MC11g0620 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCCTGAGGCACGTGATAATCATATGCCAGCCATCCAGGCCTCCGCGCCAAGGCCGTCGTCTCATCCGCTTCCTTAAATTCCCTCCGCGACCACCCCGCTGCGGTTGTTTCTCCAGTCAGTGTTCACGTTCTTCTCCGGAATAAAATTGTCCGCTCCTTCAAAGCCCTAACACCTCTCCAAGAACTAACTTCTGGTTCTAGGTCAACTATGGCGGGAGCTCTCAGAGAAAGAGCACTCTCTCTCATGGCCGCCGCTAACAACCATGGTGATTTAACGGTCAAGATTTCATCTTTGAGGCAGGTGAAGGATATTATACTGTCCATCGAGCCATCGTTCGCCGCAGAGCTCTACTCCTACTTGGTGGAGCTTCAGTCTTCCCCCGAGAGCCTACTACGTAAATTGTTAATTGAGTGAGTCCACAACCCTAATTTTCCATCTCTGTTGTATGTATTTTGGATTATTTATACTTTTTGTTACACTTCCCATATTTATACTACCTACAAAGTGACTTACACCGAAGTATGATCCTTGTATGAGTCCAACGTTGCTAAATAGTGGAGCGAGATGTAAAGTTTGGGGAAACCATATCCCATTGCGAGGGAAAGTACGTTTTGGTCTTGTGTATACTGAATTATATGCAAAAATATTGGTTACCTACTTATGGGAATCTTGTTTCTTACATATCATGCTCGTCCGTCTTACTTGGTCCGCAATGTATTTATATGCGGCATCAAATTTTGATCAAAGACATCAATCTATAGTCATTAGGTACATGTTCAATTATTATGCTAAAAAACTTAAAGTTGATAGGTTTAAGATAAATTTTATTCTAAAATGTTTGGAGTTTGGTGCTGGAAGAATTTGAGCTTAAATGCGATTCTGCTAAGGAGGCTTTGTCCTTGTTCCGCCTCCTCCTTTACAGAGCTCCTTTCAAGAGACCAATGAGGGACATATTTGTGAACTTTGGGAGTATGCCAAATTTAACGTCATTGTGTGGTGCTTTGGTCAAAGTTTCTTAGTACTTATTCTTCTTTTTCGATTACTACATTTTTCATCAACTCCCTTGGTTTTTGTTGGTTGGGAGATTGCTTATCCTTCCCTCCTGTAATTATCTATTTGACAATGAAAAATTGTTTCTTGCAAAAAATAGATGGGCTAGGCCTAGGGTAAATTTAATAATTTCAATATATTTTTAATGGGATAGTTGGTCAGTTTCACGTGGATTCAGTTTTCTTGCATATATATGTCTTTTAAAAACTATTGTTTTACTTTGGCTAATTGTTTGCTATGAAGGAGATATGCTTAGTCCAGGTGCAGTCAATGATAGCTCATCTATGTTGCACTCTTTTAGCCGCTGTGTATTTGTTATCAGAGCCGTATCTTATATTTTACTCTGTTACTGTCCGAGAATGTTCTTATACTCGAATCAAATTTTATGGCCAGTTAATATACTCATGGTATAACTTGTATTTTCTTCTGTAAGCATAACTATATTTGCGTTTCAGAGTGAGTGCATGGCTTGTCCACTAGGCTTCTTTTTTTAATACCTTCAATTTCTCCAGCTGCTGGAATATTTTTCTATCGTTTATTTATACCCTAAATGGTTTCAATTTACACGATGTACAGGGTGATTGAAGACATTGGACTAAGAGCCATGGAACATTCGCCTCTATTAATGTCAGTTTTATTGGCATCTTTAAAGGATGAAGACCCTATTGTAGCAAGACAATCAATTATTAGTGGCCAAAAATTATTTTGTGGTGTTTTAAGAGAGATGACAATGCAGGTTTCTCCTTCTGCTTCTCCTTGCTTAAAGTGGAAGAAATGTTAAAACTGTCGGACTTACTAAACATATGCTTAATTTTATTGCTTGCCCGACATGGTTAGAGAAGGCCAGTCAATCATTATGTTATATTTATGTATAATCACTTCTAGTCTTTGATCAATGTCATTAGCATGCAGATGCTTTATATATATTCTCCAGTTGAAATTTATTTTATAGTTTTTAAAATTAGATGCTAACTTTAGAATTCCACAGTTGCATCGGCGAGGTAAAGTTGAGAGATGGCTTGAAGAACTGTGGATGAGAATGTTGAAGTTTAAAGACGATATTTTGGCAATTGCTATAGAGGTATATAAATGCCCAACTTCCAGTCCTCTAAACATTGTGCTACTGTTTTTATTTGAAATTGGAATTGCATTCGTATTTGCGTGGATATGTTGATCTTGTTAATGGTACATCAATAATACAAGTAAACCTGAGGCTGCCATTGCCAGGTACTTCTCTGTGTTTTTTGGAGGAATGCATGGAAATAGTATGGAGTAATCCCATACTATGGCATTTATATGGTCCCGAAAGTTTTTAAGCTAGCCTATCTTGTCATTTTAGTCTTATTTTCCTGTTGTTTTATAAAGCAATTGAAGCTCTTTTGAGTATTGTTACCTTGCATCTTATAGTAGTAAGTTTTCCTCACATTTGATGCTTTTTTATGCAGTTGAATTTCAGTGCTTTTTTCTCAGTATCAGTATATACAGTGTATCGTTTAAGGATTTGTATGTGATAAAAAAAGATTATTTTTGTACTCCATTTCTCAAATTCTCCATTTTTGTAGTGAAAAATTTAAAACTTTTCAGGAGTTGTCAATTTATTTGAATTCGAGCATTAATCCATAAAAGTTTATCTTATGGTTGAAGTACACTTAGAATAATATTGAAGATATACATGATTGTCTTGATAGTTTATGGGTCAGTCATGAGTGTGAAAAATATGGTATAAATTTGGATACGAATCTGAAGGTTTAGATGGTTCAATAACTTTTTCTATTCCCCCTTTCTTTAATAGATTACACCTCTTTGTATTCTATGTTTCTAGAGGAATTTTAATTTTCCTAACATAACTTTACCATACTTTTAGTAATGAATACATTTTTTTAGTTCTGAATACTTTCAGTGGATGTTGTGTTTTAATGTGTGTTTAATATTAAAATGCTCCTTCCGGGCCACTTCCTTGTATATTTCATTTTTCTTATCGGAAGGTACACATGATTAGTTGAATTTCCAGTATTTTATTTTTATTTTTGAGGAACTACCAAGTGTTATGATCTTAAAGCTGCTGCTTAAATGTCATATTGTAGCCTGGTTCTGTTGGGAAGAGGTTGCTGGCTTTGAAATTTTTGGAAACATATGTTCTACTTTTTACCTCTGATACAAATGATCCACAGAAACCTGTCTCAGAAGGTATTACATTTAGGCATCACAAACTTGTTCCCACGTTTGTAGCATTTCTCATTTTTTCCAGTTGTTTAGCTTAGAAGTAAATATATATTTGTAATCTGTTTCTAGAAGTTTGTTTGCTCGGAATTTAACTTAATTCTGTCTACTAACAGGAAATGGGGATATTTTTAATATTTCATGGCTAGCTGGTGGTTTTCCTATTTTGGATCCAGTTGGGCTCATGTCGGAAGCTAATAGGATGCTTGGCATTCTGTTAAATTTGTTGCAGTCCAGTTCTGTTCCTGGTACATACACAGTTACAGTTGTCAGTTGGTGAGATTTCTCTCTCTAATTTTTGGTTGTTTTATTAGTTGATGGCTGTTTGACATTTAAAATTGAAGTTTATTCTCTTCATTCTGTATAATTTATCCATCGCTAGTTGCTATCTGTCCTTTTGGTGTAAATGTACTGTCGTTTAGGATAATGTGAAAGAAGTTAAAGAAAAAAAGGCAGGATTACATACGTTACTGCTGTGTATCAAGTGAAAAGCATCAGACTTCATTTTCATCAGCTTAAGGATCTTGAGTTAATAATATTCATTTTTTTTCTTTATTGTTAATCATAGACCACCACCTCTCAACATATGGGAGAGGAAATCAGATTTAGAATTGGTGCTAGATGGTGTGTCTTGATATATATGTTTAAGTACAAACTTGTTCATGCACACATCTAACCTAAAGAGGCCAAGCCCAAAGAAAAATTTATGTCTACATCACTAGAACTTACTTCTAGGTTCTCATTTCTCGACTGGTTGTATTTGTTTTTAATTATTTTCTAAAGTCCAGCAACTTCTAATATTATATTTTCAACAATATATCTCCTTTGTGGTTGTTGATCTAGATCTTTCTGAATGATGATGGAACTAACTGCTTTCTGGATATTTTCTTATAAAAATAAACTGCTTTCTGCATATTTAGAGTGGATAATTTATTGGTTTAAAATTTTATTTTGAATTTATGTATGTATGTATGTATGTTAATTTGAGCGAATTTCTGTATTCCTAAATGCGACATTGAAATCTGTGTTTGAGTCTTCATCATTTTCTCCAAGAGTAAAGCTGTGATTTTCTTTGAGAGTTGGTAACTTTTAAAATATAAATGATTAGTTTTTATTTCTTGAAAAAAAAGGGAAAAAAAGGAAAGATTTGAACTGTGACATTCTTCAGGTGTAGTTGATTCTTTTTGAATGTTCTCTAATCAGCACTTTTTTTGTGCTTGTCAAATTAACAAATTTGTTTGCGTAATTTTTGCTTACATGCCATTTTATGATATTTTTAAATTAGTTTATTGTTTGATTCAATTTCTTGTGCTGTCTAAAATGTAATGCTCTTCCTGTTATGTACTATTACGTTCTTATTTTGAAGTATTTGATTATGATATTATAGAATTTTTACTTCTTGTTTATTGTATTTATGTTAGATCTTTATATTCTCCTTTTCCAGCATTCATCACGGTGATTATATGATAATGACAATACTTCTAAAAAGACATAACATAGAGGATGCAGAAAGTTGCAGATAGTGCCGTTACTGTTTTACTTGCATTCTGTATGCATCTAGTTATACAACAACTAAATTAGATTGGAAATTATCGTCTTGATCTATGTTGAAAGATGTGTTCCATTCAAAATTTAGTGCTTATAATCTTTTTAGAACATCTATTCATCTTTATTATTGCTTATATGACATGGCCAACATTCTTAGGTCATGATCATTGAATCTT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MAGALRERALSLMAAANNHGDLTVKISSLRQVKDIILSIEPSFAAELYSYLVELQSSPESLLRKLLIEVIEDIGLRAMEHSPLLMSVLLASLKDEDPIVARQSIISGQKLFCGVLREMTMQLHRRGKVERWLEELWMRMLKFKDDILAIAIEPGSVGKRLLALKFLETYVLLFTSDTNDPQKPVSEGNGDIFNISWLAGGFPILDPVGLMSEANRMLGILLNLLQSSSVPGTYTVTVVSCLAAIARKRPVHYGNILSALLEFIPSFEMLKGRHAASVQYSIRSALMGFLRCMHPAFVELDFLLVQSRDRLLKALRAINAGDAADQVIRQVDKMVKAADRASRDVWLGKDDQSSNQLNVSVDLTRKRPRPLDDEELSNGRDVVSKQIRFGPDVHLVFAAQKDGSLQNAISNGTPPDIHALDVELTPAEQMIAMIGALLAEGERGAESLEILISNIHPDLLADIVITNMKNLPKASPPLTRHGDLPVTRQGSSHVQVLASSAPSSSVQTPVATAQVPFSLAISAGSTFADSTVNSLPVDSKRDPRRDPRRLDPRRVGVSSASSVEETTSNIPDVDGSISLVKPASAPVSVTIENPSVPLISKMKVEEKTVEIPVGFGTDQSTPKSKSPDGAEKVDTILEVNDSLDPTPSAVGKADEDLVAVNLFDESATKRDDTSSSTEYSQYSPSVTNAAVSEDTCQELPLLPPYVDLTPEQQITVRNLAAEKIFDSCKNLNGAECHQIRLAVIARLVAQVDADDYIVGMLEKQVALDYQQQKGHELALHVLYHLHSLDILDSVESSSSAVYEKFLLVVAKSLLDSFPASDKSFSRLLGEVPVLPDSTLELLHNLCYSDVTDNHGKDTPDIERVTQGLGTVWNLIVKRPYSRQACLDIALKCAMHSEVKIRATAIRLVANKLYRLSYISDRIEQYATNLFLNAVDNLQTDAEPSSCGSIEQRTRGEGESQETTICASQVSDPGTSEIDSMRSSQPTVHGSSTLSSSEAERHISLLFALCVKKPQLLQLVFDAYGRAPRAVKEAVHEHIPNLITALGSSDSELLRIISDPPQGSEHLLALVLQVLTQGTTPSSDLIATVQHLYETKLKDVTILIPMLSSLSKNEVLPVFPRLVDLPLEKFQRALAHILQGSAYTRPALTPVEVLIAIHNITPEKDGLALKKITDACSACFEQRTVFTQQVLAKALSQMVEQTPLPLLFMRTVIQAIDAFPTLVDFVMEILSKLVNKQVWRMPKLWFGFLKCAFQTQPHSFRVLLQLPPPQLENALNKYVNLKGPLAAYASQPTTKSTLSR Homology
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZYV9 (Symplekin OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=sympk PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 232.6 bits (592), Expect = 2.4e-59 Identity = 175/586 (29.86%), Postives = 288/586 (49.15%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92797 (Symplekin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYMPK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 228.4 bits (581), Expect = 4.6e-58 Identity = 180/586 (30.72%), Postives = 293/586 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80X82 (Symplekin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Sympk PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 7.9e-58 Identity = 178/586 (30.38%), Postives = 292/586 (49.83%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8MSU4 (Symplekin OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Sym PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 6.5e-44 Identity = 108/291 (37.11%), Postives = 169/291 (58.08%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q01329 (Pre-tRNA-processing protein PTA1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PTA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 48.9 bits (115), Expect = 5.0e-04 Identity = 33/109 (30.28%), Postives = 57/109 (52.29%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. NCBI nr
Match: XP_022142024.1 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2456 bits (6365), Expect = 0.0 Identity = 1291/1298 (99.46%), Postives = 1291/1298 (99.46%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. NCBI nr
Match: XP_022141301.1 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2451 bits (6353), Expect = 0.0 Identity = 1291/1299 (99.38%), Postives = 1291/1299 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. NCBI nr
Match: XP_022140519.1 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2451 bits (6353), Expect = 0.0 Identity = 1291/1299 (99.38%), Postives = 1291/1299 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. NCBI nr
Match: XP_022139751.1 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2447 bits (6341), Expect = 0.0 Identity = 1291/1300 (99.31%), Postives = 1291/1300 (99.31%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. NCBI nr
