
MC11g1352 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGCTCCATAGAAAGGAAAGAAATTAAGTAAAATTTGGCAACCCTATATTAGCTTAGCCGCCGTGAATGCGAAAGAGGAGGAGAAAATTTCTTCTGTGAGTTCTTTTTCCTGCTTTCTCTCGGCGAGGTTGCTGTTGTTGTGTTTAAGATGGCCATGGCGACAGCATTTTCAAGCCCGAATCACTGTTTTGGTCGGCAATGGAACTCGCAATTTCCTACCAGCGGTCACATTTATCGTCGGAACTTGCAGAATCCGTCGTCATTTAGGTCGCCGGCGGGCCGTGTTTGTTGTAGTGAGGCACAGAGCATAAGCATAGCTTCCGATTCCAAACCGAATTCATCTGTTCAACGCCCGCCGTACATCCCCAATCGCATCCCTGACCCTTCCTATGTTCGCATTTTTGATACGACTCTCCGCGATGGCGAGCAGTCCCCAGGTGCGTCCCTCACCTCTAAAGAGAAGCTGGATATTGCTCGTCAGCTCGCCAAGCTCGGCGTGGACATAATTGAGGCTGGATTCCCAGCTGCTTCGAAGGAAGACTTTGAGGCTGTGAAGATCATTGCCAAAGAGGTGGGAAATGTTGTCGACCAGGACGGGTACGTGCCTGTAATTTGTGGTCTCTCGAGGTGCAATGAGAAGGATATTCGAACTGCATGGGAGGCCGTGAAGTACGCTAAGAGACCGCGGATACATACGTTTATTGCAACTAGCGAAATTCATATGAAGTATAAGCTGAGGAAGACGAGGGAGGAAGTGATTGAGATTGCTCGAAGTATGGTGCGGTTTGCACGAAGTTTGGGCTGTGATGATGTTGAGTTCAGCCCCGAGGATGCTGGGAGGTTTGACCTTGATCTCCACTTTTTAAAATTTCAAATTTGGTTTCATCTAATTTATGCAAACGAAAGAGTAAGCTGACTTTGCATGCTCCTTGGAAGTTCAAAACCTCTCAATCATTATTGATGTTTGCATCAAGTCGTTAATCAGTTTAGGTTTATGAAGCCTGAAGTTGTAAAATGTGAATTTGTTTTTTTTTTAGATAAGAAACATTTCATTAAGAAGGAAAACCAAAAAACGAACTAGGACAAGGGACGTCCCTTTCCCTAAAGAACACTAAAAGAGAAGGGCTCTCCAATCTGGTATGATCTTAGAGAGGCTGTAATTACTTGTTCCTATAACACTACCAAGATGTCATAATATGAACACGGTTCCTTTTCCAGCCATAAGTGGCATCAGAGAGCTCTAAAAGCACGGCCCCATAACTCTTTGCATTTACCGCTGAAGCTCCGTCCTTGAGTACATTCTGTCAACCAATCATCAATCATCTCAGGCAAGCAAGTAGAAATAGGGAATACATCGAACAAAAACTGCCACCCCCTTTTAGCAAAAGAATAATGAAAGAAAAGGTGATCTAAAGGATATGAAAATTAATAGGATATGAAAAATCTTGAATTGGTGTAGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTTGATTTGTAAAAGTTGGGGGTTTCACAATTTTGATTTATATAATTTGGGTTTACATAGGCTAGTGTGGTTAACAAACCTTTAACTAGTTTTGGCCTTTTTGTTGGCTGGATTAATACAATTAATTTAATGGGACAATGCTTAGACCCTATGTATGGTTGTTATCTAACTTGTACAGGTTGCCTATATATTTAATGCCCTATTTATCTGTTGCTGTTCATGAACGATATGTATCTTGTAAAATAATGAAGATAAAATATTTATTTTTCTGCTAGACATTACAAATTTATATTTGCAACTTTTCAAATTCTAAATTCTCGCACATATAAATATTTGCCTTTTTTATTTTCTGGCGTCCTATCAGATCTGATAGGGAGTTTCTTTACGAAATTCTGGGTGAAGTTATAAAGGCTGGGGCAACTACTCTCAACATACCAGATACTGTGGGTTATACCATGCCGGTTGAATTTGGGGCGTTGATTGCTGATATAAAAACTAATACGCCTGGCATTGAAAATGTTATCATTTCGACACACTGCCAGAATGATCTTGGACTCGCAACTGCCAACACAGTAGCAGTAAGTAATGCCTTTTTCTTCCCTTTTAATCCTGTTGATTGAACTGGACGTTTAATTTGGAACTACCCGAAGATAGTAGGAAAGTAAAAAGGATTACAAATATCATACTATAACACTAAGAAAGAAAAGGAAAAATATAAAAAAAAACAAGACGTGAAAATGATGAGGCTGCATCGTTGGAATATATACCTATAGTTATGGTCATATTTTAAGGATTTATATGCTCAAGAGTTTGCATCTTAAATTATGAAGAAGGGATAAGATATACATTTTGTGGCTTGATCTTTGTCCCTCGAAGTACAAAAGTTGTACTTGTGGAGGACAAACTTCTTCAGCCGCTCCTGGAAATTTGGCGAATTGCTAAGGGATTTTAGTGTGAACTATAAATCACTCTTCCACCTATGACCTATCTAAATGCTGTTACGACTTCATCTATTTCCTTAAGTAAATTATGTTTGATTCCTCTCATCTTTTTTCAGGGAGCATGTGCAGGTGCAAGGCAAGTTGAGGTCACAATTAATGGCATTGGTGAGAGAGCTGGAAATGCTTCGCTGGAGGAGGCAAGTTATTTATTTAATTTATTTCCTACTTATTCTTTCATTTATTTTGAAATAATAATCATTCAAGAAGGTTGTGTATAATAATAAGTTTTTAAACTTTAATAAATGTCTAACAAGCTCCTAAACTTTCAATTTTATATCTAATAGCTTCTTGAACTCTAATATATTCTTGACTAATGAGGCTTCTTTGACTATATTTTTCCACAATAATTTAGCACCAATTTTCATCCCATGACCACACCACATACCAACATAAAAACGTTATTTCAAAGCTTTCCTCTCCAAATACAAATTGGAAACAATAACTATAACTTGAAAATAGATACCACTAACAATATATAGTTCGCCATAGCCTCCTCTTGGAGCTCTTGCTCAGGGGAGTTTTGTTATTATTCTCCTAATGTTGCTTTATATTGGAGTGTTTTTTAAGCTCCTTTGGAGTTCTTGTACATTATTTACATAGAGAAGAAAAGTTTTGTTTCTTATAAATTTCTTAAGCACAATGTTGGCTGTACTTTGTTCTTTTCCTCTCCTCCTACAGCCCAACAATATGCTACTTTCTTTAATTTTTCTCTTTTGATAGGAAACAATTTTCATTGATGATATGAAATTATACAAAATGATCAAAACCTATACAATGAAGTTAAAAAATCTTCTCCAAATGGATATAAGAGACTTCAAGCTATAATTGCTAAAAGGAGAGACATTTTTACACCATGTTAGAGCCAAAAAAGAAATGAAATCAATCAATCAAGCGTTGCCAAATGACCCCCAACTTCTCCTTGAGGCAACTCTTATAGGACACTAATAAGACTGAATAGGACGAATTGCTCATTCTCATTAAATGTAATAGAGGAACAACTGTCCATATATACACACCACACAGGTGTCACTTAAATAATGTGACAAAATAACAACTTAACTATCTAACCATACAACTAACTAAGATAATATTAATACACTCATACTCCCCCCTCAAGATGGGGAAAAAACATCAAGAGACCCATCTTGCATAGCAGAGAGTTAAGCGTGACAGCAGGCAAGGCTTTTGTAAAAACATCAGCTAGTTGTAGGTGCGAACGAATAGGTAGAAGCCGAATAACACGAGATTTCTCCCGAACGAAATGTCAATCAAGCTCTATGTGCTTGGTACGCTCATGAAAACTCGGGTTAGTAGCAATGTGGATGACTGCGCATTATCACAATATAAAAGTGCAGGAGATGATATCATGATATAGGAACCTGCACTCATGTAGCAAATTGGTTAACCAAATAAGTTCACAAGTTGTAGCTGCCAACGCTCCGTACTCGGCTTCAACAGAGGATCGAGAAATTGTGGTATGCTTTTTTGCCTTCCAAGACACCAAGGAATCACCTAAGAAAACACAGAACCCAGTGGTACAACGCTGAGTATCAAGACACGATCCCAATCTGCAATTAGAGAATGATTTCAATTGAAAAGAAGAAGTAGCCAAAAAGATTCCACGACCTGGGGCATTTTTCAAATAGCGAAGCAGATAACATATAGCATGAAGATGAGCTTTGCTAGGTTGGGAAACAAACTAACTTAACTTGTGAACGACATACGTGATATCAAGCCGAGATATTGTCAGATAGAGAAGACGACTAACAAGTCTTCTAAAAACAGAAGGATCATCAAGATCAGTATTTCGAAGGTGAGTAGAAGGATCCATGGGAACAGCCACAGACTTGCATCCCAATAATCCAGTATCTTCTAATAAAGAGAGTGTATAATGCCTCTGAGATAAAGAAATACCACGATCTTCTAATAAAGAGAGTGTATAATGCCTCTGAGATAAAGAAATACCACGAGATGACCGTGCTAGCTCAAGGCCAAGAAAATACTTAAGTTGGTCGAGATCTTTCAGCTTAAAAGTCTGGTCAAGAAGACATTTCAAATCATTAAGGGCCCGTTTGGTTGGAAACTCGGATTCTGTTTTTGTTTTCAGATTCACTGAATCAAATGAGTGTTTGGCAGAATTTTTGAGTTTCGTTTTTTAAAACTGTTTTCGGATTCTGTGATTCAAACAGTAGAAATTTTGAAAACGACTTTTTTATGTTTTCAGTGTTTTCAGATTCAGAATTTGAAATTTTTAAGATGCAGAATTACATTAAAAAGATAAAAACTTTGATAAAATATATTACTTCATATTATAAACTCATTTTATGCTTGTTAAAATTGAAACATGTAAAATATAATGTATTCTAAATTATATAACCCTGTAAAATAATAATCATACAAAATTCATAAAAAAATGTTAATAAATTACTTAATATAATTTAGATTAAACTTTGTAACTAATTTTAGTTTAGAAATTTAGTTTGTAACTAATTTTGCAACTGGAGAGAATGTCTCCAT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ATGGCCATGGCGACAGCATTTTCAAGCCCGAATCACTGTTTTGGTCGGCAATGGAACTCGCAATTTCCTACCAGCGGTCACATTTATCGTCGGAACTTGCAGAATCCGTCGTCATTTAGGTCGCCGGCGGGCCGTGTTTGTTGTAGTGAGGCACAGAGCATAAGCATAGCTTCCGATTCCAAACCGAATTCATCTGTTCAACGCCCGCCGTACATCCCCAATCGCATCCCTGACCCTTCCTATGTTCGCATTTTTGATACGACTCTCCGCGATGGCGAGCAGTCCCCAGGTGCGTCCCTCACCTCTAAAGAGAAGCTGGATATTGCTCGTCAGCTCGCCAAGCTCGGCGTGGACATAATTGAGGCTGGATTCCCAGCTGCTTCGAAGGAAGACTTTGAGGCTGTGAAGATCATTGCCAAAGAGGTGGGAAATGTTGTCGACCAGGACGGGTACGTGCCTGTAATTTGTGGTCTCTCGAGGTGCAATGAGAAGGATATTCGAACTGCATGGGAGGCCGTGAAGTACGCTAAGAGACCGCGGATACATACGTTTATTGCAACTAGCGAAATTCATATGAAGTATAAGCTGAGGAAGACGAGGGAGGAAGTGATTGAGATTGCTCGAAGTATGGTGCGGTTTGCACGAAGTTTGGGCTGTGATGATGTTGAGTTCAGCCCCGAGGATGCTGGGAGATCTGATAGGGAGTTTCTTTACGAAATTCTGGGTGAAGTTATAAAGGCTGGGGCAACTACTCTCAACATACCAGATACTGTGGGTTATACCATGCCGGTTGAATTTGGGGCGTTGATTGCTGATATAAAAACTAATACGCCTGGCATTGAAAATGTTATCATTTCGACACACTGCCAGAATGATCTTGGACTCGCAACTGCCAACACAGTAGCAGGAGCATGTGCAGGTGCAAGGCAAGTTGAGGTCACAATTAATGGCATTGGTGAGAGAGCTGGAAATGCTTCGCTGGAGGAGGCAAGTTATTTATTTAATTTATTTCCTACTTATTCTTTCATTTATTTTGAAATAATAATCATTCAAGAAGGTTGTGTGGTAATGGCCTTACAATGTCGTGGAGAGCATGTGCTTGGAGGTCTTCATTCTGGAATTAACTCAAGACATATCTTTCTGACTAGCAAGATGGTAGAAGAATATACTGGCTTGAATGTACAACCGCACAAGGCTATTGTTGGAGCTAATGCTTTTGCTCATGAAAGTGGCATCCACCAGGATGGGATGCTTAAGCACAAAGGTACTTATGAAATCATATCCCCTGAAGACATTGGCTACGAACGATCCAATGATGCTGGTATTGTTCTAGGAAAACTTAGTGGACGCCATGCCCTTAAAAGTCGACTTCAAGAGCTTGGTTATGAGCTTGACAATGAGAATCTTGACAACATATTCTGGCGTTTCAAAGCAGTAGCTGAACAAAAGAAGAGAGTAACAGATGCTGATCTTCGAGCATTGGTATCCGATGAAGTTTTTCAACCAAGTGTTGTCTGGAAGCTGCTAGATTTGCAGGTAACCTGTGGAACTCTTGGTCTTTCTACGGCTACCGTTAAACTCCTCAATGCTGATGGTAAAGAGCATACTAATTGTGCTGTTGGAACGGGGCCTGTAGATTCAGCTTACAAGGCTGTAGATGGCATTGTGAAGGAACCAGTTGCACTTCTTGAGTATTCGATGAACGCTGTCACTGAAGGCATTGATGCAATTGCCACGACCCGTGTTGTAATAAGAGGGGAAAACAGTTACACATCTACTAATGCAATTACAGGAGAAGCAGTTCAACGAACATTTAGTGGTATCGGGGCTGGCATGGACATAGTCGTATCAAGTGTGAAGGCCTACATTGGTGCACTAAACAAGATGCTTGGTTTTCAAGGAGTTGACATTAAGGTTTAG MAMATAFSSPNHCFGRQWNSQFPTSGHIYRRNLQNPSSFRSPAGRVCCSEAQSISIASDSKPNSSVQRPPYIPNRIPDPSYVRIFDTTLRDGEQSPGASLTSKEKLDIARQLAKLGVDIIEAGFPAASKEDFEAVKIIAKEVGNVVDQDGYVPVICGLSRCNEKDIRTAWEAVKYAKRPRIHTFIATSEIHMKYKLRKTREEVIEIARSMVRFARSLGCDDVEFSPEDAGRSDREFLYEILGEVIKAGATTLNIPDTVGYTMPVEFGALIADIKTNTPGIENVIISTHCQNDLGLATANTVAGACAGARQVEVTINGIGERAGNASLEEASYLFNLFPTYSFIYFEIIIIQEGCVVMALQCRGEHVLGGLHSGINSRHIFLTSKMVEEYTGLNVQPHKAIVGANAFAHESGIHQDGMLKHKGTYEIISPEDIGYERSNDAGIVLGKLSGRHALKSRLQELGYELDNENLDNIFWRFKAVAEQKKRVTDADLRALVSDEVFQPSVVWKLLDLQVTCGTLGLSTATVKLLNADGKEHTNCAVGTGPVDSAYKAVDGIVKEPVALLEYSMNAVTEGIDAIATTRVVIRGENSYTSTNAITGEAVQRTFSGIGAGMDIVVSSVKAYIGALNKMLGFQGVDIKV Homology
