MELO3C004498 (gene) Melon (DHL92) v4
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTACTCAAGCCCCATGGATTTGGATGCCTTTCTACCAACTTCCTCTCATCTCGATCTGTATTTTCGTCCCAGTAAGAGAGCTCAAATCGGTGCGCCGATTGTGTTGGAGGAAGAGAATTTGAGCAGGAGTGTACGCCATCCTTTGAAGCTCTTTCAGGTGAATGTCTCTTTGAGATTTTCAGGCATCTCCACAGTCCTAGAGTGAGGAGCTCTGGTGCCCGTGTCTGGAAACGGTGGCTTATGCTTTTGAGTACAAGACAAAATTTGCAAGATACGGCCTACATCCGCTTGCAGGACCATGGTAAGTTGTCTGTGCCTAAGTAATAACTATGGGAACCGTTTCCCGCCTTTATTTGAAAAAAACAAAATAGTCAGTAGTTAGTAAACAGTTTAGAAAATTAGGCAAATCACTCCCAAATTTCATCCGCTCTCCTTCGATCGACGATGCTTCCGATTCTCAATCCGCTCCTCTTCTTCCTTTATCCTTCGACCGTGCTTCTCTTCACACCTTCACGGCTCCTCACACCTTCGCGGCTCCTCACACCTTCACGGCTCCTCACACCTTCGCGACTCCTCACACCTTCGCGGCTCCTAATTTCAGTGAGTTCCAATCACGCAAATAGGAGAGGACGAGGATTTTATCGGAGGGTTCTTCCTTCTCCTCCTGCGGTTGATTTTGCTTCATCCGACGGTAAGCGTCTCTTTGCTGAAGCATTGGGAGATGGAAGCATGGAATGTTTTTTTAAGATAGTTTCTTATTATCAAACTCAATCCGAACCCAGCTACTGTGGACTAACAACTCTCGCTGCCGTTCTCAATGCCCTTTCGATTGATCCGGGTAGAAAATGGAAAGGGTTGTGGAGATGGTTTGATGAGACCATGATGGACTGCTGTGACCCTCTAGAAAAGATCCAAACGGATGGTATAACATTCGACAAGTTTGCTTCGATGGCTCGCTGTAATGGTGCCGAGGTGCTAGTTTTCAGGACCAACGAAAGCACAATTGGTGAATTCCGTGAGCAGCTTATATCATCTTCATCCTGTGAAGACCGTCACATGGTAACCTCGTACCACAGAAGAGTTTTCAAACAGAGTGGAACTGGCCATTTTTCCCCAATTGGGGGTTATCATGGTGGAAAAGACATGGTGCTCATCTTGGATGTTGCACGTTTCAAATATCCCCCTCATTGGGTTCCACTTAGCCTACTGTGGGATGCCATGAGACAATTGATGATGCAACAGGACTACCTAGAGGGTACATGATTTTATCAAAGCTAACATGAGAGAATTTAAAGGGCTGATTGAACAGTATATAGTGGATGTGTATATCATATATAGTGTGTTTCGAGTAGGGATGTATATATCTTCCACGGTATAGGACCGGATATGAGTTTTTGTTACTAGCCCGGATATGAGTTTTTGTTACTAGCCCGGATATGATTTTTTGTTACTAGACCAGATATGATTTTTTGTTAATTCATGAATCTTGTATTGCTATTGAAGCAATATGATATCTCAATGAACATCCACTTAATTTTCATATATATGTATGGCAATTTAGCATGTAGAAGTATGTTGAATCTACAAGAGTCAACAGCTCATCACACAACTTTTTGCTTGGGATTCATCATTCATGCACTATTAAACCAAAAATCTTATTATATTAAAAAAGAGAGAGGAAAAAAGAAAGAAATAAGGGGGGGGAGTTGCGGTAGTCGGTAATGGGAAAATTGGTTGGACAGTGGCAAAGGGGCAAAGAGCAAGAGGGAGAGGGGGGGGTCTGCTTGGAATTTATGGTTTTGTGGAGAGATTCATTGCACATTCACAATCCCACCTCAAATTCATACTCATTATATGAATATTTTGTCACCCACTATCACTGAGATAGACATCTTCCATCCCTTTTCTTATTTTTTTTTCCATTAATCAATTCTATATTCCAAATATATTTACTCTTTTCATTCCATTTCTTCTTCCCACTTCACAAATTTCTCTTCTTTCTTCTCTTTTTTCCCCTTTTCTCTATTGGGGTTTTCTGCAAAATGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCATAATTCTCATTTGCGTTTTCTTCAACCTCTTGTTTGTGGGAAGCTTCTCTTTTCTCTTCTTCTCCTTCGTTGCTCTGTTGCTGTCCCCATGCCTGCCCTCGTCAATTAGGTGGTGAGTTCTTTGATCTTTTCTATTTTGATATTCTTTCATCTGGGTAGGAGTTGAATCGGTTTAATTTGATGGGTTTGGGGTATTTGTTTTGTTTATGACTTTGTTTTTGAGGTTTTGTGATGATGTGATCTGGGCTTGTTTGAGGATGGTTGATTTTTTATGGAAAAGTATGGTATTTTAGATATCTTAAGCTAGTTTGTTCTTTGATGAGAGTAGTTTGAAGATTTCTAGTTTATGCATCTTGTTAAATGTCTCTTAGTTAGGTTTGTAATGGATCTAGTTCTTTGAGAGAGATTGTTCTGATGATGGAATTTATTTAGTGATGAACCGAATAGGTTGAACTTTTTTGGAGAGAAGAGGTGTGCAATTTTGGCTGATTTGTTGTTGTTGGTGGTGTTATTGGGTTTTCAGGTGATGATGAATATTACCCTGGGGGTTCCTTTTATTCGAACCCCATGGATTTGGATGCATTTCTACCAACTTCCTCTCATGTCGATCTGTATTTTTGTCCTAGTAAGAGAGCTCTAATCTGTGCGCCGGTTGTGTTTGGAGGAGGAGAATTTGAGCAGGACTGTACGCCATCCATTCAAGCTCTTCCCGATGAATGTCTCTTTGAGATTTTCAGGCATCCCCACAGTGCTAGAGAGAGGAGCTCTTGTGCCGGTGTCTCGAAACGGTGGCTTATGCTTTTGAGTACTATTCGTAAGGCTGAAATTTGCAAGAGCAGAAGCACATGTATCAGTCAGATGGTTGAGTGCTCAAATGTTGAGCAGCAGAATACTGAATTTGATGAGATTTCGGTAGTGAACTGTGATGAAGATCAAGAGGATGAAAGTAATGGTTTTCTTACAAGATGTTTGGACGGCAAGAAAGCTACTGATGTTAGACTTGCTGCTATTGCAGTAGGAACTAGTGGACGAGGGGATTGGGAAACTTTCAATTTGAGGAAGTAACTCTACTCGTGGAGTTACCAACCTTGGTCTTTCGGCCATTGCCTACAGTTGCCCTTCTCTTTGGATGCTTTCTCTGTGGAATGTACCTGTTGGAACCCAATCTCCAACACAGATTTAAGGTATGAATGAAATCAAATCTTTACTGCTTATCAGTAGAATTCAATTACAATCAAAGAATCGAATTGAATAATGAATTCAATTCGATGACTACAATGCTAGGCTCTCAATATACCTGCAGAATATCAACCAACATACACATACACAATAGAGATATTCCTATCCAGCTACTCAAACACAGCTATTCATATTTGGAGTGGTGTTTTAACTGATAATATGAAAGATGATATTTCCTTCATGGAGTGATGAGTTTTTGTTCTGCAAATACTTTCAGCTTCTCTTATGAAGAGGCTTGAGTGATTCTAATTTAGAGATTCTTTTTAATTGGGAAATTGCTTTCTAGACAGAATTTCTTAATCTGCAATTAAGGAACCTTGGAAAGTGAAAGAAATATCAGTTGGTTCTTACTTCTTAGTAAGTGTTCAGGTCTGAAAAAATAAGGGGAAAATGGTAGCTTCATTTTTCTTCCATGAATTGAACCTCATGGATTAGTAGTTGTTTGCATCATTGAAGTCTATTCTTGCTCCAAGAAGTCAGCTTTTTAGAACTGGGTTGTACTGGACTTTGGAATGCTAGTTTTTGGATGGTCAAAAGAGTTGCAAGTGGTGAGAACGTGTTCAATGCATATATCCTTGGTTCCTTGGTTCATTAACTAATTGATCTTTTATCTTGGTTATAATTTTTCATGTTTCATTGTCAGTGTTTAGGTTCATGACATCGGGGTTTGTTTTCCTAAGATATATTCAATGATCTGTATACATGCATAGTTTATTTCAAACTTCATTGAGGGCCTGGAACCATGTTAGTGGATTCTTCTCTTGATTTAAAGTATGGCTGTGATATTCATGCATTTGCATTTGCATTTTTTATTTTTAGTAAGTGTCAGTTCTTTGTAAGCCTTTAAGAAGGCATTTTAATTTATTATTCTTATATGAAAAAAAAGAAATGAGTTTTTTCTGGCCTGGCCTCCTGAATTTTGTTTCTGTATCCATAAGTCTAAAATTTCTCCAAAAGTTGCTTTGTTTTTATTTACAATTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAAAGCCTTACCATCGATGCATACCTTTACTTTTTCTATGTTTTCTGGTGTTTTTCTTTAGTTGAGATATTAAAACCATAATATAATTAACAGGAAATGGTAGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAAGCCGCTCAATTGAAAGAACAATCACCTTGTGCATACACTATCCTTGTGACTTTTTTCTTTCGTGTTTTGGAGTTCAATTCCGTGCCTACCACCTTAACTTGGGATCAATTCGATACAAGTTTAACATACAAAATGACACCATTGGTTTGCTAACCTTTTCGATATTGCTACTACATTGGAGATCTCTAAGGGGAGGGGCCAATTGTGAACTAACCCAAAATCAAAGATCTTCCAATTGATCGGCGAGCTAAATGGTAAGCCCCCTCCGACCAATATACTTTATACATACATATCAAACTTTCTTCATCATTAGTTTAATATATGATGAAGCATCAACTTTGCAGTGTGTTTGATGCAATGTTGTTGATGATTGACTTGTTGTAATTGATGTAAAAGAATAGATAATAATTAATCTCTCTAAAACAAACTCTTCTTTGTTTTGAATTCCTGATAAAATATCGAGATTGATTTTGTGGTGATATTGCTGTCAAATGTGTTGGATGGTAGAGAGAACAGAT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MLLSTRQNLQDTAYIRLQDHGDDEYYPGGSFYSNPMDLDAFLPTSSHVDLYFCPSKRALICAPVVFGGGEFEQDCTPSIQALPDECLFEIFRHPHSARERSSCAGVSKRWLMLLSTIRKAEICKSRSTCISQMVECSNVEQQNTEFDEISVVNCDEDQEDESNGFLTRCLEGKKATDVRLAAIAVGTSGRGGLGKLSIRGSNSTRGVTNLGLSAIAHGCPSLRMLSLWNVPSVGDEGLFEIARECHLLEKLDLCHCPSISDKGLIAIAEQCTNLTSLSIESCPKIGNEGLQAIGKLCSKLQTISIRDCPRVGDQGVSSLFASSSCAIMKVKIQALNITDFSLAVIGHYGQAITHLTLSGLQNVSEKGFWVMGSAQGLKKLTMMTIASCRGMTDVSLEAMGKGIANLKQMCIQKCCFVSDNGLIAFAKAAGSLEMLQLEECNRITLLGIGGALSNHIRNLKSLTVVKCLGIKDIAQEVTLPSLCTSLRSLSVQNCPGFGSASLSMVGKLCPQLQHVELIGLYGITDASMFPLLETCEGLVKVNLSGCINLTDETVSTLVRLHGGTIEVLNLDGCRKITDASLVAIADACLLLNELDASKCAVTDAGLAVLSSSEQINLQVLSLSGCSEVSNKSLPFLERLGKSLVGLNLKNCHSISSGTVGTIVENLWRCDILV Homology