Match: XP_038898451.1 (uncharacterized protein LOC120086087 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2197 bits (5694), Expect = 0.0 Identity = 1162/1300 (89.38%), Postives = 1215/1300 (93.46%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKE2 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2456 bits (6365), Expect = 0.0 Identity = 1291/1298 (99.46%), Postives = 1291/1298 (99.46%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CFX6 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2451 bits (6353), Expect = 0.0 Identity = 1291/1299 (99.38%), Postives = 1291/1299 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CIR7 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2451 bits (6353), Expect = 0.0 Identity = 1291/1299 (99.38%), Postives = 1291/1299 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CDN2 (uncharacterized protein LOC111010308 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2447 bits (6341), Expect = 0.0 Identity = 1291/1300 (99.31%), Postives = 1291/1300 (99.31%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQH3 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2167 bits (5614), Expect = 0.0 Identity = 1142/1299 (87.91%), Postives = 1205/1299 (92.76%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. TAIR 10
Match: AT1G27595.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Symplekin tight junction protein C-terminal (InterPro:IPR022075); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HEAT repeat-containing protein (TAIR:AT5G01400.1); Has 593 Blast hits to 297 proteins in 111 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 139; Fungi - 49; Plants - 57; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 345 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 820.5 bits (2118), Expect = 2.0e-237 Identity = 488/946 (51.59%), Postives = 645/946 (68.18%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. TAIR 10
Match: AT5G01400.1 (HEAT repeat-containing protein ) HSP 1 Score: 653.7 bits (1685), Expect = 3.2e-187 Identity = 481/1340 (35.90%), Postives = 711/1340 (53.06%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. TAIR 10
Match: AT1G27590.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3453 (InterPro:IPR021850); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein (TAIR:AT1G27570.1); Has 109 Blast hits to 109 proteins in 38 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 65; Fungi - 4; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 285.4 bits (729), Expect = 2.3e-76 Identity = 142/239 (59.41%), Postives = 186/239 (77.82%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.1 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 256.1 bits (653), Expect = 1.5e-67 Identity = 151/347 (43.52%), Postives = 215/347 (61.96%), Query Frame = 0
BLAST of MC11g0620 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.2 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 5.8e-40 Identity = 123/368 (33.42%), Postives = 182/368 (49.46%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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