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C550 (2-isopropylmalate synthase 2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPMS2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 919.5 bits (2375), Expect = 2.1e-266 Identity = 463/581 (79.69%), Postives = 518/581 (89.16%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LPR4 (2-isopropylmalate synthase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPMS1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 908.7 bits (2347), Expect = 3.8e-263 Identity = 465/597 (77.89%), Postives = 515/597 (86.26%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04973 (2-isopropylmalate synthase A OS=Solanum pennellii OX=28526 GN=IPMSA PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 844.7 bits (2181), Expect = 6.7e-244 Identity = 418/569 (73.46%), Postives = 491/569 (86.29%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04974 (2-isopropylmalate synthase B OS=Solanum pennellii OX=28526 GN=IPMSB PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 832.0 bits (2148), Expect = 4.5e-240 Identity = 415/570 (72.81%), Postives = 491/570 (86.14%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39891 (Probable 2-isopropylmalate synthase OS=Glycine max OX=3847 GN=GMN56 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 745.0 bits (1922), Expect = 7.2e-214 Identity = 383/576 (66.49%), Postives = 450/576 (78.12%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. NCBI nr
Match: XP_022141882.1 (2-isopropylmalate synthase 2, chloroplastic-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1197 bits (3096), Expect = 0.0 Identity = 614/639 (96.09%), Postives = 614/639 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. NCBI nr
Match: XP_022141881.1 (2-isopropylmalate synthase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1197 bits (3096), Expect = 0.0 Identity = 614/639 (96.09%), Postives = 614/639 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. NCBI nr
Match: XP_038875433.1 (2-isopropylmalate synthase 2, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1047 bits (2708), Expect = 0.0 Identity = 549/650 (84.46%), Postives = 577/650 (88.77%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. NCBI nr
Match: XP_011651428.1 (2-isopropylmalate synthase 2, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN57885.1 hypothetical protein Csa_010376 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1037 bits (2682), Expect = 0.0 Identity = 540/654 (82.57%), Postives = 574/654 (87.77%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. NCBI nr
