
MC10g0915 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGATTTTTCATTTTTTGTGTATGGGGATTCACAAATTGGTAATTTAACATAAAATTAGTATTGTGCGAAAGACATAAAAGCCCTGCATCCAAGGGGTGGGGCGGGCGATGGCGAGTGGCGAGGCGAGGCGAGGCGACGCATCGTTAGAGGCTTTCCTGTAATTATATATTTAGTCAGGGGTATTCCGGTAAAAAAGCGAAATGATTTTCTCTCAGATGTCTATAAATACCGGCCCCCTCTTCAATTTCTTGCCCATTCTTCAATTGGGTCAGCCAGACGATTTCAATTGCGAAAGATAATCCCATCCAATTCGATCAGCGTCCAGGTACTACTTCTTCATTCTCTGCTCTCTTAGGGTTCGTAGTTTCTAGGGTTTTTATTAAGTTTTCTTCTGGTTTATGATGTGTTATTTTCTTACTGCCTCTAACCTAGGGTTCTACTCGTCGTCGTATCCTGTGTGCTTCCCGTTCTTTGTGTTTTTCGTTGTTTCTGTTTCTTTTTCTTGGTTGGGTGGGCGGAAATGGGTGGGGCGGAGAATTTATAGTTTCTGGTTTGAATAACAATATTAGAGTGCCTGAATTCTGGATTTTACGCGTGAAATTGAGTAATTGGTAGCGTGGTGATATGGCATTCGGATCAAAAATGGAATTTTCCGGAAGTTTTAGTTATGATTTGCTTTTGGTTCGTTCCCTAGTTGATGAATTTGTATGATTTTAGGGAAGTGAAAATTGCACCCCGAGTATACTTGCTTTTTCTTGATTGGAGTAGTCCATACTTTTAATGTGAATGTTTTTTAATAGTAAGGACGGGTAGTGAATGTGGGTTTTATTTTATGAGGATTGGTAGTTTTATTGACTGTTTGATATGCTCGAAAGATCTAGTCTCTATGTCCTTTCAAGTTTCATTACAACTCTCATTCGTAAGACTGATTGCTAATGGTATTGTATATGGATGTGGACAGACTCGCGCCACAAGAAATGGGAAAAAGAAAATCAAGAGCAAAGCCCCCACCTAAGAAGAGGATGGATAAGCTCGACACTGTTTTTAGCTGCCCCTTCTGCAATCATGGGACCAGCGTGGAATGTCGCATGTAAGTTTGCATTTGGTTTCTCTCGGTTTCTAGTAACACGTGGGGGAGGGATTTGATTGAAGGATTTTAGTAGTTCGAGGCACAATGCATGGTTTTACTTCAAAATGTCATACAAAAAGCAGTAACAGTGAATATGTATAATGTCATTAACTTGTCTCCTGGATTAGTCTCTCTGTCTAGGTGCCTCATTGTTTTGCATTGTGACGAGGGTGTTTGTATGGTTTTAGTGATATGAAGAACCTGATTGGGGAAGCCTCCTGTAGGATTTGTCAAGAGGGCTTTAGCACAACCATTACAGGTATTCCTTCAAATTTATTTACGAGTGACCGTTTTCCATGAGCTGCTGTGTTTATTTTATTTCTTGTTATTTATTATGATGCGATTGGAACAATTTAGAAATTTTTTATGTATGTTTTGTTTTCAACTGAACCCTTTTTTAGGTTTTGGACTTTGAACGGGCGCATGTGAATATTGCCCCATTTTCTCAGTGCTGAAAGTCGATAGGATTTATGGAAGATTTGATTTGCATTATTACTAGATCATTTCTAGATTTTGTCCTGTTGTGGGGAAGTTGGATTGTAAATGAAAATGTGTTCAAGTTTAGGTCTCTTGTATGACTTTTGTGGATTGAATCGTCTTCACATTGGATTGAATGCTTCCAACAAAAATTTCATTAATATCTAATTTCTTTTATTTTGCAGCCTTGACAGAGCCAATAGACATGTAAGTAAAATTAAAAATGCAAATGGTTTTGTCAATGTTGATGCGTTTCAGTACTTCAATTGACATGATATTGTTCTGATCAGATATAGCGAATGGATTGATGAATGTGAGCGGGTAAACAACCTTGAGGAAGATGATGCTGCCTAGGGGTATCAAAGGGGAAGGTTGAAGTTCGCCGTTTCTCCATGAAAAAAGAAGCTGGCTAGTTCGAAGTACGTTTTATGAATCAATCTAAATTAAGAGGGTCTCACTCTGGTAGGTATAACAACACTCTTAGCCTCATAGCAGTATAGACAAGCATGTATGTACAGTAGTATGTTGTAACGCGAATTTTACATACTCTGTAATTTTCTTTCATGATTTTTGAATCTCGGATCTTGGACACAAAAGTAATGGTAATGCGAATTTTCTTCCATGTCTGAACCATTCATTGATAACTTAGAATAATTCAAGCTTTTTGTAAATGAAATATTGAAAGATATGTTATTTATGGTATCTTTTTATCATAGAATTTATGATCATTGGACCTTTTTTTGAAAATGGAAATAATATCATATGGAGCTTATTCGTAGCACGTGAAAAACAAATTAGAAGATAGAATTCTTTATGATTGTAGGGTGGTGGAGTGCTGTAAATGGTTTAAAACTAAAGCCCTTTAAAGTTTTGTAACTTACGTTGGTACTATCAGGCAATATTTTTGTGTAACTTTCATTTTTGTAATTCAGGTAGGTTTACTTTATTTTAAACTATGAGTTATATAAATTTGCAATAAAAAAATTAACTTCCACATTTCTTCATCTGGGCAAATTTCCATGTGATAACATAGTTTTGCTGAGTCTAACTTTTTATTTAAAATATTAATAGATGTTTGTTTCAATACTATTTTTAAAACTTTTTTTTATTTAAAATGTTAATAGATGTCTGCTCGAACACTATTTTTTAAACTTCTATGAAAGGTGAAAGATAGTATTGAAATTTTTAAGGATTCAATTAGCAGAATTTTTTTAGTACCAATTAGCATAAATTTACTAGAAGGTATCGGAACAAGAAAGTTAGAAATGAAATTGATCCAACTTTCCTAAGTTTAGAGCTAAAACTTTCATTCATTTTTATTGAAAAATCAATTTTCACCAAGAAAAATGAAAAGTATACAAAATAGCAACTTTTCTGTGATCCAAAATATGTCTTTGTACCTGTATTAGTAGTATATCAGATACTGATATATATACATATTGCACGTGCACTCATATAAGTAGTATATTACATACATATTGTAAATATATCATACACGTATCATATCACATATTCAAATATATTACAGATATATATCATTTGGGTAAAGTTATCACTTTTCAAAACTAAATGTGATTGTTATTTTGCTAATTTATTAAATGTTTTTGACATATTTGCTCATCCAACAAAAAGAAACCGAATGTGTTAGATCCAAACAAACAAGTTTTTATACCCTATTTCTTTTATATTCTTTTAAGGTTAAAGAATGTTATGCACTTTCATTAAAACTTTTAAACGTAATGATTTGGTCATCACTCGATTTCTACTCAGTTTTGAAAGAACGAACATGCCTCCCATTTTTTCTAATGATTTTCATCTTCTAGTTTCCACCTTTTTGACTTGCCACTAATTTCATGGTTTGGCTACTAAAGATGAGTGTTTGGAATGACGTTAGTTCTGACCAATTGAATTTTGGTCGAGAGCCAAAATGAAACAAATTTGTTGCCAAAATTTTGTGCTATAACACGGTTTAATGCAATTTTGCAAAAAGATCATTCAACATTTGAAAAAACTTGCAAAAATCAAGAGGAACGAGTAATATTTTTCTATTTTGGTTACATCACAATCCTTATCTTGGTTGGAATATAGCCTTTAATAATGCAATTATCTTTTTAACTTTAGTGATTTTTTTTTAATAATTGTATGAAGACTTTTTATTTATTTAAATTATAGATTTTTGGTGTTGATGCGGCCAATAAAATATTTAAATAGAAAATTTGTGGTGTGTGTATTTAGTACACCCGTGAAAATGCTCATTGCCCACCAACTTTATTTAAATTTGCAATATCCCTCGGTCTTTTTTTAATATTTTTAAAAATATATTTAATTGAGAGATGCACTAATAGCACTTCACATGTTTCTTATTTTATCACACCACTTTTCTATGTATGCAAACTTTGTCAAAAGGGAAATTTGAGGGGTGTTCTTTTTAGTTTTAAATAAATTTTTAGATATTAGAAATGTATTAAAAAAAAGAAGTTCAAGTTTCCGAGGAAGGATAAAATACAAAATTCAATAGTGCGAGCTTGAGTATAGTGGAGATTCGAATCTCCATCTATATTGCTGTACTAAAAAAGAAGTTAAGTGCGGAAAAAAAACTTATTCTTTCGAAAGAAAATAAAAAATGAAAAATGTCATTAAACAAATAACCTCACTTAATTATGACAATATCTACCGTATGTTTTTTTTTTCCTTTTTTAGGTGTCACATTTGTTAAATATAATTAATGAGTTGAATATCTTCTTTCAATGTAATGTTAATAAGATAAATCAATCATAAATCATATTCACGACCAAGATGTTTAGACAAGTCTCTCAAACATCTAACGGACACGCTTGTTTTTTAGTTCTACAATGGTGGATACTTTGAATCTCAAACCTTTAAGAATGTAAGTTATTGTTCGACAATTTGAGTTAGACTTATAATAGTTAAAAGTCATGAGATACGTTTCATGCCATTGAAATTGTAAGCTCAACACTAGCATGTAACCGTCATTCCAAATCTCTTAATCATATTTAATGCAAAAAGTCGAATTTTTCTAACTAGATGTGGTCAACATGAGCTTAGCTAAAAAGTTGGCATGTTTCTCTGATAAAAAAAGGTTTTGAGTTCAAATCTCCCCACCTATTTATTGTACTAAAAAAAACTAAACAAATGTGTAATTAGATTAACCAGCAAATATAAAGTCGAGTTCTCCTAGTTAGATAGCAGTGACACAATGAGGATCAACCATCGATATATATTTCATCAAACCTTTGGTAAATGATATCTAAAATGTTGCCAACTTGAGTATGTACAAAAAAAATCTTGTGTTTGAATTCTAACCCCCATGTTTTTTAACAAGAAAAAGAAAAAGAAAAATAAAAGATGTAATATGTCATGAGCAAAC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ATGCGAGCTCTACTGCGATGTCGCACCTCTGAATTCGAGCACGGATCGCCTTTTCTTGCTGGCTTTTGGTTTAGAACCATCGTCACCAGTTGCAGAGCCGTGGTTTTGCCCCGCTTCGGCGGTCCGGAGGTGCTCCAGCTCCGTCCCGACGTTGACGTCCCCAATCTCAAGCCTAATGAGGTTCTCGTCCGTGCTCGTGCTGTTTCCATCAACCCGCTTGATACCAGAATGCGATCAGGTTATGGTCGCTCAATATTTGAACCACTTCTACCGGTCATTTTGGGCCGTGATATCAGTGGTGAAGTTGCGGCTGTTGGTTCTTCAGTTCGTTCAGTAAGTGTTGGAGAAGAAGTTTTTGGTGCTCTGCATCCAACTGCTGTGAGGGGTACTTACGCTGATTATGCAATACTTTCAGACGATGAATTAAGTGCTAAACCAGTGTCATTTACACATGTGGAGGCAAGTGCCATTCCTTTTGCTGCACTGACTGCATGGCGGGCTCTAAAAAGTACTGCTAGAATCACCCAGGGGCATAGGGTATTAGTAATTGGTGGTGGAGGAGCCGTAGGTTCTGCTGCAGTTCAGATTTCAGTTGCTTCAGGCTGCCACGTCACAACTACTTGTGGAAGTCAAAGTATAGATAAATTACTTGCAGCAGGTGCTGAGCAAGCAGTTGACTATACTACCGAGGACATTGAATTGGTAATAAAGGGGAAATTTGATGCTGTTTTGGATACCATTGGTGCGCCAGATACTGAACGAATTGGCATCAGTCTTTTGAAGAGAGGTGGACACTATATGACACTTCAGGGTGAGGCTGCATCATTCACTGATAAATATGGGCTACTTTTCGGGCTCCCTATAGCTACAAGTGTATTGGCGAAGAAACAGATACAGTATAGATACTCTCATGGAATCGAGTATTGGTGGACATACATGAGGGCGGATTCTGAAGGTTTACATGAGATCAGGAAGCTATGTGAAGCTGGAAAGCTGAAAATACCAGTCGAGAAAACATTTCCCATCTCACAAGTGAGAGAAGCCCACAACGCGAAGGATAAGAACCTCATTCCTGGTAAAGTGGTGCTAGAGCTGGATTCCCTTTGA