MELO3C004006.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDSstart_codonstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AATATTAATAAATAATAATAATATATAGAAACGCCTTCCTAAGCGGAACTGGCTTCAGTACACTGGTCCCTCACATTACAGAGATTCGTCTCTTCTTAGTTTCGGAGAAGAAGACGAGAGAGAGAGATATAGCAAAGTTTGCTACTGCCATTCTTTAAACCTCCGTATCTCCACCATTTTCTTTCTCCTTCTCAAAGAAGGAAGCCATTTCCGCAATGGATTCCGTGTTTGTTAGAGCCTATAGAAGTCATTTTACTCTTGCTGCAGGTTCGCCTCAAAAGTGACTTTCCACTTTTTCAGTGTTCAATCTTAGATTTCTCCGCTGGAAATTCTGCATCGTGCTTGAGCTTCTTCTTTTTCCTCTTATTGATTGGTGCATTTTTGTTATCGAGTCTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTCTATTTTGATGATTCATTTTTCTTTGCGCTTGATGAGTAACTCGATTATATTCTCGCGATTGTCATCTTATTTGGTTGATTGAAGCTGATTTGCTGTTTCTGTTTCAGTTGGTGGGATTGGAAACGGGTGGACGAGTAGTGACGTCAACAACGTAAGGCTTCCAAGTAAGATTAATTCGTTTTTAGACCTTTATTTTCTTTGCATTGATCGCTTTCGCTTTTCGTCTTCTCTGGTATCTTTAATTCGCCAATGGCATTTTCGTTCGTTTTTTTCGAATTTCATGTTTCGTATTGCAAACTTTGAAAGAATTTGTCGTTGATTGTGGAAGTTGGATGAATTGAACTGGTGGAAAGGATTATCCTGGCGGCGAATTCGCATGTAACCTTTGGAGGGGCTATTTGAGAGTTGGGAACAATGTTTTTTCTTTTTTTTCCATTGAAATAAAAATTAAATAATTTTTTATAAAATTTAATTTGAAGTGTGTGTATATATATATTGAAGGGAACTTGGAAAACATTATATAAACTTACCTGTCAATCAGCGCCAGTGGCAATTAAAATTCTGGAAAGTGTGTTTTCTTTTTTCCATTGGAATAATAGATTTCAATCTCTTGGTCCTCGACGTACTTTTTGGCCATTTCACTGCAATTTCAGTTTAAAACTGAAATAAAAAGATTACAGTTCTCAAAATTACATTTTTTTTAGAGACAAAATTAATATTTTAATATTATTTTTTTGTAATAATGTTTTCAGCATTTTCTTTTGGACCAAATTGCGAATATTTGGATGCCAAAGATGATAAATGAATACTTTAATATTGATTGAGTAGCCATTTTTCGTTTGGAAGTCATTAATATATCTCCAAGGAGCTTCAAACGAAACACGAGAGATAGGAGAGGGCCAAATACAATTCGATAGTTTATTAATATTTGTATTTCTTTTGCTTGAGAAAGAAGTATCCCACAAATGTGTTGTTGTGTTGGCAGCAGCATAAATGACGTAATTTTAAAGCAGGAGATCAACTAGATTTTCACCCTTTTTAGAAGAAAAGACTTCGACCTCATGTAAATGACAGCTCTGAAGGGGGAAAAAAAAGTGAATTACTAAAGATTATGAATGTCCTCGAATAACAAATTTCCATCTTTGACCCCCTAAATTTGAGAGAACACTGCGTTTGACCTAAGCTGCTCAATGTCTGACGTGATTGACGCAAGTAGGACACGTTTAATAGTGAATGTTTGCACGCTGGGCCATTTACAAAAGTGCCTGCATGCGTGATGTTGGCCTTCTGTCACTGACTAGTGGCACATGGCATGTCGTAATTTTGTTTCAAGTCCATGACCGAAAAAGGAAGTAGAAAGCAACGAAGAAAGTCAAGAAAGATAATAGGAGAAAAGATTCTTATATGCGGATATGTATGTTGGGAAAAACATCCCAATATGGCAGAATAAACAGAAAAATAATAGTATTGTGAAAAAAAATGATAGTTGGAAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAGAAGATAATAATAGAGAAATAACAAAAATAATAAAATGGAAAACACACAAATCAACATGAAAAAACTTCAGACTCAAAAAACTATCGAACTTTACTATTTGAAAAATCACTACGATCACACAAAAATCTCACGTTTAAAGGTGTTGGAAGAGCCTAAGTTGAAAAATTCAATATGAGATTATTGGACTTTTATGCCAAAACACGTGAATCTGCTAGTATTTCAACTACATATGCTGTCTTGCATGTCTACATTACGTGTCATAAGAGTGGGAAGGTGCGGATCAATATCTAAGGATGACCTTACTTAACCTTACCTGTACTTGATCTACTCTGTTAGTCGTACTTGTTCTATAACTTGTATAACTGTGCTCATTCTACAGAGTAGATTTTGGAAATCTCAAGACCAGTGTCCAGGATCTGCAAACAATTCTTCTACCAGGAACAGATCTGGCACTTATGCAAACCAAAAGTTAAACCTTTTATCAAAATGATTACTCTCTCAAATGAGGAGAGAAATGTTGTATTCATATAGAAATATGAGTACAAGTTCCAAACTACCCTTTTAACTAACTTTCTAACTTCCCTCTTTTGAAAACAAGCAACTCTCTTTTAATATAAAAGTAACTCTCACTCTGTCGGGTACACCATATTCCACCCCTCTAAAATCAAACTCGTCCTCGAGCGTGACTATTTAGAATACCAATTGTGTAACACTTTGAAAAGGTGAATTATTACAAGGTTCCTTTTCCAAAGTTAACCACCCTTCGAGATTTATCCCTAGCCAATAAATGAGTCATTTCACTAAATTCATCTGCCACAACCATCACGACATCTTACCCTCGCTGAAATTTTGGAAACTCATCGAACAACTTCTGCATTTCTTGATGAACTTCACCGTTCTTTTATTTTCTACATTTTTAACTACTACAAGGCCCAATCAACCTCCCTTTCTTTACCAAACATTTTGCAATGTATTTGAGGATTAAAATCTCCTTCGGGAGCAATCTGCATCGTTTGAAGAAGACAAGATACATCACGTTCATCCGTGGACCGTGTCAATATAATTGGTTTCTTTCTCATTATCTTCACTCATCCAGCCAACAAATTCTCTTTTCTTCATCCATATATATTCCTGTTTTATGTTGGGGCACTCACTAGACAAGTGCCCCACTTGGTCACCCCCTTAAACATTTTCCAGTGTAGGCCAATTATAAAGATTTTGAACTTTCTACTTGTAAACAACCTTTGTTTCTTTCTCACCAACCTCTTCTTGCTCTTCTTTATCCATTTTCTTTAACTTCTTTCCACTGATTATGATAACCAAATGATTGCTTCTACTCTTCTTGGAACTAACACTTTCATTTTCCTTTTGGGTCAGAGGCAACAGTACCATCTTTTTATCCATCCATTGAAATTCATAAGTATTCTCTTTCCCATAATGTAAGGCCTGAGTATCGTATTGCCACGTTCTCTCCAATAGAACGTGACACACATCCATCTCCTAAACATCTCAAACTATTTGATCTTTGTAGCTACTTCCAATTGTCAACGGAACGGTGCATATCTCATTAACTTGAGCTTCTCCTCTTTTCTTCACCCATCCAATCTTGTAGGCACTTGGATGATACTCGGTTTTCAAATTCAAGGCTGCCACTAACTTCTTGGCAACGAAATTCTCACTACTTCCGCTATCTATGATGACATTGCAAACTTTGTCGTTGATTTCAAGTTTAGAAAAAGGATGGAGAAACAAATATTGCATATACTTAAAGTTTGAGTGGCCCAACCGAAAATGGCACCACATGCAATCATGTTCAGAAGTGCTAAAATAGGAAGAGAGTAAACTAGCCCTAGAGAAACTACTACTAGAGGTATCATCATCAAGAATGTAAAGTCCCCCGCTAAGTCGGGCAATGCCAATCCTCCTCCCTGAGCTCATGTCCTGAAAACAAATAAATTCAGGTAAGAAGATAGCTTTGGAATGCAGCTCACTAGTGATCTTGCTTATAGATAGCAAATTGTAAGATAGTTTAGGCACATGCATAACATTCTGGAGAGCAAAACTGTTAAAGGAAACTATTTGTCCTTTGCCAACGATCAAGGCTAGAAGCCATTGGCTATCCAAATTTTTTCATTACCGGCACATCGAACATAAGAGATAAAGTGCTCCAAAGAACTTGTCAAGTGATATGTAGCCCCTGAGTCTAAAATCCAGAGATTCTTCCCATCAACGCTAATAAGCCTAAGGGAAGGCATACCTGACGGAGCAATGGCACCCAGATTAGGAGTCTTGGTCTGGCTTGCAGTAGGGCCAGTTGATTAAGAAGTGCTGGCAGAGGTAAGGCTCACTAACGTGGGCACGTCTTGAGCTCTGTTTCTCGTTGAAGGACCGTTTCTTACCTTCTGAGGGACGATCGTGGAGTTTCCAACACTGATCCTTGGTGTGCCATTGTTGCTTGCAGTGCTCATAAAAAGGGATTGGTTTCCCATTATTCTCGTCACTATCATGATTGAGGGCCGAGCACTAAAGGCAGTAGAGTCAGTAGCAAGGGTAATCAGTATACCAATGACATTAGTGCGGTCTTCTTCGAGACGGACTTCAAAACACACTTCCATTAGGGAGGGAAGAGGTCTTTGTTCGAGTATACAACCATAAACAATATCAAATTTCGGATTAGACCCTGTAAGGAAGTCATAAATACGGTTAGCCTCTTCAAGCTTAGCATATTGTATATCGTCATTTGGTGTGTCCCAAACTGTCTCTCTGCACAAATCCCTCTCTTTCCAGAGAAGAGAGAGCTTGTTGAAATAGGTAGTCACGTCTAGGGTCCCTTATTTGCAATCATGGACCTGTTTTCTTAATGTATACAACCAAGAGGCATTCTGTCATTTCAAGTAAAGGGTCTGAATTGTTTCCTCCAAATCTTTTGTTGTGGTTGCGTATGGTAGAAGCTTGCCAATATGAGGTTCCATATTATTAATCAACATGGACCAAATGAGTGAGTCCTCCTCTTTCTAGAGTCGTTCCAAGGCCTCACTCGGTGGAGGACATACAGTCTCTCCAGTT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Match: XP_004148327.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61152.1 hypothetical protein Csa_021364 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 764 bits (1972), Expect = 1.74e-277 Identity = 389/409 (95.11%), Postives = 400/409 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038889435.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 759 bits (1961), Expect = 8.27e-276 Identity = 385/409 (94.13%), Postives = 401/409 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_038889438.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 753 bits (1945), Expect = 2.18e-273 Identity = 384/409 (93.89%), Postives = 400/409 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_016901965.1 (PREDICTED: homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 721 bits (1862), Expect = 2.80e-261 Identity = 375/409 (91.69%), Postives = 375/409 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VWJ1 (Homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HPT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 468.8 bits (1205), Expect = 6.4e-131 Identity = 241/335 (71.94%), Postives = 282/335 (84.18%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7FA90 (Probable homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HPT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 462.2 bits (1188), Expect = 6.0e-129 Identity = 241/322 (74.84%), Postives = 277/322 (86.02%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB13 (Homogentisate geranylgeranyltransferase OS=Triticum aestivum OX=4565 GN=HGGT PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 5.0e-91 Identity = 178/297 (59.93%), Postives = 227/297 (76.43%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB14 (Homogentisate geranylgeranyltransferase OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=HGGT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 335.1 bits (858), Expect = 1.1e-90 Identity = 180/304 (59.21%), Postives = 228/304 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DAK7 (Homogentisate geranylgeranyltransferase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HGGT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 334.0 bits (855), Expect = 2.5e-90 Identity = 178/297 (59.93%), Postives = 221/297 (74.41%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRS9 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492819 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 798 bits (2062), Expect = 1.62e-291 Identity = 409/409 (100.00%), Postives = 409/409 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKA3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G059830 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 764 bits (1972), Expect = 8.43e-278 Identity = 389/409 (95.11%), Postives = 400/409 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E1V5 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492819 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 721 bits (1862), Expect = 1.36e-261 Identity = 375/409 (91.69%), Postives = 375/409 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K9K8 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 711 bits (1835), Expect = 5.43e-257 Identity = 365/409 (89.24%), Postives = 385/409 (94.13%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7F2 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 711 bits (1834), Expect = 7.43e-257 Identity = 365/409 (89.24%), Postives = 385/409 (94.13%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G18950.1 (homogentisate phytyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 468.8 bits (1205), Expect = 4.5e-132 Identity = 241/335 (71.94%), Postives = 282/335 (84.18%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.2 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 1.1e-37 Identity = 118/343 (34.40%), Postives = 178/343 (51.90%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.1 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 152.5 bits (384), Expect = 7.2e-37 Identity = 116/346 (33.53%), Postives = 179/346 (51.73%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C004006.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G51820.1 (UbiA prenyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 47.0 bits (110), Expect = 4.3e-05 Identity = 49/203 (24.14%), Postives = 84/203 (41.38%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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