147.1 hypothetical ... [more]
XP_038892275.14.15e-12191.26uncharacterized protein LOC120081463 [Benincasa hispida][more]
XP_023541138.13.90e-11587.50uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
XP_022945518.15.54e-11587.50uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita moschata] >XP_022968603.1 un... [more]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3CFT21.57e-13199.01Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
A0A1S3BGI91.57e-13199.01uncharacterized protein LOC103489347 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489347 PE=... [more]
A0A0A0KUN32.61e-13098.03Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G612270 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1HYI62.68e-11587.50uncharacterized protein C19orf60 homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC11146... [more]
A0A6J1G1472.68e-11587.50uncharacterized protein C19orf60 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111... [more]
BLAST of MELO3C012309.jh1 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT5G04910.11.1e-6561.75unknown protein; Has 71 Blast hits to 71 proteins in 36 species: Archae - 0; Bac... [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 97..124
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 183..203
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..22
IPR039491Required for excision 1-B domain-containing proteinPFAMPF14966DNA_repr_REX1Bcoord: 28..122
e-value: 3.8E-33
score: 114.0
IPR039491Required for excision 1-B domain-containing proteinPANTHERPTHR28309REQUIRED FOR EXCISION 1-B DOMAIN-CONTAINING PROTEINcoord: 18..201

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C012309.jh1.t1MELO3C012309.jh1.t1mRNA
MELO3C012309.jh1.t2MELO3C012309.jh1.t2mRNA