MRALLRCRTSEFEHGSPFLAGFWFRTIVTSCRAVVLPRFGGPEVLQLRPDVDVPNLKPNEVLVRARAVSINPLDTRMRSGYGRSIFEPLLPVILGRDISGEVAAVGSSVRSVSVGEEVFGALHPTAVRGTYADYAILSDDELSAKPVSFTHVEASAIPFAALTAWRALKSTARITQGHRVLVIGGGGAVGSAAVQISVASGCHVTTTCGSQSIDKLLAAGAEQAVDYTTEDIELVIKGKFDAVLDTIGAPDTERIGISLLKRGGHYMTLQGEAASFTDKYGLLFGLPIATSVLAKKQIQYRYSHGIEYWWTYMRADSEGLHEIRKLCEAGKLKIPVEKTFPISQVREAHNAKDKNLIPGKVVLELDSL Homology
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q924D0 (Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rtn4ip1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 204.1 bits (518), Expect = 2.6e-51 Identity = 126/382 (32.98%), Postives = 207/382 (54.19%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0VC50 (Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial OS=Bos taurus OX=9913 GN=RTN4IP1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 202.2 bits (513), Expect = 1.0e-50 Identity = 125/363 (34.44%), Postives = 196/363 (53.99%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7T3C7 (Reticulon-4-interacting protein 1 homolog, mitochondrial OS=Danio rerio OX=7955 GN=rtn4ip1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 195.3 bits (495), Expect = 1.2e-48 Identity = 123/355 (34.65%), Postives = 201/355 (56.62%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8WWV3 (Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTN4IP1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 194.5 bits (493), Expect = 2.1e-48 Identity = 122/367 (33.24%), Postives = 195/367 (53.13%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54II4 (Reticulon-4-interacting protein 1 homolog, mitochondrial OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=rtn4ip1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 165.2 bits (417), Expect = 1.4e-39 Identity = 104/336 (30.95%), Postives = 181/336 (53.87%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. NCBI nr
Match: XP_023553198.1 (reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 645 bits (1663), Expect = 7.57e-232 Identity = 330/366 (90.16%), Postives = 345/366 (94.26%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. NCBI nr
Match: KAG7015031.1 (Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 643 bits (1659), Expect = 3.08e-231 Identity = 330/366 (90.16%), Postives = 343/366 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. NCBI nr
Match: KAG6577009.1 (Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 642 bits (1656), Expect = 8.82e-231 Identity = 329/366 (89.89%), Postives = 343/366 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. NCBI nr
Match: XP_022922906.1 (reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 639 bits (1648), Expect = 1.46e-229 Identity = 329/366 (89.89%), Postives = 340/366 (92.90%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. NCBI nr