Match: TYK01483.1 (2-isopropylmalate synthase 2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1035 bits (2677), Expect = 0.0 Identity = 539/650 (82.92%), Postives = 573/650 (88.15%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CL37 (2-isopropylmalate synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012138 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1197 bits (3096), Expect = 0.0 Identity = 614/639 (96.09%), Postives = 614/639 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKJ3 (2-isopropylmalate synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012138 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1197 bits (3096), Expect = 0.0 Identity = 614/639 (96.09%), Postives = 614/639 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L7C8 (2-isopropylmalate synthase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G363180 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1037 bits (2682), Expect = 0.0 Identity = 540/654 (82.57%), Postives = 574/654 (87.77%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BP53 (2-isopropylmalate synthase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold451G00350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1035 bits (2677), Expect = 0.0 Identity = 539/650 (82.92%), Postives = 573/650 (88.15%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4S6 (2-isopropylmalate synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496846 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1034 bits (2674), Expect = 0.0 Identity = 539/653 (82.54%), Postives = 573/653 (87.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. TAIR 10
Match: AT1G74040.1 (2-isopropylmalate synthase 1 ) HSP 1 Score: 919.5 bits (2375), Expect = 1.5e-267 Identity = 463/581 (79.69%), Postives = 518/581 (89.16%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. TAIR 10
Match: AT1G18500.1 (methylthioalkylmalate synthase-like 4 ) HSP 1 Score: 908.7 bits (2347), Expect = 2.7e-264 Identity = 465/597 (77.89%), Postives = 515/597 (86.26%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. TAIR 10
Match: AT5G23010.1 (methylthioalkylmalate synthase 1 ) HSP 1 Score: 543.9 bits (1400), Expect = 1.7e-154 Identity = 282/484 (58.26%), Postives = 359/484 (74.17%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g1352 vs. TAIR 10
Match: AT5G23020.1 (2-isopropylmalate synthase 2 ) HSP 1 Score: 534.6 bits (1376), Expect = 1.1e-151 Identity = 266/452 (58.85%), Postives = 350/452 (77.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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