MELO.jh102094.1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTTTCAATTTCAGTGTACTCAAAGATGTTGAATTTAAGGTATCCAATGCTAATTATTGCAGAATTAACAATGATTTTGTTGGTGATTACAGATAATTCGAAAATAAATACTGATCATTTATTTGTTAGTATGAATGGTTTTGAACAAAAATTTAATTTCACGTGCTTCACTTTTTTTATTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTCTAATAATGTGAGCCAATAGCCTTATTCATATTGAAACTGGATCAAGAGTTGTAATATTTTCTTAAATTAAGATATTGTACAACATTCAGCCATCCACTATCTTATAGAGTAAGTGATGTGTCTTAATATATTTAAAAGAATGACAAACTTTATAAGCACTTTATGCTTTATTATTCATAAATTGCAAAAATAAGAAAATAAGAACAAAATAAATAAACAAAACACCAATTATGTTTCACAATTCATGGTTCCACCTTTTCTTTCAAAATAGAATATTTACGTTGGTACTTTTTTTCTTTGATATCTAAATTTTGAAAATCAACTTCCAGTCCTTGAATTTTTAAGAATAAATTCAAATAAGCTGTGGATGTCATTCGATTAGTTTTATCTTCCTCTTTCATTTATGTCCTTTCGTTACAAGGCTTTTCATTATTATTTTTAATAGACAATTCAGTCATCTGTCCAATTTTATACATTTAATTTAATTCAAAACTCATATTAAAAGCTACAACTTCTAAATATTAAATCCAACTAAAAAAACATTAAACTCACACACTCATAAATATCTTCAATATAATGTTTTGCTCAAACTTTTGATATTCTTCGAATTCATAATTATACGCATAACTTTTCATTTATTCTAAACGATTGATCTTCTTCAAGTTTATAACTAATTGTTCACACGAGATTTCATGAGAAATTTAATTCGTAGAATCGAACTTTGTATTGATTTATGTATTGTGAATACAATCTCTAATATTTACTCCTTTGATTCTTTCTCTCGAATACAAAAAAAATAAAATTTAGAACTTCGTGGTCTTCGATCTTCAAGATGTTGTAATTACAAGTCAATTCGAGCTTCAATCTTCTGGAATTCAAGGAAAGTTTGATCTTCCAAGTCTTCGATCTTTCAGAAGGATGATTTCGAGATTGATGATAACTTGCACGTCTTGAGAGTCTTTAGAAGTTTTTGTCTTCAATTTTTCAGAGCTTCGATTCTTCTTTTCAACCAAAGGTCCCTCAAATGAATGGTAGATGTCTCTATTTATAGAGAAATTTTATGGGCTTTAAGTGGGCTTGGGCCTGTTTGTTTGTTAGGCTTGGGCCTATCTGTCTGTTGGACTTAGGCTTGGCCCATTTGCTTATTGGGCTTGGGCTTGAGCCTACCTGACACTCTGGGCTTGGGCCCATTTGCTTGTTGGGTTCGTGTCCGGGTCCAATTGTTTGACGGGCTTGGTCCATTATTTCTTGCCCTAATTTATATTTAGGGCTTAATTAGATCAGATACAAGAAAGCTTAATTATCCAAACCCAATCAAATTATGATTATCACAATATTTATTGTGATGACGTGGCAGAATTTAATTGGCCAAAATTTATTGCTCAACACTAATCACTCTATATCACTATAAATATCAATATTTCTTGGTTAAGCTTGAACCAAATAATATTTATCGTTTTTTCTTCCTTCTTTATTCAAAATACAAATTTCTTTTCACTTGTTATTTTAGCACGGTTATTTAGATTTCTTCTCAATGGTCAATTGCTCAAACTTAAACTTTGTACATGTGTTGATGATATAGATGTTCAAGTATGAAATAAAGTTGTTGGTTTCTTTTTTATATATTTGTTAACGTTGTGGATATTATGTATGTGTTGTTGACATAGTTAAGATTTTTGTTGCTTTTATTCTCTCCACTCCTTATTCGTAGATGACTTCTAAATTTCTTTTTAATTTTTTTTATTTTAATTATTTAAAAGTGAAATGTTGTAAAAACACATATTTCTAAATATATGTATTGTCTTTCTTCGTTGTATGTTTTTCTATTTATCTCTCTCAATCCCAAGTTTCTTCCACTCTCCTATCTCATCCATAAAATAATTGATCTCACATATTAACATTGTTATCTCACAATCTAACCAAATATAATCATAAATTGTTAATATTAATTAAGATGGTATAATTCCACCATAGGTTATAAATTAAAATAAAAATTGAGAACTAATTTATAGACTATTAAAACATCCTTATCATTATCCTTACTGTATTAAAAGTAACTCAGGGGAAGAATCATTTTTACCCCTTGCCAAATTTTAAATCTACAATATTATCATTTTATTTTCTATCCTAAATTATTCTCATTAGAGTGTTTGTGTTTCTATCAAGTTATTAGGTTGATAATTAGAAAACAAAATACATACTCCGTTATTTTTCTCCTTTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTAACAACCTACCTGGGTATTCAAGAGTTTGTTTTTTTTTTTTAAGAAAATTTTTATTTACATACAATAATTAATATTATTTGTTATTATTTAATTAATACAAAATCTTCAAACTTGGAGAATCATTTTTAAACTATATTTCATCCAAATATTTATCCTTAATTCCAAATATAACTCTCATTTAATTTTTATTTGTTAGTATTTTAAAAAAATTAACTTATAAAAAAATAAAATCTAGAGAGAATTCTATAATTATGGGATTCTTCAAATTCCACGACTCTTTCATATTCAACTTGGGCTTAATATTATATTCATTGATTTACTACTCTTTAAGTTGGTTTTAAATTCTATACTCCTAATTTCATAATAACAAAAAAGAGTGGATTCAAATTTTTATAACCGATTGAATTTGAAAGGTCTTTTTTCAAAAGATATATAAAAAATAAATATTTATATTATTTTGATATATTTTTATTAATCTTGACTCCAAAAAAACCAATGAAATATCCAACTTAATCTTCCATGTAAAAAGTCTCATGTATTTTTCTAAAGGAAAAAATGATTATTTTTCTTTTAACTTTTACCTTTATTTTTCTTTTACATTCTATTTTGAATTTTGTTATATTACAAGTTAAGATTTATAATTATTTGTTTAAGTTTCGATTTAGACTACTCTTACGCTCTTGCCAATACAATACAAAACCTCAAACATATTAGAAATATGCTCATACATGTTTTGGAAATTTCTTAAAATAATTAGAATTGTTCAAATATAAGAACTCTTTGAAGTACAAAGACAAACACCAAAGTCTCTAATTATCAAATATTTTAAACAATAATAATTATAATTTATTAATTATTTTATTTTTACCTCTCAAGAATGATTTTTTTCTAGCACGCATATTAATCAATAATATCAAGTATGTATGATGATCTTGAAGTAAGAGGTTTAATCCCCACATCACACATATTGTCAAAAAAATAATAATAAATTTTCAATTTTCTTGAATGAATGAAAAATTTGTAGTTGAAGATACAAAAAATTTCATGATAAATATAATTATAATTTAAAACATTTGTCTCTTTACAAAATATATTTATTTGAAATACTTGGAATATTTGATAATTTTATAGGATTTAGATTAAAAGAATAAAACGAATTTTCTTTCTAAAAGTCAAAGGTTTGATTCTCATTTTTGAAATTGTTATAGTAAGAATTTTATAATAACATTAACACATGCAATGAACGTCAATATTCTCTAATATATATATATATATTAAAAGGATGTAACTTTTCTTTTTAAAGTCACATTCCTTATTTTAAATCACCAGTTCATTAAGCATAAATATCAAAGATTGTTTGATATTAATGTATATGTTTTGAACTATCGATTTGTTTGTCCATTATCAATCAAAGTCTACACATTCCTTTTTATAAAGCGCACGACCTATAAAGATCTTTTTGTGTCTAGTAGATCTTCAACATGGTCAACGAATATATTATAAAATTAACGAACTCAACTTATTCTATAACGTAATTAACATTATATCTAACGCACAATAAATTTTTAATTATGTTTAACCCACCATTAAGCCCTTAATTTCATGTCAACAAGTTTATGATCTTTTTCTTCCTATGTCATATATGTGATGGAATGACAAAGCCCATCTTAAAAGTTGAAGTGCATATTAGGTACAAAATTAAAAAAGTTTATAGCTTTAAGAGGCAATTAGGCCCCAACTTGCCTTGAATATGTTAGTCGTTATCCCACTAAATATTGAACCTCACATTTATAATGGTTGAAGTTTCCAATTATTGTAACACACGATCACCGCAATAAAAACTATTTGTCTCATGTGTTTCTACAACATTTGTTATTTTATAACAACACATATTATAATAACCAACATGACGTCCTTAAATAGACACATTTTGAAATTTATAAATTTACCATACACACAAATAGGAGTTTAACGACTTGTTAAATGATTCGTTAAAGTTAACGAAAAGACGTTTATAAAAGACTAAACTTGTAATTTTTAAAAAACTATTATAAACTTATTTAAATTCCATATTGACTGGATTTCTAAACTAAGAATTAAAATAGAAAATTTGAGAGCGTAAAATATTGTGTAGACGATAAAATAAAGAAAAAAGACAGTCCTAACTTCTCCCCACTGATCTATACGTCTTATACTAACTATCGCAAGAAGAGAAACGTCTCACACATTGATACATTCTCAACAATGTAGATAAAATAGTGGACTACTGCAAGTACGTATTTCCAACTTTATACTTCATTGACACTTGATTAAAATTTTTGTATTTCGAAATTATTTAAAAACAACACTATGCACTTGATTATTAGTCCTGAATTTATATTAATTTGCTCATCACCCTCCTCATTCTTATATCTACATACCAATATGTCACTATAGTAAATAGACAAATTATATCATAATAGTGAACAGACAAGTATTTGACTATCCATATCTAAACTTCTCAACTTCACCATTCAAATTGACAAAATTGAAGTTCAGAGT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Match: KAA0062919.1 (serine hydroxymethyltransferase 3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 211 bits (538), Expect = 5.75e-63 Identity = 102/104 (98.08%), Postives = 102/104 (98.08%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008245916.2 (PREDICTED: serine hydroxymethyltransferase 3, chloroplastic-like, partial [Prunus mume]) HSP 1 Score: 197 bits (500), Expect = 3.47e-57 Identity = 92/102 (90.20%), Postives = 98/102 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008451853.1 (PREDICTED: serine hydroxymethyltransferase 3, chloroplastic [Cucumis melo] >TYK16426.1 serine hydroxymethyltransferase 3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 205 bits (521), Expect = 8.74e-57 Identity = 98/102 (96.08%), Postives = 100/102 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94JQ3 (Serine hydroxymethyltransferase 3, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SHM3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 190.7 bits (483), Expect = 3.3e-47 Identity = 87/102 (85.29%), Postives = 97/102 (95.10%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P34896 (Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SHMT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 139.8 bits (351), Expect = 6.7e-32 Identity = 70/110 (63.64%), Postives = 84/110 (76.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RFK5 (Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic OS=Pongo abelii OX=9601 GN=SHMT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 139.8 bits (351), Expect = 6.7e-32 Identity = 70/110 (63.64%), Postives = 84/110 (76.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P07511 (Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic OS=Oryctolagus cuniculus OX=9986 GN=SHMT1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 1.5e-31 Identity = 69/110 (62.73%), Postives = 83/110 (75.45%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P50431 (Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic OS=Mus musculus OX=10090 GN=Shmt1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 2.5e-31 Identity = 68/110 (61.82%), Postives = 84/110 (76.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BTK7 (Glycine hydroxymethyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493015 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 268 bits (685), Expect = 1.45e-86 Identity = 129/130 (99.23%), Postives = 129/130 (99.23%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DYW5 (Glycine hydroxymethyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493015 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 262 bits (669), Expect = 4.22e-84 Identity = 125/127 (98.43%), Postives = 126/127 (99.21%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VBD7 (Glycine hydroxymethyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold468G00110 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 211 bits (538), Expect = 2.79e-63 Identity = 102/104 (98.08%), Postives = 102/104 (98.08%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D173 (Serine hydroxymethyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G002230 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 205 bits (521), Expect = 4.23e-57 Identity = 98/102 (96.08%), Postives = 100/102 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BSI5 (Serine hydroxymethyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493017 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 205 bits (521), Expect = 4.23e-57 Identity = 98/102 (96.08%), Postives = 100/102 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G32520.1 (serine hydroxymethyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 190.7 bits (483), Expect = 2.3e-48 Identity = 87/102 (85.29%), Postives = 97/102 (95.10%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G32520.2 (serine hydroxymethyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 190.7 bits (483), Expect = 2.3e-48 Identity = 87/102 (85.29%), Postives = 97/102 (95.10%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G37930.1 (serine transhydroxymethyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 2.9e-30 Identity = 66/110 (60.00%), Postives = 78/110 (70.91%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. TAIR 10
Match: AT5G26780.1 (serine hydroxymethyltransferase 2 ) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 5.4e-29 Identity = 64/110 (58.18%), Postives = 76/110 (69.09%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh102094.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G13930.1 (serine hydroxymethyltransferase 4 ) HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 1.9e-26 Identity = 61/111 (54.95%), Postives = 72/111 (64.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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