Match: XP_022984733.1 (reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 635 bits (1639), Expect = 3.43e-228 Identity = 327/366 (89.34%), Postives = 341/366 (93.17%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E5E5 (reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430742 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 639 bits (1648), Expect = 7.07e-230 Identity = 329/366 (89.89%), Postives = 340/366 (92.90%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JBD9 (reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482921 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 635 bits (1639), Expect = 1.66e-228 Identity = 327/366 (89.34%), Postives = 341/366 (93.17%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L6P2 (PKS_ER domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G236570 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 599 bits (1545), Expect = 3.58e-214 Identity = 309/366 (84.43%), Postives = 333/366 (90.98%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CLG4 (Reticulon-4-interacting protein 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold227G001120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 593 bits (1529), Expect = 9.79e-212 Identity = 307/366 (83.88%), Postives = 329/366 (89.89%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UZ93 (Reticulon-4-interacting protein 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold803G00370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 592 bits (1526), Expect = 2.80e-211 Identity = 306/366 (83.61%), Postives = 329/366 (89.89%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. TAIR 10
Match: AT3G15090.1 (GroES-like zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein ) HSP 1 Score: 525.0 bits (1351), Expect = 4.8e-149 Identity = 251/340 (73.82%), Postives = 301/340 (88.53%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. TAIR 10
Match: AT1G23740.1 (Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein ) HSP 1 Score: 134.8 bits (338), Expect = 1.4e-31 Identity = 98/347 (28.24%), Postives = 172/347 (49.57%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. TAIR 10
Match: AT4G21580.1 (oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein ) HSP 1 Score: 115.2 bits (287), Expect = 1.1e-25 Identity = 104/350 (29.71%), Postives = 156/350 (44.57%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. TAIR 10
Match: AT4G13010.1 (Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein ) HSP 1 Score: 114.0 bits (284), Expect = 2.6e-25 Identity = 87/334 (26.05%), Postives = 155/334 (46.41%), Query Frame = 0
BLAST of MC10g0915 vs. TAIR 10
Match: AT4G21580.3 (oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein ) HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 1.4e-23 Identity = 98/346 (28.32%), Postives = 150/346 (43.35%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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