BLAST of MELO3C004498 vs. NCBI nr
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BLAST of MELO3C004498 vs. NCBI nr
Match: TYJ97820.1 (EIN3-binding F-box protein 1-like isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1258.0 bits (3254), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/653 (97.86%), Postives = 644/653 (98.62%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. NCBI nr
Match: KAA0061614.1 (EIN3-binding F-box protein 1-like isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1252.3 bits (3239), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/653 (97.86%), Postives = 642/653 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. NCBI nr
Match: XP_008457494.1 (PREDICTED: EIN3-binding F-box protein 1-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1252.3 bits (3239), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/653 (97.86%), Postives = 642/653 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. NCBI nr
Match: XP_004139306.1 (EIN3-binding F-box protein 1 [Cucumis sativus] >KGN60684.1 hypothetical protein Csa_019310 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1250.0 bits (3233), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/653 (96.94%), Postives = 643/653 (98.47%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKK0 (EIN3-binding F-box protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EBF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 2.5e-188 Identity = 339/652 (51.99%), Postives = 468/652 (71.78%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q708Y0 (EIN3-binding F-box protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EBF2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 643.7 bits (1659), Expect = 2.4e-183 Identity = 347/655 (52.98%), Postives = 450/655 (68.70%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5D2 (F-box/LRR-repeat protein 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FBL4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 176.0 bits (445), Expect = 1.4e-42 Identity = 163/613 (26.59%), Postives = 283/613 (46.17%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RWU5 (F-box/LRR-repeat protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FBL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 3.1e-29 Identity = 126/462 (27.27%), Postives = 204/462 (44.16%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P34284 (F-box/LRR-repeat protein fbxl-1 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=fbxl-1 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 1.2e-25 Identity = 96/343 (27.99%), Postives = 161/343 (46.94%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E1N9 (EIN3-binding F-box protein 1-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497170 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1332.8 bits (3448), Expect = 0.0e+00 Identity = 673/673 (100.00%), Postives = 673/673 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BD88 (EIN3-binding F-box protein 1-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold285G00300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1258.0 bits (3254), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/653 (97.86%), Postives = 644/653 (98.62%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V2X7 (EIN3-binding F-box protein 1-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold41G001790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1252.3 bits (3239), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/653 (97.86%), Postives = 642/653 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C582 (EIN3-binding F-box protein 1-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497170 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1252.3 bits (3239), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/653 (97.86%), Postives = 642/653 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LI26 (Grr1 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G006790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1250.0 bits (3233), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/653 (96.94%), Postives = 643/653 (98.47%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. TAIR 10
Match: AT2G25490.1 (EIN3-binding F box protein 1 ) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 1.8e-189 Identity = 339/652 (51.99%), Postives = 468/652 (71.78%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. TAIR 10
Match: AT5G25350.1 (EIN3-binding F box protein 2 ) HSP 1 Score: 643.7 bits (1659), Expect = 1.7e-184 Identity = 347/655 (52.98%), Postives = 450/655 (68.70%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. TAIR 10
Match: AT4G15475.1 (F-box/RNI-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 176.0 bits (445), Expect = 1.0e-43 Identity = 163/613 (26.59%), Postives = 283/613 (46.17%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. TAIR 10
Match: AT5G01720.1 (RNI-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 2.2e-30 Identity = 126/462 (27.27%), Postives = 204/462 (44.16%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004498 vs. TAIR 10
Match: AT5G23340.1 (RNI-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 120.2 bits (300), Expect = 6.5e-27 Identity = 77/258 (29.84%), Postives = 136/258 (52.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (DHL92) v4
Date Performed: 2022-08-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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